Maya türlerinin tanımlanmasında ticari testlerin karşılaştırılması

Benzer belgeler
Candida Türlerinin İdentifikasyonunda Fermentasyon-Asimilasyon Testleri ve Otomatize Sistemler. Dr Beyza Ener Uludağ Üniversitesi Tıp Fakültesi

Dilara YILDIRAN. Candida İzolatlarının Tür Düzeyinde. ve MALDI-TOF MS Sistemlerinin Karşılaştırılması. Mikr. Uzm.

Mikrobiyoloji Laboratuvarlarında Maya Türlerinin Tanımlanmasında Sık Kullanılan Ticari Sistemlerin Değerlendirilmesi: Çok Merkezli Bir Çalışma

M50 otomatik tanımlama Ve duyarlılık testi

Mine Doluca Dereli Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim

Klinik Örneklerden İzole Edilen Candida Türlerinin Tanımlanmasında Phoenix Yeast ID Panel ile API ID 32C Ticari Sistemlerinin Karşılaştırılması

Candida Cinsi Mayaların Tür Düzeyinde Tanımlanmasında Kullanılan Yöntemlerin Karşılaştırmalı Analizi

ANTİFUNGAL DİRENÇ ve ANTİFUNGAL DUYARLILIK TESTLERİ

CANDIDA GLABRATA NIN TANISINDA HIZLI TREHALAZ TESTİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ*

Yoğun Bakım Ünitesinde Gelişen Kandida Enfeksiyonları ve Mortaliteyi Etkileyen Risk Faktörleri

Enzimlerinin Saptanmasında

VERİFİKASYON. Dr. Tijen ÖZACAR. Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD - İZMİR

Kan Kültürlerini Nasıl Değerlendirelim? Rehber Eşliğinde. Dr. Banu Sancak

Komplike deri ve yumuşak doku enfeksiyonu etkeni çoklu dirençli patojenlerin bakteriyofaj duyarlılıklarının araştırılması

KAN KÜLTÜRLERİNDEN İZOLE EDİLEN CANDIDA TÜRLERİNİN DAĞILIMININ VE ANTİFUNGAL DUYARLILIKLARININ RETROSPEKTİF OLARAK DEĞERLENDİRİLMESİ*

Çok ilaca dirençli Mycobacterium tuberculosis izolatlarının hızlı tespitinde nitrat redüktaz testinin değerlendirilmesi: Çok merkezli bir çalışma

MAIA Pesticide MultiTest

Mikolojik Tanı. Dr Dilek Yeşim Metin Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Bornova-İzmir

CLOSTRIDIUM DIFFICILE ENFEKSİYONUNDA GLUTAMAT DEHİDROGENAZ VE TOKSİN A/B TESTLERİNİN TANI DEĞERİ VE MALİYET ETKİNLİĞİ

Maya ve Candida infeksiyonlarının insidansı artmaktadır Özellikle non albicans türlerin neden olduğu infeksiyonlarda önemli artış Antifungal


Biyofilmler; mikroorganizmaların, biyotik veya abiyotik yüzeylere adhezyonu sonrasında oluşturdukları glikokaliks olarak da adlandırılan

GERM TÜP TESTİNİN MÜELLER HİNTON AGAR VE SERUMDA KARŞILAŞTIRILMASI EVALUATION OF MUELLER-HINTON AGAR FOR GERM TUBE TEST

Karbonhidratlar, odunsu bitkilerin en önemli yapı maddeleridir.

Yatan Hastalardan İzole Edilen Candida Türlerinin ve Antifungal Duyarlılıklarının Belirlenmesi

Tıbbi Mikoloji Çalışma Grubu

Prof. Dr. Nilgün Çerikçioğlu Marmara Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD, 2016

Tüberküloz laboratuvarında kalite kontrol

Gebelikte vulvavagina kandidozu:


Tüberküloz dışı mikobakterilerin (TDM) tür tayini, klinik önemi ve ilaç duyarlık (İDT) testleri Prof. Dr. Ahmet Yılmaz Çoban

Genişlemiş Spektrumlu Beta-Laktamaz Üreten Gram Negatif Kan İzolatları: Karbapenemlere Duyarlılık ve Fenotipik/Genotipik Direnç Mekanizmaları

ANTİBİYOTİK DUYARLILIĞI VE DİRENÇLERİN YORUMLANMASINDA UZMAN SİSTEMLERİN ROLÜ

Deneysel Hayvan Modelinde Candida Tropicalis Peritonitinin Tedavisinde Kaspofungin ve Amfoterisin B Etkinliğinin Karşılaştırılması

Prof. Dr. Filiz Özçelik. Ankara Üniversitesi Mühendislik Fakültesi Gıda Mühendisliği Bölümü

Solunumda organik bileşikler karbondioksite yükseltgenir ve absorbe edilen oksijen ise suya indirgenir.

Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Kandida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları

Yöntem ve Test Seçimine Yaklaşım. Dr. Alpay Özbek Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji AD. Dokuz Eylül Üni. Tıp Fak. İZMİR

TÜBERKÜLOZUN MOLEKÜLER TANISINDA GÜNCEL DURUM

Klinik Mikrobiyoloji Testlerinde Doğrulama (verifikasyon) ve Geçerli Kılma (validasyon)

Süleyman PELİT*, Gonca ERKÖSE GENÇ*, Ayşe BARIŞ**, Zayre ERTURAN*

Gıda Kimyası II Gıdaların işlenmesi sırasında ortaya çıkan reaksiyonlar. Vural Gökmen

ARAŞTIRMA. Abstract. Özet

Antifungal Duyarlılık Testleri

İlaç direnci saptanmasında yeni yöntemler. Prof. Dr. Cengiz ÇAVUŞOĞLU Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD, Bornova, İZMİR

AÇIKÖĞRETİM FAKÜLTESİ ÖĞRETİM YILI UZAKTAN EĞİTİM ÖNLİSANS PROGRAMLARI DERS PLANI GIDA KALİTE KONTROLÜ VE ANALİZİ ÖNLİSANS PROGRAMI

Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Candida Kökenlerinin İdentifikasyonu ve Antifungal Duyarlılıklarının Araştırılması

Kan Kültürlerinden İzole Edilen Maya Türlerinin Vıtek 2 Sistemi ile Tanımlanması ve Antifungal Duyarlılıkları

IV. KLİMUD Kongresi, Kasım 2017, Antalya

VERİFİKASYON (SEROLOJİ, MOLEKÜLER TESTLER)

Metschnikowia pulcherrima Türü Mayaların İzolasyonu ve Pulcherrimin in Antimikrobiyal Aktivitelerinin Araştırılması. Prof. Dr.

YAZILIYA HAZIRLIK SORULARI. 9. Sınıf 2 KARBONHİDRAT LİPİT (YAĞ)

Bitki Kökenli Laktobasiller Üzerine Bir Araştırma 1

Karbohidratlar. Karbohidratların sınıflandırılması. Monosakkaritler

HİPERVİRÜLAN ESCHERİCHİA COLİ ST131 KLONU ÜLKEMİZDE YENİ Mİ?

ULUSAL ENTERİK PATOJENLER LABORATUVAR SÜRVEYANS AĞI (UEPLA) XXXVII. TÜRK MİKROBİYOLOJİ KONGRESİ KASIM 2016 ANTALYA

Referans Dışı Yöntemlerdeki Gelişmeler Neler Sunuyor? Dilek Yeşim METİN Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD, Bornova-İZMİR

Kısa Bildiri/Short Communication. Mikrobiyol Bul 2010; 44:

HİPP Biberon Mamaları

Emrah Salman, Zeynep Ceren Karahan Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi. Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

KALİTE SİZSİNİZ. Uzm. Dr. Özgür APPAK Prof. Dr. A. Aydan ÖZKÜTÜK Prof. Dr. Nuran ESEN Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji A.

Enterobacteriaceae Ġzolatlarında Karbapenemazların Saptanmasında Modifiye Hodge Testi ve Carba NP Testlerinin Karşılaştırılması

AÇIKÖĞRETİM FAKÜLTESİ ÖĞRETİM YILI UZAKTAN EĞİTİM ÖNLİSANS PROGRAMLARI DERS PLANI GIDA KALİTE KONTROLÜ VE ANALİZİ ÖNLİSANS PROGRAMI

Yılları Arasında Ülkemizde Kan Kültürü ve Antibiyotik Duyarlılık Sonuçlarının Değerlendirmesi

Pozitif kan kültürü şişesinden doğrudan MALDI-TOF MS ile identifikasyon

Yoğun Bakımlarda İnfeksiyon Kontrolü: Haricen Klorheksidin Uygulanmalı mı?

Yatan hasta örneklerinden izole edilen Candida izolatlarının tür dağılımlarının ve antifungal duyarlılık profillerinin değerlendirilmesi

Enfeksiyon odaklarından izole edilen Gram negatif ve Gram pozitif bakterilerde antimikrobiyal duyarlılık sonuçları

ANTİBİYOTİK DUYARLILIK TEST SİSTEMLERİNİN VERİFİKASYONU

Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Candida Türlerinin Tanımlanmasında Kromojenik Besiyerinin Değerlendirilmesi

Yılları Arasında Üretilen Salmonella İzolatlarının Antibiyotik Duyarlılık Sonuçları

Sema KEÇEL ÖZCAN*, Handan A IRBAfiLI**, fieyda ÇALIfiKAN*, Ayfle WILLKE***

HPV Moleküler Tanısında Güncel Durum. DNA bazlı Testler KORAY ERGÜNAY 1.ULUSAL KLİNİK MİKROBİYOLOJİ KONGRESİ

UZMANIYLA TARTIŞALIM MİKOLOJİ LABORATUVARINDA YAŞANAN SORUNLAR

OTOMATİZE TANIMLAMA SİSTEMLERİ KALİTE GÜVENCESİ. Melda SINIRTAŞ

Antifungal duyarlılık testleri

DISTRIBUTION OF CANDIDA SPECIES IN VAGINAL SPECIMENS AND EVALUATION OF CHROMAGAR CANDIDA MEDIUM. Berna GÜLTEKİN**, Vesile YAZICI**, Neriman AYDIN**

AMAÇ. o Sefoperazon-sulbaktam (SCP), o Ampisilin-sulbaktam (SAM), o Polimiksin-B (PB) o Rifampin (RİF)

OLGU SUNUMLARI. Dr. A. Nedret KOÇ. Erciyes Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Kayseri

VOGES PROSKAUER TESTİ

Çeşitli Klinik Örneklerden Soyutlanan Kandidaların Tür Dağılımı ve Antifungal Direnci*

İDENTİFİKASYONUNDA YENİLİKLER VE SORUNLAR

Enzimler, reaksiyon hızlarını büyük oranda artıran ve bunu mükemmel bir. seçicilikle yapan proteinlerden oluşan biyolojik katalizörlerdir.

Klinik örneklerde saptanan Candida türlerinin MALDI-TOF MS ile tiplendirilmesi

Tüberküloz Laboratuvar Sürveyans A ı (TULSA) Çalı maları,

Candida Epidemiyolojisi. Dr. Nur Yapar Aralık 2009 Çeşme İzmir

Antifungal Duyarlılık Testleri:

Organik bileşikler; karbonhidratlar, lipidler, proteinler, vitaminler ve nükleik asitler olmak üzere beş gruba ayrılır.

YOĞUN BAKIM ÜNİTELERİNDEN DÖRT YILLIK DÖNEMDE İZOLE EDİLEN MAYALARIN TÜR DAĞILIMININ DEĞERLENDİRİLMESİ*

Candida Enfeksiyonları. Beyza Ener Uludağ Üniversitesi Tıp Fakültesi

Gram Pozitif Bakteriler ve Duyarlılık Testleri. Güner Söyletir

Çoklu İlaç Dirençli A. baumanni İzolatlarının OXA tipi Karbapenemaz Genlerinin Tespiti ve PFGE ile Moleküler Epidemiyolojik Analizi

CRYPTOCOCCUS TÜRLERĠNĠN ĠDENTĠFĠKASYONU. Süleyha HĠLMĠOĞLU POLAT Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

Yorumlu ve Kısıtlı Antibiyogram Kursu

İzolasyon ve İdentifikasyon

MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS KOMPLEKS KLİNİK İZOLATLARINDA İZONİAZİD DİRENCİNE NEDEN OLAN DIŞA ATIM POMPALARININ SAPTANMASI

MALDI TOF-MS Performans ve Yenilikler. Dr. Görkem Yaman Düzen Laboratuvarlar Grubu İstanbul

ANTİFUNGAL DUYARLILIK TESTLERİNDE YENİ NELER VAR? EUCAST YÖNTEMİ VE YENİ ÖNERİLER

Hücrelerde gerçekleşen yapım, yıkım ve dönüşüm olaylarının bütününe metabolizma denir.

Laboratuvar Tekniği. Adnan Menderes Üniversitesi Tarımsal Biyoteknoloji Bölümü TBY 118 Muavviz Ayvaz (Yrd. Doç. Dr.) 8. Hafta (04.04.

Transkript:

Maya türlerinin tanımlanmasında ticari testlerin karşılaştırılması Doç. Dr. Aydan Özkütük Dokuz Eylül Üniv. Tıp Fak Tıbbi Mikrobiyoloji AD

Maya identifikasyon testleri Karbonhidrat asimilasyonu Glukoz Maltoz Galaktoz Laktoz Rafinoz İnositol Sorbitol Sukroz Ksiloz Melezitoz Arabinoz Sellobioz Trehaloz Adonitol..

Enzimatik reaksiyonlar Heksozaminidaz (N-asetil galaktozaminidaz aktivitesinin saptanması) Fenoloksidaz Pirolinarilamidaz

Genel Özellikler Testler türbidimetrik yada kolorimetrik test prensiplerine göre çalışılmakta 24-48 saatlik taze kültürlerden çalışma öneriliyor İnkübasyon ısısı genelde 30 C Maya inokulum yoğunluğu ticari teste göre değişmekte (1,5-3 McFarland)

Genel Özellikler İnkübasyon süresi 24-72 h arasında değişiyor Bulanıklık; renk değişimi değerlendiriliyor Ek testler önerilebiliyor 37 C de üreme Miçel ya da artrospor oluşumu Kapsül varlığı 5-10 arası numerik bir profil saptanıyor ve sonuç veri bankasında aranıyor

Tanımlama paneli ve test prensibi Auxacolor APİ 20CAUX ID32C APİ Candida (Biorad) (Biomerieux) (Biomerieux) (Biomerieux) Kolorimetrik Türbidimetrik Türbidimetrik Kolorimetrik 13 şeker 19 şeker 24 şeker 5 şeker Asimilasyonu Asimilasyonu Asimilasyonu Asimilasyonu + + + 3 enzimatik reaksiyon+ siklohekzimid 5 organik asit+ siklohekzimid ve eskülin 7 enzimatik reaksiyon

AUXACOLOR 2

AUXACOLOR 2 Negatif reaksiyon Pozitif reaksiyon C.Neg GLU. MAL SAC. GAL. LAC. RAF. INO. CEL. TRE. ADO. MEL XYL ARA. HEX. POX. / PRO

APİ 20C AUX, ID 32C

Tanımlama paneli ve test prensibi Micronaut Candida (Merlin) Rapid Yeast Plus (Innovative Diagnostic Systems) Fungichrom (International Microbio, Signes,) Kolorimetrik Kolorimetrik Kolorimetrik 8 kromojenik substrat + 14 şeker asimilasyonu 5 şeker asimilasyonu + 13 enzimatik reaksiyon 7 şeker asimilasyonu 8 enzimatik reaksiyon Aktidion direnci

Micronaut-Candida

Rapid Yeast Plus

Fungichrom

İnokulum yoğunluğu Auxacolor APİ 20CAUX ID32C APİ Candida (Biorad) (Biomerieux) (Biomerieux) (Biomerieux) 1,5 McFarland 2 McFarland 2 McFarland 3 McFarland

İnokulum yoğunluğu Micronaut Candida (Merlin) Rapid Yeast Plus (Innovative Diagnostic Systems) Fungichrom (International Microbio, Signes,) 0.5 McFarland 3 McFarland 2 McFarland

İnkübasyon süresi Auxacolor APİ 20CAUX ID32C APİ Candida (Biorad) (Biomerieux) (Biomerieux) (Biomerieux) 24-48h 48-72h 24-48h 24-48h

İnkübasyon süresi Micronaut Candida (Merlin) Rapid Yeast Plus (Innovative Diagnostic Systems) Fungichrom (International Microbio, Signes,) 24h 4h 24-48h

Tanımladığı maya türü Auxacolor APİ 20CAUX ID32C APİ Candida (Biorad) (Biomerieux) (Biomerieux) (Biomerieux) 33 maya 43 maya 63 maya 15 maya

Tanımladığı maya türü Micronaut Candida (Merlin) Rapid Yeast Plus (Innovative Diagnostic Systems) Fungichrom (International Microbio, Signes,) 34 maya 43 maya 24 maya

Mevcut durum/sorunlar Vitek,APİ ID 32C, APİ 20C AUX, Yeast Star, Auxacolor, Rapid Yeast Plus, APİ Candida sistemlerinin karşılaştırıldığı bir çalışmada; Sistemlerin doğru tanımlama oranları %59.6-%80.8 Çimlenme borusu negatif mayalarda Api Candida ve Auxacolor un %93.1 doğru tanımladığı bildirilmekte Verweij PE et al. J Clin Pathol. 1999;52: 271-73

Mevcut durum/sorunlar APİ 20C AUX ve ID 32C sistemlerinde türbiditenin değerlendirilmesinde güçlük Renk değişiminin yorumu Rapid Yeast Plus ta daha sıkıntılı Testlerin birçoğunda ek teste ihtiyaç duyuluyor Bazı türlerin tanımlanmalarında halen eksiklik var Verweij PE et al. J Clin Pathol. 1999;52: 271-73

Sorunlar C.lipolytica C.sake G.candidum C.dubliniensis API 20C AUX tanımlanamıyor C.lipolytica C.norvegensis API Candida Trichosporon türleri..

C. dubliniensis C. inconspicua C.kefyr C.famata C.norvegensis C.lipolytica C.sake Rapid Yeast Plus ile tanımlanamayanlar

Fungichrom ile tanımlanamayanlar C. dubliniensis C. inconspicua C.sake C.norvegensis Trichosporon türleri

Mikronaut-Candida ile API ID 32C nin karşılaştırıldığı bir çalışmada; ATCC suşlarında; 1 C. pulcherrima yı tanımlayamadı 1 C. norvegensis hatalı identifikasyon Micronaut-Candida 1 C.rugosa hatalı identifikasyon Z. Szabo et al. JCM 2008;46 (5): 1824-25

Z. Szabo et al. JCM 2008;46 (5): 1824-25 Klinik izolatlarda; 18 izolat ID 32C ile 2 izolat da Micronaut ile hatalı tanımlandı. 12 C. inconspicua C. norvegensis olarak 5 C. lusitaniae C. famata 1 C. tropicalis C. humicolus ID32C 2 C. pulcherrima tanımlanamadı Micronaut-Candida İki sistem arasında hatalı identifikasyon oranı anlamlı olarak farklı (% 0.76-6.82; P 0.001)

Nadir görülen maya türlerinde tanımlama oranları çok düşük!!! C. orthopsilosis, C. metapsilosis, C.bracarensis, C. haemulonii, C. nivariensis % 25 Auxacolor, API 20C, ID32C Cendejas-Bueno E et al. JCM 2010; 48(5): 1895-99

Pincus DH Med Mycol 2007; 45:97-121 İnkübasyon süresi İnkübasyon ısısı Doğru tanımlama oranı Karşılaştırma yöntemi API 20C 48-72 h 30 C %93-100 Klasik yöntemler API Candida 24-48 h 37 C %68-97,4 Klasik yöntemler API 20C ID32 C* 24-48 h 30 C %88,5-98 Klasik yöntemler Auxacolor 24-48 h 30 C %63,8-95,2 Klasik yöntemler API ID32C Fungichrom 24-48 h 30 C %65-96 Klasik yöntemler Rapid yeast plus 4 h 30 C %84-99 Klasik yöntemler API 20C ID32C Candifast 4 h 37 C %88,8 Klasik yöntemler Fungifast 24-48 h 37 C %65-84,7 Klasik yöntemler

Otomatize testlerde karşılaştırmalar Test özelliği İnkübasyon süresi İnkübasyon ısısı Doğru tanımlama oranı Karşılaştırma yöntemi The Biolog YT MicroPlate (Biolog) MicroScan Yeast Identification Panel (Dade Behring) MIDI Sherlock VITEK 2 YST (Biomerieux) 94 çukurlu mikroplak Karbon asimilasyon Enzimatik reaksiyonlar Üre Yağ asidi analizi Karbon ve organik asit asimilasyon Üre,Eskülin 24-72 h 30 C %48,8 Klasik yöntemler 4 h 37 C %85,3-96,6 API 20C %68-70,2 Klasik yöntemler API 20C 18h 35 C %94,8-98,5 Klasik yöntemler API 20C

VITEK-2

microscan

MIDI Sherlock

Sonuç olarak Ticari tanımlama testlerinin duyarlılığı giderek artmakta, bir çok yeni seçenek test geliştirilmektedir Her laboratuvar kendi koşullarına uygun testi seçerken; performans, kullanım kolaylığı, inkübasyon süresi ve maliyetini gözönünde bulundurmalıdır Klasik tanı yöntemlerinin öncelikli kullanımı düşünülmelidir

Tekrar buluşmak umuduyla