Kayseri Civarında Yetiştirilen Holştayn İneklerde Kalıtsal Faktör XI Yetmezliği Geninin Allel Frekansının Belirlenmesi*

Benzer belgeler
Türkiye de Yetiştirilen Holştayn ve Bazı Yerli Sığır Irklarında Citrullinemia Allelinin Belirlenmesi

Anahtar Kelimeler: Kalıtsal hastalık, miyofosforilaz, RFLP, Şarole

Islah Stratejileri ve Türkiye Ulusal Sığır Islah Programı

Damızlık İnek Seçimi. Zir. Müh. Zooteknist. Tarım Danışmanı Fatma EMİR

BÜYÜKBAŞ HAYVANCILIK ARAŞTIRMALARI ÇALIŞMA GRUBU. Önder SÖZEN Koordinatör

MOLEKÜLER TANISI DÜZEN GENETİK HASTALIKLAR TANI MERKEZİ. SERPİL ERASLAN, PhD

Comparison of Adaptation Levels of Cultural Cattle in Kahramanmaras Province in Terms of Insurance Claims Compensation

Sperma DNA İçeriği. Cinsiyeti Belirlenmiş Sperma Gebelik Oranları?

Türkiye de Simental Genotipinin Yaygınlaştırılması. Araş. Gör. Ayşe Övgü ŞEN Ankara Üniversitesi Ziraat Fakültesi

I. Projenin Türkçe ve İngilizce Adı ve Özetleri İvesi Koyunlarında mikrosatellite lokuslarında polimorfizmin tespiti Güneydoğu Anadolu Tarımsal Araştı

GÖKHÖYÜK TARIM İŞLETMESİNDE YETİŞTİRİLEN SİYAH ALACA SIĞIRLARIN SÜT VE DÖL VERİM ÖZELLİKLERİ 2. DÖL VERİM ÖZELLİKLERİ

SIĞIR YETİŞTİRİCİLİĞİ VE BESİCİLİĞİ

Ders Adı Kodu Yarıyılı T+U Saati Ulusal Kredisi AKTS HAYVAN SAĞLIĞI VE HASTALIKLARDAN KORUNMA

P U B E R TA S, SUNİ T O H U M L A M A, G E B E L İ K V E T E R İ N E R HEKİ M : A H M E T K E S K İ N

Prof.Dr. Selahattin Kumlu

GÖKHÖYÜK TARIM İŞLETMESİNDE YETİŞTİRİLEN SİYAH ALACA SIĞIRLARIN SÜT VE DÖL VERİM ÖZELLİKLERİ 1. SÜT VERİM ÖZELLİKLERİ

ZOOTEKNİ BÖLÜMÜ. Araş. Gör. Ertuğrul KUL

A8. Kul, E., Erdem, H., Relationships Between Somatic Cell Count and Udder Traits in Jersey Cows. J. Appl. Anim. Res. 34 (2008):

İstatistiki Bölge Birimleri Sınıflamasına Göre Düzey 2 (TRA1 ve TRA2) Bölgelerinde Büyükbaş Hayvan Varlığı ve Süt Üretiminin Karşılaştırılması

Kazova Vasfi Diren Tarım İşletmesinde Yetiştirilen Siyah Alaca Sığırların Döl Verimi Özellikleri *

Analizi. Önder AYTEKİN* Özet. A Retrospective Analysis of Artificial Insemination Applications Carried out under Field Conditions Abstract

AYDIN İLİ DAMIZLIK SIĞIR YETİŞTİRİCİLERİ BİRLİĞİ OCAK 2016 KAYE EĞİTİM TOPLANTISI SEDA EMİNE PAYIK TEKNİK İŞLER ŞUBE MÜDÜRÜ

Hayvan Islahı ve Yetiştirme 2. ders

/ Mayıs 2009 CUMA. Resmî Gazete. Sayı : TEBLİĞ. Köyişleri Bakanlığından: HAYVANCILIĞIN DESTEKLENMESİ HAKKINDA

ERCİYES ÜNİVERSİTESİ VETERİNER FAKÜLTESİ DERGİSİ Journal of Faculty of Veterinary Medicine, Erciyes University


II. BÖLÜM TABİİ TOHUMLAMA MANDA BOĞALARININ SAĞLIK TESTLERİNDE UYULMASI GEREKEN ŞARTLAR

EMBRIYO TRANSFERIYLE BIR INEKTEN?100 BUZAGI ALINACAK

TÜRKİYE DE SIĞIR YETİŞTİRİCİLİĞİ

2 Nisan 2015 PERŞEMBE. Resmî Gazete. Sayı : TEBLİĞ. Gıda, Tarım ve Hayvancılık Bakanlığından:

DAMIZLIK SIĞIR YETİŞTİRİCİLİĞİNDE KADININ ROLÜ. Zerrin KUMLU. Salahattin KUMLU. DGRV Eğitim Ekibi Ankara, 2016

Hayvansal Üretim 49(2): 1-6, 2008 Araştırma Makalesi

ADIM ADIM YGS LYS Adım EKOLOJİ 15 POPÜLASYON GENETİĞİ

Kazova Vasfi Diren Tarım İşletmesinde Yetiştirilen Siyah Alaca Buzağılarda Büyüme Performansı ve Yaşama Gücü *

T. C. DİCLE ÜNİVERSİTESİ VETERİNER FAKÜLTESİ KAMU HİZMET STANDARTLARI TABLOSU

Irkların Sınıflandırılması

CA ve kalitesine göre 2-6 kg kaba yem 10 aylık yaşta meme bezi gelişimini tamamlar;

Türkiye de Yetiştirilen Esmer ve Siyah Alaca Sığırlarda Süt Verimi, İlk Buzağılama Yaşı ve Servis Periyodu *

ARAŞTIRMA MAKALESİ. Türkiye ye 2015 yılında sperması ithal edilen boğalardaki kalıtsal kusurlar. Şeref İnal*, Mustafa Çam

DAMIZLIK DİŞİ SIĞIRLARIN BÜYÜTÜLMESİ. Prof.Dr. Selahattin Kumlu. Akdeniz Üniversitesi Ziraat Fakültesi Zootekni Bölümü Antalya. Jump to first page

GENETİK HASTALIKLARDA TOPLUM TARAMALARI

Populasyon Genetiği. Populasyonlardaki alel ve gen frekanslarının değişmesine neden olan süreçleri araştıran evrimsel bilim dalı.

Araştırmacılar. Araştırma İNEKLERDE ÜREME VERİMİ KLİNİK ENDOMETRİTİS

İstanbul Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji AD Prof. Dr. Filiz Aydın

KOP BÖLGESİ BÜYÜKBAŞ HAYVANCILIĞINDA GENETİK İLERLEMENİN SAĞLANMASI

Dr. AKIN PALA. Zooteknist? Zootekni-Zooteknist? Zooteknist? Zooteknist? Islah, genotip-çevre

SPERMA,OVUM VE EMBRİYO İTHALATINDA UYULMASI GEREKEN USUL VE ESASLAR HAKKINDA TALİMAT

Hakan ÇETİN Atakan KOÇ

Hayvancılık İşletmelerinin Veteriner Hekimlik Hizmetlerinden Beklentileri: Kars ili Örneği

SIĞIRLARIN NODÜLER EKZANTEMİ LUMPY SKIN DISEASE (LSD) Hastalık Kartı. Hazırlayan. Dr. M. Fatih BARUT Vet. Hekim

Yozgat İli Boğazlıyan İlçesinde Özel Bir İşletmede Yetiştirilen Siyah Alaca Sığırların Döl Verimi Özellikleri*

Siyah Alaca Sığırlarda Kuruda Kalma Süresi, Servis Periyodu ve İlkine Buzağılama Yaşı ile Bazı Süt Verim Özellikleri Arasındaki İlişkiler

Birlikle el ele, Hayvancılıkta daha ileriye

T.C. ÇANAKKALE ONSEKİZ MART ÜNİVERSİTESİ BİGA MESLEK YÜKSEKOKULU MÜDÜRLÜĞÜ DERS İÇERİKLERİ

Türk Tarım - Gıda Bilim ve Teknoloji Dergisi

AABB X aabb F1 ler daima AaBb

Kocatepe Veteriner Dergisi Kocatepe Veterinary Journal

Türk Tarım - Gıda Bilim ve Teknoloji Dergisi

α1-antitrypsin quicktype

Süt Sığırcılığında Döl Verimi Kayıplarının İşletme Gelirine Etkisi

MENDEL DIŞI KALITIM. Doç. Dr. Bengi ÇINAR KUL. Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Genetik Anabilim Dalı

Norveç Kırmızısı (NRF) ile Melezleme

Sarımsaklı Tarım İşletmesinde Yetiştirilen Siyah-Alaca Irkı Süt Sığırlarının Döl Verim Özellikleri

Doğu Akdeniz Tarımsal Araştırma Enstitüsünde Yetiştirilen Siyah Alaca Buzağılarda Büyüme Performansı ve Yaşama Gücü

Tekirdağ&Ziraat&Fakültesi&Dergisi&

Detection of Akirin 2 Gene Polymorphism with PCR-RFLP Method in Some Cattle Breeds Reared in Turkey

Yarı-entansif sığır yetiştiriciliği

Çiftlik Hayvanlarında Embriyo Aktarımı. Prof Dr Fatin Cedden

23 Aralık 2011 CUMA Resmî Gazete Sayı : YÖNETMELİK

AİLESEL AKDENİZ ATEŞİ (AAA-FMF)

SİYAH ALACA SIĞIRLARDA LAKTASYONUN İLK 10 GÜNÜNDE SÜTÜN BİLEŞİMİNDE MEYDANA GELEN DEĞİŞİM

Birlikle el ele, Hayvancılıkta daha ileriye

TÜRKİYE DE BULUNAN BAZI YERLİ SIĞIR IRKLARININ GENETİK YAPILARININ KARAKTERİZASYONU

Holştayn Irkı Sığırlarda Bazı Verim Özellikleri

Konuklar Tarım İşletmesinde Yetiştirilen Esmer Sığırların Döl Verim Özellikleri *

TEMEL SÜRÜ SAĞLIĞI YÖNETİMİ

ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ

YÖNETİCİ ÖZETİ. Proje ile yüksek genetik kapasiteli damızlıklar öncelikle yurt içinden temin edilmeye çalışılacaktır.

SIĞIRLARDA KIZGINLIĞIN BELİRLENMESİ VE ÜREME KUSURLARI. Araş. Gör. Koray KIRIKÇI

AMASYA İLİ DAMIZLIK SIĞIR YETİŞTİRİCİLERİ BİRLİĞİ

Bu amaçları yerine getirebilmek için genetik danışmanın belli basamaklardan geçmesi gerekir. Bu aşamalar şunlardır:

TÜBİTAK BİDEB LİSE ÖĞRETMENLERİ FİZİK, KİMYA, BİYOLOJİ, MATEMATİK- PROJE DANIŞMANLIĞI EĞİTİMİ ÇALIŞTAYI LİSE3 (Çalıştay 2013) BİYOLOJİ GRUP TUHAF

Tekirdağ Ziraat Fakültesi Dergisi Soyak ve ark., (3) Journal of Tekirdağ Agricultural Faculty

Döl Tutma Problemi Olan Holştayn Irkı Sığırlarda Sitogenetik ve Moleküler Genetik Taramalar

BİYOTEKNOLOJİ NEDİR? Canlılar aracılığı ile ürün ve hizmet üretmektir

Çiftlik Hayvanlarında Türlere Göre Üreme Özellikleri. Prof. Dr. Fatin CEDDEN

attomol apo B-100 quicktype

Mikrobiyolojide Moleküler Tanı Yöntemleri. Dr.Tuncer ÖZEKİNCİ Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji A.D

Gıda Tarım Hayvancılık Bakanlığının Kontrolüne Tabi Ürünlerin İthalat Denetimi Tebliği (Ürün Güvenliği ve Denetimi Tebliği 2013/5)

Çiftlik Hayvanlarında Cinsiyetin Denetimi

ÜLKEMİZDE HAYVANCILIK

KAHRAMANMARAŞ HOLSTEIN FRIESIAN DAMIZLIK SÜT SIĞIRI YETİŞTİRİCİLERİ BİRLİĞİ MODEL ÇALIŞMASI

VIII. FAKTÖR XII EKSİKLİĞİ TANI VE TEDAVİ KILAVUZU BÖLÜM ULUSAL TANI VE TEDAVİ KILAVUZU 2013

POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU (PZR-PCR) VE RESTRİKSİYON PARÇA UZUNLUĞU POLİMORFİZMİ (RFLP)

SIĞIRLARDA KURU DÖNEM BESLEMESİ

Süt Tipi Oğlakların Doğum, 30. Gün ve 60. Gün Canlı Ağırlıkları Üzerine Sistematik Çevre Etmenlerinin Etkileri

ADIM ADIM YGS LYS Adım EVRİM

Mutasyon: DNA dizisinde meydana gelen kalıcı değişiklik. Polimorfizm: iki veya daha fazla farklı fenotipin aynı tür popülasyonunda bulunmasıdır.

Genler ve Çevre fenotipik varyansa ne kadar katkıda bulunuyor?

Kanatlı Hayvan Hastalıkları

Transkript:

Erciyes Üniv Vet Fak Derg 9(1) 7-12, 2012 J Fac Vet Med Univ Erciyes 9(1) 7-12, 2012 G. Araştırma YAŞAR, B. Makalesi AKYÜZ Research Article Kayseri Civarında Yetiştirilen Holştayn İneklerde Kalıtsal Faktör XI Yetmezliği Geninin Allel Frekansının Belirlenmesi* Güneri YAŞAR 1, Bilal AKYÜZ 2 1 Erciyes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Kayseri-TÜRKİYE 2 Erciyes Üniversitesi Veteriner Fakültesi Genetik ABD, Kayseri-TÜRKİYE Özet: Bu çalışmanın amacı Kayseri ve civarında yetiştirilen dişi Holştayn larda, kalıtsal faktör XI yetmezliği (FXID) hastalığına neden olan mutant allelinin bulunup bulunmadığının araştırılmasıdır. Ayrıca çalışmada, veteriner hekimler ve yetiştiricilerin bu kalıtsal hastalıktan haberdar olmalarını sağlamak hedeflenmiştir. Bu çalışmanın hayvan materyalini Kayseri ve civarında yetiştirilen 150 baş Holştayn inek oluşturmuştur. Çalışmada FXID e neden olan mutant allelinin varlığı veya yokluğu polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) yöntemi kullanılarak araştırılmıştır. İncelenen örneklerden birinin FXID taşıyıcısı olduğu belirlenmiştir. Sonuç olarak, incelenen örneklerde FXID prevalansının yaklaşık olarak %0.7 olduğu belirlenmiştir. Anahtar Kelimeler: FXID, Holştayn, kalıtsal hastalık, PZR Detection of Allele Frequency of Hereditary Factor XI Deficiency Gene in Holstein Cows Reared in Kayseri Vicinity Summary: The purpose of this study was to investigate presence or absence of allele that caused the hereditary factor XI deficiency disease (FXID) in the Holstein cows in Kayseri vicinity. In this study, moreover, it was aimed to make veterinarians and breeders aware of this hereditary disease. Animal material of this study consisted of 150 Holstein cows raised in Kayseri and its vicinity. In this study, the method of polymerase chain reaction (PCR) was applied to determine the mutant allele causing the FXID. In investigated samples, one of the samples was detected as a FXID carrier. In conclusion, it was determined that FXID prevalence was approximately 0.7% in investigated samples. Key Words: FXID, Holstein, inherited disease, PCR Geliş Tarihi/Submission Date : 10.10.2011 Kabul Tarihi/Accepted Date : 12.12.2011 * TSY-09-979 Proje Koduyla Erciyes Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Koordinasyon Birimi Tarafından Desteklenen Kayseri Bölgesinde Yetiştirilen Holştayn Sığırlarında Kalıtsal Faktör XI Yetmezliğine Neden Olan Genin Allel Frekansının Belirlenmesi Adlı Yüksek Lisans Tezinden Özetlenmiştir. Giriş Kalıtsal hastalıklar, hayvanın yaşama gücünü, verimi veya döl verimini düşürerek ekonomik kayıplara neden olmaktadır (3). Bu durum, işletmelerin hedeflediği kazanca ulaşmasını engelleyerek karlılığı düşürmektedir. Kalıtsal hastalıklardan kaynaklanan ekonomik kayıplar ancak hastalığa neden olan mutant genin sürüden uzaklaştırılması ile önlenebilir. Süt sığırı yetiştiriciliğinde uygulanan genetik iyileştirme programlarının amacı, laktasyon başına ortama süt veriminde ve süt kompozisyonunda ilerleme elde etmektir (5). Yapılan ıslah programları ve seleksiyon çalışmaları bu avantajlarının yanı sıra damızlık bir bireyde ortaya çıkabilecek mutant allellerin frekansının hızla popülasyon içinde yayılmasına da neden olabilmektedir (5). Bu nedenle yetiştirme programları yapılırken, yetiştirilmesi planlanan ırklarda en yaygın görülen kalıtsal hastalıklar yönünden damızlık adaylarının taranması ve ari olduklarının belirlenmesi gereklidir. Entansif sığır yetiştiriciliğinde yaygın olarak kullanılan suni tohumlama yöntemi, genetik ve verim özellikleri yönünden üstün sınırlı sayıda erkek damızlığın belirlenerek kullanılmasına olanak sağlamıştır. Benzer şekilde yüksek verimli dişi damızlıklardan multiple ovulasyonla elde edilen embriyoların kullanıldığı, embriyo nakli yönteminin kullanımı da gittikçe çiftlik hayvanları yetiştiriciliğinde artmaktadır. Bu şekilde sınırlı sayıda damızlığın kullanılmasına olanak veren yöntemler, ırk içerisinde kalıtsal hastalıkların kısa sürede tüm dünyaya yayılma riskini de artırmaktadır (15). Özellikle süt sığırı yetiştiriciliğinde suni tohumlama yöntemi, hayvan başına verimi artırırken aynı zamanda yetiştiriciliği yapılan ırklarda, ırk içi genetik benzerliğin de artmasına neden olmaktadır (10). Kalıtsal hastalıkların büyük çoğunluğu resesif kalıtım şekli gösterdikleri için bireylerin fenotiplerinden genetik yapılarının tahmini yapılamamaktadır. Kalıtsal hastalıkların kontrolündeki en önemli problemlerden birisi, kalıtsal hastalığa sebep olan resesif allelin varlığının belirlenmesine kadar geçen sürede bu allelin frekansının popülasyon içinde yüksek bir frekansa ulaşmasıdır (1). Bu duruma en güzel örnek, taşıyıcılarının teşhisinin yapılabildiği 1990 yılına kadar tüm dünyadaki Holştayn lara yayılan 7

Holştaynlarda faktör XI yetmezliği Erciyes Üniv Vet Fak Derg 9(1) 7-12, 2012 ve mutant allelin ilk olarak 1952 yılında doğan bir boğada ortaya çıktığı BLAD verilebilir (2). Sığırlarda önemli verim kayıplarına neden olan kalıtsal hastalıklar çoğunlukla ırka özgüdür (4). Bu nedenle erkek ve dişi damızlık adaylarının ırka özgü kalıtsal hastalıklar yönünden taranması gereklidir. Ekonomik açıdan bir sürünün tüm bireylerinin kalıtsal hastalıklar yönünden taranması zor ve pahalıdır. Ancak, özellikle suni tohumlama ve embriyo nakli amacıyla kullanılan damızlık adaylarının ırka özgü kalıtsal hastalıkları taşıyıp, taşımadıklarının belirlenmesi, kalıtsal hastalıkların kontrol altına alınmasına yardımcı olabilir (10). Kanın pıhtılaşmasında görevli proteinlerden biri olan plazma tromboplastin öncüsü olarak da bilinen faktör XI, serin proteaz olarak da adlandırılır (7). Faktör XI yetmezliği (FXID) insan, köpek ve sığır gibi bir kaç memeli türünde belirlenmiş kalıtsal bir hastalıktır (9, 13). Yapılan pedigri analizlerinde hastalığın, otozomal resesif bir kalıtım şekli gösterdiği belirlenmiştir. FXID sığırlarda, sadece Holştayn ve Japon Siyah sığır ırklarında bulunduğu bildirilmiştir (16). Hastalık ilk kez 1969 yılında ABD de yetiştirilen Holştayn larda tespit edilmiştir (13). Daha sonra, Kanada ve İngiltere de yetiştirilen Holştayn larda da bildirilmiştir (11). Türkiye de yetiştirilen Holştayn larda FXID e neden olan mutant allelin varlığı ilk kez 2009 yılında Meydan ve ark. (13) tarafından bildirilmiştir. Hastalığın moleküler temelini, faktör XI geninin 12 numaralı ekzonuna 76 baz eklenmesine neden olan bir mutasyon oluşturmaktadır (9, 15). Gerek homozigot gerekse heterozigot bireylerde hastalığın kesin tanısına olanak verecek özel klinik belirtiler yoktur. Faktör XI yetmezliğinden etkilenen hayvanlar çoğunlukla belirgin semptomlar göstermeden yaşayabildikleri de bildirilmiştir (3). Ancak, FXID e neden olan mutant allel yönünden homozigot ve heterozigot buzağıların, homozigot normal buzağılara oranla daha düşük doğum ağırlığı ve yaşama gücü gösterdiği, enfeksiyöz hastalıklara yakalanma olasılıklarının daha yüksek olduğu bildirilmiştir (11). Heterozigot bireylerde FXI pıhtılaşma aktivitesi azalmış, homozigotlarda ise tamamen ortadan kalkmıştır. Homozigot bireylerde, belirgin olarak enjeksiyon sonrası kanama süresinin uzaması, kanlı süt, anemi, pnömoni, mastitis ve metritise karşı direnç düşüklüğü gibi birkaç belirtinin görüldüğü bildirilmiştir (13). Ayrıca kastrasyonda ve boynuz kesimi yapılan hayvanlarda uzun süren kanamalar, yeni doğum yapmış ineklerde sıklıkla pembe renkli kolostrum, yeni doğan buzağılarda göbek kordonunda ve çevresinde kanamaların görüldüğü bildirilmiştir (11, 13). FXID taşıyıcı ve homozigot hayvanların ovülasyon döneminde kan östrodiol oranında düşme, foliküler gelişimi tam olmaması ve üreme performasının düşmesine bağlı olarak repeat breeding (üç tohumlamada gebe kalmama durumu) prevalansında artışa neden olabilmektedir. Bu durum işletmelerde buzağılama aralığının uzamasına neden olmaktadır (7). Homozigot hasta hayvanlarda yüksek mortalite ve morbidite gösterebilseler dahi çoğunlukla FXID li bireylerin tanınmalarına olanak verecek herhangi bir klinik belirti göstermeden sürü içerisinde yıllarca yaşayabilirler (11). Bu nedenle homozigot ve heterozigot bireylerin belirlenerek damızlıktan çıkarılması önemlidir. Tanıda, bireylerdeki faktör XI etkinliğini izlemek için aktive parsiyel tromboplastin zamanını (APTT) ölçümü kullanılabilmektedir (7). Ancak bu yöntem, homozigot bireylerin belirlenmesi için olumlu sonuç vermesine karşın heterozigot bireylerin belirlenmesinde istenen sonucu verememektedir (7). Bu nedenle FXID taşıyıcılarının kesin olarak tespiti için en etkili yöntem uygun primerlerin kullanılmasıyla yapılan polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) yöntemidir (11). Yapılan bu çalışmada, Kayseri ve civarında yetiştirilen damızlık dişi Holştayn larda, FXID ne neden olan mutant allelin frekansının belirlenmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem Çalışmanın hayvan materyalini oluşturan 150 baş Holştayn sağmal inek ve damızlık adayı düve, Kayseri ilinin Develi ve Bünyan ilçelerinde süt sığır yetiştiriciliği yapan işletmelerden sağlanmıştır. Hayvan materyalinin seçiminde, incelenen bireylerin yakın akraba olmamalarına dikkat edilmiştir. PZR da kullanılacak DNA lar fenol-kloroform ekstraksiyon yöntemi ile izole edilmiştir. FXID ye sebep olan mutant alleli belirlemek için yapılan PZR işleminde primer olarak FXIF 5 - CCCACTGGCTAGGAATCGTT-3 ; FXIR 5 - CAAGGCAATGTCATATCCAC -3, şekilde bir primer seti kullanılmıştır. PZR; 14 µl dh 2 O, 5 µl MgCl 2, 2 µl 10 x PZR buffer, 1.1 µl dntp, 0.4 µl (20nmol) primer, 0.1 Taq polimeraz enzimi (5 U/µL) ve 2 µl DNA eklenerek toplam hacmi 25 µl olan karışımla yapılmıştır. PZR işlemi, hazırlanan karışımın önce 95 o C de 10 dakika tutulmasından sonra her bir döngüsü; 95 o C de 30 saniye, 55 o C de 1 dakika, 72 o C de 30 saniye olacak şekilde 34 döngü yapılmıştır. Son döngüden sonra örnekler, 72 o C de 10 dakika tutularak PZR işlemi tamamlanmıştır. İncelenen bireylerin FXID yönünden genotipleri elde edilen PZR ürünlerinin % 2 lik agaroz jel elektroforezi ile belirlenmiştir. 8

Erciyes Üniv Vet Fak Derg 9(1) 7-12, 2012 G. YAŞAR, B. AKYÜZ Resim 1. M; 50 bç lik DNA merdiveni, 1: FXID taşıyıcı kontrol: 2: FXID homozigot normal kontrol; 3 FXID taşıyıcı birey (a: 244 ve b: 320 bç lik PZR ürünleri): 4-6 FXID yönünden homozigot normal bireyler Bulgular Yapılan PZR sonunda, taşıyıcı bireyde 244 ve 320 bç lik iki bant, homozigot normal bireylerde ise 244 bç lik tek bant görülmüştür (Resim 1). İncelenen 150 örnek içerisinden sadece birinin FXID taşıyıcısı olduğu ve taşıyıcıların prevalansının yaklaşık olarak %0.7 olduğu belirlenmiştir. İncelenen örneklerde FXID yönünden homozigot bireylere rastlanılmamıştır. Tartışma ve Sonuç Süt sığırcılığı işletmelerinde hedef, eldeki damızlık varlığından en yüksek verimi elde etmektedir. Dolayısıyla bir işletmede bu hedefe ulaşmayı engelleyecek bakteriyel ve viral enfeksiyonlar, metabolik hastalıklar, beslenme hastalıkları ve sürü idaresinden kaynaklanan sebeplerin damızlıkların seçiminden önce ve seçilmelerinden sonra periyodik olarak kontrol edilmeleri gereklidir. Süt sığırcılığında hayvan başına alınan verimin düşmesinde etkili olan sebeplerden başka özellikle 1990 lı yıllardan itibaren kalıtsal hastalıklar konusu da önemini giderek artırmıştır. Son yıllarda geliştirilen moleküler genetik metotları, kalıtsal hastalıklar yönünden damızlık adaylarının durumları henüz yavru iken hatta embriyonal aşamada belirlenmesine olanak vermektedir. Ancak kalıtsal hastalıklar, hastalık kaynağı taşıyıcıların belirlenmesine kadar, özellikle son birkaç on yıldır süt sığırı yetiştiriciliğinde yaygın olarak kullanılan suni tohumlama yöntemi nedeniyle çok kısa sürede ülkeler hatta kıtalar aşarak küresel bir problem olabilmektedir. Türkiye de verim kayıplarına neden olan sebepler arasında yetiştiriciler ve veteriner hekimler tarafından en az bilinenler ve en az önemseneni kalıtsal hastalıklardır. Kendi damızlık stokunu oluşturan ülkeler, özellikle erkek damızlık adaylarını, her ırkta en yaygın görülen kalıtsal hastalıklar yönünden tarayıp, bilinen kalıtsal bozukluklar yönünden genotip bilgilerini damızlık kataloglarına kaydederler. Ancak Türkiye de kalıtsal bozukluklar konusu sadece konu ile ilgili çalışmaları olan araştırıcıların ilgisini çekmektedir. Bir gende meydana gelen mutasyon, yavrunun ölümüne veya döl tutma problemlerine neden olarak döl verimini düşürür. Bu durum işletme için ekonomik kayba neden olurlar. Bazı durumlarda da hasta yavrular doğar, doğan hasta yavrularda kalıtsal hastalığın neden olduğu semptomların tedavisi amacıyla yapılan veteriner hekim müdahaleleri ve sağlık harcamaları işletme için ayrıca ekonomik kayba neden olabilmektedir. Özelliklede erkek damızlıkların, hasta yavru doğumuna neden olabileceği için damızlık olarak kullanılmadan önce belirli kalıtsal hastalıklar yönünden genotiplerinin belirlenerek taşıyıcıların yetiştirme programlarından çıkartılmaları gereklidir (10). 9

Holştaynlarda faktör XI yetmezliği Erciyes Üniv Vet Fak Derg 9(1) 7-12, 2012 Holştayn sığır ırkı, süt sığırı yetiştiriciliğinde dişilerin yüksek süt verimi, erkeklerin ise yüksek etçilik özelliklerinden dolayı tüm dünyada en çok tercih edilen sütçü sığır ırkıdır. Holştayn ırkına ait erkek buzağıların sadece %14 ü damızlık olarak kullanılmaktadır. Bu uygulama ise tüm dünyadaki Holştayn ırkı içindeki akrabalığı yükselterek FXID gibi kalıtsal hastalıkların tüm populasyona kısa sürede yayılmasına neden olabilmektedir (14). FXID ilk olarak 1969 yılında Marron ve arkadaşları tarafından ABD de yetiştirilen Holştayn sığırlarında bildirilmiştir (8). Daha sonra Japon Siyah sığır ırkında FXI geninin 9. ekzonunda 15 baz çifti uzunluğunda bir parçanın eklenmesi sonucu FXID in geliştiği bildirilmiştir (16). Hindistan da yetiştirilen Karan Fries ırkı sığırlarda, yine Hindistan da yetiştirilen farklı ekzotik sığır (B. taurus) ırklarında, zebularda (B. indicus), B. taurus x B. indicus melezlerinde ve Hindistan da yetiştirilen mandalarda (Bubalus bubalis) mutant FXID alelline rastlanılmamıştır (19). Bu bulgular yerli sığır ırklarında FXID ye neden olan allelin bulunması konusunda olasılığın düşük olduğunu düşündürtmektedir. Ancak yerli ırkların hem ekzon 12 hem de ekzon 9 da görülen insersiyonlar yönünden taranmaları düşünülebilir. Türkiye de bulunan yerli sığır ırklarında FXID yönünden yapılan bir çalışma olmamıştır. Ayrıca, Türkiye gibi ülkelerde yerli sığır ırklarının verimlerinin artırılması amacıyla farklı kültür ırkları ile melezleme çalışmaları yapılmaktadır. Bu nedenle, özellikle erkek melezleri FXID ye neden olan mutant allel yönünden taranabilirler. Çünkü Türkiye de ekstansif yetiştiriciliğin yapıldığı bölgelerde suni tohumlama yerine fenotipik olarak uygun görünüşlü erkek hayvanlar damızlık olarak kullanılmaktadır. Bu uygulama ise FXID mutant allelinin yerli hayvan varlığına da bulaşma olasılığını ortaya çıkarmaktadır. Marron ve arkadaşları ABD de 419 baş Holştayn sığırı kullanılarak yapılan çalışmada, incelenen örnekler içerisinde FXID ye neden olan mutant allel frekansının %1.2 olduğunu bildirilmişlerdir (11). Ghanem ve Nishibori Batı Japonya da 2006-2007 yılları arasında 12 farklı çiftlikten 500 baş Holştayn ineği FXID yönünden incelemiş ve taşıyıcıların insidensinin %1 olduğunu belirlemişlerdir (6). Japonya da döl tutma problemi olan 40 baş inek incelenmiş ve bu hayvanlarda FXID prevalansının %2.5 olduğu belirlenmiştir (7). Polonya da, 103 ü farklı çiftliklerden rasgele seçilmiş sağlıklı hayvan, 28 i döl tutma problemli (repeat breeder) inek ve 9 u ise tekrarlayan mastitis gösteren bireylerden oluşan toplam 140 baş Holştayn inek incelenmiş; rastgele seçilen 103 baş ve mastitisli 9 baş inekte FXID sebep olan mutant allele rastlanılmamıştır. Ancak 28 baş döl tutma problemi olan ineklerden bir tanesinin FXID mutasyonu yönünden taşıyıcı olduğu belirlenmiştir (8). FXID ye neden olan mutant alleli genotiperinde bulunduran hayvanların östrus sikluslarında luteolizisin yavaş gerçekleştiği bildirilmiştir. Bu durum aynı zamanda ovulasyona yakın zamanda oluşması gereken östradiol pikinin yavaşlığına eşlik eden küçük folikül gelişimiyle ilişkilendirilebilir. Ayrıca hasta hayvanlarda döl tutma probleminin prevalansının diğerlerinden %50 daha fazla olduğu bildirilmiştir (6). Japonya da rastgele seçilerek incelenen 123 Japon Siyah sığırından yedisinin mutant FXID alleli yönünden homozigot oldukları, ancak bu hayvanların her hangi bir semptom göstermedikleri belirlenmiştir. Ayrıca incelenen bu hayvanlardan 51 inin ise taşıyıcı oldukları belirlenmiştir (16). Watanabe ve ark. (20) inceledikleri Japon Siyah sığırları içerisinde FXID taşıyıcısı ve homozigot hasta oldukları belirlenen bireyler arasında repeat breedering olarak adlandırılan döl tutma problemlerinin bulunduğunu bildirilmişlerdir. Bu da göstermektedir ki FXID yönünden döl tutma problemleri olan hayvanları incelemenin taşıyıcı bulma şansını artırabilecektir. Türkiye de FXID ye neden olan mutant allelin varlığı, Meydan ve arkadaşları tarafından incelenen 225 Holştayn ineğin dört tanesinin (yaklaşık olarak % 1.7) FXID taşıyıcısı olduğunu belirledikleri çalışma ile ilk kez 2009 yılında ortaya konmuştur (13). Aynı araştırıcıların Ankara ve Şanlıurfa da mezbahaya getirilen 350 baş dişi Holştayn sığırın incelendiği çalışmada, FXID mutant allelinin frekansını %0.6, taşıyıcıların prevalansını ise yaklaşık olarak %1.2 olarak bildirmişlerdir (12). Öner ve arkadaşları 2010 yılında Bursa ilinde yetiştirilen 170 baş Holştayn inek kullanarak yaptıkları çalışmada, inceledikleri örneklerden ikisinin FXID taşıyıcısı olduğunu ve taşıyıcıların prevalansının %1.17 olduğunu bildirmişlerdir (17). Bu çalışmada ise Kayseri ilinde yetiştirilen 150 baş dişi Holştayn incelenmiş ve bir tane taşıyıcı bireye rastlanılmıştır. Çalışma sonunda incelenen hayvanlar arasında taşıyıcıların prevalansının yaklaşık olarak % 0.7 olduğu belirlenmiştir. Bu çalışmada Türkiye de FXID nin araştırılması amacıyla yapılan çalışmalarda elde edilen prevalanslardan düşük olduğu sonucu ortaya çıkmıştır. Bu düşük prevalansın sebebinin, incelenen hayvan sayısı ve örneklerin toplandığı çiftliklerde döl tutma problemli bireylerin ayrılması ile FXID yönünden farkında olmadan bir seleksiyon yapılmış olmasından kaynaklanabileceği düşünülmüştür. Meydan ve ark. (12) nın, 350 baş örneği inceledikleri ikinci çalışmalarında, çalışma materyalini mezbahaya getirilen hayvanlar oluşturmuştur. Hayvanların niçin mezbahaya getirildikleri hakkında bir bilgi yoktur. Döl tutma problemi olan hayvanların ayıklanarak kesime sevk edilmiş olabileceği ve bu işleminde prevalanstaki 10

Erciyes Üniv Vet Fak Derg 9(1) 7-12, 2012 G. YAŞAR, B. AKYÜZ yüksekliğe neden olabileceği düşünülmektedir. Diğer taraftan, Türkiye nin farklı bölgelerinde yapılan Holştayn yetiştiriciliğinde farklı ülkelerden gelen spermaların kullanılmasından dolayı taşıyıcıların prevalansı arasında fark ortaya çıkmış olabilir. Çünkü Hindistan da yapılan bir çalışmada taşıyıcı hayvanların hepsinin Danimarka orijinli bir boğanın yavruları oldukları belirlenmiştir (19). Bu dört çalışma Türkiye Holştayn popülasyonunda mutant FXID alellinin varlığını göstermektedir. Boğaların ve damızlık dişilerin bu kalıtsal bozukluk yönünden taranmaları gereklidir. Türkiye de yetiştirilen Holştayn ırkı sığırlarda FXID, BLAD, CVM ve DUMPS gibi kalıtsal hastalıkların neden olduğu hastalıklara ait klinik vakaların gerçek sayısı bilinmemektedir. Fakat bu hastalıklar yönünden taşıyıcılarının bulunması, dikkatli bakıldığında bu kalıtsal hastalıklar yönünde homozigot bireylerin görülebileceği anlamına gelmektedir. Yapılan çalışmada, Türkiye deki Holştayn popülasyonunda FXID ye sebep olan mutant allelin varlığının araştırılması ve ileride Türkiye deki damızlıkların mutant FXID yönünden taranabilmesi için rutin kullanımda uygulanabilir bir yöntemin belirlenmesi amaçlanmıştır. Moleküler seviyede belirlenen kalıtsal anomalilerin sayısının gün geçtikçe artacağını söylemek yanlış olmayacaktır. Moleküler genetik alanındaki mevcut gelişmeler, kalıtsal anomalilerden sorumlu mutasyonları belirlemek için geliştirilen testlerin, yakın gelecekte Türkiye deki ıslah programlarında da kullanılacağını düşündürtmektedir. Gittikçe küçülen ve uluslar arası ticaretin öneminin arttığı, ticaret için ülkeler arasındaki gümrük engellerinin kalktığı dünyada, kalıtsal hastalıkların tanısının yapılması, mutasyonun orijini olan boğaların tüm dünyada kullanılmasını önleyebileceği için kritik önemi bulunmaktadır. Kaynaklar 1. Akyüz B, Bayram D, Ertugrul O, İşcan KM. Türkiye de yetiştirilen Holştayn ve bazı yerli sığırlar ırklarında citrullinemia allelinin belirlenmesi. Erciyes Üniv Vet Fak Derg 2008; 5(1): 17-20. 2. Akyüz B, Ertuğrul O. Detection of bovine leukocyte adhesion deficiency (BLAD) in Turkish native and Holstein cattle. Acta Vet Hung 2006; 54: 173-8. 3. Citek J, Rehout V, Hajkova J, Pavkova J. Monitoring of the genetic health of cattle in the Czech Republic. Vet Med Czech 2006; 51(6): 333-9. 4. Čítek J, Řehout V, Hanusová L, Vrabcová P. Sporadic incidence of factor XI deficiency in Holstein cattle. J Sci Food Agric 2008; 88: 2069-72. 5. Distl O. The use of molecular genetics in eliminating of inherited anomalies in cattle. Arch Tierz Dummerstorf 2005; 48(3): 209-18. 6. Ghanem ME, Nishibori M. Genetic description of factor XI deficiency in Holstein semen in Western Japan. Reprod Dom Anim 2009; 44: 792-6. 7. Ghanem ME, Nishibori M, Nakao T, Nakatani K, Akita M. Factor XI mutation in a Holstein cow with repeat breeding in Japan. J Vet Med Sci 2005; 67(7): 713-5. 8. Gurgul A, Rubis D, Slota E. Identification of carriers of the mutation causing coagulation factor XI deficiency in Polish Holstein-Friesian cattle. J Appl Genet 2009; 50(2): 149-52. 9. Karslı T, Şahin E, Karslı BA, Alkan S, Balcıoğlu MS. Identification of alleles for factor XI (FXID) and uridine monophosphate synthase (DUMPS) deficiencies in Holstein cows reared in Antalya. Kafkas Univ Vet Fak Derg 2011; 17(3): 503-5. 10. Kulaklı GN, Akyüz B. Kayseri bölgesinde yetiştirilen Holştayn sığırlarında kompleks vertabral malformasyon hastalığı geninin allel frekansının belirlenmesi. Erciyes Üniv Vet Fak Derg 2011; 8(2):69-74. 11. Marron BM, Robinson JL, Gentry PA, Beever JE. Identification of a mutation associated with factor XI deficiency in Holstein cattle. Anim Genet 2004; 35(6): 454-6. 12. Meydan H, Yildiz MA, Agerholm JS. Screening for bovine leukocyte adhesion deficiency, deficiency of uridine monophosphate synthase, complex vertebral malformation, bovine citrullinaemia, and factor XI deficiency in Holstein cows reared in Turkey. Acta Vet Scand 2010; 52: 56. 13. Meydan H, Yildiz MA, Özdil F, Gedik Y, Özbeyaz C. Identification of factor XI deficiency in Holstein cattle in Turkey. Acta Vet Scand 2009; 51: 5. 14. Mirck MH, Von Bannisseht-Wijsmuller TH, Timmermans-Besselink WJH, Van Luijk JHL, Buntjer JB, Lenstra JA. Optimization of the PCR test for the mutation causing bovine leukocyte adhesion deficiency. Cell Mol Biol 1995; 41(5): 695-8. 11

Holştaynlarda faktör XI yetmezliği Erciyes Üniv Vet Fak Derg 9(1) 7-12, 2012 15. Mukhopadhyaya PN, Jha M, Muraleedharan P, GuptaPP, Rathod RN, Mehta HH, Khoda VK. Simulation of normal, carrier and affected controls for large-scale genotyping of cattle for factor XI deficiency. Genet Mol Res 2006; 5 (2): 323-32. 16. Ohba Y, Takasu M, Nishii N, Takeda E, Maeda S, Kunieda T, Kitagawa H. Pedigree analysis of factor XI deficiency in Japanese Black cattle. J Vet Med Sci 2008; 70(3): 297-9. 17. Oner Y, Keskin A, Elmaci C. Identification of BLAD, DUMPS, citrullinaemia and factor XI deficiency in Holstein cattle in Turkey. Asian J Anim Vet Adv 2010; 5(1): 60-5. 18. Patel RK, Singh KM, Soni KJ, Chauhan B, Sambasiva RKRS. Lack of carriers of citrullinaemia and DUMPS in Indian Holstein cattle. J Appl Genet 2006; 47: 239-42. 19. Patel RK, Soni KJ, Chauhan JB, Singh KM, Rao KRSS. Factor XI deficiency in Indian Bos taurus, Bos indicus, Bos taurus x Bos indicus crossbreds and Bubalus bubalis. Genet Mol Biol 2007; 30(3): 580-3. 20. Watanabe D, Hirano T, Sugimoto Y, Ogata Y, Abe S, Ando T, Ohtsuka H, Kunieda T, Kawamura S. Carrier rate of factor XI deficiency in stunted Japanese Black cattle. J Vet Med Sci 2006; 68(12): 1251-5. Yazışma Adresi : Doç. Dr. Bilal AKYÜZ Erciyes Üniversitesi Veteriner Fakültesi Genetik Anabilim Dalı, Melikgazi/KAYSERİ Tel: 0352 207 66 66/29721 E-mail: bakyuz@erciyes.edu.tr 12