Türkiye buğday faunası için yeni bir tür, Meloidogyne artiellia (Franklin) nın morfolojik ve moleküler yöntemlerle tanımlanması



Benzer belgeler
Bitlis ili patates üretim alanlarında Kök-ur nematodu (Meloidogyne chitwoodi Golden, O Bannon, Santo et Finley, 1980) nun saptanması 1

Doğu ve Güneydoğu Anadolu Bölgelerinde Kök Ur Nematodları, Meloidogyne spp. (Goeldi) Üzerinde Araştırmalar

DİYARBAKIR İLİ BUĞDAY, SEBZE VE BAĞ ALANLARINDA ÖNEMLİ BİTKİ PARAZİTİ NEMATOD TÜRLERİNİN BELİRLENMESİ *

Determination of Meloidogyne incognita (Kofoid & White, 1919) (Nemata:Meloidogynidae) Races in Vegetable Fields in Erbaa and Niksar plains in Tokat

Kök-ur Nematodları ve Konukçuları Arasındaki İlişkiler

Araştırma Makalesi (Research Article)

Samsun ili lahana ekim alanlarındaki kist nematodları (Tylenchida: Heteroderidae) nın yayılışı ve bulaşıklık derecesi 1

Araştırma Makalesi (Research Article)

Türk. entomol. bült., 2016, 6(4): ISSN X DOI: E-ISSN

ÖZGEÇMİŞ AKADEMİK VE MESLEKİ DENEYİM

YÜKSEKÖĞRETİM KURULU YARDIMCI DOÇENT : Sinop Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Biyoloji Bölümü Sinop

Dayanıklılık Geni Cre1 in Akdeniz Tahıl Kist Nematodu, Heterodera latipons Franklin (Tylenchida: Heteroderidae) e Karşı Etkinliğinin Araştırılması

Dayanıklılık Geni Cre1 in Akdeniz Tahıl Kist Nematodu, Heterodera latipons Franklin (Tylenchida: Heteroderidae) e Karşı Etkinliğinin Araştırılması

Summary. Key words: Lagenaria siceraria, root-knot nematode, resistant, watermelon, grafting

Orta Karadeniz Bölgesi Seralarındaki Kök-Ur Nematodlarının Yayılış ve Bulaşıklık Oranı

Meloidogyne javanica ve Meloidoyne incognita Kök-ur Nematodlarının Bazı Yağlık Zeytin ve Badem Çeşitlerindeki Saldırganlıklarının Belirlenmesi

Bazı sanayi domatesi çeşitlerinin Kök ur nematodları [Meloidogyne incognita (Kofoid & White) Chitwood] na dayanıklılıklarının araştırılması

Domateste Kök ur nematodu (Meloidogyne javanica (Treub, 1885) Chitwood) na dayanıklılık sağlayan Mi-1.2 geninin Mi23 SCAR markırı ile belirlenmesi

ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ

Fen Bilimleri Enstitüsü Gıda Mühendisliği Anabilim Dalı Devam Ediyor (2008 -)

ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ

Summary. Orijinal araştırma (Original article) Adem ÖZARSLANDAN 2 İ. Halil ELEKCİOĞLU 3*

Nematod nedir? İpliksi solucan nematos + eidos Baş ve kuyrukta incelen silindirik şekilli Hayvan, bitki parazitleri, çürükçül vs. En büyügü 8 m Placen

Ege Bölgesi patates alanlarında Globodera rostochiensis Wollenweber, (Tylenchida: Heteroderidae) in moleküler yöntemlerle saptanması

06-PHYLIB-EUPHRESCO PROJE SONUÇ TOPLANTISI Ekim Edinburgh, İskoçya

ÖZGEÇMİŞ. YURT İÇİ MESLEKİ EĞİTİMLER Konu Yer Tarih Sebze Islahında Genom Analizleri ve Moleküler Haritalama

Çanakkale ili lahana ekim alanlarında kist nematodu türlerinin (Heterodera spp.) belirlenmesi 1

Araştırma Makalesi (Research Article)

depo zararlılarına karşı gerekli olan uygun savaş yöntemleri hakkında bilgi sahibi olup bunu gelecekteki işlerinde kullanacaklardır.

Öğr. Gör. Tuğba GÜLEÇ

Bazı Ceviz (Juglans regia L.) Çeşitlerinin Çimlenme ve Çöğür (Anaçlık) Gelişme Performanslarının Belirlenmesi

Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü

Ordu Üniv. Bil. Tek. Derg., Cilt:5, Sayı:1, 2015,50-55/Ordu Univ. J. Sci. Tech., Vol:5, No:1,2015,51-55

ÖNEMLİ ZARARLILARI. Spodoptera spp. (Yaprak kurtları) yumurta

Kök-ur nematodu Meloidogyne incognita nın Ordu ili kivi bahçelerindeki populasyon dalgalanması*

Bazı aspir genotiplerinin pas hastalığına karşı reaksiyonları hakkında ön çalışma 1

YURTDIŞI GEÇİCİ GÖREV DÖNÜŞÜ BİLGİLENDİRME TOPLANTISI Sunan: Dr. Suat KAYMAK. Zirai Mücadele Merkez Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü.

Araştırma Makalesi (Research Article)

ÖZET. Yüksek Lisans Tezi. Đmge Đ. TOKBAY. Adnan Menderes Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Tarla Bitkileri Anabilim Dalı


ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ ÖZGEÇMİŞ

POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU (PZR-PCR) VE RESTRİKSİYON PARÇA UZUNLUĞU POLİMORFİZMİ (RFLP)

TÜBERKÜLOZ DIŞI MİKOBAKTERİLERİN TANIMLANMASINDA PCR-RFLP VE DNA SEKANS ANALİZİ SONUÇLARININ KARŞILAŞTIRILMASI

33. Current Situation of Bingöl Province in The Context of Crop Production

ĠKLĠM DEĞĠġĠKLĠĞĠ ve TARIM VE GIDA GÜVENCESĠ

ODTÜ BİYOTEKNOLOJİ 25.YIL. Prof. Dr. Fusun Eyidoğan Başkent Üniversitesi

EGE ÜNİVERSİTESİ BİLİMSEL ARAŞTIRMA PROJE KESİN RAPORU EGE UNIVERSITY SCIENTIFIC RESEARCH PROJECT REPORT

Manisa da Bağlarda Kamalı Nematod, Xiphinema index in (Dorylaimida: Longidoridae) Populasyon Yoğunluğu

Organik domates yetiştiriciliğinde Kök-ur nematodları (Meloidogyne spp.) na karşı bazı organik ve mikrobiyal gübrelerin nematisidal etkinlikleri 1

Molecular Characterization of Human Isolate of Fasciola hepatica in Turkey

Moleküler Nematoloji. Eğitim Süresi: 6 ay (29 Aralık Haziran 2014) Eğitim Yeri: Kaliforniya Üniversitesi, Davis Bitki Bilimleri Bölümü

Malatya ili kayısı bahçelerinde yeni bir zararlı Eurytoma schreineri Schreiner (Hymenoptera:Eurytomidae)

ÖDEMİŞ İLÇESİNDE PATATES ÜRETİMİ, KOŞULLAR ve SORUNLAR

AKADEMİK ÖZGEÇMİŞ ve ESERLER LİSTESİ

Türk Tarım - Gıda Bilim ve Teknoloji Dergisi

ZEYTİN-ZEYTİNYAĞI ÜRETİM MALİYETLERİ ÜZERİNE UZMAN ÇALIŞMA GRUBU SONUÇLARI

Ankara ili armut (Pyrus communis L.) bahçelerinde saptanan Tylenchida (Nematoda) takımına ait bitki paraziti nematodlar 1

Sevilhan MENNAN* Summary

Türkiye Cumhuriyeti-Ekonomi Bakanlığı,

SOĞAN YETİŞTİRİCİLİĞİ GİRİŞ:

Kök lezyon nematodları (Pratylenchus spp.) nın sert ve yumuşak çekirdekli meyve anaçlarında konukçu reaksiyonları 1

Hafta VIII Rekombinant DNA Teknolojileri

Bazı biber hat ve çeşitlerinin kontrollü şartlar altında Meloidogyne incognita (Kofoid & White, 1919) Chitwood, 1949 ırk1 e karşı reaksiyonu

Arpa (Hordeum vulgare L.) Bitkisinde Mikrobiyel Gübrelerin Çimlenme Üzerine Etkisinin Belirlenmesi. Çiğdem KÜÇÜK, Cenap CEVHERİ

Bursa İli Nilüfer İlçesi Görükle Mevkii Topraklarında Entomopatojen Nematod Sürveyi *

SNP TEK NÜKLEOTİD POLİMORFİZMLERİ (SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS)

Türkiye Cumhuriyeti-Ekonomi Bakanlığı,

KİŞİSEL BİLGİLER. Toprak Bilimi ve Bitki Besleme Bölümü Toprak Bilimi ve Bitki Besleme Bölümü -1997

TOHUMCULUK ÜRETİM. Türkiye Cumhuriyeti-Ekonomi Bakanlığı,

EGE ÜNİVERSİTESİ BİLİMSEL ARAŞTIRMA PROJE KESİN RAPORU EGE UNIVERSITY SCIENTIFIC RESEARCH PROJECT REPORT

ÖZGEÇMİŞ. Yıl Unvanı Görev Yeri Arş. Gör. Fen Edebiyat Fakültesi Giresun Üniversitesi 2000-

Erbey, M., Bazı Dysmachus (Diptera: Asilidae) türlerinin spermateka yapıları.

221 Araştırma Makalesi

VIII. Hafta: Şeker Pancarında Toprak altı Zararlılar; Nematodlar, Tel kurtları, Toprak Kurtları ve Toprak Pireleri

Hatay İli Heterocera (Lepidoptera) Faunasına Katkılar

TÜRKİYE ODALAR VE BORSALAR BİRLİĞİ

TÜBİTAK BİDEB LİSE ÖĞRETMENLERİ FİZİK, KİMYA, BİYOLOJİ, MATEMATİK- PROJE DANIŞMANLIĞI EĞİTİMİ ÇALIŞTAYI LİSE3 (Çalıştay 2013) BİYOLOJİ GRUP TUHAF

Türkiye Balıkları ve Temel Morfolojisi

Uygulamalı. Moleküler Biyoloji Teknikleri, Temel Mikrobiyoloji, Temel Biyokimya ve Laboratuvar Yönetimi Kursları. Yaz Dönemi Başlıyor!

Gıda Tarım ve Hayvancılık Bakanlığı 2012 YILI TARIMSAL DESTEKLER

Ege Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Bahçe Bitkileri Anabilim Dalı / 2010

Patates yumrularındaki Dit Yi enchus di psaci ve D. dest ruct or ( Nematoda : Tylen choidea ) arasındaki biyolojik ve morfolojik farklar

Tablo 4- Türkiye`de Yıllara Göre Turunçgil Üretimi (Bin ton)

6. Seçilmiş 24 erkek tipte ağacın büyüme biçimi, ağacın büyüme gücü (cm), çiçeklenmenin çakışma süresi, bir salkımdaki çiçek tozu üretim miktarı,

Türkiye Cumhuriyeti-Ekonomi Bakanlığı,

DÜNYA DA VE TÜRKİYE DE ORGANİK ÜZÜM YETİŞTİRİCİLİĞİ

EVALUATION OF DIYARBAKIR PROVINCE IN TERMS OF CROP PRODUCTION

I. KISIM: Temel Bilgiler ve Muhafaza

ÖZGEÇMİŞ. YURT İÇİ MESLEKİ EĞİTİMLER Konu Yer Tarih Sebze Islahında Genom Analizleri ve Moleküler Haritalama

T.C. GIDA,TARIM VE HAYVANCILIK BAKANLIĞI TÜRKİYE TARIM HAVZALARI ÜRETİM VE DESTEKLEME MODELİ. 30 Havza

T.C. SÜLEYMAN DEMİREL ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ ISPARTA İLİ KİRAZ İHRACATININ ANALİZİ

Dünya ve 20 Gelişmiş Ülke Ekonomisinde Hayvancılığın Yeri

VİRAL TANI KİTLERİ (GFJ-480)

Ödemiş (İzmir) ilçesi sert ve yumuşak çekirdekli meyve fidanlıklarında bulunan bitki paraziti nematod faunası 1

EGE ÜNİVERSİTESİ BİLİMSEL ARAŞTIRMA PROJE KESİN RAPORU EGE UNIVERSITY SCIENTIFIC RESEARCH PROJECT REPORT

YONCA ISLAHINDA YEREL POPÜLASYONLARIN DEĞERLENDİRİLMESİ

KİŞİSEL BİLGİLER EĞİTİM BİLGİLERİ

FEN ve MÜHENDİSLİK BİLİMLERİ DERGİSİ

Türkiye de ve Dünyada Makarnalık (Durum) Buğdayı Pazarı

Polimeraz Zincir Reaksiyonu. Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

Transkript:

Türk. entomol. derg., 2014, 38 (2): 189-196 ISSN 1010-6960 Orijinal araştırma (Original article) Türkiye buğday faunası için yeni bir tür, Meloidogyne artiellia (Franklin) nın morfolojik ve moleküler yöntemlerle tanımlanması Morphological and molecular identification of a new species Meloidogyne artiellia (Franklin) on wheat fauna in Turkey Mustafa İMREN 1* Adem ÖZARSLANDAN 2 Ece B. KASAPOĞLU 3 Halil TOKTAY 4 İbrahim Halil ELEKCİOĞLU 3 Summary Root-knot nematodes (Meloidogyne spp.) are among some of the most economically important plant parasitic nematodes in the world. It is known that the nematode belong to Meloidogyne genus causes significantly crop losses in vegetables and cereals. The root-knot nematodes, M. artiellia causes damages especially cereals, legumes and cruciferous crops. Isolates of M. artiellia recovered from root and soil samples collected from wheat fields in 2012 growing season were firstly identified by using morphological and molecular aspects in Hatay province of Turkey. M. artiellia was morphologically identified by using morphological features and allometric criteria of second stage juvenile and female. Also, it was molecularly identified by using the sequences of partial mitochondrial DNA cytochrome C oxidase subunit (COI) gene region and clearly separated from other species. Key words: Meloidogyne artiellia, morphology, nucleotide polymorphism, wheat. Özet Kök-ur nematodları (Meloidogyne spp.) dünyada ekonomik önem sahip bitki paraziti nematodları arasındadır. Meloidogyne cinsine ait nematod türleri sebzelerde ve tahıllarda önemli oranda ürün kayıplarına neden oldukları bilinmektedir. Kök ur nematodu, M. artiellia özellikle tahıllar, baklagiller ve cruciferae familyasına ait ürünlerde zarara neden olabilmektedir. Bu çalışmadaki M. artiellia izolatları Türkiye de ilk defa Hatay ili buğday ekim alanlarından 2012 yılı üretim sezonunda toplanan toprak ve kök örneklerinden elde edilmiş olup morfolojik ve moleküler olarak tanımlamaları yapılmıştır. M. artiellia, ikinci dönem larva ve dişi bireylere ait morfolojik özellikler ve allometrik kriterler esas alınarak tanımlanmıştır. Ayrıca, mitokondriyal DNA nın sitokrom C oksidaz alt ünitesine (COI) ait nükleotid dizilimleri kullanılarak moleküler olarak da tanımlanmış ve diğer kök ur nematodu türlerinden bariz olarak ayrıldığı saptanmıştır. Anahtar sözcükler: Meloidogyne artiellia, morfoloji, nükleotid polimorfizmi, buğday. 1 Abant İzzet Baysal Üniversitesi Ziraat ve Doğa Bilimleri Fakültesi, Bitki Koruma Bölümü, Gölköy Kampüsü, Bolu 2 Biyolojik Mücadele Araştırma İstasyonu Müdürlüğü, Yüreğir, Adana. 3 Çukurova Üniversitesi, Ziraat Fakültesi, Bitki Koruma Bölümü, Sarıçam, Adana. 4 Niğde Üniversitesi, Tarım Bilimleri ve Teknolojileri Fakültesi, Bitkisel Üretim ve Teknolojileri Bölümü, Merkez Yerleşke, Niğde * Sorumlu yazar (Corresponding author) e-mail: m.imren37@gmail.com.com Alınış (Received): 22.10.2013 Kabul ediliş (Accepted): 08.05.2014 189

Türkiye buğday faunası için yeni bir tür, Meloidogyne artiellia (Franklin) nın morfolojik ve moleküler yöntemlerle tanımlanması Giriş Türkiye de kültür bitkilerinde arız olan birçok hastalık, zararlı ve yabancı ot bulunmaktadır. Dünya ekonomisine yıllık maliyeti yaklaşık 100 milyar Euro olduğu tahmin edilen bitki paraziti nematodlar, zararlı etmenler içerisinde en önemli grubu oluşturmaktadır (Moens et al., 2009). Bitki paraziti nematolar içerisinde de bitki köklerinde oluşturdukları irili - ufaklı urlar ile karakterize edilen kök ur nematodları (Meloidogyne spp.) bu grubun ana zararlı konumundadır. Dünyanın tropik ve subtropik iklim bölgelerinde; kök ur nematodlarının farklı türleri, ırkları ve çok sayıda virülent - avirülent populasyonlarının olduğu bildirilmektedir (Decker & Fritzsche, 1991; Xu et al., 2001). Dünya da Meloidogyne cinsine ait 2009 yılına kadar tespit edilmiş 97 tür bulunmaktadır (Hunt & Handoo, 2009). Türkiye de 2011 yılına kadar gerçekleştirilen araştırma bulgularına göre 48 farklı lokasyonda, 66 ayrı konukçuda 240 bitki paraziti nematod türü tespit edilmiştir. Bu çalışmalar içinde M. incognita (Chitwood), M. arenaria (Chitwood), M. chitwoodi (Golden, O'Bannon, Santo & Finley), M. exigua (Göldi), M. hapla (Chitwood), M. javanica (Chitwood), M. thamesi (Goodey) ve M. ethiopica (Whitehead) olmak üzere toplam 8 adet kök ur nematodu türü tespit edilmiştir (Kepenekci, 2012; Aydınlı et al., 2013). Buğday ülkemizin en önemli tarımsal ürünü olup, 8.5 milyon hektar ekim alanında 19-21 milyon ton üretimi yapılmaktadır (Tuik, 2013). Buğday yetiştiriciliğinde bitki paraziti nematodların dünyada her yıl ortalama %7-10 oranında ürün kaybına neden oldukları bildirilmektedir (Sasser, 1987). Dünyada buğdayda ürün kayıplarına neden olan bitki paraziti nematodlar; tohum gal nematodu, soğan sak nematodu, kök ur nematodu, kök yara nematodu ve tahıl kist nematodu olduğu belirtilmektedir (Nicol, 2002). Buğdayda zararlı nematodlar içerisinde kök ur nematodları önemli bir yere sahip olup, M. naasi (Franklin) ve M. artiellia (Franklin) en yaygın bulunan türler olduğu bildirilmektedir (Sikora, 1988). M. artiellia geniş bir konukçu dizisine sahip olup, Akdeniz Havzası nda tahıllar (mısır ve yulaf hariç), Cruciferae familyasına ait ürünler ile baklagillerde (mercimek hariç) yaygın olarak bulunduğu bildirilmektedir (Kyrou, 1969; Ritter, 1972; Tobar Jiménez, 1973; DiVito & Zaccheo, 1987). Kök ur nematodlarının Akdeniz türü olarak bilinen M. artiellia Cezayir, İngiltere, Fransa, Yunanistan, İtalya, İsrail, Suriye, Tunus ve Sibirya da bulunduğu rapor edilmiştir (Greco et al., 1992 a, b; Shiabova, 1981). M. artiellia tahıllar içerisinde özellikle arpa (Hordeum vulgare) ve makarnalık buğdayda (Triticum durum ve T. vulgare) zarar oluşturmaktadır. M. artiellia nın bitki kökünde küçük urlar meydana getirdiği, iletim demetlerinin yapısını bozduğu böylelikle bitkide bodurluk, yapraklarda sararma ile başağının seyrek ve küçük olmasına neden olduğu bildirilmektedir (DiVito & Zaccheo, 1987). M. artiellia Akdeniz Havzası ndaki ülkelerde sırasıyla İtalya, İspanya, Fransa ve Yunanistan da buğdayda önemli derecede zarara neden olduğu ve ortalama ürün kaybının %10-12 arasında gerçekleştiği belirtilmektedir (Kyrou, 1969; Ritter, 1972; Tobar Jiménez, 1973; DiVito et al., 1987). Özelliklede nohut ve buğday münavebe sisteminde verimde %80 lere varan kayıplara neden olduğu rapor edilmiştir (DiVito & Greco, 1988). M. artiellia buğdayda beslenmesi ile doğrudan zararının yanı sıra hastalıkların (Fusarium spp.) bitkiye infeksiyonuna yardımcı olması ile de dolaylı olarak zarara neden olabilmektedir (Castillo et al., 2003). M. artiellia nın konukçusu olduğu kültür bitkilerinin (en yoğun buğday ve nohut) açık ve geniş alanlarda üretiminin yapılıyor olmasından dolayı zararlıya karşı mücadelede en ekonomik yöntemin kültürel önlemler ve dayanıklı/tolerant çeşitlerin kullanımı olduğu bilinmektedir. Ülkemizde M. artiellia Uşak ta bir nohut lokasyonunda saptanmış olmakla birlikte buğdayda tespit edildiğine yönelik her hangi bir kayda rastlanılamamıştır (DiVito et al., 1994). Bu çalışmada Hatay ili buğday alanlarından alınan dört adet kök ur nematodu populasyonunun morfolojik ve moleküler yöntemlerle teşhisi yapılmıştır. 190

İmren et.al., Türk. entomol. derg., 2014, 38(2) Materyal ve Yöntem Hatay ilinde buğday alanlarından dört farklı lokasyondan alınan kök ur nematodu populasyonu ile çalışılmıştır (Çizelge 1). Çizelge 1. Çalışmada kullanılan kök ur nematodu populasyonlarının elde edildiği yerlere ait bilgiler No Lokasyon Enlem Boylam Yükseklik 1 Akcurun (doğu) 36º 11' 56K 36º 17' 35D 170 2 Akcurun (batı) 36º 11' 56K 36º 17' 31D 149 3 Danışma 36º 11' 48K 36º 18' 20D 164 4 Kozluca - Avsuyu 36º 12' 17K 36º 18' 12D 195 Morfolojik teşhis Kök ur nematodlarının ikinci dönem larva (J 2 ) ve dişi bireylerine ait morfolojik karakterler ile morfometrik ölçümleri kullanılarak klasik teşhisi yapılabilmektedir. Bu amaçla M. artiellia nın ikinci dönem larva ve dişi bireylerine ait daimi preparatları hazırlanmıştır. İkinci dönem larva: M. artiellia ile infekteli buğday bitkisinin kök bölgesinden nematoda ait yumurta paketleri toplanmış, yumurta paketlerinden ise ikinci dönem larvalar elde edilmiştir. M. artiella ya ait ikinci dönem larvalar 65 o C de 2 dakika su banyosu yaptırılarak, TAF çözeltisi (7ml formalin (%40 formaldehyd) + 2 ml triethanolamin + 91 ml saf su) içerisinde fikse edilmiştir (Hooper, 1986). Nematodlar fiksasyon işleminden sonra çözelti 1 de (1 kısım gliserin ve 79 kısım saf su) 35 40 o C de 12 saat ve çözelti 2 de (5 kısım gliserin ve 95 kısım (%96) ethanol) 40 o C de 3 saat bekletilip gliserin içerisine alınmış ve en son lam üzerinde sabitleştirilerek tür teşhisine hazır duruma getirilmiştir (Seinhorst, 1959). Dişi Birey: M. artiellia ile infekteli buğday köklerinden toplanan yumurta paketlerinden binoküler altında dişi bireyler pens yardımıyla elde edilmiştir. M. artiellia ya ait dişi bireylerin daimi preperatları Hartman & Sasser (1985) tarafından geliştirilmiş olan Perineal Örneklerin Preperasyon Yöntemi kullanılarak hazırlanmıştır. Bu amaçla, dişilerin vulval kesitleri %45 lik laktik asit içerinde kesilerek, gliserin içerisinde sürekli preparatları yapılmıştır. Meloigodyne artiellia ya ait ikinci dönem larva ve dişi bireylerin morfolojik özellikleri ve allometrik kriterler esas alınarak klasik teşhisleri yapılmıştır. Meloigodyne artiellia nın klasik teşhisleri Erica & Venette (2004) den faydalanılarak gerçekleştirilmiştir. Moleküler teşhis Kök ur nematodlarının klasik teşhisinde kullanılan morfolojik karakterlerin bazı türlerde bir birine çok yakın olması, teşhisin deneyim gerektirmesi ve zaman alması nedeniyle klasik teşhis sonuçların moleküler bulgularla desteklenmesi istenmektedir. M. artiellia nın bir diğer kök ur nematodu türü M. graminicola (Golden & Birchfield) ile morfolojik karakterlerinin benzerlik gösterdiği bilinmekte olup, bu amaçla çalışmadaki kök ur nematodu populasyonlarına ait mitokondriyal DNA nın sitokrom C oksidaz alt ünitesinin (COI) nükleotid dizilimleri kullanılarak tür teşhisleri gerçekleştirilmiştir. DNA izolasyonu: DNA izolasyonu Waeyenberge et al. (2000) nin tek larvadan DNA elde etme protokolü esas alınarak gerçekleştirilmiştir. Bu metoda göre içerisinde 25 μl ddh 2 O bulunan PCR tüpteki (0.2 ml) 6-8 larva üzerine 25 μl WLB (+) ilave edilmiştir. Karışım 65 C de 1.5 saat ardından 99 C de 5dk thermocycle de inkübe edilerek 20 C'de muhafaza edilmiştir. DNA nın izolasyonunda kullanılan WLB (+) nin hazırlanmasında 950µl Worm Lysis Buffer WLB (-) +10 µl beta-mercaptoethanol + 40 µl (20mg/ml ProtK) kullanılmıştır. 191

Türkiye buğday faunası için yeni bir tür, Meloidogyne artiellia (Franklin) nın morfolojik ve moleküler yöntemlerle tanımlanması DNA Amplifikasyonu: M. artiellia nın genomundaki Mitokondriyal DNA nın sitokrom C oksidaz alt ünitesi (COI) forward ve reverse primerler (Çizelge 2) kullanılarak amplifike edilmiştir. PCR reaksiyonu 5 ng / μl DNA, 2.5 μl PCR tampon çözelti, 2 mm MgCI 2, 200 µm dntp, her primerden 0.4 μm primer, 1 ünite Taq DNA polimeraz ve ddh 2 O olacak şekilde toplam 25 mikrolitrede gerçekleştirilmiştir. Çizelge 2. Meloidogyne artiellia türünün moleküler tanımlanmasında kullanılan primerler Primer ismi 5_3 sekans Kaynaklar JB3 (Forward) TTTTTTGGGCATCCTGAGGTTTAT Hu et al. (2008) JB5 (Reverse) AGCACCTAAACTTAAAACATAATGAAAATG Hu et al. (2008) Amplifikasyon işlemi her bir populasyon için üç defa tekrarlanmış ve sekans analizine gönderilecek yeterli miktarda PCR ürünü elde edilmiştir. PCR ürünü Promega nın saflaştırma kiti kullanılarak (Wizard SV Gel and PCR Clean-Up System) agoroz jelden prufike edilip sekansa gönderilmiştir. Sekans Analizi: Mitokondrial DNA nın sitokrom C oksidaz gen bölgesi JB3 ve JB5 primerleri ile amplifike edilen kök ur nematodu populasyonlarının sekans analizleri Güney Kore de Macrogen firmasına yaptırılmıştır. Populasyonlara ait nükleotid dizileri Q-bank ta (http://www.q-bank.eu) tanımlanmıştır. Araştırma Sonuçları ve Tartışma Morfolojik teşhis Dişilerin vulva bölgesi oval veya yuvarlak şeklinde olup, dorsal ve ventral çok iyi gelişmiş stria lar ve kutikular kıvrımlar mevcuttur. Lateral alanlar oldukça belirgin, boşaltım kanalı (excretory pore) stylet tokmakcıkları hizasında olup, EP/ST oranı 1.6 dır. İkinci dönem larvada hemizonid boşaltım deliğinin bir iki anül önünde yer alır ve kuyruk uzun, dar ve koniktir. Erkeklerde ise lateral alan, vücudun ön ve arka kısmında 4 çizgili, vücut ortasında ise 6 çizgilidir. Kök ur nematodu populasyonlarının ikinci dönem larva ve dişi bireylerin morfolojik özellikleri ve bazı allometerik kriterleri esas alınarak yapılan teşhis sonucunda tüm örneklerin M. artiellia olduğu tespit edilmiştir (Şekil 1) (Çizelge 3). Şekil 1. Meloidogyne artiellia nın ikinci dönem larva ve dişi bireyi. A: İkinci dönem larvaya ait kuyruk yapısı, B: İkinci dönem larvadaki lateral alan, C: Dişi bireye ait vulva kesiti 192

İmren et.al., Türk. entomol. derg., 2014, 38(2) Çizelge 3. Meloidogyne artiellia populasyonlara ait ikinci dönem larva ve dişilerinin ölçüm değerleri ile bazı allometrik kriterler Karakter Vücut uzunluğu (L) Vücudun en geniş yerindeki genişlik Boşaltım kanalındaki vücut genişliği Anus deki vücut genişliği Stilet uzunluğu DGO* İkinci dönem larva (μm) Çalışma bulguları Erica & Venette (2004) Çalışma bulguları Dişi (μm) Erica & Venette (2004) n 10 10-20 10 8-10 355.96 ± 8.02 (344-369.6) 15.04 ± 0.82 (14.4-16.8) 13.84 ± 0.53 (12.8-14.4) 9.9 ± 0.89 (8.8-11.2) 14.16 ± 0.65 (14-15.6) 2.24 ± 0.12 (2.2-2.8) 301-370 10-16 355.96 ± 6.02 (344-362.6) 385.96 ± 7.24 (344-392.3) 650-760 340-460 14-16 12.90 ± 0.25 (11.5-14.6) 12-16 EP / ST - - 1.6 - Kuyruk uzunluğu Kuyruk terminus uzunluğu Anus primordium 27.36 ± 1.49 (24-28.8) 6.72 ± 1.01 (4.8-8.0) 86.88 ± 7.43 (76.8-104.0) Vulva genişliği - - a ** 23.73 ± 1.5 (20.48-25.65) b' c (Excretory pore/l) X 100 5.32 ± 0.22 (5.0-5.7) 14.30 ± 0.85 (12.33-15.40) 18.5 ± 0.16 (17.60-20.12) 18-26 - - 16.14 ± 0.22 (14.4-18.12) 15-22 * DGO: Dorsal ösafagus gland bezi açıklığı ile stilet tokmakçığı arasındaki uzaklık; EP / ST: Dişi bireyde stylet tokmakcıkları ile boşaltım kanalı (excretory pore) arasındaki uzaklığın stilet uzunluğuna oranı. ** a: Vücut uzunluğunun vücudun en geniş yerine oranı; b': vücut uzunluğunun ösafagal bezlerin posteriör ucu ile vücudun en ön ucu arasındaki uzaklığa oranı; c: Vücut uzunluğunun kuyruk uzunluğuna oranı. Çizelge 3 te araştırma bulguları Erica & Venette (2004) ile karşılaştırılmalı olarak değerlendirilmiştir. Çalışmadaki M. artiellia populasyonlarının ikinci dönem larva ve dişi bireye ait morfolojik karakterlerin genelde referans değerleri ile uyumlu olduğu görülmektedir. Bununla birlikte ikinci dönem larvanın kuyruk uzunluğunun referans değerlerinden biraz yüksek olduğu belirlenmiştir. Bulundukları toprak tipi, coğrafya, yükseklik, beslenme koşulları vb. özelliklere göre dikkate alındığında bu farklılığın varyasyon şeklinde görülebileceği sonucuna varılmıştır. Moleküler teşhis Mitokondrial DNA nın sitokrom C oksidaz gen bölgesi JB3 ve JB5 primerleri ile amplifike edilen kök ur nematodu populasyonlarına ait PCR ürünü UV transilluminatörde görüntülenmiş ve 400 bp de tek bir DNA bandı gözlemlenmiştir (Şekil 2.). Bu sonucun Hu et al. (2008) ile uyumlu olduğu saptanmıştır. 193

Türkiye buğday faunası için yeni bir tür, Meloidogyne artiellia (Franklin) nın morfolojik ve moleküler yöntemlerle tanımlanması Şekil 2. Meloidogyne artiellia populasyonlara ait PCR ürünlerinin 400 bp de oluşturduğu DNA bant görüntüsü Kök ur nematodu populasyonlarına ait nükleotid dizileri Macrogen (Güney Kore) firmasından elde edilmiştir. Populasyonlara ait elde edilen nükleotid dizileri Q-bank ta (http://www.q-bank.eu) blast yapılmış ve 2728 Meloidogyne artiellia COI NEMAT referans numarası ile M. artiellia oldukları tespit edilmiştir. Q-bank, Avrupa Birliği Karantina listesindeki bitki hastalık ve zararlılarına ait kapsamlı bir veri tabanıdır. Q-bank virus, viroid, fitoplazma, nematod, böcek, fungus ve bakteri gibi bitki patojenlerinin morfolojik, ekolojik, fizyolojik ve sekans verilerini içermektedir. Q-bank ta sekans verilerinin sitemdeki mevcut veri tabanında eşleştirilmesi yapılabilmekte, sisteme dışarıdan veri girilememektedir. Bu durum Q-bank ın güvenirliliğini artırmakta ve sonuçların kesin olduğunu göstermektedir. Kök ur nematodunun çalışma kullanılan populasyonlarının Q-bank veri tabanıyla %91.72 oranında örtüştüğü ve %100 benzerlikle ile M. artiellia olduğu saptanmıştır. Sekans analizi ile moleküler düzeyde tür teşhislerinde %90 ve üzerinde nükleotid eşlemesi istenildiği dikkate alındığında çalışma sonucunun oldukça güvenilir olduğu görülmektedir. Ayrıca, Q-bank ta populasyonlara ait nükleotid dizilerinin blast yapıldığında sonuçların M. artiellia dışında düşük tekrar oranında bile olsa başka bir kök ur nematodu ile eşleşme göstermemesi moleküler teşhisin güvenilirliğini ortaya koymaktadır. Bu çalışmada hem morfolojik hem de moleküler düzeyde kök ur nematodu populasyonlarının M. artiellia olduğu saptanmıştır. Bu çalışma ile Hatay ili buğday alanlarında tespit edilen M. artiellia ülkemizdeki buğdayda zararlı nematod faunası için ilk kayıt olma niteliğindedir. Kök ur nematodunun Akdeniz türü olarak adlandırılan Meloidogyne artiellia Akdeniz Havzası nda birçok ülkede saptanmıştır. Bu kapsamda M. artiellia Yunanistan (Kyrou, 1969), Fransa (Ritter, 1972), İspanya (Tobar Jiménez, 1973) ve Suriye de (DiVito & Zaccheo, 1987) tespit edildiği bildirilmektedir. Ülkemizde M. artiellia Uşak ta bir lokasyonda nohutta saptanmış olmakla birlikte buğdayda tespit edildiğine yönelik her hangi bir kayda rastlanılamamıştır (DiVito et al., 1994). Yukarıda M. artiellia nın tespit edildiği ülkelerin ortak özelliği Akdeniz havzasında olmalarıdır. Türkiye nin Akdeniz sınırında bulunan Hatay ili buğday alanlarında M. artiellia nın tespit edilmiş olması Akdeniz havzasında bulunan ülkelerdeki sonuçlarla uyumluluk göstermektedir. Meloidogyne artiellia nın konukçu dizisi içerisinde buğday (makarnalık), arpa, nohut yoğun olarak zarar oluşturduğu bildirilmektedir (DiVito & Zaccheo, 1987). Ülkemizde Güneydoğu Anadolu Bölgesi nde nohut ve özellikle makarnalık buğdayın yoğun bir şekilde üretimi yapılmakta olup, M. artiellia nın söz konusu ürünlerin münavebe sisteminde %80 lere varan kayıplara neden olduğu bildirilmektedir (DiVito & Greco, 1988). Bu nedenle önümüzdeki dönemde Güneydoğu Anadolu Bölgesi nde nohut ve buğday başta olmak üzere Bölgede yetiştirilen M. artiellia nın konukçusu olduğu bilinen ürün grupları itibariyle kapsamlı bir sörvey çalışmasının yapılarak nematodun mevcut durumun ortaya konulması gerekmektedir. Ayrıca, M. artiellia nın konukçusu olduğu kültür bitkilerinin (en yoğun buğday ve nohut) açık ve geniş 194

İmren et.al., Türk. entomol. derg., 2014, 38(2) alanlarda üretiminin yapılıyor olmasından dolayı zararlıya karşı mücadelede en ekonomik yöntemin kültürel önlemler ve dayanıklı/tolerant çeşitlerin kullanımı olduğu bilinmektedir. Bu sebeple yapılacak sörvey çalışmalarında elde edilebilecek populasyonların bölgede yaygın olarak yetiştirilen buğday hat ve çeşitlerine karşı reaksiyonları araştırılmalıdır. Bunun yanında nematod ve hastalığa (Fusarium spp.) karşı buğday hat ve çeşitlerinin çoklu dayanıklılığı da ayrıca incelenmelidir. Teşekkür Çalışmada morfolojik ve moleküler teşhiste yardımcı olan Ghent (Belçika) şehrinde bulunan Ziraat ve Balıkçılık Enstitüsü nden (ILVO) Lieven WAEYENBERGE ve Nancy De SUTTER e teşekkür ederim. Yararlanılan Kaynaklar Aydınlı, G., S. Mennan, Z. Devran, S. Širca & G. Urek, 2013. First report of the Root-knot nematode Meloidogyne ethiopica on tomato and cucumber in Turkey. Plant Disease, 97 (9): 1262. Castillo, P., J. A. Navas-Cortés, D. Gomar Tinoco, M. DiVito & R. M. Jiménez-Díaz, 2003. Interactions between Meloidogyne artiellia, the cereal and legume rootknot nematode and Fusarium oxysporum f. sp. ciceris race 5 in chickpea. Phytopathology, 93: 1513-1523. Decker, H. & R. Fritzsche, 1991. Resistenz von kulturpflanzen gegen Nematoden. Akademie Verlag-Berlin, 340 p. DiVito, M. & G. Zaccheo, 1987. Response of cultivars of wheat to Meloidogyne artiellia. Nematologia Mediterranea, 15: 405-408. DiVito, M. & N. Greco, 1988. Effect of population densities of Meloidogyne artiellia on yield of wheat. Nematologia Mediterranea, 16: 167-169. DiVito, M., N. Grecoi, G. Ores, M.C. Saxena, K.B. Singh & I. Küsmenoğlu, 1994. Plant parasitic nematodes of legumes in Turkey. Nematologia Mediterranea, 22: 245-251. Erica, E.D. & R.C. Venette, 2004. Mini Risk Assessment British root-knot nematode: Meloidogyne artiellia Franklin (Nematoda: Meloidogynidae). Department of Entomology, University of Minnesota. Greco, N., M. DiVito & M.C. Saxena, 1992a. Plant parasitic nematodes of cool season food legumes in Syria. Nematologia Mediterranea, 20: 37-46. Greco, N., N. Vovlas, M. DiVito & R.N. Inserra, 1992b. Meloidogyne artiellia: a Root-Knot Nematode Parasite of Cereals and Other Field Crops. Florida Department of Agriculture & Consumer Services, Nematology Circular, 201, 4 p. Hartman, K. M. & J.N. Sasser, 1985. Identification of Meloidogyne Species on The Basis of Differantial Host Test and Perineal Pattern Morfology, 69 77. In: An advanced treatise on Meloidogyne, Volume II. Methodology. (Ed. K.R. Barker, C.C. Carter & S. Sasser). Printed by North Carolina State University graphics, Raleigh, North Carolina, 223 p. Hooper, D. J., 1986. Extraction of Free Living Stages From Soil, 5 30. In: Labarotory Methods for Work with Plant and Soil Nematodes. (Ed. Southey, J.F.). Her Majesty s Stationery Office, London.. Hu, J., S. Zacharek, Y.J. He, H. Lee, S. Shumway, R.J. Duronio & Y. Xiong, 2008. WD40 protein FBW5 promotes ubiquitination of tumor suppressor TSC2 by DDB1-CUL4-ROC1 ligase. Genes & Development, 22(7): 866-- 871. Hunt, D.J. & Z.A. Handoo, 2009. Taxonomy, Identification and Principal Species, 55-97. In: Root-knot Nematodes (Ed. Perry, R.N., Moens, M. & Starr, J.L.). CAB International, Wallingford, UK... Kepenekci, İ. 2012. Nematoloji (Bitki Paraziti ve Entomopatojen Nematodlar) [Genel Nematoloji (Cilt-I), ISBN 978-605-4672-11-0, Taksonomik Nematoloji (Cilt-II) ISBN 978-605-4672-12-7] Eğitim, Yayım ve Yayımlar Dairesi Başkanlığı, Tarım Bilim Serisi Yayın No:3 (2012/3), 1155 sayfa. Kyrou, N.C., 1969. First record of occurrence of Meloidogyne artiellia on wheat in Greece. Nematologica, 15: 432-433. Moens, M., R.N. Perry & J.L. Starr, (2009). Meloidogyne species - a Diverse Novel Group and Important Plant Parasites, 1-17. In: Root Knot Nematodes (Ed. Perry, R.N., Moens, M. & Starr, J.L.). CAB International, Wallingford, UK,. 195

Türkiye buğday faunası için yeni bir tür, Meloidogyne artiellia (Franklin) nın morfolojik ve moleküler yöntemlerle tanımlanması Nicol, J.M., 2002. Important Nematode Pests, 345-366. In: Bread Whead Improvement and Production (Ed. Curtis, B. C., S. Rajaram, H. Gomez Macpherson). Food and Agriculture Organization of the United Nations, Rome.,. Ritter, M., 1972. The economic importance of Meloidogyne in Europe and the Mediterranean Basin. OEPP/EPPO, Bulletin 6: 17-22. Sasser, J.N.A., 1987. Perspective on Nematode Problems Worldwide, 1-12. In: Nematode Parasitic to Cereals and Legumes in Temperate Semi-arid Regions. (Ed: M.C. Saxena, R.A. Sikora & J.P. Sarivastava). Proceedings of a Workshop (1-5 March 1987), Larnaca, Cyprus. Seinhorst, J.W., 1959. A rapid method for the transfer of nematodes from fixative to anhydrous glycerin. Nematologica, 4: 67 69. Shiabova, T. N., 1981. Meloidogyne artiellia a parasite of cereals in western Siberia. Helminthological, 37: 29-32. Sikora, R. A., 1988. Plant Parasitic Nematodes of Wheat and Barley in Temperate and Temperate Semi-arid Regions a Comporative Analysis, 46-68. In: Nematodes Parasitic to Cereals and Legumes in Temperate Semi-arid Regions. (Ed: M.C. Saxena, R. A. Sikora & J. P. Srivastava). ICARDA: Alepo, Syria,. Tobar Jiménez, A., 1973. Nematodes de los secanos dela comarca de Alhama. I. Niveles de población cultivos hospedadores. Revista Ibérica de Parasitología, 33: 525-556. Tuik, 2013. Türkiye İstatistik Kurumu, Ankara (http://tuikrapor.tuik.gov.tr). (Erişim tarihi: Kasım, 2013). Waeyenberge, L, A. Ryss, M. Moens, J. Pinochet & T.C Vrain, 2000. Molecular characterization of 18 Pratylenchus species using rdna restriction fragment length polymorphism. Nematology, 2: 135-142. Xu, J., T. Narabu, T. Mizukubo & T. Hibi, 2001. A molecular marker correlated with selected virulence against the tomato resistance gene Mi in Meloidogyne incognita, M. javanica and M. arenaria. Phytopathology, (91): 377-382. 196