ÜNİTE 7. Porfirinler. Amaçlar. İçindekiler. Öneriler

Benzer belgeler
BİYOİNORGANİK KİMYA 5. HAFTA

ÜNİTE 6 Nükleoproteinler ve Nükleik Asitler

δ-aminolevulinik ASİT

BİLİRUBİN METABOLİZMASI. Yrd. Doç. Dr. İlyas Yolbaş Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları ABD

Prof. Dr. Şule PEKYARDIMCI

Mert Görücü Ders Notları 2015 Güz BİYOKİMYA - I. Proteinler Ders Notu. Özet Biyokimya I dersine yardımcı proteinler ders notu.

Suda çözünebilen nişasta molekülleri pityalin (amilaz) enzimiyle küçük moleküllere parçalanır.

OKSİJENLİ SOLUNUM

Solunumda organik bileşikler karbondioksite yükseltgenir ve absorbe edilen oksijen ise suya indirgenir.

Kloroform, eter ve benzen gibi organik çözücülerde çözünen bunun yanı sıra suda çözünmeyen veya çok az çözünen organik molekül grubudur.

ELEMETLER VE BİLEŞİKLER ELEMENTLER VE SEMBOLLERİ

-- Giriş -- Enzimler ve katalizörler -- Enzimlerin isimlendirilmesi -- Enzimlerin etki mekanizması -- Enzimlerin yapısı -- Enzimler ve prostetik

GENEL ÖZELLİKLERİ: Tüm canlılarda sudan sonra en fazla bulunan moleküllerdir. Canlının kuru ağırlığının %50 si proteindir. Oldukça büyük ve kompleks

ÇİSEM İLGİN ( ) LÜTFİYE ALAÇAM ( ) Prof. Dr. Figen ERKOÇ GAZİ ÜNİVERSİTESİ

HAYVANSAL ÜRETİM FİZYOLOJİSİ

Akıllı Defter. 9.Sınıf Biyoloji. vitaminler,hormonlar,nükleik asitler. sembole tıklayınca etkinlik açılır. sembole tıklayınca ppt sunumu açılır

Organik Bileşikler. Karbonhidratlar. Organik Bileşikler YGS Biyoloji 1

I. Koenzim A nedir? II. Tarihsel Bakış III. Koenzim A nın yapısı IV. Asetil-CoA nedir? V. Koenzim A nın katıldığı reaksiyonlar VI.

CANLILARIN YAPISINDA BULUNAN TEMEL BİLEŞENLER

11. SINIF KONU ANLATIMI 2 ATP-2

KARBON ve CANLILARDAKİ MOLEKÜL ÇEŞİTLİLİĞİ

6. BÖLÜM MİKROBİYAL METABOLİZMA

ENDÜSTRIDE VE CANLILARDA ENERJI. Canlılarda Enerji

ĐÇERĐK. Vitamin B6 Formları. LOGO Tarihsel Bakış. Yapısal Formüller. 4 Piridoksin Piridoksal Piridoksamin Piridoksal-fosfat

Keton Cisimleri. Prof. Dr. Fidancı

ÜNİTE 11 Su ve Minaral Metabolizması

ELEMENTLER VE BİLEŞİKLER

MİNERALLER. Dr. Diyetisyen Hülya YARDIMCI

Atomlar ve Moleküller

M. (arpa şekeri) +su S (çay şekeri) + su L.. (süt şekeri)+ su

Kanın fonksiyonel olarak üstlendiği görevler

Hücrelerde gerçekleşen yapım, yıkım ve dönüşüm olaylarının bütününe metabolizma denir.

Canlıların yapısına en fazla oranda katılan organik molekül çeşididir. Deri, saç, tırnak, boynuz gibi oluşumların temel maddesi proteinlerdir.

ELEMENT VE BİLEŞİKLER

Canlılarda Enerjitik Olaylar, Fotosentez ve Kemosentez, Aerobik Solunum ve Fermantasyon

KİMYA-IV. Yrd. Doç. Dr. Yakup Güneş

Biochemistry Chapter 4: Biomolecules. Hikmet Geçkil, Professor Department of Molecular Biology and Genetics Inonu University

YGS YE HAZIRLIK DENEMESi #2

ayxmaz/biyoloji Adı: 1.Aşağıda verilen atomların bağ yapma sayılarını (H) ekleyerek gösterin. C N O H

İÇİNDEKİLER ÖN SÖZ... III

Paylaşılan elektron ya da elektronlar, her iki çekirdek etrafında dolanacaklar, iki çekirdek arasındaki bölgede daha uzun süre bulundukları için bu

Solunum: Solunum sistemi" Eritrositler" Dolaşım sistemi"

Organik bileşikler; karbonhidratlar, lipidler, proteinler, vitaminler ve nükleik asitler olmak üzere beş gruba ayrılır.

Hidroklorik asit ve sodyum hidroksitin reaksiyonundan yemek tuzu ve su meydana gelir. Bu kimyasal olayın denklemi

FOTOSENTEZ VE KEMOSENTEZ

Öğr. Gör. Dr. İlker BÜYÜK (Botanik, 10. Hafta): Fotosentez FOTOSENTEZ

TEST 1. Hücre Solunumu. 4. Aşağıda verilen moleküllerden hangisi oksijenli solunumda substrat olarak kullanılamaz? A) Glikoz B) Mineral C) Yağ asidi

Örnek : 3- Bileşiklerin Özellikleri :

ÖĞRENME ALANI : MADDE VE DEĞİŞİM ÜNİTE 4 : MADDENİN YAPISI VE ÖZELLİKLERİ

Karbohidratlar. Karbohidratların sınıflandırılması. Monosakkaritler

Günümüzde bilinen 117 element olmasına rağmen (92 tanesi doğada bulunur) bu elementler farklı sayıda ve şekilde birleşerek ve etkileşerek farklı

ÇÖZÜNÜRLÜK DENGESİ (Kçç)

Canlıların dış ortamdan aldıkları inorganik maddelerden gelişmeleri için zorunlu olan organik maddeleri yapmalarına özümleme (asimilasyon) denir.

BİLEŞİKLER VE FORMÜLLERİ

DERSĐN SORUMLUSU : PROF.DR ĐNCĐ MORGĐL

CANLILARIN TEMEL BİLEŞENLERİ

MADDE NEDİR? Çevremize baktığımızda gördüğümüz her şey örneğin, dağlar, denizler, ağaçlar, bitkiler, hayvanlar ve hava birer maddedir.

DOYMAMIŞ YAĞ ASİTLERİNİN OLUŞMASI TRİGLİSERİTLERİN SENTEZİ

BİYOİNORGANİK KİMYA. Prof. Dr. Ahmet KARADAĞ

BİTKİ BESİN MADDELERİ (BBM)

8. Hafta Amino Asitler, Peptidler ve Proteinler: Prof. Dr. Şule PEKYARDIMCI PEPTİT BAĞI

2006 ÖSS BİYOLOJİ SORULARI VE CEVAPLARI

Yağ Asitlerinin Biyosentezi. Prof. Dr. Fidancı

1.1. Amino asitlerin yapıları 1.2. Amino asitlerin yazılmaları 1.3. Amino asitlerin streokimyası Asimetrik

HISTOLOJIDE BOYAMA YÖNTEMLERI. Dr. Yasemin Sezgin. yasemin sezgin

YAZILIYA HAZIRLIK SORULARI. 11. Sınıf 1 CANLILARDA ENERJİ DÖNÜŞÜMLERİ

1-GİRİ 1.1- BİYOKİMYANIN TANIMI VE KONUSU.-

VİTAMİN NEDİR? Vitaminler organik besinler grubunda bulunup

FOTOSENTEZ. 1. Fotosentez, güneş enerjisini, besin içindeki saklı kimyasal bağ enerjisine çeviren olaydır.

YAZILIYA HAZIRLIK SORULARI. 9. Sınıf

CANLILAR VE ENERJİ İLŞKİLERİ

HİDROKARBONLAR ve ALKİNLER. Kimya Ders Notu

o Serin o Triyonin o Sistein o Metiyonin o Arjinin o Histidin

BESİNLERİN ENERJİYE DÖNÜŞÜMÜ

1- Aşağıdakilerden hangisi Aşındırıcı sembolüdür? a. b. c. d. CEVAP: D. 2- Aşağıdakilerden hangisi Yanıcı sembolüdür? a. b. c. d.

YAZILIYA HAZIRLIK SORULARI. 9. Sınıf 2 KARBONHİDRAT LİPİT (YAĞ)

Hücreler, kimyasal yasaların geçerli olduğu kimyasal fabrikalar olarak da kabul edilmektedir.

9.Sınıf Biyoloji. Yaşam Bilimi Biyoloji. cevap anahtarı

ORGANİK BİLEŞİKLER Karbon Dünyası

KAN DOKUSU. Prof. Dr. Levent ERGÜN

SU VE HÜCRE İLİŞKİSİ

YAZILIYA HAZIRLIK TEST SORULARI. 11. Sınıf

Biyoloji Canlılarda Solunum Enerjinin Açığa Çıkışı

Hücre canlının en küçük yapı birimidir.

vitamininin indirgenmesi istemli midir?

FOTOSENTEZ C 6 H 12 O O 2. Fotosentez yapan canlılar: - Bitkiler - Mavi yeşil algler - Bazı bakteriler - Bazı protistalar. Glikoz IŞIK KLOROFİL

Kolesterol Metabolizması. Prof. Dr. Fidancı

KİMYA-IV. Alkenler (3. Konu)

Yağ Asitlerinin Metabolizması- I Yağ Asitlerinin Yıkılması (Oksidasyonu)

Solunum. Solunum ve odunsu bitkilerin büyümesi arasında yüksek bir korelasyon bulunmaktadır (Kozlowski ve Pallardy, 1997).

BİYOİNORGANİK KİMYA. Prof. Dr. Ahmet KARADAĞ

Dr. Hülya ÇAKMAK Gıda Mühendisliği Bölümü ANTİOKSİDANLAR

İstanbul Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji ABD Prof. Dr. Filiz Aydın

YAĞLAR (LİPİTLER) Yağların görevleri:

LİPİTLERİN ORGANİZMADAKİ GÖREVLERİ SAFRA ASİTLERİ

YGS YE HAZIRLIK DENEMESi #18

ADIM ADIM YGS-LYS 27. ADIM HÜCRE 4- HÜCRE ZARINDAN MADDE GEÇİŞLERİ

Tüm yaşayan organizmalar suya ihtiyaç duyarlar Çoğu hücre suyla çevrilidir ve hücrelerin yaklaşık %70 95 kadarı sudan oluşur. Yerküre içerdiği su ile

TIBBİ BİYOLOJİ YAĞLARIN VE PROTEİNLERİN OKSİDASYONU

5.111 Ders Özeti #12. Konular: I. Oktet kuralından sapmalar

Transkript:

ÜNİTE 7 Porfirinler Amaçlar Bu üniteyi çalıştıktan sonra; Porfirin, porfin ve pirol halkası tanımlamalarını, Porfirinlerin özelliklerini, Hemoglobinin yapısını ve özelliklerini, Hemoglobinin yıkılışını ve bilirubin metabolizmasını bileceksiniz. İçindekiler Giriş Porfirinlerin Özellikleri Hem ve Hemoglobin biosentezi Hemoglobin Yapısı, Özellikleri ve Bileşikleri Hemoglobinin Yıkılışı Özet Değerlendirme Soruları Yararlanılan ve Başvurulabilecek Kaynaklar Öneriler Ünitede size yabancı kavramlar olursa çevrenizdeki ilgili kişilere sorup öğrenin.

1. GİRİŞ Porfirinler, dört metidilin (-HC=) köprüsü ile birbirine bağlanmış dört pirol biriminden ibaret olan "porfin" halka sistemini ihtiva eden maddelerdir. Porfin halka sistemi doğada bulunmaz ve hiç bir substituent ihtiva etmez. HC 4 3 CH 8 1 2 I 3 HC 5 2 CH IV II 1 7 4 N H Pirol 6 III 5 Yukarıda şematize ettiğimiz porfin halka sistemindeki I, II, III ve IV pirol halkalarını göstermektedir. Substitue porfinler ve doğada bulunan porfirinler bazen serbest halde ve çok defa merkezlerinde bir metal iyonu ihtiva eden kelat kompleksleri halinde bulunurlar. Doğada bulunan başlıca porfirinler; uroporfirin I ve III, koproporfirin I ve III, protoporfirin IX, mezoporfirin IX ve hemoporfirin IX'dur. Protoporfirin IX'un Fe +2 iyonu ile meydana getirdiği kelat kompleksi (hem) hemoglobinin, miyoglobinin ve sitokromlardan birçoğunun prostetik grubunu teşkil eder. Hemoglobin H 2 SO 4 gibi kuvvetli asitlerde muamele edilerek parçalanır ve porfirin serbest hale geçer. 2. PORFİRİNLERİN ÖZELLİKLERİ Pirol halkalarında bulunan tersier atomları dolayısıyla bütün porfirinler zayıf bazdır. Genellikle yan zincirlerdeki karboksil gruplarından dolayı asit olduklarından zayıf amfoter özellik gösterirler. Porfirinler ihtiva ettikleri konwuge bağların rezonans özelliği dolayısıyla karakteristik absorbsiyan spektrumları verirler. Organik çözücülerdeki veya inorganik asitlerdeki çözeltileri çok kuv- - 74 -

vetli kırmızı floresans gösterirler. Bu floresanstan profirinlerin aranması ve miktar tayininde yararlanılır. Porfirin halka sistemindeki pirollerin azot atomları, demir magnezyum, bakır, çinko gibi bazı metal atom iyonları ile kelat kompleksleri teşkil ederler. Örneğin kanın kırmızı rengini veren hemoglobin, kasların kırmızı rengini veren miyoglobin, sitokrom oksidaz, katalaz ve peroksidaz demir-porfirin bileşikleridir. Bitkilerin yeşil rengini veren klorofil ise magnezyum-porfirin bileşiğidir. Doğada bulunan porfirinleri sayınız. 3. HEM VE HEMOGLOBİN BİOSENTEZİ Bileşik bir protein olan hemoglobinin prostetik grubu hem, proteini ise globindir. Yetişkin insanda hemoglobin prostetik grubu hem, proteini ise globindir. Yetişkin insanda hemoglobin sentezi normal olarak kemik iliğindeki olgunlaşmamış eritrositlerde meydana gelir. Hemoglobinin biosentezi için üç bileşene ihtiyaç vardır. (1) Protoporfirin IX, (2) globin, (3) Fe + iyonu. Bu sentez pantotenik asit, piridoksal fosfat, B 12 vitamini, intrinsik faktör ve bakır iyonu gibi kofaktörlerin yardımıyla gerçekleşir. Hem, daha önce bahsettiğimiz gibi, protoporfirin IX'un Fe +2 iyonu ile teşkil ettiği bir kelat kompleksidir. Hemoglobinin teşekkülü için gerekli protoforfirin IX endojen olarak meydana gelir. Organizmaya şırınga edilen protoporfirin hemoglobin sentezinde kullanılmaz, hiçbir değişikliğe uğramaksızın idrarla, besinlerle giren ise dışkı ile dışarıya atılır. Protoporfirin biosentezinde ön maddeler, her ikisi de endojen olan suksinil Co-A ve glisindir. bir sıra reaksiyonla porfobilinojen oluşur. Porfobilinojen hayvan organizmasındaki bütün porfirinlerin ön maddesidir. Bundan sonra karmaşık bir dizi reaksiyonla protoporfirin IX meydana gelir. Fe +2 iyonu katılmasıyla "Hem" oluşur. Hem'in organizmada sentez edilen globin adlı proteine bağlanmasıyla hemoglobin oluşur. Normal halde idrarla günde dışarı atılan porfirin miktarı eser miktardan 40 mg'a kadar değişir. İdrara normalden fazla porfirin çıkmasına "porfirinüri" denir. Hem'in oluşumunu açıklayın. - 75 -

4. HEMOGLOBİNİN YAPISI, ÖZELLİKLERİ VE BİLEŞİKLERİ Hemoglobinin en büyük kısmı protein olup bir hemoglobin molekülü 4 demir iyonu (%0.33 kadar demir) ihtiva etmektedir. Molekül ağırlığı 64500 dür. Hemoglobindeki globin histonlar alt sınıfına ait bir proteindir ve fazla miktarda bazik aminoasitler ihtiva eder. Yetişkin insan hemoglobini dört polipeptit zincirinden ibarettir. Bunlara α, β, γ, δ zincirleri adı verilir. Globinin bu dört polipeptit zinciri birer hem grubu ile birleşmiştir. Yani bir hemoglobin molekülünde dört tane hem bulunur. Normal insan kanında bulunan hemoglobin A'nın %97,5'u hemoglobin A 2 ve %2,5 hemoglobin A 2 tipindedir. Hemoglobinin organizmada en önemli fonksiyonu oksijeni akciğerlerden dokulara götürmesidir, diğer bir deyişle hemoglobin organizmanın oksijen taşıyıcısıdır. Hemoglobinin diğer önemli bir fonksiyonu kanın en önemli tamponlarından biri olmasıdır. Hemoglobindeki Fe +2 nin bazı maddelerin etkisiyle Fe +2 ye yükseltgenmesiyle "methemoglobin" oluşur. Esmer kırmızı renkli olan bu maddenin oluşumu tehlikelidir. Hemoglobinin altıncı koordinasyon yerine CO (Karbonmonoksit) gelirse "karboksihemoglobin" oluşur. Hemoglobinin yapısını açıklayınız. 5. HEMOGLOBİNİN YIKILIŞI İzotoplarla yapılan deneyler hemoglobinin eritrositlerin kemik iliğinden dolaşıma geçişinden 120-130 gün sonra, retiküloendotelyal sistem hücrelerini ihtiva eden dalak, karaciğer ve özellikle kimek iliğinde yıkıldığını göstermiştir. Retiküloendotelyal sistemde eritrositlerin dışına çıkan hemoglobinin yıkılışına önce hem'in protoporfirin halka sisteminden ayrılmasıyla demir-biliverdin ve globinden oluşan yeşil renkli "koleglobin" veya "verdoglobin" denen madde meydana gelir. verdoglobinden ise önce demir iyonu sonra globin ayrılarak, iki oksijen atomu moleküle katılarak biliverdin meydana gelir. Fe +2 iyonu demir depolarına veya kemik iliğine taşınır. Globin ise kendini oluşturan aminoasitlere parçalanır. Biliverdin ise mavi-yeşil renkli olup, "biliverdin redüktaz" enziminin katalizi ile "bilirübin" meydana gelir. Karaciğer dışındaki retiküloendotelyal sistem hücrelerinde hasıl olan bilirubin kan dolaşımı ile karaciğer hücrelerine getirilir. Safranın renkli maddesi olan ve suda çözünmeyen bilirubinin büyük kısmı albüminle, az bir kısmı ise α 1, ve α 2 globulinle kompleks şeklinde birleşir. Proteinle kompleks teşkil eden bilirubin suda çözünmediğinden idrara çıkmaz. Bilirubin karaciğer hücrelerinde proteinden ayrılır ve - 76 -

glokoronitlerle birleşerek konjuge bilirubini oluşturur ve suda çözünebilir. Proteinle kompleks teşkil eden bilirubine serbest bilirubin, diğerlerine ise bağlı bilirubin veya konjuge bilirubin denir. Bilirubinin kandaki miktarı hepatosellüler veya tıkanma sarılıklarında %2 mg'ı aşarak idrara çıkar. Buna bilirubinüri denir. Hemoglobin yıkılışının ara ürünleri ürobilinojen ve sterkobilinojendir. Kalın bağırsakta bunlar ürobilin ve sterkobilin'e yükseltgenir. Hemoglobinin nasıl yıkıldığını açıklayınız. Özet Birleşik bir protein olan hemoglobin hem ve globinden meydana gelir. Hem ise protoporfirin IX ile Fe +2 iyonunun teşkil ettiği bir kelat kompleksidir. Hemoglobinin organizmada en önemli fonksiyonu oksijeni akciğerlerden dokulara götürmesidir. Yani organizmanın oksijen taşıyıcısıdır. Ayrıca kanın önemli bir tamponudur. Hemoglobin eritrositlerin kemik iliğinden dolaşıma geçişinden 120-130 gün sonra, retiküloendotelyel sistem hücresini ihtiva eden, dalak, karaciğer ve özellikle kemik iliğinde yıkılır. Sonunda safranın renkli maddesi olan bilirubin meydana gelir. Bilirubinin kandaki miktarı hepatosellüler ve tıkanma sarılıklarında %2 mg'ı aşarak idrara çıkar. Buna bilirubinüri denir. Değerlendirme Soruları 1. Hemoglobinin yapısında bulunan porfirin aşağıdakilerden hangisidir A) Uroporfirin I ve III B) Koproporfirin I ve III C) Protoporfirin IX D) Mezoporfirin IX E) Hematoporfirin IX - 77 -

2. Protoporfirin IX ile Fe +2 iyonunun teşkil ettiği kelat kompleksine ne denir A) Hem B) Hemoglobin C) Globin D) Albümin E) Bilirubin 3. Protoporfirin biosentezinde ön maddeler hangisidir A) Asetil Co-A B) Asetil Co-A ve glisin C) Valin D) Süksinil Co-A E) Süksinil Co-A ve Valin 4. Hemoglobinin en önemli görevi dokulara... taşımasıdır. A) Karbondioksit B) Oksijen C) Karbonmonoksit D) Azot E) Demir 5. Proteinlerle kompleks halde bulunan bilirubine ne denir A) Konjuge bilirubin B) Total bilirubin C) Bağlı bilirubin D) Serbest bilirubin E) Hiçbiri Yararlanılan ve Başvurulabilecek Kaynaklar ARAS, Kazım ve Gülseren Erşen. Klinik Biokimya, Ankara, Hacettepe Taş Kitapçılık Ltd.Şti., 1990. GÖZÜKARA, Engin M. Biyokimya, Ankara, Ofset Pepianat Ltd. Şti., 1990. YENSON, Mutahhar. İnsan Biyokimyası, İstanbul Üniversitesi Tıp Fakültesi Yayınları No.128, 1989. - 78 -