BAZI SARIMSAK GENOTİPLERİNİN (Allium sativum L.) VE MUTANTLARININ RAPD BELİRLEYİCİLERİ İLE TANIMLANMASI

Benzer belgeler
KASTAMONU SARIMSAĞININ (Allium sativum L.) SELEKSİYON YOLUYLA ISLAHI VE SEÇİLEN KLONDA IŞINLAMA YOLUYLA MUTASYON YARATMA

Aspir (Carthamus tinctorius L.) de Varyasyon Oluşturmak Amacıyla Kullanılabilecek Gama ( 60 Co) Dozunun Belirlenmesi

KARADENİZ BÖLGESİNDEN SEÇİLEN BAZI KIRMIZI AHUDUDU (Rubus ideaus L.) TİPLERİNİN GENETİK FARKLILIĞININ RAPD TEKNİĞİ İLE BELİRLENMESİ

Bazı Ceviz (Juglans regia L.) Çeşitlerinin Çimlenme ve Çöğür (Anaçlık) Gelişme Performanslarının Belirlenmesi

Domuz Ayrığı (Dactylis glomerata L.) Populasyonlarında Genetik Çeşitliliğin Belirlenmesi

İpek 607 Pamuk (G. hirsitum L.) Çeşidinde Farklı Gama Işını (Cobalt 60) Dozlarının M2 Popülasyonunda Lif Kalite Özellikleri Üzerine Etkisi

MUTATION INDUCTION IN DURUM WHEAT

Süleyman Demirel Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi 8 (1):78-83, 2013

NOHUTTA MUTASYON ISLAHI

YÜKSEKÖĞRETİM KURULU YARDIMCI DOÇENT : Sinop Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Biyoloji Bölümü Sinop

Ege Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Bahçe Bitkileri Anabilim Dalı / 2010

Sebze Islahında Moleküler Markırların Kullanımı

Bazı Tritikale Çeşitlerine Uygulanan Farklı Gama Dozlarının Fide Gelişimi Üzerine Etkileri

Öğr. Gör. Tuğba GÜLEÇ

DNA MİNİSATELLİT MARKIRLARINDAN YARARLANILARAK FİĞDE (Vicia sativa L.) TANE VERİMİNİN ÖNCEDEN BELİRLENMESİ OLANAKLARI

SAMSUN KOŞULLARINDA GELİŞTİRİLEN BAZI TEK MELEZ MISIR ÇEŞİTLERİ ÜZERİNE ARAŞTIRMALAR

Doç. Dr. Ahmet İPEK ÖĞRENİM DURUMU GÖREVLER

Bazı aspir genotiplerinin pas hastalığına karşı reaksiyonları hakkında ön çalışma 1

FARKLI YETİŞTİRME ORTAMLARININ SERA VE İKLİM ODASI KOŞULLARINDA PATATES (Solanum tuberosum L.) MİNİ YUMRU ÜRETİMİNE ETKİLERİ

Zaman Konu Eğitimci(ler)

GENEL. Zaman Konu Eğitimci(ler)

Ziraat Mühendisi. Toprak Bilimi ve Bitki Besleme Toprak Bilimi ve Bitki Besleme Tarım Ekonomisi

ISSN: Yıl /Year: 2017 Cilt(Sayı)/Vol.(Issue): 1(Özel) Sayfa/Page: Araştırma Makalesi Research Article

ÖZET. Yüksek Lisans Tezi. Đmge Đ. TOKBAY. Adnan Menderes Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Tarla Bitkileri Anabilim Dalı

ÖZGEÇMİŞ VE YAYIN LİSTESİ. : Batı Akdeniz Tarımsal Araştırma Enstitüsü, 07100, ANTALYA Tlf: 0 (242) , ayseserpil.kaya@gthb.gov.

Tarım ve Hayvancılık Il Mudurlugu, Kocaeli Üni., Arslanbey Meslek Yuksekokulu, 41285, Arslanbey/Kocaeli

BİTKİ ISLAHÇILARI ALT BİRLİĞİ BİTKİ ISLAH KURSU PROGRAMI

Seçilmiş bazı nohut (Cicer arietinum L. ) hatlarının agronomik ve kalite özellikleri bakımından değerlendirilmesi

BURSA İLİ III. ALT BÖLGESİNDE (GEMLİK, ORHANGAZİ, İZNİK VE MUDANYA) YETİŞTİRİLEN CEVİZ TİPLERİNİN SELEKSİYONU

Archived at

GÖREV YERLERİ(Tarih/Unvan/Kurum) Araştırma Görevlisi Uludağ Üniversitesi Ziraat Fakültesi

6. Seçilmiş 24 erkek tipte ağacın büyüme biçimi, ağacın büyüme gücü (cm), çiçeklenmenin çakışma süresi, bir salkımdaki çiçek tozu üretim miktarı,

YAYGIN FİĞ (Vicia sativa L.) ÇEŞİTLERİNDE GAMA IŞINLAMASININ M 1 VE M 2 DÖLÜNDE BAZI BİTKİSEL ÖZELLİKLERE ETKİSİ ÜZERİNE BİR ARAŞTIRMA

Mustafa Kemal SOYLU. Yüksek Mühendis.

Prof.Dr. Meryem İPEK. Öğrenim Durumu:

I. Projenin Türkçe ve İngilizce Adı ve Özetleri İvesi Koyunlarında mikrosatellite lokuslarında polimorfizmin tespiti Güneydoğu Anadolu Tarımsal Araştı

daha çok göz önünde bulundurulabilir. Öğrencilerin dile karşı daha olumlu bir tutum geliştirmeleri ve daha homojen gruplar ile dersler yürütülebilir.

TOHUMCULUK VE TOHUMCULUK TERİMLERİ. Prof. Dr. Necmi İŞLER M.K.Ü. Ziraat Fakültesi Tarla Bitkileri Bölümü

YABANCI DİL BİLGİSİ Yabancı Dil / Derecesi KPDS ÜDS TOEFL IELTS

Ege Sahil Kuşağına Uygun Kavuzsuz Yulaf Çeşidinin Geliştirilmesi Beslenme Yaklaşımı

Arpa (Hordeum vulgare L.) Bitkisinde Mikrobiyel Gübrelerin Çimlenme Üzerine Etkisinin Belirlenmesi. Çiğdem KÜÇÜK, Cenap CEVHERİ

Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü

Bazı Ekmeklik Buğday (Triticum aestivum L.) Çeşit ve Hatlarının Genetik Uzaklıklarının Belirlenmesi

BAHÇE BİTKİLERİNİN ÇOĞALTILMASI

GENETİK LABORATUVARI

CEVİZLERDE TERMİNAL VE LATERAL SÜRGÜNLER ÜZERİNDE OLUŞAN MEYVELERİN POMOLOJİK OLARAK KARŞILAŞTIRILMASI

Hindistan Çay Plantasyonlarında Yürütülmekte Olan Dört Farklı Bitki Islah Programı

Seçilmiş Ceviz Genotiplerine Ait Bazı Meyve Özelliklerinin Değerlendirilmesi

Devam Daire Başkanı Tarımsal Araştırmalar ve Politikalar Genel Müdürlüğü Daire Başkan Vekili


BAZI KARPUZ GENOTİPLERİNİN SSR ve SRAP MARKÖRLERİ ile KARAKTERİZASYONU 1. Characterization of Some Watermelon Genotypes by SSR and SRAP Markers

Anahtar Kelimeler: Pamuk, Gossypium hirsutum L., Verim, Verim Unsurları, Lif Kalite Özellikleri

Araştırma Makalesi (Research Article)

Nesrin AKTEPE TANGU. Ege Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Bahçe Bitkileri Anabilim Dalı 2012

Ali SENAY TAEK, Ankara Nükleer Araştırma ve Eğitim Merkezi. Cemalettin Yaşar ÇİFTÇİ A.O. Ziraat Faakültesi, Tarla Bitkileri Bölümü

SNP TEK NÜKLEOTİD POLİMORFİZMLERİ (SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS)

ADİ FİĞ TESCİL RAPORU

SELEN AKAN, Ph.D. Date of city & birth : Ankara &

DR. SELEN AKAN. Eğitim ve Akademik Deneyim

KİŞİSEL BİLGİLER. YABANCI DİL BİLGİSİ Yabancı Dil / Derecesi YDS (KPDS) ÜDS TOEFL IELTS İngilizce 53 GÖREV YERLERİ

TÜRKİYE DE BULUNAN BAZI YERLİ SIĞIR IRKLARININ GENETİK YAPILARININ KARAKTERİZASYONU

ADIM ADIM YGS LYS. 91. Adım KALITIM -17 GENETİK VARYASYON MUTASYON MODİFİKASYON ADAPTASYON - REKOMBİNASYON

Şeker Pancarı Islahı

Bazı Makarnalık Buğday Çeşitleri ile Yeni Geliştirilen Hatlarda Genetik İlişkilerin RAPD Markörleriyle İncelenmesi 1

Aydın KARAKUŞ. Ziraat Mühendisi. EĞİTİM BİLGİLERİ. Ziraat Fakültesi Bahçe Bitkileri Bölümü-2009

T.C ANKARA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ DOKTORA TEZİ

Çizelge yılında patlıcan ve 1999 yılında domates serasına ait bilgiler.

Bazı Karnabahar Çeşitlerinin (Brassica oleracea var. botrytis) Verim, Kalite ve Bitki Özelliklerinin Belirlenmesi

YARASA VE ÇİFTLİK GÜBRESİNİN BAZI TOPRAK ÖZELLİKLERİ ve BUĞDAY BİTKİSİNİN VERİM PARAMETRELERİ ÜZERİNE ETKİSİ

Ümit SERDAR Ondokuz Mayıs Üniversitesi Ziraat Fakültesi Bahçe Bitkileri Bölümü, SAMSUN. Geliş Tarihi:

MOLEKÜLER BİYOLOJİ LABORATUVARI

DUFED 4(1) (2015) dergi anasayfa:

MOLEKÜLER BİYOLOJİDE KULLANILAN YÖNTEMLER I DNA POLİMORFİZMİNİN MOLEKÜLER MARKER LARLA ANALİZİ

Tohumluk Tescil ve Sertifikasyon Merkez Müdürlüğü. Sebze Çeşitlerinin Kayıt Altına Alınması

ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ

Proje Yürütücüsü Prof. Dr. Erdoğan Eşref Hakkı Selçuk Üniversitesi Toprak Bilimi ve Bitki Besleme Bölümü

Farklı Soya Fasulyesi (Glycine max L. Merr.) Hatlarının Bursa Ekolojik Koşullarında Bazı Verim ve Kalite Özelliklerinin Belirlenmesi

Patateste Genotip x Çevre İnteraksiyonları ve Yorumlanması

WALNUT SELECTION IN CAMILI VICINITY (ARTVIN-BORÇKA) Abstract

The Possibilities of the Direct Seeding of Watermelon Seed By Pneumatic Precision Planter

ORDU NUN ÜNYE İLÇESİNDE PALAZ FINDIK ÇEŞİDİNİN KLON SELEKSİYONU. * Geliş Tarihi: Kabul Tarihi:

Fen ve Mühendislik Dergisi 2000, Cilt 3, Sayı KAHRAMANMARAŞ BÖLGESİNDE TRABZONHURMASI (Diospyros kaki) SELEKSİYONU

Bazı Yerli ve Yabancı Ceviz (Juglans regia L. ) Çeşitlerinin Kahramanmaraş Ekolojisine Adaptasyonu

ZEYTİN ÇEŞİT GELİŞTİRME PROJESİ

ZBB306 KODLU SÜS BİTKİLERİ YETİŞTİRİCİLİĞİ DERSİ NOTLARI. Doç.Dr. Soner KAZAZ

BİLECİK ŞEYH EDEBALİ ÜNİVERSİTESİ AKADEMİK ÖZGEÇMİŞ FORMU

TARIMSAL DEĞERLERİ ÖLÇME DENEMELERİ TEKNİK TALİMATI

İncelenen özelliklere ait varyans ve regresyon analiz sonuçları aşağıda verilmiştir.

ORNEMENTAL HORTİKÜLTÜR &ÇİÇEK TASARIMI

Fen Edebiyat Fak. Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü Kütahya 1977

EĞİTİM BİLGİLERİ Namık Kemal Üniversitesi Ziraat Fakültesi 2010

BİSAB-BİTKİ ISLAHI KURSU 2013 YILI TEORİK EĞİTİM PROGRAMI (11 ŞUBAT- 17 ŞUBAT) (GENEL)

Selçuk Tarım Bilimleri Dergisi. Konya Koşullarında Bazı Aspir Çeşitlerinin Verim ve Verim Unsurlarının Belirlenmesi

YERFISTIĞI (Arachis hypogaea L.) YETİŞTİRİCİLİĞİNDE FARKLI ÇEŞİTLER VE SIRA ÜZERİ MESAFELERE GÖRE TEK VE ÇİFT SIRALI EKİM YÖNTEMLERİNİN KARŞILAŞTIRILMASI

ALBATROS YULAF ÇEŞİT ADAYININ TESCİLİ HAKKINDA RAPOR

Elazığ İli Karakoçan İlçesinden Elde Edilen Sütlerde Yağ ve Protein Oranlarının AB ve Türk Standartlarına Uygunluklarının Belirlenmesi

BAHÇE Özel Sayı: VII. ULUSAL BAHÇE BİTKİLERİ KONGRESİ BİLDİRİLERİ - Cilt I: Meyvecilik

ANTEPFISTIĞI SSR LOKUSLARINDAN YENİ ISSR PRİMERLERİNİN GELİŞTİRİLMESİ. Development Of New ISSR Prımers From Pıstachıo SSR Locı

Özgeçmiş. Çalıştığı Kurum/Kurumlar ve Yıl Ankara Üniversitesi Ziraat Fakültesi Bahçe Bitkileri Bölümü (2007-Devam) Dr. Araş. Gör.

FARKLI GÜBRE KOMPOZİSYONLARININ ÇAYIN VERİM VE KALİTESİNE ETKİSİ. Dr. GÜLEN ÖZYAZICI Dr. OSMAN ÖZDEMİR Dr. MEHMET ARİF ÖZYAZICI PINAR ÖZER

Transkript:

BAZI SARIMSAK GENOTİPLERİNİN (Allium sativum L.) VE MUTANTLARININ RAPD BELİRLEYİCİLERİ İLE TANIMLANMASI Gülay BEŞİRLİ* Münevver GÖÇMEN** Ruhsar YANMAZ*** K. Yaprak KANTOĞLU**** *Atatürk Bahçe Kültürleri Merkez Araştırma Enstitüsü-YALOVA gul662000@yahoo. com **Batı Akdeniz Tarımsal Araştırma Enstitüsü-ANTALYA ***Ankara Ün. Ziraat Fakültesi Bahçe Bitkileri Bölümü-ANKARA yanmaz@agri.ankara.edu.tr ****Türkiye Atom Ener. Kur. Nük. Tar. Ve Hay. Araş. Ens. -ANKARA kayaprakta@yahoo.com ÖZET Sarımsak (Allium sativum L.) vejetatif çoğaltılan bir sebze türü olmakla beraber, sarımsak tipleri arasında baş ve diş yapısı, diş sayısı, ağırlığı ve rengi ile yaprak özellikleri bakımından önemli farklılıklar vardır. Bu farklılığın doğada oluşan mutasyonlar sonucunda meydana geldiği düşünülmektedir. Bu noktadan hareketle, araştırmacılar sarımsakta değişik mutagenlerden yararlanılarak varyasyon yaratılabileceği fikrini geliştirmişlerdir. Bu çalışmada, varyasyon yaratmak amacıyla Kobalt-60 gama kaynağı kullanılmıştır. Çalışmanın değişik aşamaları Yalova, Ankara ve Antalya koşullarında yürütülmüştür. Işın kaynağının 0, 20, 40 ve 60 Gy dozları kullanılmıştır. Mutasyon varlığının belirlenmesinin yanında bazı sarımsak genotiplerinin tanımlanmasında RAPD belirleyicilerin kullanılma olanakları araştırılmıştır. Çalışma sonucunda, gama ışın kaynağının sarımsakta genetik değişim yaratmak amacıyla kullanılabileceği ortaya konulmuştur. Anahtar Kelimeler: Sarımsak, Allium sativum L., gama ışını, mutasyon, RAPD DIVERSITY OF SOME GARLIC (Allium sativum L.) GENOTYPES AND MUTANTS BY RAPD MARKERS ABSTRACT Garlic (Allium sativum L) is a vegetatively propagated vegetable, however there is variation among garlic types as bulb structures and colour, clove weight, colour and number, leaves number and colour. Researchers had supposed these variations were became by mutation in the nature. So, they though this instrument can be used by mutagens for getting variation on vegetatively propagated plants like garlic. One of the purpose of this study was to get mutants via irradiation in garlic and.to detect mutation by using RAPD markers and second to obtain possibility of RAPD markers using for genetic variability. The different part of the study carried out in Yalova, Ankara and Antalya condition with T 56 clone which is selected bay clone selection and 7 different garlic clones. Gamma rays radiation sources and 0, 20, 40 and 60 Gy doses were used. The results showed that genetic variation between mutants and clones can be got by RAPD markers.. Key Words: Garlic, Allium sativum L., gamma rays, mutation, RAPD GİRİŞ Sarımsak vejetatif olarak çoğaltılan bir tür olması nedeni ile genel olarak genetik değişimin az olması beklenen bir türdür. Ancak, uzun yıllardır sarımsak yetiştiriciliği yapılan bölgelerde birbirinden farklı çok sayıda sarımsak tipi bulunmaktadır. Bazı araştırmacılar bu varyasyonun nedenini, kromozomlarda değişik nedenlerle meydana gelen değişimlerin birikerek ortaya çıkması ve zaman içerisinde mutasyonlardan dolayı kromozom seviyesinde olan somatik hibridizasyonların meydana gelmesi şeklinde yorumlamıştır. Bu yaklaşım, suni mutagenler kullanarak mutasyon yoluyla genetik varyasyon yaratılabileceği fikrinin gelişmesine neden olmuştur (Matus et al. 1999). Çiçeklenmeyen bitkilerden yeni tipler geliştirmek üzere yararlanılan en önemli ıslah metotlarından birisi mutasyondur. Mutasyon ıslahında fiziksel ve kimyasal kaynaklı birçok mutagen kullanılmaktadır. Son yıllarda nükleer teknikler mutagen olarak kullanılıp mutant adaylar arasından amaca uygun bitki seçimleri yapılabilmektedir. Bu amaçla yaygın olarak beta ve gama ışın kaynakları kullanılmaktadır. Özellikle Kobalt-60 ve Sezyum-137 gama ışın kaynakları bitki ıslahı çalışmalarında geniş ölçüde kullanım alanı bulmaktadır (Demir ve Turgut 1999, Anonim 2002). Yapılan mutasyon çalışmaları sonucunda 562 si tarımsal üretimde kullanılan ve 67 si süs bitkisi olmak üzere toplam 629 adet çeşit Uluslararası Atom Enerjisi Ajansı (IAEA) kayıtlarında yer

almaktadır. Tarımsal üretimde kullanılan çeşitlerin 534 tanesi tohum ile çoğaltılan türlere ait iken, 28 tanesi vejetatif çoğaltılan bitki türlerine aittir. Vejetatif çoğaltılan çeşitler arasında Allium macrostemon sarımsak türüne ait Ninguan 1 isimli bir sarımsak çeşidi de yer almaktadır. Bu çeşidin geliştirilmesinde fiziksel mutagen kaynağı olarak gama ışın kaynağının 15 Gy lik dozu kullanılmıştır. Ajansa kayıtlı olup, mutasyon ıslahı ile geliştirilen diğer yumrulu ve soğanlı bitki türleri arasında patates ve iris türleri vardır (Anonim 2004). DNA analiz yöntemleri botanik sınıflandırılması hala tartışılan sarımsakta genetik varyasyonun belirlenmesi amacı ile kullanılmaktadır. Al- Zahim, et al. (1997), dünyanın farklı yerlerinden topladıkları 27 sarımsak tipi arasındaki genetik farklılığın belirlenmesinde RAPD metodundan yararlanmışlardır. Peiwen et al. (2001), Tayland ve Çin koşullarında Güney Asya kökenli sarımsak klonları arasındaki genetik farklılığı ortaya koymak amacı ile yürüttükleri çalışmada RAPD tekniğini kullanmışlardır. Operon grubuna ait 55 primerin amplifikasyon oluşturmak amacı ile test edildiği denemede 5 primerin 31 sarımsak klonunu genetik olarak tanımlamada kullanılabileceğini belirleyen araştırmacılar RAPD tekniğinin sarımsakları tanımlama ve sınıflandırma çalışmalarında kullanılabilecek faydalı ve etkili bir teknik olduğunu bildirmektedir. Nabulsi et al. (2001) mutagen olarak gama ışın kaynağının kullanılması sonucu elde edilen 8 mutant sarımsak klonunun beyaz kök çürüklüğüne (Sclerotium cepivorum) dayanıklılığını moleküler düzeyde, şahit eşliğinde belirleme çalışmalarında RAPD-DNA tekniğini kullanmışlardır. Çalışma sonucunda OPB-15 primerinin dayanıklı mutant sarımsak klonlarını belirlemede kullanılabileceğini saptayan araştırmacılar bu tekniğin, sarımsakta mutasyon ıslahı çalışmalarında dayanıklı bireylerin daha çalışmanın ilk aşamasında belirlenmesinde faydalı olduğunu bildirmektedir. Bu çalışmanın amacı, biryandan vejetatif olarak çoğaltılması nedeniyle genetik değişimin sınırlı olduğu sarımsakta mutasyon yoluyla değişim yaratabilme olanaklarını araştırmak diğer taraftan da elde edilen mutantları ve değişik sarımsak genotiplerinin ayırt edilmesinde RAPD belirleyicilerin kullanılıp kullanılamayacağını ortaya koymaktır. MATERYAL ve METOT Varyasyon yaratma çalışmaları: Bu çalışma sadece Kastamonu sarımsağından geliştirilen T 56 klonunda yürütülmüştür. Bu amaçla TAEK-NTHAMRB de bulunan Kobalt-60 kaynağından yararlanılmıştır (Anonim 2002b).Işınlamak amacıyla 2.5-3.5 g ağırlığındaki dişler kullanılmıştır. DNA parmak izlerinin belirlenmesi: DNA parmak izi belirleme çalışmalarında Çizelge 1. ve 2 de isimleri ve özellikleri belirtilen sarımsak materyalleri kullanılmıştır (Beşirli vd. 1994, Beşirli vd. 1999). DNA sentezlenmesi için kullanılan belirleyiciler: DNA sentezlenmesi için 10 bazlık tesadüfi nükleotid diziliminden oluşan aşağıda isimleri yazılan 31 RAPD belirleyicisi kullanılmıştır (Anonim 2001). Bunlar: OPE- 8, OPE-9, OPE-10, OPE-11, OPE 12, OPE-14, OPE-15, OPE-18, OPF-14, OPF-15, OPF-16, OPF-17, OPF-18, OPF-19, OPF-20, OPI-6, OPI-8, OPI-13, OPI-15, OPI-17, OPI-18, OPI-19, OPI-20, OPO-08, O8T-10, 4A-20, 4A-24, 4A-25, 4A-27, 4A-28 ve 4A-29 (Al-Zahim et al.1997). Çizelge 1. DNA analizi yapılan sarımsak materyalleri Materyal no Materyal adı Materyalin orijini 1 (Şahit) T 56 (0 Gy) Taşköprü Merkez-KASTAMONU Çeşit Adayı Klon 2 E 32 Taşköprü-Aşağıayvalı Köyü-KASTAMONU 3 A 2 Merkez Eşen Köyü- KASTAMONU 4 Kastamonu pop. Taşköprü pazarı 5 20 Gy T 56, Kobalt-60 6 40 Gy T 56, Kobalt-60 7 60 Gy T 56, Kobalt-60 8 Alata 1 Alata Bahçe Kültürleri Araştırma Enstitüsü-Erdemli/ İÇEL 9 Fr 1 ABKMAE-Yalova 10 Fr 7 ABKMAE-Yalova DNA parmak izlerinin belirlenmesi: Gerek ışınlama sonrasında T 56 klonunda mutasyonla değişimin oluşup oluşmadığını gerekse Kastamonu sarımsağının diğer sarımsaklara göre moleküler düzeyde farklılığını ortaya koymak amacıyla DNA parmak izinin çıkarılması amacıyla RAPD tekniğinden yararlanılmıştır (Anonim 2001). DNA izolasyonunun yapılması: 10 ayrı sarımsak materyali bitkilerden 0.5-1.0 g taze yapraklar alınmış ve sıvı azotta ezilerek Doyle ve Doyle (1990)'ye göre yapılmıştır. DNA nın Sentezlenmesi: DNA nın sentezlenmesi, 10 bazlık tesadüfi nükleotid diziliminden oluşan 31 RAPD primerinin, PCR tekniği kullanılarak yapılmıştır. PCR için hazırlanan reaksiyon miktarı 25 µl'dir. Her bir reaksiyon karışımı (Açık vd. 1997, Al-Zahim et al. 1997, Göçmen vd. 1999) protokollerine göre hazırlanmıştır. PCR ürünleri % 1.5'lik agaroz jelde ayrıştırılarak jel edityum bromid ile boyanmış ve Ultra Viyole (UV) ışığında fotoğraflanmıştır

DNA verilerinin değerlendirilmesi: Her bir primer için sarımsak materyallerinin oluşturduğu bant desenleri birbiri ile karşılaştırılarak, materyallerin birbirine benzerlik indeksleri % olarak hesaplanmıştır. Bu değerlere göre UPGMA metodu esas alınarak dendogram oluşturulmuştur (Rohlf 1992). Çizelge 2. Denemede incelenen sarımsak materyallerinin bazı özellikleri M. No BÇ (cm) BY (cm) BA (g) KS(adet/baş) DS(adet/baş) DA(g) 1 4.0 3.7 20.96 4-6 12-14 1.46 2 3.3 3.1 16.12 4-6 13 0.96 3 3.4 3.4 17.50 4-6 12.80 0.96 4 3.6 3.7 18.88 4-6 18.16 1.00 8 6.2 5.1 65.13 4.0 4.42 14.68 9 4.0 4.0 27.21 4-5 14.80 1.72 10 4.0 4.0 26.81 4-5 14.70 1.72 M: Materyal, BÇ: Baş çapı, BY: Baş yüksekliği, BA: Baş ağırlığı, KS: Kabuk sayısı, DS: Diş sayısı, DA: Diş ağırlığı BULGULAR VE TARTIŞMA Kastamonu populasyonundan geliştirilen A2, E32 ve T56 klonları, Kastamonu populasyonu ve T56 nın 20, 40 ve 60 Gy dozla ışınlanmış olan bitkilerinden elde edilen yaprak örneklerinde RAPD tekniği kullanılarak DNA analizi yapılmıştır. Ayrıca, Alata 1, Fr 1 ve Fr 7 çeşitleri de karşılaştırma amacıyla denemeye ilave edilmiştir. DNA analizleri sonucunda, Operon grubuna ait, tesadüfi nükleotid dizilimlerinden oluşan 31 primer test edilmiştir. Test edilen 31 RAPD primerinin 16 tanesinde polimorfik DNA bantları elde edilmiştir. 5 primerde monomorfik DNA bantları oluşturmuştur. 10 primerde ise DNA amplifikasyon gerçekleşmemiştir. Çalışma sonucunda elde edilen DNA bant verilerinin değerlendirilmesi ile sarımsak materyallerinin birbiri ile olan genetiksel benzerlik oranları % olarak çizelge 3'te gösterilmiştir. Çizelge 3. Sarımsak bitkilerinin benzerlik indeksi (%) M No T 56 E 32 A 2 Şahit 20 Gy 40 Gy 60 Gy Alata 1 Fr1 Fr7 T 56 - E 32 100 - A 2 100 100 - Şahit 100 100 100-20 Gy 90 90 90 90-40 Gy 89 89 89 89 94-60 Gy 85 85 85 85 91 93 - Alata 1 38 38 38 38 40 38 38 - Fr1 79 79 79 79 81 77 80 54 - Fr7 71 71 71 71 75 80 77 44 79 - UPGMA bilgisayar programı kullanılarak, elde edilen benzerlik indeksi değerleri sınıflandırılmış ve sarımsak materyalleri arasındaki genetik benzerlik ilişkileri Şekil 1'de verilen dendogram üzerinde gösterilmiştir. Elde edilen dendogram incelendiğinde 3 farklı grup oluşmuştur. Çalışmada ayrıca sarımsak için genetik varyasyonu açıklayan en uygun RAPD primerleri belirlenmiş ve denemede yer alan sarımsak materyallerine ait RAPD-DNA parmakizleri çıkarılmıştır. İncelenen primerlerden OPE-8 ve OPE-14 primerler ile yapılmış RAPD-PCR ürünlerinin %1.5'lik agaroz jelde ayrıştırılması sonucu oluşan monomorfik ve polimorfik DNA bantları Şekil 2'de verilmiştir. Yapılan bu çalışmada, 10 sarımsak materyali arasında genetik varyasyon RAPD-PCR tekniği kullanılarak gösterilmiştir (Çizelge 4). Burada, sarımsak materyalinin amfikasyon oluşturarak bant teşekkül ettikleri markörler + işareti ile belirtilmiştir. Sarımsak vejetatif olarak çoğaltılan bir bitki olmakla beraber doğada çok sayıda farklı sarımsak tipinin bulunması, araştırmacıları doğal mutasyonların gerçekleşmiş olabileceği ve mutasyon tekniği ile varyasyon yaratılabileceği görüşüne itmiştir. Bu noktadan hareketle sarımsak ıslahında mutasyon ıslahı alternatif bir ıslah yöntemi olarak kullanılmaya başlanmıştır (Soeranto, 2002). Nitekim Çin de bu yolla bir sarımsak çeşidinin geliştirildiği bildirilmektedir (Anonim 2002a, 2002b). Bu çalışmada, sarımsakta gama ışın kaynağı kullanılarak varyasyon oluşturma olanakları araştırılmıştır. Bu amaç ile, T 56 klonuna ait dişler 0, 20, 40 ve 60 Gy dozlarında Kobalt-60 ışın kaynağı kullanılarak ışınlanmıştır. Işınlama sonrası bitkilerin gelişimi incelenmiş, doz miktarı arttıkca gelişimin yavaşladığı ve daha ileri gelişim aşamasında yüksek doz uygulamsı yapılan bitkilerin öldüğü tespit edilmiştir (Taner vd. 2004).

1 2 3 4 5 6 7 9 10 8 40.00 50.00 60.00 70.00 80.00 90.00 100.00 Şekil 1. RAPD-PCR Amplifikasyon ürünlerinde cluster (UPGMA) analizi kullanılarak oluşturulan sarımsak materyallerine ait dendogram 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 OPE-8 OPE-14 Şekil 2. Sarımsak materyallerine ait RAPD-PCR ürünlerinin %1.5 agaroz jelde ayrıştırılması (Primerler; OPE-8 ve OPE 14)

Çizelge 4. Sarımsakta genetik varyasyonu gösteren polimorfik RAPD primerleri Primerler Sarımsak materyalleri T 56 E 32 A 2 Şahit 20 Gy 40 Gy 60 Gy Alata 1 Fr 1 Fr 7 OPE-8 450 + + + + + + + + + OPE-8 700 + OPE-8 800 + + + + + + + + OPE-8 1200 + + + + + + + + + OPE-8 1600 + + + + + + + + OPE-14 600 + + + + + + + + + OPE-14 1600 + OPE-15 750 + OPE-15 900 + OPI-6 300 + + OPI-6 500 + + OPI-6 700 + + + + + + + + + OPI-19 450 + + + + + + + OPI-19 1400 + OPI-19 1600 + + + + + + + OPI-19 1800 + + + + + + + + + 4A-20 300 + + + + + + + + + 4A-24 600 + 4A-27 500 + 4A-28 1100 + + + + + + + 4A-29 1000 + + + + + + + + + Mutasyon ile varyasyonun oluşturulabilirliği moleküler düzeyde RAPD-DNA parmak izi belirleme yöntemiyle belirlenmiştir. Elde edilen DNA bant verileri, sarımsak materyalleri arasındaki benzerliğin, incelenen primerler açısından % 38-100 arasında değişim gösterdiğini ortaya koymuştur. Daha önce de belirtildiği gibi, RAPD belirleyicilerle yürütülen denemelerde, yöntemin çalışıp çalışmadığını kontrol etmek amacıyla farklı sarımsak çeşitleri de denemeye alınmıştır. Kastamonu populasyonundan seçilen T 56, E 32 ve A 2 nolu klonlar ile şahit olarak alınan Kastamonu sarımsak populasyonunun genetik olarak birbirlerine benzerlik oranlarının, polimorfik bulunan 16 RAPD primeri ile yapılan testlemelerde % 100 olduğu belirlenmiştir. Buna karşılık T 56 klonunda, farklı dozlardaki ışınlama sonucunda elde edilen örneklerde ise benzerlik oranı yaklaşık % 85-94 olarak belirlenmiştir. Bu da ışınlama ile bireyler arasında bir değişimin meydana geldiği izlenimini vermektedir. RAPD belirleyiciler ile yapılan çalışmalar sonucunda, ülkemizde Allium sativum türü olarak tescil edilmiş olan ve şu anda ülkemizdeki tek tescilli sarımsak çeşidi olarak bilinen Alata-1 sarımsağının aslında Allium sativum L. türü olmadığı ortaya konulmuştur. Ortalama baş ağırlığı 60 gramın üzerinde olan bu sarımsak çiçeklenme gösterir ise, çiçek sapı etrafında ağırlığı 12-16 g olan 4-6 adet diş oluşturmaktadır. Bitkide çiçeklenme görülmez ise soğan görünümlü tek dişli başlar oluşmaktadır. Çiçeklenme görülen başların çiçek tablasında tohum oluşumu gerçekleşmemektedir. Yapılan değerlendirmeler sonucunda bu sarımsağın Allium ampeloprasum L. türü olduğu kanaatine varılmıştır ( Jones and Mann 1963, Brewster 1994). Açık vd. (1997), Al-Zahim et al. (1997), Song et al. (2000), Etoh ve Hong (2001), Peiwen et al. (2001) ve İpek vd. (2003) sarımsak klonlarının moleküler düzeyde tanımlaması ve sınıflandırmasını yapmak üzere RAPD tekniğinin kullanmışlar ve bu çalışmaların yapıldığı yıllarda kullanılmakta olan diğer teknikler ile elde edilen sonuçların kıyaslamasını yaparak sarımsağın genetik olarak tanımlanmasında RAPD tekniğinin güvenilir olarak kullanılabileceğini vurgulamışlardır. Adı geçen teknik, mutant sarımsak bireylerini ayrıt etmede de kullanılmaktadır (Nabulsi et al. 2001). Yapılan bu çalışma ile, gama ışın kaynağından yararlanarak sarımsakta varyasyon oluşturulabileceği RAPD tekniği ile ortaya konulmuştur. Elde edilen bulguların bundan sonra bu alanda çalışacak olan araştırmacılara kaynak oluşturacağı düşünülmektedir. KAYNAKLAR Açık, L., Samancı, B, Yapar, M., Kubar, A. 1997. Genetic analysis of certain Allium species with RAPD-PCA. Akdeniz Üniversitesi Ziraat Fakültesi, 10, 136-142.

Al-Zahim, M., Newbury, H. J. and Ford-Llyod, B.,V. 1997. Classification of genetic variation in garlic (Allium sativum L.) revealed by RAPD. Hort Science Vol. 32 (6), October. Anonim 2001. Bitki biyoteknolojisi, II, genetik mühendisliği ve uygulamaları (Editörler: Özcan, S., Gürel, E., Babaoğlu, Mehmet), Genetik markörler ve analiz metodları (Yıldırım, A., Kandemir, N.), s: 334-363, Selçuk Üniversitesi Basımevi, Konya. Anonim, 2002a. Plant Breeding and Genetics Newsletter, No: 9, International Atomic Energy Agency, ISSN 1564-2569, Vienna. Anonim, 2002b. Bitki ıslahında mutasyon ve doku kültürü teknikleri (Yayınlanmamış kurs notu), Türkiye Atom Enerjisi Kurumu Ankara Tarım ve Hayvancılık Araştırma Merkezi Nükleer Tarım Radyobiyoloji Bölümü, 111 s., Ankara. Anonim, 2004. Mutation breeding review. Inter. Atomic Energy Agency. (IAEA), No: 14, Wien, Austria. Beşirli, G., İnan, Y., Türkeş, T., 1994. Sarımsak çeşit tesbit denemesi, bilimsel araştırma ve incelemeler yayın No: 41, 14 s., Atatürk Bahçe Kültürleri Merkez Araştırma Enstitüsü, Yalova. Beşirli G., Yanmaz, R., Güçlü, D., 1999. Sarımsak yetiştiriciliğinde diş iriliğinin baş iriliği ve verime etkisi, Türkiye III. Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi Bildiri Kitabı 715-719 s., Ankara. Brewster, J. L.1994. Onion and other vegetable Alliums, CAB International, 236 p., UK. Doyle, J. J., Doyle j. I. 1990. Isolation of plant DNA from fresh tissue focus 12; 13-15p. Demir, İ., Turgut, İ., 1999. Genel bitki ıslahı, E. Ü. Ziraat Fakültesi, 451 s., İzmir. Etoh, T. and Hong, C. 2001. RAPD markers for fertile garlic. II. Inter. Symposium on Edible Alliaceae, Acta Hort. 555. 2009-212 p., ISHS. Göçmen, M., Polat, İ., Özçelik, N., Ekiz, H. 1999. Domateslerde (Lycopersicum esculentum Mill.) DNA parmak izlerinin RAPD markörlerle belirlenmesi, 469-473 s., Türkiye III. Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi, Ankara. İpek, M., İpek, A., Simon, P. W. 2003. Comparison if AFLPS, RAPD markers, and isozymes for diversity assessment of garlic and detection of putative dublicates in germplasm collections. Journal of the American Society for Horticultural Science, 128:246-252. Jones, H. A and Mann, L. K. 1963. Onions and their Allies, Leonard Hill, 285 p., London. Matus, I., Gonzalez, M. I., del Pozo, A., 1999. Evaluation of phenotypic variation in a chilean collection of garlic (A. sativum L.) clones using multivariate analysis. Plant Genetic Resources Newsletter, No: 117, 31-36 p. Nabulsi, I., Mir Ali, N. and Arabi, MIE. 2001. Evaluation of some garlic (A. satıvum L.) mutantn resistant to white rot disease by RAPD analysis, Annals ao Applied biology, Volume 138, Number 2, 197-202(6) p., SYRIA Peiwen, X., Srinives, P. and Yang, C. Y. 2001. Genetic identification of garlic cultivars and lines by using RAPD assay. II. IS edible Alliaceae, Acta Hort. 555, 213-220 p., ISHS. Rohlf, F. J. 1992. NTSYS-PC: Numerical taxonomy and multivaiate anaysis system, Exeter soft-ware, New York. Soeranto, H. 2002. Varietal improvement of vegetatively propagated crops by mutation techniques in Indonesia, National Nuclear Energy Agency, Pasar Jumat, Box 7002 JKSKL, Jakarta 12070. Song, Y. S., Kajima, A., Nunome, T. and Hirai, M. 2000. Classification of garlic accession by means of DNA polymorphism, plant & animal genome VIII conference, San Diego, CA. Taner, Y., Beşirli, G., Kunter, B. ve Yanmaz, R. 2004. Sarımsakta (Allium satıvum L.) radyasyonla mutasyon ıslahına yönelik olarak etkili mutasyon dozunun belirlenmesi, Bahçe 33 (1-2):95-99 s., Yalova.