Agresif Periodontitis li Türk Hastalarda Vitamin D Reseptör Geni Apa I ve Taq I Polimorfizmlerinin Görülme Sıklığı

Benzer belgeler
Parkinson Hastalığı ile α-sinüklein Geni Polimorfizmlerinin İlişkisinin Araştırılması

POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU (PZR-PCR) VE RESTRİKSİYON PARÇA UZUNLUĞU POLİMORFİZMİ (RFLP)

KRONİK BÖBREK HASTALIĞI (YETMEZLİĞİ) OLAN TÜRK HASTALARINDA TÜMÖR NEKROZ FAKTÖR ALFA ve İNTERLÖKİN-6 PROMOTER POLİMORFİZMLERİNİN ETKİSİ

Periodontal hastalık, Agresif periodontitis,kronik periodontitis

Böbrek nakli hastalarında akut rejeksiyon gelişiminde CTLA-4 tek gen polimorfizmlerinin ve soluble CTLA-4 düzeylerinin rolü varmıdır?

Sebahat Usta Akgül 1, Yaşar Çalışkan 2, Fatma Savran Oğuz 1, Aydın Türkmen 2, Mehmet Şükrü Sever 2

REKOMBİNANT DNA TEKNOLOJİSİ. Araş. Gör. Dr. Öğünç MERAL

MOLEKÜLER TANISI DÜZEN GENETİK HASTALIKLAR TANI MERKEZİ. SERPİL ERASLAN, PhD

IL28B genotip tayini kronik hepatit B hastalarında oral antiviral tedavi cevabını öngörmede kullanılabilir mi?

SNP TEK NÜKLEOTİD POLİMORFİZMLERİ (SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS)

AİLESEL AKDENİZ ATEŞİ (AAA-FMF)

PERİODONTİTİSLER I- KRONİK PERİODONTİTİS

POYRAZ TIBBİ CİHAZLAR EDVOTEK

KRONİK VİRAL HEPATİT C Lİ HASTALARDA IL28B NİN İNTERFERON TEDAVİSİNE YANITLA İLİŞKİSİ. Dr. Gülay ÇEKİÇ MOR

HLA Tiplendirmesi PCR-SSP. Türker Duman PhD

Klinik Araştırmalarda Farmakogenetik Bilginin Kullanılmasına Giriş ve Örnekler

Agaroz jel elektroforezi

BAKTERİLERİN GENETİK KARAKTERLERİ

KAPİLLER ELEKTROFOREZ DNA SEKANSLAMA

TÜBERKÜLOZ DIŞI MİKOBAKTERİLERİN TANIMLANMASINDA PCR-RFLP VE DNA SEKANS ANALİZİ SONUÇLARININ KARŞILAŞTIRILMASI

hendisliği BYM613 Genetik MühendisliM Tanımlar: Gen, genom DNA ve yapısı, Nükleik asitler Genetik şifre DNA replikasyonu

HAFTA III Bağlantı, Asosiyasyon, Haritalama

attomol apo B-100 quicktype

T.H. Morgan ve A.H. Sturtevant 1911

Mikrobiyolojide Moleküler Tanı Yöntemleri. Dr.Tuncer ÖZEKİNCİ Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji A.D

Prof.Dr. Meltem Yalınay Çırak Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji A.D. SALGINLARIN İZLENMESİ VE MOLEKÜLER

Major Depresif Bozukluk (MDD) Dünyada maluliyete sebep olan en sık ikinci hastalık Amprik tedavi yaklaşımı İlaca yanıt Yan etki bireysel farklılıklar

D Vitaminin Relaps Brucelloz üzerine Etkisi. Yrd.Doç.Dr. Turhan Togan Başkent Üniversitesi Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji

MEME KANSERİ HASTALARINDA JAM-A VE LFA-1 GEN VARYASYONLARININ ETKİSİNİN İNCELENMESİ

Gen Arama Yordamı ve Nörolojik Hastalıklarla İlgili Gen Keşfi Çalışmalarına Türkiye den Örnekler

Emrah Salman, Zeynep Ceren Karahan Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi. Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

RENAL TRANSPLANT ALICILARINDA C5aR 450 C/T GEN POLİMORFİZMİ: GREFT ÖMRÜ İLE T ALLELİ ARASINDAKİ İLİŞKİ

Periodontoloji nedir?

Dr. Nilay HAKAN Muğla Sıtkı Koçman Üniv. Tıp Fak. Neonatoloji Bilim Dalı Perinatal Medicine Nisan 2017, İZMİR

Isırıkla İlgili Literatür İncelemesi

Genom analizi için belirteç olarak kullanılan DNA dizileri

15- RADYASYONUN NÜKLEİK ASİTLER VE PROTEİNLERE ETKİLERİ

SİGARA KULLANAN VE KULLANMAYAN BİREYLERİN PERİODONTAL DURUMLARININ KARŞILAŞTIRILMASI

Tüberküloz Hastalarında Sitokin Gen Polimorfizmi ve Genetik Yatkınlığın Belirlenmesi*

Postmenopozal Kadınlarda Vücut Kitle İndeksinin Kemik Mineral Yoğunluğuna Etkisi

MOLEKÜLER BİYOLOJİ LABORATUVARI

Maskeli Hipertansiyonda Anormal Tiyol Disülfid Dengesi

PERİODONTİTİSLİ HASTALARDA MATRİKS METALLOPROTEİNAZ-9 VE TÜMÖR NEKROZİS FAKTÖR-RESEPTÖR 2 GEN POLİMORFİZMLERİNİN İNCELENMESİ

ETKİN İLAÇ KULLANIMINDA GENETİK FAKTÖRLER. İlaç Kullanımında Bireyler Arasındaki Genetik Farklılığın Mekanizması

SAĞ VE SOL KOLON YERLEŞİMLİ TÜMÖRLER: AYNI ORGANDA FARKLI PATOLOJİK BULGULAR VE MİKROSATELLİT İNSTABİLİTE DURUMU

TÜBİTAK BİDEB LİSE ÖĞRETMENLERİ FİZİK, KİMYA, BİYOLOJİ, MATEMATİK- PROJE DANIŞMANLIĞI EĞİTİMİ ÇALIŞTAYI LİSE3 (Çalıştay 2013) BİYOLOJİ GRUP TUHAF

Kırım Kongo Kanamalı Ateş hastalarında ağırlık ve ölüm riskinin tahmininde plazma cell-free DNA düzeyinin önemi

Farmakogenetikte Kullanılan Temel Yöntemler

PCR Bir reaksiyonun kurulması ve optimize edilmesi

SALGIN ARAŞTIRMASINDA KULLANILAN TİPLENDİRME YÖNTEMLERİ

Metallothionein-2A Heterezigot Gebe Kadınlar ve Yenidoğanları Daha Yüksek Kan Kurşun Düzeyleri İçin Risk Grubu mudur?

ARAŞTIRMA (Research Report)

GENETİK POLİMORFİZMLER. Prof. Dr. Filiz ÖZBAŞ GERÇEKER

GENETİK TANI YÖNTEMLERİ. Prof.Dr.Mehmet Alikaşifoğlu

Derece Bölüm/Program Üniversite Yıl Y. Lisans DİŞHEKİMLİĞİ İSTANBUL ÜNİVERSİTESİ 2002

α1-antitrypsin quicktype

NEVŞEHİR İLİNDE HEPATİT C VİRÜS GENOTİP DAĞILIMI İLE SERUM ALANİN AMİNOTRANSFERAZ VE KANTİTATİF SERUM HCV RNA DÜZEYLERİ İLİŞKİSİ*

İstanbul Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji AD Prof. Dr. Filiz Aydın

Hücre içinde bilginin akışı

VİRAL TANI KİTLERİ (GFJ-480)

attomol lactose intolerance C>T quicktype

CANDİDA İLE UYARILMIŞ VAJİNAL VE BUKKAL EPİTEL HÜCRELERİNİN SİTOKİN ÜRETİMİ

Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi, Genel Pediatri, Ankara, Türkiye 2. Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi, Pediatrik Endokrinoloji, Ankara, Türkiye 3

RTA JEL / PZR Saflaştırma Kiti

Tanı ve Tedavi Planlaması. Prof.Dr. Kıvanç Kamburoğlu Ankara Üniversitesi Diş Hekimliği Fakültesi Ağız, Diş ve Çene Radyolojisi Ana Bilim Dalı

T. C. İSTANBUL BİLİM ÜNİVERSİTESİ SAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ BİYOKİMYA ANABİLİM DALI YÜKSEK LİSANS PROGRAMI EĞİTİM-ÖĞRETİM YILI MÜFREDATI

BETA ADRENERJİK RESEPTÖR 2 KODON 27 POLİMORFİZMİ İLE MEME KANSERİ ARASINDAKİ İLİŞKİNİN ARAŞTIRILMASI

GENETİK LABORATUVARI

ETKİN İLAÇ KULLANIMINDA GENETİK FAKTÖRLER. İlaç Kullanımında Bireyler Arasındaki Genetik Farklılığın Önemi

(ZORUNLU) MOLEKÜLER İMMÜNOLOJİ I (TBG 607 TEORİK 3, 3 KREDİ)

İ. Ü İstanbul Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı Prof. Dr. Filiz Aydın

¹GÜTF İç Hastalıkları ABD, ²GÜTF Endokrinoloji Bilim Dalı, ³HÜTF Geriatri Bilim Dalı ⁴GÜTF Biyokimya Bilim Dalı

Antalya İlindeki Beta-Talasemi Gen Mutasyonları, Tek Merkez Sonuçları

NEİSSERİA MENİNGİTİDİS SEROGRUP B AŞI ANTİJENLERİNİN GENETİK ANALİZİ: MENB AŞILARI TÜRKİYE İZOLATLARINI KAPSIYOR MU?

Anahtar kelimeler: Kronik böbrek yetmezliği, MTHFR, A1298C, C677T

Biyolojik İmmünojenitesi

Juvenil SPondiloArtrit/Entezit İle İlişkili Artrit (SPA-EİA)

Enzimlerinin Saptanmasında

MİDE KANSERİNDE APOPİTOZİSİN BİYOLOJİK BELİRTEÇLERİNİN PROGNOSTİK ÖNEMİ

VDR KOD A Vitamin D reseptör geninde (vdr) polimorfizmlerin belirlenmesi için kit

HPV Moleküler Tanısında Güncel Durum. DNA bazlı Testler KORAY ERGÜNAY 1.ULUSAL KLİNİK MİKROBİYOLOJİ KONGRESİ

Diyabetik Periferik Nöropati; Çevresel ve Genetik Faktörlerin Etkisi

Metilen Tetrahidrofolat Redüktaz Enzim Polimorfizmlerinde Perinatal Sonuçlar DR. MERT TURGAL

mirna Profilleri Hepatoselüler Kansere Gidişte Marker Olabilir mi?

Replikasyon, Transkripsiyon ve Translasyon. Yrd. Doç. Dr. Osman İBİŞ

Niçin PCR? Dr. Abdullah Tuli

SADE ve SAGE ve Gen Ekspresyonunun Seri Analizi. Prof.Dr. Nermin GÖZÜKIRMIZI

Dr. Semih Demir. Tez Danışmanı. Doç.Dr.Barış Önder Pamuk

Kromozom, DNA ve Gen. Allel Segregasyonu. DNA çift sarmalı. Hastalık yapan mutasyonlar protein fonksiyonunu bozar. Hastalık yapan mutasyonlar

Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR: Polymerase Chain Reaction) Ayten AŞKIN KILINÇ Veteriner Hekim

KOLOREKTAL KARSİNOMLU HASTALARDA PRİMER İLE METASTAZ ARASINDA KRAS DİSKORDANSI

attomol HLA-B*27 Sadece in vitro diagnostik kullanım içindir! 1.Giriş 2. Genel Açıklamalar

Periodontoloji nedir?

Polimeraz Zincir Reaksiyonu. Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

ENDODONTİK TEDAVİDE BAŞARI VE BAŞARISIZLIĞIN DEĞERLENDİRİLMESİ

BRCA 1/2 DNA Analiz Paneli

Doç. Dr. Z. Ceren KARAHAN

7. PROKARYOTLARDA GEN İFADESİNİN DÜZENLENMESİ

7. PROKARYOTLARDA GEN İFADESİNİN DÜZENLENMESİ

Serçin Güven, Harika Alpay, Neslihan Çiçek, Ali Yaman, Pınar Vatansever, İbrahim Gökçe

Transkript:

ARAŞTIRMA (Research) Hacettepe Dişhekimliği Fakültesi Dergisi Cilt: 31, Sayı: 2, Sayfa: 79-84, 2007 Agresif Periodontitis li Türk Hastalarda Vitamin D Reseptör Geni Apa I ve Taq I Polimorfizmlerinin Görülme Sıklığı The Frequency of Apa I and Taq I Polymorphisms of the Vitamin D Receptor Gene in Turkish Patients with Localized Aggresive Periodontitis *Dr. Melda MISIRLIOĞLU, **Prof.Dr. Sebahat GÖRGÜN * Kırıkkale Üniversitesi Dişhekimliği Fakültesi, Oral Diagnoz ve Radyoloji Anabilim Dalı ** Ankara Üniversitesi Dişhekimliği Fakültesi, Oral Diagnoz ve Radyoloji Anabilim Dalı ÖZET Giriş: Agresif periodontal hastalıklar (AP); heterojen hastalıklar grubuna giren, erken başlangıç ve değişik periodontal yıkımlarla farklı karakteristik özellikler gösteren bir hastalıktır. Hastalığın ilerlemesinde patojenik bakteriler, primer etyolojik ajanlar olarak bilinse de, kişilerin genetik ve çevresel risk faktörlerine bağlı olarak etkilenmeleri de çok önemli bir unsurdur. Agresif periodontitis vakalarında aileden gelen bir veya birden fazla genin hastalıktan sorumlu olabileceği düşünülmektedir. Amaç: AP nin bir özelliği olan kemik kaybı, hastalık varlığında kemik hemostazı parametreleri ile Vitamin D reseptör (VDR) genindeki polimorfizimlerin birlikte değerlendirilmesine olanak sağlamaktadır. Çalışmamızda AP ile VDR genindeki Apa I ve Taq I polimorfizmlerinin birlikteliğinin araştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: 46 tane agresif periodontitis hastası ve 49 tane sağlıklı kontrol grubundan oluşturulmuştur. VDR gen bölgesi PCR (Polimeraz zincir reaksiyonu) yöntemi çoğaltılıp, genotipler PCR-RFLP (restriksiyon parça uzunluk polimorfizmi) yöntemi ile saptanmıştır. Sonuç: kontrol grubu ve LAP hasta grubu arasında genotip dağılımı veya allel sıklığı arasında anlamlı bir fark saptanmamıştır (p>0.05). ABSTRACT Objectives: Aggresive periodontal diseases (AP) are a heterogeneous group of diseases, sharing several characteristics including aggresive and severe periodontal destruction. Although periodontopathogenic bacteria are primary etiologic agents in the disease process, affected individuals suggest genetic factors also are important. Aim: Both genetic and environmental risk factors are important in AP. Genetic polymorphisms in the Vitamin D receptor (VDR) gene are associated with parameters of bone homeostasis and with diseases in which bone loss is one feature of AP. There for, to determine whether AP is associated with a polymorphism in the VDR gene. In this study, we aimed to investigate the relationship between AP and Apa I, Taq I polymorphisms of the VDR gene. Materials and Methods: 46 cases of early onset periodontitis patients and 49 healthy controls were recruited. VDR gene is amplified by using PCR (Polymerase chain reaction) technology. Genotypes are determined by PCR-RFLP (Restriction fragment length polymorphism) method. Conclusion: There was no significant difference in the genotype distribution or the allel frequencies between the control samples and the L-EOP patient group (p>0.05). ANAHTAR KELİMELER Agresif, Periodontal hastalıklar, Periodontitis, Gen polimorfizmi, Vitamin D reseptörü KEYWORDS Aggresive, Periodontal disease, Periodontitis, Gene polymorphism, vitamin D receptor.

80 Gİrİş Agresif Periodontal hastalıklar (Localized Aggresive Periodontal=LAP), belirli patojenik faktörlerle birlikte ortaya çıkan enflamatuar özellikte, genç ya da yetişkinliğin erken dönemlerinde görülen lokalize veya generalize alveolar kemik kaybıyla karakterizedir 1. LAP nin etyolojisinde; eksojen faktörler, partiküler periodontal bakteri ve genetik faktörler yer alır 2. LAP de spesifik periodontal bakterilerin varlığı bilinmekte ancak bu bakteri ürünlerinin kronik yetişkin periodontal hastalıklardaki ilerlemenin yavaşlığı, LAP üzerinde genetik faktörlerin de güçlü bir etkisi olduğunu düşündürmektedir. Bu nedenle LAP üzerindeki genetik etkilerin rolünün açıklanabilmesi ve hastalığın etyolojisinin anlaşılabilmesi için bu alanda araştırmalar başlatılmıştır. Kemik hemostazını kodlayan genlerdeki gen polimorfizimleri ile kemik mineral densitesi (BMD) ölçüm değerleri ve kemik metabolizmasındaki düzensizlikler arasında bir bağlantı olduğu sonucuna varılmıştır 3,4. BMD yi saptamak için VDR genotipi ve osteokalsin seviyeleri arasındaki ilişkiyi görmek açısından VDR nin 3 bölgesindeki polimorfizmler araştırılmıştır. Sonuç olarak alveolar kemik kaybının AP nin kardinal belirtisi olduğu ve enflamatuar periodontal hastalıklar için bir risk faktörü oluşturduğu saptanmıştır 5. VDR, Vitamin D nin hormonal fonksiyonlarının düzenlenmesinde aracılık eden ve Vitamin D nin akışkanlığını sağlayan gendir 6. Bu nedenle de kemik hemostazının ve kalsiyum metabolizmasının sağlanmasında temel rol oynar. VDR, ayrıca Vitamin D nin bir diğer görevi olan monosit değişiminin sağlanmasında da aracılık yapar 7. VDR molekülünde meydana gelen değişiklikler, hücre ve doku hemostazının düzenlenmesinde kritik değerler oluşturarak aksamalara neden olabilir 6,7. VDR geni, kromozom 12 de yerleşik olup 8 intron ve 9 eksondan oluşmaktadır. VDR geni üzerindeki çalışmalarda proteine çevrimlenmeyen 3 bölgesinde (UTR =untranslated region) polimorfizmler bildirilmiştir 5. Apa I ve Taq I restriksiyon enzimleri ile karakterize edilmiştir. Apa I ve Taq I ekson 9 da yer almaktadır. Bölgelere adını veren restriksiyon enzimleri ile polimorfizm analizi yapılmıştır. Taq I polimorfizmi kodon 352 de (ATT/ATC) T-C nükleotid değişimine, Apa I polimorfizmi ise kodon 358 de (CAG/TAG) C-T nükleotid değişimine neden olmaktadır 5. Amaç VDR geni üzerindeki çalışmalarda ekson 9 daki Apa I polimorfizminin görülme sıklığı ile ilgili olarak LAP hastalarında henüz herhangi bir araştırma yapılmamıştır.bu nedenle çalışmamızda, agresif periodontitis hastalarında ve sağlıklı bireylerde VDR Apa I ve Taq I gen polimorfizmlerinin genotipinin görülme sıklığının ve etkisinin araştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem Ankara Üniversitesi Diş Hekimliği Fakültesi Oral Diagnoz ve Radyoloji Anabilim ve Periodontoloji Anabilim Dalına başvuran agresif periodontitis teşhisi koyulmuş veya daha öncesinde LAP hikayesi bulunan ve herhangi bir sistemik hastalığı bulunmayan 14-29 yaş gubu arasındaki kişilerden cinsiyet farkı gözetmeksizin, 46 hasta ve 49 kontrol grubu, etik kurul onayı (A.Ü Diş Hekimliği fakültesi Araştırma Etik kurul kararları, 21.03.2001, toplantı sayısı:3) alınarak çalışmaya dahil edildi. Hasta grubu: Lokalize olarak periodontal kemik kaybı bulunan ve yalnızca birinci molarlar, ikinci molarlar ve kesiciler bölgesinde ve dişlerin birbirine bitişik olan yüzeylerini de içeren en az 3mm lik kemik kayıplarının olduğu hastalarda, mine-sement hududundan cep tabanına kadar olan bölge kalibreli periodontal sond kullanılarak 6 ayrı yüzeyden ölçüm yapıldı ve ataçman kaybı tespit edildi. Bleeding and probing (BOP) ( sondlamada kanama) kontrolü yapıldı ve klinik bulgular radyograflarla desteklendi. Radyografları, şekil 1A, 1B, 1C ve 1D de verilmiştir. PCR-RFLP yöntemi: Çalışma grubuna dahil edilen hasta grubu ve sağlıklı kontrollerden

81 A C ŞEKİL 1 Lokalize olarak periodontal kemik kaybı bulunan klinik bulguların radyografik görüntüleri A-Özellikle kesici diş bölgesiyle, birinci büyük azı dişleri etrafındaki alveol kemik kaybı B-22 yaşında bir hastada alt-üst kesiciler bölgesi ve 1. molarlar bölgesinde alveol kemik kaybı. C-Alt ve üst birinci ve ikinci molar dişler bölgesinde tek ve çift yönlü kemik kayıpları D- Alt anterior ve alt- üst molarlar bölgesinde vertikal kemik kayıpları 0.5M EDTA lı tüplere 5cc kan örnekleri alınarak 20 C de saklandı. Genomik DNA saflaştırılması, MoBio UltraClean DNA BloodSpin Kit (CLP, ABD) kullanılarak yapıldı. PCR amplifikasyon için 1.5mM MgCl 2 (DNAmp, İngiltere), 100μM dntp (DNAmp, İngiltere), 50 pmol/µl her primerden (Tıbmolbiol, Almanya) 5 CAGAGCAT- GGACAGGGAGCAA3 ve 5 CGAGCACAA- GGGGCGTTAGC3, 1.0U/µl Taq DNA polimeraz enzimi (DNAmp, İngiltere) ve PCR tamponu (10 mm Tris-HCI ph 8.3, 50 mm KCI, %0.1 Triton-X 100) kullanıldı. Amplifikasyonlar, 94 C de 5 dakika denatürasyonu takiben 94 C de 30 saniye, 68 C de 1.5 dakika basamaklarından oluşan 35 döngü ve son olarak 5 dakika 72 C de tutularak gerçekleştirildi. Amplifikasyon ürünleri %2 lik agaroz jelde yürütüldükten sonra UV transuliminator altında 496 baz çifti (bç) büyüklüğüne denk gelen bant aranarak analiz edildi. Apa I polimorfizminin olduğu 46084. nükleotitte kesim noktası Apa I restriksiyon enziminin kesim noktası mevcuttur. Sitozin den (C) Timin e (T) bir nükleotid değişimi olması halinde Apa I B D enziminin kesim noktası ortadan kalkmaktadır. Apa I genotipini belirlemek üzere, amplifikasyon ürünleri 10 ünite/µl Apa I (5 GGGCC/C3 ) restriksiyon enzimi ile 37 C de bir gece inkübe edildi. Taq I polimorfizminin olduğu 46068. nükleotitte kesim noktası Taq I restriksiyon enziminin kesim noktası mevcut değildir. Timin (T) den Sitozin e (C) bir nükleotid değişimi olması halinde bu polimorfizm Taq I enzimine kesim noktası yaratmaktadır. Taq I genotipini belirlemek üzere, amplifikasyon ürünleri 10 ünite/µl Taq I (5 T/ CGA3 ) restriksiyon enzimi ile 65 C de bir gece inkübe edildi. Kesim ürünleri %2 lik agaroz jel elektroferezi sonrası UV transliminatörde DNA moleküler ağırlık belirteci ile değerlendirildi. Apa I genotipi için, nükleotid değişimini taşımayan normal bireylerde (aa genotip) 279 ve 217 bç lik iki bant, heterozigot bireylerde (Aa genotip) 496, 279 ve 217 bç lik üç bant, homozigot mutant bireylerde (AA genotip) 496 bç lik tek bant olarak görüldü (Şekil 2). Taq I genotipi için, nükleotid değişimini taşımayan normal bireylerde (TT genotip) 496 baz çiftlik tek bant, heterozigot bireylerde (Tt genotip) 496, 294 ve 202 baz çiftlik üç bant, homozigot mutant bireylerde (tt genotip) 294 ve 202 baz çiftlik iki bant olarak görüldü (Şekil 3). Elde edilen verilerin istatiksel olarak değerlendirilmesinde, Fischer in kesin Ki-kare testi kul- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 ŞEKİL 2 Apa I restriksiyon enzim kesim sonuçlarının %2 lik agaroz jeldeki görüntüsü 1 nolu kolon -100 baz çiftlik moleküler ağırlık belirteci 2 nolu kolon - Kesilmemiş PCR ürünü 3, 6, 9, 10 ve 13 nolu kolonlar - Homozigot mutant bireyler (AA genotip) 5, 7 ve 11 nolu kolonlar Heterozigot bireyler (Aa genotip) 4, 8, 12 ve 14 nolu kolonlar- Homozigot normal bireyler (aa genotip)

82 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 TABLO I AP li Hasta ve kontrol gruplarında Apa I polimorfizminin (AA, Aa, aa) ve A, a allelerinin dağılımı Genotip Hasta grubu Kontrol grubu p değeri χ2 değeri AA 5 (%10.9) 2 (%4.0) lanıldı. p değeri 0.05 ten küçük olanlar anlamlı kabul edildi. Genotip ve allelerin rölatif risk oranları için Odds oranı hesaplandı. Odds oranı için güven aralığı Wholf un metodu ile hesaplandı. Gen frekansları estimation / maximization (E/M) algoritmi ile hesaplandı. Bulgular ŞEKİL 3 Taq I restriksiyon enzim kesim sonuçlarının %2 lik agaroz jeldeki görüntüsü 1 nolu kolon-100 baz çiftlik Moleküler ağırlık belirteci 2 nolu kolon- Kesilmemiş PCR ürünü 3, 4,5,9, 10 ve 15 nolu kolonlar- Homozigot normal bireyler( TT genotip) 6, 8, 11, 13 ve14 nolu kolonlar Heterozigot bireyler (Tt genotip) 7 ve 12 nolu kolonlar - Homozigot mutant bireyler (tt genotip) Çalışmamızda Apa I genotip sıklığı, LAP hikayesi bulunan 46 hastada; AA genotip sıklığı %10.9, Aa genotip sıklığı %41.3, aa genotip sıklığı %47.8 olarak saptanırken, kontrol grubunda AA genotip sıklığı %4.0, Aa genotip sıklığı %47, aa genotip sıklığı %49 olarak saptandı. Kontrol grubu ile LAP li hastalar arasında Apa I polimorfizm sıklığı açısından anlamlı bir fark saptanmadı (p>0.05). AP li hastalarda A allel sıklığı 29/92 (%31.5), a allel sıklığı 63/92 (%68.5) olarak saptandı. Kontrol grubunda ise A allel sıklığı 27/98 (%27.5), a allel sıklığı 71/98 (%72.5) olarak saptandı. Hasta ve kontrol grupları arasında A veya a allel sıklıkları açısından anlamlı fark saptanmadı (p>0.05) (Tablo I). Taq I genotip sıklığı incelendiğinde, LAP hikayesi bulunan 46 hastanın; TT genotip sıklığı %52.1, Tt genotip sıklığı %32.7, tt genotip sıklığı %15.2 olarak saptanırken, kontrol grubunda TT genotip sıklığı %53.1, Tt genotip sıklığı %34.6, tt Aa 19 (%41.3) 23 (%47) aa 22 (%47.8) 24 (%49) Toplam 46 49 A alleli 29 (%31.5) 27 (%27.5) a alleli 63 (%68.5) 71 (%72.5) Toplam 92 98 A genotipi için Odds Oranı (OR): 2.866 (0.5273-15.576) A alleli için Odds Oranı (OR): 1.210 (0.6482-2,260) genotip sıklığı %12.3 olarak saptanmıştır. Kontrol grubu ile AP li hastalar arasında Taq I polimorfizm sıklığı açısından anlamlı bir fark saptanmamıştır (p>0.05). EOP li hastalarda T allel sıklığı 63/92 (%63.5), t allel sıklığı 29/92 (%31.5) olarak saptanmıştır. Kontrol grubunda ise T allel sıklığı 69/98 (%70.5), t allel sıklığı 29/98 (%29.5) olarak saptanmıştır. Hasta ve kontrol grupları arasında T veya t allel sıklıkları açısından anlamlı fark saptanmamıştır (p>0.05) (Tablo II). TABLO II p>0.05 χ2=1.647 p>0.05 χ2=0.1942 AP li Hasta ve kontrol gruplarında Taq I polimorfizminin (TT, Tt, tt) ve T, t allelerinin dağılımı Genotip Hasta grubu Kontrol grubu TT 24 (%52.1) 26 (%53.1) Tt 15 (%32.7) 17 (%34.6) tt 7 (%15.2) 6 (%12.3) Toplam 46 49 p değeri χ2 değeri p>0.05 χ2=0.1874 T alleli 63 (%68.5) 69 (%70.5) p>0.05 t alleli 29 (%31.5) 29 (%29.5) Toplam 92 98 tt genotipi için Odds Oranı (OR): 1.286 (0.3978-4.160) t alleli için Odds Oranı (OR): 1.095 (0.5904-2.032) χ2=0.0171

83 Sonuç Enfeksiyon veya otoimmüniteye bağlı olarak görülen ve biyolojik gelişmeleri etkileyen, beraberinde enfeksiyon nedeniyle oluşan düzensizliklerin çeşitlenmesine yol açan genetik polimorfizmlerin araştırılmasına karşı gittikçe artan bir ilgi mevcuttur. Bireysel genetik polimorfizmler ya da polimorfizmlerin bir kombinasyonunun popülasyonda yer almasının avantajı; hemostaz regülasyonunu sağlaması ile birlikte bazı immün kökenli hastalıklara karşı koruyucu olmasındandır 5. Agresif periodontitis vakalarında; AP nin, genetik predispozan faktör olarak tek başına hastalığın gelişmesini sağlamakta yeterli olmadığını, hastalığın gelişmesi ve ortaya çıkması için mikrobiyal enfeksiyona da gerek olduğunu bildirilmiştir 8. AP için bu anlamda kompleks bir hastalıktır denebilir çünkü, hastalığın ortaya çıkması ve klinik fenotiplerin görülmesi açısından, gen ve çevresel etkileşimlerin birarada olması gerektiği, buna ek olarak; hastalık genotipi, gen-gen etkileşimleri ve genetik heterojenite bağlantısıyla da karakterize edilebileceğini söylenmiştir 9. Klasik epidemiyolojik çalışmaların periodontal hastalıklarda çevresel, mikrobiyal ve kişiye özgü faktörlerin henüz bireysel riskleri ortadan kaldırmaya yetmediğini, enfeksiyöz hastalıkların patogenezinin mikroplarla immün sistem arasındaki karşılıklı etkileşimlerle düzenlendiğini, periodontal hastalıklarda immün cevabın etkinliğinin hem internal - eksternal çevreye, hem de internal-eksternal etkiye bağlı olduğu söylenmiştir. Örn. Sigara içme ve sitokinlerin genetik kontrolüyle; oral bakterilerin, periodontal hastalığın ve hastalığın klinik görünümünün daha hafif seyretmesini sağladığını bildirmişlerdir 9,10. Bazı hasta gruplarındaki fenotiplerle, immün cevaptaki polimorfizimler arasındaki korelasyon; AP de FcγII a reseptörüyle, yetişkin periodontitiste ki IL-1 arasında da tanımlandığını, gelecekte belki de mikrobiyal enfeksiyona karşı kişinin vereceği cevabın, hastalığa neden olan mikrobu durdurarak inflamatuar hasarı minimale indirmek şeklinde olabileceğini, moleküler biyomarkerların bireysel risk profilleriyle beraber tanımlanmasıyla yeni tedavi stratejilerinin gelişmesinde yardımcı olacağını bildirmişlerdir 10. Periodontal hastalıklardaki risk faktörlerini tanımlayabilmek için öncelikle bakteriolojik ve immünolojik parametrelere odaklanılması gerektiği, primer etyolojik ajanın bakteriyel plak olduğu ve ne bakterinin tipinin ne de miktarının bütün popülasyonda tek başına hastalık oluşturmasının söz konusu olmadığını bildirilmiştir 11. Periodontitisin de içinde bulunduğu tek gen düzensizlikleri ile ilgili yapılan çalışmalarda, hastalık için spesifik genetik risk faktörlerinin rolünün ileride yapılacak olan çalışmalara ışık tutacağını bildirmiştir 12,14. Risk faktörlerinin organ sistemlerinde pekçok zarar meydana getirebileceğini, bu nedenle de hastalığın patogeneziyle birlikte bu organ sistemlerinin de risk faktörleriyle beraber değerlendirilmesi gerekliliği söylenmiştir 11. Biyokimyasal ve yapısal defektlerin bir çok genetik düzensizliğin tanımlanmasında rol oynadığını, ve spesifik kalıtsal veya genetik predispozan faktörlerin klinik görünüm ve başlangıç yaşı açısından faklılıklar gösterdiğini ve bunun da değerlendirmeleri güçleştirmektedir 11-13. Örn. Juvenil periodontitisin aile kökenli olduğu son 10 yıldır bilinmektedir. Bu nedenle genetik faktörlerin hastalıktaki etkisini belirleyebilmek için çevresel risk faktörlerinin de mutlaka göz önünde bulundurulmasının ve değerlendirilmesinin gerektiği söylenmiştir. Ayrıca periodontal hastalıklardaki spesifik risk faktörlerinin tanımlanmasının bir kural değil, bir istisna olduğunu bildirmiştir 11. VDR molekülünün fonksiyonunda veya yapısında meydana gelen küçük değişikliklerin, hücre ve doku hemostazının düzenlenmesinde büyük değişikliklere neden olabileceği; bunun yanısıra elde edilen verilere göre, VDR polimorfizmlerinin gen fonksiyonu üzerindeki etkisinin, BMD ve hastalık arasında iki yönlü bir ilişkiye neden olabileceğini bildirmişlerdir 15. VDR gen polimorfizmlerinin kemik mineral densitesi ölçümleri ve osteoporöz arasında bir ilişki olduğunu ve VDR geninin AP üzerinde bir rolü olduğunu söylemişlerdir 8,16,17. AP nin alt yapısında; immün sistemde ve periodonsiyum üzerinde defektlere neden olabilecek genler bulunabileceğini ve çevresel faktörlerin de genotipi etkileyerek başlangıç yaşındaki farklılıklarla, hastalığın yayılması arasındaki ilişkinin açıklanabileceğini söylenmiştir 18. Hastalık gelişiminde risk faktörü ola-

84 bileceği düşünülen diğer aday genlerle (örn. IL 1), AP nin generalize formu arasında bir ilişki kuramamışlardır 19,20. Periodontal hastalıklardaki genetik polimorfizmlerin rolünün açıklanabilmesi için AP hastalarında VDR gen polimorfizmlerini incelemişler; AP li hastalarda Taq I polimorfizmine bakıldığında hem VDR genotipinde hem de VDR allel taşıyıcısı olan hastalarla kontrol grubu arasında klinik bulgularla yapılan karşılaştırma sonucunda belirgin bir fark bulunmadığını, LAP gelişiminde t alleli taşımanın bir risk faktörü olduğunu ama AP gelişiminde VDR genotiplerinin bir etkisi olmadığını bildirilmiştir. Buna göre başlangıç yaşı (on-set), temel alındığında VDR genotipinin AP üzerinde bir etkisinin olmadığını ve/ veya bu hasta grubundaki heterojenite sebebiyle, genetik birleşmelerin maskelendiği sonucuna varılabileceğini bildirmişlerdir 5. Biz bu çalışmada periodontal hastalıklarda genetik polimorfizmlerin rolünü ve LAP li hastalarda VDR gen polimorfizmleri ile ortaya çıkabilecek olası birleşmeleri inceledik. Bizim amacımız bir grup LAP hastasıyla VDR genotip dağılımındaki belirgin değişikliklerle, VDR allel sıklıklarını karşılaştırmak ve bu farklılığın etkisini incelemekti, bunun sonucunda; Apa I polimorfizmi açısından LAP li hastalar ve kontrol grubu değerlendirildiği zaman ön çalışma sonucu olarak en sık görülen allelin, a alleli olduğu tespit edilmiştir. LAP li hastalar ve kontrol grubu arasında yapılan karşılaştırmalar sonucunda Apa I genotiplerinin istatistiksel olarak bir anlam ifade etmediği bulunmuştur. Çalışma grubu sayısının arttırılmasına bağlı olarak sonuçların daha anlamlı olabileceği düşünülebilir. Eğer genetik polimorfizmler hastalığın ilerlemesinde etkili ise, bu durumda polimorfizmlerin populasyonda tanımlanması; teşhis, tedavi ve periodontal hastalıktan korunma anlamında yeni stratejilerin oluşturulabilmesine yardımcı olacaktır. KAYNAKLAR 1. Sandallı P. Periodontoloji. Erler Matbaası, 1981: s: 4-25 2. Ishikawa I, Arakawa S, Nagasawa N, Nishihara TK, Nitta H, Koseki T, Watanabe H. Induction of the immune response to periodontopathic bacteria and its role in the pathogenesis of periodontitis. Periodontol 2000. 1997: 14; 79-111. 3. Struan FA,Ralston SH. Genes and Osteoporosis. TEM 1997: Vol. 8. No. 6 4. Morrison NA, Eisman JA, Kelly PJ, Yeoman R. Contribution of trans-acting factor alleles to normal physiological variability: Vitamin D receptor gene polymorphisms and circulating osteocalcin. Proc Natl Acad Sci (USA). 1992: 89; 6665-6669. 5. Hennig JWB, Parkhill JM, Chapple LC, Heasman PA, Taylor JJ. Association of a vitamin D receptor gene polymorphism with localized Early-Onset periodontal diseases. J Periodontol. 1999: 70 (9); 1032-1038. 6. Brown AJ, Dusso A, Slatopolsky E. Vitamin D. Am. J. Physiol. 1999: 277. F157-F175. 7. Kato S. The Function of Vitamin D Receptor in Vitamin D Action. J. Biocem. 2000:127, 717-722. 8. Hodge P, Michalowicz B. Genetic predisposition to periodontitis in children and young adults. Periodontol. 2000. 2001: 26, 2001. 113-114. 9. Hart TC. Genetic risk factors for early onset periodontitis. J Periodontol. 1996: 67: 355-366. 10. Hart TC, Kornman KS. Genetic factors in the pathogenesis of periodontitis. Periodontology 2000. 1997: 4; 202-215. 11. Michalowicz BS. Genetic and Heritable Risk Factors in Periodontal Disease. J Periodontol. 1994:65; 479-488. 12. Thomas CH. Genetic risk factors for Early-Onset Periodontitis. J Periodontol. 1996: 67 (3); 355-366. 13. Hassel TM, Harris EL. Genetic influences in caries and periodontal diseases. Crit Rev Oral Biol Med. 1995:6; 319-342. 14. Soafer JA. Genetic approaches in the study of periodontal diseases. J Clin Periodontol. 1990: 17; 401-408. 15. Grant SFA, Ralston SH. Genes and osteoporosis. Trends Endocrinol Metab. 1997: 8; 232-236. 16. Wowern N, Klausen B, Kollerup G. Osteoporosis: A Risk Factor in Periodontal Disease. J Periodontol. 1994: 65; 1134-1138. 17. Morrison NA, Crofts L,. Eisman JA ve ark. Prediction of bone density from vitamin D receptor alleles. Nature. 1994: 367; 284-287. 18. Hart TC, Shapira L, Van Dyke TE. Neutrophil defects as risk factors for periodontal diseases. J Periodontol. 1994: 65; 521-529. 19. Parkhill JM, Chapple ILC, Heasman PA, Hennig BJW, Taylor JJ. Association of interleukin-1 gene polymorphisms with early-onset periodontitis. J Clin Periodontol. 2000:27; 682-689. 20. Kornman KS, Crane A, Duff GW ve ark. The Interleukin-1 genotype as a severity factor in adult periodontal disease. J Clin Periodontol. 1997: 24; 72-77. İLETİŞİM ADRESİ Dr. Melda MISIRLIOĞLU Kırıkkale Üniversitesi Dişhekimliği Fakültesi, Oral Diagnoz ve Radyoloji Anabilim Dalı, 71200, Kırıkkale Tel: 0318 224 49 27 Faks: 0318 225 06 85 E-mail: meldamsr@hotmail com