MİKOBAKTERİYOLOJİDE RUTİN LABORATUVAR YAKLAŞIMI ÖRNEK KABULÜ VE İŞLENMESİ



Benzer belgeler
MİKOBAKTERİYOLOJİ LABORATUVARI ÇALIŞILAN TESTLER

TÜBERKÜLOZ LABORATUVARI TEST REHBERİ

KLİNİK MATERYALİN HASTADAN ALINMASI ve LABORATUVARA GÖNDERİLMESİ

SALUBRIS Gateway to Health Worldwide Dünya Çapında Sağlığa Açılan Kapı

TÜBERKÜLOZ TANISI İÇİN KLİNİK ÖRNEK ALINMASI, LABORATUVARA GÖNDERİLMESİ VE KÜLTÜR YÖNTEMLERİ

TÜBERKÜLOZ DIŞI MİKOBAKTERİ ENFEKSİYONLARI. Tanı ve Sorunlar. Süheyla SÜRÜCÜOĞLU. Celal Bayar Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD Manisa

TÜBERKÜLOZUN MOLEKÜLER TANISINDA GÜNCEL DURUM

KÜLTÜR STANDART ÇALIŞMA PROSEDÖRÜ

MİKROBİYOLOJİ LABORATUARINDA SIK KULLANILAN BAZI BESİYERLERİNİN HAZIRLANMASI VE MUHAFAZASI

ATIKSULARDA FENOLLERİN ANALİZ YÖNTEMİ

T.C. SAĞLIK BAKANLIĞI Verem Savaşı Daire Başkanlığı

Tularemi örnekleri alma, saklama ve gönderme rehberleri HAZIRLAYANLAR DOÇ. DR. ŞABAN GÜRCAN DOÇ. DR. Z. CEREN KARAHAN

KL N K MATERYAL N HASTADAN ALINMASI VE LABORATUVARA GÖNDER LMES

ÖRNEKLER N filemlenmes VE KÜLTÜR YÖNTEMLER

ÖRNEKLERİN İŞLEMLENMESİ ve KÜLTÜR YÖNTEMLERİ

RTA JEL / PZR Saflaştırma Kiti

Mikobakteriyoloji Laboratuvarı: Sorular - Sorunlar

BEÜ SAĞLIK UYGULAMA VE ARAŞTIRMA MERKEZİ ENFEKSİYON KONTROL KOMİTESİ

Steril vücut sıvılarının mikrobiyolojik olarak değerlendirilmesi. Dr. Dolunay Gülmez Kıvanç

Mikobakterilerin Üretilmesinde Kanlı Agar Besiyerinin Değerlendirilmesi*

İDRAR ÖRNEĞİ ANALİZ İÇİN NE KADAR UYGUN? (Avrupa ve CLSI kılavuzlarına göre) Dr. Koza Murat

Tüberkülozun Tanısında %2 Ogawa Besiyerinin Löwenstein-Jensen Besiyeri ile Karşılaştırılması ve Değerlendirilmesi*

GİRİŞ. Kan dolaşımı enfeksiyonları (KDE) önemli morbidite ve mortalite sebebi. ABD de yılda KDE, mortalite % 35-60

Temizlik: Mikroorganizmaların çoğalması ve yayılmasını önlemek için, yüzeylerin kir ve organik maddelerden fiziksel olarak uzaklaştırılmasıdır.

MÜŞTERİ BİLGİLENDİRME REHBERİ

DENİZLİ BELEDİYESİ SAĞLIK İŞLERİ MÜDÜRLÜĞÜ DENÇEV DENİZLİ ÇEVRE KALİTE LABORATUVARI MÜŞTERİ BİLGİLENDİRME REHBERİ

HASTANE TEMİZLİĞİ AYŞEGÜL LİKOĞLU ENFEKSİYON KONTROL HEMŞİRESİ VE EĞİTİM HEMŞİRESİ

VENTİLATÖR İLİŞKİLİ PNÖMONİ ÖNLENMESİ TALİMATI

İZOLASYON ÖNLEMLERİ. Hazırlayan: Esin Aydın Acıbadem Bodrum Hastanesi Enfeksiyon Kontrol Hemşiresi

ÇÖZÜNMÜŞ OKSİJEN TAYİNİ

TÜBERKÜLOZ. Verem; TB; TBC; Tüberküloz nasıl yayılır? Tüberküloz şikayetleri nelerdir?

RTA Kandan Genomik DNA İzolasyon Kiti

T.C. KOCAELİ ÜNİVERSİTESİ TIP FAKÜLTESİ HASTANESİ TIBBİ MİKROBİYOLOJİ LABORATUVARI - 2 TEST REHBERİ

KL N K MATERYAL N HASTADAN ALINMASI VE LABORATUVARA GÖNDER LMES

ÖZEL YALOVA HASTANESİ YOĞUN BAKIM ÜNİTESİ ENFEKSİYON KONTROL TALİMATI

Balgamdan Mycobacterium tuberculosis İzolasyonunda Mycobacteria Growth Indicator Tube (MGIT) Yönteminin Değeri

STERİLİZASYON DERSİ 4. HAFTA DERS NOTLARI YRD. DOÇ. DR. KADRİ KULUALP

MÜŞTERİ BİLGİLENDİRME REHBERİ FORMU MÜŞTERİ BİLGİLENDİRME REHBERİ ÇEVRE KORUMA KONTROL LABORATUVARI ANTALYA

HASTANE TEMİZLİĞİNDE ENFEKSİYON KONTROL KURULU STANDARTLARI. Hastanelerde makine ile ıslak temizlik yöntemleri tercih edilmelidir,

KATI ATIK ÖRNEKLERİNDE TOPLAM FOSFOR ANALİZ YÖNTEMİ

TÜBERKÜLOZ TANISINDA TÜBERKÜLOZ LABORATUVARININ ROLÜ : TANI VE İLAÇ DUYARLILIK TESTLERİNDE RUTİN LABORATUVAR YÖNTEMLERİNİN DEĞERİ

EK-4 ÖRNEK ÖZGEÇMİŞ. Derece Alan Üniversite Yıl. Biyoteknoloji (ing) Yeditepe Üniversitesi Biyoloji (ing) Abant İzzet Baysal Üniversitesi

Çok ilaca dirençli Mycobacterium tuberculosis izolatlarının hızlı tespitinde nitrat redüktaz testinin değerlendirilmesi: Çok merkezli bir çalışma

ARB BOYAMA NASIL YAPILIR

RTA Bakteriden Genomik DNA İzolasyon Kiti

Mikobakteriyoloji Laboratuvarı Sorular - Sorunlar

ÜRÜN KULLANIM KILAVUZU

Tüberküloz laboratuvarında kalite kontrol

Sterilizasyon ünitesine yönelik fiziki düzenleme yapılmalıdır.

MİKROBİYOLOJİ LABORATUVARINDA UYULMASI GEREKEN KURALLAR

KLOR (Cl2) ANALİZ YÖNTEMİ

MAIA Pesticide MultiTest

EL HİJYENİ VE ELDİVEN KULLANIMI TALİMATI

MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS İZOLATLARININ PRİMER ANTİTÜBERKÜLOZ İLAÇLARA DUYARLILIKLARININ ÇİKOLATALI AGARDA SAPTANMASI: BİR ÖN ÇALIŞMA

ULUSAL BİYOÇEŞİTLİLİĞİNİN VE GEN KAYNAKLARININ KORUNMASI HEDEFLERİ DOĞRULTUSUNDA BÜYÜK MEMELİ TÜRLERİNİN ARAŞTIRILMASI, KORUNMASI VE YÖNETİMİ

SU NUMUNESİ ALMA TALİMATI REVİZYON DURUMU. Revizyon Tarihi Açıklama Revizyon No

ÜRÜN KULLANIM KILAVUZU

SAĞLIK ÇALIŞANLARININ ENFEKSİYON RİSKLERİ

Laboratuvar Kazaları, Sterilizasyon Dezenfeksiyon Uygulamaları Doç Dr Dilek ŞATANA İ.Ü. İstanbul Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

MUĞLA HALK SAĞLIĞI LABORATUVARI NUMUNE KABUL KRİTERLERİ

Doğrudan klinik örnekte hızlı tanı. Prof. Dr. Cengiz ÇAVUŞOĞLU Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD, Bornova, İZMİR

SAĞLIK PERSONELİ KORUYUCU EKİPMANLARI (SPKE) ENFEKSİYON KONTROL KOMİTESİ

MIDDLE-BROOK 7H10 BESİYERİ İLE ANTİBİYOTİK DUYARLILIK TESTLERİ

KİŞİSEL KORUYUCU EKİPMANLAR VE KULLANIM ALANLARI

NUMUNE ALMA İŞLEMİ NASIL YAPILIR

KALİTELİ SÜT NASIL ELDE EDİLİR?

Mikrobiyolojide Kalite İndikatörü Örnekleri

Dekontaminasyon. Manuel Dekontaminasyon. Temizlik. Bir nesnenin mikroorganizmalardan arındırılarak güvenli hale getirilmesi için yapılan işlemler

ATIK YÖNETİMİ. Enfeksiyon Kontrol Komitesi

ÖRNEKLER N filemlenmes VE KÜLTÜR YÖNTEMLER

TÜBERKÜLOZ DIŞI MİKOBAKTERİLER (TDM)

FLORESAN İN SİTU HİBRİDİZASYON

T.C KONYAALTI KAYMAKAMLIĞI. İlçe Gıda, Tarım ve Hayvancılık Müdürlüğü

ORTOPEDİK PROTEZ ENFEKSİYONLARINDA SONİKASYON DENEYİMİ

REVİZYON DURUMU. Revizyon Tarihi Açıklama Revizyon No

Enfeksiyon Kontrol Hekimi Kalite Direktörü Başhekim

Prof. Dr. Ayşe Yüce. Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji AD Nisan-2014

AtılımKimyasalları AK 3151 D SUNKROM DEKORATİF KROM KATALİZÖRÜ (SIVI) ÜRÜN TANIMI EKİPMANLAR

ENDOSKOPİ HİZMETLERİ

İlaç direnci saptanmasında yeni yöntemler. Prof. Dr. Cengiz ÇAVUŞOĞLU Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD, Bornova, İZMİR

ATIK ENVANTERİ DOKÜMAN KOD:YÖN.LS.18 YAYIN TARİHİ:MAYIS 2013 REVİZYON TARİHİ: 00 REVİZYON NO:0 SAYFA NO: 3

«Bakteriyoloji Laboratuvarında Yeni

BRCA 1/2 DNA Analiz Paneli

Santral kateter ilişkili kan dolaşımı enfeksiyonları önlenebilir mi? Hemato-Onkoloji Hastalarımızdaki tecrübelerimiz Doç.Dr.

KORUYUCU EKİPMAN KULLANMA TALİMATI

TÜRKELİ DEVLET HASTANESİ 2015 İSMAİL BEZİRGANOĞLU

Kan Yoluyla Bulaşan İnfeksiyonlardan Korunma ve Riskli Yaralanmaların İzlenmesi

Kan Yoluyla Bulaşan Enfeksiyonlardan Korunma ve Riskli Yaralanmaların İzlenmesi

RTA Viral Nükleik Asit İzolasyon Kiti

Laboratuvarda çalışılan tüm test ve uygulamaları içeren rehber hazırlanmalıdır. Test ve uygulama rehberi;

ÜRÜN KULLANIM KILAVUZU

REVİZYON DURUMU. Revizyon Tarihi Açıklama Revizyon No

OLGU 3 (39 yaşında erkek)

TEMEL ARAŞTIRMA TEKNİKLERİ II

Işın Akyar 1,2, Meltem Kaya 2, Onur Karatuna 1,2, Yeşim Beşli 2. Acıbadem Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji AD, İstanbul 2

KANTİTATİF ANALİTİK KİMYA PRATİKLERİ

ÖZ DEĞERLENDİRME SORU LİSTESİ

REVİZYON DURUMU. Revizyon Tarihi Açıklama Revizyon No

8-Biyolojik İzleme. Volkan Dündar

Çamaşırhane ve Enfeksiyon Kontrolü

Transkript:

MİKOBAKTERİYOLOJİDE RUTİN LABORATUVAR YAKLAŞIMI ÖRNEK KABULÜ VE İŞLENMESİ Doç.Dr.Orhan BAYLAN GATA Haydarpaşa Eğitim Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Servisi obaylan@gata.edu.tr dr_obaylan@yahoo.com

Doğru test sonucu verilebilmesi için Laboratuvar test sonucunun doğruluğu Doğru klinik örnek seçilmeli, Doğru yöntem ile alınmalı Laboratuvara doğru şekilde ulaştırılmalı Laboratuvarda doğru şekilde işleme alınmalı

Klinik örneğin alınması ve laboratuvara ulaştırılması TB, çok çeşitli organ ve dokuları tutabildiğinden klinik örnek seçimine özen gösterilmeli Alınan klinik örneğin niteliği ve kalitesi, mikrobiyolojik tanıyı etkiler Klinik örnekler; Steril, Şeffaf, Burgulu kapaklı, Dayanıklı, Tek kullanımlık kaplara, Yeterli miktarda alınmalı.

Klinik örneğin alınması ve laboratuvara ulaştırılması Kabın üzerine klinik örneğin; Kimden alındığı, Ne zaman alındığı Klinik örnek tipi, Hastanın kimlik numarası etiketlenmeli (bilgilerin sadece kapakta olması sakıncalı) İstek kağıdında (otomasyon sisteminde) hasta ve klinik örnek ile ilgili bilgiler belirtilmeli

Klinik örneğin alınması ve laboratuvara ulaştırılması Klinik örnekler, anti-tb tedaviye başlanmadan önce alınmalı, Klinik örnekler, endojen flora ve çevresel kontaminasyonu engellemek için mümkün olduğunca aseptik şartlarda alınmalı, Kimyasal madde, dezenfektan, alkol veya fiksatif içermemeli, klinik örnekler, en kısa zamanda ve eğer mümkünse soğuk zincir ile laboratuvara gönderilmeli ve laboratuvarda hemen işleme alınmalı (bu süre, bir saati aşacak ise kan, BOS hariç diğer klinik örnekler 4 C de bekletilmeli)

Klinik örneğin alınması ve laboratuvara ulaştırılması Yapılan bir çalışmada 4-8 hafta oda ısısında ve buzdolabında saklanan ARB pozitif balgam örneklerinde mikroskobik tanı açısından fark bulunmamış iken kültür açısından basil canlılığında tedrici azalma olduğu saptanmış Dördüncü hafta sonunda buzdolabında saklanan balgamlarda üreme oranı %67 ye inmiş iken oda sıcaklığında saklanan balgamlarda üreme oranı %37 ye düşmüş Sekizinci hafta sonunda buzdolabında saklanan balgamlarda üreme oranı %46 ya inmiş iken oda sıcaklığında saklanan balgamlarda üreme oranı %23 e düşmüş - Banda HT, Harries AD, Boeree MJ, et al. Viability of stored sputum specimens for smear microscopy and culture. Int J Tuberc Lung Dis 2000; 4: 272-4.

Klinik örnekler Pulmoner örnekler Balgam Ekspektöre İndüklenmiş Bronkoalveoler lavaj (BAL) Açlık mide suyu Bronşiyal fırçalama Transtrakeal aspirasyon Akciğer biyopsisi Larenks sürüntüsü Ekstrapulmoner örnekler İdrar Steril vücut sıvıları (plevral, perikardiyal, peritoneal sıvılar ve BOS, kemik iliği, kan) Abse örnekleri ve aspirasyon sıvıları Akciğer dışı doku örnekleri (lenf nodu, deri ve diğer biyopsiler) Gaita

Pulmoner örnekler Ekspektöre balgam Hastaya uygun balgamı nasıl vereceği, tükrük veya nazofaringeal sekresyonun balgam olmadığı anlatılmalı Yiyecek artıkları ve ağız florası ile kontamine olmaması için balgam çıkarmadan önce hasta ağzını bol suyla çalkalamalı Balgam; derin, prodüktif bir öksürükten sonra akciğerlerden gelen, koyu, eksüdatif vasıfta olmalı Üç gün üst üste 5-10 ml miktarında sabah aç karna çıkartılan balgam Transport bir saati aşacak ise klinik örnek buzdolabına konmalı - CLSI. Laboratory Detection and Identification of Mycobacteria; Approved Guideline. CLSI document M48-A, Vol. 28, No. 17, Pennsylvania, USA.

Pulmoner örnekler Balgam toplama tekniği Üç gün üst üste gelemeyen hastalar için; Hastanın hastaneye başvurduğu gün klinikte mutlaka bir örnek alınmalı, Ertesi sabah kalkınca hastadan evde sabah balgamı istenmeli Bu örneği hastaneye getirdiğinde klinikte üçüncü bir örnek daha alınmalı

Pulmoner örnekler Ekspektöre balgam Balgam örnekleri, biyogüvenlik açısından özel olarak tasarlanmış, negatif basınçlı özel havalandırma sistemi bulunan, ultraviyole ışımalı kabin ya da özel odalarda verilmeli Kabin veya özel oda yok ise balgam açık havada (balkon, bahçe gibi), mümkünse bol güneşli ortamda çıkartılmalı Tedavi takibi için hastalar, tedavilerinin başlamasından 3-4 hafta sonra başlamak üzere birer hafta aralıklarla balgam örneği vermeli Üçüncü balgamın tanı değeri tartışmalı* -Yassin MA, et al.how many sputum smears are necessary for case finding in pulmonary tuberculosis? Trop Med Int Health 2003; 8: 927-32. - Nelson SM, Deike MA, Cartwright CP. Value of examining multiple sputum specimens in the diagnosis of pulmonary tuberculosis. J Clin Microbiol 1998; 36: 467-9. - Dorronsoro I, et al.effect of the number of samples studied on the diagnosis of tuberculosis. Enferm Infecc Microbiol Clin 2000;18:215-8. - Finch D, Beaty CD. The utility of a single sputum specimen in the diagnosis of tuberculosis. Comparison between HIV-infected and non-hiv infected patients. Chest 1997; 111: 1174-9.

Pulmoner örnekler İndüklenmiş balgam Hastanın kendiliğinden balgam çıkaramaması Steril, ılık, aerosolize hipertonik tuzlu suyun (10 ml %3-10 luk NaCl) nebülizatör yardımıyla 10-30 dakika kadar süren derin ve yavaş inhalasyonu sonrası akciğerler hem öksürmeye hem de sulu salgı üretmeye teşvik edecek kadar irrite olmakta Derin ve kuvvetli bir öksürük ile en az 10 ml indüklenmiş balgam örneği alınmalı Akciğer TB tanısında tek bir indüklenmiş balgam örneğinin BAL örneği ile eşit derecede etkili olduğu ileri sürülmekte* - Anderson C, et al. Comparison of sputum induction with fiber-optic bronchoscopy in the diagnosis of tuberculosis. Am J Respir Crit Care Med 1995; 152:1570-4. - Conde MB, et al. Comparison of sputum induction with fiberoptic bronchoscopy in the diagnosis of tuberculosis: experience at an acquired immune deficiency syndrome reference center in Rio de Janeiro, Brazil. Am J Respir Crit Care Med 2000; 162:2238-40.

Pulmoner örnekler İndüklenmiş balgam Klinik örnek, sulu ve tükrüğe benzediğinden reddedilmemeli, klinisyen klinik örneği gönderirken laboratuvara bilgi vermeli Tuzlu suyu hazırlarken veya nebulizatörü dezenfekte ederken musluk suyundaki saprofit mikobakteriler, yanlış pozitif sonuçlara neden olabileceğinden musluk suyu kullanılmamalı Akciğer TB tanısında bronkoskopi yapılmadan indüklenmiş üç balgam örneğinin iyi derecede maliyet-etkin strateji olduğu gösterilmiş* - McWilliams, et al. Induced sputum and bronchoscopy in the diagnosis of pulmonary tuberculosis. Thorax 2002; 57:1010-4.

Pulmoner örnekler Bronkoalveolar lavaj (BAL) Bronkoskop ile steril kaplara en az 5 ml klinik örnek Hemen laboratuvara gönderilmeli ve işleme alınmalı Kontamine bronkoskop ile bulaş olabileceğinden bronkoskopun fiziksel temizliği ve yüksek düzey dezenfeksiyonu önemli Bronkoskobik işlem öksürüğü provake edebilir; genelde tatmin edici düzeyde mikroorganizma verimliliği sağladığı için bronkoskopi sonrası çıkartılmış balgam örnekleri alınabilir* - Sarkar SK, et al. Fiberoptic bronchoscopy in the diagnosis of pulmonary tuberculosis. Tubercle 1980; 61:97-9. - de Cracia J et al. Diagnostic value of bronchoalveolar lavage in suspected pulmonary tuberculosis. Chest 1988; 93:329-32.

Pulmoner örnekler Açlık mide suyu Balgam çıkaramayan, nörolojik hastalıklar veya koma hali nedeniyle uyum gösteremeyen/öksüremeyen hastalar veya balgam alımının zor olduğu bebek veya küçük çocuklar Mide sondası yardımıyla 25-50 ml steril distile su, verildikten sonra geriye alınmakta, sıvı içinde yüzen en az 5-10 ml miktarında balgam parçaları, steril, tek kullanımlık, burgulu kapaklı 50 ml lik konik tüplere veya steril idrar kaplarına alınmalı - CLSI. Laboratory Detection and Identification of Mycobacteria; Approved Guideline. CLSI document M48-A, Vol. 28, No. 17, Pennsylvania, USA.

Pulmoner örnekler Açlık mide suyu Birbirini takip eden üç gün boyunca sabah erken aç karna alınmalı Örnekleme hasta uyandıktan hemen sonra, bir şey yemeden önce, tercihen yatağından kalkmadan yapılmalı Örnek, bir saati aşan sürede işlenemeyecek ise hemen 5-10 ml örnek başına 100 mg sodyum karbonat ile nötralize edilmeli Saklama ve transport oda ısısında yapılmalı - CLSI. Laboratory Detection and Identification of Mycobacteria; Approved Guideline. CLSI document M48-A, Vol. 28, No. 17, Pennsylvania, USA.

Pulmoner örnekler Doku örnekleri TB nin plevral effüzyonlarında plevral biyopsinin tanı değeri, plevral sıvıdan daha yüksek* - Escudero-Bueno C, et al. Cytologic and bacteriologic analysis of fluid and pleural biopsy specimens with Cope s needle. Study of 414 patients. Arch Intern Med 1990; 150:1190-4. - Valdes L, et al. Tuberculous pleurisy: a study of 254 patients. Arch Intern Med 1998; 158:2017-21. Transbronşiyal biyopsi örnekleri, akciğer TB sinin bakteriyolojik tanısına çok az katkı sağlamakta* - Stenson W, et al. Transbronchial biopsy culture in pulmonary tuberculosis. Chest 1983; 83:883-4. - Chan CH, et al. Bronchoscopy and tuberculostearic acid assay in the diagnosis of sputum smear-negative pulmonary tuberculosis: a prospective study with the addition of transbronchial biopsy. Q J Med 1992; 82:15-23.

Ekstrapulmoner örnekler İdrar İdrar verilmeden önce dış ürogenital bölge temizlenmeli Üç gün üst üste, en az 40-50 ml olacak şekilde sabah ilk idrarı steril kaba alınmalı İdrar alınamıyor ise kateter ile idrar alınabilir Transport bir saati aşacak ise örnek buzdolabına konmalı 3000xg de 15-30 dakika soğutmalı santrifüj sonrası sedimentten yayma ve dekontaminasyon sonrası kültür işlemi - CLSI. Laboratory Detection and Identification of Mycobacteria; Approved Guideline. CLSI document M48-A, Vol. 28, No. 17, Pennsylvania, USA.

Ekstrapulmoner örnekler Steril vücut sıvıları Aseptik şartlarda, 10 ml alınmalı Steril enjektör, konik tüp veya idrar kabı ile gönderilmeli Sürüntü örneği gönderilmemeli Miktar az ise doğrudan sıvı besiyerlerine (BACTEC 13A, Middlebrook 7H9, Dubos tween albümin gibi) inoküle edilebilir Steril vücut sıvıları az miktarda basil içerdiğinden büyük hacimlere gereksinim duyulmakta* 10-15 ml asit sıvısı kültür pozitifliği %35 1000 ml asit sıvısı kültür pozitifliği %66-83 - Sanai FM, Bzeizi KI. Systematic review: tuberculous peritonitis, presenting features, diagnostic strategies and treatment. Aliment Pharmacol Ther 2005; 22:685-700. - Pfyffer GE, Brown-Elliott BA, Wallace RJ. Mycobacterium: General characteristics, isolation, and staining procedures. In: Manual of Clinical Microbiology, eds: Murray PR, Baron EJ, Jorgensen JH, Pfaller MA, and Yolken RS, ASM Pres, Washington, USA, 8th ed., p:532-9, 2003.

Ekstrapulmoner örnekler Steril vücut sıvıları Kan, kemik iliği, sinovyal, plevral, perikardiyal ve peritoneal sıvılar, fibrinojen içerebileceğinden antikoagülanlı (sodyum poliyanetol sülfonat [SPS] veya heparin) tüpler içerisine alınmalı EDTA (etilen diamin tetra asetik asit), mikobakteri üremesini inhibe ettiği için EDTA lı klinik örnekler kabul edilmemeli BOS için maksimum miktar (en az 2 ml, optimal volüm 10 ml) alınmalı BOS örneği, oda ısısında saklanmalı; işlem öncesi buzdolabına konmamalı - CLSI. Laboratory Detection and Identification of Mycobacteria; Approved Guideline. CLSI document M48-A, Vol. 28, No. 17, Pennsylvania, USA.

Ekstrapulmoner örnekler Apse örnekleri ve aspirasyon sıvıları Klinik örnek alımından önce %70 lik alkol veya steril SF ile yüzeyel eksuda uzaklaştırılarak cilt temizliği yapılmalı Apse materyali, 50 ml lik konik tüp gibi sızdırmaz steril kaplara alınmalı; küçük miktarların taşınması için Middlebrook 7H9 sıvı besiyeri kullanılmalı; transferde ticari swaplar veya transport vasatları kullanılmamalı Kutanöz lezyon varlığında lezyon kenarının (perifer) altından örnek aspire edilmeli ve bu tip örneklerin kültürleri, optimum üreme sıcaklığı düşük olan mikroorganizmalar da (örneğin M. haemophilum, M.marinum, M.ulcerans) etken olabileceğinden 37 C yanısıra 30 C de de inkübe edilmeli - CLSI. Laboratory Detection and Identification of Mycobacteria; Approved Guideline. CLSI document M48-A, Vol. 28, No. 17, Pennsylvania, USA.

Ekstrapulmoner örnekler Doku örnekleri (lenf nodu, deri ve diğer biyopsi örnekleri) Aseptik şartlarda, alkol, formol ve benzeri fiksatif veya koruyucu içermeyen steril kaplar içine en az 1 gram alınmalı, gazlı beze sarılmamalı Biyopsi örneği çok küçük ise (ince iğne aspiratı gibi) kurumasını engellemek için bir miktar steril SF içine konabilir Transportta özellikle soğuk zincir önemli Dokular, steril bir doku öğütücüsünde kültür öncesi steril %0.2 sığır serum albümini veya SF içinde öğütülebilir Besiyerleri, 30 ve 37 C de inkübe edilmeli

Ekstrapulmoner örnekler Kan, kemik iliği Aseptik koşullarda alınan 10 ml kan örneği, doğrudan hasta başında 10 ml lik isolatör lizis santrifüj tüpüne (Isolator 10 tube, Wampole Laboratories, Cranbury, N.J.) (pediatrik form: Isolator 1.5 tube) Kan kültürü besiyerlerine (BACTEC myco/f lytic, MB/BacT Alert) aktarılmakta İsolatör sistem, saponin ihtiva etmekte; saponin, tüm kan hücrelerini eritir ve intrasellüler bakterilerin açığa çıkmasını sağlar Lizis santrifüj yöntemi, özellikle kanda mikobakterilerin çoğalması için önemli (3,000xg de en az 30 dakika santrifüj) Elde edilen sedimentten yayma ve kültür - Clinical Microbiology Procedures Handbook. 7.4.5. Wampole ISOLATOR Tube. Ed.: Garcia LS. 3rd edition, ASM Press, 2010. - CLSI. Laboratory Detection and Identification of Mycobacteria; Approved Guideline. CLSI document M48-A, Vol. 28, No. 17, Pennsylvania, USA.

Ekstrapulmoner örnekler Kan, kemik iliği Hasta başında ekim yapılamadığı durumlarda 10 ml tam kan, SPS veya heparinli antikoagülan içeren steril tüplere alınmalı, EDTA lı veya ACD (asit sitrat dekstroz) li tüpler kullanılmamalı Yetişkinler için en az 5 ml, çocuklar için 1 ml Saklama oda ısısında yapılmalı, kan örnekleri buzdolabına konmamalı Tam kan veya kemik iliği örnekleri, AIDS gibi immünsüpresyonlu dissemine TB şüpheli olgularda ve nedeni bilinmeyen ateşi olan hastalarda tercih edilmekte

Ekstrapulmoner örnekler Gaita Gaita örneği, intestinal TB veya M.avium-intracellulare (MAC) kompleks enfeksiyonundan şüphelenilen AIDS li hastalarda incelenmekte Transport işlemi bir saati aşacak ise buzdolabına konmalı Mikobakteri kültürü için rektal swaplar kabul edilmemeli - CLSI. Laboratory Detection and Identification of Mycobacteria; Approved Guideline. CLSI document M48-A, Vol. 28, No. 17, Pennsylvania, USA.

Rejeksiyon kriterleri Örnek miktarının yetersiz olması (40 ml den az idrar) Kuru sürüntü örnekleri (zorunlu ise transport besiyerine konup gönderilmeli) Formalin gibi fiksatif içinde gönderilen doku örnekleri Biriktirilmiş balgam örnekleri 24 saatlik biriktirilmiş, bekletilmiş veya kateter torbasından alınan idrar Üç saatten daha fazla nötralize edilmeden bekletilmiş açlık mide suyu - CLSI. Laboratory Detection and Identification of Mycobacteria; Approved Guideline. CLSI document M48-A, Vol. 28, No. 17, Pennsylvania, USA. - Pfyffer GE, Brown-Elliott BA, Wallace RJ. Mycobacterium: General characteristics, isolation, and staining procedures. In: Manual of Clinical Microbiology, eds: Murray PR, Baron EJ, Jorgensen JH, Pfaller MA, and Yolken RS, ASM Pres, Washington, USA, 8th ed., p:532-9, 2003.

Rejeksiyon kriterleri Koagüle, EDTA veya ACD li tüplere toplanan kanlar Uygun olmayan kaplarda gönderilen örnekler Örneğin gönderilmesi ile işlenmesi arasındaki sürenin uzun (>7 gün) olması Dondurulmuş örnekler - CLSI. Laboratory Detection and Identification of Mycobacteria; Approved Guideline. CLSI document M48-A, Vol. 28, No. 17, Pennsylvania, USA. - Pfyffer GE, Brown-Elliott BA, Wallace RJ. Mycobacterium: General characteristics, isolation, and staining procedures. In: Manual of Clinical Microbiology, eds: Murray PR, Baron EJ, Jorgensen JH, Pfaller MA, and Yolken RS, ASM Pres, Washington, USA, 8th ed., p:532-9, 2003.

Reddedilen klinik örnek için yapılacak işlemler İlgili hekim telefonla aranarak klinik örneğin neden kabul edilemez olduğu açıklanmalı Kayıt sistemine klinik örnek ile ilgili bilgiler, klinik örneğin işleme alınmama nedenleri, telefonla bilgilendirilen kişinin adı ve görüşme zamanı not edilmeli Çalışılmayan örnekler, 4 C de en fazla beş gün bekletilmeli, ancak hastadan tekrar klinik örnek alınamaması durumunda mevcut klinik örnek işleme alınmalı, negatif test sonucuna güvenilmemesi gerektiği vurgulanmalı

Klinik örneklerin işlenmesi 1. Konsantrasyon (santrifügasyon) 2. Homojenizasyon 3. Dekontaminasyon 4. Nötralizasyon

Konsantrasyon (santrifügasyon) Mikobakterilerin lipitten zengin hücre duvar yapıları nedeniyle genellikle bulunduğu sıvının yüzeyinde yerleşme eğiliminde İdrar, steril vücut sıvıları (BOS, plevra sıvısı, asit sıvısı vb.) az sayıda basil içermekte Büyük hacimlerdeki örnekler, izolasyon oranını arttırmak için daha fazla etken içeren küçük hacimler haline getirilmeli 3000xg de 15-30 dakika soğutmalı santrifüj işlemi Bu işlem, farklı basamaklarda klinik örnek üzerine eklenen sıvılardan dolayı örneği konsantre etmek için de uygulanmakta Santrifüj sırasında oluşan ısı artışı, mikobakteri kaybını arttırır; soğutmalı santrifüj cihazları tercih edilmeli

Homojenizasyon Klinik örneklerde bulunan organik kalıntılardan (eritrosit, lökosit, vücut sıvıları ve doku parçaları) arındırarak homojenize edip (digestion) mukus, epitel ve diğer şekilli elemanlar arasında gizlenmiş olan basilleri ortaya çıkarmak (mukolitik), klinik örnekte basillerin dengeli dağılımını sağlamak Homojenize ediciler: N-asetil-L-sistein (NALC), trisodyum fosfat

Homojenizasyon N-asetil-L sistein (NALC), oldukça etkili bir mukolitik ajan NALC, mukus proteinlerindeki disülfit bağlarını kırarak balgamın sıvılaşmasını kolaylaştırır NALC, oksijene çok duyarlı olduğu için çalışma solüsyonuna işlemden hemen önce eklenir; karışım, 24 saat içinde kullanılmalı ve hergün ekimden önce taze olarak hazırlanmalı NALC nin tartım işlemleri sırasında ambalajın ağzı uzun süre açık bırakılmamalı NALC nin etkinliği, kanlı klinik örneklerde azalmakta* - CLSI. Laboratory Detection and Identification of Mycobacteria; Approved Guideline. CLSI document M48-A, Vol. 28, No. 17, Pennsylvania, USA.

Dekontaminasyon Çoğu klinik örnek, mikobakterilerin yanısıra Klinik örneğin alındığı vücut bölgesine özgü, hızlı üreyen normal flora üyelerini Flora üyeleri, Asit-alkole duyarlı olduklarından boyalı mikroskobik incelemede fazla sorun oluşturmamaktalar Ancak kültürde mikobakterilere göre daha kısa sürede ve daha bol üreyebildiklerinden mikobakterilerin üremesini baskılanmaktalar Besiyeri yüzeyini kısa sürede kaplamaktalar Besiyerindeki besin maddelerini tüketmekteler Besiyeri ph sını asidik veya alkali yönde değiştirmekteler

Dekontaminasyon Klinik örneklerdeki kontaminant veya flora üyelerinin ortadan kaldırılması için NaOH, oksalik asit, zefiran, sülfürik asit gibi dekontaminantlar Steril örnekler, işlemden geçirilmeden doğrudan kültüre edilebilir İşlem esnasında kontamine olduğundan kuşkulanılan steril örneklere de dekontaminasyon uygulanmalı NaOH, hem dekontaminant hem de dijestan olarak kullanılabilmekte NaOH, aynı zamanda mikobakterisidal etkili (yoğunluk ve süre önemli)

Dekontaminasyon Kültürlerde %2-5 kontaminasyon oranı normal Sterilite koşullarına tam uyulduğu varsayıldığında kontaminasyon oranı %2 den düşük ise NaOH konsantrasyonu gereğinden fazla; %5 ten fazla ise NaOH konsantrasyonu yetersiz Kullanılan NaOH yoğunluğu, kontaminasyon oranına göre ayarlanmalı (%4 ten %2 veya %6 ya geçiş) Eşit miktarlarda karıştırılan NaOH ile balgam örneklerinin işlenme süresi (santrifüj işlemi dahil), NaOH yoğunluğu ne olursa olsun en az 15, en fazla 30 dakika olmalı - CLSI. Laboratory Detection and Identification of Mycobacteria; Approved Guideline. CLSI document M48-A, Vol. 28, No. 17, Pennsylvania, USA.

Kültür kontaminasyonu Kontaminasyon oranlarında artış meydana geldiğinde öncelikle steriliteden şüphe edilmeli Tüm araç-gereçler ve kimyasal çözeltiler steril olmalı Kontaminasyon kaynağını saptamak güç ve çoğunlukla uzun zaman almakta İşlem sırasında kullanılan tüm malzemeler iptal edilip sterilite koşulları gözden geçirildikten sonra yenileri hazırlanmalı Yöntemde değişiklikler, ancak sterilite faktörü bertaraf edildikten sonra yapılmalı - CLSI. Laboratory Detection and Identification of Mycobacteria; Approved Guideline. CLSI document M48-A, Vol. 28, No. 17, Pennsylvania, USA.

Dekontaminasyon %2 lik final NaOH konsantrasyonu, mikobakterilere öldürücü etkisi nedeniyle özellikle yayma negatif hastalarda tanı zorluğuna neden olabilmekte - CLSI. Laboratory Detection and Identification of Mycobacteria; Approved Guideline. CLSI document M48-A, Vol. 28, No. 17, Pennsylvania, USA.

Nötralizasyon Mikobakteriler, genelllikle ph:6-8 de iyi üremekte İdrar, açlık mide sıvısı gibi klinik örnekler asidik yapı göstermekte Diğer klinik örnekler, işlemler esnasında kullanılan kimyasal maddelerden dolayı asidik ya da bazik olmakta Genellikle fosfat tampon çözeltisi ya da brom-timol, fenol kırmızısı gibi bir indikatör eşliğinde asit (hidroklorik asit, sülfürik asit vb.) veya alkali çözeltiler (NaOH vb.) kullanılmakta Fosfat tamponu eklenmiş klinik örneğin santrifüj sonrası süpernatant kısmı iyice dökülmez ise işlenmiş örneğin yüksek kalan ph sı mikobakterilerin kültürde üremesini engellemekte

Homojenizasyon-dekontaminasyonkonsantrasyon yöntemleri 1. NaOH-NALC yöntemi 2. NaOH yöntemi 3. Benzalkonyum klorid-trisodyum fosfat yöntemi 4. Oksalik asit yöntemi 5. Setilpiridinyum klorid (cetylpyridinium chloride [CPC]) yöntemi 6. Sülfürik asit yöntemi 7. Brom-timol indikatörlü yöntem 8. NaOH-modifiye Petroff yöntemi 9. NaOH-Ogawa yöntemi - CLSI. Laboratory Detection and Identification of Mycobacteria; Approved Guideline. CLSI document M48-A, Vol. 28, No. 17, Pennsylvania, USA.

Homojenizasyon-dekontaminasyonkonsantrasyon yöntemleri Çoğu akciğer TB tanısı amacıyla balgam örneklerini temel alan, küçük ve büyük ölçekli laboratuvarlarda uygulanabilen yöntemler Her birinin kendine özgü avantajları ve dezavantajları var Hangi yöntem seçilirse seçilsin örneklerin işlenmesi sırasında kullanılan solüsyonlar ile çapraz kontaminasyonu önlemek için titizlikle çalışılmalı Laboratuvar için en uygun yöntem seçilmeli Mikobakteriyoloji laboratuvarını biyogüvenlik koşulları Laboratuvar donanım (alet, soğutmalı santrifüj gibi cihazlar, pipet, tüp, pastör pipeti gibi malzemelerin sorunsuz temini, vs.) Rutin çalışma yükü Tecrübeli ve yeterli sayıda personel durumu - CLSI. Laboratory Detection and Identification of Mycobacteria; Approved Guideline. CLSI document M48-A, Vol. 28, No. 17, Pennsylvania, USA.

NaOH-NALC yöntemi Reagent A: %4 lük NaOH çözeltisi (40 g NaOH + 1000 ml distile su) Reagent B: %2.9 luk dehidrate sodyum sitrat (29 g dehidrate sodyum sitrat + 1000 ml distile su) veya %2.6 lık sodyum sitrat anhidröz (klinik örnekte bulunabilecek ağır metal iyonlarını bağlayarak NALC nin inaktive olmasını önler) Reagent C: NALC (taze günlük hazırlanır; kuvvetli şekilde sallamayın) Reagent D: ph 6.8 fosfat tamponu veya steril distile su Reagent A ve B çözeltileri otoklavda steril edildikten sonra eşit miktarlarda karıştırılarak tabloda belirtilen miktarlarda NALC eklenmekte Toplam hacim (ml) %4 NaOH (ml) %2.9 sodyum sitrat (ml) NALC (g) 50 25 25 0.25 100 50 50 0.5 500 250 250 2.5 1000 500 500 5.0

NaOH-NALC yöntemi 5-10 ml balgam veya diğer örnekler, 50 ml lik polipropilen, burgulu kapaklı steril tüplere eklenir Üzerine klinik örnek miktarı kadar NALC-NaOH solüsyonu ilave edilir Tüpün kapağı sıkıca kapatılır Karışımı içeren tüp, solüsyon likefiye oluncaya kadar (30 saniyeyi geçmeyecek şekilde) vortekslenir Tüpler oda ısısında ara sıra elle çalkalanarak 15 dakika bekletilir. Bu süre aşılmamalıdır Süre tamamlandığında nötralizasyon amacı ile tüpün 50 ml çizgisine kadar steril fosfat tamponu (ph 6.8) veya steril distile su ilave edilip karışım el yardımı ile alt-üst edilir.

NaOH-NALC yöntemi Tüpler, 3000xg de 15-20 dakika santrifüj edilir Süpernatant, içinde 1/10-1/50 dilüe edilmiş sodyum hipoklorid bulunan kaba boşaltılır Sedimente 1-2 ml steril fosfat tamponu (ph 6.8) veya SF eklenir. Eğer kültür vasatına inokülasyon işlemi gecikecek ise PBS veya SF yerine %0.2 lik sığır serum albümin fraksiyon V eklenir. Resüspansiyon sonrası sedimentten kültür ve yayma yapılır. - CLSI. Laboratory Detection and Identification of Mycobacteria; Approved Guideline. CLSI document M48-A, Vol. 28, No. 17, Pennsylvania, USA.

NaOH yöntemi Reagent A: Steril %2-4 lük NaOH solüsyonu (kontaminasyon oranına göre) Reagent B: ph:6.8 fosfat tamponu veya steril distile su Reagent C: Fenol kırmızısı indikatörü Reagent D: 2N HCl - CLSI. Laboratory Detection and Identification of Mycobacteria; Approved Guideline. CLSI document M48-A, Vol. 28, No. 17, Pennsylvania, USA.

NaOH yöntemi 5-10 ml balgam veya diğer örnekler, 50 ml lik polipropilen, burgulu kapaklı steril santrifüj tüplerine eklenir Üzerine klinik örnek miktarı kadar %2 lik NaOH solüsyonu ilave edilir. Tüpün kapağı sıkıca kapatılır Karışımı içeren tüp, solüsyon likefiye oluncaya kadar (30 saniyeyi geçmeyecek şekilde) vortekslenir Tüpler oda ısısında ara sıra elle çalkalanarak 15 dakika bekletilir. Bu süre aşılmamalıdır Süre tamamlandığında nötralizasyon amacı ile tüpün 50 ml çizgisine kadar steril fosfat tamponu (ph 6.8) veya steril distile su ilave edilip karışım el yardımı ile alt-üst edilir

NaOH yöntemi Tüpler, 3000xg de 15-20 dakika santrifüj edilir Süpernatant, içinde 1/10-1/50 dilüe edilmiş sodyum hipoklorid bulunan bir kaba boşaltılır Sedimente birkaç damla fenol kırmızısı indikatörü eklenir. İndikatör sarı kalıncaya kadar sedimente her defasında birer damla 2N HCl eklenerek nötralize edilir. Sedimente 1-2 ml steril fosfat tamponu (ph 6.8) veya SF eklenir. Eğer kültür vasatına inokülasyon işlemi gecikecek ise PBS veya SF yerine %0.2 lik sığır serum albümin fraksiyon V eklenir Resüspansiyon sonrası sedimentten kültür ve yayma yapılır. - CLSI. Laboratory Detection and Identification of Mycobacteria; Approved Guideline. CLSI document M48-A, Vol. 28, No. 17, Pennsylvania, USA.

Benzalkonyum klorid (zefiran)- trisodyum fosfat yöntemi Reagent A: 1 kg trisodyumfosfat (Na 3 PO 4-12H 2 O) 4 L sıcak distile suda çözülür Reagent B: 7.5 ml %17 lik benzalkonyum klorid (zefiran) ilave edilerek karıştırılır ve oda ısısında saklanır Reagent C: ph 6.6 nötralizasyon tamponu, 37.5 ml 0.067 M disodyum fosfat tamponu, 62.5 ml 0.067 M monopotasyum fosfat tamponu - CLSI. Laboratory Detection and Identification of Mycobacteria; Approved Guideline. CLSI document M48-A, Vol. 28, No. 17, Pennsylvania, USA.

Benzalkonyum klorid (zefiran)- trisodyum fosfat yöntemi 50 ml lik polipropilen tüpe balgam veya diğer örnekten 5-10 ml konur Klinik örneğe eşit miktarda zefiran-trisodyumfosfat reagenti eklenir Karışım, mekanik karıştırıcıda 30 dakika kuvvetlice çalkalanır ve sonra tüpler, 20-30 dakika oda ısısında bekletilir Tüpler, 3000xg de 15 dakika santrifüj edilir ve süpernatant dezenfektan içeren bir kaba dökülür Sediment içinde arta kalan zefiranı nötralize etmek için 20 ml tampon çözeltisi ilave edilir ve bir test tüp karıştırıcıda 20 saniye karıştırılır 3000xg de 15 dakika tekrar santrifüj edilir ve süpernatant dökülür. Sedimentten kültür ve yayma yapılır

Benzalkonyum klorid (zefiran)- trisodyum fosfat yöntemi Dekontaminasyon süresinin takip edilemediği durumlarda kullanılabilir Yumurta bazlı besiyerindeki fosfolipidler, arta kalan zefiranı nötralize ettiklerinden bu yöntem, sadece yumurta bazlı vasatlarda yapılacak kültürlerde kullanılabilir Zefiranın Middlebrook besiyeri, MGIT ve diğer sıvı-bazlı kültür sistemlerinde mikobakterilere öldürücü etkisi bulunmakta - CLSI. Laboratory Detection and Identification of Mycobacteria; Approved Guideline. CLSI document M48-A, Vol. 28, No. 17, Pennsylvania, USA.

Oksalik asit yöntemi Reagent A: %5 lik oksalik asit Reagent B: %4 lük NaOH solüsyonu Reagent C: %0.85 SF Reagent D: Fenol kırmızısı indikatör Pseudomonas türleri ile sıklıkla kontamine olan klinik örneklerin işleminde tercih edilir - CLSI. Laboratory Detection and Identification of Mycobacteria; Approved Guideline. CLSI document M48-A, Vol. 28, No. 17, Pennsylvania, USA.

Oksalik asit yöntemi 50 ml lik polipropilen tüpe klinik örnekten 5-10 ml konur Klinik örneğe eşit miktarda %5 lik oksalik asit reagenti eklenir Bir test tüp çalkalayıcısında 30 saniye karıştırılır ve tüpler, 30 dakika oda ısısında bekletilir Tüplere, 50 ml çizgisine kadar steril SF konur 3000xg de 15 dakika santrifüj edilir ve sonra süpernatant dezenfektan içeren kaba dökülür Birkaç damla fenol kırmızısı indikatörü eklenir Nötralize oluncaya kadar (uçuk pembe) her seferinde bir damla %4 lük NaOH ilave edilir Sedimentten kültür ve yayma yapılır

Setilpiridinyum klorid (CPC) Reagent A: 1000 ml distile suda 20 g NaCl ve 5-10 g CPC çözülür. Reagentin sterilizasyonuna ihtiyaç yoktur. Ancak ışık, sıcaklık ve buharlaşmadan korunmalı Reagent B: Steril SF, distile su veya %0.2 lik sığır serum albümini fraksiyon V seçilir CPC yöntemi, sadece yumurta bazlı besiyerinde yapılacak kültür işlemleri için uygulanabilir; setilpiridinyumun Middlebrook besiyeri, MGIT ve diğer sıvı-bazlı kültür sistemlerinde mikobakterilere öldürücü etkisi bulunmakta NaOH dan etkilenen klinik örneklerde ve klinik örneklerin laboratuvara 24 saatlik nakil işlemlerinde tercih edilir - CLSI. Laboratory Detection and Identification of Mycobacteria; Approved Guideline. CLSI document M48-A, Vol. 28, No. 17, Pennsylvania, USA.

Setilpiridinyum klorid (CPC) 50 ml lik polipropilen tüpe klinik örnekten 10 ml konur Tüpe eşit hacimde CPC-NaCl eklenir ve yönetmeliklere uygun şekilde koruyucu kap içinde tüp postalanır Laboratuvar tüpü teslim aldıktan sonra 24 saatte dekontaminasyon işlemi tamamlanmalıdır Tüplere 50 ml ye kadar steril SF, distile su veya BSA fraksiyon V eklenir. Tüpler, 3000xg de 15 dakika santrifüj edilir ve süpernatant dezenfektan içeren kaba dökülür Sediment, 1-2 ml steril SF, distile su veya BSA fraksiyon V ile süspanse edilir Sedimentten kültür ve yayma yapılır

Brom-timol indikatörlü yöntem Dekontaminan ve mukolitik ajan olarak %4 lük NaOH çözeltisi: 40 g NaOH, 1000 ml distile suda eritilir. Otoklavda 121 C de 15 dakika steril edilir. Buzdolabı/oda ısısında saklanır. Klinik örneği nötralize etmek için indikatör çözeltisi (brom timol mavisi): 0.5 g brom timol mavisi, 125 ml %95 lik etil alkol + 500 ml distile suda iyice eriyinceye kadar karıştırılır. Renkli şişelerde ve oda ısısında saklanır. Klinik örneği nötralize etmek için hidroklorik asit çözeltisi: 175 ml distile su üzerine 25 ml saf (%37 lik) HCl yavaş yavaş eklenir. Hiçbir zaman asit içine su ilave edilmemelidir. Oda ısısında saklanır. Özellikle Pseudomonas spp. ile kontamine kültürlerde tercih edilmeli BACTEC kültür sisteminde de kullanılabilir

Modifiye Petroff yöntemi Dekontaminan ve mukolitik ajan olarak %4 lük NaOH çözeltisi NaOH un etkisini azaltmak ve örneği seyreltmek için %0.85 lik NaCl veya distile su Avantajları; Basit, ucuz ve etkili dekontaminasyon yöntemi Bir örnek için harcanan süre yaklaşık 1 saat, 20 örnek için (santrifüj cihazının kapasitesine bağlı) yaklaşık 2 saat Steril edilmiş NaOH çözeltisi, plastik şişelerde birkaç hafta saklanabilir; günlük hazırlanması gerekmez

Modifiye Petroff Yöntemi Dezavantajları; Petroff yönteminden farklı olarak bu yöntemde klinik örnek üzerine iki katı miktarda %4 NaOH çözeltisi eklenmekte, dolayısıyla NaOH yoğun konsantrasyonda kullanıldığında ve işlem süresi uzatıldığında bol miktarda mikobakteri kaybına yol açabilmekte Santrifüj içinde ısı artışına bağlı kayıpların da eklenmesi ile TB basil kaybı %60 lara kadar yükselebilmekte

NaOH-Ogawa yöntemi Klinik örneğe eşit hacimde %4 lük NaOH eklenir Tüpün kapağı sıkıca kapatılır 15 dakika oda ısısında bekletilir Bu süre içerisinde balgam ile NaOH un homojen bir şekilde karışması için tüp birkaç kez vortekslenir (ya da alt üst edilerek çalkalanır) İki adet Ogawa besiyeri ters çevrilerek steril bir gazlı bez veya pamuk üzerine besiyeri içindeki yoğunlaşmış su dökülür İşlenmiş her bir örnek için iki Ogawa tüpüne 0.1 er ml (100 µl) ekim yapılır ARB incelemesi için yayma hazırlanır

Sülfürik asit yöntemi Alkali yöntemlerden birisi ile işleme alındığında kültürlerinde kontaminasyon olan idrar ve diğer vücut sıvıları için faydalı olabilir Klinik örneğin hepsi 30 dakika 3000xg de santrifüj edilir Sedimentler birleştirilir. Sedimente eşit hacimde %4 lük H 2 S0 4 eklenir ve vortekslenir Steril distile su ile tüpler, 50 ml ye kadar tamamlanır. 3000xg de 15 dakika santrifüj edilir ve süpernatant dökülür. Fenol kırmızısı ve %4 NaOH ile nötralize edilir Sedimentten yayma ve ekim yapılır

BBL MycoPrep (BD) 0.370 g NALC-NaOH (%2)-trisodyum sitrat (%1.45) (10 ar adet 75 ml veya 150 ml lik ambalajlarda) PBS (ph 6.8) (5 ve 10 adet) NaOH-trisodyum sitrat kullanıma hazır NALC, durgun durumda mukolitik etkinliğini kaybettiğinden NaOH-sodyum sitrat çözeltisi içerisinde kilitli bir cam ampul içinde bulunmakta, kullanılmadan hemen önce cam ampul merkezden bir kez kırılır ve reaktifler yavaşça karıştırılır

TDC (TB dekontaminasyon ve konsantrasyon) kiti (RTA Lab.) Toz NALC ve steril cam boncuklar içeren 50 ml lik polipropilen örnek toplama tüpü 10 ml NaOH-trisodyum sitrat solüsyonu içeren 15 ml lik polipropilen tüp 50 ml lik polipropilen tüpte steril fosfat tamponu Dezenfektan olarak polietilen şişede 200 ml lik sodyum hipoklorit Kit oda sıcaklığında ve kuru yerde 12 ay süresince saklanabilmekte 10 testlik ambalajda

MycoProSafe (MPS) dekontaminasyon ve konsantrasyon kiti (Salubris) 40 mg toz NALC ve 4 mm çaplı steril cam boncuklar içeren 50 ml lik 25 adet polipropilen örnek toplama tüpü 125 ml %2,3,4 lük NaOH-%1.47 lik trisodyum sitrat solüsyonu içeren 2 adet plastik şişe 50 ml lik steril fosfat tamponu içeren 25 adet plastik şişe Dezenfektan olarak 125 ml lik 3 adet %2.5 lik sodyum hipoklorit (NaOCl) içeren plastik şişe 25 testlik ambalajda

Tüberküloz tanısı için santrifüj gerektirmeyen yeni bir dekontaminasyon ve yoğunlaştırma yöntemi Tanıl Kocagöz 1, Işın Akyar 1, Sedat Altın 2, İlhan Taş 2, Perihan Karaduman 3, Pınar Başören 4, Elif Yeşilyurt 3, Sinem Öktem Okullu 1, Nihan Aytekin 1, Tufan Silier 4 1 Acıbadem Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji A.D. 2 T.C. Sağlık Bakanlığı Yedikule Göğüs Hastalıkları ve Göğüs Cerrahisi Eğitim ve Araştırma Hastanesi 3 Tanısal İnovatif Biyoteknoloji Organizasyonu (TİBO) 4 Salubris A.Ş. Dekontaminasyon ve nötralizasyon işlemleri için örneğe çok fazla sıvı eklenmesi gerektiğinden seyrelmiş örnekteki mikobakterileri yoğunlaştırmak için santrifüj gerekmekte Dekontaminasyon ve yoğunlaştırma işlemini santrifüj gerektirmeden yapabilen ve kolay uygulanabilen bir kit geliştirilmiş Geliştirilen yöntemde eklenen sıvılar, emici boncuklar tarafından emildiği için santrifüj gereksinimi ortadan kalkmış Çalışmada 46 balgam örneği iki eşit miktara bölünüp NaOH-NALC yöntemi ve yeni geliştirilen bir kit olan Decomics ile işleme alınmış İşlenmiş örnekler, mikroskopla incelenmiş, LJ ve TK-SLC besiyerlerine ekilmiş

Tüberküloz tanısı için santrifüj gerektirmeyen yeni bir dekontaminasyon ve yoğunlaştırma yöntemi Tanıl Kocagöz 1, Işın Akyar 1, Sedat Altın 2, İlhan Taş 2, Perihan Karaduman 3, Pınar Başören 4, Elif Yeşilyurt 3, Sinem Öktem Okullu 1, Nihan Aytekin 1, Tufan Silier 4 1 Acıbadem Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji A.D. 2 T.C. Sağlık Bakanlığı Yedikule Göğüs Hastalıkları ve Göğüs Cerrahisi Eğitim ve Araştırma Hastanesi 3 Tanısal İnovatif Biyoteknoloji Organizasyonu (TİBO) 4 Salubris A.Ş.

Güvenlik önlemleri Örneklerle çalışılırken daima maske ve eldiven takılmalı Tüm işlemler sınıf II biyogüvenlik kabininde yapılmalı Ağızla çekerek pipetleme kesinlikle yapılmamalı Bakterilerin çöktürülmesi aşamasında aerosollerin önlenmesi için hava geçirmez kapaklı soğutmalı santrifüjler kullanılmalı Kontamine sıvı dökülürse %2 lik hipoklorit çözeltisi ile temizlenmeli NaOH-sodyum sitrat çözeltisi veya dezenfektan, göz, deri ve mukozal yüzeye temas ederse kimyasal yanıklara neden olabilir; su ile yıkanmalı, tıbbi yardım istenmeli Örnekler içinde HBV ve HIV gibi patojenler bulunabilir! Tüpler, çevre güvenliğine uygun bir şekilde atılmalı

Baylan O. İlaca dirençli tüberkülozun tedavisi. Turkiye Klinikleri J Med Sci 2012; 32(3): 788-804. Baylan O. [Extensively drug resistant and extremely drug resistant tuberculosis forms after multi-drug resistant tuberculosis: new faces of the old disease]. Mikrobiyol Bul. 2011 Jan;45(1):181-95. Acar A, Sücüllü İ, Baylan O, Filiz Aİ, Diktaş H, Kıvanc M, Öncül O, Görenek L. Coexistence of pancreatic tuberculosis with systemic brucellosis: a case report. Cent Eur J Med 2010; 5(5): 573-576. Agca H, Baylan O, Ozyurt M, Acar A, Demirpek U, Haznedaroglu T. Genitourinary tuberculosis in a 54-year-old woman: diagnostic difficulty. Cent Eur J Med 2010; 5(5): 569-572. Baylan O, Kilciler G, Albay A, Tuzun A, Kisa O, Dagalp K. Polymerase chain reaction based diagnosis of primary gastric tuberculosis in an 80- year-old woman: a case report and review of the literature. New Microbiol. 2009 Apr;32(2):217-21.

Kisa O, Albay A, Baylan O, Tozkoparan E, Acikel CH, Doganci L. Genetic diversity of Mycobacterium tuberculosis isolates at the Military Medical Academy in Ankara, Turkey. Res Microbiol. 2007 May;158(4):318-23. Baylan O, Balkan A, Inal A, Kisa O, Albay A, Doganci L, Acikel CH. The predictive value of serum procalcitonin levels in adult patients with active pulmonary tuberculosis. Jpn J Infect Dis. 2006 Jun;59(3):164-7. Oncul O, Baylan O, Mutlu H, Cavuslu S, Doganci L. Tuberculous meningitis with multiple intracranial tuberculomas mimicking neurocysticercosis clinical and radiological findings. Jpn J Infect Dis. 2005 Dec;58(6):387-9. Baylan O, Demiralp B, Cicek EI, Albay A, Komurcu M, Kisa O, Gunal A, Ugurel MS. A case of tuberculous pyomyositis that caused a recurrent soft tissue lesion localized at the forearm. Jpn J Infect Dis. 2005 Dec;58(6):376-9. Erdem H, Baylan O, Simsek I, Dinc A, Pay S, Kocaoglu M. Delayed diagnosis of tuberculous arthritis. Jpn J Infect Dis. 2005 Dec;58(6):373-5.

Baylan O, Albay A, Kisa O, Tekbaş OF, Deniz O. [Detection of primary drug resistance rates of Mycobacterium tuberculosis complex strains isolated between 2002-2003 years and comparison with the data of 1998-2001 period]. Mikrobiyol Bul. 2005 Apr;39(2):153-60. Ozgul A, Baylan O, Taskaynatan MA, Kalyon TA. Poncet's disease (tuberculous rheumatism): two case reports and review of the literature. Int J Tuberc Lung Dis. 2005 Jul;9(7):822-4. Baylan O. [Culture based diagnostic methods for tuberculosis]. Mikrobiyol Bul. 2005 Jan;39(1):107-24. Baylan O. A new colorimetric culture system for the diagnosis of tuberculosis, In Reply, Int J Tuberc Lung Dis 2004; 8(12): 1513. Baylan O, Arca E, Ozcan A, Kisa O, Albay A, Doganci L. Polymerase chain reaction based detection of Mycobacterium tuberculosis complex in lupus vulgaris: a case report. Int J Tuberc Lung Dis. 2004 Sep;8(9):1147-50.

Baylan O, Kisa O, Albay A, Doganci L. Evaluation of a new automated, rapid, colorimetric culture system using solid medium for laboratory diagnosis of tuberculosis and determination of anti-tuberculosis drug susceptibility. Int J Tuberc Lung Dis. 2004 Jun;8(6):772-7. Kisa O, Albay A, Baylan O, Balkan A, Doganci L. Drug resistance in Mycobacterium tuberculosis: a retrospective study from a 2000-bed teaching hospital in Ankara, Turkey. Int J Antimicrob Agents. 2003 Oct;22(4):456-7. Albay A, Kisa O, Baylan O, Doganci L. The evaluation of FASTPlaqueTB test for the rapid diagnosis of tuberculosis. Diagn Microbiol Infect Dis. 2003 Jul;46(3):211-5. Kisa O, Albay A, Bedir O, Baylan O, Doganci L. Evaluation of FASTPlaqueTB-RIF for determination of rifampicin resistance in Mycobacterium tuberculosis complex isolates. Int J Tuberc Lung Dis. 2003 Mar;7(3):284-8. Kisa O, Albay A, Baylan O, Doganci L. The value of submitting multiple sputum specimens for accurate diagnosis of pulmonary tuberculosis. J Microbiol 2002; 40(4): 301-304.

TEŞEKKÜR EDERİM