Algisidal Deneylerde Kullanılan Mikroorganizmaların Revizyonu Amacıyla Havuzlarda Bulunan Yaygın Mikroalglerin Belirlenmesi

Ebat: px

Şu sayfadan göstermeyi başlat:

Download "Algisidal Deneylerde Kullanılan Mikroorganizmaların Revizyonu Amacıyla Havuzlarda Bulunan Yaygın Mikroalglerin Belirlenmesi"

Su Koçak
7 yıl önce
İzleme sayısı:

1 Algisidal Deneylerde Kullanılan Mikroorganizmaların Revizyonu Amacıyla Havuzlarda Bulunan Yaygın Mikroalglerin Belirlenmesi Burçin Karabey 1, İnci Tüney Kızılkaya 2, Ataç Uzel 1, Güven Özdemir 1 1 Ege Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü, Temel ve Endüstriyel Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, 35100, Bornova, İzmir, Turkey. 2 Ege Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü, Hidrobioloji Anabilim Dalı, 35100, Bornova, İzmir, Turkey.

2 Biyosidal Ürünlerin Önemi Günümüzde sağlık, gıda ve tarım gibi insan sağlığı ile ilgili her alanda zararlılarla mücadele etmek için biyosidal ürünler kullanılmaktadır. Bu nedenle hem Türkiye hem de dünyada etkin ve geniş çaplı biyosidal ürünlerin AR-GE çalışmaları son yıllarda hız kazanmıştır.

3 Biyosidal Ürünler ve Kullanım Alanları 1. Ana Grup Biyosidal Ürünler: Dezenfektanlar ve Genel Biyosidal Ürünler Ana Ürün Grup Tipi: İnsan Biyosidal hijyeni ile Ürünler: ilgili biyosidal Koruyucular ürünler Ana Ürün Grup Tipi: Kişisel Biyosidal alanlarda Ürünler: ve umumi Haşere alanlarda Kontrolü için Atık sular, Kullanılan Hastane atıkları vb. Biyosidal kullanılan Ürünler dezenfektanlar ve biyosidal ürünler 4. Ana Grup Biyosidal Ürünler: Diğer Biyosidal Ürünler 3. Ürün Tipi: Veteriner hijyenine yönelik biyosidal ürünler 4. Ürün Tipi: Gıda ve yem alanlarında kullanılan dezenfektanlar 5. Ürün tipi: İçme suyu dezenfektanları Yüzme havuzları, Akvaryumlar,

4 Yüzme Suları Kalitesinin Önemi Su kaynaklı hastalıkların, özellikle halka açık alanlarda ki yayılma potansiyelleri düşünüldüğünde havuz sularının kalitesinin önemi göze çarpmaktadır. Bakteri, mantar ve alg gibi insan sağlığına zararlı mikroorganizmalar havuz suyunun yutulması veya deri yoluyla insan vücuduna girerek bir çok hastalığa sebep olabilmektedir. Uygun sıcaklık, güneş ışığı, besin, oksijen vb.

5 BİYOSİDAL ÜRÜN ANALİZ LABORATUVARLARININ ÇALIŞMA USUL VE ESASLARI EK-17 Dezenfektanlar ve Genel Biyosidal Ürünler için Test Organizmaları Mikroorganizmalar Bakteri Virus Fungus Mikobakteri Bakteri Sporları Alg Pleurochloris pyrenoidosa (Yüzme Havuzu) ( Xanthophyta/Sarı-Yeşil Alg) Oocystis sp. (Yüzme Havuzu) (Chlorophyta / Yeşil Alg) Phormidium minnesotense (Yüzme Havuzu) (Cyanophyta / Siyanobakteri ) Plectonema sp. (Yüzme Havuzu) (Cyanophyta / Siyanobakteri)

6 Havuzlarda Alg Popülasyonunun Zararları Havuzlarda bulanık ve kirli bir görüntü ve kötü kokular oluştururlar. Tutundukları yüzey kayganlaştığı için yüzücüler açısından tehlikelidir. Klor ve dezenfektan tüketimini artırırlar. Ürettikleri toksinler deride kaşıntıya, yutulması halinde ise ciddi sağlık problemlerine yol açar.

7 Rio Olimpiyatları

8 Türkiye Güneş Işığı Haritası Çalışmanın Amacı Farklı bölgelerde bulunan ülkelerdeki güneşin geldiği açı, sıcaklık vb. koşullar yüzünden fotosentetiklerin cinsini, türünü değiştirecektir. Dolayısıyla Türkiye havuzlarında bulunabilecek türler başka enlemlerde bulunan ülkelerin havuzlarında olmayabilecektir.

9 Çalışmanın Amacı Havuz sularının yaygın mikrobiyal florasının belirlenmesi sonucu mevcut yönetmeliklere eklenebilecek organizmalar ile etkin biyosidal ürünlerin kullanılabileceği ön görülmektedir. Türkiye nin coğrafik konumu ve mevsimsel değişimleri göz önüne alınarak, ülkemize özgü floranın belirlenmesi ile düzenlenecek ürün yönetmeliklerinin etkin sonuçlar verebileceği düşünülmektedir.

10 Materyal ve Metod Kültür Bağımsız Moleküler Analizler PCR-DGGE Yöntemi

Çalışma Basamakları Havuz örneklerinden DNA izolasyonu Polimeraz Zincir Reaksiyonu Denature Kullanılan Primerler Edici Gradiyent Jel Elektroforezi DNA Dizi Analizleri Filogenetik Analizler Primer Adı

11 Çalışma Basamakları Havuz örneklerinden DNA izolasyonu Polimeraz Zincir Reaksiyonu Denature Kullanılan Primerler Edici Gradiyent Jel Elektroforezi DNA Dizi Analizleri Filogenetik Analizler Primer Adı Primer Sekansı (5-3 ) Referans PCR CYA359F Kesilen Ürünleri DNA %45-55 ggggaattttccgcaatggg bantları oranında kalıp denaturant olarak içeren kullanılarak akrilamid GC jele kelepçe yüklenerek 60 C de 135 V / 8 saat boyunca yürütülmüştür. Yürütme sonrasında jel CYA359F / cgcccgccgcgccccgcgcccgtcccgccgcc Nübel et GelGreen Elde edilenboyası DNA dizi ileanalizi boyanarak sonuçlarının UV bilinen görüntüleme ve tanımlanmış sistemitürlerle ile GC cccgcccgggggaattttccgcaatggg al., 1997 görüntülenmiştir. birlikte analizine Mega7 gönderilmiştir. programı kullanılarak Maximum likelihood metodu ile filogenetik yakınlıkları belirlenmiştir. içermeyen primerler kullanılarak yeniden çoğaltılarak DNA dizi CYA781R gactacaggggtatctaatcccttt PCR işlemi öncelikle GC kelepçe içermeyen primerler ile yapılmıştır. PCR ürünleri kalıp olarak kullanılarak GC kelepçe içeren primerler ile yeniden amplifiye edilmiştir. Türkiye nin Elde 18 edilen farklı lokasyonundan PCR ürünleri ile İlkbahar-Yaz DGGE analizine 2015 döneminde geçilmiştir. alınan 22 havuz suyu örneğinden Qiagen DNA izolasyon kiti kullanılarak DNA izolasyonu yapılmıştır.

12 Sonuçlar ve Tartışma

13 Örnek PCR Lokasyonu Kodu sonucu DGGE Kodu K1 Çeşme + 1 K2 Antalya + 2 K3 Denizli - K4 Urla - K5 İstanbul - K6 İstanbul + 3 K7 Malatya + 4 K8 Adana + 5 K9 Hatay - K10 Diyarbakır + 6 K11 Bodrum - K12 Muğla + 7 K13 Aydın + 8 K14 Kayseri + 9 P1 Diyarbakır + 10 P2 Fethiye + 11 P3 Ayvalık - P4 Sakarya + 12 P5 Adapazarı + 13 P6 Marmaris + 14 P7 Alaçatı + 15 P8 Diyarbakır + 16 PCR sonuçları PCR sonuçlarına göre 22 havuz suyu örneğinden 16 tanesi kullanılan spesifik siyanobakteri primerleri ile pozitif sonuç vermiştir. Amplifikasyon gerçekleşmeyen örneklerin mikroskobik sonuçları incelendiğinde bu örneklerde siyanobakteri sayılarının çok düşük olduğu gözlenmiştir.

DGGE ve Dizi Analizi Sonuçları Bant No A B C D Organizma İsmi Uncultered Cyanobacterium clone Uncultured Cyanobacterium clone Uncultured bacterium

14 DGGE ve Dizi Analizi Sonuçları Bant No A B C D Organizma İsmi Uncultered Cyanobacterium clone Uncultured Cyanobacterium clone Uncultured bacterium clone Uncultured bacterium clone GenBank % Benzerlik Oranı / Eşleşen Aksesyon Numarası %97 / KC %95 / AB %94 / JF %100 / KU

15 Filogenetik Analizler

16 Sonuç Yapılan çalışma sonucu, 16 havuz suyu örneğinin hepsinde ortak olarak tek hücreli siyanobakterilerin bulunduğu hem mikroskobik hemde kültür bağımsız moleküler yöntemlerle belirlenmiştir. Belirlenen ortak türlerin Türkiye nin coğrafik konumu kaynaklı en yaygın tür olabileceği düşünülmektedir.

17 Öneri Tek hücreli siyanobakteri olan Microcystis aeruginosa gibi patojenik türlerin varlığı, Alg toksinlerinin bireylerde farklı tepkilere yol açabildiği ve, Mevcut yönetmeliğin ülkemiz şartlarına göre oluşturulmadığı düşünüldüğünde; Tek hücreli bir siyanobakteri türünün de mevcut test organizması sınıfına dahil edilebileceği yapılan çalışma sonuçlarıyla önerilmektedir.

18 Dinlediğiniz İçin Teşekkürler Prof. Dr. Güven ÖZDEMİR Prof. Dr. Ataç UZEL Yrd. Doç. Dr. İnci Tüney KIZILKAYA Araş. Gör. Burçin KARABEY

19 Kaynaklar Boutte C., Grubisic S., Balthasart P., Wilmotte A Testing of primers for the study of cyanobacterial molecular diversity by DGGE. Journal of Microbiological Methods 65: Deren Kimya- Yüzme Havuzu Sanitasyonu Adamson R. P. and Sommerfeld M. R., Laboratory Comparison of the Effectiveness of Several Algicides on Isolated Swimming Pool Algae, Applıed And Envıronmental Mıcrobıology, 39:2, p

Benzer belgeler

TÜBİTAK BİDEB LİSE ÖĞRETMENLERİ FİZİK, KİMYA, BİYOLOJİ, MATEMATİK- PROJE DANIŞMANLIĞI EĞİTİMİ ÇALIŞTAYI LİSE3 (Çalıştay 2013) BİYOLOJİ GRUP TUHAF

TÜBİTAK BİDEB LİSE ÖĞRETMENLERİ FİZİK, KİMYA, BİYOLOJİ, MATEMATİK- PROJE DANIŞMANLIĞI EĞİTİMİ ÇALIŞTAYI LİSE3 (Çalıştay 2013) BİYOLOJİ GRUP TUHAF PROJE ÖNERİSİ ADI TUHAF MATERYALLERDEN İZOLE EDİLEN DNA