Geliş Tarihi (Received): Kabul Ediliş Tarihi (Accepted):

Benzer belgeler
Sitomegalovirüs Hastalığında Antijenemi Testi ile Kantitatif DNA Testinin Karşılaştırılması

VİRUS HASTALIKLARINDA TANI YÖNTEMLERİ

J Popul Ther Clin Pharmacol 8:e257-e260;2011

Steril pyrüili böbrek nakli hastalarında gerçek zamanlı multipleks polimeraz zincir reaksiyon test sonuçları

TÜBERKÜLOZUN MOLEKÜLER TANISINDA GÜNCEL DURUM

ALT SOLUNUM YOLU ENFEKSİYONU OLAN ÇOCUKLARDA SOLUNUM SİNSİTYAL VİRUS VARLIĞININ ÜÇ FARKLI YÖNTEMLE ARAŞTIRILMASI

IV. KLİMUD Kongresi, Kasım 2017, Antalya

Konjenital CMV Enfeksiyonu: Türkiye deki Durum

Serum ALT Düzeyleri, HCV RNA Ve Anti-HCV Arasındaki İlişki #

Mikrobiyolojide Moleküler Tanı Yöntemleri. Dr.Tuncer ÖZEKİNCİ Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji A.D

KÖK HÜCRE TRANSPLANTASYONU YAPILAN HASTALARDA KOMPLİKASYONLAR: VİRAL ENFEKSİYONLAR Cytomegalovirus (CMV)


TLERDE SEROLOJİK/MOLEK HANGİ İNCELEME?) SAPTANMASI

Ekinokokkozis. E. granulosus Kistik Ekinokokkozis. E. multilocularis Alveoler Ekinokokkozis. E. vogeli ve E. oligoarthrus Polikistik Ekinokokkozis

Olgu Sunumu (İmmünyetmezlikli hastada viral enfeksiyonlar) Dr. A. Arzu Sayıner Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD

HPV Moleküler Tanısında Güncel Durum. DNA bazlı Testler KORAY ERGÜNAY 1.ULUSAL KLİNİK MİKROBİYOLOJİ KONGRESİ

GİRİŞ. Kan dolaşımı enfeksiyonları (KDE) önemli morbidite ve mortalite sebebi. ABD de yılda KDE, mortalite % 35-60

Klinik Mikrobiyoloji de Enzimli İmmün Deney Enzyme Immuno Assay. Dr. Dilek Çolak

CMV lab.tanı Hangi test, ne zaman, laboratuvar sonucunun klinik anlamı?

Hepatit C Virüsü: Tanıda Serolojik ve Moleküler Yöntemlerin Yeri. Üner Kayabaş İnönü Üniversitesi Tıp Fakültesi Malatya

EPSTEIN-BARR VİRUS ENFEKSİYONLARI TANISINDA ELISA VE İMMUNOBLOT TESTLERİNİN KARŞILAŞTIRILMASI

TOKSOPLAZMA İNFEKSİYONUNUN LABORATUVAR TANISI UZM.DR.CENGİZ UZUN ALMAN HASTANESİ

Hepatit B Virus (HBV) İnfeksiyonunda Serolojik Belirteçler, Transaminaz Düzeyleri Ve HBV DNA nın Birlikte Değerlendirilmesi #

Anti-HIV Pozitif Bulunan Hastada Kesin Tanı Algoritması. Doç. Dr. Kenan Midilli İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

Sitomegalovirüs İnfeksiyonlarında Tanı Yöntemleri

CMV Moleküler Tanısı. Prof. Dr. Dilek Çolak Akdeniz Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD Tıbbi Viroloji BD

KISA BİLDİRİ: BRUSELLOZUN TANISINDA BRUCELLACAPT TESTİNİN DEĞERİNİN ARAŞTIRILMASI

Nilgün Çerikçioğlu Marmara Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

Kırım Kongo Kanamalı Ateş hastalarında ağırlık ve ölüm riskinin tahmininde plazma cell-free DNA düzeyinin önemi

NAT Yöntem onayı. Dr. A. Arzu Sayıner Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD

Yrd. Doç. Dr. Koray Ergünay MD PhD Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD. Viroloji Ünitesi

NEVŞEHİR İLİNDE HEPATİT C VİRÜS GENOTİP DAĞILIMI İLE SERUM ALANİN AMİNOTRANSFERAZ VE KANTİTATİF SERUM HCV RNA DÜZEYLERİ İLİŞKİSİ*

KLİNİK ÖRNEKLERDE GERÇEK ZAMANLI MULTİPLEKS POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU YÖNTEMİYLE AKUT BAKTERİYEL MENENJİT TANISI

HIV TANISINDA YENİLİKLER

Human Papillomavirüs DNA Pozitif ve E6/E7 mrna Negatif, Anormal Sitolojili Servikal Örneklerin Genotiplendirilmesi

Enzimlerinin Saptanmasında

Doğrudan klinik örnekte hızlı tanı. Prof. Dr. Cengiz ÇAVUŞOĞLU Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD, Bornova, İZMİR

HIV İLE ENFEKTE OLMUŞ HASTALARDA M41L DİRENÇ MUTASYONUNUN REAL- TİME POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU İLE SAPTANMASI

Gebelikte İnfeksiyonların Değerlendirilmesi

KENE KAYNAKLI ENSEFALİTLERDE LABORATUVAR TANI

KLİNİK ÖRNEKLERDEN KANTİTATİF OLARAK HEPATİT C VİRUS RNA SININ SAPTANMASINDA COBAS AMPLICOR VE COBAS TAQMAN SİSTEMLERİNİN KARŞILAŞTIRILMASI

HIV/AIDS ve Diğer Retrovirus İnfeksiyonları,laboratuvar tanısı ve epidemiyolojisi

HIV: ALGORİTMALAR VE DİRENÇ: HIV Anti-Retro Viral Direnç: Ülkemizdeki Son Durum

Moleküler Testlerde Yöntem Geçerliliğinin Sınanması. Dr. Arzu Sayıner Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD

VİRAL TANI KİTLERİ (GFJ-480)

IV. KLİMUD Kongresi, Kasım 2017, Antalya

Özet. Abstract. Erciyes Tıp Dergisi (Erciyes Medical Journal) 27 (1) 17-21,

Servikal Erozyon Bulgusu Olan Kadınlarda HPV nin Araştırılması ve Genotiplerinin Belirlenmesi

Hepatit C Virusu (HCV) RNA Pozitif Olgularda Genotip Dağılımı

İmmünyetmezlikli Konakta Viral Enfeksiyonlar

Klinik Mikrobiyoloji Laboratuarında Validasyon ve Verifikasyon Kursu 12 Kasım 2011 Cumartesi Salon C (BUNIN SALONU) Kursun Amacı:

Hematolojik hastalar - CMV

IMMUN FLORESAN TESTİ

Kan Hizmetleri Genel Müdürlüğü

Hepatit B virus kantitasyonunda iki farklı gerçek zamanlı PCR testinin karşılaştırılması: COBAS AmpliPrep/COBAS TaqMan ve ARTHUS QS-RGQ KİT

ve KARŞILAŞILAN SORUNLAR

İnfluenza A (H1N1) pdm09 Tanısında Hızlı Antijen Testi ile RT-PCR Testinin Karşılaştırılması

Sitomegalovirusun neden olduğu enfeksiyonlarda tanısal yaklaşımlar ve sorunlar

Moleküler Test Sonuçlarında Klinisyen Farkındalığı. Dr. Dilek Çolak Dr. Ayşın Zeytinoğlu

CMV infeksiyonu tedavi yaklaşımları. Dr. Kemalettin ÖZDEN

Tüberkülozun Mikrobiyolojik Tanısı. Süheyla SÜRÜCÜOĞLU

Dr. Funda Şimşek SB Okmeydanı EAH Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji

BÖBREK NAKLİ SONRASINDA CMV HASTALIĞI. Dr. Ali Çelik Dokuz Eylül Üniversitesi Nefroloji Bilim Dalı

HIV ENFEKSİYONUNUN İMMÜNOLOJİ LABORATUARINDA TAKİBİ

İSTANBUL MEDENİYET ÜNİVERSİTESİ TIP FAKÜLTESİ TIBBİ MİKROBİYOLOJİ ANABİLİM DALI MEZUNİYET SONRASI (UZMANLIK) EĞİTİMİ DERS MÜFREDATI

ERCİYES ÜNİVERSİTESİ DENEYİMİ

İZMİR DEKİ GEBELERDE RUBELLA VE SİTOMEGALOVİRÜS İNFEKSİYONU SEROPREVALANSI RUBELLA AND CYTOMEGALOVIRUS INFECTION IN PREGNANTS IN IZMIR, TURKEY

Laboratuvarda Tularemi Örnekleriyle Çalışma Rehberi

Mardin Ýlinde Elektif Cerrahi Öncesi Tetkik Edilen Çocuklarda HBV, HCV ve HIV Seroprevalansý

KISA BİLDİRİ: HEPATİT D VİRUS (HDV) RNA POZİTİFLİĞİ İLE HDV ANTİKORLARI ARASINDAKİ İLİŞKİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ

Doç. Dr. Kenan MİDİLLİ İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

BAŞKENT ÜNİVERSİTESİ ÇOCUK NEFROLOJİ 9.ULUSAL ÇOCUK NEFROLOJİ KONGRESİ KASIM, 2016

Prediktör Testler ve Sıradışı Serolojik Profiller. Dr. Dilara İnan Isparta

PEDİATRİK KÖK HÜCRE TRANSPLANTASYON HASTALARINDA CMV SPESİFİK HÜCRESEL İMMÜN YANITIN İZLENMESİ

Klinik Araştırma ÖZET

Yöntem ve Test Seçimine Yaklaşım. Dr. Alpay Özbek Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji AD. Dokuz Eylül Üni. Tıp Fak. İZMİR

SERVİKAL ÖRNEKLERDE HPV DNA ve SİTOLOJİK İNCELEME SONUÇLARININ DEĞERLENDİRİLMESİ

Hepatit B de atipik serolojik profiller HBeAg-antiHBe pozitifliği. Dr. H. Şener Barut Gaziosmanpaşa Üniversitesi Enfeksiyon Hastalıkları ve KM AD

IL28B genotip tayini kronik hepatit B hastalarında oral antiviral tedavi cevabını öngörmede kullanılabilir mi?

Cumhuriyet Üniversitesi Tıp Fakültesi Araştırma ve Uygulama Hastanesinin Beş Yıllık ( ) Kansere Bağlı Ölüm Kayıtlarının Değerlendirilmesi

Cytomegalovirus Enfeksiyonunun Laboratuvar Tanısı Dr. Meltem Yalınay Çırak

TANIMLAR. Dr. Neriman AYDIN. Adnan Menderes Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

Sağlık Bilimleri Üniversitesi Tepecik Eğitim ve Araştırma Hastanesi Çocuk Hematoloji ve Onkoloji Kliniği

KIRIKKALE İLİNDE DEVLET HASTANESİ VE KIRIKKALE ÜNİVERSİTESİ TIP FAKÜLTESİ HASTANESİ POLİKLİNİKLERİNE BAŞVURANLARDA HEPATİT B SEROPREVALANSI

Yüksek Risk Altındaki Hastaların Klinik Örneklerinde BK ve JC Virus DNA Pozitifliğinin Gerçek Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile Araştırılması*

KISA BİLDİRİ: SALT ANTİ-HBc POZİTİF ÖRNEKLERDE OTOANTİKOR, ANTİ-HCV VE ANTİ-HIV SEROPOZİTİFLİĞİNİN ARAŞTIRILMASI*

Emrah Salman, Zeynep Ceren Karahan Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi. Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

OXA-48 in Saptanmasına Yönelik İzotermal Rekombinaz Polimeraz Amplifikasyon Yöntemine Dayalı Bir Hızlı Moleküler Test Formatının Geliştirilmesi

WEİL-FELİX TESTİ NEDİR NASIL YAPILIR? Weil Felix testi Riketsiyozların tanısında kullanılır.

Kış Sezonunda Görülen İnfluenza Virüsü Tipleri ve Tedavide Oseltamivir in Etkinliği

Cytomegalovirus Enfeksiyonları. Prof. Dr. Dilek Çolak Akdeniz Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD Tıbbi Viroloji Bilim Dalı

Çok ilaca dirençli Mycobacterium tuberculosis izolatlarının hızlı tespitinde nitrat redüktaz testinin değerlendirilmesi: Çok merkezli bir çalışma

Kronik Hepatit B li Hastalarda Oral Antiviral Tedavilerin Değerlendirilmesi

Klinik Virolojide Moleküler Yöntemlerin Kullanımı

Alıcı ve Vericinin Böbrek Transplantasyonuna Hazırlanması. Prof. Dr. Yaşar BAYINDIR BUHASDER-2017

Viral gastroenteritler

İlaç direnci saptanmasında yeni yöntemler. Prof. Dr. Cengiz ÇAVUŞOĞLU Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD, Bornova, İZMİR

Yasemin Budama Kılınç1, Rabia Çakır Koç1, Sevim Meşe2, Selim Badur2,3

Akut ve Kronik Hepatit B Aktivasyonunun Ayrımı. Dr. Murat Kutlu Pamukkale Üniversitesi Tıp Fakültesi

Gebelerde Toxoplasma gondii Seropozitifliğinin Değerlendirilmesinde İstenen Testlerin Önerilen Tanı Algoritmasına Uygunluğunun Değerlendirilmesi

Transkript:

Özgün Çalışma/Original Article Mikrobiyol Bul 2011; 45(2): 288-295 Riskli Hastaların Periferal Kan Örneklerinde Sitomegalovirus Varlığının Shell Vial Hücre Kültürü, Antijenemi Testi ve Gerçek Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile Araştırılması Investigation of Cytomegalovirus Positivity in the Peripheral Blood Samples of Risky Patients by Shell-Vial Cell Culture, Antigenemia Test and Real-Time Polymerase Chain Reaction Selma GÖKAHMETOĞLU 1, Gülhan YAĞMUR 2, Fatma MUTLU SARIGÜZEL 3, Esma DENİZ 4 1 Erciyes Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Kayseri. 1 Erciyes University Faculty of Medicine, Department of Medical Microbiology, Kayseri, Turkey. 2 Kayseri Kadın Doğum ve Çocuk Hastalıkları Hastanesi, Kayseri. 2 Kayseri Gynecology, Obstetric and Pediatric Diseases Hospital, Kayseri, Turkey 3 Kayseri Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Kayseri. 3 Kayseri Training and Research Hospital, Kayseri, Turkey. 4 Nuh Naci Yazgan Göğüs Hastalıkları Hastanesi, Kayseri. 4 Nuh Naci Yazgan Chest Diseases Hospital, Kayseri, Turkey. Geliş Tarihi (Received): 07.09.2010 Kabul Ediliş Tarihi (Accepted): 10.01.2011 ÖZET Sitomegalovirus (CMV), immün sistemi normal kişilerde genellikle belirtisiz enfeksiyonlara yol açarken, konjenital enfeksiyonu olan yenidoğanlarda ve immün sistemi baskılanmış hastalarda ciddi morbidite ve mortalite nedeni olmaktadır. CMV enfeksiyonlarının laboratuvar tanısında, hücre kültüründe izolasyon, pp65 antijenemi testi, serolojik ve moleküler yöntemler uygulanmaktadır. Bu çalışmada, CMV hastalığı için risk grubunda olan hastalardan alınan kan örneklerinde antijenemi testi, shell vial hücre kültürü ve gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR) yöntemleriyle CMV varlığının araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmaya, CMV hastalığı ön tanısıyla viroloji laboratuvarımıza gönderilen 91 hastaya (33 kadın, 58 erkek) ait 141 periferal kan örneği dahil edilmiştir. Hastaların beşi yenidoğan olup, erişkin hastaların (yaş aralığı 17-79 yıl) 81 i kemik iliği, dördü böbrek, biri karaciğer transplant alıcısıdır. Örneklerden CMV izolasyonu için shell vial hücre kültürü yöntemi (Vircell, İspanya); kan lökositlerinde pp65 antijen varlığının tespiti için indirekt immünfloresans yöntemi (CINAkit Argene, Biosoft, Fransa) ve plazma örneklerinde CMV DNA saptanması için RT-PCR (CMV QNP 2.0; Fluorion, İontek, Türkiye) yöntemi İletişim (Correspondence): Prof. Dr. Selma Gökahmetoğlu, Erciyes Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Kayseri, Türkiye. Tel (Phone): +90 533 353 3105, E-posta (E-mail): selmagk@gmail.com

Gökahmeto lu S, Ya mur G, Mutlu Sar güzel F, Deniz E. kullanılmıştır. Çalışmaya dahil edilen 141 örneğin 72 (%51) sinde shell vial hücre kültürü yöntemiyle, 82 (%58.2) sinde antijenemi testiyle, 49 (%34.8) unda ise RT-PCR ile pozitif sonuç alınmıştır. Hücre kültürü yöntemi altın standart kabul edildiğinde, antijenemi testinin duyarlılık ve özgüllüğü sırasıyla %81.9 ve %66.6; RT-PCR yönteminin duyarlılık ve özgüllüğü ise sırasıyla %43 ve %73.9 olarak bulunmuştur. Hücre kültürü ve antijenemi yöntemleriyle pozitif bulunduğu halde RT-PCR ile CMV DNA sı saptanamayan 15 olgudan rastgele seçilen üçüne ait örneklere DNA dizi analizi (ABI Prism 310 Genetic Analyzer; Perkin Elmer, ABD) uygulanmıştır. Dizi analizi sonuçlarına göre, bu üç örnekte CMV DNA nın pozitif olduğu, ancak CMV QNP 2.0 kitinde hedef alınan prob (gb) bölgesinde mutasyonların bulunduğu saptanmıştır. Sonuç olarak, CMV hastalığının hayati önem taşıdığı hastalarda, viremi ve viral yükün tespit edilmesi amacıyla antijenemi ve PCR yöntemlerinin kullanılabileceği; ancak CMV gb genini hedef alan PCR çalışmalarında beklenmeyen negatif sonuçlar elde edildiğinde mutasyon varlığının akılda tutulması ve gereğinde dizi analizi yapılmasının yararlı olacağı kanısına varılmıştır. Anahtar sözcükler: Sitomegalovirus; CMV; shell vial yöntemi; antijenemi testi; PCR; DNA dizi analizi. ABSTRACT Cytomegalovirus (CMV) infections in immunocompromised patients and congenital infections in infants have high morbidity and mortality while it may lead to asymptomatic infections in immunocompetent subjects. Serological tests, culture methods, antigenemia tests and molecular methods are applied in the diagnosis of CMV infection. The aim of this study was to investigate the presence of CMV in peripheral blood samples of patients who were at risk for CMV disease by shell vial cell culture, antigenemia test and real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) methods. A total of 141 blood specimens obtained from 91 patients (33 female, 58 male) with suspected CMV disease were included to the study. Five of the patients were newborns and the others aged between 17-79 years old were bone morrow (n= 81), kidney (n= 4) and liver (n= 1) transplantation patients. Shell vial (Vircell, Spain) cell culture method was applied for CMV isolation from the samples, while the detection of pp65 antigen in blood leukocytes was investigated by indirect immunofluorescence method (CINAkit Argene, Biosoft, France). The presence of CMV DNA in plasma samples was detected by RT-PCR (CMV QNP 2.0 kit; Fluorion, Iontek, Turkey) method. CMV was found positive in 72 (51%) of 141 samples by shell vial, 82 (58.2%) by antigenemia test and 49 (34.8%) by RT-PCR. Considering cell culture as the gold standard, the sensitivity and specificity of antigenemia test were calculated as 81.9% and 66.6%, respectively; and for PCR those rates were 43% and 73.9%, respectively. In addition DNA sequencing (ABI Prism 310 Genetic Analyzer; Perkin Elmer, USA) was performed for the samples of randomly selected three patients out of 15, who were yielded positive results with cell culture and antigenemia tests but negative CMV DNA by RT-PCR. In this analysis CMV DNA was found positive in three of the samples that were found negative by RT-PCR in spite of CMV isolation and positive antigenemia. DNA sequencing of those samples revealed multiple mutations in the probe binding region (gb) of CMV QNP 2.0 kit. It was concluded that for the detection of CMV viremia and viral load in patients under risk for CMV disease, antigenemia and PCR based methods could be applied, however, negative results obtained by PCR targeting CMV gb gene, should remind the possible presence of mutations in the related site and the results should be confirmed by sequence analysis. Key words: Cytomegalovirus; CMV; shell vial method; antigenemia test; PCR; DNA sequencing. GİRİŞ Herpesviridae ailesinde sınıflandırılan sitomegalovirus (CMV), tüm dünyada yaygın olarak görülen ve genellikle asemptomatik enfeksiyonlara neden olan bir DNA virusudur. Buna kar- 289

Riskli Hastalar n Periferal Kan Örneklerinde Sitomegalovirus Varl n n Shell Vial Hücre Kültürü, Antijenemi Testi ve Gerçek Zamanl Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile Araflt r lmas şın CMV enfeksiyonları, gebe kadınlarda, intrauterin enfeksiyon sonrası yenidoğanlarda ve immün sistemi baskılanmış hastalarda (böbrek ve kemik iliği transplantasyonu yapılan, kanserli ve AIDS li hastalar) yüksek morbidite ve mortalite nedenidir 1. CMV enfeksiyonlarının tanısında; serolojik testler, kültür yöntemleri, antijenemi testi ve nükleik asit saptama yöntemleri kullanılmaktadır. Ancak immün sistemi baskılanmış hastalarda antikor yanıtının eksik ya da bozuk olması, serolojik yöntemlerin geçerliliğini sınırlandırmaktadır. Konvansiyonel hücre kültürü ile CMV nin izolasyonu ise zahmetli ve zaman alıcıdır. Buna karşın shell vial sistemi, kısa zamanda sonuç veren hızlı bir hücre kültürü yöntemidir. Vireminin ve viral yükün tespitinde en güvenilir yöntemlerin, kanda CMV pp65 antijenemi testi ve moleküler yöntemlerle CMV DNA saptanması olduğu bildirilmektedir 2. Son yıllarda yaygın uygulama alanı bulan gerçek zamanlı (real-time) polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR) yönteminin, CMV DNA nın araştırılmasında diğer moleküler yöntemlere kıyasla daha duyarlı olduğu da rapor edilmektedir 3,4. Bu çalışmada, CMV hastalığı için risk grubunda olan hastalardan alınan kan örneklerinde antijenemi testi, shell vial hücre kültürü ve RT-PCR yöntemleriyle CMV varlığının araştırılması amaçlanmıştır. GEREÇ ve YÖNTEM Hastalar ve Örnekler Çalışmaya, Erciyes Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Viroloji Laboratuvarına CMV hastalığı ön tanısıyla gönderilen 91 hastaya (33 kadın, 58 erkek) ait 141 kan örneği dahil edildi. Hastaların beşi yenidoğan olup, erişkin hastaların (yaş aralığı 17-79 yıl) 81 i kemik iliği, dördü böbrek, biri karaciğer transplant alıcısı idi. Transplantasyon yapılan hastalardan alınan örnekler transplantasyon sonrası 1-3 ay dönemine aitti. Antijenemi ve shell vial yöntemleri, kan örneklerinden elde edilen lökositlerde gerçekleştirilirken, CMV DNA plazma örneklerinde araştırıldı. CMV Antijenemi Testi Lökositlerde CMV ye özgül pp65 (matriks proteini) antijen varlığı, indirekt immünfloresan yöntemiyle (CiNAkit, Argene-Biosoft, Fransa) kit prosedürüne uygun olarak araştırıldı. Bu amaçla kan örnekleri eritrosit lizis ile işleme alındı ve elde edilen lökositler yaklaşık 2 x 10 5 hücre/spot olacak şekilde sitosantrifüj kullanılarak lama yapıştırıldı. Formaldehid fiksasyonu ve membran permeabilizasyonu uygulandıktan sonra hücreler anti-cmv pp65 monoklonal antikoru ile 30 dakika 37 C de inkübe edildi. Fosfat tamponu ile yıkama işleminden sonra floresan izotiyosiyonat ile işaretli anti-fare IgM + IgG F(ab ) 2 ile 30 dakika 37 C de inkübe edildi. Preparatlar x400 büyütme ile floresan mikroskobunda incelenerek parlak yeşil renkte nükleer olarak boyanmış polimorf çekirdekli lökositler sayıldı. Tüm alanda 1 yeşil floresan veren hücrelerin görüldüğü örnekler pozitif olarak değerlendirildi (Resim 1). CMV RT-PCR Bu amaçla, CMV glikoprotein B (gb) yi hedef alan CMV QNP 2.0 kiti (Fluorion, İontek, Türkiye) kullanıldı. Plazma örneklerinden DNA izolasyonu, QIAmp MinElute (Qi- 290

Gökahmeto lu S, Ya mur G, Mutlu Sar güzel F, Deniz E. A B Resim 1. (A) Shell vial hücre kültürü ve (B) CMV antijenemi testi ile alınan pozitif sonuçlar. agen, Almanya) kiti ile üreticinin önerilerine uygun olarak yapıldı. 15.25 µl amplifikasyon karışımına 0.25 µl internal kontrol eklendi ve karışım üzerine 10 µl DNA konuldu. Amplifikasyon işlemi Icycler (BIO-RAD, ABD) cihazında gerçekleştirildi. RT-PCR yönteminin dinamik aralığı 5 x 10 3-10 6 kopya/ml idi. Shell Vial Hücre Kültüründe İzolasyon CMV izolasyonu için kan örneklerindeki lökositler dekstranla ayrıştırıldı 5. Virus izolasyonu için lamellerde MRC-5 hücre kültürü üretilmiş olan shell vial tüpleri (Vircell, İspanya) kullanıldı. En fazla 15 gün saklanabilen shell vial ler, çalışma gününe kadar 37 C de muhafaza edildi. Ekim yapılacağı zaman shell vial deki idame besiyeri dökülerek önceden hazırlanmış hasta örneklerinden 200 µl eklendi ve 700 g de 45 dakika santrifüj edildi. 37 C de bir saat inkübasyondan sonra inokülum dökülerek, tüplere 1 ml %2 fetal sığır serumu içeren RPMI 1640 besiyerinden eklendi ve 24 saat süreyle 37 C de inkübe edildi. İnkübasyon sonunda tüplerdeki besiyeri döküldü ve metanol eklenerek 10 dakika tesbit işlemi yapıldı. Daha sonra tüplerin içindeki lameller çıkarılarak lama yapıştırıldı ve hücreler CMV ye özgül floresanla işaretli antikorlar kullanılarak immünfloresan yöntemle (Vircell, İspanya) test prosedürüne uygun olarak boyandı (Resim 1). DNA Dizi Analizi Antijenemi ve shell vial hücre kültürü yöntemleriyle pozitif sonuç alındığı halde CMV DNA sı negatif bulunan örneklerden üçüne, İstanbul da bulunan İontek Laboratuvarında ABI Prism 310 Genetic Analyzer cihazında (Perkin Elmer, ABD) DNA dizi analizi (hedef bölge: gb) yapıldı. BULGULAR Çalışmaya dahil edilen 141 örneğin 72 (%51) sinde shell vial hücre kültürü yöntemiyle, 82 (%58.2) sinde antijenemi testiyle, 49 (%34.8) unda ise RT-PCR ile pozitif sonuç alınmıştır (Tablo I). 291

Riskli Hastalar n Periferal Kan Örneklerinde Sitomegalovirus Varl n n Shell Vial Hücre Kültürü, Antijenemi Testi ve Gerçek Zamanl Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile Araflt r lmas Tablo I. Shell Vial Hücre Kültürü, CMV Antijenemi Testi ve RT-PCR Yöntemleri ile Elde Edilen Sonuçların Karşılaştırılması Hücre kültürü Hücre kültürü Pozitif Negatif Toplam Pozitif Negatif Toplam Antijenemi Pozitif 59 23 82 RT-PCR Pozitif 31 18 49 Negatif 13 46 59 Negatif 41 51 92 Toplam 72 69 141 Toplam 72 69 141 CMV: Sitomegalovirus, RT-PCR: Gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu. Shell vial hücre kültürü yöntemi altın standart kabul edilerek, antijenemi ve PCR yöntemlerinin duyarlılık ve özgüllüğü hesaplanmış; buna göre antijenemi testinin duyarlılığı %81.9, özgüllüğü %66.6; RT-PCR yönteminin duyarlılığı %43, özgüllüğü %73.9 olarak bulunmuştur. Çalışmada, her üç testin eş zamanlı pozitifliği, 27 hastadan elde edilen 28 örnekte; her üç testin aynı anda negatifliği ise 31 hastadan elde edilen 35 örnekte saptanmıştır. Tüm testler ile pozitif bulunan hastalardan birinin yenidoğan, diğerlerinin ise kemik iliği transplant alıcısı olduğu belirlenmiştir. Takipler esnasında test pozitifliklerinde değişmelerin olduğu gözlenmiştir. Hücre kültürü ve antijenemi testleri ile pozitif bulunan ancak CMV DNA sı negatif olan 20 hastadan beşinin test takipleri sırasında bir veya birkaç kez CMV DNA pozitifliğinin mevcut olduğu izlenmiştir. Buna karşın hücre kültürü ve antijenemi testi pozitif olduğu halde takipler esnasında RT-PCR ile hiçbir zaman pozitif sonuç vermeyen 15 hastanın rastgele seçilen üçüne ait örneklere CMV DNA dizi analizi uygulanmıştır. Dizi analizi sonuçlarına göre, bu üç örnekte CMV DNA nın pozitif olduğu, ancak CMV QNP 2.0 kitinde kullanılan prob (gb) bölgesinde mutasyonların bulunduğu saptanmıştır (Şekil 1). TARTIŞMA CMV hastalığı açısından risk altında olan hastalarda virusun erken dönemde saptanması, ölüm ve ciddi komplikasyonların önlenmesi ve etkili antiviral tedaviye başlanması için gereklidir 6-8. Bu amaçla en yaygın olarak kullanılan yöntemler CMV antijenemi testi, CMV PCR ve hızlı kültür yöntemleridir. Yapılan çalışmalarda, hastanın gansiklovir tedavisi aldığı durumlarda CMV nin kültürde üretilememesine rağmen antijenemi testi ile X17403 (81283) CCTCCTATGTGGGAGATTCATCACATC- AACAAGTTTGCTCAATGCTA- CAGTTCCTACAGCCGC 313...GCCACAG...G...T... 340...CACAG...G... 350...CCACAG...G... Şekil 1. CMV DNA dizi analizi uygulanan hasta örneklerinde (No: 313, 340, 350) gb bölgesinde saptanan mutasyonlar (Gen Bankası dizileri ile karşılaştırma sonunda elde edilmiştir). 292

Gökahmeto lu S, Ya mur G, Mutlu Sar güzel F, Deniz E. pozitif sonucun alınabildiği bildirilmektedir 9. Buna karşın vireminin düşük olduğu durumlarda da CMV antijenemi testi ile negatif sonuç alınırken, CMV DNA nın gösterildiği çalışmalar mevcuttur 10. Konjenital CMV enfeksiyonu olan yenidoğanlarda veya transplantasyondan sonra lökopenik olan olgularda CMV antijenemi testi negatif sonuç verebilir. Bu durumda CMV DNA nın PCR ile çalışılması önerilmektedir 11. Transplantasyon yapılan hastalarda CMV antijenemi ve CMV DNA testlerinin birlikte çalışıldığı birçok çalışma mevcuttur 4,12-16. Aitken ve arkadaşları 12, 52 renal transplant alıcısında hibrid yakalama (HC) testi, shell vial yöntemi ve PCR bazlı amplicor CMV monitor testi ile CMV yi araştırmışlardır. Aynı çalışmada, CMV hastalığı gelişen 14 hastanın hepsinde HC ve amplicor CMV monitor testi pozitif olarak bulunurken, shell vial yöntemiyle sadece 10 hastada pozitiflik bulunmuştur. Buna göre araştırmacılar, CMV hastalığının tespiti için amplicor CMV ve HC testlerinin, shell vial yöntemine üstün olduğunu ifade etmişlerdir 12. Transplantasyon yapılmış ve insan immünyetmezlik virüsü (HIV) ile enfekte kişilerin dahil edildiği başka bir çalışmada, CMV tespitinde HC yöntemi, antijenemi testi, shell vial ve konvansiyonel tüp kültürü yöntemi kullanılmış ve yöntemlerin duyarlılıkları sırasıyla %95, %94, %43 ve %46 olarak bulunmuştur 13. Alice ve arkadaşları 4 solid organ transplantasyonu yapılan hastaları içeren çalışmalarında, CMV nin saptanmasında antijenemi ve PCR yöntemleri arasında iyi bir korelasyon bulmuşlardır. Piiparinen ve arkadaşları 14 da, renal transplant alıcılarına ait 342 kan örneğinde CMV pozitiflik oranlarını, PCR ile %35, antijenemi testiyle %40 ve shell vial yöntemiyle %17 olarak belirlemişlerdir. Bu oranlar, kemik iliği transplant alıcılarına ait 415 kan örneği ile yapılan diğer bir çalışmada, RT-PCR için %22, antijenemi testiyle ise %9 olarak bildirilmektedir 15. Griscelli ve arkadaşları 16, 16 kemik iliği transplant alıcısından elde ettikleri 197 örnekte RT-PCR ve CMV antijenemi testi ile yaptıkları çalışmada, PCR pozitif buldukları örneklerin %51.5 (66/128) inde antijenemi testini negatif bulmuşlardır. Ülkemizde yapılan bir çalışmada, immünyetmezliği olan hastalarda antijenemi ve HC yöntemleriyle CMV araştırılmış ve 56 kan örneğinin 11 (%19.6) inde her iki testle pozitif sonuç bulunmuştur 17. Aynı çalışmada antijenemi testi pozitif olan dokuz kan örneğinde CMV DNA saptanamamıştır 17. Özkan ve arkadaşlarının 18 çalışmasında, toplam 13 örnekten dokuzunda antijenemi ve CMV DNA testleri uyumlu bulunmuş; dört örnekte ise antijenemi testinin negatif, CMV DNA testinin pozitif olduğu bildirilmiştir. Başka bir çalışmada ise, CMV hastalığı tanısı alan hastalarda antijenemi, lökosit DNA ve plazma DNA testi sonuçları arasında orta derecede korelasyon saptanmıştır 19. Sunulan bu çalışmada, 86 sı transplant alıcısı, beşi yenidoğan olmak üzere 91 hastaya ait toplam 141 örneğin %58.2 sinde CMV pp65 antijenemi testi, %51 inde shell vial hücre kültürü ve %34.8 inde CMV RT-PCR yöntemi ile pozitif sonuç alınmıştır (Tablo I). Hücre kültürü yöntemi referans olarak alındığında; antijenemi testinin duyarlılık ve özgüllüğü sırasıyla %81.9 ve %66.6, RT-PCR yönteminin duyarlılık ve özgüllüğü ise sırasıyla %43 ve %73.9 olarak saptanmıştır. Bu sonuçlar irdelendiğinde, antijenemi ve hücre kültürü yöntemlerinin sonuçları diğer çalışmalarla uyumlu bulunmuş; ancak hedef bölgesi gb olan RT-PCR yönteminin duyarlılığının oldukça düşük olduğu gözlenmiştir. Bu 293

Riskli Hastalar n Periferal Kan Örneklerinde Sitomegalovirus Varl n n Shell Vial Hücre Kültürü, Antijenemi Testi ve Gerçek Zamanl Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile Araflt r lmas durumun, klinik CMV suşlarının gb bölgesindeki olası mutasyonlardan kaynaklanabileceği düşünülmüş ve bunu araştırmak amacıyla, antijenemi ve kültür yöntemleriyle pozitif bulunan ancak CMV DNA sı negatif olan 15 örneğin -ekonomik olanaksızlıklar nedeniyle- üçüne DNA dizi analizi uygulanmıştır. Dizi analizi sonucunda örneklerin hepsinde, RT- PCR kitinde kullanılan prob bağlanma bölgesinde mutasyon olduğu belirlenmiştir (Şekil 1). Nitekim bazı çalışmalarda, gb bölgesini hedef alan PCR kitleri ile CMV DNA saptanmasında, prob bağlanma bölgesindeki mutasyonlara bağlı olarak yalancı negatif sonuçlar alınabileceği vurgulanmaktadır 20,21. Nye ve arkadaşları 21, CMV gb geninin hedef bölge olduğu RT-PCR kiti ile yaptıkları çalışmada, viral genomun prob bağlanma bölgesinde mutasyon varlığını saptamışlar ve bu durumun yöntem için bir komplikasyon yaratacağını belirtmişlerdir. Sonuç olarak çalışmamızda, CMV hastalığının büyük öneme sahip olduğu hasta gruplarında, viremi ve viral yükün tespit edilmesi amacıyla antijenemi ve PCR yöntemlerinin kullanılabileceği; ancak CMV gb genini hedef alan PCR çalışmalarında beklenmeyen negatif sonuçlar elde edildiğinde mutasyon varlığının akılda tutulması ve gereğinde dizi analizi yapılmasının yararlı olacağı kanısına varılmıştır. KAYNAKLAR 1. Crumpacker CS, Wadhwa S. Cytomegalovirus, pp: 1787-89. In: Mandell GL, Bennett JE, Dolin R (eds), Mandell, Douglas and Bennett s Principles and Practice of Infectious Diseases. 2005, 6 th ed. Churcill Livingstone, Philadelphia. 2. Hodinka RL. Human cytomegalovirus, pp: 1549-63. In: Murray PR, Baron EJ, Pfaller MA, Tenover FC, Yolken RH (eds), Manual of Clinical Microbiology. 2007, ASM Press, Washington DC. 3. Piiparinen H, Höckerstedt K, Grönhagen-Riska C, Lautenschlager I. Comparison of two quantitative CMV PCR tests, Cobas Amplicor CMV Monitor and Taqman assay, and pp65-antigenemia assay in the determination of viral loads from peripheral blood of organ transplant patients. J Clin Virol 2004; 30(3): 258-66. 4. Alice T, Enrietto M, Pittaluga F, et al. Quantitation of cytomegalovirus DNA by real-time polymerase chain reaction in peripheral blood specimens of patients with solid organ transplants: comparison with end-point PCR and pp65 antigen test. J Med Virol 2006; 78(7): 915-22. 5. Reina J, Saurina J, Fernandez Baca V, Blanco I, Munar M. An increase in the number of polymorphonuclear leukocytes inoculated on shell-vial culture increases the sensitivity of this assay in detection of cytomegalovirus in the blood of immunocompromised patients. Diagn Microbiol Infect Dis 1998; 31(3): 425-8. 6. Britt WJ, Alford CA. Cytomegalovirus, pp: 2493-523. In: Fields BN, Knipe DM, Howley PM (eds), Fields Virology. 1996, 3 rd ed. Lippincott-Raven Publishers, Philadelphia. 7. Çolak D, Öğünç D. Sitomegalovirus infeksiyonlarında tanı yöntemleri. FLORA 1999; 4(2): 82-9. 8. Sayıner A. Cytomegalovirus infeksiyonu tanısında serolojik testler. I. Ulusal CMV Sempozyumu Tanı ve Tedavi Yaklaşımları: Sorunlar ve Çözümleri. 30 Kasım-02 Aralık 2001, Antalya. Sempozyum Kitabı, s: 33-9. 9. Niubo J, Perez JL, Martínez-Lacasa JT, et al. Association of quantitative cytomegalovirus antigenemia with symptomatic infection in solid organ transplant patients. Diagn Microbiol Infect Dis 1996; 24(1): 19-24. 10. Weinberg A, Hodges TN, Cai G, Zamoa MR. Comparison of PCR, antigenemia assay, and rapid blood culture for detection and prevention of cytomegalovirus disease after lung transplantation. J Clin Microbiol 2000; 38(2): 768-72. 11. Boeckh M, Boivin G. Quantitation of cytomegalovirus: methodologic aspects and clinical applications. Clin Microbiol Rev 1998; 11(3): 533-54. 294

Gökahmeto lu S, Ya mur G, Mutlu Sar güzel F, Deniz E. 12. Aitken C, Barrett-Muir W, Millar C, et al. Use of molecular assay in diagnosis and monitoring of cytomegalovirus disease following renal transplantation. J Clin Microbiol 1999; 37(9): 2804-7. 13. Mazzulli T, Drew LW, Yen-Lieberman B, et al. Multicenter comparison of the digene hybrid capture CMV DNA assay (version 2.0), the pp65 antigenemia assay, and cell culture for detection of cytomegalovirus viremia. J Clin Microbiol 1999; 37(4): 958-63. 14. Piiparinen H, Helantera I, Lappalainen M, et al. Quantitative PCR in the diagnosis of CMV infection and in the monitoring of viral load during the antiviral treatment in renal transplant patients. J Med Virol 2005; 76(3): 367-72. 15. Ghaffari HS, Obeidi N, Dehghan M, Alimoghaddam K, Gharehbaghian A, Ghavamzadeh A. Monitoring of cytomegalovirus reactivation in bone marrow transplant recipients by real-time PCR. Pathol Oncol Res 2008; 14(4): 399-409. 16. Griscelli F, Barrois M, Chauvin S, et al. Quantification of human cytomegalovirus DNA in bone marrow transplant recipients by real-time PCR. J Clin Microbiol 2001; 39(12): 4362-9. 17. Çolak D, Öğünç D, Tuncer D, Mutlu G. CMV saptanmasında CMV antijenemi ve hybrid capture CMV DNA hibridizasyon testlerinin karşılaştırılması. 8. Türk Mikrobiyoloji ve İnfeksiyon Hastalıkları Kongresi. 6-10 Ekim 1997, Antalya. Kongre Kitabı, Poster no: D-35. 18. Özkan E, Önal D, Çiftçi S, Beşışık SK, Yılmaz G, Badur S. Cytomegalovirus pp65 antijenemi testi ile pozitiflik saptanan allogenik kök hücre nakilli hastalardaki sonuçların murex hybrid capture CMV DNA assay ile karşılaştırılması. 9. Türk Mikrobiyoloji ve İnfeksiyon Hastalıkları Kongresi. 3-8 Ekim 1999, Antalya. Kongre Kitabı, T 015. 19. Zeytinoğlu A, Erensoy S, Göksel S, Töz H, Yapar N, Bilgiç A. Sitomegalovirüs hastalığında antijenemi testi ile kantitatif DNA testinin karşılaştırılması. FLORA 2002; 7(4): 241-5. 20. Gökahmetoğlu S, Deniz E. Comparison of real-time, and qualitative polymerase chain reaction assays in detection of cytomegalovirus DNA in clinical specimens. Saudi Med J 2007; 28(11): 1658-61. 21. Nye MB, Leman AR, Meyer ME, Menegeus MA, Rothberg PG. Sequence diversity in the glycoprotein B gene complicates real-time PCR assays for detection and quantification of cytomegalovirus. J Clin Microbiol 2005; 43(10): 4968-71. 295