GLİKOJENOLİZİS Glikojen Yıkımı



Benzer belgeler
GLİKOJEN METABOLİZMASI

GLİKOJEN FOSFORİLAZ HAZIRLAYAN: HATİCE GÜLBENİZ ( ) Prof. Dr. Figen ERKOÇ GAZİ EĞİTİM FAKÜLTESİ GAZİ ÜNİVERSİTESİ

Homo- ve heteropolisakkaritler olarak iki grupta toplanırlar. Nişaşta ve selüloz gibi polisakkaritler, 10 ve daha fazla monosakkarit biriminden

III-Hayatın Oluşturan Kimyasal Birimler

Karbohidratlar. Karbohidratların sınıflandırılması. Monosakkaritler

Cuma materyallerinden. Le Châtelier İlkesi: Denge halindeki bir sisteme dış etki uygulandığı zaman, denge dış etkiyi şekilde davranır.

Enzimler Enzimler metabolizma reaksiyonlarını hızlandıran moleküllerdir. Katalitik RNA moleküllerinin küçük bir grubu hariç, bütün enzimler

Solunumda organik bileşikler karbondioksite yükseltgenir ve absorbe edilen oksijen ise suya indirgenir.

GLİKOLİZİN KONTROLU Prof. Dr. İzzet Hamdi Öğüş

POLİMER KİMYASI -13. Prof. Dr. Saadet K. Pabuccuoğlu

Karbohidratlar. Yrd.Doç.Dr. Ahmet GENÇ Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu

Karbohidratlar Karbonhidratlar. Sınıflandırılması q. Sınıflandırılması. q Karbohidratlar, insan diyetinin en önemli kısmını oluştururlar

Güz Yarı Dönemi

İ. Ü İstanbul Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı Prof. Dr. Filiz Aydın

Organik Bileşikler. Karbonhidratlar. Organik Bileşikler YGS Biyoloji 1

Hücre Solunumu: Kimyasal Enerji Eldesi

BİY 315 BİYOKİMYA GİRİŞ. Yrd. Doç. Dr. Ebru SAATÇİ Güz Yarı Dönemi

Biochemistry Chapter 4: Biomolecules. Hikmet Geçkil, Professor Department of Molecular Biology and Genetics Inonu University

Organik bileşikler; karbonhidratlar, lipidler, proteinler, vitaminler ve nükleik asitler olmak üzere beş gruba ayrılır.

Organik Bileşiklerin Sınıflandırılması - Alkanlar. Prof. Dr. Arif ALTINTAŞ

Metabolizma. Metabolizmaya giriş. Metabolizmaya giriş. Metabolizmayı tanımlayacak olursak

BİYOKİMYADA METABOLİK YOLLAR DERSİ VİZE SINAV SORULARI ( ) (Toplam 4 sayfa olup 25 soru içerir) (DERSİN KODU: 217)

Monosakkaridler organizmadaki metabolik reaksiyonlara tek başlarına giremezler. Bu nedenle evvela aktifleşmeleri gerekir. Monosakkaridlerin aktif

6. glikolizde enerji kazanım hesaplamalarında; Substrat düzeyinde -ATP üretimi yaklaşık yüzde kaç hesaplanır? a. % 0 b. % 2 c. % 10 d. % 38 e.

Canlının yapısında bulunan organik molekül grupları; o Karbonhidratlar o Yağlar o Proteinler o Enzimler o Vitaminler o Nükleik asitler ve o ATP

6. BÖLÜM MİKROBİYAL METABOLİZMA

Bitkide Fosfor. Aktif alım açısından bitki tür ve çeşitleri arasında farklılıklar vardır

ÜNİTE3. Karbonhidratlar. Amaçlar. İçindekiler

Yağ Asitlerinin Metabolizması- I Yağ Asitlerinin Yıkılması (Oksidasyonu)

2. Kanun- Enerji dönüşümü sırasında bir miktar kullanılabilir kullanılamayan enerji ısı olarak kaybolur.

11. SINIF KONU ANLATIMI 2 ATP-2

BĠYOKĠMYA DOÇ. DR. MEHMET KARACA

(Anaplerotik Reaksiyonlar)

REAKSİYON KİNETİĞİ, REAKSİYONLARLA İLGİLİ TEMEL KAVRAMLAR VE METABOLİZMA. Doç.Dr. Mustafa ALTINIŞIK ADÜTF Biyokimya AD 2004

YAZILIYA HAZIRLIK SORULARI. 9. Sınıf 2 KARBONHİDRAT LİPİT (YAĞ)

Besin Zinciri, Besin Ağı ve Besin Piramidi

Kolesterol Metabolizması. Prof. Dr. Fidancı

ENZİM KATALİZİNİN MEKANİZMALARI

Canlılardaki Organik Bileşikler

BİYOMOLEKÜLLER. Dr. Fatih Büyükserin

Canlı hücrelerin bilinen kimyasal yapı taşları

Genetik Bilgi: DNA Yapısı, Fonksiyonu ve Replikasyonu. Dr. Mahmut Çerkez Ergören

Karbohidratların Sindirimi

BİTKİ FİZYOLOJİSİ. 2. Hafta

Yağ Asitlerinin β Oksidayonu. Prof. Dr. Fidancı

YAZILIYA HAZIRLIK SORULARI. 9. Sınıf

FİZYOLOJİ BİLİMİNE GİRİŞ

GENEL ÖZELLİKLERİ: Tüm canlılarda sudan sonra en fazla bulunan moleküllerdir. Canlının kuru ağırlığının %50 si proteindir. Oldukça büyük ve kompleks

HÜCRE SOLUNUMU: KİMYASAL ENERJİ ELDESİ

ATP ve NADPH. Pentoz Fosfat Yolu

Kolesterol Metabolizması. Yrd. Doç. Dr. Bekir Engin Eser Zirve Üniversitesi EBN Tıp Fakültesi Tıbbi Biyokimya A.B.D.

EGZERSİZDE VE SONRASINDA ATP - CP

ORGANİK BİLEŞİKLER Karbon Dünyası

3.1. Karbonhidratların Tanımı 3.2. Karbonhidratların Sınıflandırılması 3.3. Monosakkaritler ve Monosakkarit Türevleri Monosakkaritler

15- RADYASYONUN NÜKLEİK ASİTLER VE PROTEİNLERE ETKİLERİ

00220 Gıda Biyokimyası

BİY 315 KarbohidratlarınMetabolizması -II. Yrd. Doç. Dr. Ebru SAATÇİ Güz Yarı Dönemi

OKSİJENLİ SOLUNUM

Karbohidratların Sindirimi

LİPİTLERİN ORGANİZMADAKİ GÖREVLERİ SAFRA ASİTLERİ

Hücrelerde gerçekleşen yapım, yıkım ve dönüşüm olaylarının bütününe metabolizma denir.

LYS BÝYOLOJÝ. Biyolojiye Giriþ ve Bilimsel Yöntem Canlýlarýn Temel Bileþenleri Enzimler Canlýlarýn Sýnýflandýrýlmasý

Serbest radikallerin etkileri ve oluşum mekanizmaları

ENZİMLERİN GENEL ÖZELLİKLERİ - II. Doç Dr. Nurzen SEZGİN

İstanbul Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji ABD Prof. Dr. Filiz Aydın

METABOLİK DEĞİŞİKLİKLER VE FİZİKSEL PERFORMANS

TEST 1. Hücre Solunumu. 4. Aşağıda verilen moleküllerden hangisi oksijenli solunumda substrat olarak kullanılamaz? A) Glikoz B) Mineral C) Yağ asidi

YAZILIYA HAZIRLIK SORULARI. 11. Sınıf 1 CANLILARDA ENERJİ DÖNÜŞÜMLERİ

HORMONLAR VE ETKİ MEKANİZMALARI

SOMATOMEDİN C. Klinik Laboratuvar Testleri

KARBON ve CANLILARDAKİ MOLEKÜL ÇEŞİTLİLİĞİ

ayxmaz/biyoloji Adı: 1.Aşağıda verilen atomların bağ yapma sayılarını (H) ekleyerek gösterin. C N O H

7. Sınıf Maddenin Tanecikli Yapısı ve Çözünme Kazanım Kontrol Sınavı

KARBOHİDRATLAR. Yrd. Doç. Dr. Osman İBİŞ

METABOL ZMA. Metabolizmanın amacı nedir?

Atomlar ve Moleküller

VE GIDALARDA KULLANIM POTANSİYELLER YELLERİ. ÜSTÜN, Sadettin TURHAN

MERKEZ LABORATUVAR. Moleküler Biyoloji Deneylerinde Sıklıkla Kullanılan Bazı Aletlerin Tanıtımı

Enzimlerin Yapısı. Enzimler biyokatalizörlerdir,

Karbonhidrat Nedir? Bitkiler klorofil, güneş enerjisi, su ve karbondioksiti kullanarak karbonhidratları sentezlerler.

HÜCRE MEMBRANLARINDAN TAŞINMA

Hücreler, kimyasal yasaların geçerli olduğu kimyasal fabrikalar olarak da kabul edilmektedir.

Enzimler ENZİMLER ENZİMLER ENZİMLER İSİMLENDİRME ENZİMLER

HÜCRE ZARINDA TAŞINIM

KARBOHĐDRATLAR VE KARBOHĐDRATLARI TANIMA DENEYLERĐ

Canlılarda Enerjitik Olaylar, Fotosentez ve Kemosentez, Aerobik Solunum ve Fermantasyon

Serbest radikal. yörüngelerinde) eşleşmemiş tek. gösteren, nötr ya da iyonize tüm atom veya moleküllere denir.

DENEY 8 KARBONHĐDRAT REAKSĐYONLARI. Genel Bilgiler

SPOR FİZYOLOJİSİ I. KADEME. Doç.Dr.Mitat KOZ Ankara Üniversitesi Beden Eğitimi ve Spor Yüksekokulu

Hakkari Üniversitesi, Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksek Okulu, HAKKARİ * Bu çalışma Yüzüncü Yıl Üniversitesi Bilimsel Araştırma Proje Başkanlığı

NATURAZYME Naturazyme enzim grubu karbohidrazlar, proteaz ve fitaz enzimlerini içerir.

MBG114-BİYOLOJİ LABORATUVARI II Laboratuvar 9 Konu 4 DOKULAR (Devam)

BAŞLAR DESTEK VE HAREKET SİSTEMİ

Prof.Dr.Gül ÖZYILMAZ

METABOLİZMA. Prof. Dr. Arif ALTINTAŞ

HİDROKARBONLAR ve ALKİNLER. Kimya Ders Notu

9.Sınıf Biyoloji. Yaşam Bilimi Biyoloji. cevap anahtarı

MALZEME BİLGİSİ. Atomların Yapısı

KAS DOKUSU. Prof.Dr. Ümit TÜRKOĞLU

Glukoz - 6 Fosfataz enzim eksikliğinde hangi glikojen depo hastalığı oluşur?

Transkript:

Hatırlatma GLİKOJENOLİZİS Glikojen Yıkımı Bir aldehit veya keton alkollerle 1:1 oranda sırasıyla hemiasetal ve hemiketal oluşturmak üzere reaksiyona girerler. Bu reaksiyon sonrasında karbonil karbonunda yeni bir kiral merkez oluşur. Yapıdaki ikinci alkolün değişimi ise bir asetal yada ketal oluşturur. İkinci alkol diğer bir şekere aitse, oluşan bağa glikozit bağı denir. Hatırlatma D-glukozun iki siklik formunun oluşumu. C-1 deki aldehit grup ve C-5 teki hidroksil grubu arasındaki reaksiyon iki stereoizomerli (α ve β anomer) hemiasetal verir (Hemiasetal karbon çevresindeki stereokimya değişir). α ve β anomerlerin birbirine dönüşümü mutarotasyon olarak bilinir. 1

Şekerler indirgen ajanlardır: Glukozun anomerik karbon atomunun oksidasyonu Fehling reaksiyonunun temelini oluşturur. Alkali koşullarda oluşan kuproz iyon (Cu+) kırmızı kuprozoksit olarak çöker. Hemiasetal (halka) formda, glukozun C-1 i Cu2+ ile okside olmaz. Ancak, halkanın açık formu (düz zincirli yapı) halka formu ile denge halindedir. Reaksiyon düz zincirli form üzerinden gider. Bir disakkarit iki monosakkaritten oluşur (burada iki D-glukoz molekülü). Burada sağdaki glukozun OH grubuyla soldaki glukoz molekülünün molekül içi hemiasetal grubunun bir su çıkışı reaksiyonu sonucu O-glikozidik bağ oluşur. Bu reaksiyonun tersi hidroliz olup, glikozidik bağa suyun attağı ile gerçekleşir. Maltoz molekülünde bir adet indirgen uç (hemiasetal) bulunur. Mutarotasyon α ve β anomerlerin birbirine dönüşümü olarak bilindiğinden sağ uçtaki anomerik karbona bağlı olan bağlar dalgalışekilde veya tam yapıyı ortaya koyacak şekilde isimlendirilir. Nişaşta ve glikojen moleküllerinin elektron mikroskobu görüntüleri. a)bir Kloroplast içerisindeki geniş nişaşta granülleri. Kloroplastlardaki nişaşta D-glukoz dan fotosentetik olarak üretilir. b)hepatositlerdeki glikojen granülleri. Bu granüller (~0.1 m) sitozolde oluşur ve nişaşta granüllerine kıyasla (~1.0 m) oldukça küçüktür. 2

Nişaşta, glukozun amiloz ve amilopektin olmak üzere iki değişik polimerine sahiptir. Amiloz, uzun dallanmamış glukoz ( 1 4) polimerinden oluşur. Bu tür zincirlerin molekül ağırlıkları birkaçbinden milyona kadar gider. Amilopektinde oldukça yüksek molekül ağırlığına sahiptir (100 milyona kadar). Ancak amilozdan farklı olarak yüksek derecede dallanma bulunmaktadır. Amilopektinde de amilozda olduğu gibi ( 1 4) bağlanmaların yanısıra her 24 ila 30 rezidü arasında ( 1 6) bağ tipinden oluşan dallanmalar bulunmaktadır. Glikojen, hayvan hücrelerinin ana depo polisakkaritidir. Amilopektinde olduğu gibi glikojende ( 1 4) bağlanmaların yanısıra dallanmaları oluşturan ( 1 6) bağ tipleri mevcuttur. Glikojen in amilopektinden en önemli farklılığı dallanmaların her 8 ila 12 glukoz rezidüleri arasında gerekleşmiş olmasıdır. Dolayısıyla, glikojen nişaştaya kıyasla daha kompakt bir yapı arzeder. Glikojen bolca karaciğerde yer alır ve karaciğerin yaş ağırlığının %7 sini oluşturur. Glikojen ayrıca kaslarda da yer alır. Karaciğer hücrelerinde glikojen büyük granüller halinde görünür. Glikojen granülleri ayrıca sıkı bağlanmış formunda glikojen sentezi ve degradasyonundan sorumlu enzimleri de içerir. Glukojen molekülü dallanmadan kaynaklı olarak bol miktarda indirgen olmayan uç içerir. Ancak sadece bir tane indirgen uç içerir. Glikojen enerji kaynaklı olarak kullanıldığında indirgen olmayan uçtan başlayarak degrade edilir. Degrade edici enzimler (fosforilaz) aynı anda değişik uçlardan degradasyon işlemine başladığı için polisakkaritin monosakkarite dönüşüm hızı oldukça yüksektir. Neden Glukoz monomerik formda depo edilmez? Karaciğer hücreleri glikojeni glukoz ekivalentince 0.4M olacak şekilde depo eder. Glikojenin gerçek konsantrasyonu ise (çözünmez, sitozolun osmolaritesine çok az katkı yapar) yaklaşık 0.01 M dır. Eğer sitozol 0.4 M glukoz içermiş olsaydı, osmolarite inanılmaz birşekilde artacak ve hücre içine su girişi yüzünden hücrenin patlamasına neden olacaktı. Gerçek nasıl? Karaciğer hücrelerimizde bu glukoz eşdeğeri 0.4 M kabul edilirse, kan dolaşımımızdaki glukoz konsantrasyonu ise 5mM dır. Aradaki bu fark kan dolaşımından karaciğer hücresine (eğer yeterli glikojen depoları varsa) glukoz girişine izin vermez. Glukozun hücre içerisine girişine ilişkin serbest enerji değişimi oldukça yüksek ve pozitiftir. 3

Bitişik rijit sandalyelerin en kararlı konformasyonunda polisakkarit zinciri eğilir, yani doğrusal değildir! Amilozun üç boyutlu yapısı incelendiğinde ise, yapının sıkı olarak sarılmış sarmal konformasyonda olduğu gözlenmektedir. GLİKOJENOLİZİS Metabolizmada ana yakıt kaynağı olan glukoz, ATP üretmek üzere glikolizis ile yıkıma uğrar. Glukoz hayvanlarda ise glikojen şeklinde depo edilir. Amilopektinden tek farkı dallanma noktasının 8-14 rezidüde bir yer almasıdır. Yüksek yapılı organizmalar, yakıt kaynağının tükenmesi durumunda metabolik ihtiyaçlar doğrultusunda kullanmak üzere glukozu yüksek molekül ağırlıklı glukanlar (glukoz polisakkaritleri) şeklinde polimerleştirerek depo ederler. Glukoz bitkilerde α-amiloz [α(1 4) bağlı glukan] ve amilopektin [αamilozun α(1 4) bağına ek olarak 24-30 rezidüde bir α(1 6) dallanma içerir] in bir karışımı olan nişasta şeklinde depo edilir. Glikojenin moleküler yapısı. 4

Glikojen, 100-400 Å çapındaki 120,000 e kadar glukoz molekülü barındırabilen sitoplazmik granüllerde depo edilir. Genellikle glikojen en fazla kullanıldığı kas (ağırlığının %1-2 kadarı) ve karaciğer hücrelerinde (ağırlığının %10 kadarı, vücudun ~12 saatlik enerji kaynağı) daha bol bulunur. Glikojenin dallanmış yapısını gösteren diyagram. Ratların iskelet kasındaki bir glikojen granülünün elektron mikrografı. Bu derste; glukoz moleküllerinin glukanın indirgen olmayan ucundan ardışık salınımlarına ilişkin mekanizmalar incelenecektir. Daha önce de belirtildiği üzere, glikojenin yüksek yapılı dallanmasının fizyolojik olarak kan dolaşımına çok hızlı glukoz molekülü salabilmesinden ötürü çok büyük önemi vardır. Peki neden yağlar gibi vücutta büyük kütleye sahip yapılar dururken glikojen depo edilir? Cevap üç kısımdan oluşur: 1. Kaslar yağları glikojende olduğu gibi hızlı metabolize edemez (100 m koşucusunu düşünün) 2. Yağların yağ asidi kalıntıları anaerobik olarak metabolize edilemezler (100 m kelebek yüzücüsünü düşünün) 3. Hayvanlar yağ asitlerini glukoza dönüştüremezler! Bu yüzden yağlar tek başlarına kan glukoz seviyesini düzenleyemezler! Karaciğer ve kas, glikojenin en fazla depo edildiği iki ana organdır. Kaslarda ATP ye ihtiyaç duyulduğunda glikojen, glikolizise girmesi için glukoz-6-fosfata (G6P) yıkılır. Karaciğerde, düşük kan glukozu konsantrasyonu glikojenin G6P a yıkılmasını, G6P ın hidroliz olarak glukoza dönüşmesini ve glukozun tekrar kana verilerek kan glukoz düzeyinin normale dönmesini tetikler. 5

GLİKOJEN ÜÇ ENZİMATİK REAKSİYONLA YIKIMA UĞRAR. Reaksiyon 1: Glikojen fosforilaz, glikojenin fosforoliz (fosfat grubunun yer değiştirmesi ile bağın kırılması) ini katalizleyerek glukoz-1-fosfat (G1P) oluşturur. Bu enzim dallanma noktasından en az 5 birim kalıncaya dek glukozun açığa çıkmasını sağlar. Bu reaksiyon konfigürasyonun değişimi ile ilerler ve bu durum kovalent glikozil-enzim araürününü de içeren çift yer değiştirme mekanizmasının göstergesidir. GLİKOJEN ÜÇ ENZİMATİK REAKSİYONLA YIKIMA UĞRAR. Reaksiyon 2: Glikojen dalkırıcı enzim Bu enzim glikojenin dallanmalarını uzaklaştırarak glikojenin daha üst düzey yıkılmasına olanak sağlamak için fosforilaz enzimine kolaylık sağlar. Bu enzim ayrıca 1 6 glikozidik bağlarıda kırabilir (dallanmanın olduğu ilk glukoz molekülü). Bu enziminde yardımıyla glikojen kalıntılarının yaklaşık %92 lik kısmı G1P ye dönüştürülür. Geri kalan yaklaşık %8 lik kısım ise (dallanma noktalarındaki), dogrudan glukoza dönüştürülmüş olur. Aynı zamanda reaksiyon sırasında enzim P i glikojen üçlü kompleksini takiben korunmuş okzonyum iyonu araürününün oluştuğu düşünülmektedir. GLİKOJEN ÜÇ ENZİMATİK REAKSİYONLA YIKIMA UĞRAR. Reaksiyon 3: Fosfoglukomutaz Bu enzim G1P yi G6P ye dönüştürür. Bu ürün aynı zamanda, glikolizin ilk adımında heksokinaz enzimince de oluşturulmaktadır. Oluşan G6P kaslarda glikolitik yoldan devam ederken, karaciğerde glukoza hidrolizlenerek kana verilir. Reaksiyon 1. Glikojen fosforilazın reaksiyon mekanizması. Fosforilaz reaksiyonu sonucunda glikojenin indirgen olmayan terminal glikozil birimine ait C1-O1 bağının kırılmasıyla G1P oluşur. Bağ kırılması ve ardından okzonyum iyonunun oluşumu, P i tarafından glikozidik oksijenin protonlanmasıyla gerçekleşir (asit katalizi). Oluşan okzonyum iyonu anyonik P i ile iyon çifti oluşturarak kararlı hale gelir (elektrostatik kataliz). Şimdi, bu enzimlerin yapı ve mekanizmalarına biraz daha yakından bakalım Hemen ardından PLP a ait fosforil grubunun P i tan proton almasıyla G1P oluşur (baz katalizi). 6

Glikojen fosforilaz, 842 rezidülük altbirimleri birbirine eş dimerden oluşan glikojen yıkımının kontrol basamağını katalizleyen enzimdir. Glikojen fosforilaz reaksiyonunun okzonyum iyonu üzerinden gerçekleştiği 1,5-glukonolakton gözlemine dayanmaktadır. Bu molekül fosforilazın bir inhibitörüdür. 1,5-glukonolakton öngörülen okzonyum iyonu ile aynı yarı sandalye konformasyonuna sahiptir ve bu geçiş basamağı analogu fosforilazın aktif merkezinde okzonyum iyonunu taklit eder. Tavşan kasına ait glikojen fosforilaz a (solda) ve b (sağda) nin X-ray yapısı. Fosforilaz, kofaktör olarak pridoksal-5 -fosfat içerir ve aktivitesi için gereklidir. Bu B 6 vitamini türevi bir Schiff bazı ile Lys 679 üzerinden fosforilaza kovalent olarak bağlıdır. X-ray çalışmalarından PLP ın fosfat grubunun enzimin aktif merkezine yakın yer aldığı ve bir asit-baz katalizörü olarak görev aldığı tahmin edilmektedir. 7

Reaksiyon 2: Glikojenin dallanma noktalarını yıkan enzim, glikojen fosforilaz reaksiyonunun tamamlanmasını sağlar. Aynı zamanda α(1 6) bağlı glikozil birimlerini de glukoza dönüştürür. Sonuç olarak, glikojene ait glukoz rezidülerinin yaklaşık %92 si G1P a dönüşmüş olur. Kalan %8 lik kısım ise dallanma noktalarından elde edilen glukozu oluşturur. Glikojenin dallanma noktalarını yıkan enzim, 1540 rezidülük monomer yapısındadır. Glikojenin limit dallanma noktasından α(1 4) bağlı trisakkarid birimini başka bir dallanma noktasının indirgen olmayan ucuna transfer ederek bir α(1 4) transglikozilaz (glikozil transferaz) olarak görev görür. Dallanma noktasında geriye kalan glikozil rezidüsünü ana zincire bağlayan α(1 6) bağını da aynı enzim hidroliz ederek glukoz ve dallanmamış glikojen açığa çıkmasını sağlar. Bu nedenle dallanma noktalarını yıkan enzim transferaz reaksiyonu ve α(1 6) glukozidaz reaksiyonu için iki ayrı aktif merkeze sahiptir. Reaksiyon 3: Fosfoglukomutaz G1P ı G6P a dönüştürür. G6P da ya glikolizis yolağına girer (kaslarda olduğu gibi) ya da glukoza hidroliz olur (karaciğerde olduğu gibi). α(1 4) transglikozilaz (glikozil transferaz) α(1 6) glukozidaz Aktif fosfo-enzimden G6P a bir fosforil grubu transferi sonucu glukoz-1,6-bifosfat (G1,6P) oluşur ve bu araürün enzimi tekrar fosforillleyerek G1P a dönüşür. Dallanma noktalarını yıkan enzim tarafından katalizlenen reaksiyonlar. 8

(1) C1 karbonuna ait OH grubu fosfoenzime atak yaparak defosfoenzim-g1,6p araürününü oluşturur. (2) Defosfoenzimdeki Ser-OH grubu C6 karbonundaki fosforil grubuna atak yaparak fosfoenzimi rejenere ederken G1P ın açığa çıkmasını sağlar. Glikojen metabolizmasının Termodinamiği: Sentez ve Yıkım Yollarını Ayırmak için Gereken İhtiyaç Forforilaz enzimi için G 0 (standart biyokimyasal koşullar altındaki G) değeri +3.1 kj/mol dir. Bu veriye göre fosforilaz reaksiyonu 25 C de [Pi]/[G1P]=3.5 olduğu zaman dengeye ulaşır ( G=0). Hücre de bu oran ise 30 100 arasında değişir ki, bu da G değerini -5 ila 8 kj/mol arasına getirir. Dolayısıyla glikojen yıkımı egzergonik bir reaksiyondur. Bunun tersi ise, yani G1P ve Pi den glikojenin sentezi ise istemsiz-endergonik bir süreçtir. Bu nedenle, glikojen sentezi ve yıkımı ayrı yolaklarla gerçekleşmelidir. Çünkü, her iki yolda kullanılan metabolitler benzerdir. Bu nedenle farklı enzimatik mekanizmaların rol oynaması gerekir (Fosfofruktokinaz-1 ve Fruktoz-1,6-bisfosfataz da olduğu gibi) GLİKOJENEZİS (Glikojen Sentezi) McArdle hastalığı -Nadir, kalıtımsal glikojen depo hastalığı, ılımlı bir egzersiz sonrası şiddetli krampların oluşumu - Bu hastalardan alınan doku örneklerinin glikojen fosforilaz aktivitesinin olmadığı ve glikojen yıkımını gerçekleştiremediği görülmüştür. -Bu hastaların kaslarında ise normal düzeylerde glikojen depolarının olması, sentezin yıkımdan farklı bir mekanizma ile oluştuğunun bir diğer kanıtıdır. Glikojen sentezi yolunda rol oynayan enzimler; UDP-glukoz pirofosforilaz, glikojen sentaz, glikojen dallandırıcı enzimdir. İlaveten bir de Glikojenin isimli bir protein bulunmaktadır. 9

UDP-Glukoz Pirofosforilaz Reaksiyonu G1P ın glikojen ve P i a direkt olarak dönüşümü tüm fizyolojik P i konsantrasyonları altında termodinamik olarak istemsiz (pozitif ΔG) olduğundan glikojen biyosentezi için ek bir ekzergonik adıma ihtiyaç vardır. Bu adım, G1P ın üridin trifosfat (UTP) ile birleşimi olan üridin difosfat glukoz (UDP-glukoz veya UDPG) oluşumuna dayanır. UDP-glukoz pirofosforilaz UTP ve G1P ın reaksiyonunu katalizler. Bu reaksiyonda G1P a ait fosforil grubu oksijeninin UTP nin α fosfor atomuna atağı sonucu UDPG oluşur ve PP i açığa çıkar. Bu fosfoanhidrit değişiminin ΔG değeri beklenildiği gibi sıfıra yakındır. Ardından, oluşan PP i ortamda bulunan inorganik pirofosfataz enzimi tarafından katalizlenen ekzergonik bir reaksiyonla hidroliz olur. Bu nedenle UDPG oluşumuna ait toplam reaksiyon da ekzergoniktir. UDPG nin yüksek enerjili hali uzayan glikojen zincirine kendiliğinden bir glukozil grubu vermesine olanak sağlar. UDP-glukoz pirofosforilaz UTP ve G1P ın reaksiyonunu katalizler. Bu reaksiyonda G1P a ait fosforil grubu oksijeninin UTP nin α fosfor atomuna atağı sonucu UDPG oluşur ve PP i açığa çıkar. Bu fosfoanhidrit değişiminin ΔG değeri beklenildiği gibi sıfıra yakındır. Ardından, oluşan PP i ortamda bulunan inorganik pirofosfataz enzimi tarafından katalizlenen ekzergonik bir reaksiyonla hidroliz olur. Bu nedenle UDPG oluşumuna ait toplam reaksiyon da ekzergoniktir. Glikojen Sentaz Reaksiyonu Glikojen sentaz reaksiyonu ile UDPG ye ait glikozil birimi bir α(1 4) bağı oluşturmak üzere bir glikojen zincirinin indirgen olmayan ucundaki C4-OH grubuna transfer edilir. Bu reaksiyonda da glikojen fosforilaz reaksiyonunda olduğu gibi bir okzonyum araürünü üzerinden ilerlediği düşünülmektedir. Memeliler glikojen sentazın %70 benzerlikte iki izoformunu eksprese ederler; biri çoğunlukla kasta diğeri ise karaciğerde bulunur. Bitkiler ve bakteriler ise nişasta/glikojen sentazlara sahiptirler fakat bu canlılar UDP-glukoz yerine glukoz donörü olarak ADPglukozu kullanırlar. UDP-glukoz pirofosforilaz tarafından katalizlenen reaksiyon. 10

Glikojen sentaz reaksiyonu için ΔG değeri -13.4 kj/mol dür ve bu reaksiyon glikojen yıkımındaki istemli gerçekleşen glikojen fosforilaz reaksiyonunun gerçekleştiği koşullarda istemlidir. Bu iki reaksiyon bir arada düşünüldüğünde glikojenin döngüsel olarak sentez ve yıkımı sürekli bir hareket makinasından çok gücünü UTP hidrolizinden sağlayan bir motora benzetilebilir. Tüketilen UTP, nükleozid difosfat kinaz tarafından katalizlenen fosfat transferi reaksiyonu ile tekrar üretilir. Glikojen sentaz iki glukoz rezidüsünü basit bir şekilde birleştiremez, sadece hazır bulunan bir α(1 4) bağlı glukan rezidüsünü genişletebilir. Peki glikojen sentezi nasıl başlar? Cevap, glikojen sentezinde bir glukoz rezidüsünün yarı-katalizli olarak «glikojenin» adı verilen 332 rezidülük homo-dimerik bir proteinin Tyr 194 e ait OH grubuna aktarılmasıyla başlar. «Glikojenin», glukan zincirini UDP-glukoz tarafından sağlanan ~9 rezidüye kadar genişleterek glikojen sentezinin başlaması için bir primer oluşturur. Glikojen sentaz bu noktadan sonra devreye girerek senteze devam eder. Glikojen granüllerinin analizi sonucunda bu iki enzimin 1:1 oranda bulundukları gösterilmiştir. Glikojenin iki farklı reaksiyonu katalizler. İlk olarak Tyr 194 üzerindeki hidroksil grubunun UDPglukozun glikozil artığındaki C1 karbonuna atağı ile glikozillenmiş Tyr rezidüsü oluşur. Ardından, terminal glukozun C4 hidroksil grubu başka bir UDP-glukoz molekülünün C1 karbonuna atak yapar ve bu sekans α(1 4) glikozidik bağı ile bağlı sekiz glukoz rezidüsü içeren bir glikojen molekülü meydana gelinceye kadar uzamaya devam eder. 11

Bir glikojen molekülünün yapısı. Merkez glikojenin molekülünden başlayarak, glikojen zincirleri (12-14 rezidülük) katmanlar halinde genişler. İç kısımdaki zincirlerin her birinde iki adet α(1 6) dallanma noktası bulunur. Dış katmandaki zincirlerde dallanma yoktur. Olgun bir glikojen partikülünde 12 adet katman bulunur (burada sadece 5 tanesi gösterilmiştir). 21 nm yarıçaplı ve M r ~1 10 7 olan bir glikojen molekülü yaklaşık 55,000 adet glukoz rezidüsü içerir. Glikojen sentaz tarafından katalizlenen reaksiyon. 12

Glikojen Dallandıran Enzim Glikojen sentaz sadece α(1 4) bağı oluşumunu katalizleyerek α- amiloz meydana getirir. Dallanarak glikojen oluşumu 700 rezidülük monomerik bir enzim olan amilo-(1,4 1,6)-transglikozilaz (glikojen dallandıran enzim) tarafından katalizlenir. Her bir dal ~7 glikozil rezidüsünden oluşan terminal zincir parçalarının aynı veya başka bir glikojen zincirindeki glukoz rezidüsünün C6-OH grubuna transferi ile meydana gelir. Transfer edilen her bir parça en az 11 rezidülük bir zincirden gelmelidir ve yeni dallanma noktası diğer dallanma noktalarından en az 4 rezidü uzaklıkta bulunmalıdır. Glikojen in dallanma reaksiyonu. Glikojen fosforilazın metabolik kontrolü GLİKOJENOLİZİS VE GLİKOJENEZİN METABOLİK REGÜLASYONU Enzim hem allosterik etkileşimler hem de kovalent modifikasyon ile regüle edilir. Enzim katalizli modifikasyon prosesi ile fosforilazın iki formu arasında geçiş sağlanır: Fosforilaz a, her iki altbiriminde de Ser 14 e bağlı fosforil grubu esterine sahiptir. Fosforilaz b, fosforil grubuna sahip değildir. Fosforilazın allosterik inhibitörleri ATP, G6P ve glukozdur. Allosterik aktivatörü ise enzimin fosforile/defosforile formları ile farklı şekilde etkileşime girerek duyarlılığı yüksek bir kontrol sağlayan AMP molekülüdür. Glikojen biyosentezi, glikojen sentaz enzimi ve glikojen yıkımı da glikojen fosforilaz enzimi üzerinden allosterik efektörler, kovalent modifikasyon ve hormonal kontrol mekanizmaları aracılığıyla regüle edilir. Enzimin ligand bağlanan bölgelerinin şematik gösterimi. 13

Glikojen fosforilaz aktivitesinin kontrolü. Enzim, enzimatik olarak inaktif T konformasyonu (üstte) veya katalitik olarak aktif olan R formu (altta) arasında geçiş yapabilir. Fosforilaz b nin konformasyonu AMP, ATP ve G6P gibi efektörler tarafından allosterik olarak kontrol edilir ve fizyolojik koşullarda en çok T halinde bulunur. Buna karşılık, enzimin modifiye formu, fosforilaz a, bu efektörlere büyük oranda duyarsızdır ve glukoz düzeyi çok yüksek olmadıkça R halinde bulunur. Olağan fizyolojik koşullar altında, glikojen fosforilazın enzimatik aktivitesi, enzimin modifikasyon/demodifikasyon hızı ile belirlenir. Enzimin sadece T formunun modifiye/demodifiye edildiği unutulmamalıdır, bunun sonucu olarak efektörün bağlanması modifikasyon/demodifikasyon hızını etkiler. Karaciğerde, glukoz fosforilaz a nın allosterik inhibitörüdür ve T formuna geçmesini sağlar. Aynı zamanda fosforilllenmiş serinleri fosfataz tarafından hidroliz olmaya hazır hale getirir. Bu durum dengeyi fosforilaz b yönüne kaydırır. Kasta, primer allosterik efektörler ATP, AMP ve G6P dır. Kaslar kasılma sırasında ATP yi kullandığında, AMP düzeyi yükselir ve artan AMP fosforilaz b nin aktif olan R formuna geçmesini tetikler. ATP bolluğunda veya G6P oluşturulduğunda, bu moleküller dengeyi T formuna geri çevirerek allosterik inhibitör olarak davranırlar. Bu değişimler, glikojenin enerjiye ihtiyaç duyulduğu yüksek AMP, düşük [G6P] ve düşük [ATP] durumlarında yıkılacağını gösterir. Tam tersi durumda (düşük [AMP], yüksek [G6P] ve yüksek [ATP]) yani enerji ihtiyacı olmadığında glikojen yıkımı düşüktür. 14

Glikojen sentazın metabolik kontrolü Glikojen sentazın aktivitesi glikojen fosforilazda olduğu gibi aynı tip kovalent modifikasyon ile düzenlenir. Aradaki fark cevabın tamamen ters olmasıdır. Glikojen sentaz, fosforile haldeyken inaktif, defosforile haldeyken aktif formundadır. Hormonal sinyaller (glukagon veya epinefrin) glikojen sentazın camp bağımlı protein kinaz üzerinden fosforillenmesini stimule ederler. Glikojen sentaz fosforilaz kinaz ve glikojen sentaz kinaz gibi enzimler tarafından da fosforillenebilir. Glikojen sentaz, fosforilazdan fosfat grubunu uzaklaştıran aynı fosfoprotein fosfataz tarafından defosforillenir. Glikojen sentaz aynı zamanda allosterik olarak da kontrol edilir. ATP varlığında inhibe olurken, G6P aktivatör olarak davranır. Fakat, enzimin iki formu G6P a farklı yanıt verir. Fosforile (inaktif) formu «glikojen sentaz D» (G6P bağımlı) olarak adlandırılır çünkü sadece çok yüksek G6P konsantrasyonlarında aktiftir. Defosforile formu «glikojen sentaz ɪ» (G6P bağımsız) olarak adlandırılır çünkü düşük G6P konsantrasyonlarında dahi aktiftir. Glikojen sentaz aktivitesi üzerinde insülin in etkisi. İnsülinin karaciğer ve kaslardaki plazma membranı reseptörlerine bağlanmasıyla protein kinaz kaskadları uyarılır ve glikojen sentezi başlar. İnsülinin etkisiyle glikojen sentaz kinaz 3 (GSK3) inaktif hale gelirken, fosfoprotein fosfataz 1 (PP1) aktif hale geçer ve GLUT4 (glukoz taşıyıcı membran proteini) plazma membranına yerleşir. Glukozun hücre içine alımı ile birlikte glikojen sentezi için substrat sağlanır. Öte yandan, G6P glikojen sentazın inaktif formunu allosterik olarak aktive eder. 15

Glukagon ve epinefrin, sırasıyla, karaciğer ve kasta glikojen yıkımını aktive eden ve glikojen sentezini inhibe eden kaskad reaksiyonlarını aktive ederler. KAYNAKLAR Lehninger, Principles of Biochemistry, Fifth Edition Donald Voet and Judith Voet, Biochemistry, Third Edition Glikojen depolanmasında görülen kalıtsal hastalıklar. 16