Kistik Fibrozisli Hastalardan İzole Edilen Pseudomonas aeruginosa Suşlarında Plazmid Aracılı Kinolon Direncinin Araştırılması*



Benzer belgeler
Çocuk ve Yetişkin Üriner Escherichia coli İzolatlarında Plazmidik Kinolon Direnç Genlerinin Araştırılması

Olgularla Klinik Bakteriyoloji: Antibiyotik Duyarlılık Testleri Yorumları. Dilara Öğünç Gülçin Bayramoğlu Onur Karatuna

Kinolon Dirençli Escherichia coli ve Klebsiella spp. Suşlarında Direnç Genlerinin Araştırılması

Escherichia coli Suşlarında Plazmide Bağlı Kinolon Direncinin Araştırılması

Enterobacteriaceae Üyelerinde Plazmid Aracılı Kinolon Direnç Determinantlarının Araştırılması: Çok Merkezli Bir Çalışma

Comparison of Susceptibility of Escherichia coli Strains Isolated from Urinary System Infections to Ciprofloxacin and Other Antibiotics

Enzimlerinin Saptanmasında

Türkiye de Su Kaynaklı Aeromonas spp. İzolatlarında Saptanan İlk QnrS Gen Pozitifliği

Kinolon Dirençli Escherichia coli ve Klebsiella spp. İzolatlarında Direnç Sağlayan Gen Mutasyonlarının ve Direnç Genlerinin Araştırılması

Kırıkkale Üniversitesi Tıp Fakültesi Cerrahi Yoğun Bakım Ünitesinde Yıllarında İzole Edilen Mikroorganizmalar ve Antibiyotik Duyarlılıkları

Prof.Dr.Ayşe Willke Topcu KLİMİK AYLIK TOPLANTISI 19 KASIM 2015, İSTANBUL

Pınar ZARAKOLU*, Gülşen HASÇELİK**, Serhat ÜNAL*

Epidemiyolojik Çalışmalar

Riskli Ünitelerde Yatan Hastalarda Karbapenemaz Üreten Enterobacteriaceae taranması

Kısa Bildiri/Short Communication Mikrobiyol Bul 2009; 43:

Enterobacteriaceae Ġzolatlarında Karbapenemazların Saptanmasında Modifiye Hodge Testi ve Carba NP Testlerinin Karşılaştırılması

Dokuz Eylul University Faculty of Medicine, Department of Medical Microbiology, Izmir, Turkey.

* 1. Uluslararası Orta Asya İnfeksiyon Hastalıkları Kongresi (ICCAID, 30 Ekim - 2 Kasım 2006, Bişkek, Kırgızistan) nde poster olarak sunulmuştur.

İdrar kültürlerinden soyutlanan Enterobacteriaceae türlerinin GSBL üretimi ile ertapenem ve diğer antibiyotiklere direncinin belirlenmesi

Sorunlu Mikroorganizmalar, Sorunlu Antibiyotikler ve E Test. Prof.Dr.Güner Söyletir Marmara Üniversitesi, İstanbul

Gram-Negatif Bakterilerde Direncin Laboratuvar Tanısı ve Yorumlanması

ALT SOLUNUM YOLU ÖRNEKLERİNDEN İZOLE EDİLEN PSEUDOMONAS AERUGINOSA SUŞLARININ ANTİBİYOTİK DUYARLILIĞI*

İdrar Örneklerinden İzole Edilen Bakteriler ve Antibiyotiklere Duyarlılıkları

MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS KOMPLEKS KLİNİK İZOLATLARINDA İZONİAZİD DİRENCİNE NEDEN OLAN DIŞA ATIM POMPALARININ SAPTANMASI

Kolistine Dirençli E. coli Suşuyla Gelişen ÜSİ Olgusu ve Sonuçlar

Kandan izole edilen Escherichia coli suşlarında antimikrobiyal duyarlılık : EARSS

flora Escherichia coli İzolatlarına Üriner Sistem İnfeksiyonlarından İzole Edilen Fosfomisinin İn Vitro Etkinliği

Özgün Çalışma/Original Article. Mikrobiyol Bul 2008; 42:

Enfeksiyon odaklarından izole edilen Gram negatif ve Gram pozitif bakterilerde antimikrobiyal duyarlılık sonuçları

TÜRKİYE DE PLAZMİT ARACILI KİNOLON DİRENCİ

Emrah Salman, Zeynep Ceren Karahan Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi. Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

Klinik Örneklerden İzole Edilen Gram Negatif Bakterilerde Doripenem ve Diğer Karbapenemlerin İn-Vitro Etkinliklerinin Karşılaştırılması

Antimikrobiyal tedavide yeni yaklaşım: Doripenem. İn vitro Veriler. Prof.Dr.Güner Söyletir Marmara Üniversitesi Tıp Fakültesi, İstanbul

Prof.Dr. Müzeyyen MAMAL TORUN. İ.Ü.Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

İdrar Örneklerinden İzole Edilen Escherichia coli Suşlarında Genişlemiş Spektrumlu BetaLaktamaz Üretimi ve Antibiyotiklere Direnç Oranları

Gereç ve yöntem. Şişli Hamidiye Etfal EAH- 700-yataklı. Yenidoğan yoğun bakım ünitesi -29 yataklı Bir izolasyon odası Üç farklı bölüm

Febril Nötropenik Hastada Antimikrobiyal Direnç Sorunu : Kliniğe Yansımalar

Emine Zuhal Kalaycı Çekin 1, Gülşah Malkoçoğlu 3, Nicolas Fortineau 2, Banu Bayraktar 1, Thierry Naas 2, Elif Aktaş 1

Araştırma. Harun AĞCA 2011 DEÜ TIP FAKÜLTESİ DERGİSİ CİLT 25, SAYI 3, (EYLÜL) 2011,

Dr.Müge Ayhan Doç.Dr.Osman Memikoğlu

Aminoglikozit Dirençli Gram Negatif Bakterilerde Plazmid Aracılı Metilaz Genlerinin Araştırılması

M. Hamidullah UYANIK, Hayrunisa HANCI, Halil YAZGI, Murat KARAMEŞE

Toplum başlangıçlı Escherichia coli

Makrolid dirençli Staphylococcus aureus ile kolonize kistik fibrozis hastalarında MLS B direnç genlerinde yıllar içerisinde değişim var mı?

Klinik Örneklerinden İzole Edilen Pseudomonas Aeruginosa Suşlarının Antibiyotik Duyarlılıkları

Karbapenemlere dirençli Bacteroides fragilis grubu bakterilerin varlığını araştırmak için rektal sürüntü örnekleriyle tarama

Klinik Örneklerden İzole Edilen E.coli Suşlarının Kümülatif Antibiyotik Duyarlılıklarının Belirlenmesi

Katip Çelebi Üniversitesi, Atatürk Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı, İZMİR 2

Escherichia Coli Suşlarında Genişlemiş Spektrumlu Beta Laktamaz Sıklığı ve Antibiyotik Direnç Oranları

M. Hamidullah UYANIK, Hayrunisa HANCI, Halil YAZGI. Atatürk Üniversitesi Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, ERZURUM

GENİŞLEMİŞ SPEKTRUMLU BETA-LAKTAMAZ ÜRETEN SUŞLARIN TANISINDA İKİ FARKLI KROMOJENİK AGARIN PERFORMANSI

Direnç hızla artıyor!!!!

ANTİBAKTERİYEL DİRENÇ SÜRVEYANSI CEASAR VE UAMDS PROJELERİ

N. Tiryakioğlu, B. Aksu, M. U. Hasdemir. Marmara Üni. Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, İstanbul

KAN KÜLTÜRLERİNDEN İZOLE EDİLEN KLEBSIELLA PNEUMONIAE SUŞLARINDA GENİŞLEMİŞ SPEKTRUMLU BETA-LAKTAMAZ VARLIĞININ ARAŞTIRILMASI VE TİPLENDİRİLMESİ*

KISA BİLDİRİ: ESCHERICHIA COLI

Olgularla Antimikrobiyal Duyarlılık Testleri (Gram Negatif Bakteriler)

Meryem IRAZ ÖZET SUMMARY

Meropenem E-test, Bacteroides fragilis Suşlarında Karbapenem Direnç Geni cfia Varlığını Tahmin Etmede Kullanılabilir mi?*

KAN KÜLTÜRLERİNDEN İZOLE EDİLEN SALMONELLA İZOLATLARINDA TİGESİKLİNİN İN-VİTRO ETKİNLİĞİ VE GENİŞLEMİŞ SPEKTRUMLU BETA-LAKTAMAZ ÜRETİMİ ARAŞTIRILMASI*

GENİŞLEMİŞ SPEKTRUMLU BETA-LAKTAMAZ ÜRETEN GRAM-NEGATİF BAKTERİLERDE bla CTX-M BETA-LAKTAMAZ GENLERİNİN ARAŞTIRILMASI

Namık Kemal Üniversitesi Tıp Fakültesi, Üroloji Anabilim Dalı, TEKİRDAĞ 2

STANDARDİZASYON KURUMLARI VE TÜRKİYE

Karbapenemaz Üreten Enterobacteriaceae

Bir eğitim ve araştırma hastanesinde yoğun bakımlardan izole edilen nonfermentatif gram-negatif mikroorganizmaların direnç profilleri

Hastane Kaynaklı Pseudomonas aeruginosa İzolatlarında PER-1 Tipi Beta-Laktamaz Sıklığının ve Antibiyotiklere Direnç Oranlarının Araştırılması

İdrar Örneklerinden İzole Edilen Gram Negatif Bakterilerin Değişik Antibiyotiklere Duyarlılığı

Genişlemiş Spektrumlu Beta-Laktamaz Üreten Gram Negatif Kan İzolatları: Karbapenemlere Duyarlılık ve Fenotipik/Genotipik Direnç Mekanizmaları

Doripenem: Klinik Uygulamadaki Yeri

KOLİSTİN DİRENCİ ENTEROBACTERIACEAE VE DİĞER GRAM NEGATİFLER. Dr. Şöhret Aydemir Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD

Enterobacteriaceae üyelerinde Direnç Epidemiyolojisi

Yoğun Bakım Ünitesinde Dirençli Gram Negatif İnfeksiyonlar

Bir Üniversite Hastanesi ndeki Pseudomonas Aeruginosa Suşlarının Antibiyotik Duyarlılıkları

Klebsiella pneumoniae Suşlarında Çift Karbapenem ve Kolistin Kombinasyonlarının in vitro Değerlendirilmesi. İ.Ü.İstanbul Tıp Fakültesi

Olgularla Güncel Direnç Mekanizmaları;Saptama ve Raporlama. Dr Dilara Öğünç Akdeniz Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD

KLEBSIELLA PNEUMONIAE KLİNİK İZOLATLARINDA CTX-M TİPİ BETA-LAKTAMAZLARIN FENOTİPİK VE MOLEKÜLER YÖNTEMLERLE ARAŞTIRILMASI

İDRAR YOLU İNFEKSİYONLARINDAN İZOLE EDİLEN ESCHERICHIA COLI KÖKENLERİNDE FLOROKİNOLON DİRENCİNİN ARAŞTIRILMASI

SAĞLIK HİZMETİ İLE İLİŞKİLİ KLEBSİELLA ENFEKSİYONLARI

YATAN HASTALARDAN İZOLE EDİLEN PSEUDOMONAS AERUGINOSA SUŞLARININ ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARI

Yoğun Bakım Ünitesinde Gelişen Kandida Enfeksiyonları ve Mortaliteyi Etkileyen Risk Faktörleri

INVESTIGATION OF PLASMID-MEDIATED AmpC BETA-LACTAMASE TYPES IN KLEBSIELLA SPP. AND ESCHERICHIA COLI ISOLATES RESISTANT OR INTERMEDIATE TO CEFOXITIN

HASTANE İNFEKSİYONU ETKENİ PSEUDOMONAS SUŞLARININ ANTİBİYOTİKLERE DUYARLILIKLARI*

PSEUDOMONAS AERUGINOSA İZOLATLARININ ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARININ DEĞERLENDİRMESİ: ÇEŞİTLİ ANTİBİYOTİKLERE AZALAN DUYARLILIK*

Türkiye de ilk kez NDM-1 karbapenemaz üreten. ve IncI2, IncA/C ile IncY plazmitlerini taşıyan. Escherichia coli ST471 infeksiyonu

ÇEŞİTLİ KLİNİK ÖRNEKLERDEN İZOLE EDİLEN PSEUDOMONAS AERUGINOSA SUŞLARININ ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARI

DÜZCE TIP DERGİSİ DUZCE MEDICAL JOURNAL

56 JCEI / Gündem ve ark. İdrar kaynaklı E.coli ve Klebsiella suşlarının antibiyotik direnci 2013; 4 (1): RESEARCH ARTICLE

Fahriye EKŞİ İclal BALCI Efgan D. GAYYURHAN Goncanur ÇEKEM

INVESTIGATION OF ESBL TYPES IN COMMUNITY ACQUIRED URINARY ESCHERICHIA COLI ISOLATES BY ISOELECTRIC FOCUSING AND POLYMERASE CHAIN REACTION

TÜBİTAK BİDEB LİSE ÖĞRETMENLERİ-FİZİK, KİMYA, BİYOLOJİ, MATEMATİK PROJE DANIŞMANLIĞI EĞİTİMİ ÇALIŞTAYI (LİSE-4 [ÇALIŞTAY 2014]) GRUP ADI: SERA

Yard.Doç.Dr. Dolunay Gülmez

Pnömonide Etkene Yönelik Antimikrobiyal Tedavi

Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi, İç Hastalıkları Anabilim Dalı, Enfeksiyon Hastalıkları Ünitesi, Ankara.

Nurhan ALBAYRAK*, Şafak KAYA**

ORIGINAL ARTICLE / ÖZGÜN ARAŞTIRMA

Yoğun Bakım Ünitelerinden İzole Edilen Nonfermentatif Gram Negatif Bakterilerin Antimikrobiyal Duyarlılıklarının Araştırılması

Acinetobacter baumannii'de kolistin direncine yol açan klinik ve moleküler etkenler

İnvaziv E.coli izolatlarında 3. kuşak sefalosporin direnç yüzdeleri, AB Ülkeleri ve Türkiye (2014)

Antimikrobiyal Yönetimi Prof. Dr. Haluk ERAKSOY

Komplike deri ve yumuşak doku enfeksiyonu etkeni çoklu dirençli patojenlerin bakteriyofaj duyarlılıklarının araştırılması

Transkript:

Özgün Çalışma/Original Article Mikrobiyol Bul 2011; 45(4): 602-608 Kistik Fibrozisli Hastalardan İzole Edilen Pseudomonas aeruginosa Suşlarında Plazmid Aracılı Kinolon Direncinin Araştırılması* Investigation of Plasmid-Mediated Quinolone Resistance in Pseudomonas aeruginosa Strains Isolated from Cystic Fibrosis Patients Ahmet Yılmaz ÇOBAN 1, Yeliz TANRIVERDİ ÇAYCI 1, Tuba YILDIRIM 2, Zayre ERTURAN 3, Belma DURUPINAR 1, Bülent BOZDOĞAN 4 1 Ondokuz Mayıs Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Samsun. 1 Ondokuz Mayis University Faculty of Medicine, Department of Medical Microbiology, Samsun, Turkey. 2 Amasya Üniversitesi Fen-Edebiyat Fakültesi, Biyoloji Bölümü, Amasya. 2 Amasya University Faculty of Science, Department of Biology, Amasya, Turkey. 3 İstanbul Üniversitesi İstanbul Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, İstanbul. 3 Istanbul University Faculty of Istanbul Medicine, Department of Medical Microbiology, Istanbul, Turkey. 4 Adnan Menderes Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Aydın. 4 Adnan Menderes University Faculty of Medicine, Department of Medical Microbiology, Aydin, Turkey. * Bu çalışma, XV. Türk Klinik Mikrobiyoloji ve İnfeksiyon Hastalıkları Kongresi (23-27 Mart 2011, Antalya) nde poster olarak sunulmuştur. Geliş Tarihi (Received): 08.04.2011 Kabul Ediliş Tarihi (Accepted): 15.07.2011 ÖZET Pseudomonas aeruginosa doğada yaygın olarak bulunan ve ciddi nozokomiyal enfeksiyonlara neden olan bir bakteridir. Birçok antibakteriyel ajana karşı intrensek dirence sahip olması nedeniyle P.aeruginosa ile oluşan enfeksiyonların tedavisinde zorluklar yaşanmaktadır. Kinolonlar, özellikle siprofloksasin, tedavide kullanılan önemli ajanlardandır. Ancak kinolonlara da direnç gelişmesi önemli bir sorundur. Kinolonlara direnç sıklıkla kromozomal mutasyon ve dışa-atım pompaları aracılığıyla olmaktadır. Son yıllarda Enterobacteriaceae ailesi üyelerinde plazmid aracılı kinolon direnci de saptanmış; bu dirence neden olan gen ailesi qnr olarak adlandırılmıştır. Ayrıca yine plazmid ile aktarılan ve aminoglikozid direnci ile birlikte kinolon direncine de neden olan aac(6 )-Ib-cr gen bölgesi de Enterobacteriaceae ailesine ait bakteriyel izolatlarda tespit edilmiştir. Yapılan sınırlı sayıdaki çalışmada, P.aeruginosa izolatlarında qnr gen bölgesinin varlığı ve aac(6 )-Ib-cr gen bölgesi henüz gösterilememiştir. Bu çalışmada, kistik fibrozisli olgulardan izole İletişim (Correspondence): Doç. Dr. Ahmet Yılmaz Çoban, Ondokuz Mayıs Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, 55139 Samsun, Türkiye. Tel (Phone): +90 362 3121919/3526, E-posta (E-mail): cobanay2003@gmail.com

Çoban AY, Tanrıverdi Çaycı Y, Yıldırım T, Erturan Z, Durupınar B, Bozdoğan B. edilen P.aeruginosa suşlarında plazmid aracılı florokinolon direncinin araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmaya, hastaların solunum yolu örneklerinden izole edilen 110 P.aeruginosa suşu dahil edilmiş ve izolatların siprofloksasin duyarlılıkları CLSI önerileri doğrultusunda Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemiyle çalışılmıştır. Suşlarda qnra, qnrb, qnrc, qnrs ve aac(6 )-Ib-cr gen bölgelerinin varlığı, bu bölgeler için özgül primer çiftleri kullanılarak multipleks polimeraz zincir reaksiyonu yöntemiyle araştırılmıştır. Çalışmada pozitif kontrol olarak Escherichia coli J53 pmg252 (qnra 1 pozitif), E.coli J53 pmg252 (qnrs 1 pozitif), E.coli J53 pmg258 (qnrb 1 ve aac(6 )-Ib-cr pozitif), Klebsiella pneumoniae ref.15 (qnrb pozitif), Enterobacter cloacae ref.287 (qnrs pozitif), E.coli ref.20 (qnra pozitif) ve phs11 plazmidinin (qnrc pozitif) konjugasyon yoluyla aktarıldığı E.coli DH10 suşu kullanılmıştır. P.aeruginosa klinik izolatlarının 13 ü siprofloksasine dirençli, yedisi orta duyarlı ve 90 ı duyarlı olarak bulunmuştur. Çalışma sonucunda test edilen toplam 110 P.aeruginosa izolatında hem qnr gen bölgesi hem de aac(6 )-Ib-cr gen bölgesi tespit edilememiştir. Bununla birlikte bu bulgunun daha çok klinik izolat içeren araştırmalarla desteklenmesi P.aeruginosa izolatlarında kinolon direncinin belirlenmesi ve önlenmesinde önemli olacaktır. Anahtar sözcükler: Kistik fibrozis; Pseudomonas aeruginosa; kinolon; direnç; qnr gen bölgesi. ABSTRACT Pseudomonas aeruginosa which is widely found in the environment, may lead to serious nosocomial infections. Due to its intrinsic resistance to many antibacterial agents, treatment of P.aeruginosa infections usually present difficulty. Quinolones, especially ciprofloxacin, are crutial antibiotics for the treatment of P.aeruginosa infections. However resistance developing to quinolones may become an important problem. Resistance to quinolones is often a result of chromosomal mutations and by the effect of efflux pumps. Recently plasmid-mediated quinolone resistance have been reportedin the members of Enterobacteriaceae family. The gene responsible for this resistance is called qnr. In addition to qnr genes there is also another gene called aac(6 )-Ib-cr responsible for plasmid-mediated quinolone resistance and aminoglycoside resistance. Limited studies which to screen P.aeruginosa strains for the presence of qnr gene region, revealed no positivity. The aim of this study was to investigate the plasmid-mediated quinolone resistance in P.aeruginosa strains isolated from cystic fibrosis patients. A total of 110 P.aeruginosa strains isolated from respiratory tract specimens from the patients were included in the study. Ciprofloxacin susceptibilities of the isolates were detected by Kirby-Bauer disk diffusion method according to CLSI guidelines. The presence of qnra, qnrb, qnrc, qnrs and aac(6 )-Ib-cr genes were searched by multiplex polymerase chain reaction (PCR) with the use of specific individual primer pairs. As positive control strains, Escherichia coli J53 pmg252 (qnra 1 positive), E.coli J53 pmg252 (qnrs 1 positive), E.coli J53 pmg258 (qnrb 1 and aac(6 )-Ib-cr positive), Klebsiella pneumoniae ref.15 (qnrb positive), Enterobacter cloacae ref.287 (qnrs positive), E.coli ref.20 (qnra positive) and E.coli DH10 conjugated with phs11 plasmid (qnrc positive) were used. Of 110 P.aeruginosa clinical isolates, 13 were found resistant to ciprofloxacin, while 7 were intermediate. However multiplex PCR yielded no positivity in terms of qnra, qnrb, qnrc, qnrs and aac(6 )-Ib-cr gene regions. In conclusion, although our results indicated that none of the tested P.aeruginosa strains harboured those genes, further multicenter studies with large numbers of isolates are needed to confirm these results. Key words: Cystic fibrosis; Pseudomonas aeruginosa; quinolone; resistance; qnr genes. GİRİŞ Pseudomonas aeruginosa doğada yaygın olarak bulunabilen gram-negatif bir basil olup, immün sistemi baskılanmış, AIDS li, yanıklı ve kistik fibrozisli hastalarda ciddi enfeksiyonlara neden olmaktadır 1. Bu enfeksiyonların antibiyotikler ve dezenfektanlarla 603

Kistik Fibrozisli Hastalardan İzole Edilen Pseudomonas aeruginosa Suşlarında Plazmid Aracılı Kinolon Direncinin Araştırılması kontrolü oldukça zordur 2. P.aeruginosa bazı antibiyotiklere (ampisilin, amoksisilin, amoksisilin/klavulanik asit, birinci ve ikinci kuşak sefalosporinler, sefotaksim, seftriakson, nalidiksik asit, trimetoprim) karşı intrensek dirence sahiptir 3. Bu bakterinin antibiyotiklere yüksek oranda direnç göstermesine neden olan mekanizmalar arasında; dış membran geçirgenliğinde azalma, dışa atım pompa sistemleri, beta-laktamaz enzimleri, direnci düzenleyen genlerde kromozomal mutasyonlar ve plazmid, transpozonlar ve bakteriyofajlarla direnç genlerinin aktarımı yer almaktadır 2. Florokinolonlar P.aeruginosa nın tedavisinde kullanılan önemli ajanlardandır. Florokinolonlara karşı minimum inhibitör konsantrasyonu (MİK) değerleri, DNA giraz (gyra ve gyrb) ve topoizomeraz IV (parc ve pare) te meydana gelen mutasyonlar ve atım pompa sistemlerinde hiperaktivasyon sonucu artmaktadır. Son yıllarda bunlara ek olarak Enterobacteriaceae üyesi bakterilerde plazmid aracılı kinolon direnci de tanımlanmış olup, buna neden olan qnra, qnrb, qnrc, qnrs, qnrd, aac(6 )-Ib-cr ve qepa genlerinin varlığının da florokinolon MİK değerlerinde artışa neden olabildiği saptanmıştır 4. Ancak günümüze kadar yapılan çalışmalarda P.aeruginosa izolatlarında qnr gen ailesinin varlığı gösterilememiştir. Bu çalışmanın amacı, kistik fibrozisli hastalardan izole edilen P.aeruginosa klinik izolatlarında plazmid aracılı florokinolon direncinin araştırılmasıdır. GEREÇ ve YÖNTEM Bakteriyel İzolatlar Çalışmada İstanbul Üniversitesi İstanbul Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalının kistik fibrozis laboratuvarına gelen solunum yolu örneklerinden izole edilen 110 P.aeruginosa suşu test edildi. Tüm izolatların siprofloksasin duyarlılıkları CLSI önerileri doğrultusunda Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemiyle çalışıldı 5. Multipleks Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) ile qnr Genlerinin Araştırılması Bir gün öncesinden Mueller-Hinton agar besiyerine ekilen bakterilerden birkaç koloni alınıp, 500 µl steril distile su içine süspanse edildi ve 100 C de 20 dakika kaynatıldı. Ardından 15000 x g de 20 dakikalık santrifüj işleminden sonra süpernatan, PCR de kalıp DNA olarak kullanılmak üzere alındı ve çalışılıncaya kadar -20 C de saklandı. PCR optimizasyonu için qnr genlerini taşıyan suşlar her PCR işleminde pozitif kontrol olarak kullanıldı. Bu amaçla; Escherichia coli J53 pmg252 (qnra 1 pozitif), E.coli J53 pmg252 (qnrs 1 pozitif) ve E.coli J53 pmg258 (qnrb 1 ve aac(6 )-Ib-cr pozitif) suşları Prof. G. A. Jacoby (Lahey Clinic, Burlington, ABD) den; Klebsiella pneumoniae ref.15 (qnrb pozitif), Enterobacter cloacae ref.287 (qnrs pozitif) ve E.coli ref.20 (qnra pozitif) suşları Prof. P. Nordmann (Hôpital de Bicêtre, Faculté de Médecine et Université Paris-Sud, Bicêtre, Fransa) dan; phs11 plazmidi (qnrc pozitif) ise Prof. M. Wang (Huashan Hospital, Fudan University, Shanghai, PRC) dan temin edildi. PCR yönteminde Kim ve arkadaşları 6 tarafından daha önce tanımlanan primer çiftleri kullanıldı (Tablo I). qnra, qnrb, qnrc, qnrs ve aac(6 )-Ib multipleks PCR yöntemiyle çalışıldı. Her multipleks PCR de 2 µl DNA, 1 x PCR tamponu, 1.5 mm MgCl 2, 200 µm deoksidinükleotid trifosfat, 20 pmol her bir primerden ve 2.5U Taq DNA polimeraz içeren toplam 50 µl PCR karışımı kullanıldı. Amplifikasyon programı; 95 C de 1 dakika; 35 dön- 604

Çoban AY, Tanrıverdi Çaycı Y, Yıldırım T, Erturan Z, Durupınar B, Bozdoğan B. Tablo I. Çalışmada Kullanılan Primer Çiftleri Gen Primer Dizi Amplikon büyüklüğü Kaynak qnra qnraf ATTTCTCACGCCAGGATTTG 516 22 qnrar GATCGGCAAAGGTTAGGTCA qnrb qnrbf GATCGTGAAAGCCAGAAAGG 476 6 qnrbr2 ATGAGCAACGATGCCTGGTA qnrc qnrcf GGGTTGTACATTTATTGAATCG 307 6 qnrcr CACCTACCCATTTATTTTCA qnrs qnrsmf GCAAGTTCATTGAACAGGGT 428 7 qnrsmr TCTAAACCGTCGAGTTCGGCG aac(6 )-Ib aacibf TTGCGATGCTCTATGAGTGGCTA 482 23 aacibr CTCGAATGCCTGGCGTGTTT güden oluşan 95 de 1 dakika, 54 C de 1 dakika ve 72 C de 1 dakika ve son uzama olarak 72 C de 10 dakika olacak şekilde uygulandı 7. PCR ürünlerine %2 agaroz jelde 120v, 60 dakika 1 x TBE tamponda elektroforez yapıldı. Daha sonra 30 dakika 0.05 mg/l etidyum bromürle boyanarak görüntülendi. Plazmid Konjugasyonu Bu amaçla qnrc gen bölgesi içeren plazmid konjugasyon yoluyla E.coli bakterisine aktarıldı. Bir gün öncesinden hazırlanan E.coli DH10B kültüründen 1 ml alınarak 50 ml Brain Heart Infusion (BHI) buyyonuna eklendi ve 600 nm de OD 0.5-0.8 e ulaşıncaya kadar çalkalanarak 37 C de inkübe edildi. Bakteriler +4 C de 10 dakika 5000 rpm de santrifüj edilerek yoğunlaştırıldı ve daha önceden soğutulmuş 10 ml distile steril suda homojen hale getirildi. Bu işlemden sonraki bütün aşamalar soğuk zincir koşullarında yapıldı. Bakterilerin yoğunlaştırılmasından sonra soğuk su ile yıkama işlemi yapıldı. Buna ek olarak, önceden soğutulmuş %10 gliserol ilave edilmiş su ile iki kez yıkama yapıldı. Çökelti %10 gliserollü 2 ml suda homojenize edildikten sonra 0.1 ml lik hacimlere ayrılıp -80 C de saklandı. Transformasyon için tüp -80 C den alınıp buz içine konuldu ve çözülmesi beklendi. Ardından tüp içerisine 1-2 µl DNA (su veya TE içerisinde) eklendi. DNA kompetan bakteri karışımı uygun şekilde ayarları yapılmış olan (15 µf, 335Ω ve 2.5 KV) elektroforez aletinin (Cellject Duo, Thermo) 0.2 cm lik elektroporasyon kabı içine konarak elektropore edildi. Daha sonra bu karışıma hemen 1 ml BHI besiyeri eklendi ve 225 rpm de çalkalanarak 37 C de bir saat bekletildi. İnkübasyon süresinin sonunda karışımdan 100 µl alınarak antibiyotikli seçici besiyerine yayıldı. Konjugasyon yoluyla E.coli DH10 suşuna aktarılan qnrc plazmidi çalışmada qnrc pozitif kontrol izolatı olarak kullanıldı. BULGULAR Çalışmaya alınan 110 P.aeruginosa klinik izolatının 90 ı siprofloksasine duyarlı, 13 ü dirençli ve yedisi orta duyarlı olarak bulunmuştur. 605

Kistik Fibrozisli Hastalardan İzole Edilen Pseudomonas aeruginosa Suşlarında Plazmid Aracılı Kinolon Direncinin Araştırılması Çalışmamızda, multipleks PCR ile qnrc pozitif olduğunu düşündüğümüz üç P.aeruginosa klinik izolatı (izolat no: 24, L ve K1G7) saptanmıştır (Resim 1). Her üçü de siprofloksasine duyarlı olan bu izolatlarla yapılan multipleks PCR de, qnrc bandına denk gelen 300 baz çifti (bp) bölgesinde bant görülmüştür. Bu izolatların sadece qnrc içeren primer ile tekrar PCR yapıldığında herhangi bir bant görülmemiştir. Gözlenen bandın multipleks PCR ye bağlı yalancı bağlanma olduğuna karar verilmiştir. TARTIŞMA P.aeruginosa fırsatçı nozokomiyal enfeksiyonların en önemli etkenleri arasındadır. Antibiyotiklere karşı yüksek düzeyde direnç gösteren bu bakterinin neden olduğu enfeksiyonların tedavisinde, antipsödomonal penisilinler, sefalosporinler, karbapenemler ve özellikle siprofloksasin olmak üzere florokinolonlar kullanılmaktadır 2. Kinolonlardan ilk kullanıma giren nalidiksik asittir. Nalidiksik asidin etkisi üriner sistem enfeksiyonlarıyla sınırlı kalması nedeniyle yeni kinolon grubu antibiyotikler araştırılmaya başlanmış ve altıncı karbona bir flor atomu eklenmesiyle florokinolonlar sentezlenmiştir. Daha sonra florokinolonlara farklı bileşiklerin katılmasıyla etki spektrumu genişletilmiştir. Kinolon grubu antibiyotiklerin hedefi topoizomeraz-dna kompleksidir. Bu şekilde DNA sentezini hızla inhibe ederek bakterisidal etki gösterirler 8-10. Kinolonların etki spektrumu günümüzde gram-pozitif, gram-negatif ve anaerop bakteriler olmak üzere oldukça geniştir. Kinolon direnci sıklıkla hedef enzimde değişiklik oluşturan ya da ilacın hücre içine girişinin azalmasına neden olan kromozomal mutasyonlarla oluşmaktadır. Direnç gelişiminde her iki mekanizma da etkili olabilmektedir 11. M 1 2 3 4 5 6 300 bp Resim 1. Multipleks PCR de kullanılan qnr pozitif suşlar ve şüpheli pozitif bulunan klinik izolat [M: DNA ladder; Hat 1: qnra pozitif E.coli ref. 20; Hat 2: qnrb pozitif K.pneumoniae ref. 15; Hat 3: qnrc pozitif phs11 suşu; Hat 4: Klinik izolat K1G7; Hat 5: qnrb 1 ve aac(6 )-Ib-cr pozitif E.coli J53 pmg298; Hat 6: qnrs pozitif E.cloacae ref. 287]. 606

Çoban AY, Tanrıverdi Çaycı Y, Yıldırım T, Erturan Z, Durupınar B, Bozdoğan B. Son yıllarda kinolonlara karşı plazmid aracılı direnç görülmeye başlanmıştır. İlk olarak 1998 yılında siprofloksasine dirençli bir Klebsiella pneumoniae suşunda plazmid aracılı kinolon direnci gösterilmiştir 12,13. Plazmidin tekrarlayan pentapeptid ailesine ait proteini kodladığı anlaşılmış ve bu gen bölgesi qnr olarak adlandırılmıştır. Zaman içinde farklı qnr determinantları tanımlanmış olmakla birlikte, ilk tanımlanan gen bölgesi qnra olarak adlandırılmış; yeni bulunan diğer gen bölgelerine de qnrb, qnrc, qnrs, qnrd isimleri verilmiştir 12. Ayrıca yine plazmid aracılı kinolon direnciyle ilişkili aac(6 )-Ib-cr ve qepa determinantları tanımlanmıştır 6,14. Günümüzde dünyanın birçok farklı bölgesinde qnr taşıyan izolatlar tespit edilmiştir 15-17. qnr gen ailesi siprofloksasin MİK değerlerinde yükselmelere neden olsa da CLSI kriterlerine göre siprofloksasin direncine neden olmamaktadır 13. Yapılan bir çalışmada, K.pneumoniae izolatlarında siprofloksasin MİK değeri 1 µg/ml olan izolatlarda qnr ve aac(6 )-Ib-cr determinantlarının varlığı araştırılmış ve yüksek oranda pozitiflik saptanmıştır 18. P.aeruginosa izolatlarında kinolon direnci sıklıkla DNA giraz enziminde mutasyon veya atım pompa sisteminde hiperaktivasyon sonucu oluşmaktadır 2. Bu çalışmada, kistik fibrozisli hastalardan izole edilen P.aeruginosa izolatlarında qnr gen bölgeleri ve aac(6 )- Ib-cr varlığı araştırılmış; ancak bu gen bölgelerinden herhangi birisini taşıyan izolata rastlanmamıştır. Daha önce yapılan az sayıdaki çalışmalarda da P.aeruginosa izolatlarında pozitif suş bulunamamıştır 19-21. Çalışma sırasında multipleks PCR ile üç izolatın qnrc pozitif olabileceğinden şüphelenilmiş; buna karşın yalnızca qnrc primeri ile yapılan PCR yönteminde bunların hiçbirisinde pozitiflik saptanmamıştır. Benzer şekilde, Enterobacteriaceae üyelerinde qnr gen bölgesinin araştırıldığı bir çalışmada Kim ve arkadaşları 6 PCR sonuçlarına göre 65 izolatta pozitiflik saptarken, dizi analizi sonucu bunlardan yalnız 37 tanesinin qnr determinantı taşıdığını doğrulamıştır. Bugüne kadar P.aeruginosa da plazmid aracılı kinolon direnç bölgesi (PMQR) saptanamamış olsa da Martinez-Martinez ve arkadaşları 22 qnr gen bölgesi taşıyan plazmidi P.aeruginosa PU21 suşuna konjugasyon yoluyla aktarabilmişlerdir. Plazmid aracılı kinolon direnci Enterobacteriaceae ailesi üyelerinde hızla artmaktadır 24. Bugüne kadar P.aeruginosa izolatlarında böyle bir gen bölgesi saptanamamış olsa da, birçok direnç mekanizmasına sahip olan bu bakteride bu tip bir direnç mekanizmasının saptanmasının, antimikrobiyal kemoterapiyi nasıl etkileyeceği yapılacak daha ileri çalışmalarla açıklığa kavuşacaktır. TEŞEKKÜR Bu çalışmada qnr pozitif suşların teminini sağlayan Prof. George A. Jacoby, Prof. Patrice Nordmann ve Prof. Minggui Wang a teşekkürlerimizi sunarız. KAYNAKLAR 1. Erdem B. Pseudomonas lar, s: 551-8. Mutlu G, İmir T, Cengiz AT, Ustaçelebi Ş (ed), Temel ve Klinik Mikrobiyoloji. 1999, 1. Baskı. Güneş Kitabevi, Ankara. 2. Lambert PA. Mechanisms of antibiotic resistance in Pseudomonas aeruginosa. J R Soc Med 2002; 95(41): 22-6. 607

Kistik Fibrozisli Hastalardan İzole Edilen Pseudomonas aeruginosa Suşlarında Plazmid Aracılı Kinolon Direncinin Araştırılması 3. Livermore DM, Winstanley TG, Shannon KP. Interpretative reading: recognizing the unusual and inferring resistance mechanism from resistance phenotypes. J Antimicrob Chemother 2001; 1(48): 87-102. 4. Nazik H, Ongen B. Türkiye de plazmit aracılı kinolon direnci. Ankem Derg 2010; 24(1): 46-54. 5. Clinical and Laboratory Standards Institute. Performance standards for antimicrobial disk susceptibility tests. Approved Standard M2-A9. 2006, 9 th ed. CLSI, Wayne, PA. 6. Kim HB, Park CH, Kim CJ, Kim EC, Jacoby GA, Hooper DC. Prevalence of plasmid-mediated quinolone resistance determinants over a 9-year period. Antimicrob Agents Chemother 2009; 53(2): 639-45. 7. Cattoir V, Poirel L, Rotimi V, Soussy J, Nordmann P. Multiplex PCR for detection of plasmid- mediated quinolone resistance qnr genes in ESBL-producing enterobacterial isolates. J Antimicrob Chemother 2007; 60(2): 394-7. 8. Hooper DC, Strahilevitz J. Quinolones, pp: 487-510. In: Mandell GL, Bennett JE, Dolin R (eds), Mandell, Douglas and Bennett s Principles and Practice of Infectious Diseases. 2010, 7 th ed. Elsevier Chirchill Livingstone, Philadelphia. 9. Robicsek A, Jacoby GA, Hooper DC. The woldwide emergence of plasmid-mediated quinolone resistance. Lancet Infect Dis 2006; 6(10): 629-40. 10. Ruiz J. Mechanisms of resistance to quinolones target alterations, decreased accumulation and DNA gyrase protection. J Antimicrob Chemother 2003; 51(5): 1109-17. 11. Işık Y. Pseudomonas aeruginosa kökenlerinde kinolon direncinin moleküler olarak saptanması. Yüksek Lisans Tezi, 2008. Gazi Üniversitesi, Ankara. 12. Jacoby G, Cattoir V, Hooper D, et al. Qnr gene nomenclature. Antimicrob Agents Chemother 2008; 52(7): 2297-9. 13. Nordmann P, Poirel L. Emergence of plasmid-mediated resistance to quinolones in Enterobacteriaceae. J Antimicrob Chemother 2005; 56(3): 463-9. 14. Yamane K, Wachino J, Suzuki S, et al. New plasmid-mediated fluoroquinolone efflux pump, qepa found in an Escherichia coli clinical isolate. Antimicrob Agents Chemother 2007; 51(4): 3354-60. 15. Jonas D, Biehler K, Hartung D, Spitzmüller B, Daschner FD. Plasmid-mediated quinolone resistance in isolates obtained in German intensive care units. Antimicrob Agents Chemother 2005; 49(2): 773-5. 16. Wu JJ, Ko WC, Wu HM, Yan JJ. Prevalence of qnr determinants among bloodstream isolates of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae in Taiwanese hospital, 1999-2005. J Antimicrob Chemother 2008; 61(6): 1234-9. 17. Iabedene H, Messai Y, Ammari H, et al. Dissemination of ESBL and qnr determinants in Enterobacter cloacae in Algeria. J Antimicrob Chemother 2008; 62(1): 133-6. 18. Park YJ, Yu JK, Kim SY, Lee S, Jeong SH. Prevalence and characteristics of qnr determinants and aac(6 )-Ibcr among ciprofloxacin-susceptible isolates of Klebsiella pneumoniae in Korea. J Antimicrob Chemother 2010; 65(9): 2041-3. 19. Nazik H, Ongen B, Kuvat N. Investigation of plasmid-mediated quinolone resistance among isolates obtained in a Turkish intensive care unit. Jpn J Infect Dis 2008; 61(4): 310-2. 20. Shin JH, Jeong HS, Jung HJ, et al. Prevalence of plasmid-mediated quinolone resistance and its association with extended-spectrum lactamases in clinical isolates in Korea. 19 th ECCMID Congress, 16-19 May 2009, Helsinki, Finland. Abstracts book, Abstract no. P1478. 21. Jacoby GA, Chow N, Waites KB. Prevalence of plasmid-mediated quinolone resistance. Antimicrob Agents Chemother 2003; 47(2): 559-62. 22. Martinez-Martinez L, Pascual A, Jacoby GA. Quinolone resistance from a transferable plasmid. Lancet 1998; 352(9105): 797-9. 23. Robicsek A, Strahilevitz J, Sahm FD, Jacoby GA, Hooper DC. Qnr prevalence in ceftazidime- resistant Enterobacteriaceae isolates from the United States. Antimicrob Agents Chemother 2006; 50(8): 2872-4. 24. Park CH, Robicsek A, Jacoby GA, Sahm D, Hooper DC. Prevalence in the United States of aac(6 )-Ib-cr encoding a ciprofloxacin-modifying enzyme. Antimicrob Agents Chemother 2006; 50(11): 3953-5. 608