INFINITI HPV Genotipleme Testi Kullanım Talimatı

INFINITI HPV Genotipleme Testi Kullanım Talimatı In Vitro Diagnostik Kullanım için SADECE İHRACAT İÇİN Üretim Yeri: AutoGenomics, Inc., 2980 Scott Street, Vista, CA USA 92081 Yetkili AB temsilci: BÜHLMANN Laboratories AG Baselstrasse 55 CH-4124, Schönenbuch, Switzerland Doc EM- 34019E (English) Rev. F (CO 2030) Ocak 2012 1 of 10

KULLANIM AMACI INFINITI HPV Genotipleme denemesi, anormal Pap smir sonuçları (önemi belirsiz, tipik olmayan skuamöz hücreler, ASCUS) olan kadınlarda insan papilloma virüs (HPV) DNA tiplerinin varlığının saptanması ve betimlenmesi amacıyla kullanılmaktadır. INFINITI HPV Genotipleme denemesi, rahim ağzı numunelerinden HPV Tipleri olan tip 6, 11, 16, 18, 26, 30, 31, 33, 34, 35, 39, 45, 51, 52, 53, 56, 58, 59, 66, 67, 68, 69, 70, 73, 82 ve 85 i genotipleyecek biçimde tasarlanmıştır. INFINITI HPV Genotipleme dan elde edilen bilgi hastanın sitoloji geçmişi, diğer risk faktörleri ve ilişkili klinik bilgi ile beraber hasta idaresine rehberlik edebilmektedir. INFINITI HPVQUAD sonuçları, kolposkopi işleminin yerine kullanılamaz. INFINITI HPV QUAD yetkili hekimin reçetesi üzerine klinik laboratuvarlarda kullanılan kalitatif bir denemedir. TEMEL BİLGİLER Genital HPV enfeksiyonuna 100 den fazla farklı aile veya tipi olan insan papilloma virusleri (HPV) sebep olmaktadır. Bu virüslerin 30 dan fazlası seks yoluyla bulaşabilmekte ve kadın ve erkeklerin genital bölgelerinde enfeksiyon oluşturabilmektedir. Aktif seks hayatı olan kadın ve erkeklerin en az %50 si hayatlarının bir noktasında HPV enfeksiyonu geçirmektedirler. 50 yaş üzeri kadınların en az %80 i genital HPV enfeksiyonu edinmesi beklenmektedir. Her yıl 6,2 milyon Amerikalı genital HPV enfeksiyonu edinmektedir. (1) İnsan papilloma virusleri 8000 baz çifti içeren, dairesel, çift sarmallı, protein kılıfa sarılı DNA içeren icosahedral viral partikülden oluşmaktadır. Epitel hücrelerin enfeksiyonunu takiben, viral DNA epitelin tüm kalınlığı boyunca yerleşir ama bozulmamış virionlar sadece dokunun üst tabakalarında bulunur. Bu nedenle viral DNA lezyonun tipine ve derecesine bağlı olarak virionlar halinde ya da epizomal ya da entegre HPV sekansları olarak da bulunabilir. (9,10,11,12) Epidemiyolojik çalışmalar göstermektedir ki; belirli tipteki inatçı HPV enfeksiyonları invasiv rahim ağzı kanseri gelişimi için gerekli bir risk faktörüdür. (2,8) Rahim ağzı intraepitel neoplazisi (CIN 2/3) ile ilişkilendirilen yüksek riskli bu HPV tipleri, her ne kadar coğrafi olarak geniş bir çeşitlilik göstersede, bütün invasiv rahim ağzı kanserlerinin %70 inden sorumlu tutulmaktadır. (2,3) Rahim ağzı kanserine ek olarak, yüksek riskli HPV tipleri rahim, vajina ve anüs kanserlerine de yol açabilmektedir. Kadın genital yolundaki belirli HPV tiplerinin varlığı rahim ağzı, vajinal ve vulvar intraepitel neoplazisi ve Bowenoid papulozis gibi başka hastalıklarla da ilişkilendirilmektedir.. Düşük riskli HPV tipleri olan 6 ve 11 genital siğillerin (condyloma) varlığı ile ilişkilendirilebilir fakat prekanseröz veya kanseröz rahim ağzı değişiklikleri ile seyrek olarak ilişkilidir (4,5,6,7) HPV enfeksiyonunun kansere nasıl dönüştüğü ise henüz tam olarak anlaşılamamıştır. TEST PRENSIBI /TESTE BAKIŞ INFINITI HPV Genotipleme denemesi AutoGenomic tescilli film-temelli microarray teknolojisinin otomasyon, reaktif yönetimi ve yazılım teknolojisi ile kombinlenmesinden faydalanan rahim ağzı numunesinden elde edilen DNA da bulunan HPV genotiplerinin çoklu tespit edilmesinde kullanılan bir yöntemdir. INFINITI HPV Genotipleme aşağıdaki prosese dayanmaktadır: (a) (b) Saflaştırılmış DNA ın PCR amplifikasyonu Amplifike edilmiş PCR ürünlerinin işaretlenmesi 2 of 10

(c) Floresans işaretlenmiş DNA ürünlerinin microarray da hibridizasyonu (d) Mikroarray ın taranması (e) Floresansın tespiti ( HPV tiplerinin saptanması) (f) Sinyal algılanması ve analizi (b) den (f) e kadar basamaklar CE onaylı INFINITI Analizörü ile otomatik yapılmaktadır. Testin şematik özeti aşağıdadır; AutoGenomics CİHAZ TANIMI INFINITI HPV Genotipleme denemesi rahim ağzı numunesinde mevcut HPV tiplerinin ( Tip 6, 11, 16, 18, 26, 30, 31, 33, 34, 35, 39, 45, 51, 52, 53, 56, 58, 59, 66, 67, 68, 69, 70, 73, 82 ve 85) tespit edilmesinde kullanılan polimeraz zincir reaksiyonu (PCR), microarrayler, termal cycler, kamera ve yazılımdan oluşan in vitro diagnostik bir yöntemdir. Rahim ağzı numune tiplerinin içeriği; Numuneler süpürge tipi toplama aracı kullanılarak toplanır ve Cytyc ThinPrep Pap Test PreserveCyt Solüsyonu içerisinde muhafaza edilir. INFINITI HPV-QUAD BioFilmChip Microarray, Intellipac Reaktif Modülü, ve PCR Amplifikasyon Mix inden oluşmaktadır. INFINITI HPV- QUAD için enstrümentasyon Qmatic İşletim Yazılımı içeren AutoGenomics INFINITI Analizörüdür. INFINITI Analizör CE onaylıdır. BioFilmChip Microarray DNA analizleri için tasarlanmış tescilli çoklu tabaka komponent ile kaplı polyester filmlerden meydana gelmiştir. Tabakalar, test performansını arttırmak için çok amaçlı bir yüzey sağlamak üzere tasarlanmıştır. INFINITI HPV Genotipleme, film yüzeyindeki spotlara hapsolmuş probları olan bir mikroarray çip ( P- Chip ) kullanır. Bir magazinde on iki (12) mikroarray bulunmaktadır. Intellipac Reaktif Modülü, test reaktiflerinin yerleştirildiği ve bütünleşmiş hafıza çipinin bulunduğu bir iletişim hattıdır. Lot numarası, son kullanma tarihi, miktar kullanımı gibi reaktif bilgileri hafıza çipinde arşivlenmektedir. Intellipac Reaktif Modülü, INFINITI Analizörü ile iletişime geçerek deneme raporu ve çıktısında görülebilen reaktif bilgisini sağlar. Intellipac Reaktif Modülü 24 örneğe yetecek test reaktifi içermektedir. 3 of 10

PCR Amplifikasyon Mix i denemenin PCR amplifikasyonu basamağı için gerekli olan reaktiflerden oluşmaktadır. Her PCR Amplifikasyon Mix kutusunda dört (4) adet 500μl lik PCR Amplifikasyon mixi içeren vial bulunmaktadır. INFINITI Analizör INFINITI HPV Genotipleme denemesini otomatikleştirmiş ve örneklerin(pcr ürünü) dağıtımı, reaktif yönetimi, hibridizasyon, tesbit ve sonuç analizi gibi farklı proseslerin bütünleştirilmesini sağlamıştır. Test otomatik olarak tamamlanmakta ve aynı odaklı dâhili bir mikroskop tarafından okunmaktadır. Sonuçlar HPV genotiplerinin varlığı veya yokluğu bazında analiz edilmekte ve sunulmaktadır. INFINITI Analizörü, INFINITI Analizörü Kullanıcı El Kitabı ile beraber gelmektedir. Kullanıcı El Kitabı INFINITI Analizörü nün detaylı tanımı, çalışma prensiplerini ve kullanma talimatlarını içermektedir. INFINITI Analizatörü CE onaylıdır. UYARILAR VE ÖNLEMLER Gereksinimler In vitro diagnostik kullanım için. Eğitimli laboratuar personeli tarafından kullanılmalıdır. Bu test, sadece Cytyc ThinPrep Pap Test PreserveCyt Solüsyonu içinde toplanan rahim ağzı numunesi ile çalışılmalıdır. Çapraz kontaminasyon riskini en aza indirmek için, numune hazırlama, PCR reaksiyonunun hazırlığı ve PCR ürünü analizi gibi işlemler, CLSI (Molecular Diagnostic Methods for Genetic Diseases: Approved Guideline) de onaylanan talimatlara göre yapılmalıdır. Tüm hasta numuneleri potansiyel tehlike taşımaktadır ve insan kaynaklı materyaller çok dikkatli işlenmelidir. Hiçbir test yöntemi HCV, HIV veya diğer bulaşıcı ajanların bulunmadığına dair tam bir güvence vermez. CLSI talimatlarını takip ediniz (Molecular Diagnostics Methods for Infectious Diseases; Approved Guidelines; MM3-A). Farklı lotlardan reaktifleri karıştırmayın/havuz yapmayın. Son kullanım tarihi geçmiş kit veya reaktifleri kullanmayın. Reaktifleri ve kitleri ürün etiketine yazan koşullara göre saklayın. Laboratuar İşlemleri Laboratuar kullanımı için normal önlemleri izleyin. Ayrı kaplarda veya farklı lotlardaki reaktifleri karıştırmayın. Güvenli laboratuar prosedürlerini izleyin: ağız ile pipetleme yapmayın, koruyucu giysiler (örneğin, tek kullanımlık eldiven, laboratuar önlüğü gibi) giyin ve koruyucu gözlük takın, laboratuarda çalışma alanlarında yemek yemeyin, içecek veya sigara içmeyin. Numunelere ve reaktiflere dokunduktan sonra ellerinizi iyice yıkayın. Atıkların İşlenmesi Kullanılmayan reaktifleri, örnekleri ve atıkları bulunduğu ülke, federal, eyalet ve yerel yönetmeliklere göre imha edin. 4 of 10

Malzeme Güvenlik Bilgi Formları (MSDS) AutoGenomics Müşteri Hizmetleri tarafından istek üzerine gönderilebilir. Örnek Hazırlama Örnek uygulama kiti ile birlikte verilen prospektüsteki talimatlara bakın. INFINITI Analizörü Cihazı kullanmadan önce INFINITI Analizör Kullanıcı El Kitabı nı okuyun. "Notlar" a özellikle dikkat edin. Kullanıcı El Kitabı ndaki Güvenlik Uyarıları ve Dikkat Edilmesi Gerekenler i izleyin. Cihaz çalışırken hata ile karşılaşıldığında Hatalar Bölümü ne bakın. Sorunla karşılaşıldığında Yardım Bölümü ne bakın. SAKLAMA/STABILITE BioFilmChip Microarray: 12 ay Oda Sıcaklığında (15 C ila 30 C) Intellipac Reaktifi: 12 ay Buzdolabında (2 C ila 8 C) Not: Açıldıktan 3 hafta sonra Intellipac ı kullanmayın. Amplifikasyon Mix: 18 ay Dondurucuda (-30 C ila -15 C) Not: Ürünlerin son kullanma tarihi ürün üzerindeki etiketlerde bulunmaktadır. NUMUNE TOPLAMA VE STABILITE INFINITI HPV-QUAD da kullanılmak üzere ThinPrep (Cytyc Corp.) rahim ağzı numunesi önerilmektedir. Başka örnek toplama aparatları ile toplanan veya başka nakliye araçları ile nakliye edilen numuneler bu denemede kullanılmak için yeterli değildir. ThinPrep Pap testinin yapılmasında kullanılan numuneler süpürge tipi alet ile alınmalı ve Cytyc PreservCyt solüsyonunda saklanmalıdır. PreservCyt Solüsyonu numuneleri INFINITI HPV-QUAD denemesi prosedürüne uygun toplandığı taktirde 4 C ile 37 C aralığında 3 haftaya kadar korunabilir. PreservCyt solüsyonu dondurulmamalıdır. SAĞLANAN MATERYALLER (192 Test için yeterli.) AutoGenomics Ürün kodu 02-1050-02 HPV - QUAD Magazine BioFilmChip Microarray: Her kutuda 4 magazin bulunmaktadır. AutoGenomics Ürün Kodu 02-2050-02 HPV Genotipleme Intellipac Reaktif Yönetim Modülü: Her kutuda 2 modül, her modülde 24 test bulunmaktadır, içeriği; 1.1ml Reaksiyon Master mix dntp ler 5 of 10

Cy5-dCTP Analite Spesifik Primerler Ekstansiyon Reaksiyonu Tamponu AutoGenomics 2.6ml Hibridizasyon Tamponu SSC Hibridizasyon Pozitif Kontrol AutoGenomics Ürün Kodu 02-3050-02 HPV Genotipleme Amp Mix: 4 x 500μl vial PCR reaksiyon master mix içeriği; dntp ler Multiplex Primer Mix MgCl 2 PCR Reaksiyonu Tamponu AutoGenomics Ürün Kodu 12-0010-00 Yıkama Tamponu AutoGenomics Ürün Kodu 12-0040-00 HPV Tip 16 DNA Template Kontrol AutoGenomics Ürün Kodu 12-0050-00 HPV Tip 18 DNA Template Kontrol AutoGenomics Ürün Kodu 12-0060-00 HPV Tip 31 DNA Template Kontrol AutoGenomics Ürün Kodu 12-0070-00 HPV Tip 33 DNA Template Kontrol AutoGenomics Ürün Kodu 12-0080-00 HPV Tip45 DNA Template Kontrol AutoGenomics Ürün Kodu 12-0090-00 HPV Combo paketi (Tip 16, 18, 31, 33, 45) DNA Template Kontrol GEREKEN VE AUTOGENOMICS TARAFINDAN SAĞLANMAYAN REAKTİFLER DNA Reaksiyon Kitleri - Ticari olarak bulunan ekstraksiyon kitleri INFINITI HPV-QUAD denemesi için kullanılabilir. DNA örnekleri suda veya TE (ph 8.) de yeniden çözülebilir. Minimum final DNA konsantrasyonu 10 ng/ μl olmalıdır. DNA nın saflık oranı 1.60 olmalıdır. Distile su (DNAaz ve RNAaz sız) Platin Taq DNA Polimeraz ( Tavsiye edilen Platin Taq DNA Polimeraz ve tedarikçi için AutoGenomics Ürün Kataloğuna başvurunuz.), EKİPMANLAR Aşağıdaki ekipmanlar gereklidir fakat test ile beraber sağlanmamaktadır: AutoGenomics Ürün Kodu 10-0010-00: INFINITI Analizatör - Qmatic işletme software ile AutoGenomics Ürün Kodu 11-0080-00: INFINITI Pipet uçları AutoGenomics Ürün Kodu 11-0030-00: INFINITI 24 kuyucuklu plate/lidleri Pipetler Mini santrifüj Mikrofüj tüp rakları Termocycler Vortex 0.2 ml inceliğinde wall tüpleri PCR için 6 of 10

1.5 ml mikrosantrifüj tüpleri 24 Kuyucuklu Plate AutoGenomics TEST PROSEDÜRÜ DNA Ekstraksiyonu Kullanılan kit ile birlikte verilen talimatları izleyin.. DNA örnekleri suda veya TE (ph 8.) de yeniden çözülebilir. Minimum final DNA konsantrasyonu 10 ng/ μl olmalıdır. DNA nın saflık oranı 1.60 olmalıdır. DNA Kontrolleri Pozitif kontrol ve HPV siz template kontrolünün( moleküler derecede su veya HPV siz insan DNA sı) her teste dahil edilmesi önerilir. HPV siz kontrol, kontaminasyon kontrolü olarak kullanılır. Eğer bu kontrol pozitif ise, gerekli önlemler alınarak örnekler yeniden çalışılmalıdır. AutoGenomics den sağlanabilecek aşağıdaki pozitif kontrollerin HPV QUAD ile kullanılması önerilmektedir. (REAGENTS REQUIRED bölümünden ürün kodu ile ) (a) HPV Tip 16 DNA Template Kontrol (b) HPV Tip 18 DNA Template Kontrol (c) HPV Tip 31 DNA Template Kontrol (d) HPV Tip 33 DNA Template Kontrol (e) HPV Tip 45 DNA Template Kontrol veya (f) HPV Combo paketi (Type 16, 18, 31, 33, 45) DNA Template Kontrol Not: Reaktiflerin kontroller ile kontaminasyonunu engellemek için lütfen uygun PCR tekniklerini kullanın. Çapraz kontaminasyonu engellemek için HPV kontrolleri konmadan önce HPV DNA örnekleri ve no template kontrol içeren 24'lük WP'lerin kapaklanması önerilir. Amplifikasyon Reaksiyonu Not: Platin Taq DNA polimeraz buz üstünde tutun. Reaktifleri oda sıcaklığında çözüp hemen buz içerisinde muhafaza edin. Amplifikasyon Mix tüpünü 2 5 sn santrifüj edin. Kontaminasyondan kaçınmak için PCR reaksiyonu için ayrı bir alan ayarlayın. Pipetleri ve tüm çalışma alanlarını taze hazırlanmış %10 luk çamaşır suyu ile dezenfekte edin. Örnekleri ve kontrolleri çalışırken değişik filtre ipuçları ve eldiven kullanılmalıdır. Buharlaşma veya saçılma olmaması için tüplerin kapağının kapalı olduğundan emin olun. PCR ürünlerinde anormal bir buharlaşma olmadığından emin olun. PCR tamamlandıktan sonra herhangi bir hacim değişimine karşı, gözlemleyin. Bütün amplikasyon reaksiyonu hacimleri yaklaşık 20 μl olmalıdır. Aksi durumda denemeyi gerçekleştirmeyin. 7 of 10

1. 1. PCR Master Mix i hazırlayın. Amplifikasyon mix 14.75 µl Platin Taq Polimeraz 0.25 µl PCR Master mix in toplam hacmi 15.00 µl Not: Kullanılacak reaktif miktarını çalışılan reaksiyon sayısına bağlı olarak hesaplayın. 2. PCR master mix i hafifçe vortexleyin. Master mix i 15 μl olmak üzere 24-kuyucuklu plate lere doldurun 3. Her kuyucuğa 5 μl örnek veya kontrol DNA sı ekleyin PCR master mix 15.0 µl Örnek veya kontrol DNA 5.0 µl PCR Master mix in toplam hacmi 20.0 µl 44. 24-kuyucuklu platei 8-kuyucuklu flat strip kapakları ile kapattıktan sonra süratle thermocyclera yerleştirin ve aşağıdaki programı kullanarak amplifikasyon reaksiyonunu başlatın. Basamaklar Sıcaklık C Süre (sec) Döngü Sayısı 1 94 120 1 2a 2b 2c 94 58-50 (-0.8/cycle) 72 5 60 40 10x 3a 3b 3c 94 50 72 5 60 40 4 4 hold 1 30x Not: Basamak 2b de her döngüde ısı 0,8 C düşmektedir. Eppendorf Mastercycler EP kullanıldığında ramp rate kurulumu %75 olduğunda total döngü için geçen zaman 1 saat 48 dakdır (±5 dak.). Diğer Termal Cycler lar kullanıldığında eş zamanı elde edecek şekilde ramp ayarı yapınız. Örnek Yükleme Lütfen INFINITI Analizör Kullanıcı El Kitabı na bakın (Kısım kodu: EM 34000). 24-WP, teste özgü magazin ve Intellipack ı, pipet uçları ve yıkama solusüsyonlarını INFINITI Analizöre yükleyiniz. INFINITI Analizör ün İşleyişi 8 of 10

Lütfen INFINITI Analizör Kullanıcı El Kitabı na bakın (Kısım kodu: EM 34000) KALİTE KONTROL Termal cyclerın düzenli aralıklarla AutoGenomics 'özelliklerine göre bakımı yapılmalı ve kalibre edilmelidir. KISITLAMALAR INFINITI HPV Genotipleme denemesinden elde edilen sonuçlar sadece genel klinik tanı bağlamında yorumlanmalıdır. AutoGenomics alınan herhangi bir klinik karardan sorumlu değildir. SONUÇLARIN YORUMLANMASI INFINITI HPV Genotipleme denemesinden elde edilen sonuçlar, tesbit edilen her HPV DNA tipine bağlı olarak Pozitif veya Negatif olarak verilmektedir. Beta globin gen kontrolü, yetersiz örnek miktarı içeren numuneleri tespit etmek amacıyla kullanılır. Geçerli bir çalışma için, numune sonuçları aşağıdaki gibi yorumlanmıştır; HPV Sonuçları Bütün HPV Tipleri Negatif Beta globin (BG) Sonuçları Pozitif YORUMLAMA HPV Negatif Bütün HPV Tipleri Negatif Negatif Geçersiz Test Sonucu Bir HPV Tipi Pozitif Pozitif veya Negatif Geçerli Test Sonucu Analizör bir problem veya hata tespit eder ise hiçbir sonuç rapor edilmeyecektir. Bunun yerine problemin tanımı veya hata kodu görüntülenecektir. INFINITI Kullanıcı El Kitabı nin Sorun Giderme Bölümü nde hatanın açıklaması bulunmaktadır. Denemenin tekrar edilmesi gerekmektedir. ATIK INFINITI HPV genotipleme testi atıkları, laboratuarlarda meydana gelen yaygın çöplerdendir ve klinik laboratuarın politika/prosedürlerine uygun olarak işlem görmelidirler. PERFORMANS ÖZELLİKLERİ Analitik Spesifite Özgüllük ile ilgili çalışmalar denemenin geliştirilmesi sırasında yapılmıştır. PCR primer özgünlüğü bir jel üzerinde amplikon boyutuna göre belirlenmiş ve amplikon sıralaması yapılmışır. ASP primer özgünlüğü bilinen genomik örnekler kullanılarak test tarafından gönderilen doğru genotipler ile tespit edilmiştir. Probun yakalama özgüllüğü farklı oligoların hibridizasyonu ile tespit edilmiştir ve bilinen noktaya doğru oligo hibridleşmesini göstermektedir. 9 of 10

Analitik Duyarlılık AutoGenomics Analitik duyarlılık çalışmaları rahim ağzı kanserinden sorumlu en yaygın iki yüksek riskli HPV tipleri olan tip 16 ve 18 üzeriden yapılmıştır. (Referans: John Schiller, Ph.D.- National Cancer Institute, US Dept. of Health and Human Services). HPV DNA örnekleri tip 16 (Siha) ve tip 18 (Hela) INFINITI HPV Genotipleme denemesinin tesbit seviyesini ölçmek için kullanılmıştır. Aşağıdaki tablo çalışmanın sonuçlarını göstermektedir. Moleküler su ile bir seri sulandırma yapılmıştır. HPV Tipi Ölçülebilen en düşük seviye DNA kopyalarının sayısı Çalışmada test edilen örnek konsantrasyonları Çalışmada test edilen örnek konsantrasyonları Ölçülebilen en yüksek seviye DNA kopyalarının sayısı Tip - 16 0.0625 ng DNA/μl 62.5-125 100 ng DNA/μl 100,000-200,000 Tip - 18 0.25 ng DNA/μl 2,500-7,500 100 ng DNA/μl 1,000,000-5,000,000 Not: Klinik numunelerde, HPV tip 16 en yüksek kopya sayısında gözlenmektedir. 16 Pozitif HPV klinik numunesinde %55 in üzerinde bir oranla 10 8 kopya/μg dan fazla ekstrakte DNA içerdiği tespit edilmiştir. Tip 16 için normal sitoloji 2.2 x 10 7 kopya/μg dır. Viral türler arasında, Medyan DNA kopya sayısı >10 4 (15) Örnek Taşınması ( Carry-over) INFINITI HPV ile yapılan örnek taşınması çalışmaları sonucunda örnek taşınması gözlenmemiştir. İki tür plazmid DNA sı kullanılmıştır ( tip 16 ve 31). Su, No Template Kontrol lü olarak çalışılmıştır. Bütün çağrılar %100 doğru, bütün su çağrıları beklendiği gibidir(ntc). Örnek taşınması kontaminasyonu gözlenmemiştir. Kan ve Diğer İçeriklerden Kaynaklı Olası İnterferanslar Tam kan, şırınga, mantar önleyici krem ve kontraseptif jöle ( rahim ağzı numunesinde yaygın olarak bulunması muhtemel ajanlar) gibi maddeler rahim ağzında bulunması muhtemel konsantrasyonlarda INFINITI HPVGenotipleme denemesini etkilememektedir. Deneme Interferansı Farklı denemelerin aynı INFINITI Analizöründe çalışılması interferansa sebep olmamaktadır. Klinik Geçerliliği INFINITI HPV Genotipleme denemesi, klinik amaçlarla kullanılabilirliğini tespit etmek için bağımsız klinik referans laboratuvarlarınca değerlendirilmiştir. Klinik geçerlilik çalışmaları göstermiştir ki; INFINITI HPV Genotipleme denemesi, deneme için yayımlanmış prosedürlere uygun olması kaidesiyle klinik koşullarda (AutoGenomics den bağımsız) çalışılmaya uygundur. Değerlendirme ayrıca INFINITI HPV Genotiplendirme Testi için tekrarlanabilirliği hakkında bilgi (hücre denetimleri kullanarak) sağlamaktadır. 10 of 10

Çalışma içinde tekrarlanabilirlik (Her sefer için 5 tekrar) % uyum % CV çip sinyalleri içinde % CV çip sinyalleri arasında % CV çip oranları arasında CaSki (HPV16) 100% 0.5 to 5.8% 20.7% (5 çip) 35.9% (5 çip) HeLa (HPV18) 100% (5 çip, n=2) 9.8% (5 çip) 17.7% (5 çip) Çalışmalar arası tekrarlanabilirlik % uyum % CV çalışma sinyalleri arasında % CV çalışma oranları arasında 12 runs CaSki (HPV16) 100% 21.4% (n=24) 34% (n=12) 17 runs HeLa (HPV18) 100% 24.4% (n=34) 32% (n=17) REFERANSLAR 1. Kulasingam, S; Hughes, J et al. Evaluation of Human Papillomavirus Testing in primary Screening for Cervical Abnormalities. JAMA October 2002 Vol 288 p 1749. 2. Munoz N, Bosch FX, de Sanjose S et al., CJLM.2003. Epidemiologic classification of human papillomavirus types associated with cervical cancer. N Engl J Med 348:518-527 3 G.M. Clifford, J.S. Smith, M. Plummer, N. Munoz and S. Franceschi, Human papillomavirus types in invasive cervical cancer worldwide: a meta-analysis, Br. J. Cancer 88 (2003) pp. 63-73 4 Jenson AB, Kurman RJ, Lancaster WD. Human Papillomaviruses. In: Belshe RB, editor. Textbook of Human Virology. Littleton, MA: PSG-Wright; 1984. p. 951-68. 5 Bosch FX, Lorincz A, Munoz N, Meijer CJLM, Shah KV. The casual relation between human papillomavirus and cervical cancer. J Clin Pathol 2002 Apr; 55(4):244-65. 6. J. Walboomers, M. Jacobs, M.m. Manos et al., Human papillomavirus is a necessary cause of invasive cervical cancer worldwide, J Pathol 189 (1999) pp. 12-19 7. Doorbar, J. The papillomavirus life cycle. Journal of Clinical Virology, Volume 32 March 2005 p.7-15. 8. Ho et al., 1995; Remmink et al., 1995; Bosch et al., 2002; Kjaer et al., 2002) 9. Klug, S, Molijn, A et al. Comparison of the Performance of Different HPV Genotyping Methods for Detecting Genital HPV Types. Journal of Medical Virology 80:1264-1274 (2008). 10. International Agency for Research on Cancer (IARC) Working Group on the Evaluation of Carcinogenic Risks to Humans. Human Papillomaviruses. Lyon, France: World Health Organization; 1995. IARC Monographs on the Evaluation of Carcinogenic Risks to Humans. Vol. 64 11. Berek, Jonathan S., Practical Gynecologic Oncology, Lippincot Wiliams, Fourth Edition. 12. Pfister H. Biology and biochemistry of papillomaviruses Rev Physiol Biochem Pharmacol 1983;. 13. Broker TR. Structure and genetic expression of human papillomaviruses. Obstet Gynecol Clin North Am 1987:14:329-348. 11 of 10

14. Delius H, Hofman B. Primer-directed sequencing of human papillomavirus types. Curr Top Microbiol Immunol 1994;186:13-31. 15. Swan DC et al Human Papilloma (HPV) DNA Copy Number Is Dependent on Grade of cervical Disease and HPV Type. Journal of Clinical Microbiology April 1999 p 1030-1034 Vol 37 No 4 12 of 10