Meropenem E-test, Bacteroides fragilis Suşlarında Karbapenem Direnç Geni cfia Varlığını Tahmin Etmede Kullanılabilir mi?*



Benzer belgeler
Karbapenemlere dirençli Bacteroides fragilis grubu bakterilerin varlığını araştırmak için rektal sürüntü örnekleriyle tarama

Duyarlılık testleri vetürkiye verileri: Anaeroblar Dr. Nurver Ülger (Toprak) Marmara Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD

Marmara Üniversitesi Hastanesi nde İzole Edilen İlk Metronidazole Dirençli Bacteroides Kökeni: Bacteroides thetaiotaomicron*

Enzimlerinin Saptanmasında

Enterobacteriaceae Ġzolatlarında Karbapenemazların Saptanmasında Modifiye Hodge Testi ve Carba NP Testlerinin Karşılaştırılması

Emrah Salman, Zeynep Ceren Karahan Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi. Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

Makrolid dirençli Staphylococcus aureus ile kolonize kistik fibrozis hastalarında MLS B direnç genlerinde yıllar içerisinde değişim var mı?

Kırıkkale Üniversitesi Tıp Fakültesi Cerrahi Yoğun Bakım Ünitesinde Yıllarında İzole Edilen Mikroorganizmalar ve Antibiyotik Duyarlılıkları

Rutin anaerop tanımlama yapmıyorsak neyi kaçırıyoruz?

Antimikrobiyal tedavide yeni yaklaşım: Doripenem. İn vitro Veriler. Prof.Dr.Güner Söyletir Marmara Üniversitesi Tıp Fakültesi, İstanbul

Yard.Doç.Dr. Dolunay Gülmez

Çocuk ve Yetişkin Üriner Escherichia coli İzolatlarında Plazmidik Kinolon Direnç Genlerinin Araştırılması

Prof.Dr.Ayşe Willke Topcu KLİMİK AYLIK TOPLANTISI 19 KASIM 2015, İSTANBUL

Genişlemiş Spektrumlu Beta-Laktamaz Üreten Gram Negatif Kan İzolatları: Karbapenemlere Duyarlılık ve Fenotipik/Genotipik Direnç Mekanizmaları

Emine Zuhal Kalaycı Çekin 1, Gülşah Malkoçoğlu 3, Nicolas Fortineau 2, Banu Bayraktar 1, Thierry Naas 2, Elif Aktaş 1

STANDARDİZASYON KURUMLARI VE TÜRKİYE

Riskli Ünitelerde Yatan Hastalarda Karbapenemaz Üreten Enterobacteriaceae taranması

Klinik Örneklerden İzole Edilen Gram Negatif Bakterilerde Doripenem ve Diğer Karbapenemlerin İn-Vitro Etkinliklerinin Karşılaştırılması

Anaerop Haber Haziran 2015 sayısının konu başlığı : Yurt içi / yurt dışı anaerop yayınlar

İdrar Örneklerinden İzole Edilen Bakteriler ve Antibiyotiklere Duyarlılıkları

ACINETOBACTER BAUMANNII KLİNİK İZOLATLARININ TİGESİKLİN VE KARBAPENEME KARŞI İN VİTRO DUYARLILIKLARI*

SAĞLIK HİZMETİ İLE İLİŞKİLİ KLEBSİELLA ENFEKSİYONLARI

Prof.Dr. Müzeyyen MAMAL TORUN. İ.Ü.Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

Steril pyrüili böbrek nakli hastalarında gerçek zamanlı multipleks polimeraz zincir reaksiyon test sonuçları

Sorunlu Mikroorganizmalar, Sorunlu Antibiyotikler ve E Test. Prof.Dr.Güner Söyletir Marmara Üniversitesi, İstanbul

Direnç hızla artıyor!!!!

Antibiyotik Direncinde Laboratuvar

Karbapenem dirençli Klebsiella pneumoniae suşlarında OXA-48 direnç geninin araştırılması

KISA BİLDİRİ: ANKARA İLİNDEKİ SEKS ÇALIŞANLARINDAN İZOLE EDİLEN NEISSERIA GONORRHOEAE SUŞLARININ ANTİMİKROBİYALLERE KARŞI DİRENÇ DURUMU*

POLİMİKSİN B NİN İMİPENEME DİRENÇLİ ACINETOBACTER BAUMANNII SUŞLARINA KARŞI İN-VİTRO AKTİVİTESİ*

Olgularla Antimikrobiyal Duyarlılık Testleri (Gram Negatif Bakteriler)

PSEUDOMONAS AERUGINOSA VE ACINETOBACTER BAUMANNII SUŞLARINDA BD PHOENIX SİSTEMİ İLE SAPTANAN KARBAPENEM DİRENCİNİ RAPORLAYALIM MI?

Acinetobacter baumannii'de kolistin direncine yol açan klinik ve moleküler etkenler

Yoğun Bakım Ünitesinde Gelişen Kandida Enfeksiyonları ve Mortaliteyi Etkileyen Risk Faktörleri

Anaerop Mikrobiyolojinin Yaşam Boyu Başarı Ödülü Almış Anaerop Çalışanları

Karbapenemaz Üreten Enterobacteriaceae

N. Tiryakioğlu, B. Aksu, M. U. Hasdemir. Marmara Üni. Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, İstanbul

Enfeksiyon odaklarından izole edilen Gram negatif ve Gram pozitif bakterilerde antimikrobiyal duyarlılık sonuçları

Kolistine Dirençli E. coli Suşuyla Gelişen ÜSİ Olgusu ve Sonuçlar

HEMATOLOJİK MALİGNİTELİ OLGUDA KLEBSİELLA PNEUMONİAE İLE GELİŞEN BAKTEREMİ OLGUSU VE TEDAVİ SEÇENEKLERİ

MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS KOMPLEKS KLİNİK İZOLATLARINDA İZONİAZİD DİRENCİNE NEDEN OLAN DIŞA ATIM POMPALARININ SAPTANMASI

İdrar Örneklerinden İzole Edilen Escherichia coli Suşlarında Genişlemiş Spektrumlu BetaLaktamaz Üretimi ve Antibiyotiklere Direnç Oranları

STREPTOMİSİNE DİRENÇLİ MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS KOMPLEKS İZOLATLARINDA rpsl VE rrs GEN BÖLGESİ MUTASYONLARININ ARAŞTIRILMASI*

Gram-Negatif Bakterilerde Direncin Laboratuvar Tanısı ve Yorumlanması

Özgün Çalışma/Original Article. Mikrobiyol Bul 2008; 42:

METİSİLİNE DİRENÇLİ STAPHYLOCOCCUS AUREUS VE VANKOMİSİNE DİRENÇLİ ENTEROKOK SUŞLARININ İN VİTRO LİNEZOLİD DUYARLILIĞI

Kandan izole edilen Escherichia coli suşlarında antimikrobiyal duyarlılık : EARSS

TÜBERKÜLOZUN MOLEKÜLER TANISINDA GÜNCEL DURUM

Tepecik Eğitim ve Araştırma Hastanesi Yoğun Bakım Ünitelerinden İzole Edilen Gram-Negatif Suşlarda Doripenem Duyarlılığı

Klinik Örneklerden İzole Edilen Acinetobacter baumannii Suşlarında Beta-Laktamaz Kaynaklı Direncin Moleküler Karakterizasyonu*

ACINETOBACTER BAUMANNII VE PSEUDOMONAS AERUGINOSA SUŞLARINDA KARBAPENEM DUYARLILIĞINDA DİSK DİFÜZYON TESTİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ

Özgün Çalışma/Original Article. Mikrobiyol Bul 2009; 43: Erdinç GÜLDEN 1, Şafak ERMERTCAN 1 ÖZET

Karbapenemlerin Gram-Negatif Patojenlere Karşı İn Vitro Aktivitelerinin Karşılaştırmalı Değerlendirmesi: COMPACT Çalışması Türkiye Verisi*

Antimikrobiyal Yönetimi Prof. Dr. Haluk ERAKSOY

Antimikrobiyal Duyarlılık Testleri (AMD) Hangi Durumlarda Yapılmalı? Genel kavramlar

Yrd.Doç.Dr. Gülçin BAYRAMOĞLU KTÜ Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD. TRABZON

Olgularla Klinik Bakteriyoloji: Antibiyotik Duyarlılık Testleri Yorumları. Dilara Öğünç Gülçin Bayramoğlu Onur Karatuna

Klinik Örneklerinden İzole Edilen Pseudomonas Aeruginosa Suşlarının Antibiyotik Duyarlılıkları

Karbapenem Gerekmez Funda TİMURKAYNAK Başkent Üniversitesi İstanbul Hastanesi

ANTİBİYOTİK DUYARLILIĞI VE DİRENÇLERİN YORUMLANMASINDA UZMAN SİSTEMLERİN ROLÜ

Dr. Aysun Yalçı Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi İbn-i Sina Hastanesi Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji

Yoğun Bakımlarda İnfeksiyon Kontrolü: Haricen Klorheksidin Uygulanmalı mı?

* 1. Uluslararası Orta Asya İnfeksiyon Hastalıkları Kongresi (ICCAID, 30 Ekim - 2 Kasım 2006, Bişkek, Kırgızistan) nde poster olarak sunulmuştur.

JCEI / 2015; 6 (3):

Acinetobacter baumannii İzolatlarında bla OXA Genlerinin Dağılımı: Çok Merkezli Bir Çalışma*

Komplike deri ve yumuşak doku enfeksiyonu etkeni çoklu dirençli patojenlerin bakteriyofaj duyarlılıklarının araştırılması

Klinik Örneklerden İzole Edilen E.coli Suşlarının Kümülatif Antibiyotik Duyarlılıklarının Belirlenmesi

ANTİFUNGAL DİRENÇ MEKANİZMALARI ve DUYARLILIK TESTLERİ. Nilgün ÇERİKÇİOĞLU 2014 MARMARA ÜNİVERSİTESİ TIP FAKÜLTESİ TIBBİ MİKROBİYOLOJİ AD

Dirençli Gram Negatif Bakteri Enfeksiyonlarında Kombinasyon Tedavisi

Toplum başlangıçlı Escherichia coli

Epidemiyolojik Çalışmalar

GENİŞLEMİŞ SPEKTRUMLU BETA-LAKTAMAZ ÜRETEN SUŞLARIN TANISINDA İKİ FARKLI KROMOJENİK AGARIN PERFORMANSI

ANTIBIOTIC RESISTANCE IN STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE STRAINS ISOLATED FROM STERILE BODY SITES. Öznur AK*, Serdar ÖZER*, Nur A.

Doripenem: Klinik Uygulamadaki Yeri

Non-Fermentatif Gram Negatif Basillerde Metallo-Βeta-Laktamaz Varlığının Araştırılması

PSEUDOMONAS AERUGINOSA İZOLATLARININ ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARININ DEĞERLENDİRMESİ: ÇEŞİTLİ ANTİBİYOTİKLERE AZALAN DUYARLILIK*

GİRİŞ. Kan dolaşımı enfeksiyonları (KDE) önemli morbidite ve mortalite sebebi. ABD de yılda KDE, mortalite % 35-60

Febril Nötropenik Hastada Antimikrobiyal Direnç Sorunu : Kliniğe Yansımalar

Klinik Örneklerden İzole Edilen Çoğul Dirençli Acinetobacter baumannii Suşlarında Kolistin, Polimiksin B ve Tigesiklinin İn Vitro Etkinliği

Anaerop Bakterilerin Duyarlılık Testleri ve Direnç Durumu

Hacettepe Üniversitesi Fen Fakültesi Biyoloji Lisans 2003

ERİŞKİN HASTALARDAN İZOLE EDİLEN ACINETOBACTER TÜRLERİNDE ANTİMİKROBİYAL DİRENÇ VE METALLO-BETA-LAKTAMAZ VARLIĞI*

İdrar kültürlerinden soyutlanan Enterobacteriaceae türlerinin GSBL üretimi ile ertapenem ve diğer antibiyotiklere direncinin belirlenmesi

KLİNİK ÖRNEKLERDE GERÇEK ZAMANLI MULTİPLEKS POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU YÖNTEMİYLE AKUT BAKTERİYEL MENENJİT TANISI

Comparison of Susceptibility of Escherichia coli Strains Isolated from Urinary System Infections to Ciprofloxacin and Other Antibiotics

OXA-48 in Saptanmasına Yönelik İzotermal Rekombinaz Polimeraz Amplifikasyon Yöntemine Dayalı Bir Hızlı Moleküler Test Formatının Geliştirilmesi

ACINETOBACTER BAUMANII VE PSEUDOMONAS AERUGINOSA İZOLATLARINDA METALLO-BETA-LAKTAMAZ ÜRETİMİNİN DÖRT FARKLI FENOTİPİK YÖNTEMLE ARAŞTIRILMASI

Dr. Orhan YILDIZ Erciyes Üniversitesi Tıp Fakültesi Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji A.D.

İzmir Atatürk Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Servisi, İZMİR ÖZET SUMMARY

OLGULARLA ANAEROP BAKTERİYOLOJİ. Dr. F. Ferda Tunçkanat Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

ANTİBİYOTİK DUYARLILIK TEST SİSTEMLERİNİN VERİFİKASYONU

Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Vankomisin Dirençli Enterokokların Antibiyotik Duyarlılıkları

Pınar ZARAKOLU*, Gülşen HASÇELİK**, Serhat ÜNAL*

KAN KÜLTÜRLERİNDEN İZOLE EDİLEN ACINETOBACTER BAUMANNII SUŞLARINDA ANTİBİYOTİK DİRENCİ

TÜBERKÜLOZ DIŞI MİKOBAKTERİLER (TDM)

Araştırma. Harun AĞCA 2011 DEÜ TIP FAKÜLTESİ DERGİSİ CİLT 25, SAYI 3, (EYLÜL) 2011,

Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Enfeksiyon Hastalıkları Anabilim Dalı

İmipeneme Dirençli Acinetobacter baumannii İzolatlarında Kolistin-Ampisilin/Sulbaktam Kombinasyonu Etkinliğinin Değerlendirilmesi*

Karbapeneme Dirençli Acinetobacter baumannii Suşlarında Kolistin/Sulbaktam Kombinasyonu Etkinliğinin Değerlendirilmesi

Transkript:

Özgün Çalışma/Original Article Mikrobiyol Bul 2011; 45(3): 385-391 Meropenem E-test, Bacteroides fragilis Suşlarında Karbapenem Direnç Geni cfia Varlığını Tahmin Etmede Kullanılabilir mi?* Can Meropenem E-test be Used to Estimate the Presence of Carbapenem Resistance Gene cfia Among Bacteroides fragilis Strains? Nurver TOPRAK ÜLGER, Arzu İLKİ, Nilay ÖZEL, Neşe BALKAN, Güner SÖYLETİR Marmara Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, İstanbul. Marmara University Faculty of Medicine, Department of Medical Microbiology, Istanbul, Turkey. * Bu çalışma, 6. Ulusal Tanısal ve Moleküler Mikrobiyoloji Kongresi (15-19 Haziran 2010, Ankara) nde poster bildiri olarak sunulmuştur. Geliş Tarihi (Received): 02.01.2011 Kabul Ediliş Tarihi (Accepted): 14.02.2011 ÖZET Normalde kolon florasında bulunan Bacteroides fragilis, anaerop enfeksiyonlarda en sık izole edilen patojen olup, antibiyotiklere diğer anaeroplardan daha fazla direnç göstermektedir. Karbapenemler, beta-laktam/beta-laktamaz inhibitörleri ve metronidazol gibi sınırlı sayıda antibiyotikler Bacteroides spp. üzerine etkili olmakla birlikte, son zamanlarda bu antibiyotiklere karşı direnç geliştiren izolatlar da bildirilmiştir. Karbapenemlere direnç, cfia geni tarafından kodlanan metallo-beta-laktamaz aktivitesiyle gerçekleşmektedir. Anaerop bakterilerin duyarlılık testleri için agar dilüsyon yöntemi kullanılmakta; bunun yanı sıra morbidite ve mortalitesi yüksek, yaşamı tehdit eden enfeksiyonlara neden olan anaeroplarda, alternatif yöntem olarak E-test önerilmektedir. Bu çalışmada, B.fragilis suşlarında karbapenem direncinin belirlenmesi ve cfia gen varlığının tahmin edilmesinde meropenem E-test yönteminin değerinin araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmaya, laboratuvarımızda daha önceden, 16 sı dışkı olmak üzere 47 klinik örnekten izole edilen ve tanımlanan toplam 63 B.fragilis suşu alınmıştır. Minimum inhibitör konsantrasyonu (MİK) değerleri meropenem E-test (AB Biodisk, İsveç) ile, cfia geni varlığı ise in house polimeraz zincir reaksiyonu ile araştırılmıştır. İzolatlarda meropenem MİK aralıkları < 0.002 - > 32 µg/ml olarak saptanmış ve direnç oranı %9.5 (6/63) olarak izlenmiştir. Suşların %33 (21/63) ünde cfia geni varlığı gösterilmiştir. Direnç geni varlığı ile yüksek MİK değerleri (MİK 0.5 µg/ml) arasında istatistiksel olarak anlamlı bir ilişki bulunmuştur (p< 0.0001). Çalışmamızda, suşlarda saptanan cfia pozitiflik oranının diğer ülke verilerine göre belirgin şekilde yüksek olması, hastanemizde karbapenemlerin sık İletişim (Correspondence): Dr. Nurver Toprak Ülger, Marmara Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Haydarpaşa Kampüsü, İstanbul, Türkiye. Tel (Phone): +90 216 414 4732, E-posta (E-mail): nurverulger@yahoo.com

Meropenem E-test, Bacteroides fragilis Sufllar nda Karbapenem Direnç Geni cfia Varl n Tahmin Etmede Kullan labilir mi? kullanılmasına bağlanabilir. Elde ettiğimiz sonuçlar, B.fragilis izolatlarında muhtemel cfia gen varlığını tahmin etmede ve dirençli suşları saptamada meropenem E-testinin yararlı olduğunu göstermektedir. Anahtar sözcükler: Bacteroides fragilis; metallo-beta-laktamaz; cfia geni; meropenem; E-test. ABSTRACT Bacteroides fragilis, which is found in normal colon flora, is the most commonly encountered pathogen in anaerobic infections and more resistant to antimicrobial agents than the other anaerobes. Limited number of antibiotics; such as carbapenems, beta-lactam/beta-lactamase inhibitors and nitroimidazoles are the most effective antibiotics against Bacteroides, however resistant isolates to these antimicrobials have been reported recently. Resistance against carbapenems occurs due to a metallo-beta-lactamase enzyme expressed by cfia gene. While agar dilution method is used to test the antimicrobial susceptibility of anaerobic organisms, E-test is recommended for susceptibility testing of anaerobes associated with life-threatening infections with high mortality and morbidity. In this study, meropenem E-test was used to determine the carbapenem resistance of B.fragilis strains and to estimate the presence of cfia gene. A total of 63 B.fragilis strains that were previously isolated from clinical samples (of which 16 were from stool samples) in our laboratory, were enrolled in the study. Minimum inhibitory concentration (MIC) values were determined by meropenem E-test (AB Biodisk, Sweden) and presence of cfia genes were investigated by in-house polymerase chain reaction. The MIC ranges of meropenem were < 0.002 - > 32 µg/ml and the resistance rate was 9.5% (6/63). Thirty-three percent (21/63) of strains harboured cfia gene. A statistically significant relation (p< 0.0001) was determined between presence of cfia gene and high MIC value (MIC 0.5 µg/ml). The proportion of cfia-positive isolates detected in this study was substantially higher than that reported in other countries. This might be attributed to the frequent use of carbapenems in our hospital. The results of this study indicated that meropenem E-test method could be useful to estimate the presence of cfia gene in B.fragilis strains and thus to detect the resistant strains. Key words: Bacteroides fragilis; metallo-beta-lactamase; cfia gene; meropenem; E-test. GİRİŞ Anaerop bakteriler ciddi seyirli, hatta ölümcül enfeksiyonlara neden olabilen mikroorganizmalardır 1. Üretilmeleri yoğun emek, özel koşul ve düzenekleri gerektiren bu bakterilerin kültürü ve antibiyotik duyarlılıkları gerek dünyada, gerekse ülkemizde çok az merkezde yapılmaktadır. Genellikle anaerop enfeksiyon şüphesinde ampirik tedavi uygulanmaktadır. Ancak anaeroplarda antibiyotiklere artan oranda direnç gelişmesi nedeniyle, ampirik tedavide yetmezlikler görülebilmektedir. Tedavinin başarılı olabilmesi için, anaerop bakteriler de dahil etken mikroorganizmaların tanımlanması, antibiyotik duyarlılıklarının bilinmesi gerekmektedir 2. Anaerop patojenler arasında Bacteroides türleri birinci sırayı almaktadır ve bunların içinden en fazla B.fragilis izole edilmektedir. Normalde Bacteroides türleri kolon florasının büyük bir kısmını oluşturmakta, az oranda kadın genital organlarında, ağız boşluğu ve üst solunum yolu florasında bulunmaktadır. Ancak, genellikle bir gastrointestinal veya genitoüriner sistem operasyonu, abdominal travma, apandisit perforasyonu veya divertikülit sonrasında Bacteroides türleri, diyafram altı enfeksiyonlara neden olabilmekte, bakteremiye yol açabilmektedir 1. 386

Toprak Ülger N, lki A, Özel N, Balkan N, Söyletir G. Bacteroides türlerinin diğer bir önemi, antibiyotiklere diğer anaeroplara göre daha fazla direnç göstermeleridir. Bu bakterilerin, karbapenemler, beta-laktam/beta-laktamaz inhibitörleri, metronidazol gibi sınırlı sayıda antibiyotiğe duyarlı oldukları bilinmektedir. Ancak son dönemlerde Bacteroides suşlarının bu antibiyotiklere de direnç geliştirdiklerine dair çalışmalar bildirilmiş ve karbapenemlere dirençli suşların cfia geni ile kodlanan metallo-beta-laktamaz yapısında karbapenemaz enzimi ürettikleri gösterilmiştir 3. Karbapenemaz enziminin sadece karbapenemleri değil, aynı zamanda diğer beta-laktam grubu antibiyotikleri de inaktive ettiği tespit edilmiştir. Direnç geni cfia, kromozom içinde tek başına iken sessiz kalabilmekte veya az oranda eksprese olabilmektedir. Ancak, hemen önünde mobil bir gen olan IS elementinin yer alması halinde direnç geni ekspresyonu daha fazla artmaktadır 4,5. Anaerop bakterilerin duyarlılıklarını belirlemede Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI), referans yöntem olarak agar dilüsyon yöntemini kabul etmiştir 6. Zahmetli, pek de pratik olmayan bu yöntemin daha ziyade belirli zaman dilimlerinde yapılacak, antibiyotiklere direnç gelişiminin izlendiği sürveyans çalışmalarında kullanılması uygun görülmektedir. Bunun yanı sıra, yaşamı tehdit eden enfeksiyonların varlığında, kan gibi önemli klinik örneklerden Bacteroides, Prevotella, Fusobacterium, Clostridium türleri, Bilophila wadsworthia ve Stutterella wodworthensis gibi virülansı yüksek bakterilerin izole edildiği durumlarda, agar dilüsyon yöntemine alternatif olarak Food and Drug Administration (FDA) tarafından kabul edilen E-test önerilmektedir 7. Merkezimizde belli aralıklarla yapılan agar dilüsyon yöntemiyle elde edilen antibiyotik duyarlılık sonuçlarına göre; imipenem MİK değerlerinin belirli konsantrasyonlarda toplandığı, dirençli suşlar ile duyarlılar arasında keskin bir MİK farklılığının olduğu, cfia geni bulunmasına karşın sadece IS elementi olanlarda fenotipik direnç görüldüğü saptanmıştır. Buna karşın meropenem MİK değerleri imipenem MİK değerlerine göre daha yüksek bulunmuş, MİK değerlerinde geniş bir dağılım aralığı gözlenmiş, IS elementi olsun veya olmasın cfia varlığında MİK değerleri daha yüksek bulunmuştur. Bu gözlemlerimizden yola çıkarak çalışmamızda, meropenem E-test uygulanması halinde MİK değerlerinin agar dilüsyon yöntemiyle alınan sonuçlara göre benzer geniş bir dağılım gösterip göstermeyeceği incelenmiş, ayrıca meropenem E-testinin B.fragilis suşlarında karbapenem direncini belirlemede ve cfia gen varlığını tahmin etmede yardımcı olup olmayacağı araştırılmıştır. Dirençli suşu tespit etmenin ve cfia gen varlığını tahmin etmenin, Bacteroides türleriyle gelişen enfeksiyonların tedavisinde başarı getireceği varsayımıyla bu çalışma planlanmıştır. GEREÇ ve YÖNTEM Çalışmaya, Marmara Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarında, 16 sı dışkı olmak üzere çeşitli klinik örneklerden izole edilmiş, tanımlanmış ve stoklanmış olan toplam 63 B.fragilis suşu alındı. Bakterilerin imipenem ve meropeneme duyarlılıkları, CLSI nın anaerop bakteriler için önerdiği agar dilüsyon yöntemiyle çalışıldı 6. Aynı suşlara meropenem E-testi (AB Biodisk, İsveç) de uygulandı. Duyarlılık testlerinde ATCC 25285 B.fragilis suşu kontrol olarak kullanıldı. 387

Meropenem E-test, Bacteroides fragilis Sufllar nda Karbapenem Direnç Geni cfia Varl n Tahmin Etmede Kullan labilir mi? Bakteri DNA sının elde edilmesi amacıyla bakteri kültüründen 4-5 koloni alınarak, DNaz, RNaz bulundurmayan 200 µl su içinde süspanse edildi. Ardından 20 dakika 95 C de ısıtıldı ve 12.000 rpm de santrifüj edilerek üst kısım kullanıldı 5. Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) için uygun primerler (cfia F:5 -TTTCCCTGTCGCAGT- TATGG-3 ve cfia R: 5 - TTTCCCTGTCGCAGTTATGG-3 ) kullanılarak cfia genleri amplifiye edildi. Döngüler; 94 C de 2 dakika, 35 döngü (94 C de 45 saniye, 51 C de 45 saniye, 72 C de 45 saniye) ve 72 C de 2 dakika olarak uygulandı. Elde edilen PCR ürünleri etidyum bromür içeren %2 lik agaroz jelde ve 1 x TBE tamponu içinde 90 V de bir saat yürütüldü; oluşan bantlar UV ışığı altında gözlemlendikten sonra yorumlandı 5. Kontrol olarak, daha önce laboratuvarımızda tanımlanan cfia geni pozitif B.fragilis suşu kullanıldı. İstatistiksel değerlendirmede Pearson ki-kare analiz yöntemi kullanıldı; p< 0.05 değeri anlamlı kabul edildi. BULGULAR Agar dilüsyon yöntemine göre; imipenem MİK değerleri 0.125 ile 32 µg/ml dilüsyonlarında, meropenem MİK değerleri de 0.125 ile 64 µg/ml dilüsyonlarında yer almıştır. Tüm suşların %6.3 (4/63) ü imipeneme, %9.5 (6/63) i meropeneme dirençli bulunmuştur. Her iki antibiyotiğe dirençli olan suşlarda cfia direnç geni saptanmıştır. İmipenem MİK dilüsyonları, %86 oranında 0.5 µg/ml değerlerinde birikirken, meropenem MİK değerleri daha yaygın bir dağılım göstermiştir (Tablo I). Meropenem E-test sonuçlarına göre; MİK değerleri < 0.002 - > 32 µg/ml arasında değişiklik göstermiştir (Tablo II). Suşların %33 (n= 21) ünde cfia geni gösterilmiş olmakla beraber, direnç oranı ( 16 µg/ml) %9.5 bulunmuştur. Direnç geni varlığı ile MİK değerleri arasında bir bağlantı araştırıldığında, MİK 0.5 µg/ml değerlerine sahip suşlarda (n= 16) cfia geninin var olma olasılığı istatistiksel olarak anlamlı şekilde yüksek bulunmuş (p< 0.0001); benzer şekilde MİK değerleri 0.5 ten az olduğunda cfia geninin negatif olma olasılığı da anlamlı (p< 0.0001) bulunmuştur (Tablo III). TARTIŞMA Anaerop bakterilerin 1970 li yılların başından beri antibiyotiklere artan oranda direnç geliştirdikleri, direncin özellikle Bacteroides türleri arasında yaygın görüldüğü bildirilmiştir 3. Bu bakterilerin direnç mekanizmalarından birisi beta-laktamaz üretimidir. Bacteroides Tablo I. Agar Dilüsyon Yöntemiyle cfia Geni Varlığına Göre Suşların İmipenem ve Meropenem MİK Dağılımının Karşılaştırılması Suşların MİK (µg/ml) değerlerine göre dağılım sayıları Direnç geni Antibiyotik 0.125 0.25 0.5 1 2 4 8 16 32 64 cfia pozitif (n= 21) İmipenem 3 5 7 1 - - 1 3 1 - Meropenem 2 - - 1 4 6 2 1 2 3 cfia negatif (n= 42) İmipenem 19 18 2 1 2 - - - - - Meropenem 19 14 6-1 1 1 - - - 388

Toprak Ülger N, lki A, Özel N, Balkan N, Söyletir G. Tablo II. Agar Dilüsyon Yöntemiyle, cfia Gen Varlığına Göre B.fragilis Suşlarının İmipenem ve Meropenem MİK 50 ve MİK 90 Değerleri (µg/ml) ve Direnç Oranları İmipenem Meropenem Direnç Direnç Direnç geni MİK 50 MİK 90 Sayı % MİK 50 MİK 90 Sayı % cfia pozitif (n= 21) 0.5 16 5 24 4 64 6 28.5 cfia negatif (n= 42) 0.125 2 0 0.125 4 0 Tablo III. E-test Yöntemine Göre Meropenem MİK Değerleri < 0.5 µg/ml ve 0.5 µg/ml Olan B.fragilis Suşlarında cfia Geninin Dağılımı (sayı) Meropenem MİK (µg/ml) Direnç geni 0.5 < 0.5 Toplam cfia pozitif 16 5 21 cfia negatif 2 40 42 Toplam 18 45 63 suşlarında, moleküler sınıf A ve B de yer alan iki tip beta-laktamaz tanımlanmıştır. Moleküler sınıf A beta-laktamazlar suşların çoğunda (%79-100) bulunmakta, penisilin ve sefalosporinlere karşı direnç gelişimine yol açmaktadır. Ancak, bu enzimler klasik beta-laktamaz inhibitörleriyle inhibe olmaktadır 4. Moleküler sınıf B beta-laktamazlar (Bush sınıflamasında grup 3a) ise daha nadir görülmekte, özellikle B.fragilis türlerinde bulunmakta ve karbapenem direncine yol açmaktadır. Aktif bölgelerinde Zn +2 bulunduran metallobeta-laktamaz yapısındaki bu karbapenemazlar, EDTA varlığında inhibe olmakta, klasik beta-laktamaz inhibitörlerinden etkilenmemektedir. Bu enzimler, karbapenemlerin yanı sıra diğer beta-laktam antibiyotikleri de hidrolize edebilmektedir 5,8. Dirençten sorumlu cfia geni, plazmid veya kromozom üzerinde yer alabilmektedir. Direnç geni cfia, sessiz kalabildiği gibi değişik düzeylerde metallo-beta-laktamaz ifade edebilmektedir. Bu genlere sahip olan bakterilerin yüksek düzeyde metallo-enzim eksprese etmeleri için direnç geninin önünde IS elementinin bulunması gerekmektedir 9-12. Hastanemizde imipeneme dirençli ilk suş 1999 yılında, aspirasyon pnömonisi olan hastadan izole edilmiştir. Yapılan ayrıntılı çalışmada bu suşun cfia geni taşıdığı ve bu genin hemen önünde IS1187 bulundurduğu, karbapenemlerin yanı sıra diğer betalaktam antibiyotiklere de direnç gösterdiği bulunmuştur 13. Yakın zamanda hastanemizde izole edilen suşların yaklaşık %6-8 i karbapenemlere direnç göstermektedir. Yapılan moleküler çalışmalarla, izolatlarımızın %27 oranında cfia geni, %32 oranında ise IS1187 taşıdığı saptanmış; karbapenemlere dirençli suşlarda her iki gen birlikte bulunmuştur 14. Direnç geni pozitiflik oranımız, Türkiye de yapılan böyle bir çalışmaya rastlanmadığından ülkemiz verileri ile kıyaslanamamış; diğer ülkelerin sonuçlarına göre ise 389

Meropenem E-test, Bacteroides fragilis Sufllar nda Karbapenem Direnç Geni cfia Varl n Tahmin Etmede Kullan labilir mi? yüksek bulunmuştur. Dünyanın farklı ülkelerinde bildirilen çalışmalarda, Bacteroides suşlarının %2-7 sinin cfia geni taşıdığı, ancak suşların sadece yaklaşık %1 inin karbapenemlere direnç gösterdikleri saptanmıştır 5,15,16. Çalışmamızda saptanan karbapenem direnç oranı da diğer ülkelerin direncine göre yüksek bulunmaktadır. İmipenem ve meropeneme direnç oranları; Amerika Birleşik Devletleri, Kanada ve Avrupa ülkelerinde %0.2-1, Japonya da %2-4 ve Tayvan da %7-12 olarak bildirilmektedir 17-20. Ülkemizdeki veriler incelendiğinde; sadece Ercis ve arkadaşları 21 29 Bacteroides üzerinde yaptıkları çalışmada, bir izolatta imipeneme direnç bulmuşlardır. Uygulanan antibiyotik politikasına bağlı olarak ülkeler arasında, aynı ülkenin şehirleri arasında, hatta aynı hastanenin servisleri arasında bile antibiyotiklere direnç oranında farklılıklar görülebilmektedir. Hastanemizde yüksek oranda imipenem ve meropeneme dirençli B.fragilis ve cfia gen pozitifliği, enfeksiyon hastalıklarının tedavisinde karbapenemlerin yaygın kullanılıyor olmasına bağlanabilir. Hastanemizdeki Bacteroides suşlarında yüksek oranda cfia geni ve IS elementlerinin bulunması, gelecekte iki genin aynı bakteri içinde yer alma olasılığını artırmaktadır. Hareketli DNA parçaları olan IS elementleri, bir bakteriden diğerine aktarılabilmekte, cfia direnç geninin önüne yerleştiğinde, genin yüksek düzeyde eksprese olmasına yol açmaktadır 11,12. Uygulanacak karbapenem tedavisi bu olasılığı artıracak ve süreci hızlandıracaktır. Bu nedenle ampirik tedaviye başlamadan önce klinik örneklerin alınıp, aerop ve anaerop kültürlerinin yapılması, etken mikroorganizmanın izole edilip karbapenemlere dirençli olup olmadığının belirlenmesi önemlidir. Bunun en pratik ve kısa yolu, FDA nın agar dilüsyona alternatif olarak önerdiği E-test yönteminin kullanılmasıdır 7. Bu çalışmada meropenem E-test, agar dilüsyon yönteminde meropenemin, imipenemden farklı olarak geniş bir MİK dağılımı sergilediği ve daha yüksek MİK değerleri gösterdiği için seçilmiştir. Sonuçlarımıza göre E-test ile 0.5 µg/ml MİK değerlerine sahip suşlarda cfia geni bulunma olasılığı istatistiksel olarak anlamlı şekilde yüksek bulunmuştur (p< 0.0001). Bunun yanı sıra meropenem E-test değerleri ile agar dilüsyon değerleri arasında da uyumluluk görülmüş, dirençli suşlar her iki yöntemle de saptanmıştır. Sonuç olarak hastanemizde karbapenemlerin yaygın kullanılması, Bacteroides suşlarımızda karbapenem direncini kodlayan cfia geninin ve karbapenem direnç oranının yüksek olmasına neden olmaktadır. Laboratuvarda meropenem E-test uygulanması halinde MİK 0.5 µg/ml elde edilmesi, cfia geninin bulunma olasılığının yüksek olduğunu gösterecektir. Böylece direnç geni cfia ya sahip izolatların, karbapenemlere ve diğer beta-laktam antibiyotiklere dirençli olabileceği veya direnç geliştirebileceği öngörülebilir. Sonuçlarımıza göre başarılı bir tedavinin programlanmasında ve sürdürülmesinde, meropenem E-test MİK sonuçlarının yol gösterici olabileceği öne sürülebilir. KAYNAKLAR 1. Finegold SM. Anaerobic bacteria: general concepts, pp: 2519-75. In: Mandell GL, Bennett JE, Dolin R (eds), Principles and Practice of Infectious Diseases. 2005, 5 th ed. Churchill Livingstone, Philadelphia. 2. Finegold SM. Perspective on susceptibility testing of anaerobic bacteria. Clin Infect Dis 1997; 25(Suppl 2): S251-3. 390

Toprak Ülger N, lki A, Özel N, Balkan N, Söyletir G. 3. Hecht DW. Prevalence of antibiotic resistance in anaerobic bacteria: worrisome developments. Clin Infect Dis 2004; 39(1): 92-7. 4. Nord CE, Hedberg M. Resistance to beta-lactam antibiotics in anaerobic bacteria. Rev Infect Dis 1990; 12(Suppl 2): S231-4. 5. Soki J, Fodor E, Hecht DW, et al. Molecular characterization of imipenem-resistant cfia-positive Bacteroides fragilis isolates from the USA, Hungary and Kuwait. J Med Chem 2004; 53(Pt 5): 413-9. 6. Clinical and Laboratory Standards Institute. Methods for antimicrobial susceptibility testing of anaerobic bacteria. Approved Standards, M11-A7. 2007, 7 th ed. CLSI, Pennsylvania, USA. 7. Citron DM, Ostovari MI, Karlsson A, Goldstein EJ. Evaluation of the E test for susceptibility testing of anaerobic bacteria. J Clin Microbiol 1991; 29(10): 2197-203. 8. Walsh TR, Onken A, Haldorsen B, Toleman MA, Sundsfjord A. Characterization of a carbapenemase-producing clinical isolate of Bacteroides fragilis in Scandinavia: genetic analysis of a unique insertion sequence. Scand J Infect Dis 2005; 37(9): 676-9. 9. Rasmussen BA, Kovacs E. Identification and DNA sequence of a new Bacteroides fragilis insertion sequencelike element. Plasmid 1991; 25(2): 141-4. 10. Trinh S, Haggoud A, Reysset G, Sebald M. Plasmids pip419 and pip421 from Bacteroides: 5-nitroimidazole resistance genes and their upstream insertion sequence elements. Microbiology 1995; 141(4): 927-35. 11. Podglajen I, Breuil J, Collatz E. Insertion of a novel DNA sequences, IS1186, upsteram of the silent carbapenemase gene cfia, promotes expression of carbapenem resistance in clinical isolates of Bacteroides fragilis. Mol Microbiol 1994; 12(1): 105-14. 12. Podglajen I, Breuil J, Rohaut A, Monsempes C, Collatz E. Multiple mobile promoter regions for the rare carbapenem resistance gene of Bacteroides fragilis. J Bacteriol 2001; 183(11): 3531-5. 13. Toprak Ülger N, Aral C, İlki A, Özer A, Söyletir G. Marmara Üniversitesi Hastanesinde izole edilen ilk imipeneme dirençli Bacteroides fragilis kökeninin fenotipik ve genotipik özelliklerinin araştırılması. FLORA 2009; 14(4): 175-81. 14. Dengel Uzunkaya O, Ulger Toprak N, Karavus M, Soyletir G. Susceptibility profiles and detection of resistance genes of carbapenems and 5-nitroimidazole among Bacteroides spp. in Turkey. 19 th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases. 16-19 May 2009, Helsinki. Abstract Book, p: S618, R2102. 15. Edwards R, Hawkyard CV, Garvey MT, Greenwood D. Prevalence and degree of expression of the carbapenemase gene (cfia) among clinical isolates of Bacteroides fragilis in Nottingham, UK. J Antimicrob Chemother 1999; 43(2): 273-6. 16. Soki J, Edwards R, Hedberg M, Fang H, Nagy E, Nord CE. Examination of cfia-mediated carbapenem resistance in Bacteroides fragilis strains from a European antibiotic susceptibility survey. Int J Antimicrob Agents 2006; 28(6): 497-502. 17. Koeth LM, Good CE, Appelbaum PC, et al. Surveillance of susceptibility patterns in 1297 European and US anaerobic and capnophilic isolates to co-amoxiclav and five other antimicrobial agents. J Antimicrob Chemother 2004; 53(6): 1039-44. 18. Hedberg M, Nord CE ; ESCMID Study Group on Antimicrobial Resistance in Anaerobic Bacteria. Antimicrobial susceptibility of Bacteroides fragilis group isolates in Europe. Clin Microbiol Infect 2003; 9(6): 475-88. 19. Ueno K, Kato N, Kato H. The status of research on anaerobes in Japan. Clin Infect Dis 2002; 35(Suppl 1): S54-7. 20. Liu CY, Huang YT, Liao CH, Yen LC, Lin HY, Hsueh PR. Increasing trends in antimicrobial resistance among clinically important anaerobes and Bacteroides fragilis isolates causing nosocomial infections: emerging resistance to carbapenems. Antimicrob Agents Chemother 2008; 52(9): 3161-8. 21. Ercis S, Tunçkanat F, Hasçelik G. Klinik örneklerden izole edilen anaerop gram-negatif basillerin çeşitli antibiyotiklere direnç durumları. XXXI. Türk Mikrobiyoloji Kongresi. 19-23 Eylül 2004, Kuşadası. Kongre Kitabı, P036. 391