Muş İlinde Tekrarlayan Gebelik Kayıpları İle Mthfr C677t ve A1298c ve Pai-1 4g/5g Polimorfizmleri Arasındaki İlişki ve Alel Frekansları



Benzer belgeler
M. Kerem ÇALGIN 1, Fikret ŞAHİN 1, Melike ATASEVER 2, Deniz KÖKSAL 2, Djursun KARASARTOVA 1, Mehmet KIYAN 1. AÜTF Tıbbi Mikrobiyoloji ABD 2

Anahtar kelimeler: Kronik böbrek yetmezliği, MTHFR, A1298C, C677T

Habituel Abortus Nedeniyle Takip Edilen ki Olguda MTHFR Defekti: Olgu Sunumu

Parkinson Hastalığı ile α-sinüklein Geni Polimorfizmlerinin İlişkisinin Araştırılması

Venöz tromboembolili hastalarda anjiyotensin dönüştürücü enzim I/D ve plazminojen aktivatör inhibitör-1 4G/5G gen polimorfizmlerinin araştırılması

KRONİK VİRAL HEPATİT C Lİ HASTALARDA IL28B NİN İNTERFERON TEDAVİSİNE YANITLA İLİŞKİSİ. Dr. Gülay ÇEKİÇ MOR

16S rrna Analizi. Doç. Dr. Zeynep Ceren KARAHAN. Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

Metilen Tetrahidrofolat Redüktaz Enzim Polimorfizmlerinde Perinatal Sonuçlar DR. MERT TURGAL

ARAŞTIRMA (Research Report)

Dicle Tıp Dergisi / Dicle Med J (2018) 45 (3) :

Tekrarlayan Gebelik Kayýplarýnda Trombofili Mutasyon Sýklýklarý

Tekrarlayan düşükleri olan ailede herediter mthfr c677t mutasyonunun olası rolü

attomol apo B-100 quicktype

Akut İnme Hastalarında Risk Faktörü Olan Homosistein Düzeyine MTHFR Gen Polimorfizmlerinin Etkisi*

MTHFR geninde c677t ve/veya a1298c polimorfizmi tespit edilen bireylerde bu polimorfizm sıklıklarının incelenmesi

Erkek infertilitesinde metiyonin sentaz A2756G ve metiyonin sentaz redüktaz A66G gen polimorfizmlerinin etkisi

Trombofili nin Tekrarlayan Gebelik Kayıplarındaki Rolü. Dr. Ayhan SUCAK

KRONİK BÖBREK HASTALIĞI (YETMEZLİĞİ) OLAN TÜRK HASTALARINDA TÜMÖR NEKROZ FAKTÖR ALFA ve İNTERLÖKİN-6 PROMOTER POLİMORFİZMLERİNİN ETKİSİ

Çukurova Üniversitesi, Kadın Hastalıkları ve Doğum Kliniği, Adana 2

ÖZET. agaroz jel elektroforezinde bant uzunluklar de erlendirilmifltir.

MEME KANSERİ HASTALARINDA JAM-A VE LFA-1 GEN VARYASYONLARININ ETKİSİNİN İNCELENMESİ

ÖZET SUMMARY BETA TALASEMİ MUTASYON TİPLERİNİN MOLEKÜLER ANALİZİ MOLECULAR GENETIC ANALYSES OF BETA-THALASSEMIA PATIENTS

Dr. Semih Demir. Tez Danışmanı. Doç.Dr.Barış Önder Pamuk

Major Depresif Bozukluk (MDD) Dünyada maluliyete sebep olan en sık ikinci hastalık Amprik tedavi yaklaşımı İlaca yanıt Yan etki bireysel farklılıklar

IL28B genotip tayini kronik hepatit B hastalarında oral antiviral tedavi cevabını öngörmede kullanılabilir mi?

attomol lactose intolerance C>T quicktype

AİLESEL AKDENİZ ATEŞİ (AAA-FMF)

Plazminojen aktivatör inhibitör-1 (PAI-1) 4G/4G polimorfizminin gebelik kayıplarıyla ilişkisi

Kromozom yapı değişimleri

Light Cycler Real Time PCR Teknolojisi ile Faktör V Geninde Yeni Mutasyon Taranması

Postmenopozal Kadınlarda Vücut Kitle İndeksinin Kemik Mineral Yoğunluğuna Etkisi

α1-antitrypsin quicktype

SNP TEK NÜKLEOTİD POLİMORFİZMLERİ (SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS)

Metilentetrahidrofolat Redüktaz (Mthfr) C677t ve A1298c Gen Polimorfizmleri

Anensefalide Gebelerin Folat ve Vitamin B12 Düzeyleri ile Faktör V Leiden, Faktör II G20210A, MTHFR C667T ve MTHFR A1298C Polimorfizlerinin Önemi

Dr. Nilay HAKAN Muğla Sıtkı Koçman Üniv. Tıp Fak. Neonatoloji Bilim Dalı Perinatal Medicine Nisan 2017, İZMİR

Pulmoner ve ekstrapulmoner tüberküloz hastalarında CCL1 rs T/A gen polimorfizminin araştırılması

MOLEKÜLER TANISI DÜZEN GENETİK HASTALIKLAR TANI MERKEZİ. SERPİL ERASLAN, PhD

Anaerop Haber Haziran 2015 sayısının konu başlığı : Yurt içi / yurt dışı anaerop yayınlar

POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU (PZR-PCR) VE RESTRİKSİYON PARÇA UZUNLUĞU POLİMORFİZMİ (RFLP)

Progesteronun Preterm Doğumları ve Düşüğü Önlemede Yeri Var mıdır? Prof. Dr. Feride Söylemez A.Ü.T.F Kadın Hastalıkları ve Doğum AD

Sebahat Usta Akgül 1, Yaşar Çalışkan 2, Fatma Savran Oğuz 1, Aydın Türkmen 2, Mehmet Şükrü Sever 2

GÖĞÜS HASTALIKLARINDA GENETİK ARAŞTIRMA. Prof. Dr. Nejat Akar Ankara Üniversitesi

Agaroz jel elektroforezi

Plasenta ilişkili gebelik komplikasyonları ve trombofili. Dr. Kadir Acar Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Erişkin Hematoloji BD.

EĞİTİM BİLGİLERİ. Çukurova Üniversitesi. Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı/ 2016

KAPİLLER ELEKTROFOREZ DNA SEKANSLAMA

GSTM1 Polimorfizmi İle Primer Beyin Tümörleri Arasındaki İlişkinin Araştırılması

Böbrek nakli hastalarında akut rejeksiyon gelişiminde CTLA-4 tek gen polimorfizmlerinin ve soluble CTLA-4 düzeylerinin rolü varmıdır?

TÜBİTAK BİDEB LİSE ÖĞRETMENLERİ FİZİK, KİMYA, BİYOLOJİ, MATEMATİK- PROJE DANIŞMANLIĞI EĞİTİMİ ÇALIŞTAYI LİSE3 (Çalıştay 2013) BİYOLOJİ GRUP TUHAF

I. Projenin Türkçe ve İngilizce Adı ve Özetleri İvesi Koyunlarında mikrosatellite lokuslarında polimorfizmin tespiti Güneydoğu Anadolu Tarımsal Araştı

Doç. Dr. Ahmet Gül MFTP Kongresi Ekim 2012, İstanbul

ARAŞTIRMA. Rastgele Çoğaltılmış Polimorfik DNA Yöntemiyle Kanatlı Etlerinde Tür Tayini. 2007: 21 (4):

Geliş Tarihi (Received): Kabul Ediliş Tarihi (Accepted):

Doç. Dr. Ahmet Gül TJOD İstanbul, Ocak Not: Bu sunum daha önce MFTP Kongresi Ekim 2012, İstanbul da yapılmıştır

Erkan ALATAŞ 1, Banuhan ŞAHIN 2 *, Sevgi ÖZKAN 3, Metin AKBULUT 4

Genetik çalışmaların yüksek canlılardan çok mikroorganizmalarla yapılması bazı avantajlar sağlar.

HEREDITARY THROMBOPHILIAS AND LOW MOLECULAR WEIGHT HEPARIN (HEREDİTER TROMBOFİLİLERDE DÜŞÜK MOLEKÜLER AĞIRLIKLI HEPARİN KULLANIMI)

The Study of Relationship Between the Variables Influencing The Success of the Students of Music Educational Department

AF Konusunda Klinik Pratikte Kullanılan Genetik Çalışmalar Türkiye de Durum Ne?

T.C. NİĞDE ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ BİYOLOJİ ANA BİLİM DALI

HLA Tiplendirmesi PCR-SSP. Türker Duman PhD

İvesi Koyunlarında Mitokondriyal 16S rrna Gen Bölgesi Polimorfizmlerinin PCR-RFLP Yöntemiyle İncelenmesi

attomol HLA-B*27 Sadece in vitro diagnostik kullanım içindir! 1.Giriş 2. Genel Açıklamalar

Gıda Örneklerinde Genetiği Değiştirilmiş Organizma Analizleri

RUTİN MİKOBAKTERİYOLOJİ LABORATUVARLARI İÇİN ÜÇ ADIMDA MIRU-VNTR

Domuz Ayrığı (Dactylis glomerata L.) Populasyonlarında Genetik Çeşitliliğin Belirlenmesi

Mikrobiyolojide Moleküler Tanı Yöntemleri. Dr.Tuncer ÖZEKİNCİ Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji A.D

Farmakogenetik Dr. Pınar Saip İ.Ü.Onkoloji Enstitüsü

BETA ADRENERJİK RESEPTÖR 2 KODON 27 POLİMORFİZMİ İLE MEME KANSERİ ARASINDAKİ İLİŞKİNİN ARAŞTIRILMASI

Türk Hemofili B Hastalarında Faktör IX Geni Mutasyonları


NEFROTİK SENDROMLU ÇOCUKLARDA MDR 1 CEVABIN BELİRLENMESİNDE ROLÜ

PCR Bir reaksiyonun kurulması ve optimize edilmesi

Mide Kanserli Hastalarda Siklin D1 (G870A) Gen Polimorfizminin Araştırılması ARAŞTIRMA

Yaygın Hastalıklarda Genetik Yaklaşım

Polimeraz Zincir Reaksiyonu. Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

TÜRKİYE DE BULUNAN BAZI YERLİ SIĞIR IRKLARININ GENETİK YAPILARININ KARAKTERİZASYONU

Özgün makale / Original article Şilfeler ve ark. 1

Hafta 7. Mutasyon ve DNA Tamir Mekanizmaları

ÇEŞİTLİ GASTROİNTESTİNAL KARSİNOM ÖRNEKLERİNDE İNSAN PAPİLLOMAVİRUS DNA VARLIĞININ ARAŞTIRILMASI*

Fenilketonüri Hastalığında Prenatal-Postnatal Tanıda VNTR Bağlantısı ve Direkt Mutasyon Analizleri Birlikteliğinin Avantajları

GEBELİK KAYIPLARINDA TROMBOFİLİ. Yrd. Doç. Dr. Emine TÜREN DEMİR N.E.Ü Meram Tıp Fakültesi Kadın Hastalıkları ve ABD

ÖZGEÇMİŞ Uluslararası hakemli dergilerde yayınlanan makaleler (SCI & SSCI & Arts and Humanities)

HCV Enfeksiyonunda Prognozu Etkileyen Faktörler: Konak- Virüs. İmre Altuğlu Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD

T A D. Retrospektif moleküler bir çalışma: FMF ön tanısı alan hastalarda MEFV gen mutasyonları ARAŞTIRMA

PCOS ve GEBELİK KOMPLİKASYONLARI. Prof. Dr. Nazan Başak Yıldırım Pamukkale Üniversitesi Tıp Fakültesi Kadın Hastalıkları ve Doğum A.D.

Genom analizi için belirteç olarak kullanılan DNA dizileri

BRCA 1/2 DNA Analiz Paneli

Fetal Spina Bifida: Tanı ve Yaklaşım. Prof. Dr. E. Ferda Perçin Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Genetik AD. Ankara- 2018

SERVİKAL YETMEZİĞİNDE MCDONALDS VE MODDIFIYE ŞIRODKAR SERKLAJ YÖNTEMLERININ KARŞILAŞTIRILMASI

Farmakogenetikte Kullanılan Temel Yöntemler

Turkish Title: Tekrarlayan Düşükleri Olan Kadınlarda Faktör XII Aktivitesinin Değerlendirilmesi

SALGIN ARAŞTIRMASINDA KULLANILAN TİPLENDİRME YÖNTEMLERİ

İstanbul daki El Ayak Ağız Hastalığı Vakalarında Coxsackievirus A6 ve Coxsackievirus A16 nın Saptanması

Avian Flu Screening&Typing H5, H7

Mitokondrial DNA Analiz Paneli

Periferik Arter Hastalığı Olan Erkek Hastalarda Trombofilik Mutasyonların Yaygınlığı

Tüberküloz Hastalarında Sitokin Gen Polimorfizmi ve Genetik Yatkınlığın Belirlenmesi*

Performans Özellikleri

Transkript:

61 Kocatepe Tıp Dergisi The Medical Journal of Kocatepe 12:61-67 / Mayıs 2011 Afyon Kocatepe Üniversitesi Muş İlinde Tekrarlayan Gebelik Kayıpları İle Mthfr C677t ve A1298c ve Pai-1 4g/5g Polimorfizmleri Arasındaki İlişki ve Alel Frekansları Association between Recurrent Pregnancy Losses and Mthfr C677t and A1298 and Pai-1 4g/5g Polymorphisms and Allele Frequencies in Muş Banu BAYRAM 1, Çetin KILIÇÇI 2, Sedat BOZARI 2, Harun ÖNLÜ 2, Fezan ŞAHİN 3 1 Muş Alparslan Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji Bölümü, Muş 2 Özel Muş Şifa Hastanesi, Kadın Hastalıkları ve Doğum Anabilim Dalı, Muş 3 Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Biyoistatistik Anabilim Dalı, Eskişehir ÖZET Amaç: Bu çalışmada plazminojen aktivator inhibitör tip- 1 geni 4G/5G ile metilentetrahidrofolat redüktaz geni C677T ve A1298C polimorfizmlerinin Muş ilinde tekrarlayan gebelik kayıpları ile arasındaki ilişkinin belirlenmesi ve alel frekanslarının saptanması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Genomik DNA tekrarlayan gebelik kayıpları olan 34 hasta ve 34 sağlıklı kontrolün kan örneklerinden izole edilmiştir. DNA PAI-1 geni 4G/5G polimorfizmi için 4G ve 5G spesifik primerler ile amplifiye edilerek, MTHFR geni C677T ve A1298C polimorfizmleri için PCR-RFLP yöntemi uygulanarak agaroz jel elektroforezinde UV transillüminatör ile değerlendirilmiştir. Bulgular: Hasta ve kontrol grupları arasında PAI-1 geni 4G/5G ve MTHFR geni C677T ve A1298C polimorfizmleri alel frekansları açısından anlamlı bir fark saptanmamıştır. Genotip dağılımı açısından bakıldığında ise PAI-1 geni 4G/5G ve MTHFR geni A1298C polimorfizmleri hasta ve kontrol grupları arasında farklılık göstermemiştir. MTHFR geni 677 homozigot mutantlığı (TT) ise sadece hasta grubunda, heterozigot mutantlık (CT) ise sadece kontrol grubunda tespit edilmiş olmasına ve istatistiksel açıdan da anlamlı bir farklılık göstermesine rağmen tekrarlayan gebelik kayıplarının ortaya çıkmasında bir role sahip olarak gözükmemektedir. Sonuç: Sonuç olarak Muş ilinde PAI-1 geni 4G/5G ve MTHFR geni A1298C polimorfizmlerinin tekrarlayan gebelik kayıpları için bir risk olmadığını düşünmekteyiz. Anahtar Kelimeler: Tekrarlayan Gebelik Kayıpları, MTHFR, C677T, A1298C, PAI-1 4G/5G, Polimorfizm ABSTRACT Aim: In this study it was aimed to determine the association between plasminogen activator inhibitor type 1 gene (PAI-1) 4G/5G and methylenetetrahydrofolate reductase gene C677T and A1298C polymorphisms with recurrent pregnancy losses and the allele frequencies in Mus city. Materials and Methods: Genomic DNA was isolated from blood samples of 34 patients with recurrent pregnancy losses and 34 healthy controls. DNA was amplified with 4G and 5G specific primers for detection of PAI-1 gene 4G/5G polymorphism and PCR-RFLP technique was used to analyze MTHFR gene C677T and A1298C polymorphisms. Products were assessed with UV transilluminator by being exposed to agarose gel electrophoresis. Results: The frequencies of the PAI-1 gene 4G/5G and MTHFR gene C677T and A1298C alleles in the patient group were similar to control group. According to the genotype distribution of PAI-1 gene 4G/5G and MTHFR gene A1298C polymorphisms there was no significant difference between patient and control group. MTHFR gene 677 (TT) homozygote mutation has been detected only in patients and (CT) heterozygote mutation only in the control group, despite a statistically significant difference between patient and control groups, this polymorphism does not seem to play a role in the occurrence of recurrent pregnancy loss. Conclusion: As a result of the study we may assert that PAI-1 4G/5G and MTHFR A1298C and C677T polymorphisms are not risk factors for recurrent pregnancy losses in Mus city. Key Words: Recurrent Pregnancy Loss, MTHFR, C677T, A1298C, PAI-1 4G/5G, Polymorphism Yazışma ve tıpkıbasım için: Banu BAYRAM Muş Alparslan Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji Bölümü, Muş, İstasyon Caddesi, 49100, MUŞ Telefon : (90) (436) 213 00 13/3007, Fax : (90) (436) 212 08 53, (e-posta: bayrambanu@hotmail.com)

62 BAYRAM ve ark. GİRİŞ Tekrarlayan gebelik kayıpları 20. gebelik haftasından önce arka arkaya gerçekleşen üç ve üzerinde spontan düşük olarak tanımlanmakta ve tüm gebeliklerin %1-5 kadarında görülmektedir (1,2). Etiyolojisinde genetik, endokrin, anatomik, immünolojik, enfeksiyona bağlı ve çevresel nedenler yer alır (1,3,4). Genetik faktörlerden metilentetrahidrofolat redüktaz (MTHFR) geni C677T ve A1298C ile plazminojen aktivator inhibitör tip-1 (PAI-1) geni 4G/5G polimorfizmleri tekrarlayan gebelik kayıpları için risk faktörü olarak ifade edilmektedir. PAI-1 fibrinolitik sistem inhibitörlerinden olup, 4G homozigotluğu sonucu enzim konsantrasyonunun artmasına bağlı olarak fibrinolitik aktivite bozulur ve trombotik olaylara yatkınlık artar (5,6). MTHFR ise homosistein metabolizması için gereklidir. MTHFR gen mutasyonları MTHFR aktivitesinin azalmasına neden olarak plazmada folat konsantrasyonunda düşmeye ve homosistein konsantrasyonunda artmaya dolayısıyla tromboembolizm ve ateroskleroza atkınlığa sebep olmaktadır. Kanda homosistein düzeyinin yükselmesi ise nöral tüp defekti, fetal kayıp, plasental abrupsiyon ve plasental enfarkt riskini arttırır (7,8). Bazı çalışmalarda üç ve daha fazla tekrarlayan gebelik kaybı olan kadınlar arasında PAI-1 geni 4G/5G ve MTHFR geni C677T ve A1298C polimorfizmi mutant homozigot varyantların frekansının yüksek olduğu ifade edilirken (9-13), diğerlerinde bu polimorfizmler ile gebelik kayıpları arasında herhangi bir ilişki saptanmamıştır (14-16). Elbette gen havuzları, yaşam biçimi, popülasyonlar arasında gen-çevre etkileşimlerindeki çeşitlilik her popülasyonda genotiplere benzer şekilde yansımamaktadır (17). Bu nedenle bu çalışmada Muş ilinde PAI-1 geni 4G/5G ve MTHFR geni C677T ve A1298C polimorfizmleri alel frekanslarının ve bu polimorfizmler ile tekrarlayan gebelik kayıpları arasında bir ilişkinin olup olmadığının belirlenmesi amaçlanmıştır. GEREÇ VE YÖNTEM Çalışma Grubu Bu çalışmaya, Özel Muş Şifa hastanesine tekrarlayan gebelik kayıpları için başvuran 20. gebelik haftasından önce, 3 veya daha fazla spontan düşük yapmış yaş ortalaması 28,06±1.04 34 hasta dahil edildi. Kontrol grubu ise en az 2 canlı doğumu olan, düşük öyküsü bulunmayan yaş ortalaması 28,6±0,72 kadınlardan oluşturuldu. Bu çalışma için Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, Tıp Fakültesi etik kurulu tarafından onay alınmış, ayrıca her hasta çalışma hakkında bilgilendirilerek olur belgesi imzalatılmıştır. DNA İzolasyonu Hasta ve kontrollere ait genomik DNA lar periferik kandan DNA izolasyon kiti (Vivantis, Malesia) prosedürüne uygun olarak izole edildi ve +4 oc de saklandı. PAI-1 geni 4G/5G polimorfizmi genotip tayini PAI-1 geni 4G/5G baz çiftini içeren gen bölgesini çoğaltmak üzere, 0,5 μl DNA, 10X PCR Buffer, 0,2 mmol/l dntp karışımı, 1,25 U Taq polimeraz, 12 pmol 4G veya 5G spesifik primer, 12 pmol downstream primer, 12 pmol upstream primer içeren 25 μl PCR karışımında thermal cycler cihazında (Amplitronyx 4, USA) amplifiye edildi. Kullanılan primer dizileri 5G aleli için, 5 -GTC TGG ACA CGT GGG GG-3, 4G aleli için, 5 -GTC TGG ACA CGT GGG GA-3, downstream primer için, 5 -TGC AGC CAG CCA CGT GAT TGT CTA G-3 ve upstream primer için, 5 -AAG CTT TTA CCA TGG TAA CCC CTG GT-3 şeklindedir. Amplifikasyon için reaksiyon karışımı 94 o C de 1 dk, 54 o C de 30 sn ve 72 o C de 40 sn den oluşan 35 döngüye tabi tutuldu. PCR ürünü oluşan fragmentlerin ayırımı için % 2 lik agaroz jel elektroforezine tabi tutuldu. 139 bç bant 4G ve 5G alelini tanımladı. Buna göre 4G primeri ile 139 bç bant verip 5G primeri ile 139 bç bant vermeyen örnekler homozigot 4G genotipli, 5G primeri ile 139 bç bant verip 4G primeri ile 139 bç bant vermeyen örnekler homozigot 5G genotipli, her iki primer ile 139 bç bant verenler ise heterozigot 4G/5G genotipli olarak belirlendi (Şekil 1).

63 Muş İlinde Tekrarlayan Gebelik Kayıpları İle Mthfr C677t Ve A1298c Ve Pai-1 4g/5g Polimorfizmleri Arasındaki İlişki Ve Alel Frekansları Association Between Recurrent Pregnancy Losses And Mthfr C677t And A1298 And Pai-1 4g/5g Polymorphisms And Allele Frequencies In Muş Şekil 1. PAI-1 geni 4G/5G Polimorfizmi Jel Görüntüsü (A) 4G primer ile PCR ürünleri (B) 5G primer ile PCR ürünleri MTHFR geni C677T polimorfizmi genotip tayini MTHFR geni 677. baz çiftini içeren gen bölgesini çoğaltmak üzere, 5 μl DNA, 10X PCR Buffer, 0,2 mmol/l dntp karışımı, 1.25 U Taq polimeraz, 10 pmol spesifik F ve R primer içeren 50 μl PCR karışımında thermal cycler cihazında (Amplitronyx 4, USA) amplifiye edildi. Kullanılan primer dizileri 5 - AGG ACG GTG CGG TGA GAG TG- 3 ve 5 - TGA AGG AGA AGG TGT CTG CGG GA- 3 şeklindedir. Amplifikasyon için reaksiyon karışımı 94oC de 1 dk, 63oC de 1 dk ve 72oC de 1 dk dan oluşan 40 döngüye tabi tutuldu. Elde edilen 198 bç lik PCR ürünlerinden 10 μl si 1 ünite Hinf I enzimi (Vivantis) ile 1 saat 37oC de kesime bırakıldı. Kesim sonrası oluşan ürün fragmentlerin ayırımı için % 3 lük agaroz jel elektroforezine tabi tutuldu. Buna göre 198 bç lik fragment elde edilenler 677 CC, 198 ve 175 bç lik fragment elde edilenler 677 CT ve 175 bç lik fragmentler elde edilenler ise 677 TT olarak belirlendi (Şekil 2). MTHFR geni A1298C polimorfizmi genotip tayini MTHFR geni 1298. baz çiftini içeren gen bölgesini çoğaltmak üzere, 5 μl DNA, 10X PCR Buffer, 0,2 mmol/l dntp karışımı, 1.25 U Taq polimeraz, 10 pmol F ve R spesifik primer içeren 50 μl PCR karışımında thermal cycler cihazında (Amplitronyx 4, USA) amplifiye edildi. Kullanılan primer dizileri 5 - CTT TGG GGA GCT GAA GGA CTA CTA C- 3 ve R: 5 - CAC TTT GTG ACC ATT CCG GTT TG- 3 şeklindedir. Amplifikasyon için reaksiyon karışımı 94oC de 1 dk, 63oC de 1 dk ve 72oC de 1 dk dan oluşan 40 döngüye tabi tutuldu. Elde edilen 128 bç lik PCR ürünlerinden 10μl si, 1 ünite Mbo II enzimi (Vivantis) ile 1 saat 37oC de kesime bırakıldı. Kesim sonrası oluşan ürünler fragmentlerin ayırımı için % 3 lük agaroz jel elektroforezine tabi tutuldu. Buna göre 100 bç lik fragmentlere sahip olanlar 1298 AA; 100 ve 72 bç lik fragmentlere sahip olanlar 1298 AC ve 72 bç lik fragmentlere sahip olanlar 1298 CC olarak belirlendi (Şekil 3). İstatistiksel Analiz Verilerin istatistiksel analizi için SPSS 15.0 paket programı kullanılmıştır. Genotip dağılımlarının hasta ve kontrol gruplarında karşılaştırılması için Pearson χ 2 yöntemi uygulanmıştır. P değeri 0.05 ten küçük olanlar anlamlı olarak kabul edilmiştir.

64 BAYRAM ve ark. Şekil 2. MTHFR geni C677T Polimorfizmi Jel Görüntüsü BULGULAR Hasta ve kontrol grupları arasında, PAI-1 geni 4G/5G ve MTHFR geni C677T ve A1298C polmorfizmleri alel frekansları açısından bir farklılık saptanmadı (p>0.05) (Tablo 1). Genotip dağılımları karşılaştırıldığında ise PAI-1 geni 4G/5G ve MTHFR geni A1298C polimorfizmleri Şekil 3. MTHFR geni A1298C Polimorfizmi Jel Görüntüsü açısından hasta grubu ve kontrol grubu arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark olmadığı belirlendi (p>0,05). MTHFR geni C677T polimorfizmi genotip dağılımına bakıldığında ise gruplar arasında anlamlı bir farklılık olduğu belirlendi (p<0,05). Gruplar arasındaki genotip dağılımları Tablo 2 de gösterilmiştir. Polimorfizm tipi PAI-1 4G/5G 4G 5G MTHFR C677T T C MTHFR A1298C C Hasta allel 42 (%61,76) 26 (%38,24) 6 (%91,18) 62 (%8,82) Kontrol allel p değeri 36 (%52,94) 32 (%47,06) >0,05 11 (%16,2) 57 (%83,8) >0,05 A 39 (%53,35) 29 (%42,65) 34 (%50) 34 (%50) >0,05 Tablo1. Hasta ve kontrol grubu arasındaki PAI-1 geni 4G/5G MTHFR geni C677T ve A1298C gen polimorfizmlerinin alel frekansları Polimorfizm tipi Hasta # PAI-1 4G/5G 4G/4G 16 4G/4G 10 5G/5G 8 MTHFR C677T T/T C/T C/C MTHFR A1298C C/C A/C A/A 3 0 31 3 23 8 Kontrol # p değeri 11 14 9 >0,05 0 11 23 <0,05 6 22 6 >0,05 Tablo 2. Hasta ve kontrol grubu arasındaki PAI-1 geni 4G/5G MTHFR geni C677T ve A1298C gen polimorfizmlerinin genotip dağılımları

65 Muş İlinde Tekrarlayan Gebelik Kayıpları İle Mthfr C677t Ve A1298c Ve Pai-1 4g/5g Polimorfizmleri Arasındaki İlişki Ve Alel Frekansları Association Between Recurrent Pregnancy Losses And Mthfr C677t And A1298 And Pai-1 4g/5g Polymorphisms And Allele Frequencies In Muş TARTIŞMA Son yıllarda, tekrarlayan gebelik kayıpları ile genetik polimorfizmler arasındaki ilişkileri ortaya koyan pek çok genetik çalışma bulunmaktadır. Ancak tekrarlayan gebelik kayıplarının patogenezinde bu polimorfizmlerin etkisine ilişkin veriler çelişkiler içermektedir. Bu çelişkiler, çalışmaya dahil edilen araştırma ve kontrol grubu olgu sayıları ile bu grupları oluşturan bireylerin seçim kriterlerinin değişkenlik göstermesini ve ayrıca etnik ve coğrafik dağılımdaki farklılıklardan dolayı alel frekansları arasındaki çeşitliliği açıklamaktadır. Bu nedenle biz de bu çalışmada, Muş ilindeki tekrarlayan düşük olgularında PAI-1 geni 4G/5G ve MTHFR geni C677T ve A1298C polimorfizmleri arasında bir ilişki olup olmadığını ve alel frekanslarını belirlemeyi amaçladık. Çalışmamız sonucunda hasta ve kontrol grubu bireyleri arasında PAI-1 geni 4G/5G ve MTHFR C677T ve A1298C polimorfizmleri alel frekansları açısından anlamlı bir farklılık tespit edilmemiştir. Kontrol grubu bireylerimizde bu polimorfizmlere ait alel frekansları Türk populasyonuna ilişkin prevelans ile uygunluk göstermiştir (2, 7,17-20). Genotipler açısından hasta ve kontrol grubunu karşılaştırdığımızda ise PAI-1 geni 4G/5G ve MTHFR A1298C polimorfizmleri genotip dağılımlarının gruplar arasında bir farklılık göstermediğini tespit ettik. Bizim bulgularımızla uyumlu olarak Dossenbach- Glaninger ve arkadaşlarının yapmış oldukları çalışmada PAI-1 geni 4G/5G polimorfizminin Avusturya popülasyonunda tekrarlayan düşük olgularında bir risk faktörü olmadığı belirtilmiştir (16). Halbuki Ghosh ve arkadaşlarının Hindistan, Bucholz ve arkadaşlarının Alman popülasyonunda yapmış oldukları çalışmalarda PAI-1 geni 4G/5G polimorfizmi 4G genotipinin tekrarlayan düşük olgularında önemli olduğu vurgulanmıştır (12,13). Tepeli ve arkadaşları Eskişehir ilinde Türk popülasyonunda yapmış oldukları çalışmada MTHFR geni C667T ve A1298C polimorfizmlerinin tekrarlayan düşük kayıpları için bir risk oluşturmadığını, gruplar arasında genotipler ve alel frekansları açısından bir fark bulunmadığını belirtmişlerdir (2). Bu bulgular bizim bulgularımıza benzerlik göstersede, Muş ilinde MTHFR geni C677T polimorfizmi gruplar arasında genotipler açısından farklılık göstermiştir. 677 TT mutantlığı 34 hasta bireyden üçünde görülmüş ancak kontrol grubunda rastlanılmamıştır. 677 CT heterozigotluğuna ise sadece kontrol grubunda rastlanılmıştır. Bu bulgular her ne kadar istatistiksel olarak anlam ifade ediyor olsa da tekrarlayan gebelik kayıpları için bir risk faktörü olarak gözükmemektedir. Vettriselvi ve arkadaşlarının Hindistanda, Carp ve arkadaşlarının İsrail de yapmış oldukları çalışmada da tekrarlayan gebelik kayıpları ile MTHFR geni C677T polimorfizmi arasında bir ilişki olmadığı belirtilmiştir (21,22). Bazı çalışmalarda ise, MTHFR C677T homozigot TT varyantına sahip bireylerde homosistein düzeylerinin çok yükseldiği ve bu artışın tekrarlayan gebelik kayıpları ile anlamlı düzeyde ilişkili olduğu bildirilmiştir (9,23,24). Son yıllarda yapılan meta-analiz verileri de tekrarlayan gebelik kayıpları ile C677T varyantı arasında herhangi bir ilişki olmadığı yönündedir (7,25,26). Hohlagschwandtner ve arkadaşları trombofilik 6 polimorfizmi kombine olarak inceledikleri çalışmada MTHFR geni A1298C ve C677T polimorfizmleri alel ve genotip frekanslarının kontrol grubuna göre istatistiksel olarak anlamlı bir fark oluşturmadığını, yine tüm genler kombine olarak ele alındığında da kontrol grubuna göre anlamlı farklılığın bulunmadığını bildirmişlerdir (27). Buna karşılık, 10 trombofilik gen polimorfizmi ile tekrarlayan gebelik kayıpları arasındaki ilişkiyi belirlemek amacıyla yapılan çalışmalarda, yine MTHFR A1298C ve

66 BAYRAM ve ark. C677T polimorfizmleri alel ve genotip frekanslarının kontrol grubuna göre anlamlı bir farklılık göstermediği, ancak tüm genlerin homozigot mutasyon prevelansları birlikte değerlendirildiğinde tekrarlayan gebelik kaybı olan kadınlarda toplam homozigot mutasyon oranının ileri düzeyde arttığı öne sürülmüştür (28,29). Sonuç olarak, Muş ilinde çalışmamıza dahil edilen tekrarlayan gebelik kayıplarında PAI-1 geni 4G/5G ve MTHFR geni C677T ve A1298C KAYNAKLAR 1. Alataş E. Tekrarlayan gebelik kayıplarında tanı ve tedavinin yönlendirilmesi. TJD Uzmanlık Sonrası Eğitim Dergisi, 2004; 6:19-25. 2. Tepeli E, Müslümanoğlu HM, Uludağ A, et al. Eskişehir ilinde idiyopatik tekrarlayan gebelik kayıpları ile metilentetrahidrofolat redüktaz (MTHFR) C677T ve A1298C polimorfizmleri arasındaki ilişki. Osmangazi Tıp Dergisi, 2007; 29(1):1-11. 3. Oral D, Alp MN, Budak T. Ailesel Resiprokal Translokasyon Olgusu ve Tekrarlayan Düşükler. Dicle Tıp Dergisi, 2006; 33(3):182-184. 4. Balcı A, Yirmibeş M, Bal F, et al. Ailesel Resiprokal Translokasyon Olgusu ve Tekrarlayan Düşükler. Perinatoloji Dergisi, 1996; 4(4):218-219. 5. Bagos PG. Plasminogen activator inhibitor-1 4G/5G and 5,10- methylene-tetrahydrofolate reductase C677T polymorphisms in polycystic ovary syndrome. Molecular Human Reproduction, 2009; 15(1):19-26. 6. Karadeniz M, Erdoğan M, Berdeli A, et al. 4G/5G polymorphism of PAI-1 gene and ALu-repeat I/D polymorphism of TPA gene in Turkish patients with polycystic ovary syndrome. Journal of Assisted Reproduction and Genetics, 2007; 24:412-418. 7. Gökosmanoğlu F, Cinemre H, Bilir C. Habituel abortus nedeniyle takip edilen iki olguda MTHFR defekti. Perinatoloji Dergisi, 2008; 16(1):31-35. polimorfizmlerinin tek başına risk faktörü olmadığı saptanmıştır. Ancak polimorfizm çalışmalarının geniş popülasyonlarda daha anlamlı sonuçlar verdiği gözönünde bulundurulduğunda hasta sayısının artırılması gerektiğine ve tekrarlayan düşük kayıplarında risk faktörü olarak öne sürülmüş diğer gen polimorfizmlerinin de çalışmaya dahil edilerek kombine olarak değerlendirilmesi gerektiğini düşünmekteyiz. 8. Orio F, Palomba S, Di Biase S, et al. Homocysteine levels and C677T polymorphism of methylenetetrahydrofolate reductase in women with polycystic ovary syndrome. The Journal of Clinical Endocrinology & Metabolism, 2003; 88(2):673-679. 9. Nelen WL, Blom HJ, Streeers EA, et al. Hyperhomocysteinemia and recurrent early pregnancy loss: a meta analysis. Fertility and Sterility, 2000; 74:1196-9. 10. Sarig G, Younis JS, Hoffman R, Lanir N, Blumenfeld Z, Brenner B. Thrombophilia is common in women with idiopathic pregnancy loss and is associated with late pregnancy wastage. Fertil Steril, 2002 Feb;77(2):342-7. 11. Quere I, Bellet H, Hoffet M, Janbon C, Mares P, Gris JC. A woman with five consecutive fetal deaths: case report and retrospective analysis of hyperhomocysteinemia prevelance in 100 consecutive women with recurrent miscarriages. Fertil Steril, 1998, 69:152-54. 12. Ghosh K, Shetty S, Vora S. Plasminogen activator inhibitor-1 4G/5G gene polymorphism in women with fetal loss. International Journal of Gynecology & Obstetrics, 2009 ;107(2):159-60. 13. Bucholz T, Lohse N, Rogenhofer N, et al. Polymorphisms in the ACE and PAI-1 genes are associated with recurrent spontaneous miscarriages. Human Reproduction, 2003; 18(11):2473-2477.

67 Muş İlinde Tekrarlayan Gebelik Kayıpları İle Mthfr C677t Ve A1298c Ve Pai-1 4g/5g Polimorfizmleri Arasındaki İlişki Ve Alel Frekansları Association Between Recurrent Pregnancy Losses And Mthfr C677t And A1298 And Pai-1 4g/5g Polymorphisms And Allele Frequencies In Muş 14. Foka ZJ, Lambropoulos AF, Saravelos H, et al. Factor V leiden and prothrombin G20210A mutations, but not methylenetetrahydrofolate reductase C677T, are associated with recurrent miscarriages. Hum Reproduction, 2000 ;15(2):458-62. 15. Makino A, Nakanishi T, Sugiura- Ogasawara M, et al. No association of C677T methylenetetrahydrofolate reductase and an endothelial nitric oxide synthase polymorphism with recurrent pregnancy loss. American Journal of Reproductive Immunology, 2004 ;52(1):60-6. 16. Dossenbach-Glaninger A, Trotsenburg M, Dossenbach M, et al. Plasminogen activator inhibitor I 4G/5G polymorphism and coagulation factor XIII Val34Leu polymorphism: impaired fibrinolysis and early pregnancy loss. Clinical Chemistry, 2003; 49(7):1081-1086. 17. Gunes HV, Cosan DT, Ata N, et al. Plasminogen Activator Inhibitor Type- 1 Gene 4G/5G Polymorphism Is Associated with Hypertensive Patients in Turkish Population. Genetic Testing and Molecular Biomarkers, 2010 ; 14(3):303-305. 18. Sazcı A, Ergul E, Kaya G, et al. Genotype and allele frequencies of the polymorphic methylenetetrahydrofolate reductase gene in Turkey. Cell Biochemistry and Function, 2005 ;23(1):51-4. 19. Kucukarabaci B, Gunes HV, Ozdemir G, et al. Investigation of Association between Plasminogen Activator Inhibitor Type-1 (PAI-1) Gene 4G/5G Polymorphism Frequency and Plasma PAI-1 Enzyme Activity in Patients with Acute Stroke. Genetic Testing, 2008 ;12(3): 443-451. 20. Cosan D, Kurt E, Kurt H, et al. Plasminogen Activator Inhibitor Type- 1 (PAI-1) Gene 4G/5G Polymorphism In Patients With Asthma In Turkish Adult Patients With Asthma. Genetic Testing and Molecular Biomarkers, 2009 ;13(4): 543-546. 21. Vettriselvi V, Vijayalakshmi K, Paul SFD, et al. ACE and MTHFR gene polymorphisms in unexplained recurrent pregnancy loss. Journal of Obstetrics and Gynaecology Research, 2008 ; 34(3):301-306. 22. Carp H, Salomon O, Seidman D, et al. Prevalence of genetic markers for thrombophilia in recurrent pregnancy loss. Human Reproduction, 2002 ;17(6):1633-1637. 23. Kim NK, Choi YK, Kang MS, et al. Influence of combined methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) and thymidylate synthase enhancer region (TSER) polymorphisms to plasma homocysteine levels in Korean patients with recurrent spontaneous abortion. Thrombosis Research, 2006 ; 117:653-58. 24. Lissak A, Sharon A, Fruchter O, et al. Polymorphism for mutation of cytosine to thymine at location 677 in the methylenetetrahydrofolate reductase gene is associated with recurrent early fetal loss. American Journal of Obstetrics & Gynecology, 1999 ;181(1):126-30. 25. Rey E, Kahn SR, David M, et al. Trombophilic disorders and fetal loss: a meta-analysis. Lancet, 2003 ;361:901-908. 26. Ren A, Wang J. Methylenetetrahydrofolate reductase C677T polymorphism and the risk of unexplained recurrent pregnancy loss: a meta-analysis. Fertility and Sterility, 2006 ;86(6):1716-22. 27. Hohlagschwandtner M, Unfried G, Heinze G, et al. Combined thrombophilic polymorphisms in women with idiopathic recurrent miscarriage. Fertility and Sterility, 2003 ;79(5):1141-8. 28. Goodman CS, Coulam CB, Jeyendran RS, et al. Which thrombophilic gene mutations are risk factors for recurrent pregnancy loss? American Journal of Reproductive Immunology, 2006 ;56(4):230-6. 29. Coulam CB, Jeyendran RS, Fishel LA, et al. Multiple thrombophilic gene mutations rather than specific gene mutations are risk factors for recurrent miscarriage. American Journal of Reproductive Immunology, 2006 ;55(5):360-8.