TÜBERKÜLOZ TANISINDA YENİ BELİRTEÇLER Doç.Dr.Alpaslan ALP Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı 24.Mart.2017 Antalya 1
KLİMİK-2017 Kongresinin Değerli Düzenleme Kurulu Üyeleri ve Katılımcılarına 24 Mart 2017 tarihinde yapmam gereken Tüberküloz Tanısında Yeni Belirteçler başlıklı sunumumu, planlamamın dışında gelişen ve sunumumla aynı tarihe denk gelen, sorumlusu olduğum hastanemiz Tüberküloz Laboratuvarının Sağlık Bakanlığı adına yapılacak olan Yetkilendirme ve Ruhsatlandırma Teftiş ve Ziyareti nedeniyle yapamayacağımı üzülerek bildirmek istiyorum. Özür ve saygılarımla. Doç.Dr. Alpaslan Alp 2
Artan Laboratuvar Etkinliği Tanı Prognoz Tedavi izlemi 3
Mikrobiyolojik Tanı için; İdeal Test Var mı? Duyarlılığı yüksek olsun, Özgüllüğü yüksek olsun, Uygulaması çok zor olmasın, Hızlı sonuç alınabilsin, Ucuz olsun 4
Biyobelirteç Biyolojik süreçlerde, Patolojik durumlarda veya Tedaviye yanıtı belirlemede kullanılabilecek, Mikroorganizma veya konağa ait Statik veya dinamik, ölçülebilir objektif özelliklerdir. 5
Tüberküloz Biyobelirteçleri I. Hastalığın Tanısı II. Aktif TB da Tedavi yanıtının izlenmesi III. Latent tüberküloz reaktivasyonu IV. Aşı ile gelişen immun yanıtı belirlemede tanımlanmaya çalışılmaktadır 6
TB tanısında kullanılan Balgam, BAL Kan örnekler (Serum/Plazma/Periferik Kan Mononüklear Hücreleri) idrar Nefes (solunum havasında picomolar düzeyinde bulunabilen buharlaşabilen /uçucu, enfeksiyöz ajana ve/veya enfekte konağa ait organik bileşikleri tanımlama amacıyla) Kullanılarak çok sayıda çalışma yapılmakta Biyobelirteçlerin etkinliği tanımlanmaya çalışılmaktadır 7
Mycobacterium tuberculosis e ait En sık araştırılan antijen biyobelirteçler MtbAg85 kompleks 30-32 kda ağırlığındaki Arabinogalaktan molekülüne özgü üç proteinden (Ag85a,Ag85b ve Ag85c) oluşmakta mikobakteri hücre duvarında yer alan trehaloz dimikolatın sentezinde rol oynar sekrete edildiklerinden, kanda, balgam veya idrarda bulunabilen antijendir. İzoniyazid, bu kompleksin ekspresyonunu indükler İzoniazid tedavisi verilen kişilerde, balgamda, 14. gündeki Ag85 kompleks yüksekliği 90. günden sonra görülen persistans ile ilişkilendirilmektedir. 8
Mycobacterium tuberculosis e ait biyobelirteçler Lipoarabinomannan (LAM) İdrarda,serum ve plazmada LAM saptayabilen ticari testler geliştirilmiştir. Duyarlılığı yüksek olmamakla birlikte özellikle HIV ile koenfekte kişilerde hızlı tanıda kullanılabilir 9
Konağın immün yanıtında etki gösteren biyobelirteçler Özellikle Aktif ve Latent Tb ayrımında kullanılabilecek biyobelirteçler; IP-10 (IFN-γ inducible protein) aktive antijen sunucu hücrelerce eksprese edilen bir kemokin dir IFN-γ ya alternatif olabilecek en önemli biyobelirteç IFN-γ dan daha yüksek düzeyde sekrete olduğundan küçük hacimde örnek yeterli Tam kan örneklerinde stabil kalır (hasta başı test olabilir) IL-4, TNF-α, MCP-1 ve MCP-2, IL-15, IL-17 gibi sitokinler Mikro RNA (mirna) 10
Mikro RNA (mirna) Transkripsiyon sonrası gen ekspresyonunda görev alan 19-22 nükleotid uzunluğunda RNA lardır, hücre metabolizması, proliferasyonu, farklılaşmayı immün yanıtı düzenlerler. Hastalarının periferal kan mononükleer hücre (PBMC) örneklerinde aktif tüberkülozlu hastalarda Latent TB olanlara kıyasla mirna daha yüksek düzeyde eksprese olur, MicroRNA Array ile saptanır 11
Mpt64 antijeni M.tuberculosis komplekse yüksek özgüllük gösteren, Yaklaşık 23-24 kda ağırlığında bir immunojenik bir proteindir Enfeksiyonun erken döneminde T hücre proliferasyonunu ve IFN-γ salınımını stimule eder. Tüberküloz tanısı için deri testi çalışmalarında, ESAT-6 antijeniyle birlikte aşı olarak da kullanılmaktadır. Mpt64 antijeni ile ; immünokromatografik, immünohistokimyasal, ELISA ve kantitatif gerçek zamanlı PCR a dayalı testleri geliştirilmiş immünokromatografik testler M.tuberculosis ile Tüberküloz Dışı Mikobakterileri ayırmada yaygın kullanım alanı bulmuştur 12
Tüberküloz Tanısında Biyobelirteçler Infectious Disease Reports 2016;8;6568 13
Tüberküloz Tedavi Etkinliğinin Belirlenmesinde Biyobelirteçler Infectious Disease Reports 2016;8;6568 14
Latent tüberküloz tanısında belirteçler Geçerliliği onaylanmış olanlar IFN-γ salınım Testi (IGRA) Tam kan, ELISA ile (Quatiferon TB Gold intube ) PBMC, ELISPOT ile (T-SPOT.TB) Tuberculın Deri Testi (TDT) Patojene ait olanlar Önerilen bir strateji yok Konağa ait olanlar Uyarılmamış kan Serum/Plazma (Endotelyal growth factor-egf, IL4, IL6, IP 10, TLR 4, MCP3, MCP1) Uyarılmış Kan Mtb Latency antijenler ( FACS /ICS/ ELISA/ ELISPOT ile Fenotipleme) 15
Tüberkülozun Tanısında Aktif TB ve Latent TB ayrımında yada Latent TB dan Aktif TB a geçişi tanımlamada Birden fazla biyobelirtecin birlikte kullanımı yaralı olabilir 16
Tüm Algoritmayı Değiştirebilecek Yeni Strateji BİYOBELİRTEÇLERİN ÖTESİNDE İLAÇ DİRENCİ SORUNUNU ÇÖZEBİLECEK YENİ HEDEFLERE ODAKLI CRISPR-Cas Sistemi 17
Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats CRISPR Bu Diziler Ne??? Yabancı plazmid ve bakteriyofaj dizileri!!!
Doğal-Edinilmiş Bağışıklık
Bakterilerde Adaptif İmmünite: CRISPR-Cas Sistemleri; CRISPR dizileri: 28-37 nükleotid Ayırıcı diziler: 32-38 nükleotid CRISPR lokuslarındaki tekrar sayısı genellikle 50 den az.
Bakterilerde Adaptif İmmünite: CRISPR-Cas Sistemleri; Barrangou R, et al:crispr-cas systems: prokaryotes upgrade to adaptive immunity. Mol Cell 2014; 54:234-244. doi:10.1016/j.molcel.2014.03.011.
Luo ML, et al: Current and future prospects of CRISPR-based tools in bacteria. Biotechnology and Bioengineering 2016; 113:930-943.
Potansiyel Kullanımları Bacteriyel Genom Editing Bacteriyel Gen Regulasyonu Next-Generation Antimikrobiyaller
CRISPR Temelli Antimikrobiyaller Luo ML, et al: Current and future prospects of CRISPR-based tools in bacteria. Biotechnology and Bioengineering 2016; 113:930-943.
Teşekkürler 29