RespiFinder RG Panel El Kitabı
|
|
- Çağatay Parlak
- 7 yıl önce
- İzleme sayısı:
Transkript
1 Kasım 2013 RespiFinder RG Panel El Kitabı 25 Versiyon 1 Kalitatif in vitro diagnostik Rotor-Gene Q aletleriyle kullanılmak üzere PathoFinder B.V., Randwycksingel 45, 6229 EG Maastricht, THE HOLLANDA Distribütör: QIAGEN GmbH, QIAGEN Strasse 1, Hilden, ALMANYA R TR Sample & Assay Technologies
2 QIAGEN Sample and Assay Technologies QIAGEN her biyolojik örneğin içeriğinin saptanması ve izolasyonunu mümkün kılacak şekilde yenilikçi örnek ve test teknolojilerinin önde gelen sağlayıcısıdır. Gelişmiş ve yüksek kalitede ürünlerimiz ve hizmetlerimiz örnekten sonuca kadar başarıyı garanti eder. QIAGEN şunlarda standartları belirler: DNA, RNA ve protein saflaştırma Nükleik asit ve protein testleri microrna araştırmaları ve RNAi Test ve örnek teknolojilerinin otomasyonu Misyonumuz olağanüstü başarılar elde etmenizi ve yeni buluşlar yapmanızı sağlamaktır. Daha fazla bilgi için, adresini ziyiaret ediniz.
3 İçindekiler Kullanım Amacı 4 Özet ve Açıklama 4 İşlemin Prensibi 4 Hedef genler 6 Sağlanan Materyal 9 Kit içeriği 9 Gereken ama Sağlanmayan Malzemeler 9 Uyarılar ve Önlemler 10 Genel önlemler 11 Reaktif Saklama ve Muamele 12 Örnek Kullanımı ve Saklama 12 İşlem 13 Nükleik asit ekstraksiyonu ve hazırlama 13 Bir negatif kontrol kullanma 13 Bir dahili kontrol ve taşıyıcı RNA kullanma 14 Protokol: PCR amplifikasyonu ve erime analizi 16 Sonuçların Yorumlanması 33 Normalizasyon 33 Analiz 33 Eşik 33 Sorun Giderme kılavuzu 34 Kalite Kontrol 37 Sınırlamalar 38 Performans Özellikleri 38 Referanslar 38 Semboller 38 İrtibat Bilgisi 39 Sipariş Bilgisi 40 RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/2013 3
4 Kullanım Amacı RespiFinder RG Panel insanlarda solunum yolu enfeksiyonlarına yol açabilen 16 RNA virüsü,* 2 DNA virüsü ve 3 bakteriyi saptamak ve ayırmak için bir kalitatif multipleks PCR testidir: adenovirüs, bocavirüs, corona NL63, corona OC43, corona 229E, corona HKU1, hmpv, influenza A, influenza B, influenza A H1N1v, parainfluenza 1, parainfluenza 2, parainfluenza 3, parainfluenza 4, rinovirüs/enterovirüs, RSV-A, RSV-B, Bordetella pertussis, Legionella pneumophila ve Mycoplasma pneumoniae. RespiFinder RG Panel diğer klinik ve laboratuvar bulgularıyla birlikte kullanıldığında solunum yolu enfeksiyonunun tanısına yardımcı olur. Negatif sonuçlar viral veya bakteriyel solunum yolu enfeksiyonu olmadığı anlamına gelmez; negatif sonuçlar tanı, tedavi ve diğer ilgili kararlar için tek temel olarak kullanılmamalıdır. Pozitif sonuçlar diğer patojenlerle ortak enfeksiyon olasılığını ortadan kaldırmaz. Saptanan patojen(ler) hastalığın kesin nedeni olmayabilir. Son tanı için diğer laboratuvar testleri ve klinik durumun değerlendirilmesi de kullanılmalıdır. Ürün sadece laboratuvar uzmanları tarafından kullanım içindir. Özet ve Açıklama Akut solunum yolu enfeksiyonu, yetişkinler ve çocuklarda en sık görülen akut enfeksiyon tipidir ve immünyetmezlikli hastalarda önemli bir hastalık nedenidir. Solunum yolu enfeksiyonları sıklıkla üst solunum yolu enfeksiyonları (ÜSYE) ve alt solunum yolu enfeksiyonları (ASYE) olarak ayrılır. ÜSYE, rinore, konjonktivit, farenjit, otitis media ve sinüziti içerir. ASYE pnömoni, bronşiyolit ve bronşiti içerir. Hem virüsler hem bakteriler akut SYE durumuna neden olabilir ve neden olan ajanların hem sayısı çoktur hem de çok değişik ajanlar vardır ve böylece tanı koymak açısından önemli zorluklara yol açarlar. Nükleik asit amplifikasyon testlerinin tek başına veya çoklu formatta hızlı, hassas ve spesifik alternatifler oldukları ispatlanmıştır. Çoklu (multipleks) testler birden fazla hedefin birlikte amplifikasyonunu mümkün kılarak miks enfeksiyonların önemi açısından ve solunum hastalığının prognozu ve nüks durumu açısından bilgi verir. İşlemin Prensibi RespiFinder RG Panel tek bir gerçek zamanlı PCR reaksiyonunda 13 adede kadar hedefin yüksek ölçüde ayrıntılı analizini mümkün kılan bir teknoloji olan SmartFinder teknolojisini temel alır. RespiFinder RG Panel 21 farklı patojenin ve ayrıca bir dahili kontrolün saptanmasını mümkün kılan floresan etiketli 12 SMART (gerçek zamanlı tek tüp multipleks amplifikasyon) probuyla birlikte çeşitli MultiFinder prob setleri bulunur. Reaksiyon hedef (c)dna'yı amplifiye etmek için * RespiFinder RG Panel 16 virüsü saptar ama rinovirüsü enterovirüsten ayırmaz. 4 RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/2013
5 bir PCR adımıyla revers transkripsiyon adımını birleştiren bir ön amplifikasyonla başlar. Bunun sonucunda ön amplifikasyon reaksiyonunun bir kısmı 2 PCR tüpüne aktarılır. Bir prob hibridizasyonu adımı ve bir prob ligasyonu ve amplifikasyonu adımından oluşan iki ayrı SmartFinder reaksiyonu yapılır. Saptama, erime eğrisi analizi kullanılarak gerçekleştirilir. Tüm iş akışının şematik bir temsili Şekil 1'de verilmiştir. Şekil 1. RespiFinder RG Panel iş akışına genel bakış. RespiFinder RG Panel patojen nükleik asitlerini saptamak için Rotor-Gene Q MDx veya Rotor-Gene Q aletini kullanır. RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/2013 5
6 Teste gerçek negatif örneklerle nükleik asit degredasyonu, PCR inhibisyonu veya test başarısızlığı nedeniyle yalancı negatif örnekleri ayırmak üzere bir dahili kontrol (IC) dahil edilmiştir. Kullanılan örnek nazofaringeal sürüntülerden ekstraksiyonu ve saflaştırması yapılmış total nükleik asitlerdir. Örneklerin hazırlanması panel kapsamında ayrı bir süreçtir. Örnekleri kullanmak ve nükleik asitlerin ekstraksiyonunu ve saflaştırmasını yapmak için uygun yöntemler veya ürünler kullanın (bakınız Örnek Kullanımı ve Saklama, sayfa 12, ve Nükleik asit ekstraksiyonu ve hazırlama, sayfa 13). Hedef genler Prob ve primer tasarımı için kullanılan hedef genler Tablo 1'de gösterilmektedir. Tablo 1. RespiFinder RG Panel hedef genleri Hedef Kontrol Gen Dahili kontrol (IC) MS2 faj lizis proteini geni IC Virüsler Patojen kodu Adenovirüs Hekson geni (H) Adeno Bocavirüs Nonkapsid geni (NP1) Boca Corona 229E Nükleokapsid protein geni (NP) 229E Corona HKU1 Nükleokapsid fosfoprotein geni (N) HKU1 Corona NL63 Nükleokapsid protein geni (NP) NL63 Corona OC43 Nükleokapsid protein geni (NP) OC43 hmpv Nükleokapsid protein geni (NP) hmpv İnfluenza A Matriks protein geni (M1) InfA İnfluenza B Matriks protein geni (M1) InfB İnfluenza A H1N1v Nöraminidaz geni H1N1 Parainflüenza 1 Hemaglutinin-nöraminidaz geni (HN) PIV1 Parainflüenza 2 Hemaglutinin-nöraminidaz geni (HN) PIV2 Parainflüenza 3 Hemaglutinin-nöraminidaz geni (HN) PIV3 Tablo bir sonraki sayfada devam ediyor 6 RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/2013
7 Tablo 1. Devam Hedef Virüsler (devam) Gen Patojen kodu Parainflüenza 4 Majör nükleokapsid protein geni (N) PIV4 Rinovirüs/ Enterovirüs 5' çevrilmemiş bölge poliprotein geni (PP) Rino/ Entero RSV-A Majör nükleokapsid protein geni (N) RSVA RSV-B Majör nükleokapsid protein geni (N) RSVB Bakteri Bordetella pertussis İnsersiyon dizisi 481 (IS481) B. pert Chlamydophila pneumoniae* Legionella pneumophila Mycoplasma pneumoniae Majör dış membran geni (OmpA) Makrofaj inhibitör potansiyatör geni (Mip) Sitadhesin protein geni (P1) C. pneu L. pneu M. pneu * Not: RespiFinder RG Panel Chlamydophila pneumoniae saptanması Sadece Araştırma Kullanımı içindir. Diagnostik işlemlerde kullanım için değildir. Bir hastalığın tanısı, önlenmesi veya tedavisi hakkında bilgi sağlamak açısından kullanılması için herhangi bir iddiada veya temsilde bulunulmaz. Her örnek için bir ön amplifikasyon ve 2 SmartFinder reaksiyonu yapılır. Patojenler, etiketler ve 2 SmartFinder reaksiyonunda karşılık gelen SMART hibridizasyon probları için belirtilen T m Tablo 2'de gösterilmiştir. RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/2013 7
8 Tablo 2. SMART problarının hedefleri ve karşılık gelen T m değerleri Etiket SMART probu T m ( C) kabul edilebilir aralık Patojen kodu (karışım 1) Patojen kodu (karışım 2) Cy5 probu 1 50,5-53,5 L. pneu OC43 Cy5 probu 2 54,5-57,5 B. pert NL63 Cy 5 Cy5 probu 3 60,0-63,0 Rino/Entero 229E Cy5 probu 4 66,0-69,0 C. pneu* HKU1 Cy5 probu 5 70,5-73,5 M. pneu Cy5 probu 6 76,5-79,5 H1N1 ROX probu 1 52,5-55,5 RSVA PIV1 ROX probu 2 57,5-60,5 Adeno PIV2 ROX ROX probu 3 62,5-65,5 hmpv PIV3 ROX probu 4 66,5-69,5 RSVB PIV4 ROX probu 5 72,5-75,5 InfA Boca ROX probu 6 76,5-79,5 InfB BHQ 1 BHQ1 probu 1 70,5-73,5 IC IC * Not: RespiFinder RG Panel Chlamydophila pneumoniae saptanması Sadece Araştırma Kullanımı içindir. Diagnostik işlemlerde kullanım için değildir. Bir hastalığın tanısı, önlenmesi veya tedavisi hakkında bilgi sağlamak açısından kullanılması için herhangi bir iddiada veya temsilde bulunulmaz. 8 RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/2013
9 Sağlanan Materyal Kit içeriği RespiFinder RG Panel (25) Katalog no Reaksiyon sayısı 25 İçindekiler Pre-amplification Master Mix (Ön amplifikasyon Ana Karışım) Kapak rengi Hacim Mor 180 µl Internal Control (IC) (Dahili Kontrol) Siyah 300 µl Pre-amplification Primermix (Ön amplifikasyon Primermix) Hybridization Buffer (Hibridizasyon Tamponu) Beyaz 65 µl Sarı 80 µl Probemix 1 Kırmızı 40 µl Probemix 2 Mavi 40 µl TwoStep Buffer (İki Adımlı Tampon) Yeşil (amber tüpte) 1600 µl Ligase Enzyme (Ligaz Enzimi) Kahverengi 50 µl Taq Polymerase (Taq Polimeraz) Turuncu 20 µl Dilution Buffer (Dilüsyon Tamponu) Saydam 1700 µl RespiFinder RG Panel Handbook (English) (RespiFinder RG Panel El Kitabı) 1 Gereken ama Sağlanmayan Malzemeler Kimyasallarla çalışırken daima uygun bir laboratuvar önlüğü, tek kullanımlık eldivenler ve koruyucu gözlükler kullanın. Daha fazla bilgi için, ürün tedarikçisinden elde edilebilecek uygun güvenlik veri sayfalarına (SDS'ler) başvurun. RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/2013 9
10 Reaktifler RNA/DNA ekstraksiyon kiti (bakınız Nükleik asit ekstraksiyonu ve hazırlama, sayfa 13) RNaz/DNaz içermeyen su Sarf Malzemesi Hidrofobik filtreler içeren tek kullanımlık uçlar Hidrofobik filtreler içeren tek kullanımlık düşük retansiyon uçlar RNaz/DNaz içermeyen 1,5 ml tüpler RNaz/DNaz içermeyen 0,2 ml PCR tüpleri (kapaklı tek tüpler veya ayrı kapaklı strip tüpler) Strip Tüpler ve Kapaklar, 0,1 ml (kat. no veya ) Rotor- Gene Q aletleriyle kullanılmak üzere Ekipman Ayarlanabilir pipetler:* 0,1 2 µl, 2 20 µl, µl Çok kanallı ayarlanabilir pipet:* 1 10 µl (isteğe bağlı) Vorteks karıştırıcı* Tezgah santrifüjü* 2 ml tüpler için rotorlu Santrifüj*, 0,2 ml reaksiyon tüpleri için Soğutma bloğu veya buz Termal döngüleyici* 0,2 ml PCR tüpleri için ısıtmalı kapaklı ve 1 5 C/saniye rampa hızlı (ön-amplifikasyon ve hibridizasyon için; örn., GeneAmp PCR System 9700 blok tabanlı termal döngüleyici) Rotor-Gene Q MDx 5plex HRM* veya Rotor-Gene Q 5plex HRM* aleti ve aksesuarları Uyarılar ve Önlemler İn vitro diagnostik kullanım için Kimyasallarla çalışırken daima uygun bir laboratuvar önlüğü, tek kullanımlık eldivenler ve koruyucu gözlükler kullanın. Daha fazla bilgi için, lütfen uygun güvenlik veri sayfalarına (SDS'ler) başvurun. Bunlar çevrim içi olarak PDF halinde adresinde yer almaktadır ve kullanıcılar burada her QIAGEN kiti ve kit bileşeni için SDS'yi bulabilir, okuyabilir ve yazdırabilir. * Aletleri üreticinin önerilerine göre kontrol edildi ği ve kalibre edildiğinden emin olun 10 RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/2013
11 Kullanılan saflaştırma kiti için güvenlik bilgisi açısından ilgili kit el kitabına bakınız. Aletlerle ilgili güvenlik bilgisi açısından ilgili alet kullanıcı el kitabına bakınız. Örnek ve test atığını yerel güvenlik düzenlemelerinize uygun olarak atın. 24 saat acil bilgisi Kimyasal acil veya kaza yardımı aşağıdan günün 24 saati alınabilir: CHEMTREC ABD ve Kanada dışında Tel: (ödemeli aramalar kabul edilir) Genel önlemler Daima şunlara dikkat edin: Bu moleküler test sadece vasıflı laboratuvar personelince yapılmalıdır. Pozitif materyalleri (örnekler ve pozitif kontroller) tüm diğer reaktiflerden ayrı saklayın ve ekstrakte edin ve bunları reaksiyon karışımına konumsal açıdan ayrılmış bir yerde ekleyin. Testi yaparken tek kullanımlık eldivenler giyin. Çapraz kontaminasyonu önlemek için hidrofobik filtreler içeren tek kullanımlık uçlar kullanın. RT-PCR enzim karışımı, ligaz enzimi ve Taq polimerazı kullanırken hidrofobik filtreler içeren tek kullanımlık düşük retansiyon uçlar kullanın. Rnaz/DNaz içermeyen PCR flakonları kullanın. RNA/DNA örneklerini daima buz üstünde çözün ve bunları buz üstünde veya bir soğutma bloğunda tutun. Enzimleri buzluktan çıkardıktan sonra daima buzda veya bir soğutma bloğu içinde tutun. Enzimlere dikkatli davranın ve çok yavaş karıştırın. Çözüldüğünde reaktifleri bir santrifüjde 5 saniye santrifüje edin ve hafifçe yukarı ve aşağı pipetleyerek karıştırın. Tüm döngüleme programları Rotor-Gene Q yazılımına test yapılmadan önce girilmelidir. PCR flakonları ve plakları daima kısa süre santrifüje edin ve aerosollerden kaçınmak için dikkatli açın. Not: Kontaminasyonu önlemek için deneysel aktiviteleri PCR kabinlerinde şu 3 ayrı alan şeklinde yapmanızı kuvvetle öneririz: Alan 1: Ön amplifikasyon, hibridizasyon ve ligasyon/çözünme analizi için ana karışımlar hazırlayın. RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/
12 Alan 2: Karışıma RNA/DNA örneği ekleyin. Alan 3: Ön amplifikasyon, hibridizasyon ve erime eğrisi analizini 3 adımda yapın: Ön amplifikasyonu yapın. Ön amplifikasyon ürünlerini hibridizasyon karışımına ekleyin (tercihen bir PCR kabini içinde) ve hibridizasyon yapın. TwoStep karışımına hibridizasyon ürünlerini ekleyin (tercihen PCR kabininde) ve ligasyon, amplifikasyon ve erime eğrisi analizini yapın. Reaktif Saklama ve Muamele RespiFinder RG Panel bileşenleri 15 ila 30 C'de saklanmalıdır ve etikette belirtilen son kullanma tarihine kadar stabildir. Tekrarlanan dondurma çözmeden (>5 x) kaçınılmalıdır çünkü test performansını azaltabilir. Örnek Kullanımı ve Saklama Solunum patojeni saptanması yüksek kalitede örneklerin toplanması, laboratuvara hızla taşınmaları ve laboratuvar testinden önce uygun saklamaya dayanır. Nazofaringeal sürüntüler solunum yolunun viral ve/veya bakteriyel enfeksiyonlarının saptanması için uygundur. Klinik örnekler laboratuvara mümkün olduğunca hızlı şekilde taşınmalı, bölüntülere ayrılmalı ve işlenmelidir Örnekler 4 C'de tutulmalıdır. Eğer örnekler 48 saat içinde işlenemeyecekse dondurulmaları ve/veya 20 C altında, tercihen 70 C'de tutulmaları gerekir. 12 RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/2013
13 İşlem Nükleik asit ekstraksiyonu ve hazırlama Tablo 3'te gösterilen QIAGEN'den QIAamp MinElute Virus Spin Kiti RespiFind RG Panel kullanım için belirtilen insan örneği tipinden DNA ve RNA saflaştırma için doğrulanmıştır. Nükleik asit saflaştırmayı kit el kitabındaki talimata göre yapın. Tablo 3. RespiFinder RG Panel kullanılmak üzere doğrulanmış saflaştırma kiti Örnek tipi Nükleik asit izolasyon kiti Katalog numarası (QIAGEN) Nazofaringeal sürüntüler QIAamp MinElute Virus Spin Kit (50) µl örnek materyali kullanın ve 60 µl elüsyon tamponunda elüsyon yapın. Nükleik asitleri konsantre etmeye kalkışmamanızı kuvvetle öneririz çünkü bu durum RT-PCR enzimlerinin inhibisyon riskini arttırabilir. Lizis yapılmış örneğe bir dahili kontrol eklenir (bakınız Bir dahili kontrol ve taşıyıcı RNA kullanma, sayfa 14). QIAamp MinElute Virus Spin Kitini kullanırken lizis tamponunu örneğe bir laminar hava akışı kabininde eklemenizi öneririz. Örnek lizis yapıldıktan sonra ekstraksiyon işlemine tezgahta devam edilebilir. Kullandıktan sonra laminar hava akışı kabinini bir dekontaminasyon solüsyonu (örn., 1000 ppm çamaşır suyu)* ve UV ışığını 30 dakika çalıştırarak dekontamine etmek önerilir. Ekstraksiyonu yapılmış DNA/RNA'da dondurma-çözme döngülerinden mümkün olduğunca kaçının ve bir gün içinde işlenecekse nükleik asit ekstrelerini 4 C'de saklayın. Daha uzun dönemler için ekstraksiyonu yapılmış RNA/DNA'yı 20 C veya 70 C'de saklayın. Bir negatif kontrol kullanma Her çalışmada bir negatif kontrol olmalıdır. Bir negatif kontrol 200 µl PCR sınıfı su artı dahili kontrolden (IC) oluşur. Bu negatif kontrol nükleik asit * Kimyasallarla çal ışırken, tek kullanımlık daima uygun eldivenler bir laboratuvar ve koruyucu önlüğü gözlükler kullanın. Daha fazla bilgi için, ürün tedarikçisinden elde edilebilecek uygun güvenlik veri sayfalar ına (SDS'ler) başvurun. RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/
14 ekstraksiyonu işlemi dahil olmak üzere normal bir örnek muamelesi görür. Son analizde negatif kontrol FAM/ROX ve FAM/Cy5 kanallarında arka alan sinyali ve Green kanalında pozitif IC sinyali için bir referans görevi görür. Bir dahili kontrol ve taşıyıcı RNA kullanma QIAamp MinElute Virus Spin Kitinin RespiFinder RG Panel kombinasyon halinde kullanılması örnek hazırlama ve aşağı doğru test etkinliğini izlemek için saflaştırma işlemine bir dahili kontrol (IC) konmasını gerektirir. Ayrıca QIAamp MinElute Virus Spin Kiti taşıyıcı RNA hazırlanmasını gerektirir. IC bir MS2 fajıdır ve lizis RNA/DNA ekstraksiyonu ve RespiFinder RG Panel test performansı için ve olası PCR inhibisyonunun kontrolü için bir kontrol olarak sağlanır. IC, taşıyıcı RNA ile birlikte örneğin eklenmesinden önce lizis tamponuna eklenir. Eklenen IC miktarı örneğin başlangıç hacminden bağımsızdır. Eklenen IC miktarı elüsyon hacmine bağlıdır. QIAamp MinElute Virus Spin Kitini kullanıldığında ekstraksiyonu yapılmış RNA/DNA elüsyonu 60 µl içinde yapılacaktır. AL tamponuna eklenecek IC hacmi örnek başına 5,5 µl'dir (bakınız Tablo 4). Kuvvetli bir enfeksiyon ve/veya çoklu enfeksiyon durumunda IC erime tepesi son analizde görülmeyebilir. Bunun nedeni yüksek miktarda patojenik nükleik asidin testteki reaktiflerin çoğunu tüketmesidir. Bunun sonucunda IC sinyali bir enfeksiyon belirten bir veya daha fazla spesifik çözünme tepesi varlığında yoksa test halen geçerlidir. 14 RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/2013
15 Tablo 4. Gereken AL Tamponu, taşıyıcı RNA AVE Tamponu karışımı ve IC hacmi Örnek sayısı AL Tamponu Hacmi (ml) Taşıyıcı RNA AVE hacmi (µl) Dahili kontrol hacmi (µl) 1 0,22 6,2 5,5 2 0,44 12, ,66 18,5 16,5 4 0,88 24, ,1 30,8 27,5 6 1,32 36, ,54 43,1 38,5 8 1,76 49, ,98 55,4 49,5 10 2,2 61, ,42 67,7 60,5 12 2,64 73,8 66 RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/
16 Protokol: PCR amplifikasyonu ve erime analizi Başlamadan önce yapılacaklar Şablon RNA/DNA'yı (donmuşsa) ve tüm reaktifleri çözün ve tüpleri buz üstünde tutun. Pipetleme kayıplarını dengelemek üzere çeşitli karışımların gereken miktarlarından biraz daha fazlasını hazırlayın. İşlem Ön amplifikasyon 1. Ön amplifikasyon ana karışımını ana karışımın tam olarak çözünmesi ve homojenizasyonunu sağlamak üzere ters çevirin. Tüpü kısa süre santrifüje edin. Ön amplifikasyon reaksiyon karışımını Tablo 5 uyarınca hazırlayın ve buz üstünde tutun. Reaksiyon karışımı tipik olarak örnek dışında PCR için gerekli tüm bileşenleri içerir. Not: Hibridizasyon karışımları (adım 6) ve TwoStep karışımı (adım 12) ön amplifikasyon karışımıyla aynı anda hazırlanabilir ve kullanılıncaya kadar karanlıkta 4 C sıcaklıkta saklanmalıdır. Tüm 3 karışımın aynı anda hazırlanması ancak tüm protokol gecikme olmaksızın izlendiğinde yapılabilir; farklı adımlar arasında duraklamaya izin verilmez. Daha uzun süre saklama (gece boyunca gibi) sonrasında karışımların stabilitesi garanti edilmez. Tablo 5. Ön amplifikasyon reaksiyon karışımının hazırlanması Örnek sayısı (reaktif tüpünün kapak rengi) 1 12 Seyreltme tamponu (saydam) 6,25 µl 75 µl Ön amplifikasyon ana karışımı (mor) 6,25 µl 75 µl Ön amplifikasyon primer karışımı (beyaz) 2,5 µl 30 µl Toplam hacim 15 µl 180 µl 2. Ön amplifikasyon reaksiyon karışımını hafifçe ama iyice karıştırın ve karışımdan 15 µl miktarını her 0,2 ml PCR tüpüne pipetleyin. Sonra elüsyon yapılmış örnek DNA/RNA'sı veya negatif kontrolden 10 µl ekleyin (bakınız Tablo 6). 16 RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/2013
17 3. PCR tüplerini kapatın. İyice karıştırın. Tüpleri kısa süre santrifüjleyin ve tüp tipleri tekrar buza veya bir soğutma bloğuna koyun. Tablo 6. Ön amplifikasyon reaksiyonlarının hazırlanması Örnek sayısı 1 12 Ön amplifikasyon reaksiyon karışımı 15 µl her birinden 15 µl Örnek veya negatif kontrol 10 µl her birinden 10 µl Toplam hacim 25 µl her birinden 25 µl 4. Blok tabanlı termal döngüleyiciyi Tablo 7'ye göre programlayın. Tablo 7. Ön amplifikasyon için termal döngüleyici programı Ters transkripsiyon: 20 dakika 50 C Başlangıç aktivasyon adımı: 3 adımlı döngüleme: 2 dakika 95 C Denatürasyon 25 saniye 94 C Birleştirme 25 saniye 55 C Uzatma 40 saniye 72 C Döngü sayısı 40 Tut: 20 C 5. Ön amplifikasyon programını PCR tüpleri halen buzdayken başlatın. Termal döngüleyicinin 50 C'ye ulaşmasını bekleyin. Sonra tüpleri termal döngüleyici bloğuna koyun ve ısıtmalı kapağı kapatın. Hibridizasyon 6. Hibridizasyon karışımı 1'i Tablo 8'e ve hibridizasyon karışımı 2'yi Tablo 9'a göre hazırlayın ve yavaşça ama iyice karıştırın. RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/
18 Hibridizasyon karışımları adım 1 içinde zaten hazırlanmışsa ön amplifikasyon programının tamamlanmasını bekleyin ve sonra 7 ile devam edin. Tablo 8. Hibridizasyon karışımı 1 hazırlanması Örnek sayısı (reaktif tüpünün kapak rengi) 1 12 Hibridizasyon tamponu (sarı) 1,5 µl 18 µl Prob karışımı 1 (kırmızı) 1,5 µl 18 µl Seyreltme tamponu (saydam) 3,0 µl 36 µl Hibridizasyon karışımı 1 toplam hacmi 6,0 µl 72 µl Tablo 9. Hibridizasyon karışımı 2 hazırlanması Örnek sayısı (reaktif tüpünün kapak rengi) 1 12 Hibridizasyon tamponu (sarı) 1,5 µl 18 µl Prob karışımı 2 (mavi) 1,5 µl 18 µl Seyreltme tamponu (saydam) 3,0 µl 36 µl Hibridizasyon karışımı 2 toplam hacmi 6,0 µl 72 µl 7. Her örnek için hibridizasyon karışımı 1'den 6 µl miktarını yeni bir PCR tüpüne pipetleyin ve hibridizasyon karışımı 2'den 6 µl miktarını yeni bir PCR tüpüne pipetleyin. 8. Ön amplifikasyon programı bittikten sonra (adım 5), PCR tüplerini termal döngüleyiciden çıkarın ve kısa süre santrifüjleyin. 2 tüpten her birine her ön-amplifikasyon reaksiyonundan 2 µl pipetleyin birinde hibridizasyon karışımı 1 ve birinde hibridizasyon karışımı 2 vardır (bakınız Tablo 10). 18 RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/2013
19 Tablo 10. Hibridizasyon reaksiyonlarının hazırlanması Örnek sayısı 1 12 Hibridizasyon karışımı 1 (adım 7) 6,0 µl her birinden 6,0 µl Ön amplifikasyon reaksiyonu (adım 8) 2,0 µl her birinden 2,0 µl Toplam hacim 8,0 µl Hibridizasyon karışımı 2 (adım 7) 6,0 µl her birinden 8,0 µl her birinden 6,0 µl Ön amplifikasyon reaksiyonu (adım 8) 2,0 µl her birinden 2,0 µl Toplam hacim 8,0 µl her birinden 8,0 µl 9. PCR tüplerini kapatın ve kısa süre santrifüje edin. 10. Blok tabanlı termal döngüleyiciyi Tablo 11'ye göre programlayın. Tablo 11. Hibridizasyon için termal döngüleyici programı Denatürasyon: 10 dakika 98 C Probların hibridizasyonu: 30 dakika 60 C Tut: 60 C 11. Ön amplifikasyon reaksiyonunun karışımları ve hibridizasyon karışımlarını içeren tüpleri termal döngüleyici bloğuna yerleştirin ve ısıtmalı kapağı kapatın. Hibridizasyon programını başlatın. Ligasyon ve PCR 12. TwoStep karışımını Tablo 12 uyarınca hazırlayın. Yavaşça ama iyice karıştırın ve kullanıncaya kadar buzda tutun. Not: Örnekler 2 kısma bölündüğünden (hibridizasyon karışımı 1 ve hibridizasyon karışımı 2) TwoStep karışımı iki kat olarak hazırlanmalıdır. Her iki hibridizasyon karışımının her biri için 32,0 µl TwoStep gerekir. RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/
20 TwoStep karışımı adım 1 içinde zaten hazırlanmışsa adım 13 ile devam edin. Tablo 12. TwoStep karışımı hazırlama Örnek sayısı (reaktif tüpünün kapak rengi) 1* 2 x 1 2 x 12 TwoStep tamponu (yeşil) 30,6 µl 61,2 µl 734,4 µl Ligaz enzimi (kahverengi) 1,0 µl 2,0 µl 24,0 µl Taq polimeraz (turuncu) 0,4 µl 0,8 µl 9,6 µl Toplam hacim 32,0 µl 64,0 µl 768,0 µl * Not: 1x TwoStep karışımı hazırlamak asla gerekmez çünkü her örnek için TwoStep karışımından 2 x 1 hacim hazırlanmalıdır. 13. Rotor-Gene Q aleti için aşağıdaki adımlara göre bir sıcaklık profili oluşturun. Tablo 13, sayfa 21 içinde termal döngüleyici programına bir genel bakış sağlanmıştır. Genel test parametrelerini kurma Şekil 2, 3 Yeni kanallar oluşturma Şekil 4-7 Yükseltmeyi düzenleme Şekil 8, 9 Sıcaklık profilini programlama Şekil Erime programını programlama Şekil 17, 18 Özet ve şablonu kaydetme Şekil 19, 20 Çalışmayı başlatma Şekil 21 Tüm spesifikasyonlar Rotor-Gene Q yazılım versiyonu ile ilgilidir. Rotor-Gene aletlerini programlamak ile ilgili ek bilgiyi alet kullanıcı el kitabında bulabilirsiniz. Şekillerde bu ayarlar kalın siyah çerçeveyle gösterilmiştir. Rotor-Gene Q aletleri için şekiller dahil edilmiştir. 20 RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/2013
21 Tablo 13. TwoStep döngüleme için termal döngüleyici programına genel bakış Probların bağlanması: 15 dakika 54 C Notlar Başlangıç denatürasyon adımı: 2 dakika 95 C PCR 1: 3 adımlı döngüleme: Yüksek özgüllüklü PCR Denatürasyon 15 saniye 94 C Birleştirme 15 saniye 60 C Uzatma 15 saniye 72 C Döngü sayısı 10 PCR 2: 3 adımlı döngüleme: Denatürasyon 15 saniye 94 C Birleştirme 15 saniye 50 C Alma* Denatürasyon 15 saniye 72 C Döngü sayısı 23 Denatürasyon: 2 dakika 95 C Erime programı: C Alma * Alan kanallar: Yeşil, yükseltme 4; Kırmızı, yükseltme 1; FAM /ROX, yükseltme 8 ve FAM/Cy5, yükseltme 10. Alan kanallar: Yeşil, Kırmızı, FAM/ROX ve FAM/Cy5. Optimize gain before melt on all tubes (Tüm tüplerde erime öncesinde yükseltmeyi optimize et) kullanın. The gain giving the highest fluorescence less than 95 will be selected (95 altında en yüksek floresansı veren yükseltme seçilecektir). RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/
22 14. Önce New Run Wizard (Yeni Çalışma Sihirbazı) diyalog kutusunu açın (Şekil 2). Locking Ring Attached (Kilitleme Halkası Tutturulmuş) kutusunu seçin ve Next (Sonraki) kısmına tıklayın. 1 2 Şekil 2. New Run Wizard diyalog kutusu. 15. Reaksiyon hacmi için 40 seçin ve Next kısmına tıklayın (Şekil 3). 1 2 Şekil 3. Genel test parametrelerini kurma. 22 RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/2013
23 16. Sonraki New Run Wizard diyalog kutusunda Create New (Yeni Oluştur) düğmesine tıklayın (Şekil 4) ve Şekil 5 7'de gösterildiği gibi 2 ek kanal programlayın. 1 Şekil 4. Yeni kanallar oluşturun. 1 2 Şekil 5. Yeni kanal FAM/ROX oluşturun. RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/
24 1 2 Şekil 6. Yeni kanal FAM/Cy5 oluşturun. 1 2 Şekil 7. Yeni kanallar dahil edilmiştir. 17. Her kanal için yükseltmeyi Şekil 8'de belirtildiği şekilde düzenleyin. Her kanal için son yükseltme ayarları Şekil 9'da belirtilmiştir. Rotor-Gene Q aleti için yükseltme ayarları saptama kanallarında satürasyonu önleyecek şekilde seçilir. Ancak saptama kanallarından herhangi birinde satürasyon gözlenirse bu satüre olmuş kanal için yükseltme ayarları uyarlanmalı ve yeni bir erime eğrisi analizi yapılmalıdır. 24 RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/2013
25 1 2 Şekil 8. Yükseltmeyi düzenleme. Örnek olarak şekil Cycling Green kanalı için yükseltmeyi 4'e ayarlamayı göstermektedir. 1 Şekil 9. Tüm kanallar için son yükseltme ayarları. Gerekli kanallar şunlardır: Yeşil, yükseltme 4; Kırmızı, yükseltme 1; FAM/ROX, yükseltme 8 ve FAM/Cy5, yükseltme 10. RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/
26 18. Sonraki New Run Wizard diyalog kutusunda Edit Profil (Profil Düzenle) düğmesine tıklayın (Şekil 10) ve sıcaklık profilini Şekil 11-13'de gösterildiği gibi programlayın. 1 Şekil 10. Profili düzenleme. 1 2 Şekil 11. Probların bağlanması RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/2013
27 1 2 Şekil 12. Başlangıç denatürasyon adımı a Şekil 13. Bağlanmış probların amplifikasyonu. 6 RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/
28 1 2 4a Şekil C'de sinyal alma dahil bağlanmış probların amplifikasyonu. Alma için gerekli kanallar Şekil 15'te gösterilmiştir Şekil 15. Alma için gerekli tüm kanalların seçilmesi. 28 RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/2013
29 1 2 Şekil 16. PCR ürünleri ve problarının denatürasyonu Şekil 17. Erime programı. 3 RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/
30 1 2 Şekil 18. Erime programı sırasında alma. 1 Şekil 19. Sıcaklık profilinin özeti. 30 RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/2013
31 19. Şablonu daha sonra kullanma için kaydedin (Şekil 20). 1 Şekil 20. Şablonu daha sonra kullanma için kaydedin 20. TwoStep karışımının (adım 12 kısmından) oda sıcaklığına (15 25 C) dengelenmesini bekleyin ve Rotor-Gene Q aletinin her Strip Tüpü içine TwoStep karışımından 32,0 µl pipetleyin. Not: Her örnek için 2 yeni tüpün her birine 32,0 µl TwoStep karışımı pipetleyin. 21. Her hibridizasyon reaksiyonunu (8 µl) TwoStep karışımı içeren Strip Tüplerine pipetleyin. Son hacim örnek başına 40 µl verir. Not: Hibridizasyon reaksiyonlarını TwoStep karışımına ekleninceye kadar 60 C'de tutun. 22. Strip Tüplerini uygun kapaklarla kapatın ve hemen Rotor-Gene Q aleti rotoruna yerleştirin. 23. Rotoru Rotor-Gene Q aletine yerleştirin. Kilitleme halkasını (Rotor-Gene Q aleti aksesuarı) tüplerin çalışma sırasında yanlışlıkla aşınmasını önlemek üzere en üste yerleştirildiğinden emin olun. RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/
32 24. Çalışmayı (Şekil 21) kaydedilen şablonu kullanarak (adım 19) başlatın. 1 Şekil 21. Çalışmayı başlatma. 32 RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/2013
33 Sonuçların Yorumlanması Normalizasyon Rotor-Gene Q aletlerinde FAM/Cy5 kanalı için ham veriler farklı kanallar arasında çapraz geçişi dengelemek üzere önce normalize edilmelidir. Cy5 sinyallerinin normalizasyonu için ham kanal Erime FAM/Cy5 (filtre ayarları nm) açın. Option (Seçenek) düğmesine basın ve Normalise to Melt FAM/ROX (FAM/ROX Erime için normalize et) seçin. Yeni oluşturulmuş Melt FAM/Cy5/Melt FAM/ROX ham veri dosyasının kırmızı kanal için ek olarak normalize edilmesi gerekir (filtre ayarları 625/660 nm). Bu yeni Melt FAM/Cy5/Melt FAM/ROX, ham veri dosyası açılıp Option düğmesine tıklanması ve Normalise to Melt Red (Kırmızı Erime için Normalize Et) seçilerek yapılır. Bu normalizasyonla Cy5 sıcaklık bağımlı floresansı düzeltilir ve daha simetrik bir erime tepesiyle sonuçlanır. Analiz Ham veri dosyasını analiz etmek için Analysis (Analiz) penceresini açın ve FAM/Cy5 için uygun normalize ham veri dosyasını Melt (Erime) sekmesi altında seçin. Green (Yeşil) kanaldaki sinyaller (IC) (filtre ayarları nm) ve FAM/ROX kanalındaki sinyallerin (filtre ayarları nm) normalize edilmesi gerekmez FAM/ROX ve Green kanalları içinde karşılık gelen ham veri dosyaları seçilir. SMART problarının farklı erime sıcaklıkları Tablo 14 sayfa 34 içinde gösterilmiştir. Eşik Tablo 13 (sayfa 21) ve Şekil 17 (sayfa 29) içinde tanımlandığı şekilde TwoStep reaksiyonunun erime programında Rotor-Gene Q yazılımı yükseltme optimizasyonu kullanılarak örnek sonuçlarını analiz etmek için erime eğrisi analiz plotlarında şu eşik değerleri ayarlanmalıdır. FAM/ROX kanalı: Eşik = 1 FAM/Cy5 kanalı (normalize): Eşik = 0 Green kanal (IC): df/dt işaretini çevirin ve her iki karışımla FAM/ROX ve FAM/Cy5 kanallarında pozitif erime tepesi göstermeyen tüm örnekleri seçin. Eşiği bu negatif örneklerle elde edilen 50 C'de en yüksek floresans seviyesine manuel olarak ayarlayın. Dahili kontrolün (70,5 73,5 C) kabul edilebilir T m aralığı dahilinde her iki karışımla erime tepeleri gösteren örneklere artık gerçek negatif örnekler denebilir. Tek pozitif dahili kontrol sonucu gösteren veya hiç göstermeyen örnekler geçersiz kabul edilmelidir. Geçersiz örnekler tekrarlanmalıdır. RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/
34 Tablo 14. SMART problarının hedefleri ve karşılık gelen T m değerleri Etiket SMART probu T m ( C) kabul edilebilir aralık Patojen kodu (karışım 1) Patojen kodu (karışım 2) Cy5 probu 1 50,5-53,5 L. pneu OC43 Cy5 probu 2 54,5-57,5 B. pert NL63 Cy5 Cy5 probu 3 60,0-63,0 Rino/Entero 229E Cy5 probu 4 66,0-69,0 C. pneu* HKU1 Cy5 probu 5 70,5-73,5 M. pneu Cy5 probu 6 76,5-79,5 H1N1 ROX probu 1 52,5-55,5 RSVA PIV1 ROX probu 2 57,5-60,5 Adeno PIV2 ROX ROX probu 3 62,5-65,5 hmpv PIV3 ROX probu 4 66,5-69,5 RSVB PIV4 ROX probu 5 72,5-75,5 InfA Boca ROX probu 6 76,5-79,5 InfB BHQ1 BHQ1 probu 1 70,5-73,5 IC IC * Not: RespiFinder RG Panel Chlamydophila pneumoniae saptanması Sadece Araştırma Kullanımı içindir. Diagnostik işlemlerde kullanım için değildir. Bir hastalığın tanısı, önlenmesi veya tedavisi hakkında bilgi sağlamak açısından kullanılması için herhangi bir iddiada veya temsilde bulunulmaz. Sorun Giderme kılavuzu Bu sorun giderme kılavuzu çıkabilecek herhangi bir problemi çözmekte faydalı olabilir. Daha fazla bilgi için Teknik Destek Merkezimizde Sık Sorulan Sorular sayfasına da bakınız: QIAGEN Teknik Servisindeki bilim insanları bu el kitabındaki bilgi ve protokollerle ya da örnek ve test teknolojileriyle ilgili herhangi bir sorunuzu cevaplandırmaktan daima mutlu olacaktır (irtibat bilgileri için arka kapağa bakınız veya adresini ziyaret ediniz). 34 RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/2013
35 Açıklama ve öneriler Görünür spesifik erime tepesi yok ve IC erime tepesi yok a) Termal döngüleme programında programlama hatası/hataları Termal döngüleyiciyi Protokol: PCR amplifikasyonu ve erime analizi, sayfa 16 uyarınca programlayın ve testi tekrarlayın. b) Pipetleme hatası veya eksik reaktif. c) IC eklenmemiş veya IC örneğe lizis tamponu eklenmesinden önce eklenmiş d) Örnekte PCR inhibitörleri var RespiFinder testini Protokol: PCR amplifikasyonu ve erime analizi, sayfa 16 izleyerek tekrarlayın. IC ve taşıyıcı RNA'yı lizis tamponuna kullanılan ekstraksiyon protokolüne bakılmaksızın tercihen örneğe eklendikten sonra eklemek önemlidir (bakınız Bir dahili kontrol ve taşıyıcı RNA kullanma, sayfa 14). Aksi halde IC, örnekteki nükleazlar nedeniyle bozulabilir. Nükleik asit ekstraksiyonu ve RespiFinder testini tekrarlayın. Testi izole RNA/DNA'nın beş kat dilüsyonunu kullanarak tekrarlayın. Patojene spesifik erime tepeleri varlığında IC erime tepesi yok Kuvvetli enfeksiyon ve/veya çoklu enfeksiyon Yanlış erime tepeleri görünüyor Çapraz kontaminasyon IC test içinde rekabet nedeniyle elenmiş. Sonuç halen geçerli. Çapraz kontaminasyonu önlemek için reaksiyon adımlarının ayrı odalarda yapıldığından emin olun. RespiFinder testini tekrarlayın. Döngüleme programını kontrol edin ve tüm muamele adımlarının Protokol: PCR amplifikasyonu ve erime analizi, sayfa 16 içinde tanımlandığı şekilde yapıldığından emin olun. Protokolde belirtilen yerlerde buz üzerinde çalıştığınızdan emin olun. RespiFinder testini tekrarlayın. RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/
36 Açıklama ve öneriler Örnek reaksiyonunda spesifik bir amplifikasyon olmadığında artmış arka alan floresans sinyalleri görülebilir. a) Örnek nükleik asit ekstresinde bulunan inhibe edici faktörler etkin ve spesifik amplifikasyonu önlüyor. Artmış arka alan sinyalleri RespiFinder RG Panel eşik değerleri üzerinde olabilir ama nonspesifik erime tepeleri olarak kolayca tanınır. Artmış arka alana bir örnek Şekil 22 sayfa 37 içinde verilmiştir. b) Negatif örneklerde dahili kontrol olmaması Artmış arka alan sinyalleri RespiFinder RG Panel eşik değerleri üzerinde olabilir ama nonspesifik erime tepeleri olarak kolayca tanınır. RespiFinder testini tekrarlayın. Artmış arka alana bir örnek Şekil 22 sayfa 37 içinde verilmiştir. 36 RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/2013
37 FAM/ROX kanalı Karışım 1 Karışım 2 Gerçek pozitif Negatif kontrol IC yok IC yok Negatif kontrol FAM/Cy5 kanalı Karışım 1 Karışım 2 IC yok Negatif kontrol Gerçek f Negatif kontrol IC yok Green kanal (IC) Karışım 1 Karışım 2 Negatif kontrol IC yok IC yok Negatif kontrol Şekil 22. Artmış arka alan örneği. Negative control (Negatif kontrol): Çizgiler negatif kontrolle uyumludur ve FAM/ROX ve FAM/Cy5 kanallarında sinyal göstermez ama Green kanalda (IC) spesifik bir dahili kontrol tepesi gösterir. True positive (Gerçek pozitif): FAM/ROX karışım 1 ve FAM/Cy5 karışım 2 için belirtilen çizgiler gerçek pozitif erime tepeleri gösteren örneklere karşılık gelir. No IC (IC yok): Çizgiler dahili kontrolün eklenmemiş olduğu bir örneğe karşılık gelir. Bu örnekte spesifik bir amplifikasyon olmamış ve sonuçta FAM/ROX kanalı için artmış arka alan floresansı olmuştur ve açık erime tepeleri göstermez ama eşik değerinin üzerinde floresans seviyeleri gösterir. Kalite Kontrol RespiFinder RG Panel Hollanda'da Maastricht'de PathoFinder BV tarafından ISO13485:2003 ve EN ISO 13485:2012 akreditasyonunu kalite sistemlerine göre üretilmiştir. RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/
38 Sınırlamalar RespiFinder RG Panel diğer klinik ve laboratuvar bulgularıyla birlikte kullanıldığında solunum yolu enfeksiyonunun tanısına yardımcı olur. Negatif sonuçlar viral veya bakteriyel solunum yolu enfeksiyonunun bulunmadığına işaret etmez. Negatif sonuçlar tanı, terapi veya diğer tedavi kararları için tek temel olarak kullanılmamalıdır. Pozitif sonuçlar diğer patojenlerle ortak enfeksiyon olasılığını ortadan kaldırmaz. Saptanan patojen(ler) hastalığın kesin nedeni olmayabilir. Son tanı için diğer laboratuvar testleri ve klinik durumun değerlendirilmesi de kullanılmalıdır. Performans özellikleri QCMD'den doğrulanmış EQA panelleriyle belirlenmiştir. Ürün sadece laboratuvar uzmanları tarafından kullanım içindir. RespiFinder RG Panel Chlamydophila pneumoniae saptanması Sadece Araştırma Kullanımı içindir. Diagnostik işlemlerde kullanım için değildir. Bir hastalığın tanısı, önlenmesi veya tedavisi hakkında bilgi sağlamak açısından kullanılması için herhangi bir iddiada veya temsilde bulunulmaz. Performans Özellikleri RepliFinder RG Panel performans özellikleri için bakınızwww.qiagen.com/p/replifinder-rg-panel-ce. Referanslar QIAGEN, QIAGEN ürünlerini kullanan bilimsel yayınların büyük ve güncel bir çevrimiçi veri tabanını tutmaktadır. Kapsamlı araştırma seçenekleri gereksinim duyduğunuz makaleleri basit bir anahtar kelime arama veya uygulama, araştırma alanı, başlık, vs. belirterek bulmanızı mümkün kılar. Referans listesi için adresindeki çevrim içi QIAGEN Referans Veri Tabanını ziyaret edin veya QIAGEN Teknik Servis ya da yerel distribütörünüzle irtibat kurun. Semboller Ambalaj veya etikette şu semboller belirebilir: <N> <N> reaksiyon için yeterli reaktif içermektedir Son kullanma tarihi 38 RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/2013
39 İn vitro diagnostik tıbbi cihaz Katalog numarası Lot numarası Materyal sayısı Sıcaklık sınırlaması Üretici Kullanma talimatına başvurun Dikkat İrtibat Bilgisi Teknik yardım ve daha fazla bilgi için lütfen adresindeki Teknik Destek Merkezimize gidin veya numarasını arayın veya QIAGEN Teknik Servis Bölümlerinden ya da yerel distribütörlerden birini arayın (arka kapağa bakın veya adresini ziyaret edin). RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/
40 Sipariş Bilgisi Ürün İçindekiler Kat. no. RespiFinder RG Panel (25) CE 25 reaksiyon için: Ön amplifikasyon Ana Karışımı, Dahili Kontrol, Ön amplifikasyon Primermix, Probemixes, Ligase Enzyme, Taq Polymerase ve Tamponlar QIAamp MinElute Virus Spin Kit RespiFinder RG Panel kullanılmak üzere nazofaringeal sürüntülerden viral DNA ve RNA'nın eş zamanlı saflaştırılması için QIAamp MinElute Virus Spin Kit (50) 50 miniprep için: 50 QIAamp MinElute Sütunu, QIAGEN Proteaz, taşıyıcı RNA, tamponlar, Toplama Tüpleri (2 ml) Rotor-Gene Q MDx klinik uygulamalarda in vitro diagnostik olarak doğrulanmış gerçek zamanlı PCR analizi için Rotor-Gene Q MDx 5plex HRM Platform 5 kanal artı HRM kanallı (yeşil, sarı, turuncu, kırmızı, kızıl) gerçek zamanlı PCR döngüleyici ve yüksek çözünürlüklü eritme analizörü dizüstü bilgisayar, yazılım, aksesuarlar parçalar ve işçilik için 1 yıllık garanti dahildir kurulum ve eğitim dahil değildir Rotor-Gene Q MDx 5plex HRM System 5 kanal artı HRM kanallı (yeşil, sarı, turuncu, kırmızı, kızıl) gerçek zamanlı PCR döngüleyici ve yüksek çözünürlüklü eritme analizörü dizüstü bilgisayar, yazılım, aksesuarlar parçalar ve işçilik için 1 yıllık garanti dahildir kurulum ve eğitim dahil değildir RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/2013
41 Ürün İçindekiler Kat. no. Rotor-Gene Q gerçek zamanlı PCR'de olağanüstü performans için Rotor-Gene Q 5plex HRM Platform 5 kanal artı HRM kanallı (yeşil, sarı, turuncu, kırmızı, kızıl) gerçek zamanlı PCR döngüleyici ve yüksek çözünürlüklü eritme analizörü dizüstü bilgisayar, yazılım, aksesuarlar parçalar ve işçilik için 1 yıllık garanti dahildir kurulum ve eğitim dahil değildir Rotor-Gene Q 5plex HRM System 5 kanal artı HRM kanallı (yeşil, sarı, turuncu, kırmızı, kızıl) gerçek zamanlı PCR döngüleyici ve yüksek çözünürlüklü eritme analizörü dizüstü bilgisayar, yazılım, aksesuarlar parçalar ve işçilik için 1 yıllık garanti dahildir kurulum ve eğitim dahil değildir Rotor-Gene Q aksesuarları Strip Tubes and Caps, 0.1 ml (250) Strip Tubes and Caps, 0.1 ml (2500) µl 1000 reaksiyon için 4 tüp ve kapaklı 250 strip µl'lik reaksiyon için 4 tüp ve kapaklı 10 x 250 strip Güncel lisanslama bilgisi ve ürüne spesifik red beyanları için ilgili QIAGEN kiti el kitabı veya kullanıcı el kitabına bakınız. QIAGEN kit el kitapları ve kullanıcı el kitapları adresinde bulunabilir veya QIAGEN Teknik Servis veya yerel distribütörünüzden istenebilir. RespiFinder RG Panel El Kitabı 11/
42
43 Ticari markalar: QIAGEN, QIAamp, MinElute, Rotor-Gene (QIAGEN Group); BHQ (Biosearch Technologies, Inc.); Cy (GE Healthcare); FAM, GeneAmp, ROX (Life Technologies Corporation); RespiFinder (PathoFinder BV). RespiFinder RG Panel için Sınırlı Lisans Sözleşmesi Bu ürünün kullanılması ürünün herhangi bir satın alanı veya kullanıcısının şu şartları kabul ettiğini belirtir: 1. Ürün sadece ürünle birlikte ve bu el kitabında sağlanan protokollerle uyumlu olarak ve panel içindeki bileşenlerle kullanım için kullanılabilir. QIAGEN ürünle sağlanan protokoller, bu el kitabı ve adresinde bulunan ek protokollerde tanımlananlar dışında bu kite dahil edilmemiş herhangi bir bileşen ile kitin içindeki bileşenleri kullanma veya birleştirme açısından herhangi bir fikri mülkiyet altında bir lisans vermez. Bu ek protokollerden bazıları QIAGEN kullanıcıları tarafından QIAGEN kullanıcıları için sağlanmıştır. Bu protokoller QIAGEN tarafından iyice test edilmiş veya optimize edilmiş olmayabilir. QIAGEN üçüncü tarafların haklarını ihlal etmediklerini garanti etmez ve beyan etmez. 2. Açık olarak belirtilen lisanslar dışında QIAGEN bu kitin ve/veya kullanımının/kullanımlarının üçüncü tarafların haklarını ihlal etmediği konusunda garanti vermez. 3. Bu panel ve bileşenleri tek kullanım için lisanslanmıştır ve tekrar kullanılamaz, yenilenemez veya tekrar satılamaz. 4. QIAGEN açık olarak belirtilenler dışında açık veya zımni herhangi bir başka lisansı özellikle reddeder. 5. Panelin satın alıcısı ve kullanıcısı yukarıda yasaklanan herhangi bir eyleme neden olabilecek veya bunları kolaylaştırabilecek herhangi bir adım atmamayı veya başkasının atmasına izin vermemeyi kabul eder. QIAGEN bu Sınırlı Lisans Sözleşmesinin yasaklarını herhangi bir mahkemede yürürlüğe koyabilir ve kit ve/veya bileşenleriyle ilişkili herhangi bir fikri mülkiyet hakkı veya bu Sınırlı Lisans Sözleşmesini yürürlüğe koymak için tüm araştırma ve mahkeme masraflarını avukat masrafları dahil olmak üzere geri alacaktır. Güncellenmiş lisans şartları için bakınız Satın alana not Bu ürün Hollanda'da Maastricht'de PathoFinder BV tarafından ISO13485:2003 akreditasyonlu kalite sistemlerine göre üretilmiş bir RespiFinder ürünüdür. Bu ürünler sadece son kullanıcı tarafından kullanım için satılır ve tekrar satılamaz, dağıtılamaz veya tekrar paketlenemez QIAGEN, tüm hakları saklıdır.
44 Australia Austria Belgium Brazil Canada China Denmark Finland France Germany Hong Kong India Ireland Italy Japan Korea (South) Luxembourg Mexico The Netherlands Norway Singapore Sweden Switzerland UK TR Sample & Assay Technologies
RTA DNA qpcr Probe Master Mix
RTA DNA qpcr Probe Master Mix Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi -- 2012-01 DNA'nın gerçek zamanlı tayini ve miktar ölçümü için Yalnızca profesyonel kullanım için REF 09030025 25 test 09030100 100 test 09030500
Detaylıartus HCV QS-RGQ Kit Performans Özellikleri Ocak 2014 Sample & Assay Technologies Saptama limiti (LOD) Versiyon yönetimi
artus HCV QS-RGQ Kit Performans Özellikleri artus HCV QS-RGQ Kit, Versiyon 1, 4518363, 4518366 Versiyon yönetimi Bu belge artus HCV QS-RGQ Kit Performans Özellikleri, Versiyon 1, R1 belgesidir. Testi gerçekleştirmeden
Detaylıartus BK Virus QS-RGQ Kit
artus BK Virus QS-RGQ Kit Performans Özellikleri artus BK Virus QS-RGQ Kit, Versiyon 1, 4514363 Testi gerçekleştirmeden önce www.qiagen.com/products/artusbkvirusrgpcrkit.aspx adresinde yeni elektronik
Detaylıartus BK Virüsü RG PCR Kiti El Kitabı
Aralık 2014 artus BK Virüsü RG PCR Kiti El Kitabı 24 (katalog no. 4514263) Sürüm 1 96 (katalog no. 4514265) Kantitatif in vitro diagnostik Rotor-Gene Q Aletleriyle kullanılmak üzere 4514263, 4514265 1056823TR
Detaylıartus EBV RG PCR Kiti El Kitabı
Aralık 2014 artus EBV RG PCR Kiti El Kitabı 24 (katalog no. 4501263) Versiyon 1 96 (katalog no. 4501265) Kantitasyon in vitro diagnostik Rotor-Gene Q Aletleriyle kullanılmak üzere 4501263, 4501265 1046897TR
DetaylıMitokondrial DNA Analiz Paneli
FAST-mtDNA Sequencing Kit Mitokondrial DNA Analiz Paneli Dizi Analizi Amaçlı Kullanım İçin KULLANIM KILAVUZU İÇİNDEKİLER 1 GİRİŞ... 3 2 KİT İÇERİĞİ... 3 3 SAKLAMA... 3 4 GEREKLİ MATERYAL VE CİHAZLAR...
DetaylıRTA JEL / PZR Saflaştırma Kiti
RTA JEL / PZR Saflaştırma Kiti Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi - 2011-12 DNA parçalarının agaroz jelden geri kazanımı ve PZR ürünlerinin saflaştırılması için Yalnızca profesyonel kullanım için REF 09009050
DetaylıBRCA 1/2 DNA Analiz Paneli
FAST-BRCA Sequencing Kit BRCA 1/2 DNA Analiz Paneli Dizi Analizi Amaçlı Kullanım İçin KULLANIM KILAVUZU İÇİNDEKİLER 1 GİRİŞ... 3 2 KİT İÇERİĞİ... 3 3 SAKLAMA... 3 4 GEREKLİ MATERYAL VE CİHAZLAR... 3 5
DetaylıKistik Fibrozis DNA Analiz Paneli
FAST-CFTR Sequencing Kit Kistik Fibrozis DNA Analiz Paneli Dizi Analizi Amaçlı Kullanım İçin KULLANIM KILAVUZU İÇİNDEKİLER 1 GİRİŞ... 3 2 KİT İÇERİĞİ... 3 3 SAKLAMA... 3 4 GEREKLİ MATERYAL VE CİHAZLAR...
DetaylıQIAsymphony DSP Dolaşan DNA Kiti
QIAsymphony DSP Dolaşan DNA Kiti Şubat 2017 Performans Özellikleri 937556 Sample to Insight İçindekiler Performans Özellikleri... 4 Temel performans... 4 Çalışma kesinliği... 5 2 ml ve 4 ml protokollerinin
Detaylıartus CMV RG PCR Kiti El Kitabı
Aralık 2014 artus CMV RG PCR Kiti El Kitabı 24 (katalog no. 4503263) Sürüm 1 96 (katalog no. 4503265) Kantitatif in vitro diagnostik Rotor-Gene Q Aletleriyle kullanılmak üzere 4503263, 4503265 1046908TR
DetaylıTissue_LC_200_V7_DSP ve Tissue_HC_200_V7_DSP (QIAsymphony DSP DNA Mini Kiti için kullanıcı açısından doğrulanmıştır)
Ağustos 2015 QIAsymphony SP Protokol Sayfası Tissue_LC_200_V7_DSP ve Tissue_HC_200_V7_DSP (QIAsymphony DSP DNA Mini Kiti için kullanıcı açısından doğrulanmıştır) Bu belge Kit Versiyonu 1 için Tissue_LC_200_V7_DSP
DetaylıQIAsymphony SP Protokol Sayfası
Şubat 2017 QIAsymphony SP Protokol Sayfası circdna_2000_dsp_v1 ve circdna_4000_dsp_v1 Bu belge QIAsymphony circdna_2000_dsp_v1 ve circdna_4000_dsp_v1 Protokol Sayfası, Versiyon 1, R1 belgesidir. Sample
Detaylıartus JCV RG PCR Kit El Kitabı
artus JCV RG PCR Kit El Kitabı Ekim 2015 Versiyon 1 Rotor-Gene Q aletleriyle kullanılmak üzere 96 R1 4532265 altona Diagnostics GmbH, Mörkenstraße 12, 22767 Hamburg, ALMANYA 1096240-TR Distribütör: QIAGEN
Detaylıartus HBV RG PCR Kiti El Kitabı
Aralık 2014 artus HBV RG PCR Kiti El Kitabı Versiyon 1 24 (katalog no. 4506263) 96 (katalog no. 4506265) Kantitatif in vitro diagnostik Rotor-Gene Q Aletleriyle kullanılmak üzere 4506263, 4506265 1046920EN
DetaylıVersiyon 1 Rotor-Gene Q aletleriyle kullanılmak üzere
Ekim 2015 artus HHV-6 RG PCR Kit El Kitabı Versiyon 1 Rotor-Gene Q aletleriyle kullanılmak üzere 96 R3 4521265 altona Diagnostics GmbH, Mörkenstraße 12, 22767 Hamburg, ALMANYA 1096238-TR Distribütör: QIAGEN
DetaylıVersiyon 1 Rotor-Gene Q aletleriyle kullanılmak üzere
Ekim 2015 artus HSV-1/2 Quant RG PCR Kit El Kitabı Versiyon 1 Rotor-Gene Q aletleriyle kullanılmak üzere 96 R1 4515265 altona Diagnostics GmbH, Mörkenstraße 12, 22767 Hamburg, ALMANYA 1096239-TR Distribütör:
Detaylıartus HCV RG RT-PCR Kit El Kitabı
Mart 2015 artus HCV RG RT-PCR Kit El Kitabı Versiyon 1 24 (katalog no. 4518263) 96 (katalog no. 4518265) Kantitasyon in vitro diagnostik Rotor-Gene Q Aletleriyle kullanılmak üzere 4518263, 4518265 1049309TR
Detaylıartus HI Virus-1 RG RT-PCR Kit El Kitabı
Mart 2015 artus HI Virus-1 RG RT-PCR Kit El Kitabı 24 (katalog no. 4513263) 96 (katalog no. 4513265) Versiyon 1 Kantitasyon in vitro diagnostik Rotor-Gene Q Aletleriyle kullanılmak üzere 4513263, 4513265
Detaylıartus HSV-1/2 RG PCR Kiti El Kitabı
Aralık 2014 artus HSV-1/2 RG PCR Kiti El Kitabı 24 (katalog no. 4500263) 96 (katalog no. 4500265) Sürüm 1 Kalitatif in vitro diagnostik Rotor-Gene Q aletleriyle kullanılmak üzere 4500263, 4500265 1060171TR
DetaylıRTA Kandan Genomik DNA İzolasyon Kiti
RTA Kandan Genomik DNA İzolasyon Kiti Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi - 2011-05 IVD İnsan kan örneklerinden in vitro tanı amaçlı genomik nükleik asit izolasyon ve saflaştırması için In vitro tanı amaçlı
Detaylıartus Parvo B19 RG PCR Kiti El Kitabı
artus Parvo B19 RG PCR Kiti El Kitabı 24 (katalog no. 4504263) 96 (katalog no. 4504265) Kantitatif in vitro diagnostik Rotor-Gene 3000 ile kullanılmak üzere Aralık 2014 Versiyon 1 4504263, 4504265 1046914EN
DetaylıListeria Monocytogenes Real time PCR Tespit Kiti
Listeria Monocytogenes Real time PCR Tespit Kiti Protokol PD LM00 0 50 Reaksiyon REŞİT GALİP CADDESİ 74-7 06700 ÇANKAYA, ANKARA, TÜRKİYE T +90 32 447 22 79 / 80 F +90 32 447 22 07 W www.bmlabosis.com İnternal
DetaylıQIAsymphony SP Protokol Sayfası
QIAsymphony SP Protokol Sayfası PC_AXpH_HC2_V1_DSP protokolü Kullanım Amacı İn vitro diagnostik kullanım içindir. Bu protokol QIAsymphony SP ve QIAsymphony DSP AXpH DNA Kiti kullanılarak PreservCyt Solüsyonunda
DetaylıVersiyon 1 Rotor-Gene Q aletleriyle kullanılmak üzere
Ekim 2015 artus HAdV RG PCR Kit El Kitabı Versiyon 1 Rotor-Gene Q aletleriyle kullanılmak üzere 96 R1 4530265 altona Diagnostics GmbH, Mörkenstraße 12, 22767 Hamburg, ALMANYA 1096380-TR Distribütör: QIAGEN
DetaylıPerformans Özellikleri
Performans Özellikleri QIAamp DSP DNA FFPE Tissue Kiti, Sürüm 1 60404 Sürüm yönetimi Bu belge, QIAamp DSP DNA FFPE Tissue Kiti Performans Özellikleri, Sürüm 1, R3 belgesidir. Testi gerçekleştirmeden önce
DetaylıProtokolü PD S Reaksiyon
Salmonella sp. Real time PCR Tespit Kiti Protokolü PD S00 0 50 Reaksiyon REŞİT GALİP CADDESİ 74-7 06700 ÇANKAYA, ANKARA, TÜRKİYE T +90 32 447 22 79 / 80 F +90 32 447 22 07 www.bmlabosis.com İnternal Pozitif
Detaylıartus BK Virus RG PCR Kit El Kitabı
Eylül 2009 artus BK Virus RG PCR Kit El Kitabı 24 (katalog no. 4514263) 96 (katalog no. 4514265) Sürüm 1 Miktarsal in vitro tanılama Rotor-Gene Q Cihazları ile kullanım içindir 4514263, 4514265 1056823TR
DetaylıAvian Flu Screening&Typing H5, H7
REF V-34-50R VER 04.03.08 Avian Flu Screening&Typing H5, H7 Kullanılan Semboller REF Liste Numarası 2-8 C/ -20 C de saklayın RUO Sadece Araştırma Kullanımı için Dikkat! LOT Lot Numarası VER Versiyon Son
DetaylıLaboratuvar Gereçleri Listesi QIAsymphony SP
Şubat 2017 Laboratuvar Gereçleri Listesi QIAsymphony SP QIAsymphony DSP Dolaşan DNA Kiti ve QIAsymphony SP (yazılım versiyonu 4.0 ve yazılım versiyonu 4.1; laboratuvar gereçleri paketi SOW-516-6) ile kullanılabilecek
Detaylıartus HBV QS-RGQ Kiti El Kitabı
Mayıs 2012 artus HBV QS-RGQ Kiti El Kitabı 24 (katalog no. 4506363) Versiyon 1 72 (katalog no. 4506366) Kantitatif in vitro diagnostik QIAsymphony SP/AS ve Rotor-Gene Q Aletleriyle kullanılmak üzere 4506363,
DetaylıRTA Viral DNA İzolasyon Kiti Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi - 2010-05
RTA Viral DNA İzolasyon Kiti Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi - 2010-05 IVD In vitro tanı amaçlı insan plazma ve serum örneklerinden viral nükleik asit izolasyon ve saflaştırılması için In vitro tanı amaçlı
Detaylıattomol apo B-100 quicktype
attomol apo B-100 quicktype İnsan apolipoprotein B-100 (apo B-3500 mutasyonu) gen inde 10708G>A geçiş tespitine yönelik kit Sadece in vitro diagnostik kullanım içindir! 20 tespit sipariş numarası: 1015
DetaylıQIAsymphony RGQ Uygulama Sayfası
QIAsymphony RGQ Uygulama Sayfası QIAsymphony RGQ uygulaması artus BK Virus QS-RGQ Kit (örnek tipi: idrar, 400 µl) Testi gerçekleştirmeden önce www.qiagen.com/products/artusbkvirusrgpcrkit.aspx adresinde
Detaylıattomol HLA-B*27 Sadece in vitro diagnostik kullanım içindir! 1.Giriş 2. Genel Açıklamalar
attomol HLA-B*27 HLA-B*27 in tespitine yönelik kit (Doku tiplemesi için kullanmayın!) Sadece in vitro diagnostik kullanım içindir! 40 tespit sipariş numarası: 1030 1.Giriş İnsan lökosit antijenleri(hla)
Detaylıartus HCV QS-RGQ Kiti El Kitabı
Ocak 2016 artus HCV QS-RGQ Kiti El Kitabı Versiyon 1 24 (katalog no. 4518363) 72 (katalog no. 4518366) Kantitatif in vitro diagnostik QIAsymphony SP/AS ve Rotor-Gene Q Aletleriyle kullanılmak üzere 4518363,
DetaylıBIONEER MARKA ACCUPOWER EBV QUANTATIVE PCR KİTİ PROTOKOLÜ
BIONEER MARKA ACCUPOWER EBV QUANTATIVE PCR KİTİ PROTOKOLÜ Kullanılan Ekipmanlar : - Bioneer Marka ExiPrep16 Plus Model Tam Otomatik Nükleik Asit Ekstraksiyon Sistemi - Bioneer Marka ExiPrep Viral DNA/RNA
DetaylıProtokolü PD S001 01. 50 Reaksiyon
Salmonella sp. Real time PCR Tespit Kiti Protokolü PD S001 01 50 Reaksiyon REAKSİYON PRENSİPLERİ Reaksiyon Bileşenleri: qpcr Master Mix (PMM) Hedef probe Mix (HPM) Zenginleştirilmiş gıda ürünleri kültüründen
DetaylıRTA Plazmid DNA İzolasyon Kiti
RTA Plazmid DNA İzolasyon Kiti Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi - 2011-12 Bakteri örneklerinden plazmid DNA izolasyonu ve saflaştırılması için Yalnızca profesyonel kullanım için REF 09007050 50 test 09007100
DetaylıREAKSİYON PRENSİPLERİ
REAKSİYON PRENSİPLERİ Reaksiyon Bileşenleri: qpcr Master Mix (PMM) Hedef probe Mix (HPM) Zenginleştirilmiş gıda ürünleri kültüründen izole edilen DNA örneği Polimerase Chain Reaction (PCR): Son yıllarda
DetaylıQIAsymphony RGQ Uygulama Sayfası
QIAsymphony RGQ Uygulama Sayfası QIAsymphony RGQ uygulaması artus HBV QS-RGQ Kiti (örnek tipi: plazma) Testi gerçekleştirmeden önce www.qiagen.com/products/artushbvpcrkitce.aspx adresinde yeni elektronik
DetaylıRTA Bakteriden Genomik DNA İzolasyon Kiti
RTA Bakteriden Genomik DNA İzolasyon Kiti Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi - 2011-12 IVD Bakteri örneklerinden genomik nükleik asit izolasyonu ve saflaştırılması için In vitro tanı amaçlı kullanım için Yalnızca
Detaylıartus CMV QS-RGQ Kiti El Kitabı
artus CMV QS-RGQ Kiti El Kitabı Kantitasyon in vitro diagnostik QIAsymphony SP/AS ve Rotor-Gene Q aletleriyle kullanılmak üzere Sürüm 1 4503363 QIAGEN GmbH, QIAGEN Strasse 1, D-40724 Hilden R6 1060926
DetaylıQMS TOPIRAMAT. İmmün testi. Simgelerin Açıklamaları TOPIRAMATE KONTROLLERİ 0374181 1-3
0155241-C October, 2014 QMS TOPIRAMAT İmmün testi Bu Quantitative Microsphere System (QMS) prospektüsü kullanım öncesinde dikkatle okunmalıdır. Prospektüste verilen talimatlar uygulanmalıdır. Bu prospektüste
Detaylıartus M. tuberculosis RG PCR Kiti El Kitabı
artus M. tuberculosis RG PCR Kiti El Kitabı Ekim 2015 24 Versiyon 1 Kantitatif in vitro diagnostik Rotor-Gene Q aletleriyle kullanılmak üzere 96 4555263 (24 reaksiyon) 4555265 (96 reaksiyon) QIAGEN GmbH
Detaylıattomol lactose intolerance C>T quicktype
attomol lactose intolerance -13910C>T quicktype İnsan laktase-genine karşı -13910C>T geçiş tespitine yönelik mutasyon testi Sadece in vitro diagnostik kullanım içindir! 20 tespit sipariş numarası: 1045
Detaylıattomol bacterial respiratory panel- DNA-LINA II
attomol bacterial respiratory panel- DNA-LINA II Swab numunelerinde Bordetella pertussis-, Bordetella parapertussis-, Mycoplasma pneumoniaeve Legionella pneumophila-dna nın tespitine yönelik test Sadece
DetaylıMAIA Pesticide MultiTest
MAIA Pesticide MultiTest GIDALARDA PESTİSiT KALINTILARI İÇİN AB MAKSİMUM KALINTI LİMİTLERİ İLE UYUMLU ÇOKLU KALINTI TARAMA TESTİ Microplate Acetylcholinesterase Inhibition Assay (MAIA) katı veya sıvı gıda
DetaylıRTA Viral Nükleik Asit İzolasyon Kiti
RTA Viral Nükleik Asit İzolasyon Kiti Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi - 2011-10 IVD In vitro tanı amaçlı insan serum veya plazma (EDTA) örneklerinden viral DNA ve RNA izolasyon ve saflaştırılması amacıyla
DetaylıTrueScience RespiFinder Identification Panels
TrueScience RespiFinder Identification Panels HIZLI REFERANS KARTI Güvenlik ve biyolojik tehlike yönergeleri için TrueScience RespiFinder Identification Panels Protocol (PN 4460429) Safety kısmına bakın.
DetaylıEylül 2015 artus HSV-1/2 QS-RGQ Kiti: Performans Özellikleri
Eylül 2015 artus HSV-1/2 QS-RGQ Kiti: Performans Özellikleri artus HSV-1/2 QS-RGQ Kiti, Versiyon 1 4500363 Testi gerçekleştirmeden önce www.qiagen.com/products/artushsv- 12pcrkitce.aspx adresinde yeni
DetaylıQIAamp DSP DNA FFPE Tissue Kiti El Kitabı
Şubat 2017 QIAamp DSP DNA FFPE Tissue Kiti El Kitabı Sürüm 1 50 İn vitro tanı amaçlı kullanım için 60404 QIAGEN GmbH, QIAGEN Strasse 1, 40724 Hilden, ALMANYA R3 1062689TR Sample to Insight QIAamp DSP DNA
DetaylıRTA Mayadan Genomik DNA İzolasyon Kiti
RTA Mayadan Genomik DNA İzolasyon Kiti Kullanma Klavuzu Yayın Tarihi - 2011-12 Maya örneklerinden genomik nükleik asit izolasyonu ve saflaştırılması için Yalnızca profesyonel kullanım için REF 09002050
Detaylıartus HSV-1/2 QS-RGQ Kiti El Kitabı
artus HSV-1/2 QS-RGQ Kiti El Kitabı Kantitasyon in vitro diagnostik QIAsymphony SP/AS ve Rotor-Gene Q aletleriyle kullanılmak üzere Sürüm 1 4500363 QIAGEN GmbH, QIAGEN Strasse 1, D-40724 Hilden R6 1062626
Detaylı400 HbA1c test veya 200 HbA2/F/A1c test 220-0375 D-10 Printer Kağıdı...10 rulo Lyphochek Diabet Kontrol ikiseviye (2 seviyeden 3 adet)...
H e m o g l o b i n T e s t i D-10 HbA 1c, HbA 2 ve HbF Eşsiz Destek Bio-Rad dünya çapında servis ve destek ekibiyle HbA1c testi konusunda uzun yıllardır destek vermektedir. D-10 size güvenen hastalar
DetaylıNilgün Çerikçioğlu Marmara Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı
Nilgün Çerikçioğlu Marmara Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Kandolaşımı Enfeksiyonları %10 Kandidemi Ölüm hızı : % 50 (YBÜ) Erken tanı (?), tedavinin önemi Etken: Candida allbicans
DetaylıRTA Dokudan ve Parafine-Gömülü Dokudan Genomik DNA İzolasyon Kiti
RTA Dokudan ve Parafine-Gömülü Dokudan Genomik DNA İzolasyon Kiti Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi - 2011-05 IVD İnsan dokusu ve parafine gömülü doku örneklerinden in vitro tanı amaçlı genomik nükleik asit
DetaylıMikrobiyolojide Moleküler Tanı Yöntemleri. Dr.Tuncer ÖZEKİNCİ Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji A.D
Mikrobiyolojide Moleküler Tanı Yöntemleri Dr.Tuncer ÖZEKİNCİ Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji A.D 1 Enfeksiyonun Özgül Laboratuvar Tanısı Mikroorganizmanın üretilmesi Mikroorganizmaya
DetaylıRTA Viral RNA İzolasyon Kiti
RTA Viral RNA İzolasyon Kiti Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi - 2011-09 IVD In vitro tanı amaçlı insan plazma ve serum örneklerinden viral nükleik asit izolasyon ve saflaştırılması için In vitro tanı amaçlı
Detaylıipsogen PML-RARA bcr1 Kit El Kitabı
Mart 2015 ipsogen PML-RARA bcr1 Kit El Kitabı 24 Versiyon 1 Kantitatif in vitro diagnostik Rotor-Gene Q, ABI PRISM, Applied Biosystems 7500 Real- Time PCR System, LightCycler ve SmartCycler aletleriyle
DetaylıEksiği yok. Fazlası var. Thermo Scientific MicroCL 17 ve 21 Mikrosantrifüj Serisi
Eksiği yok. Fazlası var. Thermo Scientific MicroCL 17 ve 21 Mikrosantrifüj Serisi Thermo Scientific MicroCL 17 ve 21 Mikrosantrifüjler Eksiği yok. Kompakttır, az alan kullanır Mikro hacimli protokolleriniz
DetaylıQMS LAMOTRIGINE. İmmün testi. Simgelerin Açıklamaları LAMOTRİGİN KALİBRATÖRLERİ 0373787
0155199-E-TR November, 2014 QMS LAMOTRIGINE İmmün testi Bu Quantitative Microsphere System (QMS) prospektüsü kullanım öncesinde dikkatle okunmalıdır. Prospektüste verilen talimatlar uygulanmalıdır. Bu
DetaylıQMS LAMOTRIGINE. İmmün testi. Simgelerin Açıklamaları LAMOTRİGİN KONTROLLERİ 0374090
0155206-D-TR October, 2014 QMS LAMOTRIGINE İmmün testi Bu Quantitative Microsphere System (QMS) prospektüsü kullanım öncesinde dikkatle okunmalıdır. Prospektüste verilen talimatlar uygulanmalıdır. Bu prospektüste
Detaylıtherascreen BRAF RGQ PCR Kit Kullanım Kılavuzu
Ağustos 2012 therascreen BRAF RGQ PCR Kit Kullanım Kılavuzu 24 Versiyon 1 in vitro diyagnostik kullanım için Rotor-Gene Q MDx 5plex HRM ya da Rotor-Gene Q 5plex HRM cihazda kullanım için 870211 QIAGEN
Detaylıα1-antitrypsin quicktype
attomol α1-antitrypsin quicktype İnsan α-1 antitripsin gen inde M-, Z- and S-alellerin tespitine yönelik kit Sadece in vitro diagnostik kullanım içindir! Z-mutasyonun tespiti için 10 sipariş numarası:
DetaylıRT-PCR. (reverse transckripsiyon-polimeraz zincir reaksiyonu) Dr Gülnur Güler
RT-PCR (reverse transckripsiyon-polimeraz zincir reaksiyonu) Dr Gülnur Güler RT-PCR (reverse transckripsiyon-polimeraz zincir reaksiyonu) mrna ekspresyon seviyelerini belirlemek için sensitiv bir metod
Detaylıattomol HSV 1, 2 Screening-DNA-LINA
attomol HSV 1, 2 Screening-DNA-LINA Beyin omurilik sıvısında ve swab numunelerinde HSV tip 1- ve tip 2- DNA yı tespit etmek için yapılan test Sadece in vitro diagnostik kullanım içindir! 20 tespit sipariş
DetaylıQIAsymphony RGQ Uygulama Sayfası
QIAsymphony RGQ Uygulama Sayfası QIAsymphony RGQ uygulaması artus EBV QS-RGQ Kiti (örnek tipi: plazma) Testi gerçekleştirmeden önce www.qiagen.com/products/artusebvpcrkitce.aspx adresinde yeni elektronik
DetaylıBIOKITS RAPID 3-D Fındık Test Kat. No E
BIOKITS RAPID 3-D Fındık Test Kat. No. 902087E Test etmeden önce lütfen talimatları dikkatle okuyun. Giriş ve Kullanım amacı BIOKITS RAPID 3-D Fındık Test birbirinden faklı 3 tespit çizgisi ile tasarlanmıştır
Detaylıattomol VZV-DNA-LINA Sadece in vitro diagnostik kullanım içindir! 1.Giriş
attomol VZV-DNA-LINA Beyin omurilik sıvısı ve swab numunelerinde VZV-DNA tespitine yönelik test Sadece in vitro diagnostik kullanım içindir! 20 tespit sipariş numarası: 1035 1.Giriş Varicella zoster (VZV)
DetaylıMOLEKÜLER MİKROBİYOLOJİ LABORATUVARI ÇALIŞMA PROSEDÜRÜ
KOD.MİK.PR.02 YAYIN TRH. KASIM 2011 REV. TRH. EYLÜL 2012 REV. NO.1 SAYFA NO.1/14 1. AMAÇ: Moleküler mikrobiyoloji laboratuvarında yürütülen faaliyetleri tanımlamak. 2. KAPSAM: Bu talimat, Moleküler mikrobiyoloji
Detaylıipsogen BCR-ABL1 Mbcr IS-MMR Kit El Kitabı
Mart 2015 ipsogen BCR-ABL1 Mbcr IS-MMR Kit El Kitabı 24 Versiyon 1 Kantitatif in vitro diagnostik Rotor-Gene Q, Applied Biosystems, ABI PRISM ve LightCycler aletleriyle kullanılmak üzere 670723 QIAGEN
DetaylıKAPİLLER ELEKTROFOREZ DNA SEKANSLAMA
İçerik Giriş...2 Deney İçin Gerekli Olan Malzemeler...3 Deneyin Yapılışı... 4-9 Genomik DNA Kalıbının Hazırlanması...4 PCR Amplifikasyonu... 4-5 DNA Miktarının Belirlenmesi...6 Sekans Reaksiyonunun Hazırlanması...7
DetaylıPCR Bir reaksiyonun kurulması ve optimize edilmesi
Hafta V PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları PCR Bir reaksiyonun kurulması ve optimize edilmesi Doç. Dr. Hilâl Özdağ F Đ Z Đ K Đ A L T Y A P I Reaksiyonda kullanılanlar: P C R I. Kalıp DNA a) PCR degrade
DetaylıREAKSİYON PRENSİPLERİ
REAKSİYON PRENSİPLERİ Reaksiyon Bileşenleri: qpcr Master Mix (PMM) Hedef probe Mix (HPM) Zenginleştirilmiş gıda ürünleri kültüründen izole edilen DNA örneği Polimerase Chain Reaction (PCR): Son yıllarda
DetaylıKULLANIM KILAVUZU. LCD Array Kit. Süt ID 2.0. Customized LCD-Array Kit. Kod: A
KULLANIM KILAVUZU LCD Array Kit Süt ID 2.0 Customized LCD-Array Kit Kod: A-850-12 1) Giriş: Bu dizi süt ve süt ürünlerinde hayvan DNA'sının hızlı, kolay ve güvenilir tanımlaması için geliştirilmiştir.
DetaylıMICROPORT TEK KULLANIMLIK PROPHECY ÖZEL YAPIM ALETLERİNİN KULLANIMI 150807-0
TR MICROPORT TEK KULLANIMLIK PROPHECY ÖZEL YAPIM ALETLERİNİN KULLANIMI 150807-0 Bu pakette aşağıda belirtilen diller mevcuttur: English (en) Deutsch (de) Nederlands (nl) Français (fr) Español (es) Italiano
DetaylıKromozom, DNA ve Gen. Allel Segregasyonu. DNA çift sarmalı. Hastalık yapan mutasyonlar protein fonksiyonunu bozar. Hastalık yapan mutasyonlar
Temel Genetik Kavramlar DNA izolasyon yöntemleri Kromozom, DNA ve Gen Hücre Nukleus Kromozomlar Gen Prof.Dr.Uğur ÖZBEK Protein DNA çift sarmalı Allel Segregasyonu Şeker Fosfat omurga Bazlar Baz çifti A
Detaylıı. BCR-ABL Mbcr Kiti(p210) 144 test
C.B.Ü. TIP FAKÜLTESi TıBBi GENETiK ANABiLiM DAlı Moleküler Genetik Hematolojik Malignensi Translokasyon Testleri ve Cihaz Teknik Şartnamesi ı. BCR-ABL Mbcr Kiti(p210) 144 test 2. BCR-ABL mbcr Kiti(p190)
DetaylıÇiğ, işlenmiş ve karışık et, süt ve plazmada tür içeriğinin kalitatif tespiti için F.A.S.T. IMMUNOSTICK ET TÜRLERİ TARAMA KİTİ
Çiğ, işlenmiş ve karışık et, süt ve plazmada tür içeriğinin kalitatif tespiti için F.A.S.T. IMMUNOSTICK ET TÜRLERİ TARAMA KİTİ İÇERİK BÖLÜM SAYFA NUMARASI 1 2 F.A.S.T (FOOD ANALYTE SCREENING TESTS) 2 2
Detaylıipsogen BCR-ABL1 mbcr Kit El Kitabı
Mart 2015 ipsogen BCR-ABL1 mbcr Kit El Kitabı 24 Versiyon 1 Kantitatif in vitro diagnostik Rotor-Gene Q, ABI PRISM, LightCycler ve SmartCycler aletleriyle kullanılmak üzere 670023 QIAGEN GmbH, QIAGEN Strasse
DetaylıRAS Extension Pyro Eklentisi Hızlı Başlangıç Kılavuzu
Şubat 2017 RAS Extension Pyro Eklentisi Hızlı Başlangıç Kılavuzu PyroMark Q24 Cihazları ve PyroMark Q24 Yazılım sürümü 2.0 ile kurulum ve kullanım için Sample to Insight RAS Extension Pyro Eklentisi Hakkında
Detaylıartus HI Virus-1 QS-RGQ Kiti El Kitabı
Aralık 2014 artus HI Virus-1 QS-RGQ Kiti El Kitabı 24 (katalog no. 4513363) 72 (katalog no. 4513366) Versiyon 1 Kantitatif in vitro diagnostik QIAsymphony SP/AS ve Rotor-Gene Q Aletleriyle kullanılmak
DetaylıINNO-LiPA HLA-DPB Amplifikasyon
INNO-LiPA HLA-DPB Amplifikasyon ANAHTAR-KODU: FRI33177 80345 INNO-LiPA HLA-C Amplifikasyon 28798 v1 2015-04-24 p 1/7 Türkçe Tarafından üretildi: Fujirebio Europe N.V. Technologiepark 6 9052 Gent Belgium
DetaylıLaboratuvar Gereçleri Listesi QIAsymphony AS
Aralık 2017 Laboratuvar Gereçleri Listesi QIAsymphony AS QIAsymphony AS (yazılım sürümü 5.0; laboratuvar gereçleri paketi SOW-516-7) ile kullanım için sarf ve adaptörler Bu belge, laboratuvar gereçleri
DetaylıBu Döküman Uludağ Üniversitesi Rektörlüğü'ne aittir. Başkaları tarafından kullanılamaz ve çoğaltılamaz.
1 / 107 Malzeme Kodu : JENL1243 33893 BCR-ABL T(9;22) TRANSLOKASYON 2 SUBTIPIN BELIRLENMESI ICIN KANTITATIF PCR KITI.SUBTIPLER:P190 (MBCR), P210 (MBCR) (TEST/KUTU) SATINALMA BİLGİSİ (ŞARTNAME) (*) Düzenleme
DetaylıKullanılan Semboller. REF Liste Numarası 2-8 C de saklayın in Vitro Diagnostik kullanım Dikkat! IVD. LOT Lot Numarası VER Versiyon.
REF TB10-50 FEP IVD in Vitro Diagnostik kullanım için 50 Aladin (Sacace)'de End Point analizi (FEP) ile Flüoresan tespitinin ve Brucella species (B.melitensis, B.abortus, B.suis, B.ovis, B.canis, B.neotomae)
DetaylıRightFax'e Tara. Yönetici Kılavuzu
RightFax'e Tara Yönetici Kılavuzu Kasım 2016 www.lexmark.com İçerikler 2 İçerikler Genel Bakış...3 Dağıtıma hazır olma denetim listesi... 4 Uygulamayı yapılandırma... 5 Uygulamanın yapılandırma sayfasına
DetaylıEksiği yok. Fazlası var. Thermo Scientific Medifuge Santrifüj
Eksiği yok. Fazlası var. Thermo Scientific Medifuge Santrifüj YENİ masaüstü santrifüjümüzü sunarız! Thermo Scientific Medifuge Eksiği yok. 2 si 1 arada hibrit rotor ile rutin klinik ve yaşam bilimleri
DetaylıINFINITI RVP Plus Testi
INFINITI RVP Plus Testi Kullanım Talimatı In Vitro Diagnostik Kullanım İçin SADECE İHRACAT İÇİN Üretim Yeri: AutoGenomics, Inc., 2980 Scott Street, Vista, CA USA 92081 Yetkili AB Temsilcisi: BÜHLMANN Laboratories
Detaylıtherascreen EGFR RGQ PCR Kiti El Kitabı
Ağustos 2016 therascreen EGFR RGQ PCR Kiti El Kitabı Sürüm 2 24 İn vitro tanı amaçlı kullanım için Rotor-Gene Q MDx cihazları ile birlikte kullanım içindir 874111 QIAGEN Manchester Ltd, Skelton House,
DetaylıVHOPE ve VHOPE kitaplık dosyalarını kurma
VHOPE ve VHOPE kitaplık dosyalarını kurma Adım 1, VHOPE'yi kurma Bu USB sürücüsündeki sunum materyalini kullanabilmeniz için öncelikle VHOPE uygulamasının bilgisayarınıza yüklenmesi gerekir. Volvo Kurumsal
DetaylıDünyanın en iyi Oftalmik Cerrahi Cihazları. Anterior Vitrektomi Ucu
Dünyanın en iyi Oftalmik Cerrahi Cihazları Anterior Vitrektomi Ucu TÜRKÇE LAUREATE Anterior Vitrektomi Ucu Destekleyici resim açıklaması 1. LAUREATE Anterior Vitrektomi Ucu 1a. Aspirasyon Borusu 2. İrigasyon
Detaylıipsogen BCR-ABL1 Mbcr IS-MMR Kit El Kitabı
Temmuz 2016 ipsogen BCR-ABL1 Mbcr IS-MMR Kit El Kitabı Versiyon 1 24 Kantitatif in vitro diagnostik Rotor-Gene Q, Applied Biosystems, ABI PRISM ve LightCycler aletleriyle kullanılmak üzere 670723 QIAGEN
Detaylıtherascreen EGFR RGQ PCR Kiti El Kitabı
Haziran 2013 therascreen EGFR RGQ PCR Kiti El Kitabı Sürüm 1 24 İn vitro tanı amaçlı kullanım içindir Rotor-Gene Q MDx 5plex HRM cihazı ile kullanım içindir. 870111 QIAGEN Manchester Ltd, Skelton House,
DetaylıKullanılan Semboller. in Vitro Diagnostik Kullanım için
REF TV55-50FRT IVD in Vitro Diagnostik kullanım için RotorGene 3000/6000 (Corbett Research), SmartCycler (Cepheid), iq icycler ve iq5 (Biorad), Applied Biosystems 7300/7500 Real Time PCR Systems (Applera),
Detaylıartus VZV RG PCR Kiti El Kitabı
Aralık 2014 artus VZV RG PCR Kiti El Kitabı 24 (katalog no. 4502263) Sürüm 1 96 (katalog no. 4502265) Kantitatif in vitro diagnostik Rotor-Gene Q Aletleriyle kullanılmak üzere 4502263, 4502265 1056824TR
DetaylıSoru 1: DNA miktarını saptamak için spektrofotometrik yöntemin arkasındaki prensibi açıklayınız:
Ara Sınav Soruları Soru 1: DNA miktarını saptamak için spektrofotometrik yöntemin arkasındaki prensibi açıklayınız: Cevap1: 260 nm de 1 cm yol uzunluğundaki OD = 50 μ g/ml çift sarmal DNA için, 40 μ g/ml
Detaylıipsogen JAK2 MutaScreen RS Kiti El Kitabı
Ocak 2013 ipsogen JAK2 MutaScreen RS Kiti El Kitabı Sürüm 1 19 Kantitatif in vitro tanı amaçlı Rotor-Gene Q, Applied Biosystems, ABI PRISM ve LightCycler cihazlarıyla kullanım için 673123 QIAGEN GmbH,
DetaylıMOLEKÜLER BİYOLOJİ LABORATUVARI
MOLEKÜLER 2014-2015 BİYOLOJİ LABORATUVARI GÜZ DÖNEMİ MOLEKÜLER BİYOLOJİ LABORATUVARI 7.HAFTA DERS NOTLARI GAZİ ÜNİVERSİTESİ FEN FAKÜLTESİ BİYOLOJİ BÖLÜMÜ Sayfa 1 / 6 1. RFLP (RESTRİKSİYON PARÇA UZUNLUK
Detaylı