TIBBİ MİKROBİYOLOJİ ANABİLİM DALI TRAKYA ÜNİVERSİTESİ TIP FAKÜLTESİ TIBBİ MİKROBİYOLOJİ ANABİLİM DALI MEZUNİYET SONRASI UZMANLIK EĞİTİM (İHTİSAS) DERSLERİ 2015-2016 TIBBİ MİKROBİYOLOJİ ANABİLİM DALI ÖĞRETİM ÜYELERİ Prof. Dr. Nermin ŞAKRU Prof. Dr. Şaban GÜRCAN Doç. Dr. Neşe SANSA Yrd.Doç. Dr. Canan ERYILDIZ
TIBBİ MİKROBİYOLOJİ ANABİLİM DALI UZMANLIK EĞİTİM DERSLERİ Dersin Dersin Adı TEO UYG KREDİ Öğretim Üyesi Kodu MİK 700 Tez Danışmanlığı 0 1 1 İlgili Öğretim Üyesi MİK 701 Seminer 0 1 1 Tüm Öğretim Üyeleri MİK 702 Makale Saati 0 1 1 Tüm Öğretim Üyeleri MİK 703 Genel Mikrobiyoloji 1 4 3 Prof. Dr. Nermin ŞAKRU Prof. Dr. Şaban GÜRCAN Doç. Dr. Neşe SANSA Yrd.Doç.Dr. Canan ERYILDIZ MİK 704 Bakteriyoloji 2 10 7 Prof. Dr. Şaban GÜRCAN Yrd.Doç Dr. Canan ERYILDIZ MİK 705 Mikobakteriyoloji 1 6 4 Prof. Dr. Şaban GÜRCAN Yrd.Doç Dr. Canan ERYILDIZ MİK 706 Mikoloji 1 6 4 Prof. Dr. Şaban GÜRCAN Yrd.Doç Dr. Canan ERYILDIZ MİK 707 Viroloji 2 1 3 Prof. Dr. Şaban GÜRCAN Yrd.Doç.Dr. Canan ERYILDIZ MİK 708 Mikrobiyolojide sero-immünolojik ve 1 8 5 Doç.Dr.Neşe SANSA antijen test ve yöntemleri MİK 709 Moleküler tanı test ve yöntemleri 1 4 3 Doç.Dr.Neşe SANSA MİK 710 Tıbbi Parazitoloji 1 6 4 Prof.Dr.Nermin ŞAKRU MİK 711 MİK 712 MİK 713 Hastane İnfeksiyonları Mikrobiyolojisi Laboratuvar Etiği, İşletimi ve Yönetimi Hücre kültürüyle viral tanı yöntemleri 1 2 2 Prof. Dr. Şaban GÜRCAN Yrd.Doç.Dr. Canan ERYILDIZ 1 2 2 Prof. Dr. Nermin ŞAKRU Prof. Dr. Şaban GÜRCAN Doç. Dr. Neşe SANSA Yrd.Doç.Dr. Canan ERYILDIZ 1 4 3 Doç.Dr.Neşe SANSA 2
TIBBİ MİKROBİYOLOJİ ANABİLİM DALI UZMANLIK EĞİTİM DERSLERİ MİK 700: Tez Danışmanlığı MİK 701: Seminer MİK 702: Makale Saati MİK 703: Genel Mikrobiyoloji MİK 704: Bakteriyoloji MİK 705: Mikobakteriyoloji MİK 706: Mikoloji MİK 707: Viroloji MİK708: Mikrobiyolojide sero-immünolojik ve antijen test ve yöntemleri MİK 709: Moleküler tanı test ve yöntemleri MİK 710: Tıbbi Parazitoloji MİK 711: Hastane İnfeksiyonları Mikrobiyolojisi MİK 712: Laboratuvar Etiği, İşletimi ve Yönetimi MİK 713: Hücre kültürüyle viral tanı yöntemleri TIBBİ MİKROBİYOLOJİ ANABİLİM DALI TIPTA UZMANLIK EĞİTİMİ PROGRAMI MİK 700: Tez Danışmanlığı (0-1-1) (Her Uzmanlık Öğrencisi İçin) Dersin kapsamı: Öğretim üyelerinin danışmanı olduğu her bir tez öğrencisi için haftalık 1 saat gerçekleştirdiği faaliyetleridir. Dersin Yeri: Dersler, tez danışmanı olan öğretim üyesinin ofisinde yapılır. Dersin saati: Her hafta Cuma günü 11.30-12.30 arası bir saat 1x1=1 Dersin planlanan saati ile Tıp Fakültesine verilen ders saatleri arasında çakışma olursa, aynı ders o haftanın uygun olan başka saatinde yapılır. Öğretim üyesinin vereceği ders saati, danışmanı olduğu tez öğrencisi sayısına göre değişkenlik gösterebilir. Dersin süresi: 1 yıl Dersin öğrencisi: Tıbbi Mikrobiyoloji uzmanlık öğrencisi Dersin sorumlusu öğretim üyesi: Uzmanlık öğrencisinin tez danışmanı olduğu her bir tez öğrencisi için haftalık bir teorik ders dışı faaliyet yüküne eşdeğerdir. Dersin İçeriği: 1. Uzmanlık öğrencisinin tez konusu hakkında literatür bilgisinin geliştirilmesi ve dokümantasyonu 2. Teze ait materyal ve metod bilgisinin öğretilmesi, kurulması ve geliştirilmesi 3. Sonuçların değerlendirilmesi 4. Tezin yazılması Planlanan dersin ders saati Tıp Fakültesi, diğer fakülteler ve enstitülerde diğer verilen dersler ile çakırsa, aynı haftanın uygun olan başka saatinde yapılır. 3
MİK 701: Seminer (0-1-1) (Her Öğretim Üyesi İçin) Dersin kapsamı: Tıbbi Mikrobiyoloji uzmanlık öğrencileri ve öğretim elemanları tarafından seçilen konular tartışılır. Dersin Yeri: Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Seminer Salonu Dersin saati: Her hafta Cuma günü 15.30-16.30 saatleri arası. Dersin süresi: 1 yıl Dersin öğrencisi: Tıpta uzmanlık öğrencileri Dersin sorumlusu öğretim üyesi: Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı başkanı tarafından görevlendirilen öğretim elemanları. Bu ders, her bir öğretim üyesi için haftada iki saat teorik ders dışı yüküne karşılıktır. Dersin İçeriği: Tıbbi Mikrobiyolojide güncel konuları içeren seminerler. Planlanan dersin ders saati Tıp Fakültesi, diğer fakülteler ve enstitülerde diğer verilen dersler ile çakırsa, aynı haftanın uygun olan başka saatinde yapılır. MİK 702: Makale Saati (0-1-1) (Her Öğretim Üyesi İçin) Dersin Kapsamı: Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı uzmanlık öğrencileri ve öğretim üyeleri tarafından seçilen makalelerin sunumu yapılır. Dersin Yeri: Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı seminer salonu. Dersin saati: Her hafta Cuma günü 14.30-15.30 saatleri arası. Dersin süresi: 1 yıl Dersin öğrencisi: Tıpta uzmanlık öğrencileri Planlanan dersin ders saati Tıp Fakültesi, diğer fakülteler ve enstitülerde diğer verilen dersler ile çakırsa, aynı haftanın uygun olan başka saatinde yapılır. MİK 703: Genel Mikrobiyoloji Dersin kapsamı: Laboratuvar güvenliği, sterilizasyon ve dezenfeksiyon, örnek yönetimi, mikroskopi, boyalar ve besiyerleri Dersin yeri: Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı ve Merkez Laboratuvarı Mikrobiyoloji Bölümü Dersin saati: Haftanın her günü 10.30-11.30 saatleri arası. Dersin süresi: 2 ay Dersin sorumlu öğretim üyeleri: Prof. Dr. Nermin ŞAKRU, Prof. Dr. Şaban GÜRCAN, Yrd.Doç. Dr. Canan ERYILDIZ Biyogüvenlik: Laboratuvar tasarımı, laboratuvara giriş ve çıkışların düzenlenmesi, laboratuvarda çalışmaya ilişkin risklerin tanımlanması, biyogüvenlik düzeylerinin tanımlanması, biyogüvenlik 4
kabinlerinin kullanılması, kişisel kuruyucu donanımların kullanılması, laboratuvar kazalarında ve acil durumlarda müdahale, biyogüvenlik sürekli eğitim programı, laboratuvar atıklarının yönetimi, laboratuvar alanlarının temizliği Mikrobiyoloji laboratuvarında sterilizasyon-dezenfeksiyon uygulamaları: Ortam temizliği, dezenfeksiyonu ve el hijyeni, aseptik çalışma teknikleri, mikrobiyolojide kullanılacak sterilizasyon yöntemleri ve uygulamalar Merkezi Sterilizasyon Ünitesi (MSÜ): MSÜ işletimi ve yönetimi, dekontaminasyon ve dezenfeksiyon işlemleri, sterilizasyon yönteminin seçimi, sterilizasyon kontrolü, mönitarizasyonu ve kayıtlama, dezenfektanların etki mekanizmaları ve etkinlik kontrolleri, koruyucu hekimlik ve bildirim Örnek yönetimi: Örnek alma, örnek transportu, örnek kabulü/reddi, örnek işleme, örnek saklama Mikroskop çeşitleri ve kullanımı: Mikrobiyoloji laboratuvarında kullanılan mikroskop çeşitleri ve kullanım alanları, mikroskopların kullanım ve bakımı Besiyeri hazırlama: Mikrobiyoloji laboratuvarında sık kullanılan besiyerlerinin özellikleri ve hazırlanması Boya ve solüsyon hazırlama: Mikrobiyoloji laboratuvarında sık kullanılan boya ve solüsyonların özellikleri ve hazırlanması Planlanan dersin ders saati Tıp Fakültesi, diğer fakülteler ve enstitülerde diğer verilen dersler ile çakırsa, aynı haftanın uygun olan başka saatinde yapılır. MİK 704: Bakteriyoloji Dersin kapsamı: Sistemlere ait örneklerden bakterilerin izolasyonu ve tanımlamasının yapılması. Antimikrobiyal direnç testlerinin uygulanması ve mikrobiyolojik yönlendirme. Mikrobiyolojik test sonuçlarının rapor haline getirilmesi. Çevre örneklerinin mikrobiyolojik değerlendirmesi ve örneklerde etken saptama. Gebelik öncesi ve gebelikte mikrobiyolojik değerlendirme. Prenatal ve konjenital enfeksiyonların mikrobiyolojik tanısı Dersin yeri: Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı ve Merkez Laboratuvarı Mikrobiyoloji Bölümü Dersin saati: Her hafta Pazartesi, Çarşamba ve Cuma günleri 09.30-11.30, Salı ve Perşembe günleri 8.30-11.30 saatleri arası. Dersin süresi: 1 yıl Dersin sorumlu öğretim üyeleri: Prof. Dr. Şaban GÜRCAN, Yrd.Doç. Dr. Canan ERYILDIZ Sistemlere ait örneklerden bakterilerin izolasyonu ve tanımlamasının yapılması: Solunum sistemi örneklerinin mikrobiyolojik değerlendirilmesi ve örneklerde etken saptama. Sindirim sistemi örneklerinin mikrobiyolojik değerlendirilmesi ve örneklerde etken saptama. Genito-üriner sistem örneklerinin mikrobiyolojik değerlendirilmesi ve örneklerde etken saptama. Merkezi sinir sistemi örneklerinin mikrobiyolojik değerlendirilmesi ve örneklerde etken saptama. Göz örneklerinin 5
mikrobiyolojik değerlendirmesi ve etken saptama. Kan, lenf dolaşımı ve kemik iliği örneklerinin mikrobiyolojik değerlendirmesi ve etken saptama. Kemik, eklem sıvısı, deri ve yumuşak doku örneklerinin mikrobiyolojik değerlendirmesi ve etken saptama. Konvansiyonel yöntemler ve otomatize sistemlerle bakteri tanımlama. Antimikrobiyal direnç testlerinin uygulanması ve mikrobiyolojik yönlendirme: Antimikrobiyal direnç mekanizmalarının tanımlanması. Antimikrobiyal duyarlılık testlerinin uygulanması (disk difüzyon, dilüsyon testleri, gradyen test, MBC testleri, otomatize sistemler). Antibiyogram sonuçlarının yorumlanması. Kısıtlı antibiyogram sonucu bildirme. Antibiyotik direnci ve direnç mekanizmalarının belirlenmesinde moleküler yöntemler. Mikrobiyolojik test sonuçlarının rapor haline getirilmesi: Rapor yazılması, sonuçların iletilmesi, bildirim gerektiren sonuçlar, panik değerlerin yönetimi. Çevre örneklerinin mikrobiyolojik değerlendirmesi ve örneklerde etken saptama: Su ve gıda örneklerinin bakteriyolojik olarak değerlendirilmesi. Su ve gıda kaynaklı patojenlerin tanımlanması. Gebelik öncesi ve gebelikte mikrobiyolojik değerlendirme: Streptococcus agalactiae, Treponema pallidum ve diğer bakteriyel genital enfeksiyon etkenleri Prenatal ve konjenital enfeksiyonların mikrobiyolojik tanısı: Amniyon sıvısı, kordosentez, koryon villus biyopsisi ve kordon kanı gibi örneklerin bakteriyolojik incelemesi Bağışıklığı baskılanmış konakta gelişen bakteriyel enfeksiyonlarda etkene yönelik saptama: Fırsatçı bakteri enfeksiyonlarında etken saptama Planlanan dersin ders saati Tıp Fakültesi, diğer fakülteler ve enstitülerde diğer verilen dersler ile çakırsa, aynı haftanın uygun olan başka saatinde yapılır. MİK 705: Mikobakteriyoloji Dersin kapsamı: Direkt mikroskobik inceleme ve boyama yöntemleri (ARB, Kinyoun, Auramine), örneğin homojenizasyon ve dekontaminasyonu, klasik ve/veya otomatize yöntemle ekim-üretim, gerektiğinde identifikasyon ve duyarlılık testleri, tüberküloz-nontüberküloz ayırımı. Dersin yeri: Merkez Laboratuvarı Mikrobiyoloji Birimi Mikobakteriyoloji Laboratuarı Dersin saati: Her hafta Pazartesi, Salı ve Çarşamba günleri 09.30-10.30 ve 15.30-16.30 arası, Perşembe günü 15.30-16.30 saatleri arası. Dersin süresi: 3 ay Dersin sorumlu öğretim üyeleri: Prof. Dr. Şaban GÜRCAN, Yard. Doç. Dr. Canan ERYILDIZ 6
Mikobakteriyoloji laboratuvarında güvenlik kabini kullanımı Örneklerin (Balgam, diğer) dekontaminasyon, homojenizasyon ve konsantrasyon işlemleri Uygun besiyeri hazırlama Direkt mikroskopik inceleme yöntemlerinin bilinmesi, uygulanması ve yorumu ARB Auramine-rhodamin Geleneksel ve otomatize sistemlerde Mikobakteri kültürü İdentifikasyon testleri Duyarlılık testleri Mikobakteri infeksiyonlarının tanısında kullanılan immünolojik ve moleküler yöntemler Örneklerin saklanması Suşların saklanması Kalite kontrol ve standardizasyon Planlanan dersin ders saati Tıp Fakültesi, diğer fakülteler ve enstitülerde diğer verilen MİK 706: Mikoloji Dersin kapsamı: Temel mikolojik tanı yöntemleri (boyasız-boyalı preparat inceleme, kültür, identifikasyon ve gerektiğinde duyarlılık testi işlemleri), mikolojide serolojik test kullanımı, immündüşkün hastada mikolojik sorunlarla ilgilenme Dersin yeri: Merkez Laboratuvarı Mikrobiyoloji Birimi Mikoloji Laboratuvarı Dersin saati: Her hafta Salı ve Cuma günleri 09.00-11.00, Pazartesi, Çarşamba ve Perşembe günleri 10.00-11.00 saatleri arası. Dersin süresi: 3 ay Dersin sorumlu öğretim üyeleri: Prof. Dr. Şaban GÜRCAN, Yard. Doç. Dr. Canan ERYILDIZ Mikolojik inceleme amacıyla alınan klinik örnekler, Keratinize örnekler (Saç, Deri, Tırnak), Genital örnekler, Solunum örnekleri, Kan, Diğer Mikroskopik inceleme (preparat hazırlama, boyama, inceleme) KOH Laktofenol pamuk mavi Çin mürekkebi Kalkoflor beyazı Besiyerlerinin hazırlanması ve örneğe göre uygun besiyerinin seçilmesi Ekim teknikleri ve kültürlerin makroskopik ve mikroskopik incelenmesi Mantarların tür düzeyinde tanımlanması, Lam kültürü Germ tüp testi, Asimilasyon testleri, Üreaz testi, Saç perforasyon testi, Mısır unlu Tween 80 agara ekim, Otomatize istemler, Mantar identifikasyon kitleri 7
Klinik önemi olan Mantarların identifikasyonu Dermatofitler, Candida, Cryptococcus, Aspergillus, Fırsatçı, saprofit mantarlar Antifungal duyarlılık testlerinin yapılması ve yorumlanması Mantar infeksiyonlarının tanısında kullanılan immünolojik ve moleküler yöntemler Örneklerin saklanması Suşların saklanması Kalite kontrol ve standardizasyon Planlanan dersin ders saati Tıp Fakültesi, diğer fakülteler ve enstitülerde diğer verilen MİK 707: Viroloji Dersin kapsamı: Sistemlere ait örneklerin virolojik olarak değerlendirilmesi ve virüslerin tanımlanması. Gebelik öncesi ve gebelikte viral enfeksiyonların mikrobiyolojik değerlendirmesi. Bağışıklığı baskılanmış konakta gelişen enfeksiyonlarda etkene yönelik saptama. Viral hepatitlerin mikrobiyolojik değerlendirilmesi. Dersin yeri: Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı ve Merkez Laboratuvarı Mikrobiyoloji Bölümü Dersin saati: Her hafta Salı günü 13.30-15.30, Perşembe günü 13.30-14.30 saatleri arası. Dersin süresi: 2 ay Dersin sorumlu öğretim üyeleri: Prof. Dr. Şaban GÜRCAN, Yard. Doç. Dr. Canan ERYILDIZ Mikrobiyoloji laboratuvarına gönderilen örneklerin virolojik olarak değerlendirilmesi ve örneklerde etken saptama. Kemik, biyopsi, apse ve eklem sıvısı örneklerinde virolojik etkenlerin saptanması. Göz örneklerinin virolojik olarak değerlendirilmesi ve viral etkenlerin saptanması. Gebelik öncesi ve gebelikte CMV, Rubella virüs, HSV, VZV, Parvovirüs B19, HBV, HCV ve HIV enfeksiyonlarının mikrobiyolojik olarak değerlendirilmesi. Fırsatçı viral enfeksiyonlarda etken saptama. Hepatit etkeni virüslerin tanımlanması, viral hepatitlerin mikrobiyolojik tanısı (serolojik ve moleküler), viral hepatitlerin mikrobiyolojik tanısında örnek yönetimi, koruyucu hekimlik ve tedavi yönlendirme. Planlanan dersin ders saati Tıp Fakültesi, diğer fakülteler ve enstitülerde diğer verilen MİK 708 : Mikrobiyolojide Sero-immünolojik ve Antijen Test ve Yöntemleri Dersin kapsamı: Girişimsel yeterlik için mikrobiyolojide sero-immünolojik ve antijen test ve yöntemleri, Klinik yeterlik için mikrobiyolojik immünokimyasal testler Dersin yeri: Merkez Laboratuvarı Seroloji-IFA Birimi Laboratuvarı Dersin saati: Her hafta Salı günü 13.00-14.00 saatleri, Perşembe günü 13.30-15.30 saatleri, Pazartesi, Çarşamba ve Cuma günleri 9.30-11.30 saatleri arası. 8
Dersin süresi: 5 ay Dersin sorumlu öğretim üyeleri: Doç. Dr. Neşe SANSA Girişimsel yeterlik için mikrobiyolojide sero-immünolojik ve antijen test ve yöntemleri: Aglütinasyon, kompleman fiksasyon, presipitasyon, mikro EIA, kemiluminesan, mikropartikül, nefelometrik, turbidometrik, IFA, immünoblot, immünokromatografik ve ilgili diğer yöntemler ve testler (3. yıl). Akım sitometrede lenfosit fenotipleme (3. yıl). ABO kan grubu saptama, çapraz-uyum testi (4. yıl). Klinik yeterlik için mikrobiyolojik immünokimyasal testler: Otoimmün serolojide (3. yıl) ve kan bankası serolojisinde (4. yıl) EIA, IFA, İB. Kan merkezi testleri, immün-hematolojik testler, kan ve bileşenlerinin ayrımı-depolanması (4. yıl). Solunum örneklerinde (1. yıl) ve mesleksel risk gruplarının viral enfeksiyonunda (3. yıl) AG/AB için örnek. Planlanan dersin ders saati Tıp Fakültesi, diğer fakülteler ve enstitülerde diğer verilen MİK 709: Moleküler Tanı Test ve Yöntemleri Dersin kapsamı: Klinik yeterlik için moleküler mikrobiyolojik testler. Girişimsel yeterlik için moleküler mikrobiyolojik testler ve yöntemler Dersin yeri: Merkez Laboratuvarı Moleküler Mikrobiyoloji Birimi Laboratuvarı Dersin saati: Her hafta Pazartesi günü 13.30-15.30 saatleri, Çarşamba günü 13.00-14.00 saatleri, Perşembe günü 9.30-11.30 saatleri arası. Dersin süresi: 2 ay Dersin sorumlu öğretim üyeleri: Doç. Dr. Neşe SANSA Girişimsel yeterlik için moleküler mikrobiyolojik testler ve yöntemler: Bakteri, mantar, parazit tanısında ve antibiyotik duyarlık saptanmasında moleküler yöntemler (1. yıl). Antibiyotik duyarlık saptanmasında moleküler yöntemler (2. yıl). DNA/RNA izolasyonu, hibridizasyon ve problar, PZR, GZ PZR, kantitatif PZR, genotipleme ve mutasyon analizi, ilaç direnci, DNA dizi analizi, filogenetik analiz, proteomiks, pirosekans, mikro-dizilim ve benzeri analizler, RFLP, PFGE ve benzeri analiz yöntemleri (3. yıl). Klinik yeterlik için moleküler mikrobiyolojik testler: Hastane enfeksiyonlarında moleküler iz sürme/ tiplendirme (4. yıl). Adli mikrobiyolojik moleküler tanı yöntemleri (diğer tanısal yöntemler hariç) (3. yıl). Solunum örneklerinde (1. yıl) ve mesleksel risk gruplarının viral enfeksiyonda (3. yıl) NAT için örnek (1. yıl). 9
Planlanan dersin ders saati Tıp Fakültesi, diğer fakülteler ve enstitülerde diğer verilen MİK 710:Parazitoloji Dersin kapsamı: Dışkı ve Diğer Klinik Örnekleri Değerlendirme, Serolojik Testleri Değerlendirme Dersin yeri: Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı ve Merkez Laboratuvarı Mikrobiyoloji Bölümü Dersin saati: Her hafta Pazartesi, Çarşamba ve Cuma günleri 10.00-12.00 saatleri, Perşembe günü 14.00-15.00 saatleri arası. Dersin süresi: 3 ay Dersin sorumlu öğretim üyeleri: Prof.Dr.Nermin ŞAKRU Protozoonlar (İntestinal, doku ve kan protozoonları), Sestodlar (intestinal ve doku sestodları), Trematodlar (intestinal, kan, akciğer ve karaciğer trematodları), Nematodlar (intestinal ve doku nematodları), Artropodlar, Immonoparazitoloji, Parazitolojide tanı yöntemleri, Paraziter hastalıkların epidemiyolojisi. Tıbbi Parazitoloji laboratuvarında yapılan tetkiklerin genel prensipleri, yapılışları, olası aksaklıkların giderilmesi konusunda izlenmesi gereken yollar hakkında teorik bilgi verilmesi ve uygulanması. Tıbbi Parazitoloji Anabilim laboratuarında yapılan serolojik testlerin prensipleri, yapılışları, olası aksaklıkların giderilmesi konusunda izlenmesi gereken yollar hakkında teorik bilgi verilmesi ve uygulanması. Planlanan dersin ders saati Tıp Fakültesi, diğer fakülteler ve enstitülerde diğer verilen MİK 711: Hastane Enfeksiyonları Mikrobiyolojisi Dersin kapsamı: Hastane infeksiyonları (tanımı, izlemi, kontrolu), Hastane infeksiyonları kontrol komitesi (HİKK) çalışmaları, hasta izolasyonları, toplumda bulaşıcı hastalıkların önlenmesi, aşı ve pasif immünizasyon. Dersin yeri: Trakya Üni. Sağlık Uygulama ve Araştırma Hastanesi Enfeksiyon Kontrol Komitesi, Merkez Laboratuvarı Mikrobiyoloji Birimi Bakteriyoloji Laboratuvarı Dersin saati: Her hafta Çarşamba günü 13.00-15.00 saatleri, Cuma günü saat 13.30-14.30 saatleri arası. Dersin süresi: 1 ay Dersin sorumlu öğretim üyeleri: Prof. Dr. Şaban GÜRCAN, Yard. Doç. Dr. Canan ERYILDIZ Hastane infeksiyonlarına neden olan sorun bakterilerin antimikrobiyal duyarlılık testlerinin uygulanması 10
direnci VRE, MRSA, GSBL, İndüklenebilir beta laktamaz, Enterokoklarda yüksek düzeyde aminoglikozit Hastane infeksiyonu etkeni olan izolatların saklanması Hastane ortamında salgın zamanlarında yapılması gereken mikrobiyolojik işlemler (çevre, burun, el kültürleri vb) Hastanede uygulanan sterilizasyon ve dezenfeksiyon politikalarının izlenmesi Dezenfektan aktivitesi ölçümü Sterilizasyon kontrolü (Fiziksel, Kimyasal, Biyolojik) Merkezi Sterilizasyon Ünitesi işlevinin bilinmesi Hastane İnfeksiyonları Kontrol Komitesi (HİKK) toplantısına katılma Planlanan dersin ders saati Tıp Fakültesi, diğer fakülteler ve enstitülerde diğer verilen dersler ile çakırsa, aynı haftanın uygun olan başka saatinde yapılır. MİK 712: Laboratuvar Etiği, İşletimi ve Yönetimi Dersin kapsamı: Kalite yönetim sistemi, laboratuvar tasarım ve kurulumu, ulusal ve uluslararası organizasyonlarla iletişim. Laboratuvarda etik ilkelere uyum. Mevzuat. Dersin yeri: Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı ve Merkez Laboratuvarı Mikrobiyoloji Bölümü Dersin saati: Her hafta Pazartesi günü 13.30-15.30 saatleri, Çarşamba günü 14.30-15.30 saatleri arası. Dersin süresi: 1 ay Dersin sorumlu öğretim üyeleri: Prof. Dr. Nermin ŞAKRU, Prof. Dr. Şaban GÜRCAN, Doç. Dr. Neşe SANSA, Yrd.Doç. Dr. Canan ERYILDIZ Tıbbi Laboratuvarlar Yönetmeliği ve Kalite Yönetim Sistemi (IS015189) çerçevesinde mikrobiyoloji laboratuvarının tasarım, kurulum ve yönetimi. Personel görev tanımlarının ve iş yüklerinin etkin bir şekilde belirlenmesi. Güncel rehberler ve veriler ışığında laboratuvar test seçimi ve prosedürlerinin yapılandırılması. Kalite kontrol çalışmaları ve verilerin kaydı. Satın alma süreçleri ve şartname hazırlama. Laboratuvar malzemelerinde verimlilik takibi ve sürekliliği sağlayabilme. Laboratuvar verilerinin düzenli olarak istatistiksel analizinin yapılıp yorumlanması. Laboratuvar işleyişinde etik ilkeler. İlgili mevzuatın takibi ve gerekliliklerinin yerine getirilmesi. Planlanan dersin ders saati Tıp Fakültesi, diğer fakülteler ve enstitülerde diğer verilen MİK 713: Hücre Kültüründe Viral Tanı Yöntemleri Dersin kapsamı: Klinik ve girişimsel yeterlik için hücre kültüründe viral tanı 11
Dersin yeri: Merkez Laboratuvarı Moleküler Mikrobiyoloji Birimi Laboratuvarı Dersin saati: Her hafta Salı ve Çarşamba günleri 14.30-16.30 saatleri, Cuma günü 13.30-14.30 saatleri arası. Dersin süresi: 2 ay Dersin sorumlu öğretim üyeleri: Doç. Dr. Neşe SANSA Girişimsel yeterlik için hücre kültüründe viral tanı: Hücre dizisi oluşturma, saklama, pasaj (sitopati değerlendirmesi hariç), besiyeri seçimi, viral ekim (parazit ekimi hariç). Klinik yeterlik için hücre kültüründe viral tanı: Solunum örneklerinde (1. yıl) ve mesleksel risk gruplarının viral enfeksiyonunda (3. yıl) viral kültür için örnek. Planlanan dersin ders saati Tıp Fakültesi, diğer fakülteler ve enstitülerde diğer verilen NA Uzmanlık Ders Konuları Dersin Kodu Dersin Adı TEORİK UYGULAMA KREDİ Öğretim Üyesi LABORATUVAR TASARIM 1 1 1 KY- NA1 HÜCRE DİZİLERİ OLUŞTURMA, KORUMA, SAKLAMA 1 1 1 GY- NA3 HÜCRE KÜLTÜRÜNE EKİM 1 1 1 GY- NA3 VİRÜSLERİN HÜCRE KÜLTÜRÜNDE ÜREMESİNİN VE SİTOPATİK ETKİLERİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ 1 1 1 GY3 SHELL- VİAL HÜCRE KÜLTÜRÜ 1 1 1 GY- NA3 VİRÜS İÇİN UYGUN BESİYERİ SEÇİMİ, EKİMİ VE İNKÜBASYONU 1 1 1 GY- NA3 PARAZİTLER İÇİN UYGUN BESİYERİ SEÇİMİ, EKİMİ VE İNKÜBASYONU 1 1 1 GY3 LENFOSİT SUBTİP BELİRLEME (AKIM SİTOMETRE) 1 1 1 GY- NA3 NÜKLEİK ASİT (DNA VE RNA) İZOLASYONU VE SAFLAŞTIRILMASI 1 1 1 GY- NA3 HİBRİDİZASYON YÖNTEMLERİ, PROBLAR 1 1 1 GY- NA3 KLASİK POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU (PCR; PZR) 1 1 1 GY- NA3 GERÇEK ZAMANLI PZR 1 1 1 GY- NA3 12
KANTİTATİF PZR 1 1 1 GY- NA3 GENOTİPLEME YÖNTEMLERİ, MUTASYON ANALİZİ 1 1 1 GY- NA3 GENOTİPİK İLAÇ DİRENÇ ANALİZİ 1 1 1 GY- NA3 NÜKLEİK ASİT DİZİ ANALİZİ YÖNTEMLERİ, FİLOGENETİK ANALİZ 1 1 1 GY- NA3 DİĞER MOLEKÜLER TEKNİKLER VE İLERİ TEKNOLOJİLER (MALDİ- TOF, PİROSEKANS, "MİKRO- ARRAY" GİBİ) 1 1 1 GY- NA3 RFLP, PFGE GİBİ ANALİZ YÖNTEMLERİ 1 1 1 GY- NA3 1 1 1 LAM AGLÜTİNASYON TESTİ 1 1 1 GY- NA3 TÜP AGLÜTİNASYON TESTİ 1 1 1 GY- NA3 HEMAGLÜTİNASYON TESTİ 1 1 1 GY- NA3 KOMPLEMAN FİKSASYON TESTİ 1 1 1 GY- NA3 FLOKÜLASYON/PRESİPİTASYON TESTLERİ 1 1 1 GY- NA3 MİKRO ELİSA TESTİ 1 1 1 GY- NA3 KEMİLUMİNESAN- MİKROPARTİKÜL YÖNTEMLER 1 1 1 GY- NA3 NEFELOMETRİK- TURBİDOMETRİK YÖNTEMLER 1 1 1 GY- NA3 İMMÜNFLORESAN YÖNTEMLER 1 1 1 GY- NA3 İMMÜNBLOT YÖNTEMLER 1 1 1 GY- NA3 İMMÜNKROMATOGRAFİK YÖNTEMLER 1 1 1 GY- NA3 DİĞER SERO- İMMÜNOLOJİK YÖNTEMLER VE ANTİJEN TESTLERİ 1 1 1 GY- NA3 ABO KAN GRUPLARININ SAPTANMASI 1 1 1 GY- NA4 "CROSS- MATCH" 1 1 1 GY- NA4 ANTİBİYOTİK DUYARLIK SAPTAMADA MOLEKÜLER YÖNTEMLER 1 1 1 GY- NA2 VİRÜS KÜLTÜRÜ İÇİN SOLUNUM YOLU ÖRNEĞİ 1 1 1 KY1 NAT İÇİN SOLUNUM YOLU ÖRNEĞİ 1 1 1 KY1 AG TESTİ İÇİN SOLUNUM YOLU ÖRNEĞİ 1 1 1 KY1 MESLEKSEL RİSK GRUPLARINDA ENFEKSİYONLARIN VİROLOJİK DEĞERLENDİRİLMESİ KÜLTÜR İÇİN ÖRNEK 1 1 1 KY3 13
MESLEKSEL RİSK GRUPLARINDA ENFEKSİYONLARIN VİROLOJİK DEĞERLENDİRİLMESİ AG/AB TESTİ İÇİN ÖRNEK 1 1 1 KY3 MESLEKSEL RİSK GRUPLARINDA ENFEKSİYONLARIN VİROLOJİK DEĞERLENDİRİLMESİ NAT İÇİN ÖRNEK 1 1 1 KY3 ADLİ MİKROBİYOLOJİK İNCELEMELERDE MOLEKÜLER VE DİĞER TANISAL YÖNTEMLER 1 1 1 KY3 OTOİMMÜN SEROLOJİ * EIA KY- NA3 OTOİMMÜN SEROLOJİ * İMMÜN FLORESAN YÖNTEMLER 1 1 1 KY- NA3 İ OTOİMMÜN SEROLOJİ * MMÜN BLOT 1 1 1 KY- NA3 KALİTE YÖNETİM SİSTEMİ (İSO15189 UN 4. VE 5. BAŞLIKLARINDA KAPSANAN MADDELER ) 1 1 1 KY- NA3 LABORATUAR TASARIM VE KURULUMU 1 1 1 KY- NA3 HASTANE ENFEKSİYONU ETKENLERİNİN TANIMLANMASI VE MİKROBİYOLOJİK DEĞERLENDİRİLMESİ - MOLEKÜLER İZ SÜRME /TİPLENDİRME (MOLEKÜLER EPİDEMİYOLOJİ) 1 1 1 KY- NA4 KAN MERKEZİ VE KAN BANKASI LABORATUVAR SORUMLULUĞU- MİKROBİYOLOJİK TESTLERİN UYGULANMASI 1 1 1 KY- NA4 KAN MERKEZİ VE KAN BANKASI LABORATUVAR SORUMLULUĞU- İMMÜN- HEMATOLOJİK TESTLER 1 1 1 KY- NA4 KAN MERKEZİ VE KAN BANKASI LABORATUVAR SORUMLULUĞU- KAN VE KAN BİLEŞENLERİNİN AYIRIMI VE DEPOLANMASI 1 1 1 KY- NA4 BAKTERİ, MANTAR, PARAZİT TANIMLANMASI- MOLEKÜLER YÖNTEMLER 1 1 1 KY- NA4 14