Tulareminin Laboratuvar Tanı Yöntemleri. Dr. Fetiye Kolaylı KOÜ Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD

Benzer belgeler
Laboratuvarda Tularemi Örnekleriyle Çalışma Rehberi

Tularemi: Tanı yöntemleri. Doç.Dr. Aynur Karadenizli Kocaeli Üniversitesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD

TULAREMİ: Epidemiyoloji ve Laboratuvar Tanı

TULAREMİ. Doç.Dr. Aynur KARADENİZLİ. Kocaeli Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

TULAREMİ: Etken ve Epidemiyoloji. Doç.Dr. Aynur Karadenizli Kocaeli Üniversitesi Mikrobiyoloji AD

VİRUS HASTALIKLARINDA TANI YÖNTEMLERİ

MOLEKÜLER TANI VE TİPLENDİRME YÖNTEMLERİ

CLOSTRIDIUM DIFFICILE ENFEKSİYONUNDA GLUTAMAT DEHİDROGENAZ VE TOKSİN A/B TESTLERİNİN TANI DEĞERİ VE MALİYET ETKİNLİĞİ

Başarılı bir kongre ve toplantı olması dileği

Hayvanlarda Klinik Özellikler, Tanı ve Tedavi

TOKSOPLAZMA İNFEKSİYONUNUN LABORATUVAR TANISI UZM.DR.CENGİZ UZUN ALMAN HASTANESİ

İSTANBUL MEDENİYET ÜNİVERSİTESİ TIP FAKÜLTESİ TIBBİ MİKROBİYOLOJİ ANABİLİM DALI MEZUNİYET SONRASI (UZMANLIK) EĞİTİMİ DERS MÜFREDATI

Akreditasyon Sertifikası Eki (Sayfa 1/11) Akreditasyon Kapsamı

Anti-HIV Pozitif Bulunan Hastada Kesin Tanı Algoritması. Doç. Dr. Kenan Midilli İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

Riskli Ünitelerde Yatan Hastalarda Karbapenemaz Üreten Enterobacteriaceae taranması

Kan Kültürlerini Nasıl Değerlendirelim? Rehber Eşliğinde. Dr. Banu Sancak

MİKROBİYOLOJİ LABORATUVARINDA UYULMASI GEREKEN KURALLAR

TÜBERKÜLOZ LABORATUVARI TEST REHBERİ

Brusellozda laboratuvar tanı yöntemleri

TULAREMİ OLGU SORGULAMA FORMU. Dr. Güven ÇELEBİ Zonguldak Karaelmas Üniversitesi Tıp Fakültesi Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji AD

Francisella tularensis

EPSTEIN-BARR VİRUS ENFEKSİYONLARI TANISINDA ELISA VE İMMUNOBLOT TESTLERİNİN KARŞILAŞTIRILMASI

WEİL-FELİX TESTİ NEDİR NASIL YAPILIR? Weil Felix testi Riketsiyozların tanısında kullanılır.

BRUSELLOZDA TANI + Dr. Şua SÜMER Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji AD

Işın Akyar 1,2, Meltem Kaya 2, Onur Karatuna 1,2, Yeşim Beşli 2. Acıbadem Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji AD, İstanbul 2

Moleküler Yöntemlerin Klinik Mikrobiyolojide Kullanımı Ne zaman? Nerede? Ne kadar? Klinik Parazitoloji

NOCARDIA Türlerinin Laboratuvar Tanısı. Uzm. Dr. Ayten Coşkuner İzmir Eğitim ve Araştırma Hastanesi

ORTOPEDİK PROTEZ ENFEKSİYONLARINDA SONİKASYON DENEYİMİ

Komplike deri ve yumuşak doku enfeksiyonu etkeni çoklu dirençli patojenlerin bakteriyofaj duyarlılıklarının araştırılması

Nocardia Enfeksiyonları. Dr. H.Kaya SÜER Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji

IV. KLİMUD Kongresi, Kasım 2017, Antalya

Enfektif Endokardit, Myokardit ve Perikardit Laboratuvar Tanı. Dr. Ali O. KILIC 19 Nisan 2014

FRANCISELLA TULARENSIS İN İNSAN KANLI AGARDA İZOLE EDİLMESİYLE TANIMLANAN BİR OROFARENGEAL TULAREMİ OLGUSU

Ülkemizde Önem Kazanan Zoonotik Hastalıkların Güncel Durumu: «Tularemi»

Francisella tularensis in Hücre. yapısı ve alt türleri

Yrd Doç Dr Gülşah AŞIK Afyon Kocatepe Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

BRUSELLOZUN İNSANLARDA ÖNLENMESİ VE KONTROLÜ

VERİFİKASYON. Dr. Tijen ÖZACAR. Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD - İZMİR

Staphylococcus Gram pozitif koklardır.

BRUSELLA ENFEKSİYONU. Doç. Dr. Mehtap BULUT Bursa Şevket Yılmaz EAH Acil Tıp Kliniği

Mikobakteriyoloji Laboratuvarı Sorular - Sorunlar

TIBBİ MİKROBİYOLOJİ ANABİLİM DALI MEZUNİYET SONRASI (UZMANLIK) EĞİTİMİ DERS MÜFREDATI

MİKROBİYOLOJİ LABORATUVAR SÜRECİ. Dr. Özcan DEVECİ Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

MİKOBAKTERİYOLOJİ LABORATUVARI ÇALIŞILAN TESTLER

TLERDE SEROLOJİK/MOLEK HANGİ İNCELEME?) SAPTANMASI

«Bakteriyoloji Laboratuvarında Yeni

Halis Akalın, Nesrin Kebabcı, Bekir Çelebi, Selçuk Kılıç, Mustafa Vural, Ülkü Tırpan, Sibel Yorulmaz Göktaş, Melda Sınırtaş, Güher Göral

TÜBERKÜLOZ DIŞI MİKOBAKTERİ ENFEKSİYONLARI. Tanı ve Sorunlar. Süheyla SÜRÜCÜOĞLU. Celal Bayar Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD Manisa

Salmonella. XLT Agar'da Salmonella (hidrojen sülfür oluşumuna bağlı olarak siyah) ve Citrobacter (sarı) kolonileri

Aşağıdaki 3 kriterin birlikte olması durumunda derin cerrahi alan enfeksiyonu tanısı konulur.

IV. KLİMUD Kongresi, Kasım 2017, Antalya

B. garinii B. afzelii B. valaisiana B. japonica. B. tanukii. B. sinica B. andersonii B. bissettii

KENE KAYNAKLI ENSEFALİTLERDE LABORATUVAR TANI

VERİFİKASYON (SEROLOJİ, MOLEKÜLER TESTLER)

GASTROENTERİT YAPAN VİRUSLAR VE ENFEKSİYON OLUŞTURMA MEKANİZMALARI

OXA-48 in Saptanmasına Yönelik İzotermal Rekombinaz Polimeraz Amplifikasyon Yöntemine Dayalı Bir Hızlı Moleküler Test Formatının Geliştirilmesi

ERCİYES ÜNİVERSİTESİ DENEYİMİ

Gram boyama Mikrobiyolojinin vazgeçilmezi

1.5 Kalite Kontrol Bölüm Fiziksel Kalite Kriterleri Bölüm Mikrobiyolojik Kalite Kriterleri Mikrobiyal Kontaminasyon

HIV/AIDS ve Diğer Retrovirus İnfeksiyonları,laboratuvar tanısı ve epidemiyolojisi

KLİNİK ÖRNEKLERDE GERÇEK ZAMANLI MULTİPLEKS POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU YÖNTEMİYLE AKUT BAKTERİYEL MENENJİT TANISI

Tularemi Mikroaglütinasyon Testi İçin Tetrazolyum Mavisi ile Boyalı Francisella tularensis Antijeninin Geliştirilmesi

Deneysel Hayvan Modelinde Candida Tropicalis Peritonitinin Tedavisinde Kaspofungin ve Amfoterisin B Etkinliğinin Karşılaştırılması

SINIR DEĞERLER NE ÖNERİLİR? Düzen Laboratuvarlar Grubu

TULAREMİ KORUNMA KONTROL VE

ÖZEL MİKROORGANİZMALARDA DUYARLILIK TESTLERİ VE TÜRKİYE VERİLERİ. Brusella

GRAM POZİTİF BAKTERİ ANTİBİYOGRAMLARI

Emrah Salman, Zeynep Ceren Karahan Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi. Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

T.C. Sağlık Bakanlığı Türkiye Halk Sağlığı Kurumu

BAĞIRSAK PROTOZOONLARINDA İN-VİTRO KÜLTÜR SİSTEMLERİ. Prof.Dr. Sibel Ergüven Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD.

Enzimlerinin Saptanmasında

Bacillus anthracis. Hayvanlarda şarbon etkenidir. Bacillus anthracis. Gram boyama. Bacillus anthracis. Bacillus anthracis

TULAREMİ Yard. Doç. Dr Esma Kepenek Kurt Meram Tıp Fakültesi Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji

Hepatit B Virüs Testleri: Hepatit serolojisi, Hepatit markırları

Yasemin Budama Kılınç1, Rabia Çakır Koç1, Sevim Meşe2, Selim Badur2,3

ETKEN BELİRLEMEDE KLASİK YÖNTEMLER, MOLEKÜLER YÖNTEMLER. Doç. Dr. Gönül ŞENGÖZ 9 Mayıs 2014

Ekinokokkozis. E. granulosus Kistik Ekinokokkozis. E. multilocularis Alveoler Ekinokokkozis. E. vogeli ve E. oligoarthrus Polikistik Ekinokokkozis

KÜÇÜK KOLONİ VARYANTLARI, BİYOFİLM FORMLARI TOLERAN, PERSİSTAN BAKTERİLER VE L-FORMLARI

Marmara Üniversitesi Tıp Fakültesi Faz II Elektif Staj programı. Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

OLGU SUNUMLARI. Dr. A. Nedret KOÇ. Erciyes Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Kayseri

Global Leishmaniasis. Leishmaniasis. Türkiye de leishmaniasis. Leishmaniasis. Leishmaniasis

Örneklerin Alınmas. nması, şınması. Doç.. Dr. Z. Ceren KARAHAN Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

Tularemi. Dr. Esra KAYA KILIÇ Ankara Eğitim ve Araştırma Hastanesi EKMUD Ankara Günleri 08/11/2017

TEMEL SAĞLIK HİZMETLERİ GENEL MÜDÜRLÜĞÜ

TIBBİ MİKROBİYOLOJİ Dr. Teoman Z. APAN /1 Dr. Latife İŞERİ /2 KOD DERS ADI ÖÜ T P KREDİ AKTS

SÜRÜNTÜ ÖRNEKLERİNE YAKLAŞIM

Ertuğrul GÜÇLÜ, Gülsüm Kaya, Aziz Öğütlü, Oğuz Karabay. Sakarya Üniversitesi Tıp Fakültesi Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji AD.

MARMARA ÜNİVERSİTESİ SAĞLIK HİZMETLERİ MESLEK YÜKSEKOKULU

Muhammet TEKİN Bulaşıcı Hastalıklar Çevre ve Çalışan Sağlığı Şube Müdürü

ÜST SOLUNUM YOLU ÖRNEKLERİNE LABORATUVAR YAKLAŞIMI. Doç. Dr. Aynur EREN TOPKAYA Maltepe Üniversitesi Tıp Fakültesi

Prostetik Materyal ile İlişkili İnfeksiyonların Tanısı

Değerli Katılımcılar, 3. Zoonotik Hastalıklar Sempozyumuna hoş geldiniz.

DOMUZ PLEUROPNEUMONİSİ. Dr. Kemal METİNER

Tularemi: BİYOGÜVENLİK

OTO-ANTİKORLARIN TANISINDA YENİ YÖNTEMLER

Bornova Vet.Kont.Arst.Enst.

TIBBİ MİKROBİYOLOJİ ANABİLİM DALI MEZUNİYET SONRASI (UZMANLIK) EĞİTİMİ DERS MÜFREDATI

Olgularla Klinik Bakteriyoloji: Antibiyotik Duyarlılık Testleri Yorumları. Dilara Öğünç Gülçin Bayramoğlu Onur Karatuna

Karbapenem dirençli Klebsiella pneumoniae suşlarında OXA-48 direnç geninin araştırılması

ANTİGLOBULİN TESTLER. Dr. Güçhan ALANOĞLU

Transkript:

Tulareminin Laboratuvar Tanı Yöntemleri Dr. Fetiye Kolaylı KOÜ Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD

F. tularensis in tanımlanmasında Direk mikroskopik inceleme Seroloji Bakterinin izolasyonu Moleküler yöntemler kullanılır

Gram boyama Gram boyası ile boyanıp direk mikroskopik inceleme tahmini tanı için hızlı bir yöntemdir İnce, pleomorfik, zayıf boyanan, çoğunlukla tek tek görünen, gram negatif bakteri Tanı değeri çok düşüktür

Seroloji Serolojik testler tularemi tanısında 50 yıldan beri sürekli ve en sık kullanılan metotlardır Antikor/antijen aranabilir

Antikor aranması Antikor yanıtı, enfeksiyonun başlangıcından iki hafta sonra oluşmakta (%89-95.4) Antikorlar 10 yıldan uzun bir süre kalabilirler ve IgA,IgM ve IgG tipi antikorlar belirlenebilir Antijen olarak ; FopA, LPS, dış membran karbohidrat-protein fraksiyonu veya inaktive edilmiş tam hücre kullanılır

Aglütinasyon yöntemleri Tüp aglütinasyon veya mikroaglütinasyon yöntemi kullanılabilir Mikroaglütinasyon testi en sık kullanılan yöntemdir. Antijen hazır olarak temin edilebildiği gibi ülkelerin kendi şuşlarından hazırladıkları antijenler de kullanılabilir

Hastalığı tanımlama kriteri Tek testte 1:160 serum titresi veya Akut ve konvelesan dönemde alınan örneklerde serum titresinin dört kat artışı Mikroaglütünasyon testinde 1:128 titre de pozitif olarak kabul edilebilmektedir Seroprevalans çalışmalarında 1:20 titre pozitif olarak kabul edilebilmektedir

ELISA Aglütinasyon testlerine göre duyarlılığı ve özgüllüğü daha yüksektir. Özellikle epidemiyolojik çalışmalarda ELISA testinin Western blot ile kombine edilmesi önerilmektedir Antijen olarak, LPS özütü kullanılır

Serolojik testlerin avantajı; Uygulamasının kolay olması Semptomların başlangıcından sonra yalancı negatifliğin nadir olması

Dezavantajları; Enfeksiyonun erken fazında yalancı negatif sonuç verebilir Nadir de olsa çapraz-reaksiyon nedeniyle yalancı pozitiflik verebilir Özellikle Brucella spp. Ayrıca daha önce geçirilmiş tularemi enfeksiyonuna bağlı olarak yalancı pozitif sonuçlar olabilir

Antijen aranması Klinik örneklerde bakterinin direk tanısında veya üremiş kültürlerde bakterinin teyid edilmesinde kullanılır İnaktive edilmiş tam hücre antijenlerine karşı oluşmuş ve FITC-işaretlenmiş tavşan antikorları kullanılır Lam aglütinasyonu da izolatların teyidi için hızlı bir teknik

Antijen yakalayan ELISA (celisa) ile antijen aranabilir Formalinle fikse edilmiş dokularda da İmmunhistokimyasal yöntemle antijen aranabilir

Serolojik yöntemler F.tularensis in her iki alt türünü (tip A ve tip B) saptayabilir

Bakterinin izolasyonu Bakterinin kültürü altın standarttır Enfeksiyonun kesin tanısının konulmasını sağlar Antibiyotik duyarlılığının belirlenmesi için Moleküler epidemiyolojinin kaynağını oluşturur Yeni türlerin/alt türlerin keşfini sağlaması

Sıvı besiyerlerinde üretme Katı besiyerlerinde üretme Achantomoeba kültürü Fareye inokülasyon

F.tularensis fakültatif intraselüler Zorunlu aerobik bakteri 35-37 C de 2-5 günlük inkübasyon sonrası koloni oluştururlar. Artmış CO 2 konsantrasyonu bakterinin üremesini stimüle eder.

F. tularensis alttür tularensis, holarctica, mediasiatica için sülfidril bileşiklerine ihtiyaç duyar F.tularensis subsp. novicida ve F. philomiragia daha kolay üreyen bakteriler olup koyun kanlı agar gibi genel üretim besiyerlerinde üretilebilirler.

F.tularensis primer ülserlerden lenf nodu aspiratları ve biyopsilerinden balgam kemik iliği ve karaciğer, dalak gibi doku biyopsilerinden üretilmesi mümkündür.

Örnekler işlenene kadar 4-8 C de saklanabilir Transport için aktif kömürlü Amies taşıma besiyeri önerilmekte -80 C de dondurularak transfer bakterinin kültürde üretilme şansını artırmakta

F.tularensis in Sıvı Besiyerlerinde Üretilmesi F. tularensis üretilmesinde sıvı besiyerleri optimum üreme ortamları olarak kullanılmaz. Sıvı besiyeri olarak Brain heart infusion (BHI) Tripticase soy broth (TSB) Tiyoglukolat sıvı besiyerleri kullanılabilir. Sistein gibi sülfat bakımından zengin kaynakların ilave edilmesi gerekmektedir.

Katı besiyerlerinde üretilmesi Geleneksel olarak sistein-glukoz kanlı agar (Francis besiyeri) kullanılır %9 ısıtılmış koyun kanı ilaveli cystein heart agar (CHAB) Sistein ilaveli zenginleştirilmiş çukulatamsı agar (ÇA), Buffered charcoal yeast extract (BCYE) %1 hemoglobin, %1 İsoVitaleX ilaveli GC agar base II Thioglycollate- glucose blood agar (TGBA) gibi besi yerleri de izolasyon için kullanılmaktadır

CHAB en sık kullanılan besiyerlerinden biridir. Floralı bölgeden alınan örneklerin antibiyotikli CHAB (CHAB-A) besiyerine ekilmesi önerilmektedir 7,5 µg/ml kolitsin, 2.5 µg/ml amfoterisin, 0.5 µg/ml linkomisin, 4.0 µg/ml trimetoprim, 10 µg/ml ampisilin

Fare inokülasyonu Kontamine örneklerden /kontamine kültürlerden bakterinin izolasyonunda ve saflaştırılmasında kullanılan metotlardan biridir Örnekler serum fizyolojik içinde sulandırılarak fareye karnın alt bölgesinden subkutan enjekte edilir

Fareler 2-3 günden sonra hastalanırlar Ölmeden hemen önce kurban edilerek Karaciğer Dalak gibi dokuları çıkarılarak besi yerlerine ekilir

Achantamoeba kültürü Achantamoeba castellani serbest yaşayan bir amip F. tularensis amip içersinde üreyebilmekte Hadi Abd, APPL ENV MICROBIOL, Jan. 2003, p. 600 606

Moleküler Yöntemler F. tularensis in belirlenmesinde çeşitli PZR yöntemleri geliştirilmiştir. Klasik PZR RT-PZR Bakterinin tanımlanmasında tul4, fopa, 23kDa gen, ISFtu2 hedef genleri seçilmiştir.

Özellikle RT TaqMan-PZR yöntemi ile Klinik örneklerden (boğaz sürüntüsü, ülseratif lezyonlar, pü, lenf nodu aspiratları gibi) Çevresel örneklerden (su, çamur,kene gibi) bakteriyi belirlemek mümkün olmaktadır

Diğer metotlar İmmunkromotografik metod F.tularensis LVS nun LPS e spesifik oluşturulan MAb lar nitroselüloz membrana aktarılmakta. Üzerine 200mikrolitre antijen ilave edilmekte Üzerine anti-f.tularansis tavşan serumu ilave edilmekte 10 6-7 bakteri/ml belirleyebilmekte

Son çalışmalar ise ; Ülseroglandular tularemili hastalarda Affymetrix microarray ile 14,500 gen araştırılmış Tulareminin erken fazında yedi genin belirleyici özelliğinin olduğu tanımlanmış Fakat bu konuda çok daha fazla çalışmanın yapılması gerektiği bildirilmekte