BİYOKİMYA DOÇ. DR. MEHMET KARACA (9. BÖLÜM)

Benzer belgeler
ÜNİTE 6 Nükleoproteinler ve Nükleik Asitler

Yağ Asitlerinin β Oksidayonu. Prof. Dr. Fidancı

12. SINIF KONU ANLATIMI 2 DNA VE RNA

Genetik Bilgi: DNA Yapısı, Fonksiyonu ve Replikasyonu. Dr. Mahmut Çerkez Ergören

LİPİTLERİN ORGANİZMADAKİ GÖREVLERİ SAFRA ASİTLERİ

Akıllı Defter. 9.Sınıf Biyoloji. vitaminler,hormonlar,nükleik asitler. sembole tıklayınca etkinlik açılır. sembole tıklayınca ppt sunumu açılır

Yağ Asitlerinin Metabolizması- I Yağ Asitlerinin Yıkılması (Oksidasyonu)

BİYOLOJİ DERS NOTLARI YGS-LGS YÖNETİCİ MOLEKÜLLER

BİY 315 Lipid Metabolizması-II. Yrd. Doç. Dr. Ebru SAATÇİ Güz Yarı Dönemi

Prof.Dr. Yeşim ÖZKAN G.Ü. Eczacılık Fakültesi Biyokimya Anabilim Dalı


III-Hayatın Oluşturan Kimyasal Birimler

DOYMAMIŞ YAĞ ASİTLERİNİN OLUŞMASI TRİGLİSERİTLERİN SENTEZİ

Hücre zarının yapısındaki yağlardan eriyerek hücre zarından geçerler.fazlalıkları karaciğerde depo edilir.

BAKTERİLERİN GENETİK KARAKTERLERİ

MOLEKÜLER BİYOLOJİ DOÇ. DR. MEHMET KARACA (5. BÖLÜM)

15- RADYASYONUN NÜKLEİK ASİTLER VE PROTEİNLERE ETKİLERİ

İstanbul Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji ABD Prof. Dr. Filiz Aydın

11. Hafta: Prof. Dr. Şule PEKYARDIMCI NÜKLEOTİDLER

M. (arpa şekeri) +su S (çay şekeri) + su L.. (süt şekeri)+ su

Yağ Asitlerinin Biyosentezi. Prof. Dr. Fidancı

Referans:e-TUS İpucu Serisi Biyokimya Ders Notları Sayfa:368

YAĞ ASİTLERİNİN OKSİDASYONU

TEST 1. Hücre Solunumu. 4. Aşağıda verilen moleküllerden hangisi oksijenli solunumda substrat olarak kullanılamaz? A) Glikoz B) Mineral C) Yağ asidi

DNA ve RNA NIN YAPISI. Yrd.Doç.Dr. Özlem KURT ŞİRİN

YAĞLAR (LİPİTLER) Yağların görevleri:

YAZILIYA HAZIRLIK SORULARI. 12. Sınıf 1 GENDEN PROTEİNE

OKSİJENLİ SOLUNUM

YAZILIYA HAZIRLIK SORULARI. 9. Sınıf

BİY 315 BİYOKİMYA GİRİŞ. Yrd. Doç. Dr. Ebru SAATÇİ Güz Yarı Dönemi

Nükleik Asitlerin İşlevi

Hücrelerde gerçekleşen yapım, yıkım ve dönüşüm olaylarının bütününe metabolizma denir.

ayxmaz/biyoloji Adı: 1.Aşağıda verilen atomların bağ yapma sayılarını (H) ekleyerek gösterin. C N O H

Hücre Solunumu: Kimyasal Enerji Eldesi

Nükleoproteinlerin Yapısı. Yrd.Doç.Dr. Özlem KURT ŞİRİN

Solunumda organik bileşikler karbondioksite yükseltgenir ve absorbe edilen oksijen ise suya indirgenir.

Metabolizma. Metabolizmaya giriş. Metabolizmaya giriş. Metabolizmayı tanımlayacak olursak

A. DNA NIN KEŞFİ VE ÖNEMİ

BĠYOKĠMYA DOÇ. DR. MEHMET KARACA

NÜKLEİK ASİTLER ( DNA VE RNA)(Yönetici Moleküller)

YAZILIYA HAZIRLIK SORULARI. 9. Sınıf 2 KARBONHİDRAT LİPİT (YAĞ)

2. Histon olmayan kromozomal proteinler

TRANSLASYON ve PROTEİNLER

MAKROMOLEKÜLLERİN YAPI VE İŞLEVLERİ

3.1. Karbonhidratların Tanımı 3.2. Karbonhidratların Sınıflandırılması 3.3. Monosakkaritler ve Monosakkarit Türevleri Monosakkaritler

Biyoloji Canlıların Temel Bileşenleri, Organik Bileşikler

PÜRİN VE PİRİMİDİN METABOLİZMASI

Solunum. Solunum ve odunsu bitkilerin büyümesi arasında yüksek bir korelasyon bulunmaktadır (Kozlowski ve Pallardy, 1997).

I. Koenzim A nedir? II. Tarihsel Bakış III. Koenzim A nın yapısı IV. Asetil-CoA nedir? V. Koenzim A nın katıldığı reaksiyonlar VI.

Canlılarda Enerjitik Olaylar, Fotosentez ve Kemosentez, Aerobik Solunum ve Fermantasyon

2. Kanun- Enerji dönüşümü sırasında bir miktar kullanılabilir kullanılamayan enerji ısı olarak kaybolur.

METABOLİZMA. Prof. Dr. Arif ALTINTAŞ

Prof. Dr. Ulvi Reha FİDANCI

NÜKLEOTİT METABOLİZMASI

NUKLEOPROTEİNLER VE NUKLEİK ASİDLERİN YAPISI. Prof. Dr. Nuriye AKEV

Sınıf ; Çalışma yaprağı 3

Kloroform, eter ve benzen gibi organik çözücülerde çözünen bunun yanı sıra suda çözünmeyen veya çok az çözünen organik molekül grubudur.

Organik Bileşikler. Karbonhidratlar. Organik Bileşikler YGS Biyoloji 1

Biyoloji Canlılarda Solunum Enerjinin Açığa Çıkışı

6. glikolizde enerji kazanım hesaplamalarında; Substrat düzeyinde -ATP üretimi yaklaşık yüzde kaç hesaplanır? a. % 0 b. % 2 c. % 10 d. % 38 e.

RNA DNA. Nükleosit Baz + Şeker Riboz (RNA) Deoksiriboz (DNA) Ribonükleozitler : Adenozin, Pürinler: Pirimidinler: AveGdışında

LYS ANAHTAR SORULAR #4. Nükleik Asitler ve Protein Sentezi

Doğadaki Enerji Akışı

Chapter 10 Lecture. Genetik Kavramlar Concepts of Genetics Tenth Edition. 1. DNA Yapısı. Çeviri: Aslı Sade Memişoğlu

İal-biyoloji METABOLİZMA/SOLUNUM. 1.Metabolizma ölçümünde dikkate edilecek koşullar nelerdir?

TRANSLASYON VE DÜZENLENMESİ

Sitrik Asit Döngüsü. (Trikarboksilik Asit Döngüsü, Krebs Döngüsü)

RNA Yapısı ve Katlanması, Hücrede Bulunan RNA Çeşitleri

ENERJİ KAYNAKLARI- ENERJİ SİSTEMLERİ DOÇ.DR.MİTAT KOZ

Adı ve Soyadı : Sınıfı ve Numarası : 1- DNA molekülünün görevlerini yazınız? * * 2- ATP molekülünün görevini açıklayınız?

Karbohidratlar. Karbohidratların sınıflandırılması. Monosakkaritler

Canlının yapısında bulunan organik molekül grupları; o Karbonhidratlar o Yağlar o Proteinler o Enzimler o Vitaminler o Nükleik asitler ve o ATP

Beslenmeden hemen sonra, artan kan glikoz seviyesi ile birlikte insülin hormon seviyesi de artar. Buna zıt olarak glukagon hormon düzeyi azalır.

KAFKAS ÜNİVERSİTESİ TIP FAKÜLTESİ DÖNEM I DERS YILI 4. KOMİTE: HÜCRE BİLİMLERİ DERS KURULU IV

METABOLİZMA REAKSİYONLARI. Hazırlayanlar Prof. Dr. Ayşe CAN Prof.Dr. Nuriye AKEV

BİYOKİMYADA METABOLİK YOLLAR DERSİ VİZE SINAV SORULARI ( ) (Toplam 4 sayfa olup 25 soru içerir) (DERSİN KODU: 217)

Chapter 10 Lecture. Konu 10 Genetik Kavramlar Concepts of Genetics Tenth Edition. DNA Yapısı ve Analizi

DÖNEM II DERS YILI SİNDİRİM VE METABOLİZMA DERS KURULU ( 24 ARALIK MART 2019)

ÜNİTE 7:HÜCRESEL SOLUNUM

Yağ ihtiyacı nereden karşılanır?

BİY 315 Nükleik asitlerin Metabolizması. Yrd. Doç. Dr. Ebru SAATÇİ Güz Yarı Dönemi

HÜCRE SOLUNUMU ve FERMENTASYON

Keton Cisimleri. Prof. Dr. Fidancı

Sunum ve Sistematik 1. ÜNİTE: CANLILARDA ENERJİ DÖNÜŞÜMÜ KONU ÖZETİ

Biochemistry Chapter 4: Biomolecules. Hikmet Geçkil, Professor Department of Molecular Biology and Genetics Inonu University

ÜNİTE 7 : HÜCRESEL SOLUNUM

6. glikolizde enerji kazanım hesaplamalarında; Substrat düzeyinde -ATP üretimi yaklaşık yüzde kaç hesaplanır? a. % 0 b. % 2 c. % 10 d. % 38 e.

NÜKLEİK ASİTLER İsmail Temel

Kolesterol Metabolizması. Prof. Dr. Fidancı

BİYOKİMYA II EK NOT. Ortak biyokimyasal tepkimeler

METABOL ZMA. Metabolizmanın amacı nedir?

Lipidler. Yrd. Doç. Dr. Ahmet GENÇ Adıyaman Üniversitesi Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu

Nükleik Asitler. DNA ve RNA nükleik asitleri oluşturur

PROF. DR. SERKAN YILMAZ

13 HÜCRESEL SOLUNUM LAKTİK ASİT FERMANTASYONU

Biyokimya. Biyokimyanın tanımı ve önemi Organizmanın elementer yapısı Canlılık Su Kovalent olmayan bağlar (intermoleküler etkileşimler)

MİTOKONDRİ Doç. Dr. Mehmet GÜVEN

BİYOKİMYA ANABİLİM DALI LİSANSÜSTÜ DERS PROGRAMI

NÜKLEİK ASİTLER ÜN TE 3

DÖNEM II DERS YILI SİNDİRİM VE METABOLİZMA DERS KURULU ( 25 ARALIK 02 MART 2018)

Transkript:

BİYOKİMYA DOÇ. DR. MEHMET KARACA (9. BÖLÜM)

YAĞ ASİTLERİ REKASİYONLARI (SAPONİFİKASYON) Tuz Reaksiyonları (Sabunlaşma): Yağ asiti (R-COOH) + NaOH => R-COO-Na Sodyum veya Potasyum tuzları ile sabunlar, traş kremi vb üretimi. Yeşil sabunda keten yağı, sodyum ve potasyum karışımlarından elde edilir.

YAĞ ASİTLERİ REKASİYONLARI (ESTERLEŞME) BİR KARBOKSİLİK ASİT BİR ALKOL BİR ESTER SU

YAĞ ASİTLERİ REKASİYONLARI (LİPİT PEROKSİDASYONU) Yağların yükseltgenmesi sonucu bozulmasıdır. Yağların genel bozulma biçimi, bileşimlerindeki doymamış moleküllerin oksijenle yükseltgenmesidir. Lipit peroksidasyonu sonucu aldehit, keton, hidroksi asitler, keto asitler, alkoller ve daha küçük moleküllü yağ asitleri meydana gelir. Organizma lipitlerinin peroksidasyon ile yapıları bozulur ve yaşamlarını yitirebilir.

YAĞ ASİTLERİ REKASİYONLARI (HİDROGENASYONU) Yağların hidrogenasyonu ile doymuş yağlar üretilerek yağların uzun raf ömürleri uzatılmaktadır. Hidrogenasyon sonucu trans-yağlar oluşmaktadır.

YAĞLARIN BOZULMASI a) Hidroliz: Serbest yağ asitleri ile gliserol oluşması sonucu gıda maddesinde sabunumsu bir yapı, tat ve koku oluşumu. b) Ransidite (rancidity/acıma): Doymamış yağ asitlerinin otooksidasyonu sonucu acı tat oluşumu. c) Tat değişimi (Deversion): Özellikle bitkisel yağlar, balık yağları ve diğer yüksek derecede doymamış yağ içeren gıdalarda linoleik asitlerin oksidasyonu ile oluşan tat değişikliği. d) Polimerizasyon: Doymamış yağlarda iki karbon atomu arasındaki zincirin kopması, iki karbon arasında karşı bağ oluşması veya oksijen bağları oluşması sonucu meydana gelen tat değişikliğidir.

LİPOGENEZ & LİPOLİZ (LİPİT SENTEZİ & YIKIMI (YAKIMI)) LİPOGENEZ YAĞ ASİTLERİ VE GLİSEROLDEN LİPİTLERİN SENTEZİDİR. LİPOGENEZ 3 ANA KISIMDA GERÇEKLEŞİR 1. GLİSEROLUN SENTEZİ 2. YAĞ ASİTLERİNİN SENTEZİ 3. TRİASİLGLİSEROLÜN SENTEZİ

GLİSEROL GLİSEROLUN BİYOSENTEZİ GLİKOLİZ DİHİDROKSİ ASETON FOSFAT GLİSEROL 3 FOSFAT DEHİDROGENAZ GLİSEROL KİNAZ GLİSEROL 3 FOSFAT

YAĞ ASİTLERİ BİYOSENTEZİ Yağ asitleri besinlerle alındığı gibi, organizmada sentez de edilir. Yağ asitlerinin sentezi insanda özellikle karaciğer ve yağ dokusu hücrelerinde sitozolde, bitkilerde ise sitozolde ve kloroplasta gerçekleşir. Bu sentez şekillerinden biri yağ asitlerinin hücrede yeniden yapılmasıdır. Buna "De Novo" sentezi de denir ve oldukça karmaşık reaksiyonlar zincirinden oluşur. İkinci biosentez yolu ise hücre içinde mevcut olan yağ asitlerinin, 2C atomlu birimlerin ilavesiyle 16 karbon uzunluğunda yağ asitlerine dönüştürülmesidir.

YAĞ ASİTLERİ BİYOSENTEZİ Yağ asidinin yıkımı, yağ asidi sentezinin tersi değildir. SENTEZİ (LİPOGENEZ) SİTOZOL/KLOROPLAST NADPH KULLANILIR ASİL TAŞIYICI PROTEİN (ACP) ÖNEMLİDİR CO2 KULLANILIR (AKTİVASYON) ASETİL KOENZİM A KULLANILIR BETA OKSİDASYON (LİPOLİZ) MİTOKONDRİ/PEROKSİZOM/ OLEOZOM NADH & FADH 2 ÜRETİLİR ACP GEREKMEZ KULLANILMAZ ASETİL KOA ÜRETİLİR

YAĞ ASİTLERİ BİYOSENTEZİ YAĞ ASİTİ SENTEZİNDE: 1-AKTİVASYON, 2-İNİSASYON, 3-ELONGASYON ve 4-TERMİNASYON AKTİVASYON: Sitoplazmada de novo yağ asidi biyosentezinin ilk basamağı, ASETİL KOA MOLEKÜLÜNE BİR CO2 ASETİL KOA KARBOKSİLAZ ENZİMİ ARACILIĞI İLE KATILMASI MALONİL KOA YI OLUŞTURMASINA AKTİVASYON DENİLİR.

YAĞ ASİTİ BİYOSENTEZİ

HOR ALL DOÇ. DR. MEHMET KARACA Y.A. BİYOSENTEZİN REGÜLASYONU (ASETİL KoA KARBOKSİLAZ) Asetil KoA Karboksilaz Asetil KoA Malonil KoA SİTRAT MALONİL KoA PALMİTOL KoA İNSULİN EPİNEFRİN GLİKOGON KISA DÖNEM DÜŞÜK KALORİLİ DİET VE AÇLIK YÜKSEK KALORİLİ DİET UZUN DÖNEM

TRİASİLGLİSERİT BİYOSENTEZİ Gerek hayvansal yağlar gerekse bitkisel yağlar, yağ asitlerinin gliserin (gliserol) ile oluşturdukları oldukça kompleks esterlerdir. Trigliseridler vücutta, gliserol-3- fosfat ve yağ asil-koa prekürsörlerinden sentezlenirler Karbohidrat ve proteinlerin fazla miktarda alınması durumunda glikoz ve amino asitlerden trigliserit oluşur ki bu olay LİPONEOGENEZ olarak tanımlanır. Hayvanlarda trigliserid sentezi, hormonlar vasıtasıyla düzenlenir. İnsülin, glikozun trigliseride dönüşümünü uyarır.

TRİASİLGLİSEROL SENTEZİ

LİPİT KATABOLİZMASI (LİPOLİZ) Hayvanlarda: 1. Adipoz dokularındaki triasilgliserol (TAG) yağ asitleri ve glisorele parçalanır. 2. Yağ asitleri kanla kullanılacak olan dokulara taşınır. 3. Yağ asitleri Yağ-asil-Koenzim A ile esterleşerek sitoplazmada aktifleştirilir. 4. Mitokondriye taşınır ve burada asetil-koa ya yıkılır. Bu yıkım beta-oksidasyon olarak adlandırılır. Bitkilerde ise oleozomlardan (lipozomlar) peroksizomlara yağ asitleri şeklinde mobilize edilir ve yıkım burada devam eder. Trigliseridlerin hidrolizi lipoliz olarak tanımlanır. İnsanda lipoliz, hormona duyarlı triasilgliserol lipaz tarafından katalizlenir ve düzenlenir. Lipoliz sonucu yağ asitleri asetil KoA dönüştürülür.

TRİASİLGLİSEROLÜN LİPOLİZİ DOÇ. DR. MEHMET KARACA ADİPOZ DOKULARI, OLEOZOMLARDA DEPOLANAN TAG

BETA OKSİDASYON 1- Aktivasyon, 2- Sitozolden mitokondriye (bitkilerde peroksizoma) transferi, 3- Beta oksidasyon ile asetil koenzim a ya dönüştürlmesi. Aktivasyon: Asil-KoA Sentetaz (ER ve Mitokondri Dış Membranında) yağ asitinin aktivasyonunu başlatır (Sitozol). Taşıma: Karnitin taşıma sistemi ile Yağ Asiti-KoA- Karnitin mitokondride matrikse alınır. Karnitin tekrar uzaklaştırılarak Yağ-Asil-KoA matrikse alınır.

HAYVAN VE BİTKİLERDE LİPOLİZ DOÇ. DR. MEHMET KARACA Yağ asitlerinin oksidasyonu hayvanlarda mitokondrilerde ve bitkilerde peroksizomlarda da gerçekleşir. Peroksizomlarda 20-26 karbonlu veya dallı zincirli veya hidroksillenmiş yapıya sahip yağ asitleri okside edilir. Yağ asil-koa ların peroksizoma girmeleri için karnitine gerek yoktur. Yağ asitleri tümüyle asetil-koa ya yıkılmaz; zincir kısalması olur. İşlem sırasında yüksek enerjili bağlar elde edilmez. Enzimler farklıdır. Yağ asitlerinin ayrıca ve oksidasyon denen oksidasyon yolları da vardır.

- Oksidasyon Beta Oksidasyon patikası bir döngüdür. Doymuş ve çift sayılı karbonlu yağ asitlerinden her bir döngüde 2 karbon uzaklaştırılarak döngü devam ettirilir. Döngüden çıkan ürün Asetil KoA dır. Bu döngüde ürün Asetil KoA, iki karbon kısaltılmış yağ asiti, FADH 2, ve NADH dir. Üretilen Asetil KoA Krebs döngüsüne veya diğer işlemlere alınır. Beta-oksidasyon patikasında önemli miktarda suda üretilir. Örneğin palmitik asitin beta oksidasyonu sonucu 130 molekül su üretilmektedir.

BETA OKSİDASYON

LİPOLİZ Tek sayılı ve Doymamış yağ asitlerinin oksidasyonunda farklı enzimlere ihtiyaç duyulur. Bitkilerde ve mikroorganizmalrda yaygındır. Tek sayılı karbonlu yağ asitlerinde son ürün asetil KoA yerine Propionil KoA dır. Üç enzim yardımı ile Propionil KoA Krebs Döngüsüne Süksinil KoA olarak alınır. Yağ asitlerinin oksidasyonunda yağ asiti molekülünün karboksil ucundan her seferinde 1 karbon ayrılır. Koenzim A SH ve yüksek enerjili fosfatlar oluşmaz. Her seferinde 1 NADH elde edilir ve 1 karbon eksik yağ asidi oluşur.

oksidasyon ile oluşan Asetil-KoA lar 1) Başka yağ asitlerinin sentezinde kullanılır, 2) Keton cisimlerinin yapımında kullanılır, 3) Kolesterol sentezinde kullanılır, 4) Steroitlerin ön maddesi olarak kullanılır, 5) N-asetilglikozamin gibi maddelerin oluşumu için bazı maddelerin asetillendirilmesinde kullanılır, 6) Sitrik asit döngüsünde yıkılarak organizmaya gerekli olan enerjinin sağlanmasında kullanılır.

YAĞ ASİTLERİNDEN ENERJİ ÜRETİM (β OKSİDASYON + OKSİDATİF FOSFORİLASYON 1 döngü KREBS reaksiyonlarında Asetil Ko A dan 12 ATP, FADH 2 den 2 ATP, NADH den 3 ATP elde edilir. Beta-oksidasyon döngü sayısı: Çift sayılı karbonlularda : [(#C/2)-1] Tek sayılı karbonlarda : [(#C-1/2)-1] Asetil Koenzim A sayısı: Çift sayılı karbonlardaki dönü sayısının bir fazlası, Tek sayılı karbonlarda döngü sayısına eşit olarak düşünülür. Çift sayılı karbonlularda aktivasyon için bir, tek sayılı karbonlularda ise aktivasyon için 2 ATP kullanılır. Ayrıca tek sayılı karbonlarda asetil koenzim A sayısı kadar süksinat elde edilir. Her bir süksinattan 1 ATP olarak hesaplanır.

ÇİFT SAYILI KARBON İÇERENLERDEN (β OKSİDASYON + OKSİDATİF FOSFORİLASYON 16 Karbon uzunluğuna sahip bir bitki yağ asiti (palmetik asit) Döngü sayısı: 16/2-1= 7, 7x5= 35 ATP (NADH ve FADH2) Beta oksidasyondan Asetil Koenzim A sayısı : 7+1: 8, Krebs Döngüsünden 8x12: 96 Enerji Blançosu: (96+35)-1 (aktivasyon için): 130 ATP (yaklaşık)

TEK SAYILI KARBON İÇERENLERDEN (OMEGA OKSİDASYON + OKSİDATİF FOSFORİLASYON 15C uzunluğunda denizanasında bulunan bir yağ asiti (PENTADEKONİK ASİT) Döngü sayısı: 15-1= 14, 14/2-1= 6, 6x5= 30 ATP, alfa oksidasyon 6x12= 72 Süksinat 6x1=6 ATP Enerji Blançosu: (30+72+6)-2, 108-2: 106

O Stearik asit CH 2 O C (CH 2 ) 16 CH 3 O Oleik asit CH CH 2 O O C O C (CH 2 ) 7 CH CH(CH 2 ) 7 CH 3 (CH 2 ) 12 CH 3 Mistirik asit

Keton Cisimleri Yağ asitlerinin parçalanması ile oluşan Asetil Ko-A'ların büyük kısmı TCA siklusuna bir kısmı da ASETOASETİK ASİT, 3- HİDROKSİ BÜTİRİK ASİT ve ASETON'a dönüştürür. Bu üç maddeye "keton cisimleri" denir. Dokuların keton cisimleri sentezlemesine "ketogenez denir. Metabolizmada normal şartlarda ketoliz ve ketogenez denge halindedir. Karaciğer, gereğinden daha fazla keton cisimleri yaparsa kanda keton cisimleri artar. Bu duruma "ketonemia denir. Uzun süreli açlık halinde ve şeker hastalığında özellikle aseton olmak üzere keton cisimleri idrara geçer. Bu duruma "ketonuria" denir.

NÜKLEİK ASİTLER

NÜKLEOTİTLER/NÜKLEOSİTLER ATP : HÜCRENİN ENERJİ BİRİMİ UDP-GLİKOZ: GLİKOJEN BİYOSENTEZİ KOENZİM A, NAD+, NADP+, FAD YAPI TAŞI camp ve cgmp: HÜCRESEL SİNYAL BİTKİ HORMONLARI: SİTOKİNİN RNA: YAPI TAŞI DNA: YAPI TAŞI DNA/RNA KALITIM MATERYALI: PROTEİNLERİN, LİPİTLERİN, POLİSAKKARİTLERİN VE NÜKLEOTİTLERİN BİYOSENTEZİNİ DÜZENLER

NÜKLEOTİT VE NÜKLEOSİDLER PÜRİN VEYA PİRİMİDİN BAZI İLE RİBOZ VEYA DEOKSİ RİBOZDAN MEYDANA GELEN ÜNİTEYE "NÜKLEOSİT" DENİR. NÜKLEOSİTİN ŞEKER ÜNİTESİNİN FOSFORİK ASİTLE BİRLEŞMESİ SONUCU MEYDANA GELEN ÜÇLÜ YAPI "NÜKLEOTİT" ADINI ALIR.

DNA VE RNA YAPI TAŞLARI (MONOMERLERİ) DOÇ. DR. MEHMET KARACA

NÜKLEOTİT VE NÜKLEOSİDLER Nükleositler ve nükleotitler isimlerini yapılarında bulunan pürin veya pirimidin azotlu bazlarından alırlar. Yapısında adedin bulunan nükleosite adenozin, guanin bulunana guanozin, sitozin bulunan nükleoside sitidin, urasil bulunana uridin, timin bulunana timidin denir. Yapısında adedin bulunan nükleotide, adenin nükleotit veya adenilik asit, guanilik asit, sitozin bulunana sitidilik asit, urasil bulunana uridilik asit, timidin bulunana timidilik asit denir.

DNA VE RNA DA YAYGIN BULUNAN NÜKLEOTİTLER DNA RNA

NÜKLEOTİTLERDE GERÇEKLEŞEN BAZI REAKSİYONLAR TAUTOMERİZASYON: serbest pirimidin ve pürin bazları ve polimer yapıdaki bazlar ph ya bağlı olarak fonksiyonel gruplarında bulunan hidrojen atomunun aynı baz üzerinde yer değiştirmesi ile hidrojen atomunun ve çift bağların yer değiştirmesidir. DEAMİNASYON: AMİNO GRUBU bir KETO GRUBUNA dönüştürülür. Bu durumda örnek TRANSİSYON olup Pürin-Pürin, Primidin-Primidin dönüşümleridir. TRANSVERSİYON ise Pürin-Primidin dönüşümüdür.

DEAMİNASYON REAKSİYONLARI H: hipoksiksantin, X: ksantin, 5-me C: 5-metil sitozin bazlarının kısaltamalarıdır.

DEPÜRİNASYON (APÜRİNASYON) Pürin bazlarını deoksiriboza bağlayan GLİKOZİDİK BAĞLAR KOPAR. Bu kopma çift sarmallı DNA iskeletinin zincirinin kırılmasına neden olur. Depürinasyon reaksiyonları İYONLAŞTIRICI RADYASYON, SERBEST RADİKALLER ve ALKALİLEŞTİRİCİ ajanlar tarafında oluşturulur. Eğer tamir edilmez ise mutasyona veya kansere neden olur.

PRİMİDİN DİMERLER Timin veya sitozin bazları arasında fotokimyasal reaksiyonlarla ortaya çıkmaktadır. Ultraviyole ışınlar bunların en önemli nedenleridir. Bu reaksiyonlarda genellikle T-T arasında gerçekleşir ve T-T arasında saiklo-bütil (cyclobutyl) halkası oluşur.

DNA DNA nın yapısı 1953 de JAMES WATSON, FRANCIS CRICK'İN ve diğer bazı bilim insanlarının katkısıyla ortaya konulmuştur. Zincirden meydana gelen DNA nın bir eksen doğrultusunda sağa dönen çift sarmalı meydana gelmiştir. DNA çift sarmalı birbirine antiparalel olarak devam etmektedir. DNA nın omurgasını oluşturan ve hidrofilik özelliğe sahip olan şeker ve negatif yüklü fosfat üniteleri çift sarmalın dışa bakan yüzünde ve kendilerini saran su moleküllerine dönüktür.

DNA Hidrofobik özelliğe sahip olan pürin ve pirimidin bazları ise çift sarmalın içe bakan yüzünde ve ana eksene dikey olarak yer almışlardır. Çift sarmalın çapı 20 angstromdur. Birbirini takip eden bazlar 36 derece dönüş göstererek dizilmekte ve yaklaşık 10 bazın arka arkaya gelmesi çift sarmalın bir tam dönüş yapmasına neden olmaktadır. Bir tam dönüşte çift sarmalın boyu 34 a uzanmakta ve her baz ise 3.4 a uzamakta ve her baz ise 3.4 angstrom luk bir boy artışı sağlamaktadır.

DNA Eğer karşı karşıya duran bazlardan biri purin ise diğeri mutlaka pirimidin olmalıdır. Dna yapısındaki adenin (a) daima iki hidrojen bağı ile timine (t), guanin (g) ise daima üç hidrojen bağı ile sitozine (c) bağlanmaktadır

DNA YAPISI DOÇ. DR. MEHMET KARACA

RNA mrna : tek zincir halinde olup toplam RNA nın %1-3 ünü teşkil eder. Nükleolusta ve stoplazmada bulunur. Yarı ömrü DNA dan kısadır. Haberci RNA DNA da bulunan genetik bilginin, protein yapısına aktarılmasında kalıplık görevi yapan aracı bir moleküldür. mrna ribozomlara tutunur ve DNA dan aldığı genetik şifreye göre sentezlenecek proteinin amino asit sırasını tayin etmektedir. Tek bir eukaryotik hücre yaklaşık 10.000 farklı mrna molekülü ihtiva etmekte ve bunların her birinden bir veya daha fazla polipeptid zinciri sentezlenmektedir.

RNA trna : kıvrılmış yaprak şeklinde olup toplam RNA nın %15-20 sini teşkil eder. Sitoplazmada bulunur. Protein biyosentezi için gerekli amino asitleri taşır. Ökaryotlarda yer alan 20 amino asitin her biri için en az bir trna molekülü bulunmaktadır. trna lar adaptörlük görevi yaparak bir uçlarına bağladıkları amino asiti, ribozoma tutunmuş mrna nın taşıdığı kodona göre polipeptit zincirine dizerler. trna lar üzerinde bulunan ve üçlü bazdan meydana gelen ve antikodon adı verilen bölgeye mrna üzerindeki KODON göre doğru bir şekilde dizilmelerini temin etmektedirler.

RNA rrna : toplam RNA nın %80 ini teşkil eder. Endoplazmik retikulum üzerinde yer alan ribozomlarda veya serbest ribozomlarda bulunur. rrna lar ribozomların ana yapısal elementi olup yaklaşık olarak ribozom ağırlığının % 65 ini teşkil ederler. Prokaryotik hücrelerde 3 çeşit ve ökaryotik hücrelerde ise 4 çeşit rrna bulunmaktadır. Bunlara ilave olarak ökaryotik hücrelerde farklı RNA larda bulunmaktadır. Bunlardan birincisi heterojen nuklear rna (hnrna) lardır. Bunlar ökaryotik hücrede sentezlenen ve ham mrna ve diğeri mikro RNA (mirna) molekülleridirr.

MOLEKÜLER BİYOLOJİNİN ANA KURALI

NÜKLEOTİTLERİN BİYOSENTEZİ Pürin ve pirimidin nükleotitlerinin biyosentezi mitokondri, kloroplast ve sitozolde gerçekleştirilmektedir. Nükleotitlerin hücrede biyosentezi iki değişik patika ile sentezlenirler. Bunlar biri DE NOVO (Yeniden) Sentez Patikası ile sentez ve diğeri ise KURTARMA ( Salvage ) Patikası ile sentezdır. Diyetle alınan DNA/RNA molekülleri ile kullanılmış hücresel DNA/RNA molekülleri Kurtarma patikasında DNA ve RNA sentezi için kullanılabildiği gibi fazlası enerji ve metabolitler için kullanılır ve su, amonyum ve CO 2 parçalanabilirler. Oluşan hidrojen peroksit katalaz ile amonyum ise üre döngüsü ile dışarı atılır.

NÜKLEOTİTLERİN BİYOSENTEZİ

BAZLARIN ANA MOLEKÜLLERİ

PÜRİN VE PİRİMİDİN NÜKLEOTİTLERİN KATABOLİZMASI Hücrelerde DNA ve RNA moleküllerinin yıkımı sürekli oluşur. Pürin ve pirimidin nükleotitleri atık ürünlerine kurtarma patikası ( Salvage ) ile yine nükleotitlerin sentezinde kullanılırlar. NÜKLEOPROTEİNİN protein kısmı ilgili enzimler tarafından peptitlere ve amino asitlere yıkılarak absorbe olurlar. İnsanda nükleik asitler pankreastan salınan spesifik enzimlerinin etkisi ile kendilerini meydana getiren nükleotidlere parçalanırlar.

PÜRİN VE PİRİMİDİN NÜKLEOTİTLERİN KATABOLİZMASI DNA ve RNA'yı PARÇALAYAN ÖZEL ENZİMLER mevcuttur. Hücrede ribonükleotitler deoksiribonükleotitlere oranla daha yüksek miktarlarda üretilirler ve dolaysıyla katabolizmaları oldukça fazladır. Örneğin hücrede üretilen her bir mrna belirli bir süre sonra ömürlerini doldurulurlar ve tekrar üretilmek üzere hücrede SALVAGE PATİKASINA alınmak üzere anabolizmaya dahil edilirler.

PÜRİN VE PİRİMİDİN NÜKLEOTİTLERİN KATABOLİZMASI Meydana gelen nükleotidler, mononükleotidaz enziminin etkisi ile nükleosit ve fosforik asitlere yıkılırlar. Mononükleotidaz aslında fosfotaz enzimidir. Bu fosfotazlar, nükleositleri pentoz ve azotlu bazlara parçalarlar. Meydana gelen pürin ve pirimidinler ayrı ayrı yollarla katabolize olurlar. Nükleoproteinler insanda asidik midede nükleik asitlere, histonlara ve protaminlere parçalanır. Bağırsakta nükleik asitler ribonükleaz ve deoksiribonükleaz yardımıyla mononükleotitlere ve oligonükleotitlere parçalanır.

PÜRİN VE PİRİMİDİN NÜKLEOTİTLERİN KATABOLİZMASI Oligonükleotitler mononükleotitlere ve nükleotidaz enzimi ile nükleosit ve fosfata parçalanır. Serbest pürinler Salvage patikasıyla nükleik asitlerin sentezine alınabilir, Krebs döngüsü ara moleküllerine dönüştürülebilir veya ürik asite çevrilerek vücuttan atılır.

DNA/RNA YIKIMI (KATABOLİZMASI) DOÇ. DR. MEHMET KARACA

DNA/RNA YIKIMI (KATABOLİZMASI) Pürin katabolizmasında 5 nükleotidaz enzimi fosfat grubunu uzaklaştırır. Nükleosit adenozin hipoksiksantin adenozin deaminaz ile hipoksiksantine dönüştürülür. Hipoksiksantin ksantine ve sonra ürik asite ksantin oksidaz ile dönüştürülür. Guanin veya ksantin monofosfat (XMP) ksantine ve ürik asite ksantin oksidaz ile dönüştürülür. Pürin metabolizmasındaki bozukluk aralarında GUT hastalığının yer aldığı bir çok hastalığa neden olmaktadır

DNA/RNA YIKIMI (KATABOLİZMASI) Primidin katabolizmasın Sitozin ve Urasil beta-alanin, betaalanin Malonil KoA dönüşür. Malonil KoA yağ asitleri sentezinde kullanılacaktır. Timin beta-aminobutirik asite ve metil-malonil KoA dönüşür. Arta kalan karbonlar Asetil KoA ve Süksinil KoA dönüştürülerek Krebs döngüsüne alınır. Pirimidin yıkımı son olarak amonyuma, suya ve CO 2 indirgenir. Amonyum üre döngüsüne alınır.