Bu proje Ankara Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Müdürlüğü tarafından desteklenmiştir. (Proje Kod No: ---)

Benzer belgeler
ANKARA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ DOKTORA TEZİ

Mart, 2015 DİYARBAKIR

1. Ekstraksiyon Tamponu: %2 (w/v) CTAB (Cetyltrimethyl-ammonium bromide) 1.4 M NaCl, % 0.2 (v/v) β-merkaptoetanol, 20 mm EDTA. 100 mm Tris-HCl (ph 8)

BAZI MEYVE TÜRLERİNDE DNA İZOLASYON YÖNTEMLERİNİN ETKİNLİĞİNİN KARŞILAŞTIRILMASI

POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU (PZR-PCR) VE RESTRİKSİYON PARÇA UZUNLUĞU POLİMORFİZMİ (RFLP)

Genom analizi için belirteç olarak kullanılan DNA dizileri

TÜBİTAK BİDEB LİSE ÖĞRETMENLERİ FİZİK, KİMYA, BİYOLOJİ, MATEMATİK- PROJE DANIŞMANLIĞI EĞİTİMİ ÇALIŞTAYI LİSE3 (Çalıştay 2013) BİYOLOJİ GRUP TUHAF

MOLEKÜLER BİYOLOJİ LABORATUVARI

Domuz Ayrığı (Dactylis glomerata L.) Populasyonlarında Genetik Çeşitliliğin Belirlenmesi

Geli ş Tarihi :

Gıda Örneklerinde Genetiği Değiştirilmiş Organizma Analizleri. Bölüm 9. MON810 Mısır, Bt-176 Mısır ve Roundup Ready Soya nın PCR ile Nitel Saptanması

Laboratuvar Tekniği. Adnan Menderes Üniversitesi Tarımsal Biyoteknoloji Bölümü TBY 118 Muavviz Ayvaz (Yrd. Doç. Dr.) 5. Hafta (14.03.

Agaroz jel elektroforezi

KAPİLLER ELEKTROFOREZ DNA SEKANSLAMA

Proje Yürütücüsü Prof. Dr. Erdoğan Eşref Hakkı Selçuk Üniversitesi Toprak Bilimi ve Bitki Besleme Bölümü

Proje Yürütücüsü Prof. Dr. Erdoğan Eşref Hakkı Selçuk Üniversitesi Toprak Bilimi ve Bitki Besleme Bölümü

Proje Yürütücüsü Prof. Dr. Erdoğan Eşref Hakkı Selçuk Üniversitesi Toprak Bilimi ve Bitki Besleme Bölümü

Kromozom, DNA ve Gen. Allel Segregasyonu. DNA çift sarmalı. Hastalık yapan mutasyonlar protein fonksiyonunu bozar. Hastalık yapan mutasyonlar

Siirt (Merkez) de Yetiştirilen Üzüm Çeşitlerinin Ampelografik Özelliklerinin Belirlenmesi Üzerine Bir Araştırma

Manisa da (Yuntdağı) Yetiştirilen Üzüm Çeşitlerinin Ampelografik Özelliklerinin Belirlenmesi Üzerine Araştırmalar 1

A Study on Determination of Ampelographical Characters of Grape Cultivars Grown in Şirvan And Eruh Districts of Siirt

ORGANİK K BAĞCILIKTA TAÇ YÖNETİMİ

KARADENİZ BÖLGESİNDEN SEÇİLEN BAZI KIRMIZI AHUDUDU (Rubus ideaus L.) TİPLERİNİN GENETİK FARKLILIĞININ RAPD TEKNİĞİ İLE BELİRLENMESİ

zeytinist

RTA JEL / PZR Saflaştırma Kiti

POYRAZ TIBBİ CİHAZLAR EDVOTEK

REKOMBİNANT DNA TEKNOLOJİSİ. Araş. Gör. Dr. Öğünç MERAL

TÜBİTAK 1003 Buğday Tuzluluğu Projesinin Üçüncü Dönem Raporu Özeti

BRCA 1/2 DNA Analiz Paneli

TÜRKİYE DE BULUNAN BAZI YERLİ SIĞIR IRKLARININ GENETİK YAPILARININ KARAKTERİZASYONU

BAĞCILIĞIN GELİŞTİRİLMESİ YÖNTEMLERİ VE ÜRETİM HEDEFLERİ

TEKNİK ŞARTNAME. 1) LC FS DNA Master Hy. Pb.,96 react

Soru 1: DNA miktarını saptamak için spektrofotometrik yöntemin arkasındaki prensibi açıklayınız:

Mitokondrial DNA Analiz Paneli

zeytinist

I. Projenin Türkçe ve İngilizce Adı ve Özetleri İvesi Koyunlarında mikrosatellite lokuslarında polimorfizmin tespiti Güneydoğu Anadolu Tarımsal Araştı

Mikrobiyolojide Moleküler Tanı Yöntemleri. Dr.Tuncer ÖZEKİNCİ Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji A.D

ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ

Bazı Ceviz (Juglans regia L.) Çeşitlerinin Çimlenme ve Çöğür (Anaçlık) Gelişme Performanslarının Belirlenmesi

RTA DNA qpcr Probe Master Mix

ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ

SALGIN ARAŞTIRMASINDA KULLANILAN TİPLENDİRME YÖNTEMLERİ

ISSN: Yıl /Year: 2017 Cilt(Sayı)/Vol.(Issue): 1(Özel) Sayfa/Page: Araştırma Makalesi Research Article

BAZI ÜZÜM ÇEŞİTLERİNDE (Vitis vinifera L.) İN VİTRO TESTLER YARDIMIYLA POLEN CANLILIĞI VE ÇİMLENME YETENEKLERİNİN İNCELENMESİ

Bazı Üzüm Çeşitlerinin Döl Verimleri Üzerine Tozlayıcı Kalecik Karası Çeşidinin Etkileri

1. MEYVECİLİK ARAŞTIRMALARI

Sebze Islahında Moleküler Markırların Kullanımı

Van İli Merkez İlçe ve Köylerinde Yetiştirilen Bazı Üzüm Çeşitlerinin Ampelografik Özelliklerinin Belirlenmesi

Arboridia adanae (Dlabola) (Hemiptera: Cicadellidae) nin populasyon değişimine ve zarar oranına farklı üzüm çeşitlerinin etkisi 1

Bazı Ekmeklik Buğday (Triticum aestivum L.) Çeşit ve Hatlarının Genetik Uzaklıklarının Belirlenmesi

GAP Bölgesinde Yetiştirilen Bitkilerin Sulama Proğramları

SNP TEK NÜKLEOTİD POLİMORFİZMLERİ (SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS)

verimli bir sezon için İÇİNDEKİLER KARPUZ KABAK KAVUN Görkem, Destan...2 Barçın, Dorukan...3 Gürkan, Karacan...4 Zümrüt, Berrak... 5 Yağız, Meram...

attomol apo B-100 quicktype

PCR Bir reaksiyonun kurulması ve optimize edilmesi

Parkinson Hastalığı ile α-sinüklein Geni Polimorfizmlerinin İlişkisinin Araştırılması

Amasya Üniversitesi Merkezi Araştırma Uygulama Laboratuvarı Uygulama ve Araştırma Merkezi 2017 Yılı Analiz Fiyat Listesi

GENETİK LABORATUVARI

ASMALARDA ÇİÇEK ve ÇİÇEKLENME MORFOLOJİSİ

PELEMIR( CEPHALARIA SCYRIACA) EKSTRAKT İLAVELI EKMEKLERDE RENK ANALIZI

Kullanım Yerleri. İnsan beslenmesinde kullanılır. Şekerin hammadesidir. Küspesi hayvan yemi olarak kullanılır. İspirto elde edilir

ILIMAN İKLİM MEYVE TÜRLERİNDE ÇEŞİT VE TİPLERİN MOLEKÜLER TEKNİKLERLE KARAKTERİZASYONU

ASMANIN ÇOĞALTILMASI

Kistik Fibrozis DNA Analiz Paneli

Polimeraz Zincir Reaksiyonu. Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

ÖZET Yüksek Lisans Tezi HATAY DA YETİŞEN TRABZON HURMASININ (Diospyros kaki L.) RAPD (RASTGELE ÇOĞALTILMIŞ POLİMORFİK DNA) ANALİZİ Merve GÜNERİ Ankara

DNA Đzolasyonu. Alkaline-SDS Plasmit Minipreleri. Miniprep ler bakteri kültüründen plasmit DNA sı izole etmenizi sağlar.

ISBN: YAYIN NO: GAPUTAEM-K-01

HLA Tiplendirmesi PCR-SSP. Türker Duman PhD

Bazı Sofralık Üzüm Çeşitlerinde Farklı Şarj Ve Yaprak Gübresi Uygulamalarının Gelişme, Üzüm Verimi Ve Kalitesine Etkileri Üzerinde Araştırmalar

BİTKİ TANIMA I. P E P _ H 0 4 C h a m a e c y p a r i s l a w s o n i a n a ( L a v z o n Ya l a n c ı S e r v i s i ) Yrd. Doç. Dr.

Prof. Dr. Sait GEZGİN, Uzman Nesim DURSUN. Selçuk Üniversitesi Ziraat Fakültesi Toprak Bilimi ve Bitki Besleme Böl., Konya.

ANKARA ÜNİVERSİTESİ BİYOTEKNOLOJİ ENSTİTÜSÜ YÜKSEK LİSANS TEZİ

3. Şekilde DNA, Kromozom, Gen ve Nükleotidi temsil eden vagonlar verilmiştir. basit yapılı vagondan en karmaşık yapılı vagona doğru takmak istiyor.

Özgeçmiş. Çalıştığı Kurum/Kurumlar ve Yıl Ankara Üniversitesi Ziraat Fakültesi Bahçe Bitkileri Bölümü (2007-Devam) Dr. Araş. Gör.

BAHÇE Özel Sayı: VII. ULUSAL BAHÇE BİTKİLERİ KONGRESİ BİLDİRİLERİ - Cilt I: Meyvecilik

Hücre Biyoloji Laboratuarı Güz dönemi Alıştırma Soruları (Dr.Selcen Çelik)

TÜBİTAK BİDEB LİSE ÖĞRETMENLERİ-FİZİK, KİMYA, BİYOLOJİ, MATEMATİK- PROJE DANIŞMANLIĞI EĞİTİMİ ÇALIŞTAYI (LİSE-3 [ÇALIŞTAY 2013) BİYOLOJİ PROJE RAPORU

TEZ ONAYI Funda YILDIRIM tarafından hazırlanan Ankara ve Çankırı İlleri Asma Gen Kaynaklarının SSRs (Simple Sequence Repeats) a Dayalı Genetik Karakte

AMASYA ÜNİVERSİTESİ MERKEZİ ARAŞTIRMA UYGULAMA LABORATUVARI UYGULAMA VE ARAŞTIRMA MERKEZİ ANALİZ FİYAT LİSTESİ

BIONEER MARKA ACCUPOWER EBV QUANTATIVE PCR KİTİ PROTOKOLÜ

BİLECİK ŞEYH EDEBALİ ÜNİVERSİTESİ AKADEMİK ÖZGEÇMİŞ FORMU

Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR: Polymerase Chain Reaction) Ayten AŞKIN KILINÇ Veteriner Hekim

attomol HLA-B*27 Sadece in vitro diagnostik kullanım içindir! 1.Giriş 2. Genel Açıklamalar

Moleküler Nematoloji. Eğitim Süresi: 6 ay (29 Aralık Haziran 2014) Eğitim Yeri: Kaliforniya Üniversitesi, Davis Bitki Bilimleri Bölümü

ODUN DIŞI ORMAN ÜRÜNLERİ BİTKİ TANIMI II

REAKSİYON PRENSİPLERİ

VEJETATİF ÇOĞALTMA (EŞEYSİZ)

Protokolü PD S Reaksiyon

Türkiye Tenthredopsis (Hymenoptera: Symphyta: Tenthredinidae) Tür Sınırlarının Barkodlama Yöntemi İle Saptanması

ADİ FİĞ TESCİL RAPORU

Bornova Misketi Ve Cabernet Sauvignon Üzüm Çeşitlerinde Organik Ve Konvansiyonel Yetiştiriciliğin Asmanın Gelişimine, Üzüm Ve Şarap Kalitesine Etkisi

Elma kış dinlenmesine ihtiyaç duyan meyve türü olup, soğuklama gereksinimi diğer meyvelere göre uzundur.

zeytinist

attomol lactose intolerance C>T quicktype

Nilgün Çerikçioğlu Marmara Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

KORUMA ALTINDAKİ ÇİNE ÇAPARI KOYUNLARDA GENETİK ÇEŞİTLİLİK* Pelin BİNBAŞ1, İbrahim CEMAL2

AVRASYA ÜNİVERSİTESİ

YÜKSEKÖĞRETİM KURULU YARDIMCI DOÇENT : Sinop Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Biyoloji Bölümü Sinop

Araştırma. Ordu ilinde karayemiş (Laurocerasus officinalis L.) seleksiyonu* (Research) Ali İSLAM 1, Hüseyin DELİGÖZ 1

Transkript:

ANKARA ÜNİVERSİTESİ BİLİMSEL ARAŞTIRMA PROJELERİ SONUÇ RAPORU GÜNEYDOĞU ANADOLU BÖLGESİ ASMA GEN POTANSİYELİNİN RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA) TEKNİĞİ İLE MOLEKÜLER ANALİZİ Prof. Dr. Y. Sabit AĞAOĞLU Doç. Dr. Ali ERGÜL Yard. Doç Dr. Sümer ARAS Dr. Hüseyin KARATAŞ Arş. Gör. Eda KARAAĞAÇ ANKARA

Bu proje Ankara Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Müdürlüğü tarafından desteklenmiştir. (Proje Kod No: ---)

ANKARA ÜNİVERSİTESİ BİLİMSEL ARAŞTIRMA PROJELERİ PROJE SONUÇ RAPORU TANITICI BİLGİLER.l. PROJE ALANI : FEN SAĞLIK SOSYAL DİSİPLİNLER ARASI BAĞIMSIZ YÖNLENDİRİLMİŞ.. PROJE GURUBU :.. PROJE BAŞLIĞI : GÜNEYDOĞU ANADOLU BÖLGESİ ASMA GEN POTANSİYELİNİN RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA) TEKNİĞİ İLE MOLEKÜLER ANALİZİ.. BAŞLAMA TARİHİ VE SÜRESİ :.. PROJE PERSONELİ... PROJE YÖNETİCİSİ: ADI, SOYADI,ÜNVANI :Y. SABİT AĞAOĞLU, Prof. Dr. FAKÜLTE VE BÖLÜMÜ : ZİRAAT FAKÜLTESİ BAHÇE BİTKİLERİ BÖLÜMÜ Dışkapı/Ankara TEL: /, FAKS:, E-MAİL: agaoglu@ada.net.tr... ARAŞTIRMACILAR ADI, SOYADI, ÜNVANI : ALİ ERGÜL, Doç. FAKÜLTE VE BÖLÜMÜ : ANKARA ÜNİVERSİTESİ BİYOTEKNOLOJİ ENSTİTÜSÜ Tandoğan/Ankara (KURUMU VE GÖREVİ) : Zir. Yük. Mühendisi. ADI, SOYADI, ÜNVANI : SÜMER ARAS FAKÜLTE VE BÖLÜMÜ : FEN FAKÜLTESİ BİYOLOJİ BÖLÜMÜ Tandoğan Ankara (KURUMU VE GÖREVİ) : Yrd. Doç. ADI, SOYADI, ÜNVANI : HÜSEYİN KARATAŞ, Dr. FAKÜLTE VE BÖLÜMÜ : ZİRAAT FAKÜLTESİ BAHÇE BİTKİLERİ BÖLÜMÜ Dışkapı/Ankara (KURUMU VE GÖREVİ) : (Arş. Gör.) ADI, SOYADI, ÜNVANI : EDA KARAAĞAÇ FAKÜLTE VE BÖLÜMÜ : ZİRAAT FAKÜLTESİ BAHÇE BİTKİLERİ BÖLÜMÜ Dışkapı/ Ankara (KURUMU VE GÖREVİ) : (Arş. Gör.)

ÖZET GÜNEYDOĞU ANADOLU BÖLGESİ ASMA GEN POTANSİYELİNİN RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA) TEKNİĞİ İLE MOLEKÜLER ANALİZİ Bu araştırmada, Bağcılık yönünden Güneydoğu Anadolu Bölgesinin üç önemli ili Diyarbakır, Gaziantep, Şanlıurfa'nın asma gen potansiyelinin DNA düzeyinde belirlenmesi amacı ile; bölgeden Tekirdağ Bağcılık Araştırma Enstitüsündeki Milli Koleksiyon Bağı'na aktarılan çeşitler ile yine bu bölgeden tarafımızdan toplanan asma (V. vinifera L.) çeşit populasyonlarının genetik analizleri gerçekleştirilmiştir. Deneme materyallerinden sağlanan sürgün ucu-genç yapraklar DNA izolasyonu amacı ile kullanılmış, genetik tanımlamalar RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) tekniği ile yapılmıştır. Araştırmada RAPD primeri ile ön çalışmalar yapılmış; amplifikasyonu iyi polimorfizmi yüksek primerlerden adedi seçilmiştir. Diyarbakır ilinde yetişen çeşit ve bu ilden Milli Koleksiyon Bağı'na aktarılan çeşit olmak üzere toplam ; Gaziantep ilinde yetişen çeşit ve bu ilden Milli Koleksiyon Bağına aktarılan çeşit olmak üzere toplam yine ve Şanlıurfa ilinde yetişen çeşit ve bu ilden Milli Koleksiyon Bağı'na aktarılan çeşit olmak üzere toplam çeşidinin (Vitis vinifera L.) seçilen bu dekamer primer kullanılarak çeşitler arası genetik benzerlikler ortaya konmuş ve çeşitler ayırt edilmiştir. İllerdeki çeşitler arasında saptanan genetik ilişkiler benzerlik indeksi ve dendogram düzeyinde gerçekleştirilmiştir. Diyarbakır üzüm çeşitleri arasında en düşük benzerlik Hasani-Amorku çeşitleri arasında (.), en yüksek benzerlik oranı ise Şaraplık-Avkenek çeşitleri arasında (.) görülmüştür. Gaziantep üzüm çeşitleri arasında en düşük benzerlik Timbo-Rumi çeşitleri arasında (.), en yüksek ise Dımışkı-Külahi arasında (.) saptanmıştır. Şanlıurfa çeşitleri arasında ise en düşük değerler Tilgören-Kabarcık çeşitleri arasında (.), en yüksek değerler ise Azezi-Kayısı çeşitleri arasında (.) tespit ediliştir. Çeşitlerdeki nispeten yüksek genetik benzerlik oranı dendogramlara da yansımıştır. Diyarbakır ilindeki dendogram, farklı dallanmalardan ziyade iç içe girmiş değişik sayıda çeşit içeren alt gruplardan oluşmuştur. Bunlarda ise bağlantı oluşturan çeşitler dışında temel olarak beş grup oluşmuş olup. Grupta,. Grupta,. Grupta,. Grupta ve. Grupta çeşit yer almıştır. Diyarbakır ilinde olduğu gibi Gaziantep iline ait üzüm çeşitlerinin arasındaki yüksek benzerlik oranı da dendograma yansımıştır. Dendogramda bağlantılar oluşturan çeşitler dışında temel olarak. Grupta çeşit,. Grupta çeşit,. Grup çeşit,. Grupta çeşit,. Grupta çeşit ve. Grupta çeşit yer almıştır.. Şanlıurfa ili çeşitlerinde de diğer iki ilde (Diyarbakır ve Gaziantep) olduğu gibi aralarında yüksek genetik benzerliklere ulaşmıştır. Dendogram dağılımı ise iç içe girmiş değişik sayıda çeşit içeren alt gruplardan oluşmuştur. Aralarında bağımsız bağlantılar gösteren çeşitler dışında genel olarak. Grupta çeşit,. Grupta çeşit,. Grupta çeşit,. Grupta çeşit ve. Grupta çeşit yer almıştır ANAHTAR KELİMELER: V. vinifera L. moleküler tanımlama, DNA izolasyonu, RAPD, benzerlik indeksi, dendogram, Diyarbakır, Gaziantep, Şanlıurfa i

ABSTRACT MOLECULAR ANALYSIS OF SOUTHEAST ANATOLIAN REGION S GRAPEVINE GERMPLASM BY RAPD (Random Amlifed Polymorphic DNA) TECHINQUE This study was carried out to determine genetic potential of three viticulturally import provinces (Diyarbakır, Gaziantep, Şanlıurfa) in Turkey using RAPD-PCR technique. samples were collected both from the original regions and from the grapevines grown in National Germplasm Collecion Vineyard located in Tekirdağ. Out of preselectively amplified decamer primers, were highly polymorphic and used for further amplificate of,, verieties Diyarbakır, Gaziantep, Şanlıurfa respectively, a total of, in order to establish genetic similarities and to construct a dendogram. The lowest similarity index among Diyarbakır varieties was between Hasani and Amorku (.), while the highest was Şaraplık and Avkenek (.), the lowest similarity was observed in Gaziantep varieties between Timbo and Rumi (.) and the highest was between Dımışkı and Külahi (.), Tilgören and Kabarcık were lowest similar (.) and Azezi and Kayısı (.) was the highest similar among Şanlıurfa varieties. Regarding to dendogram distrubution Diyarbakır was mainly subgrups that were composed of with different numbers of varieties, aside from independent main cultivars Grups had,,, and varieties in them respectively. Gaziantep had a grouped dendogram having,,,,, and varieties respectively. In addition to the independently grouped varieties, Şanlıurfa dendogram was comprised of subgrups which had,,, and varieties, respectively. Key Words: Vitis vinifera L.cvs., Molecular identification, DNA isolation, RAPD, similarity index, cluster analysis, Diyarbakır, Gaziantep, Şanlıurfa. ii

İÇİNDEKİLER ÖZET... i ABSTRACT... ii İÇİNDEKİLER...iii ŞEKİLLER DİZİNİ... iv ÇİZELGELER DİZİNİ... vi.giriş.... MATERYAL VE YÖNTEM..... Materyal..... Metot...... DNA izolasyonu...... PCR uygulamaları...... Sonuçların değerlendirilmesi.... ARAŞTIRMA BULGULARI VE TARTIŞMA..... DNA İzolasyonu..... PCR Uygulamaları..... Benzerlik indeksi ve genetik ilişki dendogramı...... Benzerlik indeksi..... Genetik ilişki dendogramı... KAYNAKLAR... iii

ŞEKİLLER DİZİNİ Şekil.. Araştırmada kullanılan Diyarbakır ili üzüm çeşitlerine ait DNA'ların agaroz jel üzerindeki görüntüleri... Şekil.. Araştırmada kullanılan Gaziantep ili üzüm çeşitlerine ait DNA'ların agaroz jel üzerindeki görüntüleri... Şekil.. Araştırmada kullanılan Şanlıurfa ili üzüm çeşitlerine ait DNA'ların agaroz jel üzerindeki görüntüleri... Şekil.. Diyarbakır üzüm çeşitlerinin OPA- " '-AGGTGACCGT-' " primeri ile oluşturulan pcr amplifikasyon üzümlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüsü. Markör: bp DNA Ladder (Promega). Kontrol: Genomik DNA hariç diğer PCR öğeleri... Şekil.. Diyarbakır üzüm çeşitlerinin OPO- primeri ile oluşturulan PCR amplifikasyon ürünlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri... Şekil.. Diyarbakır üzüm çeşitlerinin P- primeri ile oluşturulan PCR amplifikasyon ürünlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri... Şekil.. Diyarbakır üzüm çeşitlerinin P- primeri ile oluşturulan PCR amplifikasyon ürünlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri... Şekil.. Diyarbakır üzüm çeşitlerinin S- primeri ile oluşturulan PCR amplifikasyon ürürlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri... Şekil.. Gaziantep üzüm çeşitlerinin OPA- primeri ile oluşturulan CR amplifikasyon ürünlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri... Şekil.. Gaziantep üzüm çeşitlerinin OPO- primeri ile oluşturulan PCR amplifikasyon ürünlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri... Şekil.. Gaziantep üzüm çeşitlerinin P- primeri ile oluşturulan PCR amplifikasyon ürünlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri... Şekil.. Gaziantep üzüm çeşitlerinin P- primeri ile oluşturulan PCR amplifikasyon ürünlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri... Şekil.. Gaziantep üzüm çeşitlerinin S- oluşturulan PCR amplifikasyon ürürlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri... iv

Şekil.. Gaziantep üzüm çeşitlerinin OPA- primeri ile oluşturulan CR amplifikasyon ürünlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri... Şekil.. Gaziantep üzüm çeşitlerinin OPO- primeri ile oluşturulan PCR amplifikasyon ürünlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri... Şekil.. Gaziantep üzüm çeşitlerinin P- primeri ile oluşturulan PCR amplifikasyon ürünlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri... Şekil.. Gaziantep üzüm çeşitlerinin P- primeri ile oluşturulan PCR amplifikasyon ürünlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri... Şekil.. Gaziantep üzüm çeşitlerinin S- oluşturulan PCR amplifikasyon ürürlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri... Şekil.. Diyarbakır iline ait üzüm çeşitlerinde genetik ilişki dendogramı [*:Tekirdağ dan (Milli Koleksiyon Bağı) alınan çeşitler]... Şekil.. Gaziantep iline ait üzüm çeşitlerinde genetik ilişki dendogramı [*:Tekirdağ dan (Milli Koleksiyon Bağı) alınan çeşitler]... Şekil.. Şanlıurfa iline ait üzüm çeşitlerinde genetik ilişki dendogramı [*:Tekirdağ dan (Milli Koleksiyon Bağı) alınan çeşitler]... v

ÇİZELGELER DİZİNİ Çizelge.. Araştırmada kullanılan Diyarbakır iline ait üzüm çeşitleri (genotipleri) ve bunların kısa ampelografik özelikleri... Çizelge.. Araştırmada kullanılan Gaziantep iline ait üzüm çeşitleri (genotipleri) ve bunların kısa ampelografik özelikleri... Çizelge.. Araştırmada kullanılan Şanlıurfa iline ait üzüm çeşitleri (genotipleri) ve bunların kısa ampelografik özelikleri... Çizelge.. PCR reaksiyon karışımları... Çizelge.. Amplifikasyon koşulları... Çizelge.. RAPD analizlerinde kullanılan primerler ve baz dizileri... Çizelge.. Diyarbakır iline ait üzüm çeşitlerinde kullanılan RAPD primerlerine ait toplam bant sayısı (n), polimorfik bant sayısı (n) ve polimorfik bant oranları (%) değerleri... Çizelge.. Gaziantep iline ait üzüm çeşitlerinde kullanılan RAPD primerlerine ait toplam bant sayısı (n), polimorfik bant sayısı (n) ve polimorfik bant oranları (%) değerleri... Çizelge.. Şanlıurfa iline ait üzüm çeşitlerinde kullanılan RAPD primerlerine ait toplam bant sayısı (n), polimorfik bant sayısı (n) ve polimorfik bant oranları (%) değerleri... Çizelge.. Diyarbakır ili üzüm çeşitlerine ait benzerlik indeksi... Çizelge.. Gaziantep ili üzüm çeşitlerine ait benzerlik indeksi... Çizelge.. Şanlıurfa ili üzüm çeşitlerine ait benzerlik indeksi... vi

. GİRİŞ Türkiye tarım sektörü içerisinde bağcılık sektörü bir yılı itibariyle. ha bağ alanı ve.. ton üzüm üretimi ile önemli potansiyele sahiptir. Kültür asması Vitis vinifera L. nin gen merkezi olan ülkemizde aynı zamanda doğal melezlemelerle zaman içerisinde kültür çeşitlerine ve yabani polulasyonlara ait zengin bir genetik çeşitliliğin oluştuğu görülmektedir. Ülkemizde çeşit ve tip varyasyonunu incelemek ve korumak amacı ile koleksiyon oluşturma çalışmaları büyük ölçüde tamamlanmıştır. Bugün ülkemizde bağcılığın karşı karşıya bulunduğu sorunların başında çeşit standardizasyonlarının oluşturulmaması, dolayısıyla sahip bulunduğumuz genotiplerin sayısının tam olarak belirlenememesi gelmektedir. Bunda ise koleksiyonu oluşturan çeşit ve bunlara ait tiplerde yüksek oranda sinonimlere rastlanması ve bunların da morfolojik karakterlere dayalı ampelografik çalışmalar ile kesin olarak belirlenememesi neden gösterilmektedir. Son yıllarda ise bitki genetik tanımlamalarında DNA ya dayalı moleküler markörler devreye girmiştir. Diğer bitkilere paralel olarak asmada da tür, çeşit ve tiplerin tanımlanmasında temelde PCR (Polymerase Chain Reaction) teknolojine dayalı bu markör tiplerinin (RAPD, SSR, AFLP, vb.) genetik ayrım amacına ve teknik alt yapıya bağlı olarak kullanıldığı görülmektedir. Tarım bölgelerimiz içerisinde bitki tür çeşitliliği ve bu türler bazında ulaşılan verim yönünden önemli bir paya sahip olan Güneydoğu Anadolu Bölgesi, GAP projesi ile tarımdaki potansiyelini daha da artırmaktadır. Asma bölgeye adapte olmuş çok yıllık bahçe bitkileri türlerinin başında gelmektedir. Sofralık (Tahannebi, Hönüsü, Dımışkı vb.), şaraplık (Boğazkere, Öküzgözü vb.) ve kurutmalık (Besni vb.) çeşitleri ve değerlendirme şekilleri ile zengin bağcılık potansiyeline sahip bölgede; Diyarbakır, Gaziantep, ve Şanlıurfa illerinde yapılan ön araştırma ve çeşit muhafazası çalışmalarında yaklaşık den fazla üzüm çeşidi ve tipi tespit edilmiştir. Buna rağmen bölgenin, çeşit bazında, bağcılık kapasitesinin tam olarak belirlenemediği görülmektedir. Bunda ise bugüne kadar yürütülen araştırmaların bölge içinde belli illerde yoğunlaşması ile çeşit koleksiyonunda tüm yürelerin taranamaması etkili olurken; esas sorunu, toplanan materyallerin her birinin klasik yöntemlerle dahi henüz çeşit düzeyinde tanımlanamaması oluşturmaktadır. Güneydoğu Anadolu Bölgesi gerek genotip zenginliği gerekse yetiştirilen çeşitlerin değerlendirme şekilleri açısından üstün özelliklere sahip olması nedeni ile bağcılık araştırmalarında çok önemli bir yöre olarak kabul edilmektedir. Diyarbakır, Gaziantep ve Şanlıurfa bağcılık tarımının yoğun uygulandığı iller arasında görülürken, özellikle yılı itibariyle Gaziantep (. ton) ve Diyarbakır (. ton) üretim yönü ile ülke çapında ilk sıralarda yer almaktadır. Bölge bağcılığının incelenmesi amacı ile günümüze kadar yürütülen önemli ampelografik çalışmaların yanında (Kısakürek, Gürsöz, Kaplan ) bölge çeşitlerinin Milli Koleksiyon Bağına (Tekirdağ) taşınması çalışmaları bu incelemeler içerisinde önemli yer tutmaktadır. Ampelografik çalışmalarla sınırlı sayıda çeşit incelenirken bunların benzerlikleri/farklılıkları kesin olarak ortaya konulamamaktadır. Milli Koleksiyon Bağı oluşturma çalışmalarında ise, bölgeye ait çeşitlerin tamamının koleksiyona katılamadığı (toplama çalışmalarının bölgede terörün yoğun olduğu dönemlere denk gelmesi nedeni ile) görülmektedir. Koleksiyona katılan çeşitler de bu araştırmaya dahil edilerek, iller bazında saptanabilen tüm çeşitlerin tanımlamalarının DNA düzeyinde yapılması ve genotiplerin çeşit olup olmadıklarının ortaya konması bu çalışmanın amacını oluşturmaktadır.

Bölgede, halen büyük çoğunlukla eski bağcılık tekniği uygulanmaktadır. Filoksera zararlısı yanında, bağların yaşlı olması, kurak şartlarda bağcılık yapılması ve gelişen bağcılık tekniğinin yeterince bilinmemesi gibi nedenlerle bölgede bağcılık gittikçe gerilemektedir. Bu gerilemeyi durdurmak ve bağcılığı geliştirmek için yeni bağcılık tekniğine süratle geçilmesi için, bir dizi önlem alınması gerekmektedir. Bu önlemlerden en başta gelenlerden biri, mevcut gen potansiyelinin belirlenmesi ve özellikle çok farklı dağılım gösteren ve hızla kaybolmayla karşı karşıya kalmış bölgeye ait çeşitlerin tespitinin yapılması ve genetik tanımlamalarının gerçekleştirilmesidir. Araştırmada kullanılan Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) yöntemi, - baz uzunluğundaki rastgele oligonükleotidlerin (primerlerin), kalıp (templete) DNA'nın iki iplikçiği üzerinde, birbirine karşı iki farklı noktada tamamlayıcılarını (komplementerlerini) bularak, bu ara bölgenin çoğaltılmasını (amplifikasyonunu) esas alan nükleotid dizi polimorfizminden oluşmaktadır. Yaygın olarak diğer PCR uygulamalarının aksine iki değil bir başlatıcı DNA kullanılmaktadır. Ancak, bu başlatıcı her iki yöndeki DNA üretimi için de kullanılır. Dolayısıyla kullanılan başlatıcının DNA üzerinde birbirine yakın iki bölgeye yapışabildiği genom bölgelerinin amplifikasyonu yapılmaktadır. Çoğaltım yapılan DNA bölgeleri bir agaroz jel üzerinde elektroforeze tabi tulduğunda bazı bölglerin bazı genotiplerde çoğaltılabildiği bazılarında ise çoğalmadığı gözlenmektedir. Bu işlem açılım gösteren bir populasyonda yapıldığında ebeveynlere ait bantlara bakılarak gerçekleştirilmektedir (Welsh ve McClelland ). Bu çalışmada, Güneydoğu Anadolu Bölgesinin baz alındığı proje ile, bölgeden koleksiyona aktarılan çeşitleri de içine alan mevcut populasyonda DNA düzeyinde tanımlamalar yapılmış ve bölge çeşitlerinin DNA kimlikleri belirlenmiştir. Bu çalışma aynı zamanda bölgesel anlamda genetik tanımlamanın yapılması açısından da ülkemizde bir ilki teşkil etmektedir. Bunda bölgesel çeşitlerin tanımlanmaları, ülkemizde sonradan yapılacak agronomik ve genetik çalışmalar için bir ön veri oluşması bakımından önemlidir. Bu hedeften yola çıkarak gerçekleştirilen bu çalışmada; ülkemizde zengin gen potansiyeline sahip Güneydoğu Anadolu Bölgesi'ndeki Diyarbakır, Gaziantep ve Şanlıurfa illerinde yetiştirilen adet asma genotipinin genetik tanımlamaları gerçekleştirilmiştir. Bu amaçla Vitis vinifera L. çeşitlerin tanımlanmasında bir çok araştırıcı tarafında önerilen (Büscher et al., Ye et al., Loureiro et al., Vidal et al., Regner ve Wiedeck, Luo et al. ) RAPD Random Amplified polymorphic DNA) tekniği kullanılmıştır.

. MATERYAL VE METOT.. Materyal Bu araştırma - yıllarında Ankara Üniversitesi Ziraat Fakültesi Bahçe Bitkileri Bölümü ve Ankara Üniversitesi Biyoteknoloji Enstitüsü Tarımsal Biyoteknoloji Bahçe Bitkileri Birimi Laboratuvarında yürütülmüştür. Araştırmamızda kullandığımız materyaller ( genotiplere ait çelikler ) - yılları Mart- Nisan aylarında daha önceki çalışmalarda yerleri belirlenmiş Diyarbakır, Gaziantep ve Şanlıurfa merkez ve ilçelerindeki genotiplerden alınmıştır. Ayrıca bu illerden Milli Koleksiyon Bağına ( Tekirdağ iline ) aktarılan genotiplerin tümü de alınmıştır. Toplanan bu genotiplerin kısa ampelografik özellikleri Çizelge.,. ve.'de verilmiştir. Alınan tüm çeşitlere ait çelikler; - gözlü olarak perlit torf-kum (: : ) karışımından hazırlanmış ortamda, polietilen tüplere dikilmiş ve sera ortamında köklendirilerek gözlerin sürmesi sağlanmıştır. Denemede bu üç ilden toplanan toplam üzüm genotipine ait sürgün uçları ve genç yapraklar kullanılmıştır.

Çizelge.. Araştırmada kullanılan Diyarbakır iline ait üzüm çeşitleri (genotipleri) ve bunların kısa ampelografik özelikleri No Çeşitler Sinonimleri Çiçek Yapısı Salkım Şekli Şekli Tane Kabuk Rengi Çekirdek Sayısı Değerlendirme Şekli Alındığı İlçe Kaynak Mikeri Siyah cısna, Himkeri Erdişi Silindirik Küre Koyu kırmızı-mor Sofralık Eğil Kaplan, Erdişi Konik Uzun elips Koyu kırmızı-mor Sofralık Lice Kaplan, Erdişi Silindirik Orak biçimi Yeşil-Sarı Sofralık Çermik Kaplan, Balcani Balcan, Patlıcan, Balcanlı, Siyahbalcani Hatunparmağı Zeynebi, İstanbullu, (beyaz) Herzem Vilki Kışüzümü, Sorik Erdişi Kanatlı Küre Kırmızı Sofralık Çermik Kaplan, Şitu Kışüzümü Erdişi Konik Geniş oval Yeşil-Sarı Sofralık Merkez Kaplan, Kızılbanki Kızılvanki Erdişi Konik Geniş oval Kırmızı Sofralık Çermik Kaplan, Kohar Kohur Erdişi Silindirik Kısa elips Yeşil-Sarı Sofralık Lice Kaplan, Hasani... Erdişi Kanatlı Küre Yeşil-Sarı Sofralık Lice Kaplan, Asuri... Erdişi Silindirik Hafif oval Kırmızı-Siyah - Sofralık Eğil Gürsöz, Zerik... Erdişi Omuzlu Uzun oval Yeşil-Sarı - Sofralık Eğil Gürsöz, Erdişi Konik Küre Mavi-Siyah Sofralık- Ağek Ağanınüzümü, Sorik, Çermik Gürsöz, Kırmızıüzüm Kurutmalık Gençmehmet Mazrone Erdişi Dallı Küre Yeşil-Sarı Pekmez-Pestil Çermik Kaplan, Şaraplık Boğazkere Erdişi Kanatlı Küre Siyah - Şıralık Merkez Gürsöz, Iskıcuna... Erdişi Dallı Küre Koyu kırmızı-mor Pekmez-Pestil Lice Kaplan, Merir Meri Erdişi Konik Küre Yeşil-Sarı Pekmez-Pestil Hani Kaplan, Abderi Suluüzüm, Zeynebi Fonksiyonel Konik Uzun elips Yeşil-Sarı Sofralık- Çermik Kaplan, dşi Kurutmalık Tahannebi Beyazüzüm, Tahnvi Fonsiyonel Konik Küre Yeşil-Sarı Sofralık Kocabaş Kaplan, dişi Morek Morık, Morüzüm, Erdişi Konik Geniş oval Koyu kırmızı-mor Sofralık Ergani Kaplan, Zeynebi Vanki... Fonsiyonel Kanatlı Küre Yeşil-Sarı Sofralık- Çermik Kaplan, dişi Kurutmalık Şamuzli Şamüzümü Erdişi Konik Hafif oval Yeşil-Sarı - Sofralık-Şıralık Eğil Gürsöz, Şirelik Şireüzümü Erdişi Kanatlı Küre Yeşil-Sarı Şıralık-Şaraplık Eğil Kaplan, Karik Karaerik Erdişi Konik Geniş oval Mavi-Siyah Kurutmalık Çermik Kaplan, Mazrumi Mazruma, Mazrume, Şire Erdişi Konik Küre Yeşil-Sarı Şıralık-Şaraplık Eğil Kaplan,

Çizelge.' in devamı Belelük... Erdişi Konik Küre Koyu kırmızı-mor Pekmez-Pestil Çüngüş Kaplan, İm (küçük)... Erdişi Kanatlı Oval Koyu kırmızı-mor Şıralık-Şaraplık Hani Kaplan, Siyahgıldun... Erdişi Silindirik Küre Mavi-Siyah Sofralık Hani Kaplan, İm (büyük) İme Ermeniyan, Şarabi Erdişi Kanatlı Oval Koyu kırmızı-mor Şıralık Hani Kaplan, Çirbet Cibeyt, Çirbeyt Erdiş Konik Uzun elips Yeşil-Sarı Pekmez-Pestil Çüngüş Kaplan, Beyazgıldun... Fonsiyonel Kanatlı Uzun elips Yeşil-Sarı Sofralık Hani Kaplan, dişi Amorku Amarsev Erdişi Konik Küre Mavi-Siyah Sofralık Lice Kaplan, Avkenek Suüzümü, Avkinek Erdişi Dallı Hafif oval Yeşil-Sarı - Sofralık-Şıralık Merkez Gürsöz, İstanbullu... Erdişi Konik Uzun elips Yeşil-Sarı Sofralık Eğil Kaplan, Şekeri Auklek Erdişi Konik Geniş oval Yeşil-Sarı Sofralık- Ergani Kaplan, Kurutmalık Şarabi Şaraplık Erdişi Kanatlı Yuvarlak Kırmızı-Siyah - Şaraplık-Şıralık Eğil Gürsöz, Luvanek Tilkikuyruğu Erdişi Kanatlı Kısa elips Yeşil-Sarı Sofralık Çermik Kaplan, Hatunparmağı... Foksiyonel Silindirik Uzun elip Koyu kırmızı-mor Sofralık Çermik Kaplan, (siyah) dişi Kışgıldun... Erdişi Dallı Küre Pembe Sofralık Hani Kaplan, Kabarcık... Erdişi Silindirik Küre Yeşil-Sarı Şıralık-Şaraplık Eğil Kaplan, Siyahüzüm* Raşme Erdişi Kanatlı Küre Siyah-Mor - Şaraplık-Şıralık Ergani *T.B.A.E'' de gözlemler Şarabi*... Erdişi Kanatlı Uzun-Elips Siyah - Şıralık Eğil *T.B.A.E'' de gözlemler İsimsiz*........................ Vanki*... Erdişi Kanatlı Uzun-Elips Beyaz - Sofralık- Kurutmalık Ergani *T.B.A.E'' de gözlemler Morüzüm* Morık, Morüzüm, Zeynebi, Muhammediye Erdişi Silindirik Küre Koyu kırmızı-mor - Sofralık Eğil *TB.A.E'' de gözlemler Tahannebi* Mehmetyakupüzümü Fonksiyonel Konik Elips Yeşil-Sarı - Sofralık Çermik *T.B.A.E'' de dişi gözlemler Abderi* Suluüzüm, Zeynebi Fonksiyonel Konik Elips Yeşil-Sarı - Sofralık- Çügü *T.B.A.E'' de dişi Kurutmalık gözlemler Abdullah* Erdişi Kanatlı Küre Yeşil-Sarı? - Sofralık Eğil *T.B.A.E'' de gözlemler Kaplan,, Görsüz,, *T.B.A.E: Tekirdağ Bağcılık Araştırma Enstitüsü'den (Milli Koleksiyon Bağı) alınan çeşitler.

Çizelge.. Araştırmada kullanılan Gaziantep iline ait üzüm çeşitleri (genotipleri) ve bunların kısa ampelografik özelikleri No Çeşitler Sinonimleri Salkım Şekli Tane Şekli Tane Rengi Tane Kabuğu Tane İçi Pafı Konik, Yuvarlak Yeşil-sarı Orta kalın Dolgun etli, silindirsel Az sulu Sergi karası Antep karası, Omuzlu, Uzun Kırmızı-siyah Kalın Etli, Karalık, Çöpü konik oval, Sivri Az sulu yeşil iğ şekilli Dusuzu Konik Uzun oval Yeşil-sarı Orta kalın Yumuşak etli, silindirsel Sulu Dımışkı Nebidede, Omuzlu, Uzun oval Yeşil-sarı Orta kalın Dolgun etli, Şami konik Orta sulu Külahi Muhammediye Basit ve Yuvarlak Sarımtrak - Kalınca Gevrek etli, kanatlı konik yeşil Sulu Şekeri Omuzlu dallı Yuvarlak Yeşil-sarı Orta kalın Dolgun etli, Sulu Beyazsergi Kanatlı konik İri Tümbü Karakureyş, Tirireş, Havger, Tilgören ve piramit yumurta Omuzlu, dallı Yuvarlak Kirkit Kanatlı konik Elips Açık sarımtrakyeşil Çekirdek Sayısı Tadı Verimlilik Değerlendirme Şekli Kaynak - Tatlı Çok Şıralık Gürsöz, - Kekremsi Orta Kurutmalık Gürsöz, - Az Orta Şıralık Gürsöz, - Tatlı Çok Sofralık, Gürsöz, Kurutmalık - Çok Orta Sofralık Kısakürek, - Çok Orta Sofralık Gürsöz, Çok açık sarı Orta kalın Etli - Kekremsi Çok Kurutmalık Kısakürek, Kırmızı-siyah Orta kalın Yumuşak etli, - Az Çok Şaraplık, Sofralık Gürsöz, Çok sulu İnce ve sert Dolgun etli, Az sulu - Tatlı Orta Sofralık Kısakürek, Rumi Kilisurumusu, Urumu Konik, omuzlu Uzunca, yuvarlak Yeşil-sarı İnce Dolgun etli, Çok sulu - Çok Çok Sofralık, Şıralık Kurutmalık Gürsöz, Kızlartahtası Omuzlu, dallı Kısa oval Yeşil-sarı Orta kalın Yumuşak etli, - Orta Çok Sofralık, Şaraplık Orta sulu Gürsöz, Timbo Dallı konik Yuvarlak Kırmızı-siyah Orta kalın Yumuşak etli, Sulu - Tatlı Çok Şaraplık, Sofralık Gürsöz, Bandırma Besni Basit ve kanatlı konik Palamut Beyaz Çok ince Etli, Çok sulu - Çok Az Sofralık, Kurutmalık Kısakürek, Kızılbanki Kızılvanki Omuzlu, dallı Kısa oval Kırmızımsı Orta kalın Gevrek etli, Az sulu - Tatlı Çok Sofralık Gürsöz,

Çizelge..'nin devamı Muhammediye Omuzlu Yuvarlak Yeşil-sarı Orta kalın Etli, Sulu - Tatlı Çok Sofralık Gürsöz, konik Hatunparmağı Kadınparmağı, Dallı, omuzlu Uzun oval Yeşil-sarı İnce Dolgun etli, Az - Çok Çok Sofralık, Gürsöz, (beyaz) İnekmemesi konik sulu Kurutmalık Hönüsü Humusu, Hömüsü Omuzlu, dallı konik Uzun oval Kırmızı-siyah Orta kalın Gevrek etli, Az sulu - Tatlı Çok Sofralık Gürsöz, Künefi Konik omuzlu Yuvarlak Kırmızımsı Kalın Gevrek etli, Orta sulu - Tatlı Orta Sofralık Gürsöz, Çilorut Seyrekazezi, Çörtükazezi Dallı konik Enli yumurta Yeşil-sarı Orta kalın Etli, Sulu - Orta Çok Sofralık, Şıralık Gürsöz, Dökülgen Şirelik, Hüveydi Dallı, omuzlu Hafif oval Yeşil-sarı Orta kalın Dolgun etli - Tatlı Çok Sofralık, Şıralık Şaraplık, Gürsöz, Sarıkabarcık Kanatlı konik Yuvarlak Açık sarımtırakyeşil İnce Yumuşak etli ve Çok sulu - Çok Çok Pekmez, Şaraplık Kısakürek, Gülgülü Künefi Konik ve piramit Yuvarlak Kırmızı Kalın Etli, Az sulu - Tatlı Orta Sofralık Kısakürek, Kara Yürükkara, Terazi karası Kanatlı konik Yuvarlak Kırmızı-siyah Kalınca Dolgun etli, Az sulu - Tatlı Az Sofralık Gürsöz, Horoz karası Kilis karası Omuzlu, dallı konik İğde, küt iğ Kırmızı-siyah Kalın Dolgun etli, Orta sulu - Orta Çok Sofralık, Şaraplık, Gürsöz, Kurutmalık Horozyüreği Konik Yumurta Morumtrak İnce Gevrek etli - Kokulu Orta Sofralık Kısakürek, koyu siyah Balüzümü Konik Uzunca Yeşil-sarı İnce Yumuşak etli, - Çok Orta Sofralık Gürsöz, yuvarlak Sulu Çiloreş Kızlar, Omuzlu Kısa oval Yeşil-sarı Orta kalın Etli, Sulu - Orta Çok Sofralık, Şaraplık Gürsöz, Kızlartahtası, konik Kızıltahtası, Yıldız Dallı konik Yuvarlak oval Yeşil-sarı Orta kalın Yumuşak etli, Az sulu - Tatlı Orta Sofralık Gürsöz, Ağbanki Ağvanki Dallı konik Kısa oval Yeşil-sarı Kalın Etli, Sulu - Orta Çok Sofralık Gürsöz, Serpenekıran Konik, omuzlu Yuvarlak Yeşil-sarı İnce Yumuşak etli, Çok sulu - Az Çok Sofralık, Şıralık Gürsöz, Devegözü Yalangöz Omuzlu dallı, konik Yuvarlak Yeşil-sarı Orta kalın Dolgun etli, Sulu - Orta Az Sofralık Gürsöz,

Çizelge..'nin devamı Kışüzümü Omuzlu Karakurnur Talikireş, Reşki, Karakondur, Sergi karası, Yeşilsaplı, Tirireş, Çöpü yeşil konik Omuzlu Azezi Beziki sarısı Konik silindirsel Oğlak karası Antep karası, Omuzlu Karalık, Çöpü yeşil Hafif oval Yeşil-sarı Kalınca Yumuşak etli, Orta sulu Uzun Kırmızı-yeşil Kalın Etli, Az sulu, oval, sivri Kekremsi iğ şekilli - Orta Orta Sofralık Gürsöz, - Tatlı Orta Kurutmalık Gürsöz, Oval Sarı-yeşil İnce Etli, Sulu - Tatlı Çok Sofralık, Şıralık Gürsöz, İğde, küt Kırmızı-siyah Kalın Etli, Az sulu - Kekremsi Orta Kurutmalık Gürsöz, iğ Hatunparmağı* Kadınparmağı, Dallı, omuzlu Uzun oval Yeşil-sarı İnce Dolgun etli, Az - Çok Çok Sofralık, Gürsöz, (beyaz) İnekmemesi konik sulu Kurutmalık Öküzgözü* Çavgolik Omuzlu dallı Yuvarlak Kırmızı-siyah Kalın Yumuşak etli, Çok sulu - Orta Orta Şaraplık, Sofralık Gürsöz, Künefi* Konik, omuzlu Yuvarlak Kırmızımsı Kalın Gevrek etli, Orta sulu - Tatlı Orta Sofralık Gürsöz, Karaalaca* Terazi karası, Yürük karası Kanatlı konik Yuvarlak Kırmızı-siyah Kalınca Dolgun etli, Az sulu - Kekremsi Az Erkenci sofralık Gürsöz, Üvezi* Dallı konik Söbü Beyaz Orta Etli gevrek - Tatlı *T.B.A.E'de Tosbağakabarcığı* Konik, omuzlu Yuvarlak Yeşil-sarı Orta kalın Yumuşak etli, Az sulu - Orta Çok Sofralık, Şıralık Gürsöz, Yediveren* Ariş Omuzlu konik Yuvarlak Kırmızı-siyah Kalın Dolgun etli, Sulu - Orta Çok Sofralık, Şıralık Gürsöz, Dökülgün* Şirelik, Hüveydi Dallı, omuzlu konik Hafif oval Yeşil-sarı Orta kalın Dolgun etli - Tatlı Çok Sofralık, Şıralık Şaraplık, Gürsöz, Rumi* Konik Yuvarlak Beyaz Kalın Dolgun etli, Çok sulu - Tatlı Çok Sofralık, Şıralık, Kurutmalık *T.B.A.E'de gözlemler Hönüsü* Dallı konik Silindirik Kırmızı Kalın Gevrek etli, Az sulu - Tatlı Çok Sofralık *T.B.A.E'de gözlemler Dımışkı* Omuzlu, Konik Uzun oval Yeşil-sarı Orta kalın Dolgun etli, Orta sulu - Tatlı çok Sofralık, Kurutmalık *T.B.A.E' de gözlemler * T. B. A. E: Tekirdağ Bağcılık Araştırma Enstitüsü' den (Milli Koleksiyon Bağı) alınan çeşitler

Çizelge.. Araştırmada kullanılan Şanlıurfa iline ait üzüm çeşitleri (genotipleri) ve bunların kısa ampelografik özelikleri. No Çeşitler Sinonimleri Salkım Şekli Tane Şekli Tane Rengi Tane Kabuğu Tane İçi Hönüsü Hömüsü, Omuzlu, dallı Uzun oval Kırmızı Kalın Gevrek etli, Antepüzümü Az sulu Şire Kanatlı konik Yuvarlak Yeşil-sarı Orta kalın Yumuşak etli, Sulu Sergi karası Cibin, Reşik, Omuzlu Tirireş Oğlan konik karası, Oğlak karası, Rehani, Çöpüyeşil, Kocaboğan, İnekmemesi, Keçiemceği, Cibin Omuzlu Uzun oval, Sivri iğ şekilli Tilgören Tümbo, Tümbü, Reşik, Tirireş, Karaoğlan Çiloreş Kızlar, Kızlartahtası, Kızıltahtası, Omuzlu, dallı konik Omuzlu konik Uzun oval Kırmızı-siyah Kalın Etli, Sulu - Orta,, Kekremsi Yuvarlak Kırmızı-siyah Kalın Etli, Az sulu Kırmızı-siyah Orta kalın Yumuşak etli, Sulu Çekirdek Sayısı Tadı Verimlilik Değerlendirme Şekli Kaynak - Tatlı Çok Sofralık Gürsöz, Orta Orta Şıralık, Şaraplık Gürsöz, Orta Kurutmalık Gürsöz, - Kekremsi - Normal Kısa oval Yeşil-sarı Orta kalın Etli, Sulu - Orta Çilorut Seyrekazezi, Çörtükazezi Dallı konik Enli yumurta Yeşil-sarı Orta kalın Etli, Sulu - Orta Simore Samırı Silindirsel Yuvarlak Yeşil-sarı İnce Etli, Sulu - Orta Gülgülü Habsorik, Omuzlu, dallı Yuvarlak Pembe Orta kalın Etli, Sulu - Orta Sağteve, Sorik konik Zeyni Balma, Omuzlu Ters Yeşil-sarı Orta kalın Etli, Sulu - Orta Zeynebi, konik yumurta Orta Kurutmalık Gürsöz, Çok Çok Şaraplık, Sofralık Gürsöz, Sofralık, Şaraplık Gürsöz, Çok Sofralık, Şıralık Gürsöz, Orta Sofralık, Şıralık Gürsöz, Orta Sofralık, Şıralık Gürsöz, Orta Sofralık, Şıralık Gürsöz,

Çizelge..'in devamı. Tahannebi Tahannavi, Tahnebi Tahannevi, Kanatlı, dallıkonik Yumurta Yeşil-sarı Orta kalın Yumuşak etli, Sulu - Orta Orta Erkenci sofralık Gürsöz, Tahnavi Zeynebi Abderi Omuzlu, dallı Yumurta Yeşil-sarı Orta kalın Etli, Orta sulu - Tatlı Orta Sofralık, Kurutmalık Bastıkkabarcığı Şire, Omuzlu, dallı Yuvarlak Yeşil-sarı Kalın Yumuşak etli, - Orta Sivereküzümü, konik Sulu Siverekli, Simore Külahi Muhammedi, Habtop, Muhammediye, Beyleri Silindirik Yuvarlak Yeşil-sarı İnce Yumuşak etli, Sulu Omuzlu, dallı konik Yediveren(bağ) Ariş Omuzlu konik Horoz karası Kilis karası Omuzlu, dallı konik Hatunparmağı (beyaz) Zeynebi, İstanbullu, Herzem Azezi Beziki sarısı, Azazi Kayısı Haburik, Biso, Roveger, Mikeri beyazı Omuzlu konik Konik dallı silindirsel Silindirsel konik - Orta Gürsöz, Orta Şıralık, Şaraplık Gürsöz, Orta Şıralık, Şaraplık Gürsöz, Yuvarlak Yeşil-sarı Orta kalın Etli, Sulu - Tatlı Çok Sofralık Gürsöz, Yuvarlak Yuvarlak Kabarcık Sarıkabarcık, Zerik, Zerri, Halebi, Tahannebikardaşı Kırmızısiyah Kırmızısiyah Şarabi Şaraplık Kanatlı Yuvarlak Kırmızısiyah Danaburnu Silindirsel Yuvarlak Kırmızısiyah Kalın Kalın Dolgun etli, Sulu Dolgun etli, Orta sulu Silindirsel Yeşil-sarı Kalın Dolgun etli, Az sulu - Orta - Orta Çok Sofralık, Şıralık Gürsöz, Çok Sofralık, Gürsöz, Şaraplık, Kurutmalık - Çok Çok Sofralık, Kurutmalık Gürsöz, Kısa oval Yeşil-sarı Orta kalın Etli sulu - Tatlı Çok Sofralık, Şıralık Gürsöz, Yuvarlak Yeşil-sarı İnce Yumuşak etli, - Orta Orta Sofralık Gürsöz, Sulu - Şaraplık, Şıralık Kaplan, Kalın Etli, Sulu - Orta Orta Sofralık, Şıralık Gürsöz,

Çizelge..'in devamı. Keçiemceği Sergi karası Omuzlu, konik Uzun oval, Sivri iğ şekilli Kırmızısiyah Kalın Etli, Az sulu - Kekremsi Orta Kurutmalık Gürsöz, Dımışkı Nebidede, Şami Omuzlu, Konik Oval Yeşil-sarı Orta kalın Dolgun etli, Orta sulu - Tatlı Çok Sofralık, Kurutmalık Gürsöz, Muhammediye Külahi Omuzlu, dallı konik Yuvarlak Yeşil-sarı Orta kalın Etli, Sulu - Tatlı Çok Sofralık Gürsöz, Yediveren (çardak) Omuzlu konik Yuvarlak Kırmızısiyah Kalın Dolgun etli, Sulu - Orta Çok Sofralık, Şıralık Gürsöz, Hatunparmağı (siyah) Uzun Silindirsel Uzun oval Kırmızı Orta kalın Gevrek etli, Az sulu - Tatlı Orta Sofralık, Kurutmalık Gürsöz, Elmaüzümü Omuzlu konik Yuvarlak Yeşil-sarı Kalın Etli, Sulu - Orta Orta Sofralık, Şıralık Gürsöz, Karamikeri Karamikri Kanatlı konik Yuvarlak Kırmızısiyah Kalın Gevrek etli, Sulu - Orta Az Erkenci sofralık Gürsöz, Köseni Kösene Dallı konik Kısa oval Pembe Çördüğü Çınaryaprağı Kanatlı silindirsel Yuvarlak Yeşil-sarı Orta kalın Etli, Sulu - Orta Orta Sofralık, Şıralık Gürsöz, Serpenekıran Konik, omuzlu Yuvarlak Yeşil-sarı İnce Yumuşak etli, Çok sulu - Orta Çok Sofralık, Şıralık Gürsöz, Halebi Kayısı, Kabarcık Kanatlı konik Yuvarlak Yeşil-sarı İnce Yumuşak etli, Az sulu - Tatlı Çok Sofralık, Şaraplık, Şıralık Gürsöz, Avderi Kanatlı konik Hafif oval Yeşil-sarı Orta kalın Yumuşak etli, Çok sulu - Az Orta Sofralık, Şıralık Gürsöz, Kızılbanki Omuzlu dallı Kısa oval Pembe Orta kalın Gevrek eti, Az sulu - Tatlı Çok Sofralık Gürsöz, Antepüzümü Omuzlu dallı Uzun oval Kırmızı Kalın Etli, Sulu - Tatlı Çok Sofralık Gürsöz Dusuzu Tiriave, Bülbülü, Avderi Konik silindirsel Yuvarlak Yeşil-sarı Orta kalın Yumuşak etli, Sulu - Az Orta Şıralık Gürsöz, Siyahüzüm Kanatlı Küre Mavi-siyah İnce Yumuşak etli, Sulu Kızlartahtası Omuzlu dallı Kısa oval Yeşil-sarı Orta kalın Yumuşak etli, Orta sulu Orta - Orta Orta Şaraplık, Şıralık Kaplan, Çok Sofralık, Şaraplık Gürsöz

Çizelge..'in devamı. Şefafı Tuluki, Parsı Omuzlu Yuvarlak Yeşil-sarı Orta kalın Etli, Sulu - Orta Orta Şaraplık, Gürsöz, konik Şıralık Simore* Silindirsel Yuvarlak Yeşil-sarı İnce Etli, Sulu - Orta Orta Sofralık, Şıralık Gürsöz,, Çilorut* Dallı konik Yuvarlak Yeşil-sarı Orta kalın Etli, Sulu - Tatlı Çok Sofralık, Şıralık *T.B.A.E'de gözlemler Siverek* Bastık kabarcığı Kanatlı konik Yuvarlak Yeşil-sarı Orta kalın Yumuşak, etli, Sulu - Tatlı Orta Şıralık, Şaraplık *T.B.A.E'de gözlemler Ruhali* Külahi Dallı konik Elips Yeşil-sarı Orta kalın Gevrek etli, Sulu - Tatlı Orta Sofralık *T.B.A.E'de gözlemler Tilgören* Silindirik Yuvarlak Siyah Orta kalın Yumuşak etli, Sulu - Tatlı Çok Şıralık *T.B.A.E'de gözlemler Kayısı* Silindirsel konik Söbü Yeşil-sarı Orta kalın Yumuşak etli, Sulu - Tatlı Orta Sofralık *T.B.A.E'de gözlemler Zerik* Silindirik Yuvarlak Yeşil-sarı Orta kalın Etli, Sulu - Tatlı Orta Kurutmalık *T.B.A.E'de gözlemler Çiloreş* Konik Elips Yeşil-sarı Kalın Gevrek etli - Tatlı Çok Sofralık, Şaraplık *T.B.A.E'de gözlemler Çörtük* Silindirik Söbü Yeşil-sarı Orta kalın Etli, Sulu - Tatlı Orta Sofralık *T.B.A.E'de gözlemler * T. B. A. E: Tekirdağ Bağcılık Araştırma Enstitüsü' den (Milli Koleksiyon Bağı) alınan çeşitler

.. Metot Araştırmada kullanılan RAPD tekniği üç aşamada gerçekleştirilmiştir. Bu aşamalar; DNA izolasyonu, PCR uygulamaları ve Sonuçların değerlendirilmesidir.... DNA izolasyonu Araştırmada kullanılan DNA izolasyon (ekstraksiyon) yönteminde, daha önce değişik araştırıcılar tarafından (Ergül ve Ergül et al., Ağaoğlu vd. ve ) asmalarda kullanılan ve çok iyi sonuç verdiği saptanan Lodhi et al. () tarafından geliştirilmiş metot seçilmiştir. Bu araştırmada kullanılan üzüm çeşidinin sürgün ucundaki yarı açılmış genç yapraklar kullanılarak DNA ekstraksiyonları gerçekleştirilmiştir. Denemede kullanılan bu DNA izolasyonu metodunun aşamaları aşağıda verilmiştir. Lodhi et al. () DNA izolasyon yöntemi:. g yaprak sıvı azot kullanılarak havanda ezildi. Üzerine ml ekstraksiyon buffer eklenerek örnek bu çözelti içersinde homojenize edildi. Karışım ml' lik polypropylene santrifüj tüpüne aktarıldı. Tüpteki karışıma mg polyvinyl polyprolidone (PVPP) eklenerek karıştırıldı ( mg PVPP/g yaprak hesabı ile). Karışım o C'de dk. bekletildikten sonra, oda sıcaklığına kadar soğutuldu. Soğuyan karışım üzerine ml chloroform : octanol (:) ilave edilerek tüp hafif bir şekilde - kez sallandı. rpm'de dk. oda sıcaklığında santrifüj yapıldı. Santrifüj sonucunda üst sıvı yeni bir ml tüpe aktarıldı. Faz renginin berrak olmadığı uygulamalarda ikinci chloroform-octanol ekstraksiyonu gerçekleştirildi ve santrifüj uygulaması yapıldı. Santrifüj sonucunda elde edilen berrak üst faz sıvı kısma hacminin yarısı kadar M NaCl eklendi ve hafifçe çalkalandı. Çalkalama işleminden sonra son hacmin iki katı %'lik soğuk ethanol (- o C) tüpe eklenerek, DNA iplikçiklerinin oluşumu ve gözlenebilmesi amacı ile - dk. gerektiği hallerde hatta daha uzun süre buzdolabı koşullarında bekletildi. Oluşan DNA sarmalları, bir lup (plastik çubuk) yardımı ile alınarak, %'lık soğuk (- o C) içeren.'lik ependorf tüpüne aktarıldılar. DNA'nın çöktürülmesi amacı ile sırası ile ve rpm'de 'er dakikadan toplam dk. santrifüj edildiler. Santrifüj sonunda, sıvı kısmı (ethanol) DNA'dan uzaklaştırmak amacı ile ve DNA'lar kurutulmadan tüpler ters çevrilerek o C'de - dk. beklendi. DNA'ların - µl TE buffer'da çözündürüldüler. Her µl solusyon için µl RNAase A eklendi ve o C'de dk. süre ile bekletilerek RNA uzaklaştırıldı. Denemelerde kullanılan çözeltilerin özellikleri ve hazırlanışları aşağıda verilmiştir.

Çözeltiler Ekstraksiyon buffer: mm sodium EDTA ve mm Tris-HCL (karışım ph.'e HCI ile ayarlandı),, M NaCl ve %,'lik (ağırlık/hacim) CTAB şeklinde hazırlanan çözeltiye %, β-mercapto ethanol kullanım öncesi ilave edildi. Chloroform: Octanol : : (hacim-hacim) NaCI : M TE buffer : mm Tris-HCI ve mm EDTA karışımı (ph.) Rnase A (Sigma R) : mg/ml Yöntemde elde edilen DNA miktarı :,- mg DNA/g taze yaprak dokusu miktarlarında gerçekleşmiştir.... PCR uygulamaları PCR optimizasyonu Araştırmada ön denemeler yapılmış ve çeşit ( Kabarcık, Tahannebi, Abderi, Kızılbanki, Vanki) ile PCR optimizasyonu çalışmaları gerçekleştirilmiştir. PCR optimizasyonu için farklı protokol denenmiş (Çizelge..) ve "MJ PTC Research, INC. Thermocycler" cihazında, Çizelge..'te belirtilen koşularda amplifiye edilmiştir. Çizelge.. PCR reaksiyon karışımları Reaksiyon Protokol No. Protokol No. Bileşimi(µl) Su. (.). (.) Χ Buffer.. MgCl ( mm).. DNTP (. mm). Taq DNA plimeraz.(.).(.) (.= ünite) DNA ( ng) Primer ( ng). Toplam Hacim(µl) Çizelge.. Amplifikasyon koşulları Amplifikasyon No. Amplifikasyon No. o C' de sn. o C de dak. - o C' de dak. - o C'de dak. o C' de. dak. o C de dak. döngü döngü o C de dak. o C de dak. o C de tut o C de tut.

Bu karışım ve koşullarda yapılan denemelerin sonuçlarına göre belirli oranlarda (DNA/su: /,/,/) seyreltilen stok DNA örnekleri; P- ('-GTGACGGACT-') UBC- ('- CTCTCCAGCA-'), OPO- ('-ACGTAGCGTC-'), primerleri denenerek en iyi sonuçların alınabileceği durum araştırılmıştır. Bu sonuçlara göre, Protokol No. (. µl Taq ile) ve Amplifikasyon No. ile en iyi optimizasyon koşulunu vermiştir. Agaroz jel elektroforezi µl yükleme buffer'ı (% sucrose, %. bromofenol blue) eklenen PCR ürünlerinin elektroforezi agaroz jel ortamında gerçekleştirilmiştir. kuyucuklu jel tepsileri kullanılarak %.'lik agarozda X TBE (Trisma Base, Boric Acid, EDTA) buffer'da saat ile Volt'da yürütülen örnekler,. µg/ml ethidium bromide ile boyanmış ve UV altında Polaroid type negatifli siyah-beyaz filimle görüntülenmiştir. Pimerler Araştırmada kullanılan sentetik oligonükleotid olarak denenen primerden (OPA, OPB, OPF, OPO, P, B, S vb. serilerden) daha iyi sonuç veren primer seçilmiş ve RAPD analizleri için kullanılmıştır. Kullanılan primerler ve bunlara ait baz dizilişleri Çizelge..' da verilmiştir. RAPD sonuçlarının tekrarlanabilirliği, yapılan PCR uygulamalarında tüm çeşitlerde primer ile (OPA-, OPO-, ve P) tekrarlanmış ve elde edilen bant profilleri tamamen benzerlik göstermiştir. Ayrıca PCR reaksiyonlarda negatif kontrol (kalıp DNA sız PCR reaksiyonları kullanılması ve bunlarda herhangi bir bandın ortaya çıkmaması, elde edilen bantların kendi DNA ların ait bantlar olduğunu da göstermektedir.... Sonuçların değerlendirilmesi Agaroz jel üzerinde PCR amplifikasyon ürünlerinin oluşturdukları bantlar Polaroid film üzerine görüntülendikten sonra bantların okunmasında sadece kuvvetli bantlar değerlendirmeye alınmışlardır. Oluşan bantlar çeşitlerde ortak (monomorfik) veya farklı (polimorfik) olma durumlarına göre değerlendirilmiş; çeşitlerde var olma yada olmama durumuna göre bantlar "" veya "" şeklinde değerlendirilmiş ve benzerlik indeksleri oluşturulmuştur. Elde dilen RAPD verileri Jaccard benzerlik katsayısına (Jaccard ) göre çeşitler arasındaki genetik Benzeliği saptamak için kullanılmıştır. MVSP yazılım paket programı (Kowach ) benzerlik katsayılarını bulmak için kullanılmış ve elde edilen bu katsayılar "UPGMA cluster" kullanılarak dendogram haline dönüştürülmüştür.

Çizelge.. RAPD analizlerinde kullanılan primerler ve baz dizileri Kullanılan primerler Baz dizisi '-' OPA- '-CAGGCCCTTC-' OPA- '-TGCCGAGCTG-' OPA- '-AATCGGGCTG-' OPA- '-GAAACGGGTG-' OPA- '-GGGTAACGCC-' OPA- '-TTCCGAACCC-' OPA- '-AGGTGACCGT-' OPB- '-GGTGACGCAG-' OPF- '-CCGAATTCCC-' OPF- '-GGGAATTCGG-' OPF- '-GGGATATCGG-' OPO- '-ACGTAGCGTC-' OPO- '-CTGTTGCTAC-' OPO- '-CAGCACTGAC-' OPO- '-TCAGAGCGCC-' OPO- '-GACAGGAGGT-' OPO- '-GGTGCACGTT-' UBC- '-CTCTCCAGCA-' B- '-CGCCCGCAGT-' OD- '-GTGTGCCCCA-' P- '-GGGATTCGAC-' P- '-GTGACGGACT-' P- '-CGGATCGACA-' P- '-GCCGTGATAG-' S- '-GATAGCCGAC-'

. ARAŞTIRMA BULGULARI VE TARTIŞMA.. DNA İzolasyonu Araştırmada kullanılan üç ilimizde (Diyarbakır, Gaziantep ve Şanlıurfa) mevcut üzüm çeşitlerine ait DNA'lar, Lodhi et al. () izolasyon yöntemine göre elde edilmiştir. İzole edilen tüm çeşitlere ait DNA'ların miktar ve saflık oranları (Nanodrop ND Model Spektrofotometre ile ölçülmüştür) incelenmiştir. Çok miktarda ve parçalanmamış DNA izolasyonun belirtisi olarak yükleme hücrelerinde de DNA'lara rastlanılan ve Şekil..,.. ve..'de jel görüntüleri verilen DNA'ların PCR'da kullanılmasına uygun tek bant oluşturduğu görülmüştür. DNA'ların tek bant oluşturmuş olmaları, onların RNA ve hücre sekonder ürünlerden ari sarmal yapılarını koruyarak parçalanmamış olduklarını göstermektedir... PCR Uygulamaları RAPD analizlerinde değerlendirmeye alınan her üç ilin üzüm çeşitlerine ait toplam bant sayısı (n), polimorfik bant sayısı (n) ve polimorfik bant oranları (%) Çizelge..,.. ve..'de verilmiştir. Çizelgeler incelendiğinde, seçilerek kullanılan primerden her üç ilde de toplam bant değerlendirmeye alınmıştır. Diyarbakır iline ait üzüm çeşitlerinden değerlendirmeye alınan bu bantan tanesi polimorfik çıkmış ve tüm bantların polimorfik oranları %. olarak saptamıştır. Gaziantep iline ait üzüm çeşitlerinden elde edilen tüm bantlardan ise tanesi polimorfik olduğu görülmüş ve tüm bantların polimorfik oranları %. olarak bulunmuştur. Şanlıurfa iline ait üzüm çeşitlerinden elde edilen tüm bantlardan tanesi polimorfik bulunurken, banların polimorfik bant oranları %. olarak tespit edilmiştir. Primerler itibariyle değerlendirme yapıldığında, Diyarbakır iline ait üzüm çeşitlerinde en yüksek bant sayısını ( bant) OPO- verirken, en düşük bant sayısı bant ile OPF-, UBC-, P-, ve P- primerlerinde gözlenmiştir. Polimorfik bant sayılarında ise en yüksek değer ( bant) OPA-'de elde edilirken, OPA-, OPA-, OPA-, OPF-, OPO-, OPO- UBC- ve P- primerleri bant sayısı ile en düşük değerleri vermişlerdir. Primerler bazında polimorfik bant oranlarına bakıldığında, en yüksek oran %. ile OPA- ve B- 'da görülürken, en düşük oran OPA- ve OPO-'de %. oranında çıkmıştır. Diğer primerlerdeki polimorfik bant oranları bu değerler arasında saptanmıştır (Çizelge..). Gaziantep iline ait üzüm çeşitlerinde ise yine en yüksek bant sayısını ( bant) OPO- verirken, en düşük bant sayısı bant ile OPF-, UBC- ve P- ve P- primerlerinde görülmüştür. Polimorfik bant sayılarına bakıldığında, en yüksek değer ( bant) OPA-, P- ve P-'da elde edilirken, OPA-, OPA-, OPA-, OPA-, OPF-, OPF-, OPO- ve P- primerleri bant sayısı ile en düşük değerleri vermişlerdir. Kullanılan primerler bazında polimorfik oranları incelendiğinde, en yüksek oran %. ile P-'da görülürken, en düşük oran %. ile OPF-'de saptanmıştır (Çizelge..). Şanlıurfa iline ait üzüm çeşitlerinde kullanılan primerlerden diğer iki ilde görüldüğü gibi en yüksek bant sayısını ( bant) OPO- verirken, en düşük bant sayısı ( bant) OPF-, UBC-, P- ve P- primerlerinde gözlenmiştir. Polimorfik bant sayılarında ise en yüksek değer ( bant) OPA-, OPO- ve P-'de elde edilirken, OPA-, OPA-, OPA-, OPA-, OPF-, OPF-, OPO-, P- ve P- primerleri bant sayısı ile en düşük

değerleri vermişlerdir. Primer bazında polimorfik bant oranları incelendiğinde, en yüksek oran %. ile OPA- ve P-'de görülürken, en düşük değerler OPF-'de %. oranında tespit edilmiştir (Çizelge..). Her üç ilin üzüm çeşitlerinde kullanılan bazı primerlere ait amplifikasyon ürünlerinin jel görüntüleri ise Şekil..,...ve..'de verilmiştir. Çizelge.. Diyarbakır iline ait üzüm çeşitlerinde kullanılan RAPD primerlerine ait toplam bant sayısı (n), polimorfik bant sayısı (n) ve polimorfik bant oranları (%) değerleri Primerler Toplam bant Polimorfik bant Polimorfik bant sayısı (n) sayısı (n) oranları (%) OPA-. OPA-. OPA-. OPA-. OPA-. OPA-. OPA-. OPB-. OPF-. OPF-. OPF-. OPO-. OPO-. OPO-. OPO-. OPO-. OPO-. UBC-. B-. OD-. P-. P-. P-. P-. S-..

Çizelge.. Gaziantep iline ait üzüm çeşitlerinde kullanılan RAPD primerlerine ait toplam bant sayısı (n), polimorfik bant sayısı (n) ve polimorfik bant oranları (%) değerleri Primerler Toplam bant Polimorfik bant Polimorfik bant Sayısı (n) sayısı (n) oranları (%) OPA-. OPA-. OPA-. OPA-. OPA-. OPA-. OPA-. OPB-. OPF-. OPF-. OPF-. OPO-. OPO-. OPO-. OPO-. OPO-. OPO-. UBC-. B-. OD-. P-. P-. P-. P-. S-..

Çizelge.. Şanlıurfa iline ait üzüm çeşitlerinde kullanılan RAPD primerlerine ait toplam bant sayısı (n), polimorfik bant sayısı (n) ve polimorfik bant oranları (%) değerleri Primerler Toplam bant Polimorfik bant Polimorfik bant sayısı (n) sayısı (n) oranları (%) OPA-. OPA-. OPA-. OPA-. OPA-. OPA-. OPA-. OPB-. OPF-. OPF-. OPF-. OPO-. OPO-. OPO-. OPO-. OPO-. OPO-. UBC-. B-. OD-. P-. P-. P-. P-. S-..

Şekil.. Araştırmada kullanılan Diyarbakır ili üzüm çeşitlerine ait DNA ların agaroz jel üzerindeki görüntüleri. Mikeri Balcani Hatunparmağı (beyaz) Vilki Şitu Kızılbanki Kohar Hasani Asuri Zerik Ağek Gençmehmet Şaraplık Iskıcuna Merir Abderi Tahannebi Morek Vanki Şamuzli Şirelik Karik Mazrumi Belelük İm (küçük) Siyahgıldun İm (büyük) Çirbet Beyazgıldun Amarku Avkenek İstanbullu Şekeri Şarabi Luvanek Hatunparmağı (siyah) Kışgıldun Kabarcık Siyahüzüm Şarabi İsimsiz Vanki Morüzüm Tahannebi Abderi Abdullah Tekirdağ daki Çeşitler

Şekil.. Araştırmada kullanılan Gaziantep ili üzüm çeşitlerine ait DNA ların agaroz jel üzerindeki görüntüleri. Mikeri Balcani Hatunparmagi (beyaz) Vilki Situ Kizilbanki Kohar Hasani Asuri Zerik Agek Gençmehmet Saraplik Iskicuna Merir Abderi Tahannebi Morek Vanki Samuzli Sirelik Karik Mazrumi Belelük Im (küçük) Siyahgildun Im (büyük) Çirbet Beyazgildun Amarku Avkenek Istanbullu Sekeri Sarabi Luvanek Hatunparmagi (siyah) Kisgildun Kabarcik Siyahüzüm Sarabi Isimsiz Vanki Morüzüm Tahannebi Abderi Abdullah Tekirdag daki Çesitler

Şekil.. Araştırmada kullanılan Şanlıurfa ili üzüm çeşitlerine ait DNA ların agaroz jel üzerindeki görüntüleri. Hönüsü Sire Sergi karasi Cibin Tilgören Çilores Çilorut Simore Gülgülü Zeyni Tahannebi Zeynebi Bastikkabarcigi Kabarcik Külahi Yediveren (bag) Horoz karasi Hatunparmagi (beyaz) Azezi Kayisi Sarabi Danaburnu Keçiemcegi Dimiski Muhammediye Yediveren (çardak) Hatunparmagi (siyah) Elmaüzümü Karamikeri Köseni Çördügü Serpenekiran Halebi Avderi Kizilbanki Antepüzümü Dusuzu Siyahüzüm Kizlartahtasi Sefafi Simore Çilorut Siverek Ruhali Tilgören Kayisi Zerik Çilores Çörtük Tekirdag daki Çesitler

Tekirdağ daki çeşitler Şekil.. Diyarbakır üzüm çeşitlerinin OPA- " -AGGTGACCGT- " primeri ile oluşturulan PCR amplifikasyon ürünlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüsü. Markör: bp DNA Ladder (Promega). Kontrol: Genomik DNA hariç diğer PCR öğeleri.

Tekirdağ daki çeşitler Şekil.. Diyarbakır üzüm çeşitlerinin OPO- primeri ile oluşturulan PCR amplifikasyon ürünlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri.

Tekirdağ daki çeşitler Şekil.. Diyarbakır üzüm çeşitlerinin P- primeri ile oluşturulan PCR amplifikasyon ürünlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri.

Tekirdağ daki çeşitler Şekil.. Diyarbakır üzüm çeşitlerinin P- primeri ile oluşturulan PCR amplifikasyon ürünlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri.

Tekirdağ daki çeşitler Şekil.. Diyarbakır üzüm çeşitlerinin S- primeri ile oluşturulan PCR amplifikasyon üzümlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri.

Tekirdağ daki çeşitler Şekil.. Gaziantep üzüm çeşitlerinin OPA- primeri ile oluşturulan PCR amplifikasyon ürünlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri.

Tekirdağ daki çeşitler Şekil.. Gaziantep üzüm çeşitlerinin OPO- primeri ile oluşturulan PCR amplifikasyon ürünlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri.

Tekirdağ daki çeşitler - Şekil.. Gaziantep üzüm çeşitlerinin P- primeri ile oluşturulan PCR amplifikasyon ürünlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri.

Tekirdağ daki çeşitler Şekil.. Gaziantep üzüm çeşitlerinin P- primeri ile oluşturulan PCR amplifikasyon ürünlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri.

Tekirdağ daki çeşitler Şekil.. Gaziantep üzüm çeşitlerinin S- oluşturulan PCR amplifikasyon ürünlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri.

Tekirdağ daki çeşitler Şekil.. Şanlıurfa üzüm çeşitlerinin OPA- primeri ile oluşturulan PCR amplifikasyon ürünlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri.

Tekirdağ daki çeşitler Şekil.. Şanlıurfa üzüm çeşitlerinin OPO- primeri ile oluşturulan PCR amplifikasyon ürünlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri.

Tekirdağ daki çeşitler Şekil.. Şanlıurfa üzüm çeşitlerinin P- primeri ile oluşturulan PCR amplifikasyon ürünlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri.

Tekirdağ daki çeşitler Şekil.. Şanlıurfa üzüm çeşitlerinin P- primeri ile oluşturulan PCR amplifikasyon ürünlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri.

Tekirdağ daki çeşitler Şekil.. Şanlıurfa üzüm çeşitlerinin S- primeri PCR amplifikasyon ürünlerinin agaroz jel üzerindeki görüntüleri.

.. Benzerlik indeksi ve genetik ilişki dengogramı... Benzerlik indeksi Çeşitler arası benzerlik oranları benzerlik indeksi formülüne dayanılarak elde edilmektedir. Her üç ilin üzüm çeşitlerine ait benzerlik oranları Çizelge..,. ve..'da verilmiştir. Diyarbakır iline ait üzüm çeşitlerindeki benzerlik oranları incelendiğinde (Çizelge..), benzerlik düzeyi en düşük. oran ile Amarku()-Hasani() çeşitleri arasında görülürken, en yüksek genetik benzerlik ise. ile Çirbet()-Şaraplık() arasında tespit edilmiştir. Bunu.,. ve. yüksek benzerlik oranları ile Abderi*()-Vilki(), Morek()- Şaraplık() ve Mazrumi()-Şirelik() kombinasyonları takip etmiştir. Ayrıca ikili çeşit kombinasyonunda.'in üzerinde bir benzerlik oranı elde edilirken, ikili çeşit kombinasyonunda ise.'in altında düşük değerli benzerlikler açığa çıkmıştır. Bunu dışında kalan ve Benzerlik İndeksi'in büyük grubunu oluşturan ikili çeşit kombinasyonları ise.-. arasında benzerlik oranları meydana getirmiştir. Gaziantep iline ait üzüm çeşitlerinde ise (Çizelge..) benzerlik düzeyi en düşük. oranı ile Timbo()-Rumi*() çeşitleri arasında görülürken, en yüksek genetik benzerlik ise. ile Dımışkı()-Külahi() arasında tespit edilmiştir. Bunu.,. ve. yüksek benzerlik oranı ile Sarıkabarcık()-Tosbağakabarcığı*(), Hönüsü()-Hönüsü*() ve Serpenekıran()-Tosbağakabarcığı*() kombinasyonları takip etmiştir. Bu ile ait ikili çeşit kombinasyonunda.'ün üzerinde bir benzerlik oranı elde edilirken, ikili çeşit kombinasyonunda.'ün ve ikili çeşitte.'ün altında düşük oranda benzerlikler göstermiştir. Bunun dışında kalan yine benzerlik indeksin büyük grubunu oluşturan ikili çeşit kombinayonlarında ise.-. arasında benzerlik oranları gerçekleşmiştir. Şanlıurfa iline ait üzüm çeşitlerinin benzerlik oranlarına bakıldığında (Çizelge..) Bu ile ait çeşitler arasında benzerlik düzeyi en düşük. oranı ile Külahi()-Kızılbanki()çeşitleri arasında görülürken, en yüksek genetik benzerlik ise. ile Çilorut()-Dökülgen() arasında gözlenmiştir. Bu çeşitleri.,. ve. yüksek benzerlik oranları ile Sergikarası()-Kara(), Çilorut()-Horozkarası() ve Şekeri()-Horozkarası() kombinasyonları izlemiştir. Ayrıca ikili çeşit kombinasyonunda.'ün üzerinde bir benzerlik oranı elde edilirken, ikili çeşit kombinasyonunda. ve ikili çeşit kombinasyonunda ise.'ün altında düşük benzerlik göstermişlerdir. Bunların dışında kalan ikil çeşit kombinasyonlarında ise.-. arasında benzerlik oranları görülmüştür.