Metilentetrahidrofolat Redüktaz (Mthfr) C677t ve A1298c Gen Polimorfizmleri



Benzer belgeler
Anahtar kelimeler: Kronik böbrek yetmezliği, MTHFR, A1298C, C677T

MTHFR geninde c677t ve/veya a1298c polimorfizmi tespit edilen bireylerde bu polimorfizm sıklıklarının incelenmesi

Metilen Tetrahidrofolat Redüktaz Enzim Polimorfizmlerinde Perinatal Sonuçlar DR. MERT TURGAL

Parkinson Hastalığı ile α-sinüklein Geni Polimorfizmlerinin İlişkisinin Araştırılması

Akut İnme Hastalarında Risk Faktörü Olan Homosistein Düzeyine MTHFR Gen Polimorfizmlerinin Etkisi*

Metilentetrahidrofolat Redüktaz (MTHFR) Enziminin Moleküler Biyolojisi ve Hastalıklarla İlişkisi*

ARAŞTIRMA (Research Report)

SNP TEK NÜKLEOTİD POLİMORFİZMLERİ (SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS)

MOLEKÜLER TANISI DÜZEN GENETİK HASTALIKLAR TANI MERKEZİ. SERPİL ERASLAN, PhD

ARAŞTIRMA. MTHFR Geni C677T ve A1298C Polimorfizmlerinin Diyabetik Nöropati Etiyopatogenezindeki Rolü *,**

IL28B genotip tayini kronik hepatit B hastalarında oral antiviral tedavi cevabını öngörmede kullanılabilir mi?

Erkek infertilitesinde metiyonin sentaz A2756G ve metiyonin sentaz redüktaz A66G gen polimorfizmlerinin etkisi

KRONİK BÖBREK HASTALIĞI (YETMEZLİĞİ) OLAN TÜRK HASTALARINDA TÜMÖR NEKROZ FAKTÖR ALFA ve İNTERLÖKİN-6 PROMOTER POLİMORFİZMLERİNİN ETKİSİ

I. Projenin Türkçe ve İngilizce Adı ve Özetleri İvesi Koyunlarında mikrosatellite lokuslarında polimorfizmin tespiti Güneydoğu Anadolu Tarımsal Araştı

Kırım Kongo Kanamalı Ateş hastalarında ağırlık ve ölüm riskinin tahmininde plazma cell-free DNA düzeyinin önemi

Sivas Populasyonunda Faktör V Genin Leiden (G1691a) ve Hr2 (A4070g) Polimorfizmleri

Mendel Dışı kalıtım. Giriş

ADIM ADIM YGS LYS Adım EKOLOJİ 15 POPÜLASYON GENETİĞİ

MİDE KANSERİNDE APOPİTOZİSİN BİYOLOJİK BELİRTEÇLERİNİN PROGNOSTİK ÖNEMİ

RENAL TRANSPLANT ALICILARINDA C5aR 450 C/T GEN POLİMORFİZMİ: GREFT ÖMRÜ İLE T ALLELİ ARASINDAKİ İLİŞKİ

Antalya İlindeki Beta-Talasemi Gen Mutasyonları, Tek Merkez Sonuçları

GÖĞÜS HASTALIKLARINDA GENETİK ARAŞTIRMA. Prof. Dr. Nejat Akar Ankara Üniversitesi

Muş İlinde Tekrarlayan Gebelik Kayıpları İle Mthfr C677t ve A1298c ve Pai-1 4g/5g Polimorfizmleri Arasındaki İlişki ve Alel Frekansları

Major Depresif Bozukluk (MDD) Dünyada maluliyete sebep olan en sık ikinci hastalık Amprik tedavi yaklaşımı İlaca yanıt Yan etki bireysel farklılıklar

Anensefalide Gebelerin Folat ve Vitamin B12 Düzeyleri ile Faktör V Leiden, Faktör II G20210A, MTHFR C667T ve MTHFR A1298C Polimorfizlerinin Önemi

İstanbul Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji AD Prof. Dr. Filiz Aydın

SAĞ VE SOL KOLON YERLEŞİMLİ TÜMÖRLER: AYNI ORGANDA FARKLI PATOLOJİK BULGULAR VE MİKROSATELLİT İNSTABİLİTE DURUMU

14 Aralık 2012, Antalya

En Etkili Kemoterapi İlacı Seçimine Yardımcı Olan Moleküler Genetik Test

ÖZET Amaç: Yöntem: Bulgular: Sonuçlar: Anahtar Kelimeler: ABSTRACT Rational Drug Usage Behavior of University Students Objective: Method: Results:

Dr. U ur DEL GEZER, Dr. Ebru E. AKIfiIK, Dr. Nejat DALAY. stanbul Üniversitesi Onkoloji Enstitüsü Temel Onkoloji AbD

KOLOREKTAL KARSİNOMLARDA HPV NİN ROLÜ VE KARSİNOGENEZ AÇISINDAN P53 VE BCL-2 İLE İLİŞKİSİ

AF Konusunda Klinik Pratikte Kullanılan Genetik Çalışmalar Türkiye de Durum Ne?

KOLOREKTAL KANSERLERİN MOLEKÜLER SINIFLAMASI. Doç.Dr.Aytekin AKYOL Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Patoloji Anabilim Dalı 23 Mart 2014

HEMODİYALİZ HASTALARININ GÜNLÜK YAŞAM AKTİVİTELERİ, YETİ YİTİMİ, DEPRESYON VE KOMORBİDİTE YÖNÜNDEN DEĞERLENDİRİLMESİ

Light Cycler Real Time PCR Teknolojisi ile Faktör V Geninde Yeni Mutasyon Taranması

attomol apo B-100 quicktype

GENETİK DOKTORA PROGRAMI DERS TANITIM TABLOSU

KRONİK VİRAL HEPATİT C Lİ HASTALARDA IL28B NİN İNTERFERON TEDAVİSİNE YANITLA İLİŞKİSİ. Dr. Gülay ÇEKİÇ MOR

KOLOREKTAL KARSİNOMLU HASTALARDA PRİMER İLE METASTAZ ARASINDA KRAS DİSKORDANSI

Diafragmatik Herni. Prof. Dr. E. Ferda Perçin Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Genetik AD Ankara-2018

TÜRKİYE DE BULUNAN BAZI YERLİ SIĞIR IRKLARININ GENETİK YAPILARININ KARAKTERİZASYONU

MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS KOMPLEKS KLİNİK İZOLATLARINDA İZONİAZİD DİRENCİNE NEDEN OLAN DIŞA ATIM POMPALARININ SAPTANMASI

Dr. Nilay HAKAN Muğla Sıtkı Koçman Üniv. Tıp Fak. Neonatoloji Bilim Dalı Perinatal Medicine Nisan 2017, İZMİR

ÇANAKKALE ONSEKİZ MART ÜNİVERSİTESİ TIP FAKÜLTESİ Eğitim Yılı

POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU (PZR-PCR) VE RESTRİKSİYON PARÇA UZUNLUĞU POLİMORFİZMİ (RFLP)

GENETİK HASTALIKLARDA TOPLUM TARAMALARI

AİLESEL AKDENİZ ATEŞİ (AAA-FMF)

Spina bifida hastalarında metilen tetrahidrofolat redüktaz, TEAD2 ve PAX3 gen polimorfizmlerinin araştırılması

Tartışma. Dr.Ali Arıcan

Çocuk ve Yetişkin Üriner Escherichia coli İzolatlarında Plazmidik Kinolon Direnç Genlerinin Araştırılması

POYRAZ TIBBİ CİHAZLAR EDVOTEK

DÖNEM 1- A, 3. DERS KURULU ( )

Servikal Erozyon Bulgusu Olan Kadınlarda HPV nin Araştırılması ve Genotiplerinin Belirlenmesi

NON NÖROJENİK NÖROJENİK MESANE ve ÜROFASİAL (OCHOA) SENDROM OLGULARINDA HPSE2 GEN DEĞİŞİMLERİNİN ARAŞTIRILMASI

Isırıkla İlgili Literatür İncelemesi

2 Çeşit Populasyon mevcuttur. Gerçek/Doğal Populasyonlar: Örneğin yaşadığınız şehirde ikamet eden insanlar.

b. Amaç: Gen anatomisi ile ilgili genel bilgi öğretilmesi amaçlanmıştır.

¹GÜTF İç Hastalıkları ABD, ²GÜTF Endokrinoloji Bilim Dalı, ³HÜTF Geriatri Bilim Dalı ⁴GÜTF Biyokimya Bilim Dalı

Dikkat Eksikliği Hiperaktivite Bozukluğu ve Doğum Mevsimi İlişkisi. Dr. Özlem HEKİM BOZKURT Dr. Koray KARA Dr. Genco Usta

Kromozom, DNA ve Gen. Allel Segregasyonu. DNA çift sarmalı. Hastalık yapan mutasyonlar protein fonksiyonunu bozar. Hastalık yapan mutasyonlar

NAZOFARENKS KARSİNOMUNDA CLAUDIN 1, 4 VE 7 EKSPRESYON PATERNİ VE PROGNOSTİK ÖNEMİ

Kantitatif özellikler

AKRABA EVLİLİGİ OLAN 101 GEBEDE UL TRASONOGRAFİK BULGULARI(*) ÖZET SUMMARY. Akraba evlilikleri, arkabalık derecesine

Mutasyon: DNA dizisinde meydana gelen kalıcı değişiklik. Polimorfizm: iki veya daha fazla farklı fenotipin aynı tür popülasyonunda bulunmasıdır.

Populasyon Genetiği. Populasyonlardaki alel ve gen frekanslarının değişmesine neden olan süreçleri araştıran evrimsel bilim dalı.

I. YARIYIL MOLEKÜLER HÜCRE BİYOLOJİSİ I (TBG 601, ZORUNLU, TEORİK 3, 3 KREDİ)

Özgün makale / Original article Şilfeler ve ark. 1

Hemodiyaliz hastalarında resistin ile oksidatif stres arasındaki ilişkinin araştırılması

MEME KANSERİ HASTALARINDA JAM-A VE LFA-1 GEN VARYASYONLARININ ETKİSİNİN İNCELENMESİ

HPV Moleküler Tanısında Güncel Durum. DNA bazlı Testler KORAY ERGÜNAY 1.ULUSAL KLİNİK MİKROBİYOLOJİ KONGRESİ

Hemoglobinopatilerde Tanı Yönetimi Genetik Testler

Prolidaz; Önemi ve güncel yaklaşımlar

İstanbul Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji ABD Prof. Dr. Filiz Aydın

daha çok göz önünde bulundurulabilir. Öğrencilerin dile karşı daha olumlu bir tutum geliştirmeleri ve daha homojen gruplar ile dersler yürütülebilir.

Fetal Spina Bifida: Tanı ve Yaklaşım. Prof. Dr. E. Ferda Perçin Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Genetik AD. Ankara- 2018


PEDİATRİK MAKROTROMBOSİTOPENİLİ OLGULARDA MYH9 & TUBB1 GEN MUTASYONLARI

ÇOCUKLUK ÇAĞI PAPİLLER TİROİD KANSERİNDE BRAF V600E MUTASYONU İLE KLİNİKOPATOLOJİK ÖZELLİKLER ARASINDAKİ İLİŞKİ VE NÜKS ORANI ÜZERİNE ETKİSİ

kime aittir sorusuna cevap aranır.

18.Eyl Rektörlük Programı Eğitim Köyü Pazartesi Rektörlük Programı Eğitim Köyü Rektörlük Programı Eğitim Köyü

NEİSSERİA MENİNGİTİDİS SEROGRUP B AŞI ANTİJENLERİNİN GENETİK ANALİZİ: MENB AŞILARI TÜRKİYE İZOLATLARINI KAPSIYOR MU?

KANSER HASTALARINDA ANKSİYETE VE DEPRESYON BELİRTİLERİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ UZMANLIK TEZİ. Dr. Levent ŞAHİN

EĞİTİM - ÖĞRETİM YILI DÖNEM I. III. KURUL DERS PROGRAMI GENETİK BİLGİNİN AKIŞI- DOKUYA GİRİŞ (15 Ocak Mart 2018 )

The Study of Relationship Between the Variables Influencing The Success of the Students of Music Educational Department

TIBBİ BİYOKİMYA ANABİLİM DALI LİSANSÜSTÜ DERS PROGRAMI

EĞİTİM - ÖĞRETİM YILI DÖNEM I. III. KURULDERS PROGRAMI GENETİK BİLGİNİN AKIŞI - DOKUYA GİRİŞ (15 Ocak Mart 2018 )

Moleküler Patoloji Doktora Programı 2013 Bahar Dönemi Ders Programı:

HEMODİYALİZ HASTALARININ HİPERTANSİYON YÖNETİMİNE İLİŞKİN EVDE YAPTIKLARI UYGULAMALAR

MTHFR 677 C>T Polimorfizmi ile ilintili olduğu düşünülen hastalıklara dair Türk populasyonundaki çalışmalar

T A D. Retrospektif moleküler bir çalışma: FMF ön tanısı alan hastalarda MEFV gen mutasyonları ARAŞTIRMA

GENETİK POLİMORFİZMLER. Prof. Dr. Filiz ÖZBAŞ GERÇEKER

HANDAN TUNCEL. İstanbul Üniversitesi, Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Biyofizik Anabilim Dalı

EĞİTİM - ÖĞRETİM YILI DÖNEM I. III. KURULDERS PROGRAMI GENETİK BİLGİNİN AKIŞI- DOKUYA GİRİŞ (16 Ocak Mart 2017 )

Mthfr, Vkorc1 Gen Mutasyonlu Tek Yumurta İkizlerinde Pulmoner Tromboemboli

α1-antitrypsin quicktype

T.C. SELÇUK ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ

PRİMER HİPEROKSALÜRİ TİP 1 DE GENETİK TANI

Tip 2 Diyabetli Bireylerde Mthfr C677T ve A1298C Gen Polimorfizmleri ile Diyabetik Retinopati Arasındaki İlişkinin İncelenmesi

Human Papillomavirüs DNA Pozitif ve E6/E7 mrna Negatif, Anormal Sitolojili Servikal Örneklerin Genotiplendirilmesi

Transkript:

ARAŞTIRMA / RESEARCH REPORT İnönü Üniversitesi Tıp Fakültesi Dergisi 16 (3) 157-161 (2009) Metilentetrahidrofolat Redüktaz (Mthfr) C677t ve A1298c Gen Polimorfizmleri Nadir Koçak*, Filiz Özen**, Malik Ejder Yıldırım***, Öztürk Özdemir**** * Konya Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Konya ** Göztepe Eğitim ve Araştırma Hastanesi, İstanbul *** Sivas Devlet Hastanesi, Sivas **** Cumhuriyet Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Genetik Anabilim Dalı, Sivas Amaç: Metilentetrahidrofolat redüktaz (MTHFR) folat metabolizmasının önemli bir enzimidir. İnsan MTHFR geni kromozom 1p36.3 de lokalizedir ve 563 amino asitten oluşan MTHFR enzimini kodlamaktadır. MTHFR geninde enzimin inaktivasyonu ile sonuçlanan bazı mutasyonlar kardiyovasküler ve serebrovasküler hastalıklar için önemli risk faktörleri olarak hiperhomosisteinemi ve homosistinüriye neden olur. Çok sayıdaki literatür verisine göre, MTHFR geninin polimorfik varyantları hiperhomosisteinemi, vasküler patolojiler, nöral tüp defektleri, demans, perinatal mortalite, mental bozukluklar, nörodejeneratif bozukluklar, migren ve kanser ile ilişikilidir. Bu çalışmanın amacı, MTHFR genindeki C677T ve A1298C polimorfizmlerinin allel frekansını saptamakdır. Bu amaçla, Sivas çevresinden rastgele seçilmiş 222 bireyde (109 erkek ve 113 kadın) MTHFR geninin C677T ve A1298C polimorfizmlerinin allel frekansı araştırıldı. Materyal ve Metod: Hasta grubunu Sivas bölgesinde ikamet eden bireyler arasında rastgele seçtik. 109 erkek ve 113 kadın olmak üzere toplam 222 kişi çalışmamıza dahil edildi. Çalışma grubunun bireyleri, çalışmanın amacı hakkında bilgilendirildi ve yazılı onam belgesi imzalatıldı. Çalışma grubuna aynı zamanda bir anket formu dolduruldu. Gen mutasyonlarını belirlemek için periferik kan örneklerinden DNA izolasyonu yapıldı. Mutasyon analizi revers hibridizasyon prensiplerine dayanan strip assay tekniğiyle yapıldı. Veriler SPSS 15.0 istatistik programı kullanılarak analiz edildi. Bulgular: 677 CT genotipinin Sivas çevresinde frekansı %54, 677 CC nin %42 ve 677 TT nin %4 olarak saptandı. Ayrıca, A1298C genotipinin Sivas çevresindeki frekansı %46, 1298 AA nın %46 ve 1298 CC nin %9 idi. MTHFR 677 T allelinin ve MTHFR 1298 C allelinin allel frekansları ise her ikisi için % 31 di. Anahtar Sözcükler: Metilentetrahidrofolat Redüktaz, Polimorfizm, Homosistein The C677t and A1298c Polymorphisms of Methylenetetrahydrofolate Reductase (Mthfr) Gene Aim: Methylenetetrahydrofolate reductase is an important enzyme of folate metabolism. Human MTHFR gene is localized to chromosome 1p36.3 and coded MTHFR enzyme which consists of 563 amino acids. Some mutations seen in the MTHFR gene, resulting in the inactivation of the enzyme, cause hyperhomocysteinemia and homocystinuria as being important risk factors for cardiovascular and cerebrovascular diseases. According to the numerous literature data, polymorphic variant of the MTHFR-encoding gene, is associated with hyperhomocysteinemia, vascular pathologies, neural tube defects, dementia, perinatal mortality, mental disorders, neurodegenerative disorders, cancer and migraine. The aim of this study was to determine allelic frequencies of the polymorphic MTHFR gene C677T, A1298C. In this regard, we have investigated the allelic frequencies of C677T and A1298C polymorphisms of the MTHFR gene in 222 (109 females and 113 males) randomized individuals around Sivas. Materials and Methods: The study group was selected between individuals residing in Sivas. Total 222 subjects (109 men and 113 woman) were enrolled in the study. The subjects were informed of the purpose of the study and signed a written consent, which had previously been approved by the Ethical Committee. They also filled out questionnaire. DNA isolation was performed from peripheral blood samples such that thegene polymorphisms were determined. The mutation analysis was performed by StripAssay technique which is based on the Reverse-Hybridization principle automatically. Data were analyzed by SPSS 15.0 package program. Results:: The frequency in around Sivas of the C677T genotype was 54%; of C677C, 42%; and of T677T, 4%. The frequency in around Sivas of 1298 AC genotype was 46%; of A1298A, 46%; and of C1298C, 9%. The allelic frequencies of the T allele of MTHFR 677 and the C allele of MTHFR 1298 were both 31%. Key Words: Methylenetetrahydrofolate Reductase, Polimorphism, Homocysteine Metilentetrahidrofolat redüktaz (MTHFR) enzimi, folat metabolizmasında önemli bir enzimdir. İnsan MTHFR Başvuru Tarihi: 16.11.2009, Kabul Tarihi: 18.01.2010 geni, kromozom 1p36.3 de lokalize olmuştur ve 656 aminoasitten oluşan MTHFR enzimini kodlar. 1,2 MTHFR, 5,10 metilentetrahidrofolatı (5,10-metilen 157

Koçak ve ark. THF) irreversible olarak 5-metil tetrahidrofolata (5- metil THF) dönüştürür. 5-metil THF; DNA metilasyonu ve metiyonin sentezi için metil grubu sağlar. 5,10- metilen THF ise deoksiüridilatın timidilata dönüşümünde kullanılırken bir taraftan da pürin sentezi için 10-formil THF a okside olmaktadır. 3,4 MTHFR geninde meydana gelen bir mutasyon (en yaygın olanı C677T polimorfizmi) enzim aktivitesini azaltmaktadır. 2,3 Azalan MTHFR aktivitesi sonucunda 5-metil THF düzeyi azalmakta, 5,10- metilen THF miktarı ile plazma homosistein düzeyi artmaktadır. 4-6 Hiperhomosisteinemi ve homosisteinürinin ortaya çıktığı ciddi MTHFR eksikliğinde, periferal nöropati, gelişme geriliği, hipotonia, strok, tromboz gibi klinik özellikler görülür. MTHFR eksikliğinin hafif olduğu durumlara populasyon genelinde oldukça sık rastlanmakta olup, özellikle arterial hastalıkların oluşumunda bir risk faktörü olduğu ileri sürülmektedir. 7-9 MTHFR geninde görülen bazı mutasyonlar, kardiyovasküler ve serebrovasküler hastalıklar için önemli bir risk faktörü olan hiperhomosisteinemi ve homosisteinüri oluşmasına neden olur. 3-6,10 Mutant T allelinin, nöral tüp defektleri için risk faktörü olduğu ileri sürülmektedir. Yine nöral tüp defektlerinde kan folat seviyesinin düşük olması da önemli bir risk faktörüdür. Yapılan çalışmalar, MTHFR polimorfizmi ile birlikte oluşan folat eksikliğinin, nöronal gelişimi etkilediği ve nöral tüp kusuru oluşumunu arttırdığını göstermiştir. 3,11,12 MTHFR polimorfizminden kaynaklanan azalan enzim aktivitesi, tümör süpressör genlerin stabilitesini ve hipometilasyonunu etkiler. Akciğer kanserli hasta örnekleri ile yapılan çalışmalarda, 677T allelinin, bir tümör süpressör gen olan p16 nın ekspresyonunun artışı ile ilişkili olduğu gösterilmiştir. 13,14 677T allelinin, muhtemelen, yeterli folat alınımı ile bireylerde timin ve pürin sentezi için artan 5,10 metilentetrahidrofolat düzeyi oluşturarak, koleraktel kanser riskini azalttığı ileri sürülmüştür. 2,15 677T allelinin akciğer kanseri, lösemi ve kolon kanserine karşı koruyucu bir potensiyeli olduğu açıklanmasına rağmen, aynı durumun endometrial ve ovarial kanser gibi diğer kanser tipleriiçin geçerli olmadığı açıklanmıştır. 13,16 Servikal intraepitelial kanserli kişiler ile yapılan bir çalışmada da 677 TT ve CT genotip sıklığının yüksek olduğu bildirilmiştir. 16-17 MTHFR mutasyonları birçok hastalık etyolojisinde araştırılmış, bir kısmıyla güçlü bağlantılar rapor edilmiştir. 17 Genelikle multifaktöryel bir etyolojiye sahip görünen bu hastalıklarda genetik etyolojinin ağırlığı populasyonlar arasında büyük farklar gösterebilmektedir. 1 Hatta bu dar coğrafi bölgeler açısından da böyledir. Bundan dolayı dar coğrafi bölgelerinde gen havuzlarının ilişki mutasyonlar açısından değerlendirilmesi bu hastalıklara yaklaşımda bölgesel bir spesifiklik kazanılmasını sağlayabilecektir. Gereç ve Yöntem Araştırmaya Sivas coğrafi bölgesi içerisinde ikamet eden 109 i erkek 113 i kadın olmak üzere 222 kişi dahil edilidi. Bu kişilerin seçimi gönüllülük esasına dayanarak rastgele yapıldı. Çalışma 2007-2008 tarihleri arasında gerçekleştirildi. Çalışılan grubun kan alma işlemleri C.Ü Tıp Fakültesi Tıbbi Genetik Anabilim Dalında yapıldı. Bu kişilerin 2cc periferik venöz kan alınarak EDTA lı tüpe aktarıldı, tüpler etiketlenerek kullanılıncaya kadar -20 0 C de muhafaza edildi. Daha sonra çalışma grubundaki bireylere MTHFR ile ilişkili hastalıklarla ilgili öykülerini (kardiyovasküler hastalık, serebrovasküler hastalık, renovasküler hastalık, nöral tüp defekti, migren, kanser, tekrarlı düşük)sorgulayan bir anket uygulandı. Bu anketteki sorular kişinin kendisine ve 1. derece akrabalarına dönüktü Bütün hastalardan genomik DNA izolasyonu periferik kandan yapıldı. Bunun için Invitek Invisorb Spin Blood DNA İzolasyon Kiti kullanıldı. MTHFR geninin ilgili bölgelerinin çoklu (multipleks) amplifikasyonu için Vienna Lab CVD PCR amplifikasyon kiti kullanıldı.hibridizasyon işleminden önce elde edilen PCR ürünleri (4 μl) %1 lik elektroforezde başarılı amplifikasonlar açısından değerlendirildi. Başarılı amplifikasyon elde edilen PCR ürünlerinden 10μl ürün revers hibridizasyon analiz için kullanıldı. Southern Blot analiz için Revers-Hibridizasyon ProfiBlot T48 (Tecan) Hibridizasyon cihazı kullanıldı. Stripler oda sıcaklığında 1ml konjugat solüsyonu ile 15 dk inkübe edilerek konjugat solüsyonu içinde bulunan streptavidin-alkalan fosfataz, biyotin işaretli hibrit DNA fragmentlerine bağlanması sağlandı. Strip üzerindeki hibridize olmuş bantların görülür hale gelebilmesi için ortama 1ml alkalan fosfatazın subtratı olan nitro blue tetrazolium (NBT) ve 5-bromo-4-kloro-3-indolil fosfatdan (BCIP) oluşan renk geliştiricisi (color developer) eklendi, oda sıcaklığında 15 dk inkübasyona tabi tutuldu. Strip son olarak distile su ile yıkandı, kâğıt havlu ile kurutulduktan sonra değerlendirme tablosuna (Collector) özenle yerleştirildi. Çalışma sonucu elde edilen verilerin istatiksel olarak değerlenderilmesinde windows ortamında SPSS (Statistical Package for Social Science) 15.0 istatiksel paket programı kullanılmıştır. Niteliksel verilerin karşılaştırılmasında ve gruplar arasında farklılıkların saptanmasında Ki-Kare (Chi-Square) analizi kullanılmıştır. Sonuçlar %95 lik güven aralığında, anlamlılık p 0.05 düzeyinde değerlendirilmiştir. 158

Metilentetrahidrofolat Redüktaz (Mthfr) C677t ve A1298c Gen Polimorfizmleri Bulgular MTHFR C677T ve A1298C alleli için yapılan değerlendirmede dağılım frekansının erkekler (n=109) ve bayanlar (n=113) arasında benzer olduğu ve anlamlı bir fark bulunmadığı belirlenmiştir. MTHFR C677T allel genotiplerinin tüm bireyler arasındaki dağılımına bakıldığında CC genotipinde 93 kişi (%42), TT genotipinde 9 kişi (%4), CT genotipinde 120 kişi (%54) saptanmıştır (Tablo 1). Tablo 1. MTHFR C677T allel genotiplerinin bireyler arasında dağılımı. Sayı Yüzde CC 93 2,0 TT 9 4,0 CT 120 54,0 Toplam 222 100,0 Yapılan çapraz karşılaştırma sonuçlarına göre; MTHFR C677T polimorfizmi ile sorgulanan hastalıklar (kişinin kendisinde ve birinci derece akrabalarında bulunma durumuna göre)arasında bir ilişki bulunamamıştır (X 2 = 0.121-3.73, p>0.05. MTHFR A1298C allel genotiplerinin tüm bireyler arasındaki dağılımına bakıldığında AA genotipinde 102 kişi (%46), CC genotipinde 18 kişi (%8), AC genotipinde 102 kişi (%46) saptanmıştır (Tablo 2). Tablo 2. MTHFR A1298C allel genotiplerinin bireyler arasında dağılımı. Sayı Yüzde AA 102 46,0 CC 18 8,0 AC 102 46,0 Toplam 50 100,0 Yapılan çapraz karşılaştırma sonuçlarına göre; MTHFR A1298C polimorfizmi ile sorgulanan hastalıklar (kişinin kendisinde ve birinci derece akrabalarında bulunma durumuna göre) arasında anlamlı bir ilişki bulunamamıştır (X 2 = 0.828-5,559 ve p>0.05). MTHFR C677T ve A1298C allel genotipleri birlikte ele alınarak tüm bireyler arasındaki dağılımına bakıldığında; 36 CCAA (%16), 58 CTAC (%26), 62 CTAA (%28), 4 TTAC (%2), 40 CCAC ( %18), 4 TTAA (%2), ve 18 CCCC (%8) şeklinde dağılmıştır (tablo 3). Yapılan çapraz karşılaştırma sonuçlarına göre; MTHFR C677T ve A1298C polimorfizmlerinin olası kombinasyonları ile sorgulanan hastalıklar (kişinin kendisinde ve birinci derece akrabalarında bulunma durumuna göre) arasında bir ilişki bulunamamıştır (X 2 =1.219-12.118, p>0.05). Tablo 3. MTHFR C677T/A1298C birleşik genotip dağılımı. Sayı Yüzde CCAA 36 16 CTAC 58 26 CTAA 62 28 TTAC 4 2 CCAC 40 18 TTAA 4 2 CCCC 18 8 Toplam 222 100,0 MTHFR C677T (CC (%42), TT (%4) ve CT (%54) ) ve MTHFR A1298C (AA (%46), CC (%8) ve AC (%46) ) allelerinin dağılım frekansları kendi aralarında karşılaştırıldığında hem homozigotlu hemde heterozigotluk açısından benzer değerler bulunmuştur. Burada her ikisindede belirgin bir heterozigotluk (CT (%54), AC (%46) ) artışı dikkat çekmektedir. Tartışma MTHFR nin gerek biyokimyasal gerekse genetik mekanizmalardaki anahtar rolü ve multifaktöryel etkenlere açık yapısı ilişki kurulan hastalıklar ile iligili araştırmalarda özellikle göz önünde bulundurulmalıdır. Bölgesel prevalans faklılıklarıda ayrıca önemsenmelidir. Bu yönde bölgemiz açısından küçük bir katkı sağlama istekliliğimiz çalışma grubumuzu bu hastalıklar açısından geriye doğru taramamamıza neden olmuştur. Bu doğrultuda yaptığımız taramada (rastgele seçilmelerine rağmen) bireylerin kardiyovasküler ve serebrovasküler hastalık öyküleri oldukça kalabalık bulunmuştur (özel bir hasta grubu oluşturulmamasına rağmen). Kardiyovasküler hastalık öyküsünün büyük bir çoğunluğunu hipertansiyonun teşkil etmesi (HT =28, Kroner hastalık=6, Derin ve trombozu=2) ve homojen bir içeriğin olmaması bu artışın önemini oldukça zayıflatsada yinede not edilmesi gereken bir veridir. C677T ve A1298C polimorfizmlerinin birlikte oluşturacağı etkilerde ayrıca göz ardı edilmemelidir. Çünkü MTHFR C677T için normal 93 (%42)kişi ve MTHFR A1298C için normal 102 (%46) kişi bulunmasına rağmen her iki polimorfizm açısından normal olan bireylerin sayısı sadece 36 (%18) dir. Yani bireylerin %82 sinde allelerden en az biri bu polimorfizmler açısından mutantır. C677T ve A1298C polimorfizmleri birlikte değerlendirildiğinde, (compound heterozigotluk olasılığı da göz önünde bulundurulduğunda) bu durumun frekansının belirgin şekilde artması sözkonusudur. 159

Koçak ve ark. En azından MTHFR C677T/A1298C için CTAC [58 (%26)] genotipine sahip bireylerin bazılarında compound heterozigotluğun bulunması kuvvetle muhtemeldir. Bu da gen lokusunda normal allel bulunma olasılığını azaltacaktır. Compound heterozigotluk durumunda normal protein sentezinin olmaması homozigot mutant duruma benzer bir durum ortaya çıkarmaktadır. 6, 9 Elde etiğimiz sonuçlar ülkemizde ve diğer coğrafyalarda yapılan çalışmalarla büyük oranda benzeşmektedir. Heterozigotluk oranı diğer çalışmalardaki ortalamalara yakınken, homozigot mutant ve homozigot normal oranında bir artış dikkati çekmektedir. Bölgemizde elde edilen veriler ufak sapmalarla coğrafi olarak Avrupadan, ırk olarakta beyaz ırktan elde edilen oranlara benzemektedir. Coğrafi olarak en yakın oranlar Fransa [ MTHFR 677 CT (%52), MTHFR 677 CC (%42), MTHFR 677 TT (%12) ve MTHFR 1298 AA (%45), MTHFR 1298 CC (%10), MTHFR AC (%45)) ve Hollanda (MTHFR 677 CT (%48), MTHFR 677 CC (%45), MTHFR 677 TT (%7) ve MTHFR 1298 AA (%42), MTHFR 1298 CC (%9), MTHFR AC (%49) ] dan elde edilmiştir. 18 Çalışmamızda elde edilen sonuçlar Türkiyede elde edilen sonuçlarla genel olarak benzese de ihmal edilmeyecek farklılıklar taşımaktadır. Sivas bölgesinde MTHFR 677 CT heterozigotluğunun (%54) (Ali sazcı ve arkadaşları, 19 tarafından elde edilen) Türkiye ortalamasından ((%42) belirgin oranda yüksek, MTHFR A1298C için heterozigotluk oranının ise Türkiye ortalamasına yakın olduğu bulunmuştur (Türkiye (%50), Sivas (%46)). Homozigot normal genotipler biribirne yakın oranlarda bulunmasına rağmen (Türkiye (MTHFR CC (%47), MTHFR AA (%46), Sivas (MTHFR CC (%42), MTHFR (%46) homozigot mutant durumlar arasında TT (Türkiye (%9,6), Sivas (%4)) genotipi için belirgin bir farkdan sözedilebilir. CT heterozigotluğu dışında olumsuzluk ibresi Türkiye ortalamasını gösterse de Sivas bölgesindeki heterozigotluk oranı yinede ihmal edilmemelidir. Bu oran akraba dışı evliliklerde bile mutasyonlu bireylerin karşılaşma olasılığının artmış olduğu anlamına gelmektedir. Gerçi böyle bir riske rağmen homozigot mutant oranlarının belirgin düşüklüğü cevaplanması gereken diğer bir sorudur. Tüm bu veriler cevaplanması gereken sorularıda beraberinde getirmektedir. Yukarıda da bahsedildiği gibi (genel olarak heterozigotluk oranı mendelyen sınırlar içerisinde kalmasına rağmen) mutant genotip belirgin olarak azalmakta, normal genotip ise belirgin olarak artmaktadır. Bu boşluğu doldurabilecek nedenlerin bulunması gerekmektedir. Bu oranların dünya genelinde de benzer olması ortak nedenlerin olabileceğini düşündürmektedir. 18 MTHFR genin organizmanın hücresel kaderinin her aşamasındaki rolü (gametogenezis, embriyogenezis, histon modifikasyonu, gen ekspresyonun ve transkripsiyonun düzenlenmesi) dikkate alınacak olursa bu nedenleri bulmanın zorluğu daha iyi anlaşılmaktadır. 17 Bundan dolayı populasyon polimorfizmleri yanında gamet, embriyo, fetus, neonatal, inafant, yetişkin ve ileri yaş polimorfizmlerinin de araştırılması ve aradaki farkların belirlenmesi gerekmektedir. Kaynaklar 1. Homberger G, Linnebank M, Winter C, et al. Genomic structure and transcript variants of the human methylenetetrahydrofolate reductase gene. Eur J Hum Genet, 2000; 8: 725-9. 2. Kim Y. Methylenetetrahydrofolate reductase polymorphisms, folate, and cancer risk: A paradigm of gene-nutrient interactions in carcinogenesis. Nutr Rev 2000; 58: 205-17. 3. Weisberg I, Tran P, Christensen B, et al. A second genetic polymorphism in methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) associated with decreased enzyme activity. Mol Genet Metab 1998; 64: 169-72. 4. Daly SF, Molloy AM, Mills JL, et al. The influence of 5,10 methylenetetrahydrofolate reductase genotypes on enzyme activity in placental tissue. Brit J Obstet Gynaec 1999; 106: 1214-8. 5. Stern LL, Bagley PJ, Rosenberg IH, et al. Conversion of 5- formyltetrahydrofolic acid is unimpaired in folate- adequate persons homozygous for the C677T mutation in the methylenetetrahydrofolate reductase gene. J Nutr 2000; 130: 2238-42. 6. Nakamizo T, Nagayama M.Stroke and the genetics of hyperhomocysteinemia. Brain Nerve. 2008;60(11):1295-306. 7. Goyette P, Pai A, Milos R, et al. Gene structure of human mouse methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR). Mammalian Genome 1998; 9: 652-6. 8. Ozmen F, Ozmen MM, Ozalp N et al. The prevalence of factor V (G1691A), MTHFR (C677T) and PT (G20210A) gene mutations in arterial thrombosis. Ulus Travma Acil Cerrahi Derg 2009;15(2):113-9. 9. Khandanpour N, Willis G, Meyer FJ et al. Peripheral arterial disease and methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) C677T mutations: A case-control study and meta-analysis. J Vasc Surg 2009;49(3):711-8. 10. Ilhan N, Kucuksu M, Kaman D, Ilhan N, Ozbay Y. The 677 C/T MTHFR polymorphism is associated with essential hypertension, coronary artery disease, and higher homocysteine levels. Arch Med Res. 2008;39(1):125-30. 11. Fodinger M, Horl WH, Sunder-Plassman G. Molecular biology of 5,10 methylenetetrahydrofolate reductase. J Nephrol 2000; 13(1): 20-33. 12. van der Put NM, Gabreels F, Stevens EMB, et al. A second common mutation in the methylenetetrahydrofolate reductase gene: An additional risk factor for neural-tube defects. Am J Hum Genet 1998; 62: 1044-51. 13. Skibola CF, Smith MT, Kane E, et al. Polymorphisms in the methylenetetrahydrofolate reductase gene are associated with susceptibility to acute leukemia in adults. Med Sci 1996; 96: 12810-5. 14. Kureshi N, Ghaffar S, Siddiqui S et al. Head and neck cancer susceptibility: a genetic marker in the methylenetetrahydrofolate reductase gene. Orl J Oto-Rhino- Laryngol Relat Spec 2004; 66 (5): 241-5. 15. Larsson SC, Giovannucci E, Wolk A. Folate intake, MTHFR 160

Metilentetrahidrofolat Redüktaz (Mthfr) C677t ve A1298c Gen Polimorfizmleri polymorphisms, and risk of esophageal, gastric, and pancreatic cancer: a metaanalysis. Gastroenterology 2006; 131(4): 1271-83. 16. Piyathilake CJ, Macaluso M, Johanning GL, et al. Methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) polymorphisim increases the risk of cervical intraepithelial neoplasia. Anticancer Res 2000; 20: 1751-7. 17. Thomas P, Fenech M. Methylenetetrahydrofolate reductase, common polymorphisms, and relation to disease. Vitam Horm 2008;79:375-92. 18. Lorenzo D, Botto Y, Quanhe Y. 5,10-Methylenetetrahydrofolate Reductase Gene Variants and Congenital Anomalies. Am J Epidemiol 2000; 9; 151-866. 19. Sazci, A. Ergul, E. Kaya,G. et al. Genotype and allele frequencies of the polymorphic methylenetetrahydrofolate reductase gene in Turkey. Cell Biochem Funct 2005; 23: 51 4. İletişim Adresi: Uzm.Dr. Nadir KOÇAK Konya Eğitim ve Araştırma Hastanesi KONYA Tel: 03323236709 /2054 05065449128 e-mail:nadirkocak@yahoo.com 161

162