YND ve ülkemizde yeni anti-retrovirallerin kullanımı ışığı altında HIV direnç ve epidemiyolojisi

Ebat: px

Şu sayfadan göstermeyi başlat:

Download "YND ve ülkemizde yeni anti-retrovirallerin kullanımı ışığı altında HIV direnç ve epidemiyolojisi"

Coskun Ayral
4 yıl önce
İzleme sayısı:

2 YND ve ülkemizde yeni anti-retrovirallerin kullanımı ışığı altında HIV direnç ve epidemiyolojisi Dr. Rüçhan Sertöz Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD

16 Antiretroviral Tedavi HAART 2 NRTI + NNRTI 2 NRTI + PI 2 NRTI+ INSTI

18 FDA onaylı Antiretroviral İlaçlar

20 Virolojik başarısızlık Tedavi sonrası 6. ayda HIV-1 RNA > 50kop/mL Roche Abbott Qiagen 40 kopya/ml 40-E7 kopya/ml 40 kopya/ml 40-E7 kopya/ml 34.4 kopya/ml E2-E8 kopya/ml Baskılanma ardından tekrar yükselme (ted uyumsuzluğu, ilaç direnci)

21 HIV ilaç direnci Tanımlar Kazanılmış direnç (ADR) İletilen direnç (TDR) Tedavi öncesi direnç (pretreatment) (başlangıç-tekrar başlangıç)

22 Neden ilaç direnci? Hızlı replikasyon oranı Hergün ortalama 1-10 milyar virüs partikülü Yüksek rekombinasyon yeteneği RT da hata düzeltme (proof reading) yok

23 Antiretroviral ilaç direnci analizi: ne zaman? Primer HIV enfeksiyonunda tedavi öncesi Virolojik başarısızlık HIV (+) gebe kadınlarda Yenidoğanın HIV enfeksiyonunda Kaza sonrası proflakside

24 Genotip/subtip ve direnç saptama yöntemleri Fenotipik yöntemler Genotipik yöntemler DNA dizi analizi Line probe assay (LIPA) PCR-RFLP Real-Time PCR Mikroalan (microchip) Yeni nesil dizileme (YND) Kütle spektrometresi (MALDI-TOF MS)

25 Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Moleküler Viroloji Laboratuvarları 2008 ViroSeq (Abbott/CeleraDiagnostics, ABD) PROTEAZ RT

26 Ege Bölgesinde HIV enfekte hastalarda genotip ve direnç dağılımı R Sertöz, D Tekin, S Erensoy, S Biçeroğlu, F Kaptan, Ş Köse, B Çetin, H Pullukçu, D Gökengin Hastanelere göre dağılım Ege Üniversitesi 471 Katip İstenen Çelebi test Üniversitesi sayısı: Tepecik Eğitim Araştırma - Hastanesi 20 Bozyaka RNA Eğitim yetersiz Araştırma ve tekrarlar: Hastanesi Celal Bayar Üniversitesi 4 = 482

27 Tedavi durumları 290 naiv + 27 ART + 3 tedaviyi önceden bırakmış tedavi durumu bilinmiyor = 482

28 Naiv hastalarda (n:290) Dirençli hasta yüzde ve sayıları 12 11, , ,1 3,4 2 NRTI NNRTI PI Toplam 0

30 Naiv hastalarda TDR kodonlar

31 Subtip dağılımı-yüzde (n:482)

34 Subtiplere göre direnç dağılımı

35 Naiv hastalarda NRTİ direnci-yüzde

36 Naiv hastalarda NNRTİ direnci-yüzde

37 Naiv hastalarda Pİ direnci-yüzde

SANGER Zincir Sonlandırma Reaksiyonu Altın standart Viral popülasyondaki >%20 mutasyon sıklığı Düşük veri kalitesi İlk 15 ila 40 baz lık bölümde 700-900bazlık fragmanlarda Ticari kitler -

38 SANGER Zincir Sonlandırma Reaksiyonu Altın standart Viral popülasyondaki >%20 mutasyon sıklığı Düşük veri kalitesi İlk 15 ila 40 baz lık bölümde bazlık fragmanlarda Ticari kitler - Proteaz ve Revers transkriptaz Performance assessment of the Illumina massively parallel sequencing platform for deep sequencing analysis of viral minority variants.thys Ket al.j Virol Methods Sep

Yeni ve beklenmeyen virüslerin tanımlanması Viral genom çeşitliliğinin araştırılması ve türümsülerin karakterizasyonu İnsan virom karakterizasyonu Tam viral

40 Yeni ve beklenmeyen virüslerin tanımlanması Viral genom çeşitliliğinin araştırılması ve türümsülerin karakterizasyonu İnsan virom karakterizasyonu Tam viral genom sekanslama Viral infeksiyon epidemiyolojisi ve evriminin araştırılması Tümör virüslerinin saptanması Canlı aşılarda kalite kontrol Antiviral direnç izlemi

41 YND - Örnek havuzlama CMV polimeraz M.tbc hsp65 HIV RT HCV Ns5b HCV 5 UTR HCV 5 UTR HIV RT

42 İllumuna

43 İllumuna

44 İllumuna Flowcell

46 DeepM 2017

49 % 54 ünde çeşitli mutasyonlar % 59 u %2-20 sıklıkta Sanger ile kaçırılabilir!

51 DSÖ 31 lab. (Afrika 9, Asya 10, Avrupa 12) En çok lab tasarımlı US$ 40-US$ 317 (ortalama US$ 130) ViroSeqTM US$ 125-US$ 460 (ortalama US$ 276)

52 Sonuç RT, proteaz, integraz gen bölgesi Hasta yönetiminde direnç epidemiyolojisi önemli Hangi yöntem, hangi cut off Yeni nesil dizileme %1, %5, %10.. Klinik anlamlılık? Maliyet Multidisipliner çalışma Multipleks çalışma

Benzer belgeler

HIV: ALGORİTMALAR VE DİRENÇ: HIV Anti-Retro Viral Direnç: Ülkemizdeki Son Durum

HIV: ALGORİTMALAR VE DİRENÇ: HIV Anti-Retro Viral Direnç: Ülkemizdeki Son Durum Prof. Dr. Kenan Midilli İstanbul Üniversitesi Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı DSÖ: HIV in ilaç