DR. İBRAHİM ÇAKIR ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ

Adı Soyadı: İbrahim ÇAKIR DR. İBRAHİM ÇAKIR ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ Adres: Abant İzzet Baysal Üniversitesi Mühendislik Mimarlık Fakültesi Gıda Mühendisliği Bölümü Gölköy Yerleşkesi 14280, Bolu, TÜRKİYE Tel: +90 (374) 254 1000/ 2620 (Dahili) Faks: +90 (374) 253 45 58 E-posta: ibrahimcakir@ibu.edu.tr icakir55@gmail.com Öğrenim Durumu: Derece Bölüm/Program Üniversite Yıl Lisans Gıda Bilimi ve Ankara Üniversitesi 1993 Teknolojisi Y. Lisans Gıda Mühendisliği Ankara Üniversitesi 1996 Doktora Gıda Mühendisliği Ankara Üniversitesi 2003 Yrd. Doç. Gıda Mühendisliği Abant İzzet Baysal Üniversitesi 2004 Yüksek Lisans Tez Başlığı ve Tez Danışmanı: Et Tavuklarının Körbağırsak Florasında Yer Alan Laktobasillerin Proteolitik Aktiviteleri ve Organik Asit Oluşturma Yeteneklerinin Belirlenmesi. Prof. Dr. M. Lütfü ÇAKMAKÇI Doktora Tezi Başlığı ve Tez Danışmanı: Laktobasillus ve Bifidobakterlerde Bazı Probiyotik Özelliklerin Belirlenmesi. Prof. Dr. M. Lütfü ÇAKMAKÇI Görevler: Görev Unvanı Görev Yeri Yıl Ar. Gör. Ziraat Fakültesi, Ankara Üniversitesi 1993-1995 Ziyaretci Araştırmacı New York State Agricultural & Experiment Station, Cornell University, Hazırlık Grubu Mamul Gıdalar Hazırlık Grubu Üyesi, Standart Hazırlama Üyesi, Raportör Teknik Komite Raportörü Türk Standardları Enstitüsü Yar. Doç. Mühendislik Mimarlık Fakültesi, Abant İzzet Baysal Üniversitesi Yönetilen Yüksek Lisans Tezleri: 2000-2001 2002-2003 2004-1. M. Fatih İŞLEYEN, Mikroenkapsülasyon Tekniğinin Lb. acidophilus KPb4b ve Lb. rhamnosus KPb7 Probiyotik Kültürlerinin Stabilitesi Üzerine Etkilerinin Araştırılması. (2008-2010). 1

2. Buse YAŞLI, Lactobacillus acidophilus KPb1 ve Lactobacillus reuteri NRRL B-14171 Probiyotik Kültürlerinin Koazervasyon Yöntemi ile Kaplanmasının ve Dondurmaya İlavesinin Kültürlerin Canlılık Düzeyleri Üzerine Etkisinin İncelenmesi. (2008-2010). 3. Erkan GÜNEŞ, Otlu Peynir Üretiminde Kullanılan Salamura Otlardan Mayaların İzolasyonu, Moleküler Tanısı ve Bazı Teknolojik Özelliklerinin Belirlenmesi. (2008-2010). Yönetilen Doktora Tezleri/Sanatta Yeterlik Çalışmaları: 1. Gökçe POLAT YEMİŞ, Enterobacter sakazakii' nin Bebek Mamalarından İzolasyonu ve Gelişme Parametrelerinin İncelenmesi. Ankara Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Gıda Mühendisliği Anabilim Dalı, Doktora Öğrencisi 2. Danışmanı. Danışman Prof. Dr. A. Kadir HALKMAN (Başlama tarihi: 2006). Projelerde Yaptığı Görevler: 1. Probiyotik Kullanımı ve Ülke Şartlarında Geliştirilmesi (Ankara Üniversitesi Araştırma Fonu Proje No: 96 K 120 380, DPT, Türkiye Kalkınma Vakfı ve Tarım ve Köyişleri Bakanlığı Ankara İl Kontrol Müdürlüğü). Yardımcı Araştırıcı. 1994-1998. 2. Gıdalarda Fekal Koliform Aranması (Ankara Üniversitesi Araştırma Fonu Proje No: 97 11 12 01). Yardımcı Araştırıcı. 1997-1999. 3. Hayvansal Gıdalarda Escherichia coli O157:H7 Aranmasında Minimal İnhibisyon Konsantrasyonu (Proje No: TÜBİTAK-VHAG-1466). Yardımcı Araştırıcı. 1999-2001. 4. Bazı Laktik Asit Bakteri Kültürlerinin Probiyotik Özelliklerinin Belirlenmesi ve Bu Kültürlerin Probiyotik Ürün Eldesinde Kullanımı (Ankara Üniversitesi Biyoteknoloji Enstitüsü Proje No: 2001-K-120-240/49). Yardımcı Araştırıcı. 2002-2004. 5. Bolu ve Çevresinde Üretilen ve Bir Süt Ürünü Olan Keş in Yapılışı ile Kimyasal, Biyokimyasal, Mikrobiyolojik ve Duyusal Özelliklerinin İncelenmesi (AİBÜ-BAP, Proje No: 05.09.01.217). Yardımcı Araştırıcı. 2005-2007. 6. Transglutaminaz Enzim Üretimi ve Süt Sanayinde Kullanım Olanakları (DPT-YUUP, Proje No: 2005K120680). Yardımcı Araştırıcı. 2005-2008. 7. Selüloz Üretiminde Kullanılacak Mikroorganizmaların İzolasyonu, Moleküler Tanısı ve Mikrobiyel Selülozun Gıda Sanayinde Kullanım Olanaklarının Araştırılması (TÜBİTAK- TOVAG, Proje No: 105O158. Yardımcı Araştırıcı. 2005-2008. 8. Probiyotik Üretiminde ve Canlı Kalma Sürelerinin Artırılmasında Peyniraltı Suyu (PAS) Kullanım Olanaklarının Araştırılması (AİBÜ-BAP, Proje No: 05.09.01.241). Proje Yürütücüsü. 2005-2008. 9. Üzüm Cibresinin Antimikrobiyel ve Antioksidan Özellikleri ile Yağ Asitleri Dağılımı. (TÜBİTAK Hızlı Destek Proje No: 107O607) Yardımcı Araştırıcı. 2007-2008. 10. Türkiye'de Değişik Şarap Üretim Bölgelerinden İzole Edilmiş Endojen Şarap Mayalarının Teknolojik Özelliklerinin Belirlenmesi ve Moleküler Yöntemlerle Tanımlanması. (TÜBİTAK-TOVAG Proje No: 107O377) Yardımcı Araştırıcı. 2007-2009. 11. Mikroenkapsüle Probiyotik Bakterilerin Yoğurt Dondurması Üretiminde Kullanım Olanaklarının Araştırılması (TÜBİTAK Hızlı Destek Proje No: 108O283) Proje Danışmanı. 2008-2009. 2

12. Probiyotiklerde Mikroenkapsülasyon Tekniğinin Mikrobiyolojik Stabilite, Oksijen Toksisitesi, In Vitro Protein Sindirilebilirliği ve Duyusal Özellikler Üzerine Etkilerinin Araştırılması. (TÜBİTAK-TOVAG Kariyer Proje No: 106O559) Proje Yürütücüsü. 2007-2010. 13. Enterobacter sakazakii'nin Bebek Mamalarından İzolasyonu ve Gelişme Parametrelerinin İncelenmesi. (Ankara Üniversitesi BAP Proje No: 08B4343004) Yardımcı Araştırıcı. 2008-2010. İdari Görevler : 1. AİBÜ Yeniçağa Yaşar Çelik Meslek Yüksekokulu Müdürü (Eylül 2010- ) 1. AİBÜ Öğrenci Gelişimi ve Mezunlarla İletişim konusunda Rektör Danışmanı (Nisan 2010- ) 2. AİBÜ Sürekli Eğitim, Uygulama ve Araştırma Merkezi (SUYAM) Yönetim Kurulu Üyesi (Mart 2010 - ) 3. AİBÜ Mühendislik Mimarlık Fakültesi Gıda Mühendisliği Bölümü, Bölüm Başkan Yardımcısı (Ocak 2007 - Haziran 2009) 4. Türk Eğitim Vakfı (TEV), Abant İzzet Baysal Üniversitesi Temsilcisi (2007- ) 5. AİBÜ Mühendislik Mimarlık Fakültesi Gıda Mühendisliği Bölümü Erasmus/ AKTS (ECTS) Koordinatörü (Ekim 2005- Ekim 2007) 6. Türk Gıda Kodeksi, Gıda Hijyeni ve Mikrobiyolojisi İhtisas Alt Komisyonu Üyesi (2007- ) 7. Türk Standardları Enstitüsü, Mamul Gıdalar Hazırlık Grubu Üyesi ve Standart Hazırlama Teknik Komite Raportörü (Eylül 2002 Nisan 2003) Bilimsel Kuruluşlara Üyelikler : 1. GIDA Dergisi/ The Journal of FOOD Editörü / Yayın Yönetmeni (Gıda Teknolojisi Derneği Yayını) (2005- ) 2. Akademik Gıda Dergisi Yayın Kurulu Üyesi (2008- ) 3. Hasad Gıda Dergisi Bilimsel Yayın Kurulu Üyesi (2009- ) 4. Gıda Teknolojisi Derneği Yönetim Kurulu Üyesi (2002- ) 5. Gıda Teknolojisi Derneği Üyesi (1993- ) 6. Biyoteknoloji Derneği Üyesi (1996- ) Ödüller : 1. TÜBİTAK Uluslar Arası Bilimsel Yayınları Teşvik Ödülü 3

Son iki yılda verdiği lisans ve lisansüstü düzeydeki dersler (Açılmışsa, yaz döneminde verilen dersler de tabloya ilave edilecektir): Akademik Yıl Dönem Dersin Adı Haftalık Saati Teorik Uygulama Öğrenci Sayısı Gıda Mikrobiyolojisi I 2 2 26 Gıda Güvenliği 2 0 31 Mezuniyet Projesi I 0 4 4 Güz Gıda Güvenliği 3 0 31 Biyoteknolojide Özel Konular (YL) 2 2 7 Mikrobiyel Genetik (YL) 3 0 6 2008-2009 Genel Mikrobiyoloji 2 2 32 Biyoteknoloji 2 2 22 Mezuniyet Projesi II 0 4 4 İlkbahar Gıda Kalite Kontrol ve Mevzuatı 2 0 25 Gıda Endüstrisinde Laktik Asit Bakterileri ve Probiyotikler (YL) 2 2 4 Gıda Mikrobiyolojisinde Kullanılan Hızlı Yöntemler (YL) 3 0 4 Gıda Mikrobiyolojisi I 2 2 28 Güz Gıda Güvenliği 2 0 22 Mezuniyet Projesi I 0 4 3 Genel Mikrobiyoloji 2 2 27 2009-2010 Biyoteknoloji 2 2 33 İlkbahar Mezuniyet Projesi II 0 4 3 Gıda Endüstrisinde Laktik Asit Bakterileri ve Probiyotikler(YL) 2 2 3 Gıda Mikrobiyolojisinde Kullanılan Hızlı Yöntemler (YL) 3 0 2 4

ESERLER A. Uluslararası hakemli dergilerde yayımlanan makaleler : A1. Karahan, A.G., Akoğlu, A., Çakır, İ., Kart, A., Çakmakçı, M.L., Uygun, A., Göktepe, F. 2011. Some properties of bacterial cellulose produced by new native strain Gluconacetobacter sp. A06O2 obtained from Turkish vinegar. Journal of Applied Polymer Science, D 8 (2): 223-226. DOI: 10.1002/app.33818. A2. Çakır, İ. 2010. Antibacterial and antifungal activities of some lactic acid bacteria isolated from naturally fermented herbs. Journal of Food, Agriculture & Environment, 8 (2): 223-226. A3. Çakır, İ., Coşkun, H., Akoğlu, İ.T., İşleyen, M.F., Kıralan, M., Bayrak, A. 2009. Introducing a traditional dairy product Keş: Chemical, microbiological, and sensorial properties and fatty acid composition. Journal of Food, Agriculture & Environment, 7 (3&4): 116-119. A4. Sokullu, E., Baş, D., Boyacı, İ.H., Öner, Z., Karahan, A.G., Çakır, İ., Çakmakçı, M.L. 2008. Determination of transglutaminase activity using fluorescence spectrophotometer. Food Biotechnology, 22 (3): 297-310. A5. Dogan, H.B., Kuleasan, H., Cakir, I., Halkman, A.K. 2003. Evaluation of increased incubation temperature and cefixime-tellurite treatment for the isolation of Escherichia coli O157:H7 from ground beef. International Journal of Food Microbiology, 87 (1-2): 29-34. A6. Dogan, H.B., Cakir, I., Keven, F., Worobo, R.W., Halkman, A.K. 2003. Relationship among fecal coliform and Escherichia coli in various foods. European Food Research and Technology, 216: 331-334. A7. Cakir, I., Dogan, H.B., Baspinar, E., Keven, F., Halkman, A.K. 2002. The need for confirmation in coliform and E. coli enumeration in foods. Turkish Journal of Veterinary and Animal Science, 26 (5): 1049-1053. A8. Dogan, H.B., Cakir, I., Baspinar, E., Halkman, A.K., 2002. Comparison of LST Broth + MUG technique and conventional method for enumeration of Escherichia coli in Foods. Letters in Applied Microbiology, 34 (4): 274-278. A9. Cakir, I., Dogan, H.B., Halkman, A.K., Worobo, R.W. 2001. An alternative approach for enumeration of Escherichia coli in foods. International Journal of Food Microbiology, 68 (3): 217-223. A10. Basaran, P., Basaran, N., Cakir, I. 2001. Molecular differentiation of Lactococcus lactis subspecies lactis and cremoris strains by ribotyping and site specific-pcr. Current Microbiology, 42 (1): 45-48. B. Uluslararası bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında (Proceedings) basılan bildiriler : B1. Akoğlu, A., Karahan, A.G., Çakır, İ., Çakmakçı, M.L. 2011. Effects of bacterial cellulose as fat replacer on some sensory properties and rheological behavior of low fat mayonnaise. International Food Congress-Novel Approaches in Food Industry, May 26-29, 2011, Proceedings of the International Food Congress Novel Approaches In Food Industry, pp.154 (Poster). 5

B2. Bayram, M., Anlı, E., Erinç, H. Çakır, İ., Vural, N. 2011. The antioxidant capacity, antimicrobial properties and fatty acid profile of eight grape (Vitis vinifera) seed extracts. International Food Congress-Novel Approaches in Food Industry, May 26-29, 2011, Proceedings of the International Food Congress Novel Approaches In Food Industry, p. 998-1004. (Poster). B3. Çakır, İ., İşleyen, M.F., Yaşlı, B. 2010. Microencapsulation of Probiotic Bacteria With Alginate and Manucol Microbeads and Evaluation of Survival in Simulated Gastrointestinal Condition. 1 st International Congress on Food Technology. November 03-06, 2010, Antalya, Abstract Book, pp 84. (Poster). B4. Bağder, S., Tokatlı, M., Çakır, İ., Özçelik, F. 2010. Identification of Indigenous Wine Yeasts by Different Molecular Methods. 1 st International Congress on Food Technology. November 03-06, 2010, Antalya, Abstract Book, pp 100. (Poster). B5. Çakır, İ., Yaman, H., Yaşlı, B., Tunçtürk, Y., Coşkun, H. 2010. Chemical and Microbiological Properties Of Naturally Fermented Herbs Used in Herby Cheese Production. 1 st International Congress on Food Technology. November 03-06, 2010, Antalya, Abstract Book, pp 438. (Poster). B6. Öztürk, M., Aydın, Y., Çakır, İ. 2010. Differentiation of Closely Related Lactobacillus Species by 16S rrna PCR-RFLP Method. 22th National Biochemistry Congress, October, 27-30, 2010. Turkish Journal of Biochemistry, Vol. 35, Special Issue 1: 89. B7. Karahan, A.G., Akoğlu, A., Çakır, İ., Kart, A., Çakmakçı, M.L., Uygun, A., Göktepe, F. 2009. Characterization of bacterial cellulose produced by two Gluconacetobacter strains. BIOTECH METU 2009. International Symposium on Biotechnology: Developments and Trends, 27-30 September 2009, Ankara, Turkey, Abstract Book, pp. 82. (Sözlü Sunum). B8. Özcan, B., İşleyen, M.F., Çakır, İ. 2009. Use of Microencapsulation of Bioactive Ingredients in Food Industry. 3rd International Congress on Food and Nutrition, 22-24 April 2009, Antalya, Turkey, Abstract Book, pp. 142. (Poster). B9. İşleyen, M.F., Özcan, B., Çakır, İ. 2009. Survival of Microencapsulated Lactobacillus crispatus KPb3 Strain During The Storage at Different Temperatures. 3rd International Congress on Food and Nutrition, 22-25 April 2009, Antalya, Turkey, Abstract Book, pp 128. (Poster). B10. Çakmakçı, M.L., Karahan, A.G., Çakır, İ., Başyiğit Kılıç, G. 2007. Probiotic Studies in Turkey. 2nd International Congress on Food and Nutrition, 24-26 October, 2007, Istanbul, Turkey, Book of Abstracts, p. 180. (Poster). B11. Çakır, İ. 2007. Molecular Identifcation and Probiotic Properties of Three Pediococcus acidilactici Strains Isolated from the Cecum of Chickens. 5th International Congress on Food Technology, March 09 11, 2007, Thessaloniki Greece, Proceedings Volume 3, 387-392. (Poster). B12. Öner, Z, Karahan, A.G., Boyacı, İ. H., Kılıç, G., Aloğlu, H., Gündoğdu, A., Çakmakçı, M.L., Çakır, İ. 2007. Enzymatic Activity of Microbial Transglutaminase. 5th International Congress on Food Technology, March 09 11, 2007, Thessaloniki Greece, Proceedings Volume 1, 285-291. (Sözlü Sunum). B13. Cakir, I, Cakmakci, M.L., Karahan, A.G., Gündoğdu, A., Akoğlu, A. 2006. Microbial Cellulose Production by Acetobacter xylinum. 1st Egyptian-Jordanian Conference on 6

Biotechnology and Sustainable Development: Current Status and Future Secenarios. 11-14 December 2006 NRC, Cairo, Egypt. Abstract Book, pp. 57. (Sözlü Sunum). B14. Cakir, I., Çakmakçı, M.L. 2004. Antimicrobial activities of some commercial and non-commercial probiotic bacteria. International Dairy Symposium: Recent Developments in Dairy Science and Technology. May 24-28 Isparta. Proceedings Book, 68-71 pp. (Sözlü Sunum). B15. Cakir, I., Halkman, H.B.D., Halkman, A.K. 2003. Fecal coliforms: Do they really necessary to be analyzed in foods? Microbiologia Balkanica 2003. 3rd Balkan Conference of Microbiology, 4-6 Eylül İstanbul. Proceedings and Abstract Book, 105-108. Çatı Grafik Reklamcılık Ltd., İstanbul, 564 pp. (Sözlü Sunum). B16. Halkman, H.B.D., Cakir, I., Halkman, A.K. 2003. Isolation and identification of foodborne pathogens with conventional and rapid methods. Microbiologia Balkanica 2003. 3rd Balkan Conference of Microbiology, 4-6 Eylül İstanbul. Proceedings and Abstract Book, pp 95-98. Çatı Grafik Reklamcılık Ltd., İstanbul, 564 pp. (Sözlü Sunum). B17. Basyigit, G., Cakir, I., Karahan A.G., 2003. Detection methods of genetically modified organisms. International Advanced Research Workshop: Agricultural Activities and Food Safety Issues. Food, Agriculture & Environment; Vol. 1 (2): 364 pp. April 2003. May 25 30, Süleyman Demirel University Isparta. (Sözlü Sunum). B18. Cakir, I., Karahan, A.G., Çakmakçı, M.L. 2001. Probiotic and functional properties of some traditional Turkish foods. 1st Eurosian Congress of Molecular Biotechnology, Trabzon, Turkey, October 17-20, Proceedings Book Volume 1, pp 89-93. (Poster). B19. Basaran, N., Cakir, I., Churry, J.J., Worobo, R.W. 2001. Identification of probiotic characteristics in lactic acid bacteria using transpositional mutagenesis. 1st Eurasian Congress on Molecular Biotechnology, Trabzon, Turkey, October 17-20, Abstracts Book, p 34. (Sözlü Sunum) B20. Tagi, S., Cakir, I. 2001. Detection of foodborne pathogenic microorganisms; immunological and molecular methods. 1st Eurosian Congress of Molecular Biotechnology, Trabzon, Turkey, October 17-20. Proceedings Book Volume 1, pp 269-273. (Sözlü Sunum). B21. Cakir, I., Dogan, H.B., Kuleasan, H., Yaman, F., Halkman, A.K. 2000. Effect of novobiocin, acriflavin and cefixime-tellurite on inhibition of cohabitant flora for the isolation of Escherichia coli O157:H7 serotype. Blacksea and Central Asian Symposium on Food Technology, Book of Abstract OP31 pp33. Ankara, Turkey October 12-16. (Sözlü Sunum) C1. Yazılan ulusal / uluslararası kitaplar : C.1.1. Çakmakçı, M. L., Karahan, A. G., Çakır, İ. 2008. Mikrobiyoloji. Gıda Teknolojisi Derneği Yayınları No: 36, Bizim Büro Basımevi, Ankara. 227 s. C2. Yazılan ulusal / uluslararası kitaplardaki bölümler : C2.1. Çakır, İ. 2000. Koliform Grup Bakteriler ve E. coli. Gıda Mikrobiyolojisi ve Uygulamaları, pp 335-345. Ankara Üniversitesi Ziraat Fakültesi Gıda Mühendisliği Bölümü yayını. Genişletilmiş 2. baskı. Sim Matbaacılık Ltd. Şti., Ankara, 522 s. 7

C2.2. Çakır, İ. 2000. Escherichia coli O157:H7. Gıda Mikrobiyolojisi ve Uygulamaları, pp 403-411. Ankara Üniversitesi Ziraat Fakültesi Gıda Mühendisliği Bölümü yayını. Genişletilmiş 2. baskı. Sim Matbaacılık Ltd. Şti., Ankara, 522 s. C2.3. Çakır, İ. 2000. Aeromonas hydrophila. Gıda Mikrobiyolojisi ve Uygulamaları, pp 427-432. Ankara Üniversitesi Ziraat Fakültesi Gıda Mühendisliği Bölümü yayını. Genişletilmiş 2. baskı. Sim Matbaacılık Ltd. Şti., Ankara, 522 s. C2.4. Doğan, H.B., Çakır, İ., Halkman, A.K. 2000. Clostridium botulinum. Gıda Mikrobiyolojisi ve Uygulamaları, pp 433-444. Ankara Üniversitesi Ziraat Fakültesi Gıda Mühendisliği Bolümü yayını. Genişletilmiş 2. baskı. Sim Matbaacılık Ltd. Şti., Ankara, 522 s. C2.5. Çakır, İ. 2000. Shigella spp. Gıda Mikrobiyolojisi ve Uygulamaları, pp 453-459. Ankara Üniversitesi Ziraat Fakültesi Gıda Mühendisliği Bölümü yayını. Genişletilmiş 2. baskı. Sim Matbaacılık Ltd. Şti., Ankara, 522 s. C2.6. Doğan, H.B., Çakır, İ. 2000. Clostridium tyrobutyricum. Gıda Mikrobiyolojisi ve Uygulamaları, pp 465-467. Ankara Üniversitesi Ziraat Fakültesi Gıda Mühendisliği Bölümü yayını. Genişletilmiş 2. baskı. Sim Matbaacılık Ltd. Şti., Ankara, 522 s. C2.7. Doğan, H.B., Tükel, Ç., Çakır, İ. 2000. Rop Sporu. Gıda Mikrobiyolojisi ve Uygulamaları, pp 469-471. Ankara Üniversitesi Ziraat Fakültesi Gıda Mühendisliği Bölümü yayını. Genişletilmiş 2. baskı. Sim Matbaacılık Ltd. Şti., Ankara, 522 s. C2.8. Tükel, Ç., Çakır, İ., Doğan, H.B. 2000. Lipolitik Mikroorganizmalar. Gıda Mikrobiyolojisi ve Uygulamaları, pp 473-475. Ankara Üniversitesi Ziraat Fakültesi Gıda Mühendisliği Bölümü yayını. Genişletilmiş 2. baskı. Sim Matbaacılık Ltd. Şti., Ankara, 522 s. C2.9. Çakır, İ., Doğan, H.B., Tükel, Ç. 2000. Proteolitik Mikroorganizmalar. Gıda Mikrobiyolojisi ve Uygulamaları, pp 477-480. Ankara Üniversitesi Ziraat Fakültesi Gıda Mühendisliği Bölümü yayını. Genişletilmiş 2. baskı. Sim Matbaacılık Ltd. Şti. Ankara, 522 s. C2.10. Çakır, İ. 2000. Gıda Kaynaklı Virüsler. Gıda Mikrobiyolojisi ve Uygulamaları, pp 481-488. Ankara Üniversitesi Ziraat Fakültesi Gıda Mühendisliği Bölümü yayını. Genişletilmiş 2. baskı. Sim Matbaacılık Ltd. Şti., Ankara, 522 s. C2.11. Doğan, H.B., Çakır, İ. 2000. Biyolojik Stabilite. Gıda Mikrobiyolojisi ve Uygulamaları, pp 495-496. Ankara Üniversitesi Ziraat Fakültesi Gıda Mühendisliği Bölümü yayını. Genişletilmiş 2. baskı. Sim Matbaacılık Ltd. Şti., Ankara, 522 s. C2.12. Çakır, İ., Doğan, H.B. 2000. Membran Filtrasyon Uygulamaları. Gıda Mikrobiyolojisi ve Uygulamaları, pp 497-506. Ankara Üniversitesi Ziraat Fakültesi Gıda Mühendisliği Bölümü yayını. Genişletilmiş 2. baskı. Sim Matbaacılık Ltd. Şti., Ankara, 522 s. D. Ulusal hakemli dergilerde yayımlanan makaleler : D1. Akoğlu, A., Karahan, A.G., Çakmakçı, M.L., Çakır, İ. 2010. Bakteriyel Selülozun Özellikleri ve Gıda Sanayinde Kullanımı. Gıda / The Journal of Food, 35 (2): 127-134. D2. Coşkun, H., Bayrak, A., Çakır, İ., Akoğlu, İ. T., Kıralan, M., İşleyen, F. 2008. Bolu ve çevresinde üretilen ve geleneksel bir süt ürünü olan Keş in yapılışı. Dünya Gıda Dergisi, 13: 42-48. 8

D3. Çakır, İ., Çakmakçı, M.L. 2005. Gıdalarda patojen mikroorganizma aranmasında kullanılan moleküler genetik yöntemler. Orlab On-Line Mikrobiyoloji Dergisi, 3 (12): 1-7. www.mikrobiyoloji.org/pdf/702051201.pdf D4. Çakır, İ., Çakmakçı, M.L. 2004. Probiyotikler: Tanımı, Etki Mekanizması, Seçim ve Güvenilirlik Kriterleri. Gıda, 29 (6): 427-434. D5. Çakır, İ., Kurucu, A., Başaran, N., Çakmakçı, M.L. 2002. Sauerkraut üretiminde bazı parametrelerin ürün kalitesi üzerine etkileri. Gıda, 27 (3): 179-183. D6. Çakır, İ., Karahan, A.G., Çakmakçı, M.L. 2002. Probiyotikler ve etki mekanizmaları. Gıda Mühendisliği Dergisi, 6 (12): 15-19. D7. Doğan, H.B., Çakır, İ., Keven, F., Coşansu, S., Kıral, N., Dağer, T.İ., Gürsu, G., Halkman, A.K. 2001. Çeşitli gıdalarda koliform, fekal koliform ve E. coli varlığı. Gıda, 26 (2): 83-90. D8. Çakır, İ., Çakmakçı, M.L. 1998. Et tavuklarının körbarsak florasında yer alan Laktobasillerin proteolitik aktiviteleri ve organik asit oluşturma yeteneklerinin belirlenmesi. AÜZF Tarım Bilimleri Dergisi, 4: (3) 53-58. E. Ulusal bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitaplarında basılan bildiriler: E1. Çakır, İ., Güneş, E. 2009. Süt Ürünlerinde Mikroenkapsülasyon Uygulamalarında Kullanılan Kaplama Materyallerinin Bazı Özellikleri. Bildiriler Özet Kitabı, pp. 162-163. Pamukkale Süt ve Süt Ürünleri Sempozyumu, 21-23 Mayıs 2009, Denizli, (Poster). E2. Kart Gündoğdu, A., Akoğlu, A., Karahan, A.G., Çakmakçı, M.L., Çakır, İ. 2009. Diyet Beyaz Peynir Üretiminde Bakteriyel Selüloz Kullanılması. Bildiriler Özet Kitabı, pp. 19-20. Pamukkale Süt ve Süt Ürünleri Sempozyumu, 21-23 Mayıs 2009, Denizli, (Poster). E3. Çakır, İ., İşleyen, M.F., Özcan, B. 2008. Mikroenkapsülasyonda Kullanılan Bazı Kaplama Materyallerinin Probiyotiklerin Mikrobiyolojik Stabilitesi Üzerine Etkisi. Bildiriler Kitabı pp. 809. Türkiye 10. Gıda Kongresi, 21-23 Mayıs 2008, Erzurum, (Poster). E4. Akoglu, A., Yakar, N., Çakır, İ., Çakmakçı, M.L., Karahan, A.G. Ertaş, A.H. 2008. Fermente Türk Sucuğu Üretiminde Bakteriyel Selüloz Kullanımı ve Etkilerinin Araştırılması. Bildiriler Kitabı, pp. 655. Türkiye 10. Gıda Kongresi, 21-23 Mayıs 2008, Erzurum, (Poster). E5. İşleyen, M.F., Özcan, B., Akoğlu, İ.T., Çakır, İ. Coşkun, H. 2008. Demineralize Peyniraltı Suyunun Probiyotiklerin Canlılık Düzeylerine Etkisi. Bildiriler Kitabı pp. 227. Türkiye 10. Gıda Kongresi, 21-23 Mayıs 2008, Erzurum, (Poster). E6. Coşkun, H., Bayrak, A., Çakır, İ., Akoğlu, İ.T., Kıralan, M., İşleyen, M.F. 2008. Bolu ve Çevresinde Üretilen ve Geleneksel Bir Süt Ürünü Olan Keş in Yapılışı. Bildiriler Kitabı pp. 81. Türkiye 10. Gıda Kongresi, 21-23 Mayıs 2008, Erzurum, (Sözlü Sunum). E7. Çakır, İ. 2008. Gıda Mikrobiyolojisinde Kullanılan Hızlı Yöntemler Alanındaki Gelişmeler ve Bu Yöntemlerin Endüstriyel Açıdan Geleceği. Bildiriler Kitabı pp. 23. Türkiye 10. Gıda Kongresi, 21-23 Mayıs 2008, Erzurum, (Sözlü Sunum). E8. Çakır, İ. 2007. Fonksiyonel Gıda Bileşenleri ve Probiyotiklerde Mikroenkapsülasyon Uygulamaları. pp. 107-110. 5. Gıda Mühendisliği Kongresi, Kongre Kitabı, 08-10 Kasım 2007, Filiz Matbaacılık San. ve Tic. Ltd. Sti., Ankara, 649 s. (Sözlü Sunum). 9

E9. Akoğlu, A., Yakar, N., Çakır, İ., Çakmakçı, M.L. 2007. Gluconacetobacter spp. nin Selüloz Üretimi Üzerine Glukoz ve Fruktozun Etkisi. 5. Gıda Mühendisligi Kongresi, Kongre Kitabı, pp. 439-443. 08-10 Kasım 2007, Filiz Matbaacılık San. ve Tic. Ltd. Sti., Ankara, 649 s. (Poster). E10. Acar Soykut, E., Çakır, İ. 2007. Değişik Kaynaklardan İzole Edilen Potansiyel Probiyotik Suşların Bakteriyofajlara Karşı Direnci. 15. Biyoteknoloji Kongresi, Biyoteknoloji 2007 Bildiri Kitabı, pp. 367. 29-31 Ekim 2007 Antalya. (Sözlü Sunum). E11. Çakır, İ. Akoğlu, A., Yakar, N., Çakmakçı, M.L., Karahan, A.G. 2007. Mikrobiyel Selüloz Üretiminde Kullanılan Gluconacetobacter spp. Suşunun Moleküler Tanısı. 15. Biyoteknoloji Kongresi, Biyoteknoloji 2007 Bildiri Kitabı, pp. 389. 29-31 Ekim 2007 Antalya. (Sözlü Sunum). E12. Çakır, İ. 2006. Mikroenkapsülasyon tekniğinin probiyotik gıda üretiminde kullanımı. Bildiriler Kitabı, pp. 693-696. Türkiye 9. Gıda Kongresi, 24-26 Mayıs 2006, Bolu, Sim Matbaası, Ankara. 1012 s. (Poster). E13. Dursun, D., Yakar, N., Çakır, İ., Çakmakçı, M.L. 2006. Mikrobiyel selüloz üretimi ve gıda sanayinde kullanımı. Bildiriler Kitabı pp. 981-984. Türkiye 9. Gıda Kongresi, 24-26 Mayıs 2006, Bolu, Sim Matbaası, Ankara. 1012 s. (Poster). E14. Çakır, İ., Çakmakçı, M.L. 2005. Çeşitli kaynaklardan izole edilen probiyotik bakterilerin düşük ph dirençleri. Kongre Kitabı. p 261. 4. Gıda Mühendisliği Kongresi, 29 Eylül-1 Ekim 2005, Ankara. (Poster). E15. Çakır, İ. 2005. Fonksiyonel gıdalar ve probiyotikler. Kongre Kitabı. pp. 57-69. 4. Gıda Mühendisliği Kongresi, 29 Eylül-1 Ekim 2005, Ankara. (Çağrılı Konferans). E16. Çakır, İ., Çakmakçı, M.L. 2005. Çeşitli kaynaklardan izole edilen laktik asit bakterilerinin moleküler tanısı ve ticari probiyotik preparatlarının canlılık durumları. Bildiri ve Poster Kitabı, pp. 390. 14. Biyoteknoloji Kongresi, 31 Ağustos-2 Eylül 2005. Eskişehir (Sözlü Sunum). E17. Çakır, İ., Çakmakçı, M.L. 2002. Probiyotik teknolojisi ve Türkiye deki durumu. Kongre Kitabı pp. 179-187. Türkiye 7. Gıda Kongresi, 22-24 Mayıs 2002, Ankara, Ankara Üniversitesi Basımevi, Ankara. 899 s. (Sözlü Sunum). E18. Kuleaşan, H., Fakıoğlu, Ö., Yaman, F., Çakır, İ., Doğan, H.B., Halkman, A.K. 2001. Escherichia coli O157:H7 izolasyonunda sıcaklığın etkisi. Bildiriler Kitabı, pp. 25-28, 12. Biyoteknoloji Kongresi, 17-19 Eylül, Balıkesir (Sözlü Sunum). F. Diğer yayınlar : F1. Bilgiyi Yayma ve Topluma Hizmet F1.1. Çakır, İ. 2010. Turizm İşletmelerinde Gıda Güvenliği ve Gıda Hijyeni. Bolu Valiliği İl Kültür ve Turizm Müdürlüğü, Turizm Haftası Etkinlikleri, 15-22 Nisan 2010, İl Kültür Merkezi, Bolu. (OREKA çalışanlarına ve halka açık Çağrılı Konferans). F1.2. Köroğlu TV (Bolu) yerel kanalında yayınlanan Üniversiteniz adlı TV programında canlı yayına katıldı. Mezunlar Derneği (İBUMED) üyeleri ile birlikte Mezunlarla İletişim ve Kariyer Gelişiminin Önemi konularında bilgiler verdi (12.04.2010). 10

F1.3. Çakır, İ. 2010. ISO 22000 the new approach to food safety management. TAIEX, Seminar on Food Hygiene Package. RTP 40159. 13-14 Ocak 2010, Bolu. (Bolu, Düzce ve diğer çevre illerden katılan Gıda Mühendislerine Eğitim Semineri). F1.4. Çakır, İ. 2009. Gıda Sanayinde Biyofilm Oluşumu ve Gıda Güvenliği Açısından Önemi. AİBÜ MMF Seminerleri, 03 Mart 2009, Bolu. F1.5. Çakır, İ. 2008. Probiyotik ve Fonksiyonel Gıda Bileşenlerinde Mikroenkapsülasyon Uygulamaları. AİBÜ MMF Seminerleri, 14 Nisan 2008, Bolu. F1.6. Çakır, İ. 2006. Beslenme ve Hijyen. Tarım İl Müdürlüğü, Dünya Gıda Günü Etkinlikleri. Bolu İl Kültür ve Turizm Müdürlüğü Konferans Salonu, 16 Ekim 2006, Bolu. Tarım İl Müdürlüğü, (İlk ve orta öğretim öğrencilerine açık, Konferans). F1.7. Çakır, İ. 2002. Patojen mikroorganizma aranmasında moleküler tekniklerin kullanımı. SDÜ Merkez Araştırma Laboratuvarı, 21 Mart 2002, Isparta. (Çağrılı Seminer). 11