T.C. ANADOLU ÜN VERS TES YAYINI NO: 2339 AÇIKÖ RET M FAKÜLTES YAYINI NO: 1336 V ROLOJ



Benzer belgeler
T.C. ANADOLU ÜN VERS TES YAYINI NO: 2339 AÇIKÖ RET M FAKÜLTES YAYINI NO: 1336 V ROLOJ

VİROLOJİ LBV211U KISA ÖZET

Viral Nükleik Asitler Viral nükleik asitler birbirlerinden son derece farklılık gösteren moleküllerdir. o Bazı viral nükleik asitler RNA, diğerleri DN

VİROLOJİ-1. Yrd. Doç. Dr. Müjde ERYILMAZ

Virusların genel özellikleri ve sınıflandırma

VİRUSLARIN SINIFLANDIRILMASI

Mikroorganizmalar; nükleus özelliklerine göre prokaryot ve ökaryot olmak üzere iki grupta incelenir.

K MYA 8 ÜN TE III KARBON H DRATLAR GENEL YAPILARI VE ADLANDIRILMALARI MONOSAKKAR TLER D SAKKAR TLER

S. 1) Aşağıdakilerden hangisi biyolojik mücadele ye örnektir? A) Üreaz enziminin üretimi. B) Sadece böcekleri hasta eden virüs üretimi.

Virüsler Hazırlayan: Yrd.Doç.Dr. Yosun MATER

VİROLOJİ - I VİRUSLARIN YAPISI

ADIM ADIM YGS-LYS 55. ADIM CANLILARIN SINIFLANDIRILMASI-15 VİRÜSLER

BAKTERİLERİN GENETİK KARAKTERLERİ

VĠRÜSLERĠN GENEL ÖZELLĠKLERĠ

Yrd. Doç. Dr. Olcay Bige AŞKUN. İşletme Yönetimi Öğretim ve Eğitiminde Örnek Olaylar ile Yazınsal Kurguları

Araflt rma modelinin oluflturulmas. Veri toplama

Mikroorganizmalar gözle görülmezler, bu yüzden mikroskopla incelenirler.

Mercedes-Benz Orijinal Ya lar

Doğada yaşayan canlıların tamamı hücrelerden oluşmuştur. Canlılardan bazıları tek bir

AFRİKA HASTALIĞI -SIĞIRLARIN NODÜLER EKZANTEMİ -LUMPY SKIN DISEASE (LSD)

2007 YILI VE ÖNCES TAR H BASKILI HAYVANCILIK B LG S DERS K TABINA L fik N DO RU YANLIfi CETVEL

K MYA K MYASAL TEPK MELER VE HESAPLAMALARI ÖRNEK 1 :

X +5 iyonunda; n = p + 1 eflitli i vard r. ATOM VE PER YOD K CETVEL ÖRNEK 15: ÖRNEK 16:

GAZLAR ÖRNEK 16: ÖRNEK 17: X (g) Y (g) Z (g)

6 MADDE VE ÖZELL KLER

Kocaeli Üniversitesi ktisadi ve dari Bilimler Fakültesi Ö retim Üyesi. 4. Bas

Aç ve Aç Ölçüsü. Üçgen, Kare ve Dikdörtgen. Geometrik Cisimler. Simetri. Örüntü ve Süslemeler

ULAfiTIRMA S STEMLER

Hücre zedelenmesi etkenleri. Doç. Dr. Halil Kıyıcı 2015

CO RAFYA AKARSULAR. ÖRNEK 1 : Afla daki haritada bir yöredeki akarsular gösterilmifltir.

PROKARYOT VE ÖKARYOT HÜCRELER

Pnömokokal hastal klar

CO RAFYA KONUM. ÖRNEK 2 : Afla daki haritada, Rize ile Bingöl il merkezlerinin yak n ndan geçen boylam gösterilmifltir.

VİRUS HASTALIKLARINDA TANI YÖNTEMLERİ

fiekil 2 Menapoz sonras dönemde kistik, unilateral adneksiyel kitleye yaklafl m algoritmas (6)

İ. Ü İstanbul Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı Prof. Dr. Filiz Aydın

DNA Đzolasyonu. Alkaline-SDS Plasmit Minipreleri. Miniprep ler bakteri kültüründen plasmit DNA sı izole etmenizi sağlar.

Tarifname BCL2 BASKILAMA İŞLEVİYLE ANTİ-KARSİNOJENİK ETKİ GÖSTERMEYE YÖNELİK BİR FORMÜLASYON

3- Kayan Filament Teorisi

K MYA GAZLAR. ÖRNEK 2: Kapal bir cam kapta eflit mol say s nda SO ve NO gaz kar fl m vard r. Bu kar fl mda, sabit s - cakl kta,

6. SINIF MATEMAT K DERS ÜN TELEND R LM fi YILLIK PLAN

Biyolojik Risk Etmenleri

Yrd. Doç. Dr. Seda SABAH Teknolojisi (Tartışma) 11:30 12:15 Tıbbi Biyoloji ve Genetik: DNA. Yrd. Doç. Dr. Seda SABAH Teknolojisi (Tartışma)

Yukar daki kare ve dikdörtgene göre eflitlikleri tan mlay n z. AB =... =... =... =...

VİTAMİN D VE İMMÜN SİSTEM VİTAMİN D

TIBBĠ BĠLĠMLERE GĠRĠġ DĠLĠMĠ MĠKROBĠYOLOJĠ ANABĠLĠM DALI

Buzağılarda Protein Beslemesi ve Buzağı Mamasının Önemi. Sayı:2013/Rm-37 Sayfa:

CO RAFYA GRAF KLER. Y llar Bu grafikteki bilgilere dayanarak afla daki sonuçlardan hangisine ulafl lamaz?

CO RAFYA. DÜNYA NIN fiekl N N VE HAREKETLER N N SONUÇLARI ÖRNEK 1 :

ÜN TE V SOSYAL TUR ZM

Tablo 3.3. TAKV YES Z KANAL SAC KALINLIKLARI (mm)

DR. NA L YILMAZ. Kastamonulular Örne i

ÇOCUK ve ERGENL KTE GUATR

Do al Say lar Do al Say larla Toplama fllemi Do al Say larla Ç karma fllemi Do al Say larla Çarpma fllemi Do al Say larla Bölme fllemi Kesirler

Mehmet TOMBAKO LU* * Hacettepe Üniversitesi, Nükleer Enerji Mühendisli i Bölümü

kesri 3 tane Bu kesri yedide üç fleklinde okuruz. Yukar daki bütün 7 efl parçaya ayr lm flt r. Buna payda denir. 3

Tablo 2.1. Denetim Türleri. 2.1.Denetçilerin Statülerine Göre Denetim Türleri

HEPATİT C SIK SORULAN SORULAR

G ünümüzde bir çok firma sat fllar n artt rmak amac yla çeflitli adlar (Sat fl

Hepatit B. HASTALIK Hepatit B nin etkeni nedir? Hepatit B hepatit B virüsü (HBV) ile meydana getirilen bir hastal kt r.

GEOMETR 7 ÜN TE III S L ND R

standartlar Standartlar ve Sertifikalar sertifika

Proteinler. Fonksiyonlarına göre proteinler. Fonksiyonlarına göre proteinler

TÜRK YE B L MSEL VE TEKNOLOJ K ARAfiTIRMA KURUMU DESTEK PROGRAMLARI BAfiKANLIKLARI KURULUfi, GÖREV, YETK VE ÇALIfiMA ESASLARINA L fik N YÖNETMEL K (*)

12. SINIF KONU ANLATIMI 2 DNA VE RNA

T.C. ANADOLU ÜNİVERSİTESİ YAYINI NO: 3275 AÇIKÖĞRETİM FAKÜLTESİ YAYINI NO: 2138 HAVACILIK EMNİYETİ

Uluslararas De erleme K lavuz Notu, No.11 De erlemelerin Gözden Geçirilmesi

ANKARA ÜNİVERSİTESİ PSİKİYATRİK KRİZ UYGULAMA VE ARAŞTIRMA MERKEZİ

256 = 2 8 = = = 2. Bu kez de iflik bir yan t bulduk. Bir yerde bir yanl fl yapt k, ama nerde? kinci hesab m z yanl fl.

ÜN TE II L M T. Limit Sa dan ve Soldan Limit Özel Fonksiyonlarda Limit Limit Teoremleri Belirsizlik Durumlar Örnekler

BELGES Z MAL BULUNDURULMASI VEYA H ZMET SATIN ALINMASI NEDEN YLE KDV SORUMLULU U

MİKROBİYOLOJİ SORU KAMPI 2015

MURAT YÜKSEL. FEM N ST HUKUK KURAMI VE FEM N ST DÜfiÜNCE TEOR LER

Bakteriyofajlara kısaca faj da denilmektedir

MOTORLU TAfiIT SÜRÜCÜLER KURSLARINDA KATMA DE ER VERG S N DO URAN OLAY

SÜRES NASIL HESAP ED MEL D R?

TEMEL MATEMAT K TEST

OYUNCU SAYISI Oyun bir çocuk taraf ndan oynanabilece i gibi, farkl yafl gruplar nda 2-6 çocuk ile de oynanabilir.

Sermaye Piyasas nda Uluslararas De erleme Standartlar Hakk nda Tebli (Seri :VIII, No:45)

CO RAFYA. TÜRK YE DE YERfiEK LLER VE ETK LER

11. SINIF KONU ANLATIMLI. 2. ÜNİTE: KUVVET ve HAREKET 4. KONU AĞIRLIK MERKEZİ - KÜTLE MERKEZİ ETKİNLİK ÇÖZÜMLERİ

Fizik I (Fizik ve Ölçme) - Ders sorumlusu: Yrd.Doç.Dr.Hilmi Ku çu

2. Projelerle bütçe formatlar n bütünlefltirme

Okumufl / Mete (Ed.) Anne Babalar için Do uma Haz rl k / Sa l k Profesyonelleri için Rehber 16.5 x 24 cm, XIV Sayfa ISBN

Romatizmal Ateş ve Streptokok Enfeksiyonu Sonrası Gelişen Reaktif Artrit

MATEMAT K. Hacmi Ölçme

AURAM NE RHODAM NE FLORESAN BOYAMA

4- Solunum Sisteminin Çalışması : Solunum sistemi soluk (nefes) alıp verme olayları sayesinde çalışır.

DERMATOZLU KÖPEKLERDE MALASSEZİA ETKENLERİNİN PREVALANSI

L K Ö R E T M. temel1 kaynak MUTLU. Matematik Türkçe Hayat Bilgisi

BOYAR MADDELERDE AKTİF KARBONUN ADSORPLANMA ÖZELLİĞİNE HİDROJEN PEROKSİTİN ETKİSİ

... ANADOLU L SES E T M YILI I. DÖNEM 10. SINIF K MYA DERS 1. YAZILI SINAVI SINIFI: Ö RENC NO: Ö RENC N N ADI VE SOYADI:

Ders 3: SORUN ANAL Z. Sorun analizi nedir? Sorun analizinin yöntemi. Sorun analizinin ana ad mlar. Sorun A ac

İÇİNDEKİLER. 1 Projenin Amacı Giriş Yöntem Sonuçlar ve Tartışma Kaynakça... 7

VOB- MKB ENDEKS FARKI VADEL filem SÖZLEfiMES

DÖNEM 1- A, 3. DERS KURULU ( )


Bir Müflterinin Yaflam Boyu De erini Hesaplamak çin Form

Zihinden fllem Yapal m, Yuvarlayal m, Tahmin Edelim

İZMİR KÂTİP ÇELEBİ ÜNİVERSİTESİ ENGELSİZ ÜNİVERSİTE KOORDİNATÖRLÜĞÜ VE ENGELLİ ÖĞRENCİ BİRİMİ ÇALIŞMA USUL VE ESASLARI BİRİNCİ BÖLÜM

Transkript:

T.C. ANADOLU ÜN VERS TES YAYINI NO: 2339 AÇIKÖ RET M FAKÜLTES YAYINI NO: 1336 V ROLOJ Yazarlar Prof.Dr. Kadir YEfi LBA (Ünite 1-8) Prof.Dr. Mehmet ÇABALAR (Ünite 7-10) Editör Prof.Dr. Kadir YEfi LBA ANADOLU ÜN VERS TES

Bu kitab n bas m, yay m ve sat fl haklar Anadolu Üniversitesine aittir. Uzaktan Ö retim tekni ine uygun olarak haz rlanan bu kitab n bütün haklar sakl d r. lgili kurulufltan izin almadan kitab n tümü ya da bölümleri mekanik, elektronik, fotokopi, manyetik kay t veya baflka flekillerde ço alt lamaz, bas lamaz ve da t lamaz. Copyright 2011 by Anadolu University All rights reserved No part of this book may be reproduced or stored in a retrieval system, or transmitted in any form or by any means mechanical, electronic, photocopy, magnetic, tape or otherwise, without permission in writing from the University. UZAKTAN Ö RET M TASARIM B R M Genel Koordinatör Prof.Dr. Levend K l ç Genel Koordinatör Yard mc s Doç.Dr. Müjgan Bozkaya Ö retim Tasar mc lar Doç.Dr. Murat Ataizi Yrd.Doç.Dr. Figen Ünal Çolak Grafik Tasar m Yönetmenleri Prof. Tevfik Fikret Uçar Ö r.gör. Cemalettin Y ld z Ö r.gör. Nilgün Salur Ölçme De erlendirme Sorumlusu Ö r.gör. U ur Pifliren Grafikerler Nihal Sürücü Ayflegül Dibek Kitap Koordinasyon Birimi Yrd.Doç.Dr. Feyyaz Bodur Uzm. Nermin Özgür Kapak Düzeni Prof. Tevfik Fikret Uçar Dizgi Aç kö retim Fakültesi Dizgi Ekibi Viroloji ISBN 978-975-06-1013-4 1. Bask Bu kitap ANADOLU ÜN VERS TES Web-Ofset Tesislerinde 10.700 adet bas lm flt r. ESK fieh R, Eylül 2011

çindekiler iii çindekiler Önsöz... xi Viruslar n Genel Özellikleri... 2 G R fi... 3 V RUSLARIN HAYATIMIZDAK YER... 3 Viruslar n Biyolojik Mücadele Arac Olarak Kullan lmas... 4 Viruslar n Vektör Olarak Kullan lmas... 4 Bakterilerin Tiplendirilmesinde Viruslar n (faj) Kullan m... 4 Moleküler Biyolojide Kullan lan Enzimlerin Eldesi... 4 Kanser Tedavisinde Viruslar n Kullan m... 5 V RUS NED R?... 5 Viruslarla Bakteriler Aras ndaki Farklar... 6 V RUSLARIN YAPISAL BÖLÜMLER... 7 Virion... 7 Viral Nükleik Asit... 7 Viral Proteinler... 9 Viral Zarf... 9 Viral Enzimler... 11 V RUS MORFOLOJ LER... 11 Kübik ( kosahedral) Simetri... 11 Helikal Simetri... 12 Kompleks Simetri... 12 Kombine Simetri... 13 V RUSLARIN F Z KSEL VE K MYASAL ETK LERE DUYARLILI I... 14 S cakl k... 14 ph... 15 Radyasyon... 15 Fotodinamik naktivasyon... 15 Tuz Çözeltileriyle Stabilizasyon... 15 Ya Eriticilerine Duyarl l k... 15 Formaldehit... 15 Di er Kimyasal Maddeler ve Antimikrobiyel Ajanlar... 15 Özet... 16 Kendimizi S nayal m... 17 Kendimizi S nayal m Yan t Anahtar... 18 S ra Sizde Yan t Anahtar... 18 Yararlan lan Kaynaklar... 19 Viruslarda S n fland rma ve Ço alma... 20 V RUSLARIN SINIFLANDIRILMASI... 21 SUBV RAL AJANLAR... 25 Viroidler... 25 Virusoidler ve Uydu Viruslar... 25 Prionlar... 25 V RUSLARDA ÇO ALMA... 26 Tutunma (Adsorbsiyon) Basama... 27 Penetrasyon ( çeri Al nma)... 27 Eklips (Sentez Aflamas )... 29 Olgun Virus Partikülü Oluflumu (Matürasyon)... 29 1. ÜN TE 2. ÜN TE

iv çindekiler D flar Dökülme... 29 V RUS ÇO ALMASININ DURDURULMASI... 29 Antiviral Ajanlar... 29 nterferonlar ve nterferens... 31 V RUSLARDA GENET K DE fi M... 32 Özet... 33 Kendimizi S nayal m... 34 Kendimizi S nayal m Yan t Anahtar... 35 S ra Sizde Yan t Anahtar... 35 Yararlan lan Kaynaklar... 35 3. ÜN TE 4. ÜN TE Viruslar n Üretilmesi... 36 V RUS ÜRET LMES NDE KULLANILAN ORTAMLAR... 37 Deney Hayvanlar... 37 Konvansiyonel Hayvanlar... 37 SPF (Spesifik Patojen Free) Hayvanlar... 37 Germ Free Hayvanlar... 37 Embriyolu Yumurtalar... 38 Embriyolu Tavuk Yumurtas na Virus Ekimi... 39 Hücre Kültürleri... 40 Subkültür Haz rlanmas... 42 Hücrelerin Dondurulmas ve Çözülmesi... 43 HÜCRE KÜLTÜRLER NE V RUS EK M... 44 V RUS ÜREMES N N SAPTANMASI... 45 Sitopatojen Viruslar n Üremesine Ba l Hücresel De ifliklikler... 45 Proliferatif Viruslar n Üremesine Ba l De ifliklikler... 45 Sitopatojen Olmayan (Hücre Kültüründe Morfolojik De iflim Yapmadan Ço alan) Viruslar... 45 V RUSLARIN T TRASYONU... 46 Plak Test... 46 Özet... 48 Kendimizi S nayal m... 49 Kendimizi S nayal m Yan t Anahtar... 50 S ra Sizde Yan t Anahtar... 50 Yararlan lan Kaynaklar... 51 Viruslarda Buluflma ve Hastal k Oluflturma Süreci... 52 V RUSLARIN BULAfiMA YOLLARI... 53 Horizontal Bulaflma... 53 Vertikal Bulaflma... 54 V RUSLARIN ORGAN ZMAYA G R fi... 55 Solunum Kanal Yolu ile Girifl... 56 Sindirim Kanal Yolu ile Girifl... 56 Deri Yolu ile Girifl... 57 Genital Kanal Yolu ile Girifl... 58 Konjuktiva Yolu ile Girifl... 58 V RUSLARIN ORGAN ZMA Ç NDE YAYILMASI... 58 Kan Yoluyla Yay l m... 58 Sinirler Yoluyla Yay l m... 58 HEDEF DOKULARA LOKAL ZASYON... 59 HASTALIK BEL RT LER N N OLUfiMASI... 59 Direkt Doku Hasar... 59

çindekiler v Doku Hasar Olmadan fiekillenen Fizyolojik Bozukluklar... 60 Doku Hasar Sonucu Sekonder Enfeksiyonlar Teflvik... 60 V RUSLARIN VÜCUT DIfiINA SAÇILIMI... 60 V RUSLARIN ORGAN ZMADAN EL M NE ED LMES... 61 Özet... 62 Kendimizi S nayal m... 64 Okuma Parças... 65 Kendimizi S nayal m Yan t Anahtar... 66 S ra Sizde Yan t Anahtar... 66 Yararlan lan Kaynaklar... 67 Laboratuvar Gereksinimleri ve Temel Uygulamalar... 68 V ROLOJ LABORATUVARINDA ÇALIfiMA... 69 KOfiULLARI... 69 zolasyon... 69 Sterilizasyon... 70 Dezenfeksiyon - Dekontaminasyon... 70 Laboratuvar Donan m... 71 TEMEL C HAZLAR VE MALZEMELER... 71 Santrifüjler... 71 Biyogüvenlik Kabinleri... 72 Mikroskoplar... 73 Derin Dondurucular... 74 Homojenizatörler... 75 Kar flt r c lar ve Çalkalay c lar... 75 Su Banyosu... 76 nkübatörler... 76 Filtrasyon Sistemleri... 76 Otoklav ve Sterilizatör... 77 Cam Malzemeler... 78 TEMEL UYGULAMALAR... 79 Pipet Kullan m... 79 Sterilizasyon... 80 Kuru S cak Hava ile Sterilizasyon... 80 Nemli S cak Hava ile Sterilizasyon... 80 Ifl nlama ile Sterilizasyon... 81 Gaz ile Sterilizasyon... 81 Filtrasyon ile Sterilizasyon... 82 Santrifüjleme fllemi... 82 Özet... 84 Kendimizi S nayal m... 85 Kendimizi S nayal m Yan t Anahtar... 86 S ra Sizde Yan t Anahtar... 86 Yararlan lan Kaynaklar... 87 Viral Hastal klar n Teflhisi... 88 V ROLOJ K TEfiH S AMACIYLA ÖRNEKLEME... 89 Örneklerin Nakledilmesi... 90 ÖRNEKLER N TESTLERDE KULLANILMAK ÜZERE HAZIRLANMASI... 91 Organ ve D flk Örneklerinin Haz rlanmas... 91 Kan Örneklerinin Haz rlanmas... 92 Virus zolasyonu çin Kullan lacak Kan n Haz rlanmas 5. ÜN TE 6. ÜN TE

vi çindekiler (Löykosit Haz rlama)... 92 Serolojik Çal flmalarda Kullan lacak Kan n Haz rlanmas... 92 Svab (Sürüntü) Örneklerinin Haz rlanmas... 93 nokulumun Bakteriyel Kontaminasyondan Ar nd r lmas... 94 V ROLOJ K TEfiH S YÖNTEMLER... 94 Virus Partikülünün Tespiti... 94 Virus zolasyonu ve dentifikasyonu... 94 Viral Antijenlerin Tespitinde Kullan lan Yöntemler... 95 ELISA (Enzyme-Linked Immunosorbent Assay)... 96 mmunoperoksidaz Tekni i... 98 mmunofloresan Tekni i... 98 Hemaglütinasyon Testi (HA)... 99 Virusa Spesifik Antikorlar n Tespitinde Kullan lan Serolojik Yöntemler... 100 Nötralizasyon Testi... 101 ELISA (Enzyme-Linked Immunosorbent Assay)... 102 Agar Jel mmunodifuzyon Testi (AGID)... 103 Hemaglütinasyon nhibisyon Testi... 104 ndirekt mmunofloresan Tekni i (IFAT)... 104 Viral Nükleik Asit Tespitinde Kullan lan Yöntemler... 104 Özet... 105 Kendimizi S nayal m... 107 Okuma Parças... 108 Kendimizi S nayal m Yan t Anahtar... 108 S ra Sizde Yan t Anahtar... 109 Yararlan lan Kaynaklar... 109 7. ÜN TE S rlar n Önemli Viral Hastal klar... 110 G R fi... 111 fiap HASTALI I... 112 Etiyoloji... 112 Epidemiyoloji... 112 Patogenez ve Klinik Bulgular... 112 Teflhis... 113 Korunma ve Kontrol... 113 SI IR VEBASI... 114 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 114 Patogenez ve Klinik Bulgular... 114 Teflhis... 115 Korunma ve Kontrol... 115 SI IRLARIN ENFEKS YÖZ RH NOTRAKE T S... 115 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 115 Patogenez ve Klinik Bulgular... 115 Teflhis... 116 Korunma ve Kontrol... 117 SI IRLARIN V RAL D YARES... 117 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 117 Patogenez ve Klinik Bulgular... 117 Teflhis... 119 Korunma ve Kontrol... 119 SI IR LÖYKOZU... 119 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 119 Patogenez ve Klinik Bulgular... 120

çindekiler vii Teflhis... 120 Korunma ve Kontrol... 120 AKABANE HASTALI I... 120 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 120 Patogenez ve Klinik Bulgular... 121 Teflhis... 121 Korunma ve Kontrol... 121 ÜÇ GÜN HASTALI I... 121 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 122 Patogenez ve Klinik Bulgular... 122 Teflhis... 122 Korunma ve Kontrol... 122 SI IRLARIN KOR ZASI... 122 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 122 Patogenez ve Klinik Bulgular... 123 Teflhis... 124 Korunma ve Kontrol... 124 SI IRLARIN SÜNGER MS BEY N HASTALI I... 124 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 124 Patogenez ve Klinik Bulgular... 124 Teflhis... 125 Korunma ve Kontrol... 125 NEONATAL BUZA I SHALLER... 125 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 125 Patogenez ve Klinik Bulgular... 125 Teflhis... 126 Korunma ve Kontrol... 126 SI IRLARIN MEME BAfiI HASTALIKLARI... 126 S rlar n Mamillitisi... 126 S rlar n Papillomatozu... 127 S r Çiçe i... 128 Yalanc S r Çiçe i... 128 SI IRLARIN SOLUNUM S STEM HASTALIK KOMPLEKS... 129 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 129 Patogenez ve Klinik Bulgular... 129 Teflhis... 130 Korunma ve Kontrol... 130 Özet... 131 Kendimizi S nayal m... 134 Okuma Parças -1... 135 Okuma Parças -2... 135 Kendimizi S nayal m Yan t Anahtar... 136 S ra Sizde Yan t Anahtar... 136 Yararlan lan Kaynaklar... 137 Koyun ve Keçilerin Önemli Viral Hastal klar... 138 G R fi... 139 MAV D L HASTALI I... 140 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 140 Patogenez ve Klinik Bulgular... 140 Teflhis... 141 Korunma ve Kontrol... 141 8. ÜN TE

viii çindekiler BORDER DISEASE... 141 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 142 Patogenez ve Klinik Bulgular... 142 Teflhis... 143 Korunma ve Kontrol... 143 KÜÇÜK RUM NANT VEBASI... 143 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 143 Patogenez ve Klinik Bulgular... 143 Teflhis... 144 Korunma ve Kontrol... 144 MAED -V SNA... 144 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 144 Patogenez ve Klinik Bulgular... 144 Teflhis... 145 Korunma ve Kontrol... 145 KEÇ LER N ARTR T S-ENSEFAL T S ENFEKS YONU... 145 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 145 Patogenez ve Klinik Bulgular... 146 Teflhis... 146 Korunma ve Kontrol... 146 KOYUN VE KEÇ Ç ÇE... 146 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 146 Patogenez ve Klinik Bulgular... 147 Teflhis... 147 Korunma ve Kontrol... 148 EKT MA KONTAG OZUM (ORF)... 148 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 148 Patogenez ve Klinik Bulgular... 148 Teflhis... 149 Korunma ve Kontrol... 149 SCRAP E... 149 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 149 Patogenez ve Klinik Bulgular... 150 Teflhis... 150 Korunma ve Kontrol... 151 AKUT V RAL SOLUNUM S STEM ENFEKS YONLARI... 151 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 151 Patogenez ve Klinik Bulgular... 151 Teflhis... 152 Korunma ve Kontrol... 152 Özet... 153 Kendimizi S nayal m... 155 Okuma Parças... 156 Kendimizi S nayal m Yan t Anahtar... 156 S ra Sizde Yan t Anahtar... 156 Yararlan lan Kaynaklar... 157 9. ÜN TE Köpek ve Kedilerin Önemli Viral Hastal klar... 158 G R fi... 159 KUDUZ... 160 Etiyoloji... 160 Epidemiyoloji... 160

çindekiler ix Patogenez ve Klinik Bulgular... 161 Teflhis... 161 Korunma ve Kontrol... 162 KÖPEKLER N GENÇL K HASTALI I... 162 Etiyoloji... 162 Epidemiyoloji... 163 Patogenez ve Klinik Bulgular... 163 Teflhis... 164 Korunma ve Kontrol... 164 KÖPEKLER N PARVOV RUS ENFEKS YONU... 164 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 164 Patogenez ve Klinik Bulgular... 164 Teflhis... 165 Korunma ve Kontrol... 165 KÖPEKLER N ENFEKS YÖZ KARAC ER YANGISI... 165 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 165 Patogenez ve Klinik Bulgular... 165 Teflhis... 166 Korunma ve Kontrol... 166 KÖPEKLER N ENFEKS YÖZ TRAKEOBRONfi T S... 166 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 166 Klinik Bulgular... 166 Teflhis... 167 Korunma ve Kontrol... 167 KÖPEKLER N HERPESV RUS ENFEKS YONU... 167 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 167 Patogenez ve Klinik Bulgular... 167 Teflhis... 168 Korunma ve Kontrol... 168 KÖPEKLER N ORAL PAP LLOMATOZU... 168 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 168 Patogenez ve Klinik Bulgular... 168 Teflhis... 169 Korunma ve Kontrol... 169 KED LER N GENÇL K HASTALI I... 169 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 169 Patogenez ve Klinik Bulgular... 169 Teflhis... 169 Korunma ve Kontrol... 170 KED LER N HERPESV RUS ENFEKS YONU... 170 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 170 Patogenez ve Klinik Bulgular... 170 Teflhis... 171 Korunma ve Kontrol... 171 KED LER N CAL C V RUS ENFEKS YONU... 171 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 171 Patogenez ve Klinik Bulgular... 171 Teflhis... 172 Korunma ve Kontrol... 172 KED LER N ENFEKS YÖZ PER TON T S... 172 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 172 Patogenez ve Klinik Bulgular... 172

x çindekiler Teflhis... 173 Korunma ve Kontrol... 173 Özet... 174 Kendimizi S nayal m... 176 Okuma Parças... 177 Kendimizi S nayal m Yan t Anahtar... 177 S ra Sizde Yan t Anahtar... 178 Yararlan lan Kaynaklar... 179 10. ÜN TE Atlar n Önemli Viral Hastal klar... 180 G R fi... 181 AT VEBASI... 181 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 182 Patogenez ve Klinik Bulgular... 182 Teflhis... 183 Korunma ve Kontrol... 183 ATLARIN NFLUENZASI... 183 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 183 Patogenez ve Klinik Bulgular... 184 Teflhis... 184 Korunma ve Kontrol... 184 ATLARIN ENFEKS YÖZ ANEM S... 184 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 184 Patogenez ve Klinik Bulgular... 185 Teflhis... 185 Korunma ve Kontrol... 185 ATLARIN V RAL ARTER T S... 185 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 185 Patogenez ve Klinik Bulgular... 186 Teflhis... 186 Korunma ve Kontrol... 186 ATLARIN HERPESV RUS ENFEKS YONU... 187 Etiyoloji ve Epidemiyoloji... 187 Patogenez ve Klinik Bulgular... 187 Teflhis... 188 Korunma ve Kontrol... 188 Özet... 189 Kendimizi S nayal m... 190 Okuma Parças..... 191 Kendimizi S nayal m Yan t Anahtar... 192 S ra Sizde Yan t Anahtar... 192 Yararlan lan Kaynaklar... 192 Sözlük... 193

Önsöz xi Önsöz Viroloji; viruslar n özelliklerini, yaflam döngüsünü ve oluflturduklar hastal klar inceleyen bilim dal d r. Günlük hayat m zda bile birçok virusun ad yla veya bunlar n oluflturduklar hastal klarla karfl laflmaktay z. Ayr ca, sürekli olarak yeni viruslar n tespit edildi ini veya mevcut viruslar n de iflime u rayarak yeni hastal klar ve salg nlar oluflturabildi ini de duyabiliyoruz. Bütün bu gerekçeler viruslarla ilgili bilgi birikiminin art r lmas ve mümkün oldu u kadar genifl kitlelere aktar lmas gerekti ini göstermektedir. Lisans e itimi veren programlar ndan ba ms z haz rlanan bu kitapta, önlisans programlar na yönelik olarak genel viroloji konular, viroloji laboratuvar na iliflkin genel koflullar ve hayvanlarda viruslar n neden oldu u önemli hastal klar hakk nda temel bilgilerin bir düzen içinde verilmesi amaçlanm flt r. E itim amaçl kullan lacak bir kitap olmas nedeniyle terimler mümkün oldu unca Türkçe karfl l klar ile kullan lm fl, tam olarak Türkçe karfl l bulunmayan terimler için genifl kapsaml bir sözlük haz rlanm flt r. Bu kitab n haz rlanmas nda baflta yazar olarak büyük katk sa layan Prof.Dr. Mehmet Çabalar olmak üzere eme i geçen herkese teflekkür ediyorum. Ö rencilerimize ve tüm kullan c lara yararl olmas dile iyle Editör Prof.Dr. Kadir Yeflilba

1V ROLOJ Amaçlar m z Bu üniteyi tamamlad ktan sonra; Virusleri tan mlayabilecek, Viruslar n yap s n aç klayabilecek, Viruslar n di er mikroorganizmalardan farklar n s ralayabilecek, Viruslar n çevresel faktörlerden nas l etkilendi ini aç klayabileceksiniz. Anahtar Kavramlar Virus Virion Virus simetrisi Nükleik asit Viral zarf çindekiler Viroloji Viruslar n Genel Özellikleri G R fi V RUSLARIN HAYATIMIZDAK YER V RUS NED R? V RUSLARIN YAPISAL BÖLÜMLER V RUS MORFOLOJ LER V RUSLARIN F Z KSEL VE K MYASAL ETK LERE DUYARLILI I

Viruslar n Genel Özellikleri G R fi Viruslar n yap s n, biyolojisini, virus-konakç iliflkilerini ve viruslar n neden oldu- u hastal klar inceleyen bilim alan Viroloji olarak adland r lmaktad r. Modern anlamdaki viroloji çal flmalar n n 1885 y l nda Frans z bilim adam Louis Pasteur ve 1892 y l nda Rus bilim adam Dimitri Iwanowski taraf ndan yap lan çal flmalarla bafllad kabul edilmektedir. Ancak tarihi belgelere dayan larak yap lan yorumlarda çok daha eski dönemlerde viral hastal klar n var oldu u anlafl lmaktad r. Örne- in viral bir hastal k olan insan çiçe i hastal n n MÖ 10.000 li y llarda Kuzeydo- u Afrika da bulundu u ve buradan ticaret kervanlar yla Orta Asya ya tafl nd na inan lmaktad r. Ayr ca Eski M s r a ait olan ve MÖ 1400 lere tarihlendirilen hiyeroglif tabletlerde çocuk felci hastal n n resmedildi i görülebilir. MÖ 1000 li y llara ait Eski Yunan ve Mezopotamya kanunlar nda da kuduz hastal ndan bahsedildi i bilinmektedir. Bütün bu bilgiler viruslar n neden oldu u hastal klar n çok uzun y llar önce var oldu unu ancak modern anlamdaki viroloji çal flmalar n n yaklafl k 100 y l önce bafllad n göstermektedir. Louis Pasteur ü tüm dünyada üne kavuflturan çal flmay biliyor musunuz? 1 Yirminci yüzy l ve sonras nda birçok salg n hastal k kontrol alt na al n rken yeni DÜfiÜNEL M DÜfiÜNEL M viral hastal klar n ortaya ç kt ve bilim dünyas nda a rl kl gündem oluflturdu u da görülmektedir. Baflta AIDS (edinsel immunyetmezlik sendromu) olmak üzere s rlar n süngerimsi beyin hastal (BSE), köpeklerin parvovirus enfeksiyonu, SORU insanlarda SORU atipik akut solunum yolu sendromu (SARS), viral hepatitler (hepatit B ve C) ve kufl gribi (yüksek patojeniteli avian influenza) bu kapsamda say labilecek örneklerdir. Genel olarak insanlar ve hayvanlar enfekte eden viruslar hayvan viruslar olarak tan mlan r. Ancak viruslar, insanlar ve hayvanlar d fl nda bitkileri, bakterileri, mayalar, mantarlar, algleri, mikoplazmalar ve protozoonlar SIRA da S ZDE enfekte edebilmektedir. An lan konakç sistemlerde enfeksiyon oluflturdu u saptanm fl olan 4000 den fazla virus türü bulunmaktad r. AMAÇLARIMIZ AMAÇLARIMIZ V RUSLARIN HAYATIMIZDAK YER Viruslar günlük hayatta daha çok hastal k etkeni olarak gündeme gelmektedir. Ancak viruslar n gündelik hayat m za yans yan birçok olayda insan eliyle ve bazen de K T A P yararl amaçlarla kullan labilen biyolojik bir araç olarak da görev alabildi ini bilmek gerekir. Bu durumu birkaç örnekle aç klayabiliriz: TELEV ZYON K T A P TELEV ZYON NTERNET NTERNET

4 Viroloji Viruslar n Biyolojik Mücadele Arac Olarak Kullan lmas Viruslar do ada biyolojik mücadele arac olarak kullan labilmektedir. Bu amaçla hayvan viruslar yla yap lan iki önemli deneme vard r. Bu denemelerin ikisi de Avustralya da afl r düzeyde ço almas nedeniyle do al hayat ve bitki örtüsünü tehdit eden ve tar m arazilerine zarar veren yaban tavflanlar na karfl uygulanm flt r. Avustralya da do al hayatta 100 milyon civar nda yabani tavflan bulundu u düflünülmektedir. Afl r ço alan bu popülasyonu viruslar kullanarak kontrol edebilmek için ilk uygulama tavflan myxoma virusu ile yap lm flt r. Bu virus Avustralya daki yaban tavflan popülasyonunu oluflturan Avrupa tavflanlar nda (Oryctolagus sp.) ölümcül enfeksiyonlara neden olmaktad r. Ancak bafllang çta baflar l olan bu uygulama ayn baflar yla devam ettirilememifl ve bunun yerine baflka bir tavflan virusu olan tavflan hemorajik hastal virusu kullan lm flt r. Viruslar n biyolojik mücadele arac olarak kullan m yla ilgili bir di er yaklafl m ise sivrisinek ço almas n n viruslar kullan larak kontrol alt na al nmas d r. Böylece insanlar veya hayvanlara sinekler arac l ile nakledilen hastal klar n kontrol alt - na al nmas hedeflenmektedir. Birçok viral hastal n vektörü olan sokucu sineklerle mücadele özellikle subtropik bölgelerde oldukça zordur. Genifl çapl ilaçlamalar ise hem çevreyi tehdit etmekte hem de do al hayat olumsuz yönde etkilemektedir. Soruna biyolojik bir çözüm olarak; bu sineklerin özellikle larvalar n enfekte eden ve sinek popülasyonunu azaltan viruslar üzerinde durulmaktad r. Bu sayede sineklerin tamamen ortadan kald r lmas mümkün olmasa bile hastal klar n yay l m h z n n azalt labilece i de erlendirilmektedir. Gelecekte önem kazanabilecek bir di er örnek ise viruslar n tar m ürünlerine zarar veren böceklerle mücadelede pestisit olarak kullan lmas d r. Bu uygulama özellikle kimyasal ilaçlarla yap lan böcek mücadelesine katk sa lamas, çevre ile dost ve do al bir alternatif oluflturmas aç s ndan önemlidir. Ancak bu fikir henüz pratikte kullan m aflamas na gelmemifltir. Viruslar n Vektör Olarak Kullan lmas Belirli enzimlerle kesilen DNA bölgelerinin baflka canl türlerinin DNA s na monte edilebilmesi mümkündür. Di er mikroorganizmalarda oldu u gibi viral nükleik asitlerle de bu tip uygulamalar yap labilmektedir. Böylece gen aktar m yap lan virus yeni genleri enfekte etti i hücrelere veya canl lara tafl makta ve kendi ço almas s ras nda bu genleri de ço altarak kodlad proteinlerin sentezine olanak tan - maktad r. Bu yolla DNA afl lar n n üretilebilmesi, mikrobiyel bir proteinin baflka bir mikroorganizmaya sentez ettirilip afl olarak kullan lmas ve birden fazla mikroorganizma için ayn anda tek vektör DNA ile afl üretilmesi mümkün olabilmektedir. Faj (bakteriyofaj): Bakterileri enfekte eden viruslara faj veya bakteriyofaj ad verilir. Çok de iflik faj tipleri bulunmaktad r. Bakterilerin neden oldu u hastal klarda tedavi edici amaçlarla fajlar n kullan m denenmifl ancak bu yaklafl m uygulamaya aktar lamam flt r. Bakterilerin Tiplendirilmesinde Viruslar n (faj) Kullan m Salmonella gibi baz bakterilerin cins düzeyinde s n fland r lmas iflleminde de iflik fajlara duyarl l klar dikkate al nmaktad r. Moleküler Biyolojide Kullan lan Enzimlerin Eldesi Moleküler biyoloji çal flmalar nda ihtiyaç duyulan baz enzimler viruslardan köken almaktad r. Örne in polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) uygulamalar nda önemli bir yeri olan reverz transkriptaz enzimi retroviruslardan köken al r.

1. Ünite - Viruslar n Genel Özellikleri 5 Kanser Tedavisinde Viruslar n Kullan m Herpes simplex virus ve vaccinia virus gibi baz viruslar genetik de iflime u rat larak kanser tedavisine yönelik araflt rmalarda kullan lmaktad r. Buradaki amaç de- iflime u rat lm fl virusun sadece kanserli hücreyi enfekte edip öldürürken sa l kl hücrelere zarar vermemesidir. V RUS NED R? Viruslar da t pk bakteri, mantar, mikoplasma, riketsiya ve klamidyalar gibi enfeksiyöz mikroorganizmalar aras nda yer almaktad r. Ancak viruslar SIRA yap lar, S ZDE biyolojik özellikleri ve izledikleri ço alma yöntemleri bak m ndan di erlerinden farkl - l k gösterirler. En basit ifade ile viruslar zorunlu hücre içi parazitleri olarak tan mlamak mümkündür. Fakat riketsiya ve klamidyalar da sadece DÜfiÜNEL M hücre içi ortamlarda DÜfiÜNEL M ço alabildikleri için bu tan mlamay biraz daha gelifltirmek gerekir. Buna göre viruslar özgün bir ço alma yöntemine sahip olan, enerji üretimi ve yap SORU tafllar n n sentezi için gerekli organelleri bulunmayan, tek tip nükleik asit tafl - SORU yan, temel olarak nükleik asit ve bunu çevreleyen protein k l f ndan oluflan enfeksiyöz etkenler olarak tan mlayabiliriz. Canl larda genetik materyal olarak RNA ve DNA olmak üzere 2 tip nükleik asit bulunmaktad r. Viruslar n en önemli özellikleri genetik materyal SIRA olarak S ZDE DNA veya RNA dan sadece birisini bulundurmalar d r. Ayr ca enerji üretimi ve protein sentezi için gerekli organellere sahip olmamalar nedeniyle ço alabilmek için canl ve virus türüne duyarl bir hücreye ihtiyaç duyarlar. Viruslar di er AMAÇLARIMIZ mikroorganizmalardan ay ran bafll ca özellikler Tablo 1.1 de verilmifltir. Nükleik asitlerin yap s ve özelliklerini detaylar yla ö renebilmek için K Moleküler T A P Biyoloji adl kitaba baflvurabilirsiniz. (A. Y ld r m, F. Bardakç, M. Karatafl, B. Tanyolaç, Nobel Yay n Da t m, sayfa 55-91, 2007) TELEV ZYON Viruslar n büyüklükleri birim olarak nanometre (1 nm=10-9 m) cinsinden ifade edilmektedir. Viruslar genel olarak 17-300 nm aras nda de iflen büyüklüklere sahiptirler. Hayvan viruslar aras nda bilinen en küçük boyuta sahip virus partikülü circoviruslara aittir ve 17 nm çap ndad r. En büyük virus partikülü NTERNET ise poxviruslarda (200x300 nm) bulunmaktad r. Virus Bakteri Mikoplazma Riketsiya Klamidya Boyut (300nm den küçük) + - ±* - ±* Cans z ortamda üreme - + + - - DNA ve RNA n n birlikte bulunmas - + + + + kiye bölünerek ço alma - + + + + Fonksiyonel ribozom varl - + + + + Antibiyotiklere duyarl l k - + + + + nterferona duyarl l k + - - - + * Baz mikoplazma ve klamidya türleri 300nm den daha küçüktür K T A P TELEV ZYON NTERNET Tablo 1.1 Viruslar ve di er baz mikroorganizmalar n karfl laflt rmal özellikleri

6 Viroloji nterferon: Virusla enfekte olan hücreler taraf ndan salg lanan ve di er hücrelerde virus ço almas na karfl korunma sa layan protein yap s ndaki biyolojik ürünlerdir. Viruslarla Bakteriler Aras ndaki Farklar Viruslarla bakteriler aras nda 7 tane temel farkl l k say labilir. Bunlar: 1. Üreme ortam : Viruslar yaln zca hücre içi (canl ) ortamlarda üreyebilirler. Viruslar n üretilebilmesi için hücre kültürleri, embriyolu yumurtalar veya deney hayvanlar ndan yararlan l r. Bakteriler ise hem canl hem de cans z ortamlarda üreme yetene ine sahiptir. 2. Yap ve ço alma flekli: Bakterilerde görülen hücre yap s viruslarda bulunmamaktad r. Bakterilerin yap s nda bulunan flagella, kapsül ve hücre duvar gibi oluflumlar virus morfolojisinde yer almaz. Ayr ca viruslar hücre içi organellerden de yoksundur. Bakteriler ikiye bölünme ile ço al rken viruslardaki ço alma yöntemi temel olarak nükleik asit replikasyonuna dayan r. Viruslar n ço almas s ras nda öncelikle virusa ait yap sal üniteler konak hücreye sentez ettirilir ve bunlar n bir araya gelmesiyle yeni virus partikülleri flekillenir. Bakterilerde ise yap sal ünitelerin miktar olarak art fl ve takiben ikiye bölünme ile yeni bakteri hücrelerinin ortaya ç kmas söz konusudur. 3. Nükleik asit tipi: Bakterilerde hem DNA hem de RNA tipinde nükleik asit mevcuttur. Viruslarda ise sadece tek tip nükleik asit bulunur. Bu, ya DNA ya da RNA yap s ndad r. 4. Filtrelerden geçebilme: Viruslar bakterilerin geçemedi i filtre sistemlerinden (Seitz, Chamberland, porselen ve membran filtreler) geçebilirler. Bu ayr m yap l rken genellikle 220 nm büyüklü ünde porlara sahip olan membran filtreler kullan l r. 5. Büyüklük & Mikroskopi: Bakteriler fl k mikroskobunda görülebilirken, çiçek viruslar d fl ndaki viruslar sadece elektron mikroskopta görüntülenebilir. Ifl k mikroskobu 300 nm ile birkaç milimetre aras ndaki büyüklüklerin incelenmesine uygundur. Yaklafl k 0,5-5 µm aras nda de iflen büyüklüklere sahip olan bakteriler fl k mikroskobunda rahatl kla görülebilir. Boyutlar yaklafl k 200x300 nm olan poxviruslar (çiçek grubu viruslar) da fl k mikroskobuyla görüntülenebilir. Di er hayvan viruslar n n büyük bir k sm n n büyüklü ü 100 nm den daha küçüktür. Picornaviruslar, caliciviruslar, astroviruslar ve parvoviruslar gibi baz zarfs z viruslar n büyüklü ü 17-25 nm aras nda de iflmektedir. Dolay s yla viruslar n görüntülenebilmesi ve yap lar - n n incelenebilmesi ancak elektron mikroskobu ile yap labilir. 6. Antibiyotiklere duyarl l k: Antibiyotikler bakterileri öldürerek veya üremesini yavafllat p-durdurarak etkirler. Viruslar n ço almas genel olarak antibiyotiklerden etkilenmez. Antibiyotikler d fl nda viruslara karfl kullan lan baz antiviral ajanlar gelifltirilmektedir. Bu ajanlar n etki mekanizmalar antibakteriyellerden oldukça farkl d r. 7. nterferona duyarl l k: nterferon viruslarla enfekte olan hücreler taraf ndan salg lanan protein yap s nda bir biyolojik üründür. nterferon kullan larak viruslar n in vivo veya in vitro ortamlarda ço almas durdurulabilir, fakat bakteriler için ayn fley söz konusu de ildir.

1. Ünite - Viruslar n Genel Özellikleri 7 V RUSLARIN YAPISAL BÖLÜMLER Virion Viruslarda temel yap olarak nükleik asit ve bunu çevreleyerek d fl etkilerden koruyan ve kapsid olarak adland r lan bir protein k l f bulunmaktad r. Bu temel yap nükleokapsid olarak tan mlan r. Nükleokapsidin merkezinde bulunan genetik materyal DNA veya RNA yap s ndaki tek tip nükleik asitten oluflur. Kapsid ise alt yap üniteleri olan kapsomer lerden oluflmaktad r. Kapsomerler viruslar n elektron mikroskopta görülebilen yap lar d r. Baz virus ailelerinde nükleokapsidi çevreleyen lipoprotein yap s nda bir zarf bulunur. Bu flekilde oluflan enfeksiyöz güce sahip olgun virus partikülüne virion denir (fiekil 1.1). Dolay s yla zarfs z viruslarda virion sadece nükleokapsidten oluflurken, zarfl viruslarda nükleokapsid ile birlikte zarf da virion yap s nda yer almaktad r. Kapsid içinde kalan bölge kor bölgesi (özyap ) olarak tan mlan r. Virus partikülünün yap s nda bulunan bölümler afla- da aç klanm flt r. Kapsomerler Kapsid Nükleik asit Nükleokapsid Peplomerler DÜfiÜNEL M SORU Zarf fiekil SIRA 1.1 S ZDE Bir virus partikülünde DÜfiÜNEL M yap sal bölümlerin yerleflimi (kübik simetri) SORU A: Nükleokapsidi oluflturan bölümler; B: Zarfl kübik simetrili bir virionun yap s A B AMAÇLARIMIZ AMAÇLARIMIZ Viruslar n yap s ve di er özellikleriyle ilgili detayl bilgilere Genel K Viroloji T A Padl kitaptan ulaflabilirsiniz (K.Yeflilba, Medipres yay nevi, Malatya) Viral Nükleik Asit TELEV ZYON Nükleik asit viruslardaki özgün genetik flifrenin tafl y c s d r. Nükleik asitler nükleotid bazlar n ard ard na dizilmesiyle oluflan polinükleotid yap lard r. Nükleik asit diziliminde yer alan her baz bir fleker grubuna ba lanarak nükleotid i oluflturur. Burada kullan lan fleker grubu RNA genomlar için riboz, NTERNET DNA genomlar için ise deoksiribozdur. Ard ard na gelen nükleotidler araya al nan bir fosforik asit molekülü arac l yla (fosfodiester ba ) birbirine ba lanm flt r. Çift iplikçikli genomlarda iplikçiklerden birinde bulunan purin bazlar (Adenin [A] ve Guanin [G]) ile di er iplikçikteki pirimidin bazlar (Sitozin [C] ve Timin [T]) eflleflerek hidrojen ba lar yla ba lanm flt r. Eflleflme düzeni G-C ve A-T fleklindedir (fiekil 1.2). RNA genomlar nda ise T yerine U (Urasil) bulunur. Daha önce de de inildi i gibi viral genomlar DNA veya RNA yap s ndaki tek tip nükleik asitten oluflur. Hayvan viruslar aras nda reverz transkriptaz enzimi tafl yan retroviruslar ve hepadnaviruslar özel bir konuma sahiptir. Bu viruslar reverz transkripsiyon yapan viruslar olarak da an l r. K T A P TELEV ZYON NTERNET

8 Viroloji fiekil 1.2 Çift iplikçikli DNA karakterinde bir nükleik asit dizilimi fieker Fosfat Fosfodiester Hidrojen Ba lar G C T A C G A T G C T A G C A T Nükleotid Nükleotid Bazlar Viral nükleik asitler yap olarak tek parçadan veya birden fazla parçadan oluflabilir. Birden fazla parçadan oluflan viral genomlara segmentli genom ad verilir. DNA yap s nda nükleik asit tafl yan viruslar n tamam tek parçal genoma sahiptir. RNA viruslar aras nda ise segmentli genoma sahip 6 adet virus ailesi bulunmaktad r. Bunlar Reoviridae, Birnaviridae, Picobirnaviridae, Orthomyxoviridae, Bunyaviridae ve Arenaviridae aileleridir (Tablo 1.2). Tablo 1.2 Segmentli genoma sahip virus aileleri ve segment say lar Virus Ailesi Segment Say s Reoviridae 10, 11 veya 12 * Birnaviridae 2 Picobirnaviridae 2 Orthomyxoviridae 6, 7, veya 8 * Bunyaviridae 3 Arenaviridae 2 * Bu virus ailelerinde bulunan segment say lar aile içerisinde yer alan virus genuslar na göre de iflkenlik göstermektedir Viral nükleik asitler tek iplikcikli (ss = single stranded) veya çift iplikçikli (ds = double stranded) olabilirler (fiekil 1.3). Birçok virus ailesinde viral genom linear ( fl nsal, düzlemsel) yap dad r. Hepadnaviridae, Papillomaviridae, Polyomaviridae ve Circoviridae ailelerinde ise genom sirküler (çembersel) bir yap ya sahiptir. Viral nükleik asitlerin büyüklü ü virus aileleri aras nda önemli farkl l klar göstermektedir. Bu durum kodlanan viral proteinlerin say s yla iliflkilidir. Örne in viral protein say lar yaklafl k olarak herpesviruslarda 150, poxviruslarda ise 400 civar ndad r. Oysa parvoviruslarda sadece birkaç viral protein bulunmaktad r. Dolay s yla bu tip viruslar n genomunda bulunabilecek gen say lar da oldukça düflüktür. Nükleik asitlerin uzunluklar sahip olduklar bazlar n (veya baz çiftlerinin) toplam say s ile ifade edilir. Genel olarak viral nükleik asitlerin uzunluklar 1,7-350 kb (kilobaz) aras nda de iflmektedir. Hayvan viruslar n n virion ve nükleik asitlerine ait özellikler Tablo 1.3 ve Tablo 1.4 de verilmifltir.

TELEV ZYON TELEV ZYON 1. Ünite - Viruslar n Genel Özellikleri 9 A. RNA viruslar nda görülen nükleik asit formlar fiekil 1.3 RNA ve DNA viruslar nda görülen viral nükleik asit formlar 1 11 111 A. DNA viruslar nda görülen nükleik asit formlar 1 11 111 1V V A. I. Tek iplikçikli RNA (Picornaviridae); II. Çift iplikçikli segmentli RNA (Birnaviridae); III. Tek iplikçikli segmentli RNA (Orthomyxoviridae) B. I. Tek iplikçikli linear DNA (Parvoviridae); II. Çift iplikçikli linear DNA (Herpesviridae); III. Tek iplikçikli sirküler DNA (Circoviridae); IV. K smi çift iplikçikli sirküler DNA (Hepadnaviridae); V. Çift iplikçikli sirküler DNA (süperheliks) (Papillomaviridae) Viral Proteinler Proteinler virus yap s nda oldukça önemli görevler üstlenirler. Viral proteinleri virionun morfolojik oluflumuna kat lan yap sal proteinler ve daha çok virus ço alma siklusunda görev alan yap sal olmayan proteinler olarak ay rmak mümkündür. Yap sal olmayan proteinlerin bir k sm virion yap s nda yer al rken büyük bir k sm virus ço almas sürecinde sentezlenir. Bu proteinler virus ço alma basamaklar n düzenlemekle görevlidirler. Basit yap l viruslarda virion bünyesinde sadece birkaç tip yap sal protein bulunurken, daha karmafl k yap l viruslarda bu say 100 den fazla olabilmektedir. Yap sal proteinlerin temel görevi kapsidi oluflturmakt r. Böylece hem viriona flekil kazand r l r hem de genetik flifrenin tafl y c s olan nükleik asitin nükleazlar ve di er d fl etkilerden korunmas sa lan r. Viral proteinler, virusun ço almak üzere konak hücre reseptörlerine tutunmas nda (adsorbsiyon) ve hücre içine girmesinde (penetrasyon) de görev al rlar. Virus ço almas kaç aflamada gerçekleflir? Viral zarf n yap s nda bulunan proteinler glikozillenmifl (glikoz molekülü içeren) proteinlerdir. Bu tip proteinlere zarf glikoproteinleri veya yüzey glikopro- DÜfiÜNEL M teinleri ad verilir. Viruslar n antijenik yap s n oluflturan yüzey antijenleri (antijenik determinantlar) viral proteinler veya glikoproteinlerden oluflmaktad r. SORU 2 DÜfiÜNEL M SORU Hemaglütinasyon nedir? Viruslar n hemaglütinasyon yetene ini nas l SIRA ölçebiliriz? S ZDE Viral Zarf Kübik simetrili viruslar n önemli bir bölümünde nükleokapsid SIRA DÜfiÜNEL M ç plakt r S ZDE DÜfiÜNEL M (zarf bulunmaz). Viral zarf helikal simetrili hayvan viruslar n n tamam nda, kübik simetrili viruslar n ise bir bölümünde bulunur. Kompleks simetriye sahip SORU olan poxviruslar- AMAÇLARIMIZ AMAÇLARIMIZ SORU 3 K T A P K T A P

10 Viroloji Lipid bilayer: Hücrelerin etraf n çevreleyen ve lipid moleküllerinden oluflan 2 tabakal ince hücresel membran. da da zarf bulunmaktad r. Hücresel membranlarda oldu u gibi lipid bilayer yap - s na sahip olan viral zarf virusun ço ald konakç hücrelerden köken al r. Virus gruplar na göre de iflmekle birlikte viral zarf konak hücrenin plazma membran, golgi ayg t, endoplazmik retikulumu veya çekirdek zar ndan köken alabilir. Viral zarf büyük oranda lipidlerden oluflur. Dolay s yla eter ve kloroform gibi ya eriticileri viral zarf n yap s n bozar ve zarfl viruslar n enfeksiyon oluflturma yetene ini ortadan kald rabilir. Viral lipidler a rl kl olarak fosfolipid yap s ndad r. Bununla birlikte de iflen oranlarda glikolipidler, trigliseridler ve kolesterol de bulunur. Zarf n bafll ca görevi virusun antijenik ve biyolojik aktivitelerini tafl makt r. Viral zarf n kimyasal yap s köken ald hücresel membran n kimyasal yap s na benzerlik gösterir, ancak zarf üzerinde virusa özgün proteinler de yer almaktad r. Zarf üzerinde bulunan glikoproteinler elektron mikroskopta fl nsal ç k nt lar fleklinde görülür. Bu ç k nt lara peplomer ad verilir (fiekil 1.1). Zarf glikoproteinlerinin bir di er önemli özelli i de virusun konak hücreye tutunmas (adsorbsiyon) ve hücre içine al nmas nda (penetrasyon) görev almalar d r. Zarfl viruslarda virion yap s nda lipidlerle birlikte az miktarda karbonhidrat da bulunmaktad r. Bu karbonhidratlar viral zarf glikoproteinlerinin yap s na kat lan fleker gruplar ndan oluflur. Tablo 1.3 Hayvan viruslar na ait baz yap sal ve genomik özellikler (RNA viruslar ) Virus Ailesi Virion Özellikleri Simetri Zarf Varl Nükleit Asit Tipi Nükleik Asit Özellikleri Nükleit Asit Formu Segment Reoviridae Kübik - dsrna Linear 10-12 Birnaviridae Kübik - dsrna Linear 2 Picobirnaviridae Kübik - dsrna Linear 2 Picornaviridae Kübik - ssrna Linear - Dicistroviridae Kübik - ssrna Linear - Iflaviridae Kübik - ssrna Linear - Caliciviridae Kübik - ssrna Linear - Astroviridae Kübik - ssrna Linear - Togaviridae Kübik + ssrna Linear - Flaviviridae Kübik + ssrna Linear - Arteriviridae Kübik + ssrna Linear - Bornaviridae Kübik + ssrna Linear - Retroviridae Kübik + ssrna Linear - Coronaviridae Helikal + ssrna Linear - Paramyxoviridae Helikal + ssrna Linear - Rhabdoviridae Helikal + ssrna Linear - Filoviridae Helikal + ssrna Linear - Orthomyxoviridae Helikal + ssrna Linear 6-8 Bunyaviridae Helikal + ssrna Linear 3 Arenaviridae Helikal + ssrna Linear 2