Arcobacter Cinsi: Genel Özellikleri, Epidemiyoloji ve Laboratuvar Tanısı

Transkript

1 Türk Mikrobiyol Cem Derg 42(2):4350, 2012 oi: /tmcd Derleme Arcobacter Cinsi: Genel Özellikleri, Epiemiyoloji ve Laboratuvar Tanısı Tuba KAYMAN Kayseri Eğitim ve Araştırma Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Kliniği ÖZET Arcobacter cinsi, aerotolerant Campylobacter olarak tanımlanan mikroorganizmaları sınıflanırmak için 1991 yılına önerilmiş olup, epsilonproteobacteria sınıfı, rrna superfamilya VI a yer alır. Arcobacter türleri Campylobacteraceae ailesinin üyeleriir ve bu ailee yer alan Campylobacter türlerine fenotipik olarak benzerlik gösterirler. Aerobik şartlara ve üşük ısılara üreyebilme yetenekleri ile Campylobacter türlerinen ayrılırlar. Arcobacter türleri gram negatif, hareketli, oksiaz ve katalaz pozitif, kıvrımlı çomaklarır. Bu cins günümüze,, A. skirrowii, A. nitrofigilis, A. cibarius, A. halophilus, A. mytili, A. thereius, A. marinus, A. trophiarum, A. efluvii, A. molluscorum, A. ellisi, A. bivalviorum ve A. venerupis olmak üzere toplam 15 tür içermekteir. Bunlaran, ve A. skirrowii insan patojeniir ve insanlara gastrointestinal enfeksiyonlar ve ekstraintestinal invazif enfeksiyonlar ile ilişkilenirilmekteirler. Arcobacter türleri hayvanlar, klinik örnekler, su ve su ürünlerinen (karies, miye, istiriye) izole eilmekteirler ve sular, gıalar, hayvan ve insan enfeksiyonlarınan sıklıkla izole eilen en önemli türür. İnsanlara geçiş yolları tam olarak ayınlatılmamış olmakla birlikte kontamine et, süt ve su tüketimi insanlara geçiş için en önemli araçlar olarak görülmekteir. Bu erlemee Arcobacter cinsinin genel özellikleri, epiemiyolojisi, oluşturuğu hastalıklar, izolasyon ve ientifikasyon yöntemleri son literatür bilgileriyle sunulmuştur. Anahtar kelimeler: Arcobacter türleri, gastroenterit, bakteriyemi SUMMARY Genus Arcobacter: General Characteristics, Epiemiology an Laboratory Diagnosis The term genus Arcobacter which was propose in 1991 to categorize bacteria initially regare as aerotolerant campylobacteria belongs to the RNA Superfamily VI of the epsilonproteobacteria. Arcobacters are members of the family Campylobacteraceae an phenotipically similar to campylobacters. They iffer from campylobacters by their ability to grow uner both aerobic conitions an uner 30 C. Arcobacters are gram negative, oxiase positive, catalase positive, motile an slightly curve ros. Currently, the genus Arcobacter has a total of 15 species incluing,, A. skirrowii, A. nitrofigilis, A. cibarius, A. halophilus, A. mytili, A. thereius, A. marinus, A. trophiarum, A. efluvii, A. molluscorum, A. ellisi, A. bivalviorum an A. venerupis. Three species, especially,, an A. skirrowii are more important in terms of public health significance an have been associate with gastrointestinal infections an extraintestinal invasive iseases in human beings. Arcobacter species have been isolate from animal, water, foo, seafoo (shrimp, mussels, oysters) an clinical specimens an is the species most frequently associate with animal an human iseases. The routes of Arcobacter spp. infection are not yet clarifie, but consumption of contaminate meat, milk an water seems to be the most likely vehicles for the transmission of infection to humans. In this review, general characteristics, classification, epiemiology, isolation an ientification methos an isolation sources of Arcobacter spp. have been evaluate by using the recent ata. Key wors: Arcobacter species, gastroenteritis, bacteremia TARİHÇE Gıa kaynaklı bir enteropatojen ve zoonoz etkeni olan Arcobacter türleri son yıllara gierek artan bir öneme sahiptir. Campylobacter cinsine bulunan ve aerotolerant Campylobacter türleri olarak tanımlanan C. nitrofigilis, C. cryaerophyla ve C. butzleri türleri, 1991 yılına yapılan etaylı taksonomik çalışma ile Arcobacter cinsine alınmıştır. Daha sonra (1992 yılı) ise A. skirrowii enteritli hayvanlaran ve atık sığır, omuz ve koyun fötüslerinen ientifiye eilmiştir (1,2). Yakın zamana izole eilen türler ile birlikte günümüze Arcobacter cinsi;,, A. skirrowii, A. nitrofigilis, A. cibarius, A. halophilus, A. mytili, A. thereius, A. marinus, A. trophiarum, A. efluvii, A. molluscorum, A. ellisi, Alınığı tarih: Kabul tarihi: Yazışma aresi: Tuba Kayman, Kayseri Eğitim ve Araştırma Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Kliniği, Kayseri eposta: tubakayman@hotmail.com 43

2 Türk Mikrobiyol Cem Derg 42(2):4350, 2012 A. bivalviorum ve A. venerupis olmak üzere toplam 15 tür içermekteir (36). Cinste yer alan, ve A. skirrowii insanlara hastalık oluşturabilir. Birçok olguan izole eilmesinen olayı cins içineki en önemli tür olarak kabul eilmekteir. International Comission on Microbiological Specifications for Foos tarafınan insan sağlığı için cii tehlike arz een mikroorganizma olarak sınıflanırılmıştır (7). Ayrıca Caroen ve ark. (8) tarafınan a önemli zoonotik patojen olarak tanımlanmıştır. Arcobacter cinsine yer alan türler, izole eilikleri ortamlar ve ilişkili olukları hastalıklar Tablo 1 e verilmiştir. Tablo 1 e görülüğü gibi cins içerisine yer alan,, A. skirrowii, A. cibarius, A. thereius ve A. trophiarum olmak üzere toplam altı tür insan ve hayvan ilişkili olmasına rağmen iğer türler çevresel örnekleren izole eilmiş olup insan ve hayvan konakları hakkına etaylı bir bilgi bulunmamaktaır. GENEL ÖZELLİKLER Arcobacter (arcus: yaykavis; bacter: çomak) türleri epsilonproteobacteria sınıfına bulunan gram negatif, x 0.53 µm boyutlarına, spiral, S şekilli, spor oluşturmayan, kılıfsız polar kamçıya sahip, hareketli ve mikroaerofilik bakterilerir. Genel olarak biyokimyasal aktiviteleri zayıf olup karbonhiratları fermente/oksie etme yetenekleri yoktur. Karbon kaynağı olarak amino asitleri kullanırlar. Fenotipik özellikleri açısınan Campylobacter türlerine benzerlik gösterirler. Ancak, 30 C nin altına ve aerob olarak üreme özellikleri ile Campylobacter türlerinen ayırt eilirler. İnoksil asetat pozitif olup, hirojene gereksinim uymazlar. Jelatin, kazein, nişasta, hippurat ve tirosin hiroliz aktiviteleri negatiftir. Arcobacter cinsine ait türlerin başlıca fenotipik özellikleri tablo 2 e gösterilmiştir. Kanlı agara 30 C e 23 günlük inkübasyonan sonra 24mm çapına, gribeyaz renkli, konveks, üzgün kenarlı koloniler meyana getirirler. Ancak koloni büyüklüğü pasajlar ile eğişkenlik gösterir ve taze agara yaygın ve yayvan koloni oluştururlar. ve A. skirrowii nin bazı suşları alfahemolitik aktiviteye sahiptirler. Eskimiş kültürlere yuvarlak, kokoi veya filamentöz formlar oluşturabilirler. Arcobacter türleri Caco 2, Vero ve CHO (Chinese humster ovary cell line) gibi oku kültürlerine e üretilmiş olup, aezyon, invazyon ve sitotoksisite gibi virülans faktörlerine sahip olukları belirlenmiştir (3,9,10). EPİDEMİYOLOJİ İnsanlara Arcobacter Türleri Tablo 1 e görüleceği üzere günümüze kaar 15 Arcobacter türü tanımlanmış olup bunlaran yalnızca, A. skirrowii ve olmak üzere üç tür insanlara hastalık olgularınan ayrılmış Tablo 1. Arcobacter cinsine yer alan türler, izole eilikleri ortamlar ve ilişkili olukları hastalıklar (36). İlişkili oluğu hastalık Türler Bilinen kaynaklar İnsan Hayvan A. nitrofigilis Bitki kökü Atık sığır fötüsü Tavuk eti A. skirrowii A. cibarius A. halophilus A. mytili A. thereius A. marinus A. trophiarum A. efluvii A. molluscorum A. ellisii A. bivalviorum A. venerupis *: Bilinmiyor 44 Atık sığır, omuz ve koyun fötüsleri Tavuk eti Tuzlu göl suyu Miye, tuzlu su Atık omuz fötüsu, omuz sinirim sistemi, örek sinirim sistemi Deniz suyu, eniz yılızı, eniz yosunu Domuz karkası Lağım suları Miye, istiriye Miye,yumuşakça Miye, eniz tarağı Miye, eniz tarağı * Gastroenterit, septisemi Gastroenterit, septisemi Gastroenterit Domuz, sığır, koyun ve atlara abortus, sığırlara mastit Domuz, sığır ve primatlara gastroenterit, omuzlara abortus Koyun ve sığırlara gastroenterit, omuz ve sığırlara abortus

3 T. Kayman, Arcobacter Cinsi ve sinirim sistemi enfeksiyonları ve bakteriyemi etkeni olarak saptanmıştır (6). Arcobacter enfeksiyonunun insanlara geçiş yolları tam olarak ayınlatılmamış olmakla birlikte kontamine su, süt ve et tüketimi en önemli bulaş aracı olarak görülmekteir. Arcobacter türlerinin insan enfeksiyonları ile ilişkilenirilmeleri ilk efa Avustralya a 1988 yılına kronik iyareli bir hastaan un izole eilmesiyle başlamıştır (11). Taylor ve ark. (12) Taylan a gastroenteritli çocukların sinirim sistemlerinen %2.4 oranına izolasyonu bilirmiştir. İtalya a bir okula ishal semptomu olmaksızın saece karın ağrısı yakınması olan 10 çocuğun üçüne, İngiltere e ishalli 761 hastanın birine (%0.13), Danimarka a 1376 enteritli hastanın birine birine e izolasyonu yapılmıştır (1315). Güney Afrika a ishalli hastanın 16 sınan (%0.1), 300 ishalli hastanın birinen (%0.3) ve Hong Kong a 4741 ishalli hastanın altısınan (%0.13) ayrılmıştır (1618). Arcobacter türlerinin gastroenteritlereki rolüne ilişkin Belçika a yürütülen ve ishalli hastayı kapsayan çalışmaa 67 (%0.1) olguan ve 10 olguan a olmak üzere toplam 77 olgu (%0.1) pozitif bulunmuştur (19). Yeni Zelana a Manisoza ve ark. (20), 1380 gastroenterit olgusunun; yeisi ve beşi e olmak üzere toplam 12 sinen (%0.9) Arcobacter türü izole etmiş tir. Ülkemize, Kayman ve ark. (21) 3287 gastrenteritli hastaya ait ışkı örneklerinin okuzunan (%0.3) izole etmiştir. Arcobacter türleri ile ilgili olarak çeşitli ülkelere yapılmış olan çalışmalar ve olgu raporları Tablo 3 ve Tablo 4 e verilmiştir (2236). Tablo 3. Çeşitli ülkelere 1988 en beri yürütülen çalışmalaran ve olgularan, gastroenterit etkeni olarak izole eilen Arcobacter türleri. Ülke Avustralya (11) Taylan (12) İtalya (13) Almanya (22) İngiltere (14) Danimarka (15) Güney Afrika (16) Güney Afrika (17) Hong Kong (18) Belçika (19) Belçika (23) Şili (24) Hinistan (25) Güney Afrika (26) İsviçre (27) Fransa (28) İtalya (29) ABD, Avrupa (30) Hinistan (31) Yeni Zelana (20) Türkiye (21) Yıl N/n* 631/15 761/1 1376/ /16 300/1 4741/ /77 400/5 322/35 500/7 345/4 99/46 201/16 75/3 1380/ /9 Prevalans (%) *:İncelenen materyal sayısı/pozitif olgu sayısı Arcobacter türü A.butzleri A.butzleri A.butzleri A. skirrowii Arcobacter spp. A. skirrowii Arcobacter spp. Tablo 2. Arcobacter cinsine yer alan türlerin fenotipik özellikleri. Özellik Üreme 37 C, aerob 37 C, CO 2 %1 glisin %4NaCl McConkey agar Minimal meium CCDA %1 safra Sefoperazona irenç (64mg/l) Enzim aktivitesi Katalaz Üreaz Nitrat reüksiyonu İnoksil asetat hirolizi A. nitrofigilis A. skirrowii A. cibarius A. halophilus A. mytili A. thereius A. marinus A. trophiarum A. efluvii A. molluscorum A. ellisii A.bivalviorum A. venerupis : pozitif : negatif : eğişken 45

4 Türk Mikrobiyol Cem Derg 42(2):4350, 2012 Tablo 4. Bakteriyemi olgularınan izole eilen Arcobacter türleri. Ülke İngiltere (32) Tayvan (33) Tayvan (34) Hong Kong (35) Hong Kong (36) Yıl Yaş Yenioğan *:bilinmiyor, K:Kaın, E:Erkek Cinsiyet Yine insanlara, Arcobacter türlerinin sinirim sistemine asemptomatik taşıyıcılığı ile ilgili çalışmalar a mevcuttur. Tip 2 iabetes mellituslu 38 hastanın ışkı örneği kültür ile %26.2, moleküler analiz ile e %79 oranına ve yönünen pozitif bulunmuştur (29). Yine Almanya a tip 1 iabetes mellituslu ve hiperürisemik iki ishalli hastaan izolasyonu yapılmıştır (22). Arcobacter türleri ayrıca Camphylobacter ve Helicobacter türlerinin izole eiliği gastroenteritli hastaların sinirim sistemlerinen sekoner etken olarak ayrılmıştır. İshal semptomu bulunan HIV pozitif hastalaran a Arcobacter türlerinin izolasyonu bilirilmiştir (25,26). Hayvan, Gıa, Su ve Çevre Örneklerine Arcobacter Türleri Tavuk, omuz, sığır, koyun, kaz ve hini sinirim sistemlerine Arcobacter türlerini eğişik oranlara bulunururlar (3,3742). Rezervuar olan bu hayvanlar ışkılarıyla çevre ve su kontaminasyonuna neen olur (3). Hayvansal ürünler içine tavuk, sığır, omuz, hini etleri ve bunlaran hazırlanan kıymaların Arcobacter türleri ile kontamine oluğu bilirilmiştir (3,37,40,41). Bu hayvanlara ait etlerin Arcobacter türleri ile kontaminasyonu, kesimhanelere olmaktaır. Yine bu etleren hazırlanan kıymalar a Arcobacter türleri ile kontamineir (40). Market ve kasaplara kontamine etler aracılığıyla iğer ürünlerin çapraz kontaminasyonu a söz konusuur. Çiğ sütleren, içme ve kaynak sularınan a Arcobacter türleri izole eilmiştir (4344). Köpek ve kei gibi pet hayvanlarının a sinirim sistemlerine Arcobacter türleri barınırıkları rapor eilmiştir (45,46). Genellikle hayvanların sinirim sistemlerinen, et ve et ürünlerinen,, A. skirrowii, A. cibarius, A. thereius ve A. trophiarum izole ve ientifiye eilmekteir. Deniz tarağı, istiriye, eniz yosunu, eniz yılızı, miye, yumuşakça gibi canlılar, tuzlu su, lagün, eniz suyu ve lağım suları gibi çevresel örnek * K E E K Arcobacter türü ler ve bitki köklerinen e Arcobacter türleri izole eilmiştir (3,6). Ancak bunların insanlar için patojeniteleri henüz bilinmemekteir. LABORATUVAR TANISI Arcobacter türlerinin hasta ve çevre örnekleri gibi çeşitli ortamlaran izolasyonlarına ilişkin farklı besiyerleri ve işlemler kullanılmasına rağmen günümüze stanarize eilmiş bir yöntem bulunmamaktaır. Bu bakterilerin izolasyon ve ientifikasyonuna genellikle Camphylobacter türleri için kullanılan besiyerleri ve yöntemler moifiye eilerek kullanılmaktaır. İzolasyon, genellikle incelenecek örneklerin seçici sıvı bir besiyerine ön zenginleştirmeye tabii tutulmasınan sonra yine seçici bir katı besiyerine pasajı ile yapılmaktaır. Her iki ortama a örnekler, 2430 C e mikroaerofilik ya a olarak inkübe eilirler (Tablo 5, Şekil 1) (4753). İzolasyona ayrıca membran filtrasyon metou a kullanılmaktaır. Bu yöntem, ışkı örneklerinin 1/5 oranına steril fizyolojik tuzlu su (FTS) ile süspansiyonu sonrasına irekt olarak uygulanır (Şekil 2). Membran filtrasyon yöntemi ayrıca ön zenginleştirme sonrası a gerçekleştirilebilmekteir. Ön zenginleştirme ve sonrasınaki pasaj için kullanılan besiyerleri, inkübasyon ısıları ve atmosfer koşulları Tablo 5 te verilmiştir. Bu izolasyon yöntemlerine ilave olarak ışkı örneklerinen seçici özellikteki bir katı besiyerine irekt ekim ile e Arcobacter türlerinin izolasyonu yapılabilmekteir (18,21,54). Tüm izolasyon yöntemlerine inkübasyon sonrasına üreyen koloniler makroskopik ve mikroskopik morfolojileri, 2537 C e ve aerob şartlara üreme yetenekleri ve Tablo 2 e gösterilen iğer biyokimyasal testler ile Arcobacter türleri yönünen eğerlenirilerek ientifiye eilir (3). Fenotipik testlerle tanımlanan izolatlar, moleküler yöntemle (Polymerase Chain Reaction= PCR) cins ve tür üzeyine oğrulanır (40,55,56). Çeşitli kaynaklaran ayrılan Arcobacter türlerinin moleküler yöntemle tiplenirilmesi amacıyla PCRRestriction Fragment Length Polymorphism (PCRRFLP), Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus (ERICPCR), Ranom Amplification of Polymorphic DNA ve PulseFiel Gel Electrophoresis (PFGE) yöntemleri kullanılmaktaır (20,40,5759,60). Ayrıca ön zenginleştirme sonrasına kültüren irekt 46

5 T. Kayman, Arcobacter Cinsi Tablo 5. Arcobacter türlerinin izolasyonu. ÖN ZENGİNLEŞTİRME İZOLASYON Besiyeri İçeriği antimikrobiyal (mg/litre) İnkübasyon Pasaj yapılan katı besiyeri İçeriği antimikrobiyal (mg/litre) İnkübasyon Kaynak EMJBH 5Florourasil (100) 30 C, 4872 saat, Kanlı agar Antibiyotik içermiyor 30 C, 4872 saat, 47 ASB Sefoperazon (32) Piperasilin (75) Trimetoprim (20) Siklohekzimi (100) 24 C, 48 saat, ASM Sefoperazon (32) Piperasilin (75) Trimetoprim (20) Siklohekzimi (100) 24 C, 48 saat, 48 EMJH 5Florourasil (200) 30 C, 9 gün, CVA Sefalotin (20) Vankomisin (10) Amfoterisin B (5) 30 C, 4872 saat, 49 CAT buyyon Sefaperazon (8) Amfoterisin B (10) Teikoplanin (4) 30 C, 48 saat, Kanlı agar Antibiyotik içermiyor Membran filtrasyon yöntemi 30 C, 7 güne kaar, 50 JMB Sefaperazon (32) 5Florourasil (200) 30 C, 48 saat, JMB agar Sefaperazon (32) 30 C, 48 saat, 51 Arcobacter buyyon Sefaperazon (16) Amfoterisin B (10) Trimetoprim (64) Novobiosin (32) 5Florourasil (100) 28 C, 48 saat, Arcobacter besiyeri Sefaperazon (16) Amfoterisin B (10) Trimetoprim (64) Novobiosin (32) 5Florourasil (100) 30 C, 2472 saat, 52 Brucella buyyon Sefoperazon (25) Piperasilin (75) Trimetoprim (20) Siklohekzimi (100) Amfoterisin B (10) 25 C, 24 saat, ASM Sefoperazon (32) Piperasilin (75) Trimetoprim (20) Siklohekzimi (100) 25 C, 3 gün 19 EMJH: EllinghausenMcCulloughJohnsonHarris, CAT: SefoperazonAmfoterisin B Teikoplanin, JMB: JohnsonMurano broth, ASB: Arcobacter selective broth, ASM: Arcobacter selective meium, CVA: Cephalotin Vancomycin Amphotericin B agar Dışkı örneği (0.5 gr) Arcobacter ön zenginleştirme besiyerine inokülasyonu takiben 2430 C e, 4872 saat, / atmosfere inkübe eilir. Süre sonuna ön zenginleştirme besiyerinen bir öze olusu alınarak selektif katı besiyerine pasaj yapılır C e, 4896 saat, / atmosfere inkübe eilir. Süre sonuna ön zenginleştirme besiyerinen 100 µl alınarak membran filtrasyon metou uygulanır. Şekil 1. Arcobacter türlerinin izolasyon işlemi. Süre sonuna üreyen koloniler Gram boyama, katalaz testi, oksiaz testi ve hareket muayenesi gbi fenotipik testlerle Arcobacter spp. yönünen eğerlenirilir. olarak mpcr ile Arcobacter türlerinin varlığı a saptanabilir. Son yıllara olukça önem kazanan Multiple Locus Sequencing Typing (MLST) Arcobacter türlerinin tiplenirilmesi için kullanılmakta olup, bununla ilgili kurulmuş olan veri tabanına ( org/arcobacter/) çeşitli ülkelere izole eilmiş ve genetik farklılıkları saptanmış olan Arcobacter türlerinin etaylı bilgisine ulaşmak olasıır (61). Bu veri tabanına ülkemizen e izole eilmiş olan yeisi tavuk, üçü insan orijinli olmak üzere toplam 10 aet 47

6 Türk Mikrobiyol Cem Derg 42(2):4350, ,45 µm gözenek boyutuna sahip steril sellüloz asetat membran filtre, antibakteriyel mae içermeyen bir besiyerine (% 5 koyun kanlı MuellerHinton agar) yerleştirilir g ışkı örneği 5 ml steril FTS ile süspanse eilir. 3. Bu süspansiyonan (veya ön zenginleştirme yapılmışsa ön zenginleştirme sıvısınan) 100 µl alınarak filtre üzerine amlatılır C e 30 akika beklenir (Bu süre içerisine arkobakterler filtreyi geçerek agar yüzeyine ulaşır). 5. Steril bir pens ile membran filtre agar yüzeyinen kalırılır. 6. Filtre eilmiş sıvı besiyerine yayılır. 7. Ekim yapılan besiyeri 30 C e 7296 saat, ortama inkübe eilir. Süre sonuna üreyen koloniler, Gram boyama, katalaz testi, oksiaz testi ve hareket muayenesi gibi fenotipik testler ile Arcobacter spp. yönünen eğerlenirilir. Şekil 2. Arcobacter türlerinin izolasyonuna kullanılan membran filtrasyon metou (19,27,40,53). izolatının MLST bilgisi yer almaktaır. TEDAVİ Arcobacter türlerinin neen oluğu gastroenterit olgularının büyük çoğunluğu, Camphylobacter enfeksiyonlarına oluğu gibi keni kenini sınırlayıcı özelliğe sahip olup, teavi gerektirmez. Bununla birlikte gastroenterit olgularına semptomların şieti ve/veya süresiyle ilişkili olarak ve bakteriyemi olgularına uyarlılık testi yapılıktan sonra antibiyotik teavisi verilmeliir. Günümüze Campylobacter türleri için stanarize eilmiş antimikrobik uyarlılık testleri bulunmasına karşın Arcobacter türleri için böyle bir urum söz konusu eğilir (62,63). Etest, isk iffüzyon, agar ilüsyon ve buyyon ilüsyon yöntemleri kullanılarak klinik olgularan ayrılan Arcobacter izolatlarının antibiyotik uyarlılıkları gerçekleştirilmiştir (20,21,6466). Arcobacter türlerinen ileri gelen insan ve hayvan enfeksiyonlarının teavisine florokinolonlar ve tetrasiklin önerilmekteir (3,21). Çalışmalara izolatların klinamisin, azitromisin, siprofloksasin, metroniazol, karbenisilin trimetoprim/sulfametoksazol, sefuroksimsoyum ve sefoperazona irençli olukları bilirilmiştir (32,64,65,67,68). SONUÇ Yurumuza Arcobacter türleri üzerine yapılmış olan sınırlı sayıaki çalışmanın artırılmasının ve akut gastroenteritlerin etiyolojisine bu bakterilerin e göz önüne bulunurulmasının yararlı olacağı üşünülmekteir. KAYNAKLAR 1. Vanamme P, Falsen E, Rossau R, et al. Revision of Campylobacter, Helicobacter, an Wolinella taxonomy: emenation of generic escriptions an proposal of Arcobacter gen. nov. Int J Syst Bacteriol 1991; 41: PMi: Vanamme P, Vancanneyt M, Pot B, et al. Polyphasic taxonomic stuy of the emene genus Arcobacter with Arcobacter butzleri comb. nov. an Arcobacter skirrowii sp. nov., an aerotolerant bacterium isolate from veterinary specimens. Int J Syst Bacteriol 1992; 42: PMi: Collao L, Figueras MJ. Taxonomy, epiemiology an clinical relevance of the genus Arcobacter. Clin Microbiol Rev 2011; 24: PMi: PMCi: Smet S, Vanamme P, De Zutter L, On SL, Douiah L, Houf K. Arcobacter trophiarum sp. nov., isolate from fattening pigs. Int J Syst Evol Microbiol 2011; 61: PMi: Figueras MJ, Levican A, Collao L, Inza MI, Yustes C. Arcobacter ellisii sp. nov., isolate from mussels. Syst Appl Microbiol 2011; 34: PMi: Levican A, Collao L, Aguilar C, et al. Arcobacter bivalviorum sp. nov. an Arcobacter venerupis sp. nov., new species isolate from shellfish. Syst Appl Microbiol 2012; 35: PMi: ICMSF. Microorganisms in foos. 7. Microbiological testing in foo safety management. International Commission on Microbiological Specifications for Foos, New York: Kluwer Acaemic/Plenum, Caroen S, Van Huffel X, Berkvens D, et al. Eviencebase 48

7 T. Kayman, Arcobacter Cinsi semiquantitative methoology for prioritization of fooborne zoonoses. Fooborne Pathog Dis 2009; 6: PMi: Lehner A, Tasara T, Stephan R. Relevant aspects of Arcobacter spp. as potential fooborne pathogen. Int J Foo Microbiol 2005; 101: PMi: Snelling WJ, Matsua M, Moore JE, Dooley JS. Uner the microscope: Arcobacter. Lett Appl Microbiol 2006; 42: PMi: Tee W, Bair R, DyallSmith M, Dwyer B. Campylobacter cryaerophila isolate from a human. J Clin Microbiol 1988; 26: PMi: PMCi: Taylor DN, Kiehlbauch JA, Tee W, Pitarangsi C, Echeverria P. Isolation of group 2 aerotolerant Campylobacter species from Thai chilren with iarrhea. J Infect Dis 1991; 163: PMi: Vanamme P, Pugina P, Benzi G, et al. Outbreak of recurrent abominal cramps associate with Arcobacter butzleri in an Italian school. J Clin Microbiol 1992; 30: PMi: PMCi: Tompkins DS, Huson MJ, Smith HR, et al. A stuy of infectious intestinal isease in Englan: microbiological finings in cases an controls. Commun Dis Public Health 1999; 2: PMi: Engberg J, On SL, Harrington CS, GernerSmit P. Prevalence of Campylobacter, Arcobacter, Helicobacter an Sutterella spp. in human fecal samples as estimate by a reevaluation of isolation methos for campylobacters. J Clin Microbiol 2000; 38: PMi: PMCi: Lastovica AJ, Le Roux E. Efficiant isolation of campylobacteria from stools. J Clin Microbiol 2000; 38: PMi: PMCi: Lastovica AJ, Le Roux E. Efficiant isolation of Campylobacter upsaliensis from stools. J Clin Microbiol 2001; 39: PMi: PMCi: Lau SK, Woo PC, Hui WT, et al. Use of cefoperazone MacConkey agar for selective isolation of Laribacter hongkongensis. J Clin Microbiol 2003; 41: PMi: PMCi: Vanenberg O, Deiste A, Houf K, et al. Arcobacter species in humans. Emerg Infect Dis 2004; 10: PMi: PMCi: Manisoza O, Burrows E, Nulsen M. Arcobacter species in iarrhoeal faeces from humans in New Zealan. N Z Me J 2012; 125:406. PMi: Kayman T, Abay S, Hızlısoy H, Atabay HI, Diker KS, Ayın F. Emerging pathogen Arcobacter spp. in human acute gastroenteritis: molecular ientification, antibiotic susceptibilities an genotyping of the isolate arcobacters. J Me Microbiol 2012; 61: PMi: Lerner J, Brumberger V, PreacMursic V. Severe iarrhea associate with Arcobacter butzleri. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 1994; 13: PMi: Wybo I, Breynaert J, Lauwers S, Linenburg F, Houf K. Isolation of Arcobacter skirrowii from a patient with chronic iarrhea. J Clin Microbiol 2004; 42: PMi: PMCi: Fernánez H, Krause S, Villanueva MP. Arcobacter butzleri in emerging enteropathogen: communication of two cases with chronic iarrhea. Brazilian J Microbiol 2004; 35: Kownhar H, Shankar EM, Rajan R, Vengatesan A, Rao UA. Prevalance of Campylobacter jejuni an enteric bacterial pathogens among hospitalize HIV infecte versus nonhiv infecte patients with iarrhea in Southern Inia. Scan J Infect Dis 2007; 39: PMi: Samie A, Obi CL, Barret LJ, Powell SM, Guerrant RL. Prevalence of Campylobacter species, Helicobacter pylori an Arcobacter species in stool samples from the Vena region, Limpopo, South Africa: stuies using molecular iagnostic methos. J Infect 2007; 54: PMi: Houf K, Stephan R. Isolation an characterization of the emerging fooborn pathogen Arcobacter from human stool. J Microbiol Methos 2007; 68: PMi: Abelbaqi K, Buissonnière A, ProuzetMauleon V, et al. Development of a realtime fluorescence resonance energy transfer PCR to etect Arcobacter species. J Clin Microbiol 2007; 45: PMi: PMCi: Fera MT, Russo GT, Beneetto A, et al. High prevalence of Arcobacter carriage in oler subjects with type 2 iabetes. J Biome Biotechnol 2010; Article ID DOI: / 2010/ Jiang ZD, DuPont HL, Brown EL, et al. Microbial etiology of travelers iarrea in Mexico, Guatemela an Inia: Importance of Enterotoxigenic Bacterioies fragilis an, Arcobacter species. J Clin Microbiol 2010; 48: PMi: PMCi: Patyal A, Rathore RS, Mohan HV, Dhama K, Kumar A. Prevalence of Arcobacter spp. in humans, animals an foos of animal origin incluing sea foo from Inia. Transboun Emerg Dis 2011; 58: PMi: On SL, Stacey A, Smyth J. Isolation of Arcobacter butzleri from a neonate with bacteremia. J Infect 1995; 31: Hsueh P, Teng LJ, Yang PC, et al. Bacteremia cause by Arcobacter cryaerophilus 1B. J Clin Microbiol 1997; 35: PMi: PMCi: Yan JJ, Ko WC, Huang AH, Chen HM, Jin YT, Wu JJ. Arcobacter butzleri bacteremia in a patient with liver cirrhosis. J Formos Me Assoc 2000; 99:1669. PMi: Woo PC, Chong KT, Leung K, Que T, Yuen K. Ientification of Arcobacter cryaerophilus isolate from a traffic accient victim with bacteremia by 16S ribosomal RNA gene sequencing. Diagn Microbiol Infect Dis 2001; 40: Lau SKP, Woo PCY, Teng JLL, Leung KW, Yuen KY. Ientification by 16S ribosomal RNA gene sequencing of Arcobacter butzleri in a patient with acute gangrenous appenicitis. J Clin Pathol: Mol Pathol 2002; 55: Atabay HI, Ayın F, Houf K, Sahin M, Vanamme P. The prevalence of Arcobacter spp. on chicken carcasses sol retail markets in Turkey an, ientification of the isolates using SDSPAGE. Int J Foo Microbiol 2003; 81: Atabay HI, Bang DD, Ayın F, Eroğan HM, Masen M. Discrimination of Arcobacter butzleri isolates by polymerase chain reactionmeiate DNA fingerprinting. Lett Appl Microbiol 2002; 35: PMi: Atabay HI, Unver A, Sahin M, Otlu S, Elmali M, Yaman H. Isolation of various Arcobacter species from omestic geese (Anser anser). Vet Microbiol 2008; 128: PMi:

8 Türk Mikrobiyol Cem Derg 42(2):4350, Ayın F, Gümüşsoy KS, Atabay HI, Iça T, Abay S. Prevalence an istribution of Arcobacter species in various sources in Turkey an molecular analysis of isolate strains by ERIC PCR. J Appl Microbiol 2007; 103: PMi: Öngör H, Çetinkaya B, Açık MN, Atabay HI. Investigation of arcobacters in meat an faecal samples of clinically healthy cattle in Turkey. Lett Appl Microbiol 2004; 38: PMi: Van Driessche E, Houf K, Vangroenweghe F, De Zutter L, Van Hoof J. Prevalence, enumeration an strain variation of Arcobacter species in the faeces of healthy cattle in Belgium. Vet Microbiol 2005; 105: PMi: Scullion R, Harrington CS, Maen RH. Prevalence of Arcobacter spp. in raw milk an retail raw meats in Northern Irelan. J Foo Prot 2006, 69: PMi: Rice EW, Rogers MR, Wesley IV, Johnson CH, Tanner SA. Isolation of Arcobacter butzleri from groun water. Lett Appl Microbiol 1999; 28: PMi: Fera MT, La Camera E, Carbone M, Malara D, Pennisi PG. Pet cats as carriers of Arcobacter spp. in Southern Italy. J Appl Microbiol 2009; 106: PMi: Houf K, De Smet S, Baré J, Daminet S. Dogs as carriers of the emerging pathogen Arcobacter. Vet Microbiol 2008; 130: PMi: Ellis WA, Neill SD, O Brien JJ, Ferguson HW, Hanna J. Isolation of Spirillum/Vibriolike organisms from bovine fetuses. Vet Rec 1977; 100: PMi: e Boer E, Tilburg JJ, Woowar DL, Lior H, Johnson WM. A selective meium for the isolation of Arcobacter from meats. Lett Appl Microbiol 1996; 23: PMi: Collins CI, Wesley IV, Murano EA. Detection of Arcobacter spp. in groun pork by moifie plating methos. J Foo Prot 1996; 59: Atabay HI, Corry JE. The prevalence of campylobacters an arcobacters in broiler chickens. J Appl Microbiol 1997; 83: PMi: Johnson LG, Murano EA. Comparison of three protocols for the isolation of Arcobacter from poultry. J Foo Prot 1999; 62: PMi: Houf K, Devriese LA, De Zutter L, Van Hoof J, Vanamme P. Development of a new protocol for the isolation an quantification of Arcobacter species from poultry proucts. Int J Foo Microbiol 2001; 71: López L, Castillo FJ, Clavel A, Rubio MC. Use of a selective meium an a membrane filter metho for isolation of Campylobacter species from Spanish paeiatric patients. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 1998; 17: PMi: Kayman T, Abay S, Ayın F, Güen A. Arcobacter butzleri ye bağlı gastroenteritis olgusu. XXXIV Türk Mikrobiyoloji Kongresi Kitabı, 711 Kasım 2010, Girne:KKTC. Sayfa Harmon KM, Wesley IV. Ientification of Arcobacter isolates by PCR. Lett Appl Microbiol 1996; 23: PMi: Houf K, Tutenel A, De Zutter L, Van Hoof J, Vanamme P. Development of a multiplex PCR assay for the simultaneous etection an ientification of Arcobacter butzleri, Arcobacter cryaerophilus an Arcobacter skirrowii. FEMS Microbiol Lett 2000; 193: PMi: Figueras MJ, Collao L, Guarro J. A new 16S rdnarflp metho for the iscrimination of the accepte species of Arcobacter. Diagn Microbiol Infect Dis 2008; 62: PMi: Houf K, De Zutter L, Van Hoof J, Vanamme P. Assessment of the genetic iversity among arcobacters isolate from poultry proucts by using two PCRbase typing methos. Appl Environ Microbiol 2002; 68: PMi: PMCi: Rivas L, Fegan N, Vanerline P. Isolation an characterization of Arcobacter butzleri from meat. Int J Foo Microbiol 2004; 91: Shah AH, Saleha AA, Zunita Z, Cheah YK, Murugaiyah M, Korejo NA. Genetic characterization of Arcobacter isolates from various sources. Vet Microbiol 2012; org/ /j.vetmic Miller WG, Wesley IV, On SL, et al. First multilocus sequence typing scheme for Arcobacter spp. BMC Microbiol 2009, 9:196. DOI: / Clinical an Laboratory Stanarts Institute (CLSI). Methos for antimicrobial ilution an isc susceptibility testing of infrequently isolate or fastiious bacteria; propose guieline. M 45P. Wayne PA: CLSI, Clinical an Laboratory Stanarts Institute (CLSI). Performance stanars for antimicrobial susceptibility testing. 20th informational supplement, M 100S20. Wayne PA: CLSI, Houf K, Devriese LA, Haesebrouck F, et al. Antimicrobial susceptibility patterns of Arcobacter butzleri an Arcobacter cryaerophilus strains isolate from humans an broilers. Microb Drug Resist 2004; 10:2437. PMi: Abay S, Kayman T, Hizlisoy H, Ayin F. In vitro antibacterial susceptibility of Arcobacter butzleri isolate from ifferent sources. J Vet Me Sci 2012; 74: PMi: Vanenberg O, Houf K, Douat N, Vlaes L, Retore P, Deiste A. Antimicrobial susceptibility of clinical isolates of nonjejuni/coli campylobacters an arcobacters from Belgium. J Antimicrob Chemother 2006; 57: PMi: Son I, Englen MD, Berrang ME, FeorkaCray PJ, Harrison MA. Antimicrobial resistance of Arcobacter an Campylobacter from broiler carcasses. Int J Antimicrob Agents 2007; 29: PMi: Teague NS, Srijan A, Wongstitwilairoong B, et al. Enteric pathogen sampling of tourist restaurants in Bangkok, Thailan. J Travel Me 2010; 17: PMi: