Prof. Dr. Bülbin SunarReeder. L.T. Daum and G.W. Fischer Longhorn Vaccines and Diagnostics, San Antonio 78208, TX, USA.

Transkript

1 Klinik Örneklerdeki RNA in korunması, Patojenlerin inaktivasyonu ve Soğuk zincire ihtiyaç olmadan taşınabilmesi için geliştirilmiş özgün moleküler taşıma ortamı (PrimeStoreMTM) Prof. Dr. Bülbin SunarReeder L.T. Daum and G.W. Fischer Longhorn Vaccines and Diagnostics, San Antonio 78208, TX, USA.

2 GEREKÇE Mikrop RNA ve DNA larının izolasyonunda ilk ve önemli basamak, örnekleri nükleik asitleri bozulmadan testlerin yapılacağı laboratuvara ulaştırabilmektir. PrimeStoreMTM bu işlemleri kolaylaştırmak maksadıyla geliştirilmiş bir moleküler taşıma mediumu olup, klinik örnekleri infeksiyon tehlikesi ve soğuk zincire ihtiyaç olmadan taşıma imkanı sağlar.

3 PrimeStoreMTM i diğer taşıma ortamlarından ayıran önemli özellikler nelerdir?

4 Virus ve bakteri örnekleri ortama konur konmaz canlılığını kaybettikleri için Enfeksiyonun yayılma tehlikesi ortadan kalkmaktadır.

5 PrimeStore Kills Microbes Initial 4-log dilutions of PrimeStore MTM + viruses were required prior to inoculation into tissue culture lines due to PrimeStore MTM lysis of the MDCK tissue culture cells. Therefore, only a minimum 4-log TCID 50 /ml reduction was observable.

6 PrimestoreMTM ortamına RNA (RNA-IPC) kontrol molekülü ilave edilerek nükleik asitlerin pozitif kalite kontroluna imkan sağlanmıştır. Bütün nükleik asit testlerinde gerçek-zamanlı-rt- PCR kullanılmıştır.

7 Cycle Threshold (C T ) PrimeStore MTM is Ideal for NAT Compared to Commercial Transport Media Cycle Threshold (C T ) values lower; X more sensitive during real-time RT-PCR Positive Control PrimeStore MTM Copan UTM BD UTM Remel M4RT Copan UTM is Copan Universal Transport Medium (Copan Diagnostics, Murreta, CA); BD UTM is Becton Dickinson Universal Transport Medium (Beckin Dickinson, Sparks, MD); PrimeStore MTM is PrimeStore Molecular Transport Medium (Longhorn Vaccines & Diagnostics, San Antonio, TX). Remel M4RT is Remel MicroTest M4RT Multi-Microbe Media (REMEL, Lenexa, KS).

8 Taşıma ve saklama süresince soğuk zincire ihtiyaç duyulmaz. Örnek çalışması sonunda artıklar normal olarak çöphe atılabilir.

9 Cylce Threshold (C T ) PrimeStore MTM Preserves Influenza 37 C for 14 days PrimeStore MTM VTM C

10 PrimeStoreMTM Nükleik asitleri taşıma ve saklama süresince enzimatik degregasyondan korur

11 PrimeStoreMTM Stabilizes IPC and viral RNA at Ambient Temperature for 30 days

12 Cycle Threshold (C T ) PrimeStore MTM vs. Copan UTM Across an Influenza Viral Dilution At lower dilutions (10 2 to 10 1 TCID 50 /ml), influen za virus was not detected in 25% (1/4) and 50% (2/4) of the replicates tested compared to PrimeStore MTM Copan UTM PrimeStore MTM e5 10e4 10e3 10e2 10e1 Virus Concentration (TCID 50 /ml)

13 Medium dan nükleik asitlerin izolasyonu bilinen metotlarda hiç bir değişiklige ihtiyaç duyulmadan kolayca yapılabilmektedir.

14 Cycle Threshold (C T ) PrimeStoreMTM is compatible with Commercial Extraction Kits Ambion RNAqueous-Micro Qiagen Viral Mini Invitrogen ChargeSwitch Ambion MagMax ^3 TCID50/mL 10^1 TCID50/mL ssrna IPC

15 PrimeStoreMTM u Özetlersek Viral örnekleri toplama ve taşıma ortamıdır RNA/DNA rı nükleazlardan korur Piyasadaki nükleik asit isolasyon kitleriyle kolaylıkla kullanılabilir Örnekleme, Taşıma ve saklama süresince soğuk zincire ihtiyaç olmadan arazide ve laboratuvarda kullanılır Nükleik asit testlerinde diğer taşıma ortamlarına göre daha sensitiftir.

16 References Daum LT, Worthy SA, Yim KC, Nogueras M, Schuman RF, Choi YW, and Fischer GW A Clinical Specimen Collection and Transport Medium for Molecular Diagnostics and Genomic Applications. Epidemiology and Infection. In press, Luke T. Daum, Sue A. Worthy, James P. Chambers, Demetra Kelenis, John Rodriquez, Dennis J. Reeder and Gerald W. Fischer Commercial Viral Transport Medium (VTM) Inhibits Nucleic Acid Testing. Manuscript Submitted, Luke T. Daum, Sue A. Worthy, Deena E. Sutter, Marty Ottolini, Kathryn E. Myhre, Robert L. Elwood, Gerald W. Fischer. Comparison of Influenza Virus Detection Methods from Pediatric Patients and Household Contacts. Journal of Medical Virology. In press, 2011.

17 Luke T. Daum, Ph.D. Gerald W. Fischer, M.D Bülbin Sunar-Reeder,Ph.D Longhorn Vaccines & Diagnostics 1747 Citadel Plaza, Suite 206 San Antonio, TX Phone: (210) THANKS! QUESTIONS? SORULARINIZ?