Ç.Ü Fen Bilimleri Enstitüsü Yıl:2008 Cilt17-2

Benzer belgeler
ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ

FEN ve MÜHENDİSLİK BİLİMLERİ DERGİSİ

Osmaniye Korkut Ata Üniversitesi, Biyoloji Bölümü Araştırma Laboratuarları ve Üniteleri

MİKROBİYOLOJİ LABORATUARINDA SIK KULLANILAN BAZI BESİYERLERİNİN HAZIRLANMASI VE MUHAFAZASI

RTA JEL / PZR Saflaştırma Kiti

BT 42 TİROSİNAZ ENZİMİNİN EKSTRAKSİYONU, SAFLAŞTIRILMASI VE FENOLLERİN GİDERİMİNDE KULLANIMI

MAIA Pesticide MultiTest

EVDE BİYOTEKNOLOJİ. Yrd. Doç. Dr. Hüseyin UYSAL ADNAN MENDERES ÜNİVERSİTESİ TARIMSAL BİYOTEKNOLOJİ BÖLÜMÜ 5. DERS

REKOMBİNANT E.coli KÜLTÜRLERİ İLE ENZİM ÜRETİMİNİN KİNETİK ÖZELLİKLERİNİN İNCELENMESİ. Dilek KAZAN, Amable HOKTAÇSU ve Agnes ÇAMURDAN

Bu metotta, toprak bir miktar su ile karıştırılarak süspansiyon hâline getirilir.

SANİTER GIDA-ÇEVRE BİLİMİ LTD.ŞTİ.

RTA Bakteriden Genomik DNA İzolasyon Kiti

Laboratuar ortamındaki kullanımı

POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU (PZR-PCR) VE RESTRİKSİYON PARÇA UZUNLUĞU POLİMORFİZMİ (RFLP)

Rahim ağzı kanseri hücreleri doku kültürü mikroskopik görüntüsü.

Hücre Biyoloji Laboratuarı Güz dönemi Alıştırma Soruları (Dr.Selcen Çelik)

1. Öğretmen Kılavuzu. 2. Öğrenci Kılavuzu

Belli dalga boylarındaki analizlerde kullanılır.

Prof. Dr. Sait GEZGİN, Uzman Nesim DURSUN. Selçuk Üniversitesi Ziraat Fakültesi Toprak Bilimi ve Bitki Besleme Böl., Konya.

WESTERN BLOT. Yrd. Doç. Dr. Eda Becer. Yakın Doğu Üniversitesi Eczacılık Fakültesi Biyokimya Anabilim Dalı

GIDA MİKROBİYOLOJİSİ LABORATUVAR UYGULAMASI

Pleurotus eryngii (DC.) Gillet in Tek Spor İzolatlarının Eldesi, Melezlenmesi ve Yeni Melezlerin Misel Büyüme Hızlarının Saptanması

Deneysel Hayvan Modelinde Candida Tropicalis Peritonitinin Tedavisinde Kaspofungin ve Amfoterisin B Etkinliğinin Karşılaştırılması

NANO KURġUN ÜRETĠMĠ VE KARAKTERĠZASYONU

KİMYA BAKLAGİLLERİN AYÇİÇEK YAĞINA ETKİSİNİN SIVI DETERJANLA KIYASLANMASI GRUP PAK

Yenilebilir mantarlar Craterellus cornucopioides Gelincik, sezar (A manita caesarea Çayır, Agaricus campestri

STERİLİZASYON. Sterilizasyon Yöntemleri. Sterilizasyonu Etkileyen Faktörler

FARKLI SICAKLIKLARIN AVCI BÖCEK SCYMNUS SUBVILLOSUS (GOEZE) (COLEOPTERA: COCCINELLIDAE) UN ERGİN ÖNCESİ DÖNEMLERİNİN ÖLÜM ORANLARINA ETKİLERİ *

YILDIZ TEKNİK ÜNİVERSİTESİ

STERİLİZASYON SİSTEMLERİ

AYÇİÇEK YAĞI ÜRETİMİ YAN ÜRÜNLERİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ

Bacillus cereus ve Analiz Yöntemleri

TEMEL ARAŞTIRMA TEKNİKLERİ II

Gıda Analizlerinde Toksik Madde Tayini LC-GC Aplikasyonu Tanım:

Amasya Üniversitesi Merkezi Araştırma Uygulama Laboratuvarı Uygulama ve Araştırma Merkezi 2017 Yılı Analiz Fiyat Listesi

Envirocheck Contact plates; Yüzey Testi için 09.01

Arpa (Hordeum vulgare L.) Bitkisinde Mikrobiyel Gübrelerin Çimlenme Üzerine Etkisinin Belirlenmesi. Çiğdem KÜÇÜK, Cenap CEVHERİ

ÜRÜN KULLANIM KILAVUZU

ŞEKER BEGONYASI POLENLERİ ÜZERİNE BİR ÇÖZÜMLEME. Günnur ÖZDEMİR. Hacettepe Üniversitesi. İstatistik Bölümü

KAYISI ÇEKİRDEĞİ KABUĞU VE CEVİZ KABUĞU KATKILI POLİSTİREN KOMPOZİT ÜRETİMİ

DNA Đzolasyonu. Alkaline-SDS Plasmit Minipreleri. Miniprep ler bakteri kültüründen plasmit DNA sı izole etmenizi sağlar.

ATIKSULARDA FENOLLERİN ANALİZ YÖNTEMİ

1. Genel Laboratuar Kuralları

Elazığ İli Karakoçan İlçesinden Elde Edilen Sütlerde Yağ ve Protein Oranlarının AB ve Türk Standartlarına Uygunluklarının Belirlenmesi

Protein Ekstraksiyonu

ÇOKLU TÜP FERMANTASYON YÖNTEMİ İLE TOPLAM KOLİFORM TAYİNİ. Koliform Bakteri Grubunun Tanımı

PROTEİNLERİN AYRIŞTIRILMASI (İKİ YÖNLÜ JEL ELEKTROFOREZİ)

AMASYA ÜNİVERSİTESİ. GAZ KROMATOGRAFİSİ ANALİZLERİ (GC/FID) GC Kalitatif 50 TL 75 TL 100 TL

Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü

DENEY I ÇÖZELTİ KONSANTRASYONLARI. Genel Bilgi

Uygulamalı. Moleküler Biyoloji Teknikleri, Temel Mikrobiyoloji, Temel Biyokimya ve Laboratuvar Yönetimi Kursları. Yaz Dönemi Başlıyor!

HPLC ile Elma Suyunda HMF Analizi

GIDALARIN BAZI FİZİKSEL NİTELİKLERİ

BT 28 MİKROBİYAL KAYNAKLI LİPAZ ÜRETİMİNE KARBON KAYNAĞI OLARAK BİTKİSEL YAĞLARIN VE GLUKOZUN ETKİSİ

Üniversitesi, Ziraat Fakultesi, Bahçe Bitkileri Bolumu Balcalı, Adana. (Sorumlu Yazar)

İÇİNDEKİLER BÖLÜM 1: MİKROBİYOLOJİYE GİRİŞ...1 BÖLÜM 2: MİKROORGANİZMALARIN MORFOLOJİLERİ.13 BÖLÜM 3: MİKROORGANİZMALARIN HÜCRE YAPILARI...

UYGULAMA NOTU. HPLC ile Gıda Ürünlerinde Fenolik Bileşen Analizi. Yüksek Performanslı Sıvı Kromatografi HAZIRLAYAN

HACETTEPE ÜNİVERSİTESİ MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ PUREZONE CİHAZI TEST RAPORU

ÖZET OTOMATİK KÖKLENDİRME SİSTEMİNDE ORTAM NEMİNİN SENSÖRLERLE HASSAS KONTROLÜ. Murat ÇAĞLAR

HHO HÜCRESİNİN PERFORMANSININ DENEYSEL OLARAK İNCELENMESİ. Konya, Türkiye,

GRUP MİSELYUM ELİF AKÇA İBRAHİM CARİ

- Fiyatlar brüt liste fiyatları olup ambalaj fiyatlarıdır - Fiyatlara KDV ve ÖTV dahil değildir - İskonto oranınız için lütfen şirketimizle irtibat

Bazı Ceviz (Juglans regia L.) Çeşitlerinin Çimlenme ve Çöğür (Anaçlık) Gelişme Performanslarının Belirlenmesi

EVDE BİYOTEKNOLOJİ. Yrd. Doç. Dr. Hüseyin UYSAL Adnan Menderes Üniversitesi Ziraat Fakültesi Tarımsal Biyoteknoloji Bölümü 4. Ders

IĞDIR ÜNİVERSİTESİ SAĞLIK HİZMETLERİ MESLEK YÜKSEKOKULU MEVCUT LABORATUVAR OLANAKLARI

EKMEK ÜRETİMİNDE DÜZENLEMELER DERSİ ÇALIŞMA SORULARI

KAŞAR PEYNİRİNİN SAKLANMASI SIRASINDA KÜFLENME HIZI İLE YÜZEY YAPISI ARASINDAKİ İLİŞKİNİN MATEMATİK MODELLENMESİ (BİYOLOJİ)

GÖRÜNÜR IŞIĞIN HAVUZ SULARININ DEZENFEKSİYONUNDA ALTERNATİF BİR YÖNTEM OLARAK KULLANILMASI

HANTZSCH TEPKİMESİNİN ÜRE SAPTANMASINA UYGULANMASI

YTÜ Çevre Mühendisliği Bölümü Çevre Mikrobiyolojisi 1 Laboratuarı

ÇİMENTO BASMA DAYANIMI TAHMİNİ İÇİN YAPAY SİNİR AĞI MODELİ

TÜBİTAK-BİDEB Lise Öğretmenleri (Fizik, Kimya, Biyoloji ve Matematik) Proje Danışmanlığı Eğitimi Çalıştayı LİSE-2 (ÇALIŞTAY 2012) SUYUN DANSI

ÜRÜN KULLANIM KILAVUZU

HAM KİL VE KALSİNE KİL KULLANILARAK ATIK SULARDAKİ ORGANİK MADDE VE İYONLARIN GİDERİMİ DANIŞMANLAR

MİKROBİYOLOJİ LABORATUVARI CİHAZ KATALOĞU

DİCLE ÜNİVERSİTESİ TIP FAKÜLTESİ DÖNEM I HÜCRE BİLİMLERİ 2 KOMİTESİ HÜCRE KÜLTÜRÜ ve TEKNOLOJİSİ Doç.Dr. Engin DEVECİ

Protokolü PD S Reaksiyon

-1- Biüret Yöntemi. ANALĐZ ĐÇĐN GEREKLĐ EKĐPMANLAR Mikro pipet (1000 µl) Makro küvet (3 ml) 1 Vorteks Analitik terazi Spektrofotometre (540 nm)

Genetik Tanı Merkezleri Ruhsat Başvuru Dosyasında Bulunması Gerekli Evraklar

TEKNİK ŞARTNAME. Alınacak kimyasallar ve biyolojik sarflar için şu hususlara dikkat edilmesi gerekmektedir:

KANTİTATİF ANALİTİK KİMYA PRATİKLERİ

DEZENKON HNS (AgNPS) Antibakteriyel Yer ve Yüzey Dezenfektanı nın H1N1 Domuz Gribi Virüsüne karşı Virusidal Test Sonuç Raporu

ISLAKLIK ÖLÇÜMLERİ. a. Metalin paslanması b. Tahtanın çürümesi c. Ekmeğin küflenmesi. Şekil 1. Malzemeler üzerindeki bozulmalar

ZİRAAT MÜHENDİSİ (TARIMSAL BİYOTEKNOLOJİ)

GRUP KOMPOZİT PROJE DANIŞMANI PROF.DR.MEHMET AY TEKNİSYEN G.DENİZ TURHAN GÖKSU

MOLEKÜLER BİYOLOJİ LABORATUVARI güz dönemi 2. HAFTA GAZİ ÜNİVERSİTESİ FEN FAKÜLTESİ BİYOLOJİ BÖLÜMÜ

TÜBİTAK 1003 Buğday Tuzluluğu Projesinin Üçüncü Dönem Raporu Özeti

TÜBİTAK BİDEB KİMYAGERLİK,KİMYA MÜHENDİSLİK VE KİMYA ÖĞRETMENLİĞİ PROJE DANIŞMANLIĞI EĞİTİMİ ÇALIŞTAYI. LİSANS (Çalıştay 2012) Grup Adı GRUP KLEOPATRA

TARIMSAL BİYOTEKNOLOJİYE GİRİŞ

REVİZYON DURUMU. Revizyon Tarihi Açıklama Revizyon No

Çok ilaca dirençli Mycobacterium tuberculosis izolatlarının hızlı tespitinde nitrat redüktaz testinin değerlendirilmesi: Çok merkezli bir çalışma

EGE ÜNİVERSİTESİ BİLİMSEL ARAŞTIRMA PROJE KESİN RAPORU EGE UNIVERSITY SCIENTIFIC RESEARCH PROJECT REPORT

Erciyes Üniversitesi Gıda Mühendisliği Bölümü Gıda Analizleri ve Teknolojisi Laboratuvar Föyü Sayfa 1

SODYUM DODESİL SÜLFAT POLİAKRİLAMİD JEL ELEKTROFOREZİ İLE PROTEİNLERİN ANALİZİ

ENTEGRE YÖNETİM SİSTEMİ TALİMATLAR

TÜBİTAK BİDEB LİSE ÖĞRETMENLERİ FİZİK, KİMYA, BİYOLOJİ, MATEMATİK- PROJE DANIŞMANLIĞI EĞİTİMİ ÇALIŞTAYI. LİSE2 (Çalıştay 2012) BİYOLOJİ GRUP TELOMER

Gıdalarda Tuz Analizi

GCMS ile Ambalajda Fitalat Kalıntı Analizi

HASTABAŞI TEST CİHAZI KULLANIMI VE BAKIMI. Dr Sibel DEVECİ Biyokimya Uzmanı

DENEY RAPORU ERPASAN KALIP PLASTİK KİMYA İNŞ. NAK. SAN. TİC. LTD. ŞTİ. Deney Raporunu Onaylayan

Transkript:

COPRİNUS CİNEREUSUN MAKSİMUM ÇİMLENME SICAKLIĞININ SAPTANMASI VE NORMAL SICAKLIKTA GELİŞMİŞ VE YÜKSEK SICAKLIKTA GELİŞMİŞ MİSEL VE MEYVELERİN PROTEİN KOMBİNASYONLARININ KARŞILAŞTIRILMASI* Determining The Maximum Germination Temperature of Coprinus cinereus and Comparing the Protein Combinations of Mycel and Fruit Bodies which Grows up at Normal and Higher Temperatures 1 Ali Murat KÜLCÜ Biyoloji Anabilim Dalı Ömer ÇOLAK Biyoloji Anabilim Dalı ÖZET Bu çalışmanın amacı, Coprinus cinereus sporlarının maksimum çimlenme sıcaklığının belirlenmesi; normal ve yüksek sıcaklıkta gelişmiş misel ve meyvelerinin protein kombinasyonlarının karşılaştırılması ile sıcaklığa dayanıklılığı ifade eden protein yapılarının tespitidir. CYM besiyerine ekilmiş olan sporlar, 24 saat içinde 37 o C da 3 defa ayrı ayrı çimlendirilmiş ve ortalama çimlenme yüzdeleri hesaplanmıştır. Bu işlemler, 40, 41, 42, 43, 44 ve 47 o C sıcaklıklar için tekrarlanmıştır. Birbirinden farklı ve saf kültür halindeki 43 monokaryon misel 43 o C ve 46 o C sıcaklarda CYM besiyerinde geliştirilmiştir. Bu süreç sonunda gelişim hızlarının ölçülmesi ile, yüksek sıcaklığa dayanıklı olanlar ve olmayanlar belirlenmiştir. Yüksek sıcaklığa dayanıklı olan 2 farklı monokaryonun kendi aralarında ve yine yüksek sıcaklığa dayanıklı olan ve olmayan iki ayrı monokaryonun birbirleriyle eşleştirilmesi ile elde edilmiş olan dikaryon misel ve meyvelerinin ayrıca, yüksek sıcaklığa dayanıklı olan ve olmayan monokaryon misellerinin protein ekstraktları çıkarılmıştır. Proteinler, SDS-PAGE yöntemi ile analiz edilerek moleküler ağırlıklarına göre ayrıştırılmıştır. Sporlar yaklaşık olarak 41,2 o C da maksimum çimlenme oranına (% 19,53) ulaşmıştır. 38 numaralı hariç, diğer monokaryon misel protein profilleri birbirine benzerlik göstermiştir. Meyve ile misel protein profillerinin farklı olduğu tespit edilmiştir. Anahtar Kelimeler: Basidiomycetes, Çimlenme, SDS-PAGE, Meyve, Misel ABSTRACT The aim of this study is determining maximum germination temperature of spores of Coprinus cinereus and the temperature resistant protein structures by comparing protein combinations of mycel and fruit-bodies which grows up at normal and higher temperature. Spores were germinated three times seperately on CYM media in 24 hours at 37 o C and average germination percentage was calculated. All applications were repeated at 40, 41, 42, 43, 44 and 47 o C temperatures. According to the result of * Master Tezi- MSc.Thesis 63

the growth value of 43 different and pure monokaryon mycel at 43 and 46 o C, one higher temperature resistant monokaryon was chosen and paired with each other and, paired the another monokaryon which is not resistant on higher temperatures. Thus these fruit-bodies and mycels were obtained. In addition, monokaryon mycels which resisted or not resisted at higher temperatures, were chosed and then obtained. All proteins of fruit-bodies and mycels were extracted. Proteins were analysed by using SDS-PAGE electrophoresis method for separating their molecular weights. Nearly at 41,0 o C, spore germination rate (19,53%) have been reached it s maximum value. The profiles of monokaryon mycel proteins were showed nearly similar except number 38. It has been established that profiles of fruit-body and mycel proteins were different. Key Words: Basidiomycetes, Germination, SDS-PAGE, Fruit-body, Mycel Giriş Kültürü kolay yapılabilen C. cinereus, her zaman ve her koşulda mezofilik olarak misel gelişimini gerçekleştirebilir (Schaeffer,J 1774; Gray, 1821). Bir yüzyıldan fazla, bu mantar model mantar olarak laboratuarlarda önem arz etmiştir. Bu mantar, homobasidiomycetes mantarların gelişim proseslerini çalışmak için kullanılmıştır. Bu mantar, aslında sentetik substratlarda meyve verebiliyor olması ve kültürünün kolayca yapılabiliyor olması, iki haftalık gibi kısa bir hayat döngüsüne sahip olması, geniş çapta genetik ve moleküler biyolojik tekniklere ve atılımlara uygun olması nedenleri ile kullanılmıştır (Binninger ve ark., 1987; Moore, 1998; Walser ve ark., 2001). Materyal ve Metot Materyal Bu araştırmada kullanılan C. cinereus örnekleri, Çukurova Üniversitesi Balcalı Yerleşkesinin Ziraat Fakültesi Uygulama Çiftliği Ahırlarının bulunduğu bölgeden toplanmış ve elde edilmiş olan sporları da kuru halde buzdolabında muhafaza edilmiştir. Besi yerleri Çalışmada ph değeri 7,5 e ayarlanan sıvı CYM (Complete Yeast Medium) besi yeri ile buna 20 gr/l agar eklenerek hazırlanan katı besi yeri (Elliott ve ark., 1986) ayrıca at gübresinden hazırlanan katı besi yeri kullanılmıştır (Esser, 1976). Besi yerleri 121 o C a ayarlı bir otoklavda sterilize edildikten sonra kullanılmıştır. Parçalama çözeltisi Çizelge 1. Parçalama çözeltisi (Rybicki ve Purves, 1996) Kimyasal Derişimi Tris-HCl (ph = 6,8) 25 M Merkaptoetanol % 10 SDS % 10 Gliserol % 10 64

Diğer Malzemeler Çalışmalarda antibiyotik olarak etken maddesi amoksisilin olan alfoxil (2 mg/ml derişimli) ile marker olarak sığır albümini (66 kda) kullanılmıştır. Metot Monokaryonların Tespit Edilmesi Üzerinde az miktarda spor toplanan öze, içinde steril su bulunan bir diğer tüpe daldırılarak, öze üzerindeki sporlar bu tüpe aktarılmıştır. Bu tüpteki süspansiyon, bir Vorteks cihazı ile karıştırılarak homojen hale getirilmiştir. İçlerinde antibiyotikli CYM besi yeri bulunan Petri kutularının her birine pipetle spor çözeltisinden birer damla eklenmiş ve bagetle de tüm yüzeye homojen bir şekilde yayılmış ve sporlar 37 o C de 24 saat inkübe edilmiştir. Mikroskop altında yapılan incelemelerle, tek spor kaynaklı kolonilerin bulunduğu bölgeler, bistüri yardımı ile kesilerek alınmıştır. Yeni hazırlanmış antibiyotikli CYM besi yeri içeren Petri kutularının her birine, tek spordan gelişen misel parçacıkları ayrı ayrı ekilmiştir. Etüvde (37 o C) gelişmeye bırakılan örnekler mikroskop altında tekrar kontrol edilmiş ve tamamiyle gelişmiş olan monokaryon miseller buzdolabında saklanmıştır. Monokaryon Misellerin Stoklanması Tek bir sporun çimlenmesiyle elde edilen misel, CYM (Complete Yeast Medium) agarda +4 o C de (buzdolabında) stok kültür şeklinde saklanmıştır. Maksimum Çimlenme Sıcaklık Testleri Steril destile su barındıran tüplere minimal miktarda kuru halde mantar sporu ilave edilmiş ve Vorteks aleti ile homojen hale getirilmiştir. Steril pipetle sulandırılan mantar sporlarının bulunduğu çözeltiden birkaç damla alınarak Thoma lamına damlatılmıştır. Thoma lamında toplam 400 küçük kareden oluşan sayım alanında (0,1mm 3 ) 1-2 spor bulunması halinde bir sonraki işleme geçilmiştir. Bir damlada yaklaşık 500-1000 spor bulunduğu hesaplanmıştır (Gürgün ve Halkman, 1990). Fazla miktarda spor bulunması halinde ise seri sulandırma işlemleriyle sporlar 10-1 oranda seyreltilmiştir. 1 damla örnek CYM besi yerine damlatılmış ve bagetle yayılmıştır. 37 o C da 24 saat bekletilen sporlar, mikroskopta incelenerek çimlenen ve çimlenmeyen spor sayıları kaydedilmiştir. Böylece 37 o C da (24 saat) gelişen sporların çimlenme yüzdesi hesaplanmıştır. Bu işlemler, 3 kez tekrarlanmış ve ortalamalarının alınmasıyla 37 o C daki çimlenme yüzdesi hesaplanmıştır. Bu işlemler, 40 o C, 41 o C, 42 o C, 43 o C, 44 o C, 47 o C için de tekrar edilmiştir. Eşleşme Testi Uyumlu monokaryon çiftlerin tespiti için eşleşme testleri yapılmıştır. İlk olarak stoklardan 0,7 cm çapındaki misel örnekleri kesilerek alınır ve antibiyotikli yeni CYM besi yerine (9 cm çaplı Petri kutularında hazırlanmış) aktarılmıştır. Diğer monokaryon misel kesitleri, merkeze ve birbirlerine aynı uzaklıkta olacak düzende ekilmişlerdir. Petri kutuları, 37 o C da bekletilmiştir. Farklı 65

monokaryonlara ait misellerin temas ettiği bölgelerde mikroskop altında incelenerek kanca yapılarının oluşup oluşmadığı incelenmiştir. Meyve Oluşum Kontrolü ve Monokaryon Testleri Uyumlu olan monokaryon çiftlerin, CYM besi yerinde (antibiyotikli) geliştirilen misellerinden, steril bir biçimde, alınan karesel kesitler (4cm 2 ) steril edilmiş olan at gübresi besiyerlerine, karşılıklı ekilmiştir. Kavanozlarda bulunan misel örnekler sırasıyla, 37 o C da 5 gün (kavanozun her yanını kaplayıncaya kadar) ve 27 o C da 7 gün boyunca ardışık olarak 12 saat aydınlık-karanlık periyodun gerçekleştiği bir ahşap düzenek (Şekil 1) içinde bekletilmiş ve incelenmişlerdir (Hamada ve ark., 2002). A B Şekil 1. Meyve yetiştirilen düzeneğin görüntüsü; A. içten; B.dıştan Monokaryon testlerinde amaç; meyve oluşturan yeteneğinde olan mutant monokaryonların saptanmasıdır. Meyve oluşum kontrolü testlerindeki tüm deneysel uygulamalar burada aynen tekrarlanmıştır. Testlerin arasındaki tek fark, burada tek bir monokaryon misel örneğiyle çalışılmasıdır. Monokaryon Misellerin Yüksek Sıcaklığa Dayanıklılık Testleri 43 farklı monokaryon misel örneğinin kullanıldığı bu testlerde, her bir örnek, 7 cm çaplı Petri kutularında hazırlanmış olan CYM besi yerinin tam merkezine 0,7 cm çaplı dairesel kesitler halinde ekilmiş ve, 43 o C da bekletilmişlerdir. Başlangıç anından itibaren 2., 4., 6., 7. günlerde misellerin çapı bir cetvel ile ölçülerek gelişim hızları tespit edilmiştir. Aynı işlemler, 46 o C için tekrar edilmiş ve 2., 4., 5., 6., 7. ve 12. günlerde ölçümleri yapılmıştır. Örneklerin Hazırlanması ve Protein Ekstraksiyonu Örneklerinin Hazırlanması SDS-page elektroforezinde kullanılan örnekler, başta yüksek sıcaklık testleri olmak üzere eşleşme gibi diğer testlerin de sonuçları göz önünde tutularak seçilmiştir. Seçilmiş olan 1, 5, 34, 37 ve 40 numaralı monokaryon örnekleri yüksek sıcaklığa dayanıklı; 4, 7, 30 ve 33 numaralılar ise yüksek sıcaklığa dayanıksız ve 8 ile 38 numaralı örnekler de karşılaştırma amaçlı olarak değerlendirilmiş ve kullanılmışlardır. Uyumlu monokaryon çiftlerin (30-37, 34-37 ve 34-38) elde edilmesindeyse; yüksek sıcaklığa dayanıklı olan 2 farklı monokaryonun kendi aralarında ve yine yüksek sıcaklığa dayanıklı olan ve olmayan iki ayrı monokaryonun birbirleriyle eşleştirilmesi yolu izlenmiştir. Elektroforez deneylerinde, normal ve yüksek sıcaklıkta gelişmiş temel mantığına göre, monokaryon miseller ile dikaryon misel ve meyvelerin protein yapıları karşılaştırılmıştır. 66

Tüm misel örnekleri, sıvı ve katı CYM besiyerlerinde (antibiyotiksiz) geliştirilmek suretiyle elde edilmişlerdir. Buna göre örnekler, 9 cm çapındaki Petri kutularının merkezine ayrı ayrı ve 1 cm ebatlarında kare kesitler halinde ekilmiştir. 37 o C da bir hafta bekletilmiştir. Bu süre sonunda tüm Petri kutusunu saracak kadar gelişmişlerdir. Aynı örnekler, sıvı CYM besi yeri içeren deney tüplerine, 2-3 adet mini kare kesitler ( 0,5 cm) halinde ekilmişler ve bir hafta süre ile etüvde yatık vaziyette inkübasyona bırakılmışlardır. Meyve örneklerin elde edilmesi için, meyve oluşum testlerinde uygulanan işlemler aynen tekrarlanmıştır (Hamada ve ark., 2002). Fakat aradaki tek fark, bir dikaryon misel parçasının merkeze ekilmiş olmasıdır. Proteinlerin Ekstraksiyonu Yaş ağırlığı 1 gram olarak tartılan her bir misel ve meyve örneği havanda sıvı azotla dondurup ezme yöntemiyle öğütülmüştür. Örnek üzerine 1,5 ml (Brom- Fenol Mavisi içeren) parçalama (Çizelge 1) çözeltisi eklenmiş ve iyice karıştırılmıştır. Karışım, steril eppendorf tüplere alınmıştır. Bu tüpler, -30 o C da 5 dakika ve +95 o C a ayarlı su banyosunda 10 dakika süreyle bekletilmiştir (Rybicki ve Purves, 1996). Örnekler santrifüjde 10000 rpm de 15 dakika süreyle çöktürülmüş ve üst faz yeni steril eppendorf tüplere aktarılmıştır. Örnekler -33 o C da saklanmıştır. Protein Örneklerinin Uygulanması ve Elektroforez Ekstraksiyonu yapılan örnekler SDS-PAGE elektroforez yöntemi ile analiz edilmiştir (Bollag ve Edelstein, 1991). Şekil 2. Çalışır durumda bir elektroforez düzeneğin görüntüsü Bulgular ve Tartışma Monokaryon Misellerin 43 o C daki Gelişimine Ait Bulgular Elektroforezde kullanılan örneklerin gelişimleri Çizelge 2 de gösterilmiştir. 67

Çizelge 2. Monokaryon misellerin gelişimleri [çapları cm cinsinden] C.cinereus örnekleri İlk çapı 2.gün çapı 4.gün çapı 6.gün çapı 7.gün çapı C-1 0,7 2,95 5,55 + + C-4 0,7 3,10 5,45 + + C-5 0,7 3,00 5,90 + + C-7 0,7 3,40 6,10 + + C-8 0,7 3,55 6,00 + + C-30 0,7 3,15 5,30 + + C-33 0,7 3,10 5,90 + + C-34 0,7 2,85 5,30 + + C-37 0,7 2,75 5,55 + + C-38 0,7 3,30 6,85 + + C-40 0,7 2,75 6,00 + + + gelişimini tamamlamış Monokaryon Misellerin 46 o C daki Gelişimlerine Ait Bulgular Elektroforezde kullanılan örneklerin gelişimleri Çizelge 3 de ve bir diğer bulguda Şekil 3 de gösterilmiştir. Çizelge 3. Monokaryon misellerin gelişimleri [çapları cm cinsinden] Ccö* İÇ** 2. G 4. G 5. G 6. G 7. G 12. G C-1 0,7 1,45 3,70 4,60 5,00 6,10 + C-4 0,7 1,50 3,15 3,55 4,00 4,40 5,95 C-5 0,7 2,15 5,20 5,60 6,45 6,90 + C-7 0,7 2,80 4,40 4,65 5,15 5,20 6,40 C-8 0,7 2,20 3,90 4,50 5,20 6,00 + C-30 0,7 2,45 3,45 3,90 4,60 5,15 + C-33 0,7 1,80 2,90 2,95 3,45 4,05 + C-34 0,7 2,90 4,25 5,00 5,20 6,85 + C-37 0,7 2,05 4,20 5,00 5,50 6,25 + C-38 0,7 2,30 4,40 4,80 5,40 6,15 + C-40 0,7 2,90 4,80 5,10 6,30 + + + gelişimini tamamlamış; - gelişimi durmuş; * Ccö: Coprinus cinereus örnekleri; ** İÇ: ilk çapı; G gün A B Şekil 3. 46 o C da Monokaryon Misellerin 5. Gün Sonundaki Gelişim Durumları; A. 5 numaralı monokaryon; B. 15 numaralı monokaryon Coprinus cinereus un Maksimum Çimlenme Sıcaklığına Ait Bulgular Şekil 4 e göre, sporların maksimum çimlenme potansiyelinin 41,2 o C da en üst düzeyde olduğu saptanmıştır. 68

Şekil 4. Coprinus cinereus sporlarının çimlenme yüzdesi Sporlar yüksek bir sıcaklık olan 47 o C da (%8,44) çimlenmesinin sürdürmüştür. Bu da sıcaklık faktörünün çimlenmeyi teşvik ettiğini göstermiştir. Chrysosporium crassitunicatum, Nannizzia fulva (+), Nannizzia fulva (-) ve Trichophyton equinum mantar sporlarını çimlendirmek (24 saat içinde) üzere karbon kaynağı olarak glükozu kullanmışlardır. Chrysosporium crassitunicatum, Nannizzia fulva (+), Nannizzia fulva (-) mantar sporlarının 35 o C ye kadar çimlenebildiğini, fakat daha yüksek sıcaklıklarda çimlenemediğini belirlemişlerdir. Fakat T. equinum un ise, 40 o C ın üzerinde düşük bir oranda çimlenebildiğini saptamışlardır (Singh ve Agrawal., 1982). Bu çalışmada (24 saatlik) ise, mezofilik bir mantar Coprinus cinereus mantarı, yüksek sıcaklık olan 47 o C da bile çimlenmesini sürdürebilmiştir. Eşleşme Testlerine Ait Bulgular Misellerin gelişim sürecinde, uyumlu misel örneklerde gelişim hızının, uyumlu olmayanlara kıyasla fazla olduğu Şekil 5 da görülmektedir. A B Şekil 5. Eşit koşullar altında misel gelişim hızların karşılaştırılması; A. 30-37 numaralı dikaryon örnek; B. 37 monokaryon numaralı örnek Eşleşme testlerinde birçok varyasyon denenmiş ve (kanca yapısı taşıyan) 30-37, 34-37 ve 34-38 (Şekil 6A) monokaryonlar birbirleriyle uyum göstermiştir. A B Şekil 6. Eşleşmelerden görüntü; A. 34-38 uyumluluğu; B. uyumsuzlar 69

Meyve Oluşum Kontrolü ve Monokaryon Testlerine Ait Bulgular. 30-37, 34-37 ve 34-38 numaralı dikaryonlar meyve verebilmiştir. Şekil 7 de, C. cinereus a ait meyve ve sporların görüntüsü verilmiştir. Şekil 7. C. cinereus un meyve ve dökülmüş sporlarının görüntüleri Dikaryon miseller 4-5 günden fazla karanlıkta tutulduğunda, normalde aydınlıkta oluşan meyveler karanlıkta da meydana gelmiş, ancak bu meyvelerin şapka kısmı gelişmemiştir (Şekil 8A). Yeterli ışığın alınmasıyla, şapka kısmı gelişmeye başlamıştır (Şekil 8B). A Şekil 8. Şapka gelişim görüntüleri B Coprinus cinereus Monokaryon Testlerine Ait Bulgular 43 monokaryon örnekten 2, 3, 5, 6 ve 23 numaralı olanlarda meyve oluşumu gözlemlenmiştir. Buna ek olarak; normal bir dikaryona kıyasla, meyve vermiş olan A mut B mut monokaryonlarda meyve gelişiminin yavaş olduğu ve meyvelerin şapka kısımlarının da cüce bir görünümde olduğu gözlemlenmiştir (Şekil 9). Şekil 9. A mut B mut monokaryonuna ait olan meyvelerin görüntüsü SDS-PAGE Elektroforezine Ait Bulgular Genel olarak, 66 kda dan daha düşük ve yüksek moleküler ağırlıkta olan protein bandların sayısının birbirine yakın sayıda olduğu gözlemlenmiştir (Şekil 10). Monokaryon Misellerin Elektroforezine Ait Bulgular 38 numaralı monokaryon örneğinde bir protein bandının eksikliği belirlenmiştir. Agaricus, Boletus, Lactarius, Leccinium, Macrolepiota ve Suillis türlerinden bir ya da birkaç mantarın protein yapılarını SDS-PAGE analizleri ile karşılaştırmışlardır. Sonuçta aynı aileye mensup türlerde bazı benzerliklerin olduğunu tespit etmişlerdir (Petrovska ve ark., 2004). 70

Yukarıda sözü edilen saptamanın bu çalışmada elde edilenler için de geçerli olduğu, yani genelde protein bantları arasında temel benzerlikler olduğu Şekil 10 dan anlaşılmaktadır. 38 numaralı örnekte 66 kilodaltondan daha düşük ağırlıkta bir proteinin eksikliği ve 5 numaralı A mut B mut homokaryon örneğin diğer monokaryon misel örnekleri ile benzer bir protein yapıda olduğu saptanmıştır. Şekil 10. Monokaryon misellerinin protein elektroforez sonucu (soldan sağa: Marker, 4, 7, 30, 33, 38, 8, 5 (A mut B mut homokaryon), 40, 37 ve 34 monokaryon miseli) Misel ve Meyvelerin Elektroforezine Ait Bulgular Bipolar Coprinus sp. ile yapılan araştırmada, karışık monokaryon örnek bantlarının, gerçek dikaryon örneklerindekine benzemediğini, ama farklı tek monokaryonlardaki ile benzer olduklarını saptamışlardır. (Ross ve ark.,1973). Bu çalışmada ise, Şekil 11 de gösterildiği gibi, gerçekten de monokaryonlar ile dikaryonların protein bantları arasında bir farklılığın ve de, meyve ile misel örnekleri arasında bazı farklılıkların olduğu gözlemlenmiştir. Genel olarak, 66 kda dan daha düşük ve yüksek moleküler ağırlıkta olan protein bandların sayısının birbirine yakın sayıda olduğu gözlemlenmiştir (Şekil 11). Şekil 11. Misel ve meyve protein elektroforez sonuçları (III) (Soldan sağa: 34-38, 30-37, 34-37 meyve; 34-38, 30-37, 34-37 dikaryon misel; 38, 37, 34, 71

30 monokaryon misel; 11. cepte marker bulunuyor). Not: soldan 3. cepteki 34-37 numaralı örnek jelden kaçmıştır. Sonuç ve Öneriler Sporlar 41,2 o C da maksimum düzeyde çimlenmiştir. Proteinlerin SDS- PAGE elektroforezinde; genelde, 66 kda dan daha düşük ve yüksek moleküler ağırlıkta olan protein bandların sayısının birbirine yakın sayıda olduğu ve, temel benzerlikler dışında 38 numaralı örnekte 66 kda dan daha düşük ağırlıkta olan bir proteinin eksik olduğu saptanmıştır. 5 numaralı A mut B mut monokaryon örneğinin de diğer monokaryon misel örnekleri ile benzer protein profiline sahip olduğu tespit edilmiştir. Gerçekten de monokaryonlar ile dikaryon örneklerin protein bantları arasında bir farklılığın olduğu belirlenmiştir. Ayrıca, meyve ile misel örneklerinin de farklılıklar gözlemlenmiştir. Sporların maksimum çimlenme sıcaklık testlerinin bağıl nem, ph değeri, farklı besiyerleri ve radyasyon parametrelerinden nasıl etkileneceğinin de ayrıca araştırılmasında yarar vardır. Ayrıca, yüksek sıcaklığa dayanıklı enzimlerden geniş ph bandında çalışan, yüksek sıcaklık ve alkalilere karşı kararlı olanların saptanması, endüstriyel atık su uygulamalarında birçok avantaj sağlayabilir. Kaynaklar BINNINGER, D. M., SKRZYNIA. C., PUKKILA, P. J. and CASSELTON, L. A., 1987. DNA-mediated transformation of the basidiomycete Coprinus cinereus. EMBO J, 6, 835-40. BOLLAG, D. M. and EDELSTEİN, S. J., 1991. Protein Methods. Wiley-Liss. New York, s. 180. ELLIOTT, T. J. and CHALLEN, M. P., Sept./1986. Mushroom Mutant States. United States Patent-4.608.775. Current U. S. Class:800/297. ESSER, K., 1976. Kryptogamen. Springer-Verlag, Berlin. GRAY, S., 1821. A Natural Arrangement of British Plants, I, 634. GÜRGÜN, V. ve HALKMAN, K., 1990. Gıda Teknolojisi Derneği, 2. Baskı, Yayın No: 7. s.146. HAMADA, H., NAMEKAWA, S., KASAI, N., NARA, T., KIMURA, S., SUGAWARA, F. and SAKAGUCHI, K., 2002. Proliferating cell nuclear antigen from a Basidiomycete, Coprinus cinereus. Eur. J. Biochem., 269, 164-174. MOORE, D., 1998. Fungal morphogenesis. Cambridge University Press, Cambridge, United Kingdom. PETROVSKA, B. B., PANOV, S., ZAFIROVSKA, D. R. and KULEVANOVA, S., 2004. Electrophoretic study of mushroom proteins. Food, Agriculture & Environment, Vol 2(1): 148-152. ROSS, I. K., MARTINI, E. M. and THOMAN, M., 1973. Changes in Isozyme Patterns Between Monokaryons and Dikaryons of a Bipolar Coprinus. Journal of Bacteriology, Vol. 114, No. 3, 1083-1089. 72

RYBICKI, E. and PURVES, M., 1996. SDS Polyacrilamide Gel Electrophoresis (SDS-PAGE). Dept Microbiology University of Cape Town. http://www.mcb.uct.ac.za/sdspage.html. SCHAEFFER, J., 1774. Mexic. Pl., 100. United Kingdom. SİNGH, K. V. and AGRAWAL, S. C., 1982. Nutritional requirements of keratinophilic fungi and dermatophytes for conidial germination. Mycopathologia Abstracts, 80(1): 27-32. WALSER, P. J., HOLLENSTEIN, M., KLAUS, M. J. and KÜES, U., 2001. Genetic analysis of basidiomycete fungi. In Talbot, N.J. (ed.) Molecular and cellular biology of filamentous fungi: a practical approach. Irl Press, Oxford, New York,Tokio, in press. 73