ÖRNEK RAPOR KALP DNA İÇGÖRÜSÜ

Transkript

1 Array: Laboratuvar Müdürü, Linda Wasserman, M.D., Ph.D. KALP DNA İÇGÖRÜSÜ KİŞİSEL AYRINTILAR DOĞUM TARİHİ 01 OCA 1980 ETNİK KÖKEN Beyaz Irk SİPARİŞİ VEREN SAĞLIK YETKİLİSİ Joseph Voland M.D Sorrento Valley Blvd Washington, DC US TEST METODOLOJİSİ Dizin temelli çoklu moleküler problarla genotipleme LABORATUVAR BİLGİSİ ERİŞİM AKTİVASYON KODU NUMUNE KODU DERLEME TARİHİ RAPOR TARİHİ ALINDIĞI TARİH D CONVR-ABABA TÜKÜRÜK 20 NIS MAY MAY 2013 BETA BLOKÖRLER, LVEF YANITI Test Edilen Gen - ADRB1 Bu hastanın genotipi beta-blokör terapisini takiben sol ventrikül ejeksiyon fraksiyonunda (LVEF) artmış bir fayda görülmesi ile ilişkilendirilmemiştir. Bu sonuç kalp yetmezliği hastaları üzerinde yapılmış araştırmalara dayanmaktadır ve başka rahatsızlıklar için tedavi gören hastalara uygun olmayabilir. Bu genetik etki bütün araştırmalarda aynı değildir ve bu varyantın atriyal fibrilasyon ve hipertansiyon gibi başka endikasyonlardaki beta-blokör yanıtı üzerindeki etkisi belirsizdir. MUHTEMEL ARTMIŞ YARAR MUHTEMEL YARAR BETA-BLOKÖRLER Test Edilen Gen - GRK5 Bu hasta beta-blokör terapisinden tipik yarar edinilmesiyle ilişkilendirilmiş bir GRK5 genotipine sahiptir ve dolayısıyla beta-blokör terapisine tipik yanıt verebilir. Bu sonuç kalp yetmezliği hastaları üzerinde yapılan bir çalışmaya dayanmaktadır ve başka rahatsızlıklar için tedavi gören hastalar için geçerli olmayabilir. Beta-blokörlere verilen yanıt yaş, cinsiyet, medikal geçmiş ve eşlik eden medikasyonlara göre de değişiklik göstermektedir. MUHTEMELEN AZALMIŞ TERAPÖTİK YARAR MUHTEMELEN TİPİK TERAPÖTİK YARAR KAFEİN METABOLİZMASI Test Edilen Gen - CYP1A2 Bu hastanın genotipi hızlı bir kafein metabolizması ile ilişkilidir. Hasta yüksek miktarda kafein tüketildiğinde (günde dört veya daha çok bardak kahve) artmış bir miyokard enfarktüsü riski ile ilişkili CYP1A2 aleline (rs762551'deki C aleli) sahip değildir. Genetiğe ek olarak, kafein metabolizması tüketilen kahve miktarı, sigara ve hormonal doğum kontrolü gibi yaşam tarzı faktörlerine bağlıdır. Rs belirtecinin Asyalılarda kafein metabolizması ile ilişkili olduğu gözlenmediğinden, bu sonuç Asyalılar için geçerli olmayabilir. HIZLI METABOLİZMA YAVAS METABOLİZMA Laboratuvar Müdürü: Linda Wasserman, M.D., Ph.D. CLIA Numarası: 05D Sorrento Valley Blvd., San Diego, CA SAYFA 1 : 14

2 KLOPİDOGREL METABOLİZMASI Test Edilen Gen - CYP2C19 Bu hasta, aynı dozda klopidogrel ile tedavi edilen çoğu hasta ile karşılaştırıldığında, perkütanöz koroner müdahale sonrasında artmış bir stent trombozu riskine sahiptir. Prasugrel gibi alternatif tedaviler düşünülmelidir. Bu hastanın genotipi düşük veya namevcut CYP2C19 enzimi faaliyetine uygunluk göstermektedir ve dolayısıyla hastanın, klopidogrel aktif metabolitinin düşük plazma konsantrasyonlarına sahip olması muhtemeldir. CYP2C19 genotipi ve metabolizör statüsü diğer ilaçlara verilen yanıtları da etkileyebilir. ULTRA HIZLI METABOLİZÖR GENİŞ ETKİLİ METABOLİZÖR ORTA METABOLİZÖR ZAYIF METABOLİZÖR METOPROLOL METABOLİZMASI Test Edilen Gen - CYP2D6 Bu hastanın genotipi metoprolola cevaben hasta kalp nabzında, diyastolik kan basıncında ve atardamar basıncında normalden daha büyük azalmalarla ilişkilendirilmiştir. Hastanın genotipi düşük CYP2D6 enzimi faaliyetine ve ortalamanın üstünde plazma metoprolol konsantrasyonları ile ilişkilendirilmiştir. Yapılan bir araştırmada zayıf CYP2D6 metabolizörleri artmış bir metoprolol uyarımlı bradikardi riskine sahiptiler. İlaç etiketi CYP2D6 inhibitörlerinin plazma metoprolol konsantrasyonlarını arttırmasının ve metoprololun kardiyoselektivitesini azaltmasının muhtemel olduğu konusunda uyarıda bulunmaktadır. CYP2D6 genotipi ve metabolizör statüsü diğer ilaçlara verilen yanıtları da etkileyebilir. Bu genotipe sahip hastalar için doz ayarlaması veya alternatif medikasyonlar tavsiye edilir. GENİŞ ETKİLİ METABOLİZÖR ORTA METABOLİZÖR ZAYIF METABOLİZÖR PERİNDOPRİL Test Edilen Genler - AGTR1, BDKRB1 Bu hastanın perindopril gibi ACE inhibitörlerinin standart dozlarından bir yarar sağlaması muhtemel değildir ve alternatif tedaviler değerlendirilebilir. Bu sonuç stabil koroner damar hastalığına (CAD) sahip hastalara dayanmaktadır ve stabil koroner damar hastalığına sahip olmayan hastalar için geçerli olmayabilir. Bir araştırmada, bu genotipe sahip olan ve ACE inhibitörü ile tedavi edilen stabil koroner damar hastalarda kardiyovasküler ölüm, ölümcül olmayan miyokard damar tıkanıklığı veya elektroşokla aşılan kalp durması riskinde azalma olmamıştır. Gözlemlenen etkinin oluşturulmasında perindopril kullanılmıştır, ancak başka ACE inhibitörleri de benzer bir etkiye yol açabilir. MUHTEMELEN YANIT VERMEYEN MUHTEMELEN YANIT VEREN Laboratuvar Müdürü: Linda Wasserman, M.D., Ph.D. CLIA Numarası: 05D Sorrento Valley Blvd., San Diego, CA SAYFA 2 : 14

3 SİMVASTATİN UYARIMLI MİYOPATİ Test Edilen Gen - SLCO1B1 Bu hasta simvastatin ile tedavi edildiğinde artmış bir miyopati geliştirme riskine sahiptir. Bu genotipe sahip hastalar için dozun azaltılması, alternatif bir statin veya statin olmayan tedavi düşünülebilir. Simvastatinin reçetelendirilmesi halinde, bu genotipe sahip hastaların serum kreatin kinaz düzeylerinin izlenmesi tavsiye edilmektedir. Simvastatin dozaj düzenlemeleri ve ilaç-ilaç etkileşimi ile ilgili olarak, güncel reçetelendirme bilgileri için en yeni simvastatin ilaçlarına bakılmalıdır. TİPİK RİSK VERAPAMİL ATENOLOL KARŞILAŞTIRMASI Test Edilen Gen - CACNA1C Bu hasta kan basıncını kontrol etmek üzere atenolol yerine verapamil ile tedavi edildiğinde artmış bir yarara sahip olabilir. Bu sonuç hipertansiyon ve stabil koroner damar hastalığına sahip hastalara dayanmaktadır ve başka rahatsızlıklar için tedavi gören hastalar için geçerli olmayabilir. Yararlar arasında azalmış oranda ölüm vakası, miyokard enfarktüsü veya inme bulunmaktadır. ATENOLOL'DAN ARTMIŞ BİR YARAR SAĞLANMASI MUHTEMEL VERAPAMİL'DEN ARTMIŞ BİR YARAR SAĞLANMASI MUHTEMEL VERAPAMİL VEYA ATENOLOL'DAN BENZER YARAR MUHTEMEL VERAPAMİL VE QTC ARALIĞI Test Edilen Gen - NOS1AP Bu hasta artmış bir verapamile bağlı QTc aralığı uzatımı riski ile ilişkili NOS1AP genotipine sahip değildir. QTc aralığı uzunluğu yaş, cinsiyet, başka genler, başka medikasyonlar ve belirli hastalık patolojileri dahil olmak üzere, birçok faktöre bağlıdır. ARTMIŞ UZATMA RİSKİ TİPİK UZATMA RİSKİ WARFARİN Test Edilen Genler - CYP2C9, VKORC1 Bu hastanın genotipi artmış bir warfarin duyarlılığı ve artmış bir kanama komplikasyonu riski ile ilişkilendirilmiştir. Azaltılmış bir ilk doz düşünülmelidir. Uygun warfarin dozları hastadan hastaya büyük değişiklikler göstermektedir; genetik faktörlere ek olarak, yaş, cinsiyet, vücut ağırlığı, ırk, eş zamanlı hastalıklar ve etkileşimli ilaçlar gibi klinik faktörler de doz çeşitliliğine yol açabilmektedir. İlk dozun seçilmesinde klinik faktörlerin yanı sıra, VKORC1 ve CYP2C9 genotiplerinin de göz önünde bulundurulması tavsiye edilmektedir. Güncel warfarin dozu belirleme yönergeleri ve kısıtlamaları için en yeni warfarin etiketlerine göz atılmalıdır. ÖNEMLİ ÖLÇÜDE ARTMIŞ DUYARLILIK ARTMIŞ DUYARLILIK TİPİK DUYARLILIK Laboratuvar Müdürü: Linda Wasserman, M.D., Ph.D. CLIA Numarası: 05D Sorrento Valley Blvd., San Diego, CA SAYFA 3 : 14

4 ÖSTROJEN TAKVİYESİ Test Edilen Genler - F2, F5 Bu hasta Faktör V Leiden mutasyonuna, protrombin G20210A varyantına ya da bunların her ikisine sahiptir; bundan dolayı hasta ağızdan doğum kontrol hapı veya hormon destek terapisi için ağızdan östrojen aldığında artmış bir venöz tromboz riskine sahiptir. Trombojenik mutasyonlar taşıdıkları bilinen kişilerde ağızdan karma doğum kontrol hapı, karma doğum kontrol plasteri veya vajinal halka kullanılması tavsiye edilmemektedir. Hormon destek terapisinin uygun görülmesi halinde, tercih edilmesi gereken seçenek ağız yoluyla olmayan östrojen ve tibolon alımıdır. Bu mutasyonlar başka sağlık riskleri ile de ilişkilidir. Hastanın genotip sonucu için lütfen raporun sonundaki Genotip/Haplotip Detay tablolarına bakın. ARTMIŞ VENÖZ TROMBOZ RİSKİ TİPİK VENÖZ TROMBOZ RİSKİ Taşıyıcılık Durumu ORAK HÜCRE ANEMİSİ Test Edilen Gen - HBB Bu hasta orak hücre anemisi taşıyıcısıdır ancak bundan etkilenmesi muhtemel değildir. Ancak bu hasta çeşitli klinik bulgular ve ender durumlarda zorlanmaya bağlı rabdomiyoliz ile ilişkili olan orak hücre özelliğine sahiptir. HOMOZİGOT TAŞIYICI TAŞIYICI DEĞİL Sağlık Koşulları ATRİYAL FİBRİLASYON Test Edilen Gen - PITX2 Bu hasta atriyal fibrilasyon ile ilgili ortalamanın üstünde genetik riske sahiptir. Bu, hastada bu hastalığın ortaya çıkacağı anlamına gelmemektedir. Bu test sonucu hastanın bildirilen etnik kökeni kullanılarak belirlenmiştir. Kişisel ve ailesel sağlık geçmişine bağlı olarak, bir tarama veya önleme programı ve de hastanın düzenli egzersiz yapmaya, alkol ve tütün kullanımını kısıtlamaya yönelik eğitilmesi uygun olabilir. Sağlık Koşulları KORONER DAMAR HASTALIĞI Test Edilen Genler - CDH13, HNF1A, _10q11, _1q41, _2q36, _5q21, _8p22, _9p21, MRAS, MTHFD1L, SEZ6L, SMAD3 Bu hasta koroner damar hastalığı ile ilgili ortalamanın üstünde genetik riske sahiptir. Bu, hastada bu hastalığın ortaya çıkacağı anlamına gelmemektedir. Bu test sonucu hastanın bildirilen etnik kökeni kullanılarak belirlenmiştir. Kişisel ve ailevi sağlık geçmişine bağlı olarak, bir tarama veya önleme programı ve de hastanın düzenli egzersiz yapmanın ve sağlıklı bir yaşam tarzı sürdürmenin önemi ile ilgili eğitilmesi uygun olabilir. Laboratuvar Müdürü: Linda Wasserman, M.D., Ph.D. CLIA Numarası: 05D Sorrento Valley Blvd., San Diego, CA SAYFA 4 : 14

5 Sağlık Koşulları MİYOKARD ENFARKTÜSÜ Test Edilen Genler - CXCL12, _1p13, _21q22, _9p21, MIA3, OR13G1, PCSK9, PHACTR1, PRR4, SH2B3, WDR12 Bu hasta miyokard enfarktüsü ile ilgili ortalamanın üstünde genetik riske sahiptir. Bu, hastada bu hastalığın ortaya çıkacağı anlamına gelmemektedir. Bu test sonucu hastanın bildirilen etnik kökeni kullanılarak belirlenmiştir. Hastanın hastalık riskini azaltmak için sağlıklı bir kiloda kalma, düzenli egzersiz ve bol meyve ve sebze içeren, düşük sodyumlu bir diyet seçmenin önemi konusunda eğitilmesi uygun olabilir. Sağlık Koşulları DİYABET, TİP 1 Test Edilen Genler - CLEC16A, CTLA4, ERBB3, HLA, IFIH1, IL2RA, INS, _4q27, PTPN2, PTPN22, SH2B3 Bu hasta tip 1 diyabet ile ilgili tipik genetik riske sahiptir. Bu, hastada bu hastalığın ortaya çıkacağı veya çıkmayacağı anlamına gelmemektedir. Bu test sonucu hastanın bildirilen etnik kökeni kullanılarak belirlenmiştir. Sağlık Koşulları DİYABET, TİP 2 Test Edilen Genler - CDKAL1, CDKN2B, ESR1, FTO, HHEX, HNF1B, IGF2BP2, JAZF1, KCNJ11, KCNQ1, MTNR1B, NOTCH2, PPARG, SLC30A8, TCF7L2, WFS1 Bu hasta tip 2 diyabet ile ilgili tipik genetik riske sahiptir. Bu, hastada bu hastalığın ortaya çıkacağı veya çıkmayacağı anlamına gelmemektedir. Bu test sonucu hastanın bildirilen etnik kökeni kullanılarak belirlenmiştir. Genel önleyici tedbirler ve hastanın düzenli fiziksel aktivitelerin ve sağlıklı bir kilonun sürdürülmesinin önemi konusunda eğitilmesi düşünülebilir. Sağlık Koşulları PERİFERİK DAMAR HASTALIĞI Test Edilen Gen - CHRNA3 Bu hasta periferik damar hastalığı ile ilgili tipik genetik riske sahiptir. Bu, hastada bu hastalığın ortaya çıkacağı veya çıkmayacağı anlamına gelmemektedir. Bu test sonucu hastanın bildirilen etnik kökeni kullanılarak belirlenmiştir. Hastanın hastalığın risk faktörleri konusunda eğitilmesi uygun olabilir. Sağlık Koşulları YÜKSEK TANSİYON Test Edilen Genler - BCAT1, PPARGC1A Bu hasta yüksek tansiyon ile ilgili tipik genetik riske sahiptir. Bu, hastada bu hastalığın ortaya çıkacağı veya çıkmayacağı anlamına gelmemektedir. Bu test sonucu hastanın bildirilen etnik kökeni kullanılarak belirlenmiştir. Laboratuvar Müdürü: Linda Wasserman, M.D., Ph.D. CLIA Numarası: 05D Sorrento Valley Blvd., San Diego, CA SAYFA 5 : 14

6 Beslenme AZALMIŞ FOLAT İLE İLGİLİ GENETİK RİSK Test Edilen Gen - MTHFR Bu hasta artmış bir düşük plazma folat düzeyleri ve daha yüksek plazma homosistein düzeyleri riskine sahiptir (yüksek düzeylerdeki homosistein kalp ve damar hastalığı ile ilişkilidir). Folat plazma homosistein düzeylerini düşürebilir ve folat yönünden zengin gıdalar azalmış kalp ve damar hastalığı riski ile ilişkilidir. Bazı doğuştan özürlü olma durumlarının önlenmesi için folat özellikle erken hamilelikte önemlidir. ALIMINI OPTİMİZE EDİN DENGELİ OLUN Metabolik Sağlık Faktörleri YÜKSELMİŞ LDL KOLESTEROL İÇİN GENETİK RİSK Test Edilen Genler - ABCG8, APOB, CELSR2, HMGCR, HNF1A, intergenic, LDLR, MAFB, NCAN, PCSK9 Bu hasta sınırda yüksek LDL kolesterol düzeyleri (130 mg/dl üzerinde) ile ilgili olarak daha yüksek genetik riske sahiptir. Ancak bu sonuç hastanın sınırda yüksek LDL kolesterol düzeylerine sahip olduğu anlamına gelmez. Hastanın LDL kolesterol kan düzeylerinin gözlenmesi düşünülebilir. YÜKSEK RİSK ALTINDA DÜŞÜK RİSK Metabolik Sağlık Faktörleri AZALMIŞ HDL KOLESTEROLÜ İLE İLGİLİ GENETİK RİSK Test Edilen Genler - ABCA1, ANGPTL4, CETP, FADS1, GALNT2, HNF4A, KCTD10, LCAT, LIPC, LIPG, LPL, PLTP, TTC39B, ZNF259 Bu hasta azalmış HDL kolesterol düzeyleri (40 mg/dl altında) ile ilgili olarak daha yüksek genetik riske sahiptir. Ancak bu sonuç hastanın azalmış HDL kolesterol düzeylerine sahip olduğu anlamına gelmez. Hastanın kandaki kolesterol düzeylerinin gözetim altında tutulması düşünülebilir. YÜKSEK RİSK ALTINDA DÜŞÜK RİSK Metabolik Sağlık Faktörleri YÜKSELMİŞ TRİGLİSERİT İLE İLGİLİ GENETİK RİSK Test Edilen Genler - ANGPTL3, APOB, FADS1, GCKR, LPL, MLXIPL, NCAN, PLTP, TRIB1, XKR6, ZNF259 Bu hasta sınırda yüksek trigliserit düzeyleri (150 mg/dl üzerinde) ile ilgili olarak daha yüksek genetik riske sahiptir. Ancak bu sonuç hastanın sınırda yüksek trigliserit düzeylerine sahip olduğu anlamına gelmez. Hastanın kandaki trigliserit düzeylerinin gözlem altında tutulması düşünülebilir. Yüksek trigliserit düzeyleri egzersiz noksanlığı, aşırı alkol tüketimi, sigara içme, aşırı rafine karbonhindrat tüketimi ve aşırı kilolu olma ile ilişkilidir. YÜKSEK RİSK ALTINDA DÜŞÜK RİSK Laboratuvar Müdürü: Linda Wasserman, M.D., Ph.D. CLIA Numarası: 05D Sorrento Valley Blvd., San Diego, CA SAYFA 6 : 14

7 GENOTİP/HAPLOTİP AYRINTILARI FARMAKOGENETİK Bu bölümde açıdan test edilen genetik belirteçler listelenmektedir. Sonuçlar ilaçlara verilen yanıtlara göre düzenlenmiştir. Her ilaç yanıtı iki bölüm içerebilir: "Genetik Sonuç" ve bununla bağlantılı üç sütunluk bir tablo. "Genetik Sonuç" haplotipi, genotipi ya da bir mutasyonun mevcudiyetini belirtir. BD içeren bir genetic sonuç bir halotipin belirlenemediğini belirtir. Rapor Edilemiyor bir sonuç sağlanamadığını belirtir. Tabloda sonuçlar ilaç yanıtlarına göre üç sütunda düzenlenmiştir: 1. "Gen/Loküs" geni ya da belirtecin yer aldığı genlerarası yeri ifade eder. 2. "Belirteç" test edilen belirtecin özgün belirleyicisini ifade eder. 3. "Genotip" belirli bir belirteçteki nükleotid kombinasyonunu ifade eder. / işaretinin iki yanındaki harf(ler) hastaya ait DNA'nın iki kopyasını ifade eder. Sil hastaya ait DNA daki nükleotid(ler)in silindiğini belirtir. "--" şeklinde belirtilen bir genotip bir sonuç elde edilemediğini belirtir. BETA BLOKÖRLER, LVEF YANITI ADRB1 rs C/C BETA-BLOKÖRLER GRK5 rs A/A KAFEİN METABOLİZMASI Genetik Sonuç: CYP1A2 *1/*1 CYP1A2 rs A/A KLOPİDOGREL METABOLİZMASI Genetik Sonuç: CYP2C19 *2/*3 CYP2C19 rs G/A CYP2C19 rs G/A CYP2C19 rs C/C CYP2C19 rs A/A CYP2C19 rs T/T CYP2C19 rs C/C CYP2C19 rs G/G METOPROLOL METABOLİZMASI Genetik Sonuç: CYP2D6 *4/*4 CYP2D6 rs16947 C/C CYP2D6 rs G/G CYP2D6 rs T/T CYP2D6 rs C/C METOPROLOL METABOLİZMASI Genetik Sonuç: CYP2D6 *4/*4 CYP2D6 rs A/A CYP2D6 rs T/T CYP2D6 rs AAG/AAG CYP2D6 rs G/G CYP2D6 rs C/C CYP2D6 rs G/G CYP2D6 rs A/A CYP2D6 rs G/G PERİNDOPRİL AGTR1 rs5182 C/C AGTR1 rs T/T BDKRB1 rs G/G SİMVASTATİN UYARIMLI MİYOPATİ SLCO1B1 rs C/C VERAPAMİL ATENOLOL KARŞILAŞTIRMASI CACNA1C rs A/A VERAPAMİL VE QTC ARALIĞI NOS1AP rs T/T WARFARİN Genetik Sonuç: CYP2C9 *1/*1; VKORC1 A/A CYP2C9 rs A/A CYP2C9 rs C/C CYP2C9 rs A/A VKORC1 rs A/A ÖSTROJEN TAKVİYESİ Genetik Sonuç: Factor V Leiden mutation (2 copies); Prothrombin G20210A mutation (2 copies) F2 F5 Prothrombin G20210A Factor V Leiden A/A A/A Laboratuvar Müdürü: Linda Wasserman, M.D., Ph.D. CLIA Numarası: 05D Sorrento Valley Blvd., San Diego, CA SAYFA 7 : 14

8 TAŞIYICILIK DURUMU Bu bölümde Taşıyıcılık Durumu için test edilen bireysel mutasyonlar listelenmektedir. Test edilen mutasyonlar hastalığa göre düzenlenmiştir ve ilgili genlerinin yanında parantez içinde yer almaktadır. Hastanın test edilen bir mutasyonu taşıması durumunda, bu "Carrier of" ("Taşıyıcı") bölümünde kırmızıyla vurgulanacaktır. Hastanın test edilen bir mutasyonu taşımaması durumunda, bu "Not a Carrier of" ("Taşıyıcı değil") bölümünde siyah harflerle listelenecektir. Bir mutasyon için bir sonuç elde edilemezse, bu "No Data for" ("Veri yok") bölümünde listelenecektir. Bekleniyor hastanın bu hastalıkla ilgili testinin hala sürdüğünü belirtmektedir. Rapor Edilemiyor sonuç elde edilemediğini belirtmektedir. Rezidüel risk: birçok ender mutasyon mevcut olduğundan, testimize dahil olmayan bir mutasyonun taşınıyor olması ihtimal dahilindedir. ORAK HÜCRE ANEMİSİ Taşıyıcı: HBB [Hemoglobin S] Laboratuvar Müdürü: Linda Wasserman, M.D., Ph.D. CLIA Numarası: 05D Sorrento Valley Blvd., San Diego, CA SAYFA 8 : 14

9 SAĞLIK KOŞULLARI Bu bölümde Sağlık Koşulları için test edilen bireysel mutasyonlar listelenmektedir. Sonuçlar mevcut durumlara göre üç sütuna ayrılmıştır: 1. "Gen/Loküs" geni ya da belirtecin yer aldığı genlerarası yeri ifade eder. 2. "Belirteç" test edilen belirtecin özgün belirleyicisini ifade eder. 3. "Genotip" belirli bir belirteçteki nükleotid kombinasyonunu ifade eder. / işaretinin iki yanındaki harf(ler) hastaya ait DNA'nın iki kopyasını ifade eder. Sil hastaya ait DNA daki nükleotid(ler)in silindiğini belirtir. "--" şeklinde belirtilen bir genotip bir sonuç elde edilemediğini belirtir. Rapor Edilemiyor bir sonuç sağlanamadığını belirtir. Her belirtece ait bilimsel kanıtların kuvveti ilgili sağlık koşulunun teknik bülteninde yer almaktadır. ATRİYAL FİBRİLASYON PITX2 rs T/C KORONER DAMAR HASTALIĞI CDH13 rs G/G HNF1A rs A/A _10q11 _1q41 _2q36 _5q21 _8p22 _9p21 rs rs rs rs rs rs T/C G/G A/C A/A C/C G/C MRAS rs T/C MTHFD1L rs G/G SEZ6L rs T/C SMAD3 rs T/C MİYOKARD ENFARKTÜSÜ CXCL12 rs T/C _1p13 _21q22 _9p21 rs rs rs T/C T/C A/G MIA3 rs C/C OR13G1 rs A/G PCSK9 rs T/T PHACTR1 rs C/C MİYOKARD ENFARKTÜSÜ PRR4 rs T/C SH2B3 rs C/C WDR12 rs T/T DİYABET, TİP 1 CLEC16A rs G/G CTLA4 rs A/G ERBB3 rs T/C HLA rs G/G HLA rs T/C IFIH1 rs C/C IL2RA rs C/C INS rs T/C _4q27 rs T/G PTPN2 rs T/C PTPN22 rs G/G SH2B3 rs C/C DİYABET, TİP 2 CDKAL1 rs A/A CDKN2B rs T/T ESR1 rs T/C FTO rs A/C HHEX rs A/G HNF1B rs T/C IGF2BP2 rs A/C JAZF1 rs C/C KCNJ11 rs5219 T/C KCNQ1 rs T/C MTNR1B rs C/G DİYABET, TİP 2 NOTCH2 rs T/G PPARG rs C/C SLC30A8 rs C/C TCF7L2 rs T/C WFS1 rs A/G PERİFERİK DAMAR HASTALIĞI CHRNA3 rs C/C YÜKSEK TANSİYON BCAT1 rs C/C PPARGC1A rs A/A Laboratuvar Müdürü: Linda Wasserman, M.D., Ph.D. CLIA Numarası: 05D Sorrento Valley Blvd., San Diego, CA SAYFA 9 : 14

10 DİYET, BESLENME VE EGZERSİZ YANITLARI Bu bölümde Diyet, Beslenme ve Egzersiz Yanıtları için test edilen bireysel mutasyonlar listelenmektedir. Sonuçlar mevcut durumlara göre dört sütuna ayrılmıştır: 1. "Gen/Loküs" geni ya da belirtecin yer aldığı genlerarası yeri ifade eder. 2. "Belirteç" test edilen belirtecin özgün belirleyicisini ifade eder. 3. "Genotip" belirli bir belirteçteki nükleotid kombinasyonunu ifade eder. / işaretinin iki yanındaki harf(ler) hastaya ait DNA'nın iki kopyasını ifade eder. "--" şeklinde belirtilen bir genotip bir sonuç elde edilemediğini belirtir. 4. "Kuvvet" genetik belirteç ve ilişkili sonuçla ilgili araştırma kanıtlarının kuvvetini ifade eder. Dört dolu kutucuk araştırmanın 2.000'in üzerinde kişiyi kapsadığını ve aynı sonuçlara ulaşan en az bir araştırma olduğunu ifade eder. Üç dolu kutucuk araştırmanın 400'ün üzerinde kişiyi kapsadığını ifade eder. İki dolu kutucuk araştırmanın 400'den az kişiyi kapsadığını ifade eder; bu kategorideki araştırmalar ön araştırma niteliğindedir ancak Pathway'in istatistiksel önem kriterlerinden geçmiş bulunmaktadır. Tek yıldız sonuçların çok büyük ölçüde ön bilgi şeklinde olduğunu ifade eder. Rapor Edilemiyor bir sonuç sağlanamadığını belirtir. AZALMIŞ FOLAT İLE İLGİLİ GENETİK RİSK KUVVET MTHFR rs T/T YÜKSELMİŞ LDL KOLESTEROL İÇİN GENETİK RİSK KUVVET ABCG8 rs T/T APOB rs G/G CELSR2 rs G/G HMGCR rs T/T HNF1A rs A/A intergenic rs G/G LDLR rs G/G MAFB rs C/C NCAN rs T/T PCSK9 rs T/T AZALMIŞ HDL KOLESTEROLÜ İLE İLGİLİ GENETİK RİSK KUVVET ABCA1 rs A/A ANGPTL4 rs A/A CETP rs C/C FADS1 rs C/C GALNT2 rs G/G HNF4A rs T/T KCTD10 rs C/C LCAT rs G/G LIPC rs C/C AZALMIŞ HDL KOLESTEROLÜ İLE İLGİLİ GENETİK RİSK KUVVET LIPG rs T/T LPL rs A/A PLTP rs7679 C/C TTC39B rs G/G ZNF259 rs G/G YÜKSELMİŞ TRİGLİSERİT İLE İLGİLİ GENETİK RİSK KUVVET ANGPTL3 rs A/A APOB rs A/A FADS1 rs C/C GCKR rs T/T LPL rs A/A MLXIPL rs T/T NCAN rs C/C PLTP rs7679 C/C TRIB1 rs A/A XKR6 rs A/A ZNF259 rs G/G Laboratuvar Müdürü: Linda Wasserman, M.D., Ph.D. CLIA Numarası: 05D Sorrento Valley Blvd., San Diego, CA SAYFA 10 : 14

11 NEGATİF TEST SONUCUNDAN SONRA REZİDÜEL RİSK Test sonucunun negatif olması (taşıyıcı değil) durumunda, hastanın test panelinin parçası olmayan bir mutasyonu taşıma olasılığına yönelik bir rezidüel risk vardır. Aşağıdaki tabloda, Pathway Genomics taşıyıcılık durumu testlerindeki taşıyıcılık koşullarına yönelik rezidüel risk tahminleri verilmiştir. Verilerin mevcut olduğu koşullar ve spesifik popülasyonlar için popülasyondaki taşıyıcılık oranı, taşıyıcı saptama oranı ve rezidüel risk gösterilmiştir. Aşağıda listelenen diğer koşullar ve gösterilmeyen popülasyonlar için prevalans nadir olup mutasyon saptama oranı bilinmemektedir ve rezidüel risk hesaplanabilir değildir. "TAŞIYICI DEĞİL" sonucu aldığı koşul için kişisel ve/veya aile geçmişinde şüpheli bir durumu olan bir birey için ek genetik testler endike olabilir. ORAK HÜCRE ANEMİSİ POPÜLASYON TAŞIYICI ORANI SAPTAMA ORANI REZİDÜEL RİSK Afrika Kökenli Amerikalı 1: % 0 Amerikan Yerlisi 1: % 0 Hispanik 1: % 0 Arap 1: % 0 Beyaz 1: % 0 Asyalı Hintli 1: % 0 Filipinli 1: % 0 Asyalı 1: % 0 Güneydoğu Asyalı 1: % 0 Laboratuvar Müdürü: Linda Wasserman, M.D., Ph.D. CLIA Numarası: 05D Sorrento Valley Blvd., San Diego, CA SAYFA 11 : 14

12 YASAL SORUMLULUK REDDİ Bu rapor sadece hasta tarafından, lisanslı bir sağlık hizmeti profesyoneline danışılmadan kullanılma amacını taşımamaktadır. Bu test testi gerçekleştiren laboratuvar tarafından geliştirilmiştir ve performans karakteristikleri yine aynı laboratuvar tarafından belirlenmiştir. Bu test Amerikan Gıda ve İlaç Kurumu (FDA) oluru veya onayını almamıştır. Bu raporla ilgili herhangi bir sorunuz varsa veya Pathway Genetics'in genetik danışmanlarından biriyle konuşmayı dilerseniz lütfen (877) numaralı telefonu arayın. Laboratuvar Müdürü: Linda Wasserman, M.D., Ph.D. CLIA Numarası: 05D Sorrento Valley Blvd., San Diego, CA SAYFA 12 : 14

13 RİSKLER VE KISITLAMALAR Laboratuvar Teknik Sorunu Veya Laboratuvar Hatası Riski Sertifikalı test laboratuvarı teknik ve operasyonel sorunlara karşı koruma sağlamak için standart ve etkin prosedürler de uygulamaya koymuştur. Ancak bu tür sorunlar yine de olabilir. Test laboratuvarı hastalar ve hekimler tarafından toplanan örnekleri almaktadır. Laboratuvara sevkiyatta ya da örneğin elleçlenmesinde numunenin veya ilgili belgelerinin zarar görmesi, yanlış etiketleme ve numunenin kaybedilmesi veya geç kabul edilmesi dâhil ve bunlarla sınırlı olmamak kaydıyla, sorunlar çıkabilir. Sonuç elde edilmesini imkânsız kılabilecek laboratuvar sorunları ortaya çıkabilir. Buna örnek olarak ancak bunlarla sınırlı olmamak kaydıyla, örneğin yanlış etiketlenmesi, DNA'nın kontaminasyona maruz kalması, yorum yapılması imkânsız sonuçlar elde edilmesi ve insan ve/veya test sistemi hataları sayılabilir. Bu gibi durumlarda test laboratuvarı yeni bir örnek talep etme ihtiyacı duyabilir. Ancak yeniden test yapılmasını takiben, sonuçların alınması yine mümkün olmayabilir. Bütün tıbbi laboratuvar testlerinde olduğu gibi, laboratuvarın yanlış bilgiler rapor etme olasılığı bulunmaktadır. Örneğin, laboratuvar aslında olmayan bir genotipi varmış gibi rapor edebilir. Herhangi bir laboratuvar hatası tıbbi tedavi ve/veya diyet ve fitnes tavsiyeleri ile ilgili yanlış kararlara yol açabilir. Bir laboratuvar hatasının oluşması veya bundan kuşkulanılması halinde, bir sağlık hizmetleri profesyoneli daha geniş bir değerlendirme ve/veya başka testler yapmayı arzulayabilir. Herhangi bir nedenle ilgili herhangi bir sonucu teyit etmek için testlere devam edilebilir. Kısıtlamalar Bu testin amacı test edilen bireye ait genlerin bazı kalıtsal hastalıklar, bazı ilaçlara verilen yanıtlar, belirli yaygın sağlık durumları ile ilgili riskler ve/veya seçilen diyet, beslenme ve/veya egzersiz yanıtları hakkında bilgi sağlamak ve de ayrıca sağlık hizmeti profesyoneli tarafından sipariş edilen belirli genetik teste bağlı olarak, test edilen bireyin geçmiş soyu hakkında daha çok şey öğrenmektir. Test edilen bireyler bir sağlık hizmeti profesyoneline danışmadan, genetik test sonuçlarına dayanarak (medikasyonların doz ve sıklığı, diyet ve egzersiz programları veya hamilelik planlaması dâhil ancak bunlarla sınırlı olmamak üzere) herhangi bir tıbbi bakımda herhangi bir değişikliğe gitmemelidir. Belirli test sonuçlarının önemi ya da yorumu ardında yatan bilim gelişmeye devam etmektedir. Genetik testlerin potansiyel yararını ileriye götürme konusunda büyük adımlar atılmış olmasına rağmen, daha keşfedilecek çok şey var. Genetik testler bugün bilinen bilgi, gelişme ve test tekniklerine dayanmaktadır. Gelecekteki araştırmalar daha önce elde edilmiş genetik test sonuçlarının yorumlanmasında değişiklikler ortaya çıkarabilir. Örneğin, herhangi bir genetik test test edilmekte olan varyantlarla sınırlıdır. Hastalık, ilaç yanıtı veya diyet, beslenme ve egzersiz yanıtı ile ilişkili olan bazı varyantlar test edilmeyebilir; muhtemelen bu varyantlar genetik çalışmalarda henüz belirlenememiştir. Test edilen rahatsızlıkların ve ilaç yanıtlarının birçoğu genetik faktörlere ve ayrıca yaş, kişisel ve ailesel sağlık geçmişi, diyet ve etnik köken gibi genetik olmayan faktörlere bağlıdır. Bu sebeple bir birey genetik test sonuçlarına uygun belirli bir ilaç yanıtı veya diyet, beslenme ve egzersiz yanıtı göstermeyebilir. Özellikle diyet ve egzersiz alanlarındaki bazı durumlarla ilgili bir başka kısıtlama da genetik ilişkilerin sadece beyaz ırka mensup nüfuslarda araştırılmış ve izlenmiş olmasıdır. Bu durumda yorumlar ve tavsiyeler beyaz ırka mensup kişiler üzerindeki araştırmalar bağlamında yapılmıştır, ancak sonuçlar test edilen farklı veya melez kökenli etnisiteye mensup kişilere uygun olmayabildiği gibi, olabilir de. Sağlık hizmeti sağlayıcıları test sonuçlarına ve test edilen bireyle ilgili başka tıbbi bilgilere dayalı olarak, ek bağımsız testlerin yapılmasını veya başka bir sağlık hizmeti sağlayıcısına ya da genetik danışmanına danışılmasını düşünebilir. Laboratuvar Müdürü: Linda Wasserman, M.D., Ph.D. CLIA Numarası: 05D Sorrento Valley Blvd., San Diego, CA SAYFA 13 : 14

14 SONUÇ DURUM TANIMLARI Değiştirildi Sonucun/sonuçların klinik önemini ve/veya hasta diyagnoz, tedavi veya yönetimini etkilemeyecek şekilde gözden geçirilmiş test sonuçları ve/veya hasta bilgileri. Düzeltilmiş Sonucun/sonuçların klinik önemini ve/veya hasta diyagnoz, tedavi veya yönetimini etkileyebilecek şekilde gözden geçirilmiş test sonuçları ve/veya hasta bilgileri. Nihai Rapor yayınlanma anında hazır olan ya da gözden geçirilerek "beklemede" statüsünden "sonuç" statüsüne güncellenen test sonuçları. Bekleniyor Raporun yayınlandığı tarihte mevcut olmayan test sonuçları. Beklemede olan bütün test sonuçları raporda belirtilecektir. Laboratuvar Müdürü: Linda Wasserman, M.D., Ph.D. CLIA Numarası: 05D Sorrento Valley Blvd., San Diego, CA SAYFA 14 : 14