Hindi Etlerinden Salmonella spp., Listeria monocytogenes ve Clostridium perfringens in Saptanması ve Karakterizasyonu

Ebat: px
Şu sayfadan göstermeyi başlat:

Download "Hindi Etlerinden Salmonella spp., Listeria monocytogenes ve Clostridium perfringens in Saptanması ve Karakterizasyonu"

Transkript

1 T.C. ANKARA ÜNİVERSİTESİ BİLİMSEL ARAŞTIRMA PROJESİ KESİN RAPORU Proje Başlığı HİNDİ ETLERİNDE SALMONELLA SPP., LISTERIA MONOCYTOGENES VE CLOSTRIDIUM PERFRINGENS İN SAPTANMASI VE KARAKTERİZASYONU Proje Yürütücüsünün İsmi PROF. DR. İRFAN EROL Proje Numarası Başlama Tarihi 2005 Bitiş Tarihi 2007 Rapor Tarihi Ankara Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Ankara 2007

2 I: Projenin Türkçe ve İngilizce Adı ve Özetleri Projenin Türkçe Adı: Hindi Etlerinden Salmonella spp., Listeria monocytogenes ve Clostridium perfringens in Saptanması ve Karakterizasyonu Projenin İngilizce Adı: Detection and Characterization of Salmonella spp., Listeria monocytogenes and Clostridium perfringens in Turkey Meat Özet: Bu çalışmada, Ankara daki marketlerde Haziran Ocak 2006 tarihleri arasında satışa sunulan 3 farklı firmaya ait, paketlenmiş formda hindi but, göğüs ve kuşbaşı etlerinden Salmonella spp., Listeria monocytogenes ve 1 Clostridium perfringens in: i) klasik kültür ve/veya immuno manyetik separasyon (IMS) teknikleri ile izole edilmesi, ii) izolatların PCR ile doğrulanması ve ayrıca Clostridium perfringens izolatlarının enterotoksin oluşumundan sorumlu olan cpe geninin varlığı yönünden incelenmesi ile iii) izolatların antibiyotik duyarlılık profilinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Çalışmada toplam 180 hindi eti örneğinin 55 inden (% 30.5) Salmonella spp., 24 ünden (% 13.3) L. monocytogenes ve 22 sinden (% 12.2) C. perfringens izole edilmiştir. PCR tekniği ile 55 Salmonella spp. izolatının 55 inde (% 100) inva geni, 24 L. monocytogenes izolatının 23 ünde (% 95.8) hlya (listeriolysin O) geni, 22 C. perfringens izolatının 22 sinde (% 100) cpa geni tespit edilmiştir. Bu 22 C. perfringens izolatında cpe geninin varlığına rastlanmamıştır. İzolatların antimikrobiyel duyarlılık profilleri disk difüzyon yöntemi ile belirlenmiştir. Çalışmada Salmonella spp. izolatlarında en fazla dirençlilik % 50.9 ile tetrasikline karşı bulunurken bu antibiyotiği % 41.8 ile nalidiksik asit, % 40.0 ile streptomisin ve ampisilin, % 5.4 ile gentamisin izlemiştir. Çoklu direnç bulgusu olarak 5 izolatın 2 antibiyotiğe, 17 izolatın 3 antibiyotiğe, 6 izolatın 4 antibiyotiğe karşı dirençli olduğu saptanmıştır. L. monocytogenes izolatlarından 19 unun (% 82.6) penisiline, 17 sinin (% 73.9) ampisiline karşı dirençli olduğu görülmüştür. İzolatlardan 16 sının ise 2 antibiyotiğe karşı çoklu direnç gösterdiği saptanmıştır. C. perfringens izolatları arasında en fazla dirençlilik % 100 ile trimetoprime karşı bulunurken, bu antibiyotiği % 86.3 ile gentamisin, % 13.6 ile tetrasiklin ve siprofloksasin izlemiştir. Çoklu antibiyotik direnci profiline bakıldığında 17 izolatın 2 antibiyotiğe, 4 izolatın 3 antibiyotiğe karşı dirençli olduğu saptanmıştır. Bu çalışma kapsamında incelenen örneklerin önemli bir bölümünün Salmonella spp., Listeria monocytogenes ve Clostridium perfringens ile kontamine olması ve izolatların

3 değişik antibiyotiklere dirençli bulunması halk sağlığı yönünden potansiyel bir sorun olarak değerlendirilebilir. Bu nedenle üretimin hijyenik koşullarda yapılmasına ve hayvansal gıda üretiminde kullanılan hayvanlarda, antibiyotiklerin profilaktik ve gelişmeyi arttırıcı amaçlı kullanımına ilişkin regülasyonların uygulanmasına özen gösterilmelidir. Summary: The objectives of this study were i) to determine the incidence of Salmonella spp., Listeria monocytogenes and Clostridium perfringens by culture technique and immunomagnetic separation (IMS) in packaged fresh brisket, leg and turkey meat cuts from 3 different producers marketed in Ankara, from June 2005 to January 2006, ii) to verify the isolates by PCR and to detect cpe gene which is responsible for the producing of enterotoxin from C. perfringens isolates, and iii) to detect the antibiotic susceptibility profiles of the isolates by disc diffusion method. In the study 55 (30.5 %) Salmonella spp., 24 (13.3 %) L. monocytogenes and 22 (12.2 %) C. perfringens were isolated from a total of 180 turkey meat samples. According to the PCR analysis, inva gene was detected in 55 Salmonella spp., hlya (listeriolysin O) gene was detected in 23 L. monocytogenes and cpa gene was detected in 22 C. perfringens isolates. In none of the C. perfringens isolates cpe gene was detected. Isolates were tested for antibiotic susceptibility profiles by disc diffusion technique. As a result Salmonella spp. isolates were most often found to be resistant to tetracycline (50.9 %), nalidixic acid (41.8 %), streptomycin and ampicillin (40.0 %) and gentamicin (5.4 %). Multiple antibiotic resistance was observed such as: 5 isolates were resistant to 2 antibiotics, 17 isolates to 3 antibiotics and 6 isolates to 4 antibiotics. Nineteen isolates of L. monocytogenes showed resistance against penicillin (82.6 %) and 17 isolates to ampicillin (73.9 %). In addition to that 16 isolates were multiple resistant to 2 antibiotics. C. perfringens isolates were most often found to be resistant to trimethoprim (100 %) and gentamicin (86.3 %). Relatively lesser resistance was observed against tetracycline and ciprofloxacin (13.6 %). Multiple antibiotic resistance were observed as followed, 17 isolates to 2 antibiotics and 4 isolates to 3 antibiotics. Based on the results of this study, turkey meat was found as a significant source of main foodborne pathogens such as Salmonella spp., L. monocytogenes and C. perfringens, and also high number of the isolates were found to be resistant to some of the widely used antibiotics. It is concluded that turkey meat must be produced under suitable hygienic and 2

4 technological conditions and antibiotics in animals. attention should be paid for current regulation using the II: Amaç ve Kapsam Bu projede; i) Salmonella spp., Listeria monocytogenes ve Clostridium perfringens in klasik kültür ve/veya immuno manyetik separasyon (IMS) teknikleriyle karşılaştırmalı olarak izolasyonu, ii) izolatların inva (Salmonella), hlya (listeriolysin O) (Listeria monocytogenes), cpa ve cpe (Clostridium perfringens) genlerinin PCR ile saptanması, iii) izolatların antibiyotik dirençliliklerinin belirlenmesi, iv) mevsimsel etkinin saptanması amaçlanmıştır. III: Materyal ve Yöntem 3.1 Materyal Bu çalışmada Ankara daki marketlerde, Haziran Ocak 2006 tarihleri arasında satışa sunulan 3 farklı firmaya ait 60 göğüs, 60 but ve 60 kuşbaşıdan oluşan, toplam 180 hindi eti örneği materyal olarak kullanıldı. Göğüs ve but örnekleri yüzeyden alındı. Mevsimsel etki de dikkate alınarak, örneklerin 90 ı Kasım, Aralık ve Ocak aylarında, 90 ı Haziran, Temmuz ve Ağustos aylarında alındı. Paketlenmiş olarak alınan örnekler, soğuk zincir altında laboratuvara getirildikten hemen sonra Salmonella spp., Listeria monocytogenes ve Clostridium perfringens yönünden kültür tekniği ile, Salmonella spp. ve Listeria monocytogenes için aynı zamanda IMS tekniği ile analiz edildi. 3.2 Yöntem Salmonella spp., Listeria monocytogenes ve Clostridium perfringens in kültür tekniği ile izolasyon ve identifikasyonu Örneklerden Salmonella spp. izolasyonunda ISO 6579 (The International Organization for Standardization) (Anon, 2002), FDA (Food and Drug Administration) (Anon, 2003a) ile Flowers ve ark. (1992) tarafından bildirilen yöntem; Listeria monocytogenes izolasyonunda, USDA (United States Department of Agriculture) ve FSIS (Food Safety and Inspection Service) tarafından önerilen yöntem (Lee ve McClain, 1989); Clostridium perfringens 3

5 izolasyonunda, Labbe (1989), Baumgart ve ark. (1990), Schalch ve ark. (1996) ile Baumgart (1997) tarafından bildirilen yöntem uygulandı Salmonella spp. izolasyonu: Her bir hindi eti örneğinden aseptik koşullarda steril plastik torbalara 25 er gr tartılıp, üzerine 225 er ml tamponlanmış peptonlu su (TPS) ilave edildikten sonra karışım stomacherde (AES, AESAP 1068-Easy Mix) 2-3 dakika homojenize edildi. Elde edilen homojenat ön zenginleştirme amacıyla 37 o C de 24 saat inkübe edildi. Ön zenginleştirme işlemini takiben selektif zenginleştirme amacıyla Rappaport-Vassiliadis Broth (RVB, Oxoid CM 0669), Selenite Cystine Broth (SCB, Oxoid CM 0699) ve Tetrathionate Brotha (TTB- American formulation, Oxoid CM 6671) ekim yapılarak, sırasıyla 42 o C, 37 o C ve 42 o C de 24 saat inkübe edildi. Selektif zenginleştirme sıvı besi yerlerinden Brilliantgreen Phenol-red Lactose Sucrose Agara (BPLS, Merck 7237) ve Xylose-Lysine Deoxycholate Agara (XLD, Oxoid CM 0469) ekim yapılarak plaklar 37 o C de saat inkübe edildi. İnkübasyon sonrası BPLS ve XLD agarda üreyen tipik kolonilerden biyokimyasal testler (TSIA testi, LIA test,,üreaz testi) yapıldı. TSIA testi pozitif, LIA testi pozitif ve üreaz testi negatif olan koloniler Salmonella şüpheli olarak değerlendirildi. Biyokimyasal test sonuçları şüpheli olan örneklerden polivalan Salmonella antiserumu (Denka Seiken AS ) ile yapılan test sonucu aglütinasyon veren koloniler Salmonella olarak değerlendirildi. Elde edilen izolatlar ileri analizler için yatık agarda 4 o C de ve gliserinli buyyonda - 85 o C de muhafaza edildi Listeria monocytogenes izolasyonu: Her bir hindi eti örneğinden 10 ar g steril plastik torbaya konulup üzerine 90 ar ml University of Vermont Medium-Modified Listeria Enrichment Broth (UVM Difco 0223) ilave edilip stomacherde (AES, AESAP 1068-Easy Mix) 2-3 dakika homojenize edildi. Homojenat ön zenginleştirme amacı ile 30 C'de saat inkübasyona bırakıldı. Ön zenginleştirme işleminden sonra asıl zenginleştirme işlemi Fraser Broth da (Oxoid CM 0895) 35 C'de saat inkübe edilerek yapıldı. Asıl zenginleştirme brothundan Modifiye Oxford Agar a (MOX, Oxoid CM 0856) ekim yapılarak, plaklar 35 C' de saat inkübasyona bırakıldı. Koyu kahverenkli, etrafı siyah haleli, 1-2 mm çaplı Listeria şüpheli kolonilerden biyokimyasal testler yapılmak üzere, TSA-YE ye (Tryptic Soy Agar-Yeast Extract; Oxoid CM YE ilave edilmiş) geçildikten sonra plaklar 30 C de saat inkübe edildi. TSA-YE de üreyen kolonilerden sırası ile; Gram boyama, katalaz (% 3 lük H 2 O 2 ile), oksidaz (Bactident oxidase, Merck 3300) ve SIM 4

6 mediumda (Sulphate Indole Motility Medium; Merck 5470) hareketlilik testleri yapıldı. İzole edilen Listeria ların identifikasyonu amacıyla % 7 lik koyun kanlı agarda ß-hemoliz ile L- ramnoz, D-ksiloz, D-mannitol, nitrat redüksiyon ve CAMP testleri yapılarak izolatların identifikasyonu gerçekleştirildi. Elde edilen izolatlar ileri analizler için yatık agar 4 o C de ve gliserinli buyyonda -85 o C de muhafaza edildi Clostridium perfringens izolasyonu: Her bir hindi eti örneğinden aseptik koşullarda steril kavanozlara 10 ar gram tartılıp, 90 ar ml Perfringens Enrichment Medium (PEM, Fluid Thioglycollate Medium: Merck 8191+D-Cyclocerine Merck 8097) ilave edilerek, kavanozların üzeri steril parafin ile kapatılıp, anaerob koşullarda, 46 o C de 20 saat süre ile inkübe edildi. Zenginleştirme sonrası gaz ve bulanıklık oluşan kavanozlardan bir öze dolusu Tryptose Sulfite Cycloserine (TSC Agar, Merck 1972) agara ekim yapılarak plaklar anaerob koşullarda (Oxoid Anaerojar, AG0025A - Gas generating kit, Oxoid BR 0038), 46 C de 20 saat inkübe edildi. TSC agarda anaerob koşullarda üreyen siyah renkli C. perfringens şüpheli kolonilerden biyokimyasal testler yapıldı. Gram boyama, katalaz (% 3 H 2 O 2 ), asit fostafaz, hareketlilik, nitrat, laktoz-jelatin ve reverse-camp (S. agalactia ile) testleri yapılarak identifikasyon gerçekleştirildi IMS tekniği ile Salmonella spp. izolasyonu: İmmunomanyetik separasyon amacıyla Salmonella spp. için Dynabeads anti-salmonella (Dynabeads M-280 anti-salmonella, ) kullanıldı. TPS de, ön zenginleştirmesi yapılan homojenattan 1ml alınarak içlerinde 20 µl anti- Salmonella immunomanyetik mikropartüküller (Dynal) bulunan 1.5 ml lik steril santrifüj tüplerine ilave edildi. Süspansiyon immunomanyetik separasyona tabi tutuldu. Prosedürde belirtildiği şekilde phosphate-buffered saline (PBS, ph 7.5, Oxoid BR 014) ile yıkama işlemi yapıldı (Dynal). PBS ile son yıkamadan sonra beadler % 0.1 Tween 20 (Merck ) içeren 100 µl steril PBS içerisinde yeniden süspanse edildi. Konsantre edilen bu sıvıdan BPLS ve XLD Agara ekimler yapılarak bu plaklarda üreyen tipik kolonilerden gerekli testler klasik kültür yönteminde belirtildiği şekilde uygulandı. 5

7 3.2.6 IMS tekniği ile L. monocytogenes izolasyonu: İmmunomanyetik separasyon amacıyla Listeria spp. için Dynabeads anti-listeria (Dynabeads anti-listeria, ) kullanıldı. Half Fraser Brothda ön zenginleştirmesi yapılan homojenattan 1ml alınarak içlerinde 20 µl anti-listeria immunomanyetik mikropartiküller (Dynal) bulunan 1.5 ml lik steril santrifüj tüplerine ilave edildi. Süspansiyon immunomanyetik separasyona tabi tutuldu. Prosedürde belirtildiği şekilde phosphate-buffered saline (PBS, ph 7.5, Oxoid BR 014) ile yıkama işlemi yapıldı (Dynal). PBS ile son yıkamadan sonra beadler % 0.1 Tween 20 (Merck ) içeren 100 µl steril PBS içerisinde yeniden süspanse edildi. Konsantre edilen bu sıvıdan MOX Agara ekimler yapılarak bu plaklarda üreyen tipik kolonilerden gerekli testler klasik kültür yönteminde belirtildiği şekilde uygulandı PCR Tekniği Salmonella spp. için PCR Tekniği Salmonella spp. için PCR koşullarının optimizasyonunu takiben Widjojoatmodjo ve ark., (1991), Fluit ve ark., (1993) ve Erol ve ark., (1999) tarafından önerilen protokol gereği oric gen sekansını oluşturan primer çiftleri (5 -TTA TTA GGA TCG CGC CAG GC-3 5 -AAA GAA TAA CCG TTG TTC AC-3 ) kullanılarak PCR işlemi yapıldı. DNA ekstraksiyonu için yatık TSA da 4 o C de muhafaza edilen izolatlar BHI broth içerisinde 24 saat zenginleştirildi. Kültürden 1 ml ependorf tüpüne alınarak soğutmalı santrifüjde (Eppendorf Centrifuge 5417R) 10 o C de 5000 rcf de 15 dk. santrifüj edildi. Üstte kalan kısım atılarak tortuya 1 ml steril bidistile su konularak vortekslendi. 10 o C de 5000 rcf de 5 dk santrifüj edildikten sonra üstteki sıvı kısım alınarak 200 µl steril bidistile su ile homojenize edildi. 95 o C lik su banyosuna (Memmert WB/OB 7-45, WBU45) konularak 20 dk bekletildi ve işlemin sonunda hemen buz üzerine alındı. Hazırlanan bu DNA ekstraktından 10 µl alınarak 40 µl PCR karışımına [1xReaksiyon buffer (M890A, Promega, flexi buffer), 100 µm dntp mix (U1515, Promega), 2 U Taq DNA Polimeraz (M8305, Promega, 500U), her birinden 0.5 µm primer ve 1.5 mm MgCl 2 (A351H, Promega, 25 mm)] ilave edildi ve toplam 50 µl lik karşımın üzeri mineral yağ ile kapatıldı. Thermocycler da (Biometra, Personal cycler) 94 o C de 1 dakika denatürasyon, 53 o C de 1 dakika bağlanma, 72 o C de 1 dakika uzatma aşamalarını kapsayan 35 siklus ve sonunda 72 o C de 10 dakika bekletilerek amplifikasyon yapıldı. Amplifikasyon ürünleri bir sonraki aşamaya kadar 4 o C de tutuldu. Elde edilen PCR ürünlerinden 10 µl alınarak, 2 µl phicol brom 6

8 phenol blue ile boyanarak, 1 µl/ml ethidium bromide (% 0.1) ile boyanan % 1.5 lik agaroz jelde, 100 Volt elektrik akımında 1 saat yürütülerek elektroforez (Biometra) işlemi yapıldı. Agaroz jel transiluminatöre (Biometra TI1 UV) transfer edilerek, oluşan spesifik bandlar DNA marker ve pozitif kontrol (ATCC 14028) yardımıyla UV ışığı altında değerlendirildi. OriC genine özgü 163 bp ağırlığındaki DNA bandları pozitif olarak kabul edildi ve jellerin dokümantasyonu (Syngene GeneGenius imaging system) yapıldı Listeria monocytogenes için PCR Tekniği L. monocytogenes izolatlarının PCR ile analizinde, Bohnert ve ark. (1992) tarafından önerilen hlya gen sekansını oluşturan (5 - GAA TGT AAA CTT CGG CGC AAT CAG-3 ; 5 -GCC GTC GAT GAT TTG AAC TTC ATC-3 ) primer çifti kullanıldı. DNA ekstraksiyonu için -85 C de cryovialde veya 4 C de yatık agarda saklanan izolatlar BHI brotha geçilerek 30 C de 24 saat inkübe edildi. İnkübasyon sonrası türbidite oluşmuş BHI brothdan 1 ml hücre süspansiyonu, 1.5 ml lik santrifüj tüplerine alınarak 5000 g de (Eppendorf Centrifuge 5417R) 15 dakika santrifüj edillip, santrifüjün ardından süpernatant atılarak 1 ml steril distile su ile dipte kalan pelet vortekslenerek resüspanse edildi. Tüpler 10 C de 5000 g de 5 dakika santrifüj edildikten sonra süpernatant atılıp ve pelet 100 µl steril distile su ile vortekslenerek resüspanse edildi. Elde edilen hücre süspansiyonu 95 C de su banyosunda (Memmert WB/OB 7-45, WBU 45) 20 dakika süreyle bekletildi. PCR amplifikasyonu için, toplam 50 µl hacimde, bileşiminde 1 x PCR buffer (M890A, Promega, flexi buffer), 1.5 mmol 1-1 MgCl 2 (A351H, Promega, 25 mm), her birinden 100 µmol 1-1 olacak şekilde dntp mix (U1515, Promega), her bir primerden 1 µmol 1-1, 2 U Taq DNA polymerase (M8305, Promega,500U), ve 10 µl örnek DNA içeren master mix kullanıldı (Aznar ve Alarcon, 2003). Amplifikasyon işlemi, thermal cycler da (Biometra Personel Cycler) 94 C de 5 dk ilk denatürasyon işleminin ardından, 94 C de 1 dk denatürasyon, 65 C de 1 dk bağlanma ve 70 C de 2 dk DNA uzatma aşamaları 30 siklus olarak yapıldı (Aznar ve Alarcon, 2003). Elde edilen PCR ürünlerinden 10 µl alınarak, 2 µl phicol brom phenol blue ile boyanarak, 1 µl/ml ethidium bromide (% 0.1) ile boyanan % 1.5 lik agaroz jelde, 100 Volt elektrik akımında 1 saat yürütülerek elektroforez (Biometra) işlemi yapıldı. Agaroz jel transiluminatöre (Biometra TI1 UV) transfer edilerek, oluşan spesifik bandlar DNA marker ve pozitif kontrol (ATCC 7644) yardımıyla UV ışığı altında değerlendirildi. HlyA genine özgü 388 bp ağırlığındaki DNA bandları pozitif olarak kabul edildi (Aznar ve Alarcon, 2003) ve jellerin dokümantasyonu (Syngene GeneGenius imaging system) yapıldı. 7

9 Clostridium perfringens için PCR Tekniği Kültür tekniği ile izolasyon ve identifikasyonu yapılan Clostridium perfringens izolatlarının PCR ile analizi, Meer ve Songer (1997) tarafından önerilen cpa gen sekansını oluşturan (5 - GCT AAT GTT ACT GCC GTT GA-3, 5 -CCT CTG ATA CAT CGT GTA AG-3 ) primer çifti ve Lin ve Labbe (2003) tarafından önerilen cpe gen sekansını oluşturan primer çifti (5 - GGA GAT GGT TGG ATA TTA GG-3, 5 -GGA CCA GCA GTT GTA GAT A-3 ) kullanılarak yapıldı. DNA ekstraksiyonu için izolatlar, Fluid Thioglycollate Medium da 37 o C de saat inkübe edilerek zenginleştirildi. Kültürden 1 ml alınarak 5000 devirde 15 dakika santrifüj (Eppendorf Centrifuge 5417R) edildi. Dipte kalan tortu iki kez steril bidistile su ile yıkanıp 200 µl steril bidistile su ile süspanse edildikten sonra 94 o C deki su banyosunda (Memmert WB/OB 7-45, WBU 45) 20 dakika bekletildi. Tüpün tekrar santrifüj edilmesinin ardından 10 µl luk süpernatant, hedef DNA olarak kullanıldı. PCR amplifikasyonu için, toplam 50 µl hacimde, bileşiminde 1 x PCR buffer (M890A, Promega, flexi buffer), 1.5 mmol 1-1 MgCl 2 (A351H, Promega, 25 mm), her birinden 0.2 mm olacak şekilde dntp mix (U1515, Promega), her bir primerden 1 µmol 1-1, 2,5 U Taq DNA polymerase (M8305, Promega,500U), ve 10 µl örnek DNA içeren master mix kullanıldı. Daha sonra tüpler amplifiye edilmek amacıyla Thermal Cycler a (Biometra Personal Cycler) yerleştirildi. Thermal Cycler da 94 o C de 1 dakika, 55 o C de 2 dakika, 72 o C de 3 dakika 30 siklus, 72 o C de 4 dakika daha tutulduktan sonra 4 o C de muhafaza edildi. Elde edilen PCR ürünlerinden 10 µl alınarak, 2 µl phicol brom phenol blue ile boyanarak, 1 µl/ml ethidium bromide (% 0.1) ile boyanan % 1.5 lik agaroz jelde, 100 Volt elektrik akımında 1 saat yürütülerek elektroforez (Biometra) işlemi yapıldı. Agaroz jel transiluminatöre (Biometra TI1 UV) transfer edilerek oluşan spesifik bandlar DNA marker yardımıyla UV ışığı altında değerlendirildi; cpa (324 bp) ve cpe (233 bp) genlerine özgü DNA bandları pozitif olarak kabul edildi, ve jellerin dokümantasyonu (Syngene GeneGenius imaging system) yapıldı İzolatların Antibiyotik Dirençliliğin Saptanması İzolatların antimikrobiyal duyarlılık profilleri disk difüzyon yöntemi (NCCLS- National Committee for Clinical Laboratory Standards) ile belirlendi (Anon, 2003b, Anon 2003 c). Bu amaçla Mueller-Hinton agar (Oxoid, CM0337) kullanıldı. Bu üç patojen bakteri için kullanılan antibiyotik diskleri çizelge 1 de gösterildi. 8

10 Çizelge 1. Salmonella spp., L. monocytogenes ve C. perfringens izolatlarında kullanılan antibiyotik diskleri Kullanılan Antibiyotik Diski Salmonella spp. L. monocytogenes Amoksisilin (10µg, Oxoid CT0161B) Ampisilin (10µg, Oxoid CT0003B) Eritromisin (15µg, Oxoid CT0066B) Gentamisin (10µg, Oxoid CT0024B) Kanamisin (30µg, Oxoid CT0026B) Kloramfenikol (30µg, Oxoid CT0013B) Nalidiksik Asit (30µg, Oxoid CT0031B) Penisilin G (10 U, Oxoid CT0043B) Siprofloksasin (5µg, Oxoid CT0425B) Streptomisin (10µg, Oxoid CT0047B) Tetrasiklin (30µg, Oxoid CT0054B) Trimetoprim (5µg, Oxoid CT0076B) Trimetoprim/Sulfametaksazol (25µg, Oxoid CT0052B) Vankomisin (30µg, Oxoid CT0058B) *: Kullanılan antibiyotik disklerini bildirmektedir. C.perfringens * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * Tryptic Soy Agardan (TSA; Oxoid CM 0131) alınan koloniler, içerisinde Tryptic Soy Broth (TSB, Oxoid CM 0129) bulunan tüplere transfer edilerek, brotlar 37ºC de, turbiditesi 0.5 McFarland standardına gelinceye kadar (yaklaşık 6-8 saat) inkübe edildi. İnkübasyondan sonra, hazırlanan steril svab ile Mueller-Hinton Agara (Oxoid CM 0337) yayma yöntemi ile ekim yapıldı. Ekimi takiben petriler 15 dk. kurumaya bırakıldıktan sonra, aralarında 30 mm olacak şekilde antibiyotik diskleri yerleştirildi. Petriler 35 o C de, saat inkübasyona bırakıldı. İnkübasyondan sonra disklerin etrafındaki inhibisyon zonlarının çapı ölçüldü. Ölçülen zonlar NCCLS de belirtilen zon çapları esas alınarak duyarlı, orta dirençli ve dirençli olarak sınıflandırılıp, dokümantasyonları yapıldı. * 9

11 IV: Analiz ve Bulgular Bu çalışmada, Haziran Ocak 2006 tarihleri arasında Ankara da tüketime sunulan değişik firmalara ait 60 göğüs, 60 but ve 60 kuşbaşıdan oluşan, toplam 180 hindi eti örneğinde Salmonella spp., ve L. monocytogenes ve C. perfringens in varlığı belirlendi. Örneklerden klasik kültür yöntemi ve IMS ile toplamda 55 inin (% 30.5) Salmonella spp. ile kontamine olduğu saptandı. Ayrıca klasik kültür tekniği ile örneklerin 55 inde (% 30.5), IMS tekniğiyle ise 14 ünde (% 7.7) Salmonella spp. izole ve identifiye edildi (Çizelge 2). Örneklerden her iki yöntemle 24 ünün (% 13.3) L. monocytogenes ile kontamine olduğu saptandı. Ayrıca klasik kültür tekniği ile 16 sında (% 8.8), IMS tekniğiyle ise 23 ünde (% 12.7) L. monocytogenes izole ve identifiye edildi (Çizelge 3). Örneklerin 22 sinin (% 12.2) C. perfringens ile kontamine olduğu saptandı. Çizelge 2. Hindi etlerinden klasik kültür ve IMS teknikleriyle saptanan Salmonella spp. pozitif örneklerin dağılımı. Klasik kültür IMS Aynı örnekte klasik pozitif örnek sayısı pozitif örnek sayısı kültür/ims pozitif örnek sayısı x/n 55/180 14/180 55/180 % x/n (x:pozitif bulunan örnek sayısı; n: analiz edilen örnek sayısı) Çizelge 3. Hindi etlerinden klasik kültür ve IMS teknikleriyle saptanan L. monocytogenes pozitif örneklerin dağılımı. Klasik kültür IMS Aynı örnekte klasik pozitif örnek sayısı pozitif örnek sayısı kültür/ims pozitif örnek sayısı x/n 16/180 23/180 24/180 % x/n (x:pozitif bulunan örnek sayısı; n: analiz edilen örnek sayısı) IMS ile klasik kültür yöntemlerinin izolasyon ve identifikasyonda başarı oranı yönünden sonuçlar değerlendirildiğinde, IMS tekniğinin hindi etlerinden L. monocytogenes tespitinde klasik kültür tekniğine kıyasla daha duyarlı bir teknik olduğu saptandı. Hindi etlerinde Salmonella spp. için ise durumun tam tersi olduğu, klasik kültür tekniğinin IMS tekniğine göre daha duyarlı olduğu saptandı. 10

12 Çalışmada, sıcak aylarda (Haziran, Temmuz, Ağustos) incelenen 90 hindi but, göğüs ve kuşbaşı örneğinin 20 sinden (% 22.2), soğuk aylarda (Kasım, Aralık, Ocak) incelenen örneklerin ise 35 inden (% 38.8) Salmonella spp. izole edildi. Soğuk aylarda alınan örneklerin klasik kültür tekniği ile 35 inin (% 38.8), IMS tekniği ile ise 14 ünün (% 15.5) Salmonella ile kontamine olduğu, sıcak aylarda ise örneklerden klasik kültür tekniği ile 20 sinin (% 22.2) Salmonella ile kontamine olduğu saptandı (Çizelge 4). Bu durum çelişkili görünmekle birlikte Guerin ve ark. (2005) nın tavuk, sığır ve domuzlardaki prevalansı inceledikleri çalışmada bizim bulgularımızla benzer şekilde kış aylarında daha fazla izolat elde ettikleri görüldü. Araştırıcılar soğuk aylarda artış olmasının nedenleri arasında kış aylarında kümeslerde relatif rutubetin fazla olması ve havalandırmanın yetersiz yapılması, Salmonella ların nem ve sıcaklığın uygun olmadığı koşullarda muhafaza edilen kontamine yemlerde çoğalabilmesi, uygun olmayan koşullarda bir sonraki sürüye ve takiben diğer sürülere yayılabilmesini, kışın binaların daha fazla rodentlere maruz kalması, birbirini takip eden sürüler arasında kümeslerin yeterince temizlik ve dezenfeksiyonunun yapılamamasını göstermişlerdir. Mevsimsel farklılığın beklenildiği şekilde sıcak aylara ilişkin örneklerde yüksek çıkmamasının nedenleri arasında kesilen hayvanların Salmonella spp. yi taşıma düzeyi ile mezbahalardaki çapraz kontaminasyonun etkili olduğu düşünülmektedir. Wedderkopp ve ark. (2001) broyler kümeslerinde yaptıkları çalışmada, Jordan ve ark. (2006) ise çiğ et türleri ve pişmiş et örnekleri üzerinde yaptıkları çalışmada mevsimsel bir farkın gözlemlenmediğini bildirmişlerdir. Çalışmada sıcak aylarda (Haziran, Temmuz, Ağustos) incelenen örneklerin 10 undan (% 11.1), soğuk aylarda (Kasım, Aralık, Ocak) incelenen örneklerin ise 14 ünden (% 15.5) L. monocytogenes izole edildi. Soğuk aylarda klasik kültür tekniği ile örneklerin 10 unun (% 11.1), IMS tekniği ile ise 13 ünün (% 14.4) L. monocytogenes ile kontamine olduğu saptandı. Sıcak aylarda ise klasik kültür tekniği ile 6 sının (% 6.6), IMS tekniği ile 10 unun (% 11.1) L. monocytogenes ile kontamine olduğu saptandı. Bu sonuçlara göre hindi etlerinin L. monocytogenes ile kontaminasyonunda mevsimsel bir etkinin olmadığı saptandı (Çizelge 5). C. perfringens yönünden yapılan değerlendirmede sıcak aylarda (Haziran, Temmuz, Ağustos) incelenen örneklerin 15 inden (% 16.6), soğuk aylarda (Kasım, Aralık, Ocak) incelenen örneklerin 7 sinden (% 7.7) etken izole edildi. Dolayısıyla hindi etlerinin C. perfringens ile kontaminasyonunda mevsimsel etkinin önemli olduğu, sıcak aylarda kontaminasyon oranının arttığı saptandı (Çizelge 6). 11

13 Çizelge 4. Hindi but, göğüs ve kuşbaşı etlerinden izole edilen Salmonella spp. lerin mevsimsel dağılımı Örneklerin alındığı aylar Örnek sayısı Pozitif örnek sayısı (%) Sıcak aylar (22.2) (Haziran,Temmuz,Ağustos) Soğuk aylar (38.8) (Kasım,Aralık,Ocak) Toplam (30.5) Çizelge 5. Hindi but, göğüs ve kuşbaşı etlerinden izole edilen L. monocytogenes in mevsimsel dağılımı Örneklerin alındığı aylar Örnek sayısı Pozitif örnek sayısı (%) Sıcak aylar (11.1) (Haziran, Temmuz, Ağustos) Soğuk aylar (15.5) (Kasım,Aralık,Ocak) Toplam (13.3) Çizelge 6. Hindi but, göğüs ve kuşbaşı etlerinden izole edilen C. perfringens in mevsimsel dağılımı Örneklerin alındığı aylar Örnek sayısı Pozitif örnek sayısı (%) Sıcak aylar (16.6) (Haziran, Temmuz,Ağustos) Soğuk aylar 90 7 (7.7) (Kasım,Aralık,Ocak) Toplam (12.2) PCR Analizi Sonuçları: Çalışmada klasik kültür ve IMS teknikleri ile Salmonella spp. olarak belirlenen suşların, oric gen sekansını oluşturan primer çiftleri kullanılarak PCR tekniği ile doğrulaması yapıldı. Bu amaçla incelenen 55 suşun 55 ininde (% 100) Salmonella spp. olduğu belirlendi (Resim 1). 12

14 163 bp Resim 1. PCR ile oric geni tespit edilmiş Salmonella spp. izolatlarının elektroforez görüntüsü (1 ve 8: 100 bp DNA marker. 2: Pozitif kontrol ( Salmonella Typhimurium ATCC 14028) 3: Negatif kontrol. 4-7: oric pozitif Salmonella spp. izolatları) Klasik kültür tekniği ve IMS tekniği ile izole edilen L. monocytogenes lerin doğrulanması amacıyla hlya gen sekansı kullanılarak yapılan PCR analizinde incelenen 24 suşun 23 ünün (% 95.8) L. monocytogenes olduğu belirlendi (Resim 2). 388 bp Resim 2. PCR ile hlya geni tespit edilmiş L. monocytogenes izolatlarının elektroforez görüntüsü (1 ve 8: 100 bp DNA marker. 2: Pozitif kontrol ( L. monocytogenes ATCC 7644) 3: Negatif kontrol 4-7: HlyA pozitif L. monocytogenes izolatları) Çalışmada klasik kültür tekniği ile C. perfringens olarak belirlenen suşların, cpa gen sekansını oluşturan primer çiftleri kullanılarak PCR tekniği ile doğrulaması yapıldı. Bu amaçla incelenen 22 suşun 22 ininde (% 100) C. perfringens olduğu belirlendi. Ayrıca, analiz bulguları sonucunda C. perfringens olarak idendifiye edilen izolatların hiç birisinin cpe geni taşımadığı yapılan PCR analizi sonucu saptandı (Resim 3). 13

15 324 bp Resim 3. PCR ile cpa geni tespit edilmiş C. perfringens izolatlarının elektroforez görüntüsü (1 ve 8: 100 bp DNA marker. 2: Pozitif kontrol (C. perfringens ATCC 13124) 3: Negatif kontrol 4-7: Cpa pozitif C. perfringens izolatları) Antibiyotik Dirençlilik Testi Sonuçları: Salmonella spp. izolatlarında antibiyotik dirençlilik testi sonucunda, izolatlardan 13 ü (% 23.6) yalnızca bir antibiyotiğe dirençli bulunurken, 5 i (% 9.0) iki antibiyotiğe, 17 si (% 30.9) üç antibiyotiğe ve 6 sı (% 10.9) dört antibiyotiğe direnç oluşturmuştur. Bu çalışma bulgularına göre 41 (% 74.5) izolat en az bir antibiyotiğe dirençli bulunurken, 28 (% 50.9) izolatın en az iki antibiyotiğe, 23 (% 41.8) izolatın ise en az 3 antibiyotiğe karşı dirençli olduğu saptanmıştır. İzolatlar arasında en fazla dirençlilik %50.9 ile tetrasikline karşı bulunurken bu antibiyotiği % 41.8 ile nalidiksik asit, % 40.0 ile streptomisin ve ampisilin, % 5.45 ile gentamisin izlemiştir. Çalışmada bazı izolatlarda çoklu dirençliliğinde geliştiği gözlenmiştir. Bu kapsamda 6 1 (% 10.9) izolat tetrasiklin, nalidiksik asit, streptomisin ve ampisiline direnç oluştururken, 15 (% 27.2) izolat tetrasiklin, nalidiksik asit ve ampisiline, 2 (% 3.6) izolat tetrasiklin, nalidiksik asit ve streptomisine, 3 (% 5.4) izolat gentamisin ve streptomisine, 2 (% 3.6) izolat ise tetrasiklin ve streptomisine dirençli olarak saptanmıştır. Trimetoprim ve trimetoprim/sulfametaksazole karşı % 100 lük bir duyarlılık saptanırken, kloramfenikol ve siprofloksasine karşı duyarlılık sırasıyla % 92.7 ve % 91.1 olarak belirlenmiştir. Ayrıca incelenen 55 izolatın 48 inin (% 87.2) kanamisine karşı orta düzeyde dirençli olduğu bulunmuştur (Çizelge 7). 14

16 Çizelge 7. Salmonella spp. izolatlarının antibiyotik duyarlılık testi sonuçları Antibiyotikler Duyarlı Orta Dirençli Dirençli n (%) n (%) n (%) Tetrasiklin 24 (43.6) 3 (5.4) 28 (50.9) Nalidiksik Asit 31 (56.3) 1 (1.8) 23 (41.8) Streptomisin 2 (3.6) 31 (56.3) 22 (40.0) Ampisilin 31 (56.3) 2 (3.6) 22 (40.0) Gentamisin 34 (61.8) 18 (32.7) 3 (5.4) Kanamisin 7 (12.7) 48 (87.2) - Siprofloksasin 51 (92.7) 4 (7.2) - Kloramfenikol 54 (98.1) 1 (1.8) - Trimetoprim 55 (100) - - Trimetoprim/Sulfametaksazol 55 (100) - - L. monocytogenes izolatlarından 20 si (% 86.9) en az bir antibiyotiğe direnç gösterirken, 16 (% 69.5) izolatın ise çoklu direnç (ampisilin + penisilin ) gösterdiği tespit edilmiştir. Çalışmada izolatların 19 unun (% 82.6) penisiline, 17 inin (% 75) ampisiline direnç gösterdiği görülmüştür. İzolatlardan 8 inde (% 34.7) eritromisine 8 inde (% 34.7) de streptomisine orta düzeyde direnç saptanmıştır. İzolatların tamamının kloramfenikol, gentamisin, tetrasiklin ve vankomisine duyarlı oldukları tespit edilmiştir (Çizelge 8). Çizelge 8. L. monocytogenes izolatlarının antibiyotik duyarlılık testi sonuçları Antibiyotik Duyarlı Orta Dirençli Dirençli n (%) n (%) n (%) Ampisilin 6 (26.0) - 17 (73.9) Kloramfenikol 23 (100) - - Eritromisin 15 (65.2) 8 (34.7) - Gentamisin 23 (100) - - Penisilin 4 (17.3) - 19 (82.6) Streptomisin 15 (65.2) 8 (34.7) - Tetrasiklin 23 (100) - - Vankomisin 23 (100)

17 C. perfringens izolatlarında yapılan testler neticesinde 22 izolatın, 1 i (%) yalnızca bir antibiyotiğe dirençli bulunurken, 17 si (%) iki antibiyotiğe, 4 ü (% 14.1) üç antibiyotiğe direnç oluşturmuştur. İzolatların tamamı (% 100) en az bir antibiyotiğe dirençli bulunmuştur. İzolatlar arasında en fazla dirençlilik % 100 ile trimetoprime karşı bulunurken, bu antibiyotiği % 86.3 ile gentamisin, % 13.6 ile tetrasiklin ve siprofloksasin izlemiştir. Çoklu antibiyotik direnci profiline bakıldığında 17 izolatın 2 antibiyotiğe, 4 izolatın 3 antibiyotiğe karşı dirençli olduğu saptanmıştır. İzolatların tamamı nalidiksik asit, ampisilin, penisilin, kloramfenikol ve amoksasiline karşı duyarlılık gösterirken, siprofloksasine karşı 86.3 lük, tetrasikline karşı 77.2 lik, gentamisine karşı % 13.6 lık bir duyarlılık saptanmıştır (Çizelge 9). Çizelge 9. C. perfringens izolatlarının antibiyotik duyarlılık testi sonuçları Antibiyotik Duyarlı Orta Dirençli Dirençli n (%) n (%) n (%) Ampisilin 22 (100) - - Kloramfenikol 22 (100) - - Trimetoprim (100) Tetrasiklin 17 (77.2) 2 (9.0) 3 (13.6) Nalidiksik Asit 22 (100) - - Siprofloksasin 19 (86.3) - 3 (13.6) Gentamisin 3 (13.6) - 19 (86.3) Penisilin 22 (100) - - Amoksasilin 22 (100) - - V: Sonuç ve Öneriler Sonuç olarak, bu çalışmada Ankara da tüketime sunulan değişik firmalara ait toplam 180 hindi eti örneğinden 55 inin (% 30.5) Salmonella spp. ile, 24 ünün (% 13.3) L. monocytogenes ile 22 sinin (% 12.2) C. perfringens ile kontamine olduğu saptandı. Bu veriler ışığında uygun olmayan üretim ve muhafaza koşullarına bağlı olarak hindi parça etlerinin sağlık açısından risk oluşturabileceği sonucuna varıldı. Bu nedenle, hindi kesim ve işleme prosesinde gerekli hijyenik ve teknik koşulların sağlanması halk sağlığı açısından önem taşımaktadır. Diğer taraftan çalışmada izole edilen Salmonella spp, L. monocytogenes ve C. perfringens izolatlarının birçok antibiyotiğe karşı dirençli bulunması da halk sağlığı yönünden potansiyel bir sorun olarak değerlendirilebilir. Özelikle entansif hayvan yetiştiriciliğinde ve 16

18 hastalıkların tedavisinde bilinçsiz ve aşırı antibiyotik kullanımı engellenmeli, antibiyotiklerin gıda üretiminde kullanılan hayvanlarda profilaktik ve gelişmeyi arttırıcı amaçlı olarak kullanımına ilişkin AB direktifleri ile uyumlu olan regülasyonların titizlikle uygulanmasına özen gösterilmelidir. VI: Kaynaklar ANON (2002). Microbiology of foods and animal feeding staff-horizontal method for the detection of Salmonella spp. International Standart (ISO, 6579). ANON (2003a). Salmonella. Bacteriological Analytical Manual. Chapter 5. Food and Drug Administration. (FDA). ANON (2003b). NCCLS (National Committee for Clinical Laboratory Standards). Performance Standards for Antimicrobial Disk Susceptibility Tests. Approved Standart M2-A8. Pennsylvania, USA. ANON (2003c)., NCCLS (National Committee for Clinical Laboratory Standards). Methods for Antimicrobial Susceptibility Testing of Anaerobic Bacteria; Volume 24 Number 2 ISSN Approved Standard Sixth Edition. M11-A6, Pennsylvania, USA. AZNAR, R., ALARCO N, B. (2003). PCR detection of Listeria monocytogenes: a study of a multiple factors affecting sensitivity. J. Appl. Microbiol. 95: BAUMGART, J., BAUM, O., LIPPERT, S. (1990). Schneller und direkter Nachweis von Clostridium perfringens. Fleischwirtsch., 70 (9): BAUMGART, J. (1997). Mikrobiologische Untersuchung von Lebensmitteln. Behr s Verlag. Hamburg BOHNERT, M., DILASSER, F., DALET, C., MENGAUD, J., COSSART, P. (1992). Use of specific oligonucleotides for direct enumeration of Listeria monocytogenes in food samples by colony hybridization and rapid detection by PCR. Res. Microbiol. 143: EROL, İ., HILDEBRANDT, G., KLEER, J., YURTYERİ, A. (1999). Kopplung von Immunomagnetischer separation und Polymerase-kettenreaktion zum Schnellachweis von Salmonellen in Hackfleisch und Geflügelinnereien. Berl. Münch. Tieraerztl.Wschr., 112: FLOWERS, R.S., D AOUST, J.Y., ANDREWS, W.H., BAILEY, J.S. (1992). Salmonella. In: Compendium of the Methods for the Microbiological Examinations of Food. Vanderzant, C., Splittoesser, D.F. (eds.). American Public Health Assoc. 3 rd.ed FLUIT, A.C., WIDJOJOATMODJO, M.N., BOX, A.T.A., TORENSMA, R., VERHOEF, J. (1993). Rapid detection of Salmonella in poultry with the magnetic Immuno-Polymerase Chain Reaction assay. Appl. Environ. Microbiol., 59(5): GUERIN, M.T., MARTIN, S.W., DARLINGTON, G.A., RAJIC, A. (2005). A temporal study of Salmonella serovars in animal in Alberta between 1990 and Can. J. Vet. Res., 69: JORDAN, E., EGAN, J., DULLEA, C., WARD, J., MCGILLICUDDY, K., MURRAY, G., MURPHY, A., BRADSHAW, B., LEONARD, N., RAFTER, P., MCDOWELL, S. (2006). Salmonella surveillance in raw and cooked meat and meat products in the Republic of Ireland from 2002 to Int.J. Food Microbiol., 112: LABBE, R.G. (1989). Clostridium perfringens. In: Foodborne Bacterial Pathogens, M.P. DOYLE (Ed.). Marcel Decker Inc., New York and Basel,

19 LEE, W.H., MCCLAIN, D., (1989). Laboratory communication No.57, U.S.D.A., F.S.I.S Microbiology Division, Bethesda. LIN, Y., LABBE, R. (2003). Enterotoxigenicty and genetic relatedness of Clostridium perfringens isolates from retail foods in the United States. Appl. Environ. Microbiol., 69 (3): MEER, R.R., SONGER, J.G. (1997). Multiplex polymerase chain reaction assay for genotyping Clostridium perfringens. Am. J. Vet. Res. 58: SCHALCH, B., EISGRUBER, H., GEPPERT, P., STOLLE, A. (1996). Vergleich von vier Routineverfahren zur Bestaetigung von Clostridium perfringens aus Lebensmitteln. Arch. Lebensmittelhyg., 47: WEDDERKOPP, A., GRADEL, K.O., JORGENSEN, J.C., MADSEN, M. (2001). Pre-harvest surveillance of Campylobacter and Salmonella in Danish broiler flocks: a 2 year study. Int. J. Food Microbiol. 68(1-2): WIDJOJOADMODJO, M.N., FLUIT, A.C., TORENSMA, R., KELLER, B.H., VERHOEF, J. (1991). Evaluation of the magnetic immuno-pcr assay for rapid detection of Salmonella. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis., 10(11): VII: Ekler a. Mali bilanço ve açıklamaları Sarf malzemeler ve cihazlar satın alınmış, kullanılmış ve sonuçları yukarıda verilmiştir. b. Makine ve teçhizatın konumu ve ilerideki kullanımına dair açıklamalar (BAP demirbaş numaraları dahil) c. Teknik ve bilimsel ayrıntılar (varsa kesim III de yer almayan analiz ayrıntıları) Başka teknik ayrıntı yoktur. d. Sunumlar(bildiriler, teknik raporlar) Bu çalışmaya ait verilerin bir kısmı aşağıda belirtilen kongrede sunulmuştur. EROL, İ., BİLİR ORMANCI, F.S., AYAZ, N.D., İŞERİ, Ö., SARIGÜZEL, D. (2006). Hindi etlerinden izole edilen Salmonella spp., Listeria monocytogenes ve Clostridium perfringens izolatlarının antibiyotik dirençliliklerinin belirlenmesi. II. Ulusal Veteriner Gıda Hijyeni Kongresi, Eylül İstanbul, s e. Yayınlar (hakemli bilimsel dergiler) ve Tezler Detection of Listeria monocytogenes in turkey meat by immunomagnetic separation and PCR determination of the antibiotic resistance (Yayına hazırlanmaktadır). Molecular typing of Clostridium perfringens isolated from turkey meat by multiplex PCR (Yayına hazırlanmaktadır). 18

SALMONELLA ARANMASI. a. GENEL ÖZELLİKLERİ

SALMONELLA ARANMASI. a. GENEL ÖZELLİKLERİ SALMONELLA ARANMASI a. GENEL ÖZELLİKLERİ Enterobacteriaceae familyasına ait, Gram negatif, spor oluşturmayan, fakültatif anaerob, çubuk formunda olup, çoğu (S.pullorum, S.gallinarum ve S.arizonea türleri

Detaylı

M. Kerem ÇALGIN 1, Fikret ŞAHİN 1, Melike ATASEVER 2, Deniz KÖKSAL 2, Djursun KARASARTOVA 1, Mehmet KIYAN 1. AÜTF Tıbbi Mikrobiyoloji ABD 2

M. Kerem ÇALGIN 1, Fikret ŞAHİN 1, Melike ATASEVER 2, Deniz KÖKSAL 2, Djursun KARASARTOVA 1, Mehmet KIYAN 1. AÜTF Tıbbi Mikrobiyoloji ABD 2 Mycobacterium tuberculosis Suşlarında Eflüks Pompa Yapısına Katılan Gen Ekspresyonlarının Çoklu İlaç Direnci Gelişimi Üzerine Olan Etkisinin Araştırılması M. Kerem ÇALGIN 1, Fikret ŞAHİN 1, Melike ATASEVER

Detaylı

Anaerop Haber Haziran 2015 sayısının konu başlığı : Yurt içi / yurt dışı anaerop yayınlar

Anaerop Haber Haziran 2015 sayısının konu başlığı : Yurt içi / yurt dışı anaerop yayınlar Haziran 2015 İletişim adresleri : "Güven Külekçi" gkulekci@istanbul.edu.tr, "Turk Mikrobiyoloji Cemiyeti" tmc@tmc-online.org Anaerop Haber Haziran 2015 sayısının konu başlığı : Yurt içi / yurt dışı anaerop

Detaylı

T.C. Sağlık Bakanlığı Türkiye Halk Sağlığı Kurumu

T.C. Sağlık Bakanlığı Türkiye Halk Sağlığı Kurumu 1 DIġKI ÖRNEKLERĠNDE SHIGA TOKSĠN OLUġTURAN E. COLI LERĠN SEROTĠP, VĠRÜLANS GENLERĠ VE ANTĠBĠYOTĠKLERE DĠRENÇLERĠNĠN DEĞERLENDĠRĠLMESĠ Dr. Revasiye GÜLEŞEN Mikrobiyoloji Referans Laboratuvarları Daire

Detaylı

Numuneden 10 gr tartılır, 90 ml BPW üzerine eklenerek stomacher de (stomacher yoksa elde) homojen hale getirilir. Bu, 1/10 luk ilk dilusyondur.

Numuneden 10 gr tartılır, 90 ml BPW üzerine eklenerek stomacher de (stomacher yoksa elde) homojen hale getirilir. Bu, 1/10 luk ilk dilusyondur. Besiyerlerinin genel özellikleri ile ilgili bilgi ve resimler aşağıdadır. Numuneden 10 gr tartılır, 90 ml BPW üzerine eklenerek stomacher de (stomacher yoksa elde) homojen hale getirilir. Bu, 1/10 luk

Detaylı

GRAM POZİTİF BAKTERİ ANTİBİYOGRAMLARI

GRAM POZİTİF BAKTERİ ANTİBİYOGRAMLARI GRAM POZİTİF BAKTERİ ANTİBİYOGRAMLARI Dr. Özlem KURT AZAP 26 Kasım 2008 Genel Kurallar Tek koloniden yapılan pasaj seçici olmayan besiyerinde (kanlı agar...) bir gece inkübe edilir Benzer morfolojideki

Detaylı

Erzincan Garnizonunda tüketime sunulan tavuk ARAŞTIRMA ve hindi etlerinden (Research konvansiyonel Report) kültür ve moleküler (PZR) metodla.

Erzincan Garnizonunda tüketime sunulan tavuk ARAŞTIRMA ve hindi etlerinden (Research konvansiyonel Report) kültür ve moleküler (PZR) metodla. Erzincan Garnizonunda tüketime sunulan tavuk ARAŞTIRMA ve hindi etlerinden (Research konvansiyonel Report) kültür ve moleküler (PZR) metodla. ERZİNCAN GARNİZONUNDA TÜKETİME SUNULAN TAVUK VE HİNDİ ETLERİNDEN

Detaylı

REAKSİYON PRENSİPLERİ

REAKSİYON PRENSİPLERİ REAKSİYON PRENSİPLERİ Reaksiyon Bileşenleri: qpcr Master Mix (PMM) Hedef probe Mix (HPM) Zenginleştirilmiş gıda ürünleri kültüründen izole edilen DNA örneği Polimerase Chain Reaction (PCR): Son yıllarda

Detaylı

Protokolü PD S001 01. 50 Reaksiyon

Protokolü PD S001 01. 50 Reaksiyon Salmonella sp. Real time PCR Tespit Kiti Protokolü PD S001 01 50 Reaksiyon REAKSİYON PRENSİPLERİ Reaksiyon Bileşenleri: qpcr Master Mix (PMM) Hedef probe Mix (HPM) Zenginleştirilmiş gıda ürünleri kültüründen

Detaylı

Yılları Arasında Üretilen Salmonella İzolatlarının Antibiyotik Duyarlılık Sonuçları

Yılları Arasında Üretilen Salmonella İzolatlarının Antibiyotik Duyarlılık Sonuçları 2007-2011 Yılları Arasında Üretilen almonella İzolatlarının Antibiyotik Duyarlılık onuçları Alev Duran1, Meral Biçmen1, evasiye Kayalı2, Belkıs Levent2, Zeynep Gülay1 1Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi

Detaylı

EYLÜL 2011 S0485&S0486

EYLÜL 2011 S0485&S0486 İSTANBUL İL KONTROL LABORATUVAR MÜDÜRLÜĞÜ GIDA MİKROBİYOLOJİSİNDE DIŞ KALİTE DEĞERLENDİRMESİ (EQA=EXTERNAL QUALITY ASSESMENT) SONUÇ RAPORU EYLÜL 2011 S0485&S0486 İstanbul İl Kontrol Laboratuvar Müdürlüğü

Detaylı

Çine Köftelerinin Mikrobiyolojik Kalitelerinin İncelenmesi

Çine Köftelerinin Mikrobiyolojik Kalitelerinin İncelenmesi J Fac Vet Med Univ Erciyes 4(1) 29-33, 2007 F. KÖK, D. KESKİN, Araştırma S. BÜYÜKYÖRÜK Makalesi Research Article Çine Köftelerinin Mikrobiyolojik Kalitelerinin İncelenmesi Filiz KÖK 1 Dilek KESKİN 2 Sadık

Detaylı

Proje Numarası: Başlama Tarihi: Bitiş Tarihi: Rapor Tarihi:

Proje Numarası: Başlama Tarihi: Bitiş Tarihi: Rapor Tarihi: TÜRKİYE CUMHURİYETİ ANKARA ÜNİVERSİTESİ BİLİMSEL ARAŞTIRMA PROJESİ KESİN RAPORU Campylobacter ve Enterobakterilerde Quinolone ve Çoklu Antibiyotik Dirençliliğinin Genetik Analizi Prof.Dr. K.Serdar DİKER

Detaylı

STANDARDİZASYON KURUMLARI VE TÜRKİYE

STANDARDİZASYON KURUMLARI VE TÜRKİYE STANDARDİZASYON KURUMLARI VE TÜRKİYE (yalnızca CLSI mı?) Dr.ELViN DiNÇ OKMEYDANI E.A.H ENFEKSİYON HASTALIKLARI VE KLİNİK MİKROBİYOLOJİ KLİNİĞİ Antibiyotik tedavisi gerektiren bir enfeksiyonda rolü olan

Detaylı

BD Mueller Hinton Agar with 5% Sheep Blood BD Mueller Hinton Agar with 5% Sheep Blood (150 mm) BD Mueller Hinton Agar with 5% Sheep blood, Square

BD Mueller Hinton Agar with 5% Sheep Blood BD Mueller Hinton Agar with 5% Sheep Blood (150 mm) BD Mueller Hinton Agar with 5% Sheep blood, Square KULLANIM TALİMATLARI KULLANIMA HAZIR PLAK BESİYERİ PA-254030.07 Rev.: April 2013 BD Mueller Hinton Agar with 5% Sheep Blood BD Mueller Hinton Agar with 5% Sheep Blood (150 mm) BD Mueller Hinton Agar with

Detaylı

E.COLI /KOLİFORM İDENTİFİKASYONU VE KÜLTiVASYONU İÇİN (TÜPTE BESİYERİ)

E.COLI /KOLİFORM İDENTİFİKASYONU VE KÜLTiVASYONU İÇİN (TÜPTE BESİYERİ) Avantaj Kullanıma hazır ürünler her anlamda dehidre besiyerlerine göre avantajlara sahiptir. En belirgin avantaj besiyeri hazırlamada zamandan tasarruf sağlanmasıdır. Ayrıca dehidre besiyerlerinin hazırlanması

Detaylı

Listeria Monocytogenes Real time PCR Tespit Kiti

Listeria Monocytogenes Real time PCR Tespit Kiti Listeria Monocytogenes Real time PCR Tespit Kiti Protokol PD LM00 0 50 Reaksiyon REŞİT GALİP CADDESİ 74-7 06700 ÇANKAYA, ANKARA, TÜRKİYE T +90 32 447 22 79 / 80 F +90 32 447 22 07 W www.bmlabosis.com İnternal

Detaylı

HAYVANSAL GIDALARDA LISTERIA TÜRLERİNİN VARLIĞININ KONVANSİYONEL VE İMMUNOLOJİK YÖNTEMLERLE ARAŞTIRILMASI

HAYVANSAL GIDALARDA LISTERIA TÜRLERİNİN VARLIĞININ KONVANSİYONEL VE İMMUNOLOJİK YÖNTEMLERLE ARAŞTIRILMASI TÜRKİYE 12. GIDA KONGRESİ 05-07 EKİM 2016; EDİRNE HAYVANSAL GIDALARDA LISTERIA TÜRLERİNİN VARLIĞININ KONVANSİYONEL VE İMMUNOLOJİK YÖNTEMLERLE ARAŞTIRILMASI Ayla EYİ GENCAN *, İlker Turan AKOĞLU, İbrahim

Detaylı

Erzurum da Tüketime Sunulan Tavuk Etlerinin Bazı Patojen Bakteriler Yönünden İncelenmesi

Erzurum da Tüketime Sunulan Tavuk Etlerinin Bazı Patojen Bakteriler Yönünden İncelenmesi Manas J Agr Vet Life Sci, 2018, 8 (1), 36 50 Erzurum da Tüketime Sunulan Tavuk Etlerinin Bazı Patojen Bakteriler Yönünden İncelenmesi Serap KILIÇ ALTUN 1* Mustafa ATASEVER 2 1* Harran Üniversitesi, Veteriner

Detaylı

MİKROBİYOLOJİ LABORATUVARINDA UYULMASI GEREKEN KURALLAR

MİKROBİYOLOJİ LABORATUVARINDA UYULMASI GEREKEN KURALLAR MİKROBİYOLOJİ LABORATUVARINDA UYULMASI GEREKEN KURALLAR Kurallar Laboratuvar saatinde geç kalan öğrenciler, eğitim başladıktan sonra laboratuvara alınmayacaktır. Laboratuvarlar devamlılık arzettiği için

Detaylı

İzolasyon ve İdentifikasyon

İzolasyon ve İdentifikasyon İzolasyon ve İdentifikasyon (9. Hafta) 1 İzolasyon : Ayırmak İzolasyon Mikrobiyolojide izolasyon? Hangi amaçlarla izolasyon yapılır? Endüstriyel mikroorganizmalar Bozulma ve/veya hastalık etmeni mikroorganizmalar

Detaylı

SU ÜRÜNLERİİŞLEME TESİSİNDEKİ MİKROBİYAL FLORANIN DEĞİŞİMİNDE TİCARİ DEZENFEKTANLARIN ETKİSİNİN ARAŞTIRILMASI. Aysu BESLER

SU ÜRÜNLERİİŞLEME TESİSİNDEKİ MİKROBİYAL FLORANIN DEĞİŞİMİNDE TİCARİ DEZENFEKTANLARIN ETKİSİNİN ARAŞTIRILMASI. Aysu BESLER SU ÜRÜNLERİİŞLEME TESİSİNDEKİ MİKROBİYAL FLORANIN DEĞİŞİMİNDE TİCARİ DEZENFEKTANLARIN ETKİSİNİN ARAŞTIRILMASI Aysu BESLER SUNUM PLANI Konu ve kapsam Amaç Yöntem Bulgular Sonuç ve Öneriler http://kaymurgida.com.tr/murat_fab/isleme.html

Detaylı

MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS İZOLATLARININ PRİMER ANTİTÜBERKÜLOZ İLAÇLARA DUYARLILIKLARININ ÇİKOLATALI AGARDA SAPTANMASI: BİR ÖN ÇALIŞMA

MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS İZOLATLARININ PRİMER ANTİTÜBERKÜLOZ İLAÇLARA DUYARLILIKLARININ ÇİKOLATALI AGARDA SAPTANMASI: BİR ÖN ÇALIŞMA Kısa Bildiri/Short Communication Mikrobiyol Bul 2008; 42: 477-481 MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS İZOLATLARININ PRİMER ANTİTÜBERKÜLOZ İLAÇLARA DUYARLILIKLARININ ÇİKOLATALI AGARDA SAPTANMASI: BİR ÖN ÇALIŞMA

Detaylı

Protokolü PD S Reaksiyon

Protokolü PD S Reaksiyon Salmonella sp. Real time PCR Tespit Kiti Protokolü PD S00 0 50 Reaksiyon REŞİT GALİP CADDESİ 74-7 06700 ÇANKAYA, ANKARA, TÜRKİYE T +90 32 447 22 79 / 80 F +90 32 447 22 07 www.bmlabosis.com İnternal Pozitif

Detaylı

Kedi ve köpeklerin ürogenital sistem. sistem infeksiyonlarından izole edilen Escherichia

Kedi ve köpeklerin ürogenital sistem. sistem infeksiyonlarından izole edilen Escherichia Kedi ve köpeklerin ürogenital sistem infeksiyonlarından izole edilen Escherichia coli suşlarının antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi* Orkun BABACAN**, Mehmet AKAN***, Müjgan İZGÜR**** Öz: Bu çalışmada

Detaylı

Mikroaerofilik (düşük oksijen) ve kapnofilik (artmış karbondioksit) (5%O 2,10%CO 2,85%N 2 ) İnsanlara bulaş: kontamine gıdalarla

Mikroaerofilik (düşük oksijen) ve kapnofilik (artmış karbondioksit) (5%O 2,10%CO 2,85%N 2 ) İnsanlara bulaş: kontamine gıdalarla Termofilik (42-43 0 C) (C. fetus hariç) Mikroaerofilik (düşük oksijen) ve kapnofilik (artmış karbondioksit) (5%O 2,10%CO 2,85%N 2 ) İnsanlara bulaş: kontamine gıdalarla özellikle kümes hayvanlarının ürünleri

Detaylı

Enzimlerinin Saptanmasında

Enzimlerinin Saptanmasında Gram Negatif Bakterilerde Karbapenemaz Enzimlerinin Saptanmasında OXA-48 K-Se T, Blue-Carba Test ve PCR Testlerinin Etkinliğinin Karşılaştırılması Ayham Abulaila, Fatma Erdem, Zerrin Aktaş, Oral Öncül

Detaylı

02. Gıda Patojenlerinin Analizi (Standart Yöntemler)

02. Gıda Patojenlerinin Analizi (Standart Yöntemler) 02. Gıda Patojenlerinin Analizi (Standart Yöntemler) Prof. Dr. A. Kadir HALKMAN Ankara Üniversitesi Mühendislik Fakültesi Gıda Mühendisliği Bölümü GDM310 Gıda Mikrobiyolojisi II Ders notu 02. Gıdalarda

Detaylı

Çoklu İlaç Dirençli A. baumanni İzolatlarının OXA tipi Karbapenemaz Genlerinin Tespiti ve PFGE ile Moleküler Epidemiyolojik Analizi

Çoklu İlaç Dirençli A. baumanni İzolatlarının OXA tipi Karbapenemaz Genlerinin Tespiti ve PFGE ile Moleküler Epidemiyolojik Analizi [SS-19] Çoklu İlaç irençli baumanni İzolatlarının OX tipi Karbapenemaz Genlerinin Tespiti ve PFGE ile Moleküler Epidemiyolojik nalizi Nergis şgın 1, Barış Otlu 2 Elçin Kal Çakmaklıoğulları 1, N Canan Gürsoy

Detaylı

MAYIS 2012 S0501&S0502

MAYIS 2012 S0501&S0502 İSTANBUL GIDA KONTROL LABORATUVAR MÜDÜRLÜĞÜ GIDA MİKROBİYOLOJİSİNDE DIŞ KALİTE DEĞERLENDİRMESİ (EQA=EXTERNAL QUALITY ASSESMENT) SONUÇ RAPORU MAYIS 2012 S0501&S0502 İstanbul Gıda Kontrol Laboratuvar Müdürlüğü

Detaylı

ULUSAL ENTERİK PATOJENLER LABORATUVAR SÜRVEYANS AĞI (UEPLA) XXXVII. TÜRK MİKROBİYOLOJİ KONGRESİ KASIM 2016 ANTALYA

ULUSAL ENTERİK PATOJENLER LABORATUVAR SÜRVEYANS AĞI (UEPLA) XXXVII. TÜRK MİKROBİYOLOJİ KONGRESİ KASIM 2016 ANTALYA ULUSAL ENTERİK PATOJENLER LABORATUVAR SÜRVEYANS AĞI (UEPLA) XXXVII. TÜRK MİKROBİYOLOJİ KONGRESİ 16-20 KASIM 2016 ANTALYA 1 Ulusal Enterik Patojenler Laboratuvar Sürveyans Ağı (UEPLA) Türkiye de Bulaşıcı

Detaylı

Sonuçların Gönderildiği Son Tarihi : 10 Ekim 2014

Sonuçların Gönderildiği Son Tarihi : 10 Ekim 2014 İSTANBUL GIDA KONTROL LABORATUVAR MÜDÜRLÜĞÜ GIDA MİKROBİYOLOJİSİNDE DIŞ KALİTE DEĞERLENDİRMESİ (EQA=EXTERNAL QUALITY ASSESMENT) SONUÇ RAPORU EYLÜL 2014 S0557&S0558 İstanbul Gıda Kontrol Laboratuvar Müdürlüğü

Detaylı

Kinolon Dirençli ve Duyarlı İnvaziv Escherichia coli Kan İzolatlarında ST131/H30 klon/altklonunun Virülans ile İlişkisi

Kinolon Dirençli ve Duyarlı İnvaziv Escherichia coli Kan İzolatlarında ST131/H30 klon/altklonunun Virülans ile İlişkisi Kinolon Dirençli ve Duyarlı İnvaziv Escherichia coli Kan İzolatlarında ST131/H30 klon/altklonunun Virülans ile İlişkisi Öznur Gürpınar 1, Ahmet İlbay 2, Gökhan Metan 3, Pınar Zarakolu 3, Özgen Köseoğlu

Detaylı

Clostridium perfringens Analizi (Kaynak 2) 1

Clostridium perfringens Analizi (Kaynak 2) 1 Clostridium perfringens Analizi (Kaynak 2) 1 01. Genel Bilgiler 02. Gıda Örneğinin Hazırlanması 03. Selektif Besiyerine Ekim 04. Cl. perfringens 'in Doğrulanması 04.01. Hareket-Nitrat Testi 04.02. Laktoz

Detaylı

Listeria monocytogenes Analizi (Kaynak 2) 1

Listeria monocytogenes Analizi (Kaynak 2) 1 Listeria monocytogenes Analizi (Kaynak 2) 1 01. Standart Analiz Yöntemi 02. İzolasyon 03. İdentifikasyon 04. Serolojik Testler 05. Faj Tiplendirmesi 06. Genetik Analizler 07. Listeria Sayımı 08. Hızlı

Detaylı

Riskli Ünitelerde Yatan Hastalarda Karbapenemaz Üreten Enterobacteriaceae taranması

Riskli Ünitelerde Yatan Hastalarda Karbapenemaz Üreten Enterobacteriaceae taranması Riskli Ünitelerde Yatan Hastalarda Karbapenemaz Üreten Enterobacteriaceae taranması BD MAX CRE Assay Yöntemi İle Karşılaştırmalı Bir Çalışma Ayşe Nur Sarı 1,2, Sema Alp Çavuş 1, Dokuz Eylül Enfeksiyon

Detaylı

Olgularla Antimikrobiyal Duyarlılık Testleri (Gram Negatif Bakteriler)

Olgularla Antimikrobiyal Duyarlılık Testleri (Gram Negatif Bakteriler) Olgularla Antimikrobiyal Duyarlılık Testleri (Gram Negatif Bakteriler) Uzm. Dr. Demet Hacıseyitoğlu Dr. Lütfi Kırdar Kartal Eğitim ve Araştırma Hastanesi Olgu 1 51 yaşındaki kadın hasta Doğalgaz patlaması

Detaylı

Mikrobiyolojide Moleküler Tanı Yöntemleri. Dr.Tuncer ÖZEKİNCİ Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji A.D

Mikrobiyolojide Moleküler Tanı Yöntemleri. Dr.Tuncer ÖZEKİNCİ Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji A.D Mikrobiyolojide Moleküler Tanı Yöntemleri Dr.Tuncer ÖZEKİNCİ Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji A.D 1 Enfeksiyonun Özgül Laboratuvar Tanısı Mikroorganizmanın üretilmesi Mikroorganizmaya

Detaylı

16S rrna Analizi. Doç. Dr. Zeynep Ceren KARAHAN. Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

16S rrna Analizi. Doç. Dr. Zeynep Ceren KARAHAN. Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı 16S rrna Analizi Doç. Dr. Zeynep Ceren KARAHAN Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Sunum içeriği Genel bilgi Uygulanışı Kullanım alanları Avantajları Dezavantajları Neden

Detaylı

Determination of L. monocytogenes, and its Antibiotic Resistance of Local Produced Cheese Consuming in Hatay

Determination of L. monocytogenes, and its Antibiotic Resistance of Local Produced Cheese Consuming in Hatay Van Vet J, 2016, 27 (1) 25-29 Van Veterinary Journal http://vfdergi.yyu.edu.tr ISSN: 2149-3359 Original Article e-issn: 2149-8644 Determination of L. monocytogenes, and its Antibiotic Resistance of Local

Detaylı

BAKTERİLER YELLERİNİN BELİRLENMES RLENMESİ. Page 1

BAKTERİLER YELLERİNİN BELİRLENMES RLENMESİ. Page 1 EZİNE PEYNİRİNDEN NDEN İZOLE EDİLEN LAKTİK K ASİT BAKTERİLER LERİ NİN N PROBİYOT YOTİK K POTANSİYELLER YELLERİNİN BELİRLENMES RLENMESİ Page 1 Page 2 Page 3 Page 4 Page 5 Page 6 1857- Pasteur Laktik Asit

Detaylı

Su Mikrobiyolojisi 02

Su Mikrobiyolojisi 02 İNSANİ TÜKETİM M AMAÇLI SULARDA MEMBRAN FİLTRASYON F YÖNTEMY NTEMİ İLE MİKROBM KROBİYOLOJİK K ANALİZLER Prof. Dr. Kadir HALKMAN Ankara Üniversitesi, Gıda Mühendisliği Bölümü Su Mikrobiyolojisi 02 Su Mikrobiyolojisi

Detaylı

EUCAST tarafından önerilen rutin iç kalite kontrol Sürüm 3.1, geçerlilik tarihi

EUCAST tarafından önerilen rutin iç kalite kontrol Sürüm 3.1, geçerlilik tarihi EUCAST tarafından önerilen rutin iç kalite kontrol Sürüm.1, geçerlilik tarihi 11.0.01 Escherichia coli Pseudomonas aeruginosa Staphylococcus aureus Enterococcus faecalis Streptococcus pneumoniae Haemophilus

Detaylı

EYLÜL 2010 S0461&S0462

EYLÜL 2010 S0461&S0462 İSTANBUL İL KONTROL LABORATUVAR MÜDÜRLÜĞÜ GIDA MİKROBİYOLOJİSİNDE DIŞ KALİTE DEĞERLENDİRMESİ (EQA=EXTERNAL QUALITY ASSESMENT) SONUÇ RAPORU EYLÜL 2010 S0461&S0462 İstanbul İl Kontrol Laboratuvar Müdürlüğü

Detaylı

Sığır kıyma ve köftelerinde Salmonella spp. varlığı

Sığır kıyma ve köftelerinde Salmonella spp. varlığı Sığır kıyma ve köftelerinde Salmonella spp. varlığı Tuba YILDIRIM * Belgin SIRIKEN ** Ceren YAVUZ * Öz: Günümüzde her yıl milyonlarca insan gıda kaynaklı hastalıklardan ölmektedir. Sığır orjinli etler

Detaylı

GIDALARDA SALMONELLA ARANMASI (RAPIDCHEK SELECT SALMONELLA)

GIDALARDA SALMONELLA ARANMASI (RAPIDCHEK SELECT SALMONELLA) 1. AMAÇ VE KAPSAM Bu talimat gıda örneklerinde Salmonella türlerinin aranmasına yöneliktir. Analiz iki aşamalı selektif zenginleştirme sonrasında protein temelli bir sistem olan Rapidchek Select Salmonella

Detaylı

Emrah Salman, Zeynep Ceren Karahan Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi. Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

Emrah Salman, Zeynep Ceren Karahan Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi. Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Emrah Salman, Zeynep Ceren Karahan Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Antibiyotik kullanımına bağlı ishal etkeni olan Clostridium difficile, nozokomiyal diyarenin en sık

Detaylı

Erzincan İli Tulum Peynirlerinden Listeria spp. İzolasyonu ve İdentifikasyonu*

Erzincan İli Tulum Peynirlerinden Listeria spp. İzolasyonu ve İdentifikasyonu* Erciyes Üniv Vet Fak Derg 9(3) 149-156, 2012 J Fac Vet Med Univ Erciyes 9(3) 149-156, 2012 M.G. AZAK, H. KILIÇ, H. Araştırma HIZLISOY, Makalesi S. ABAY Research Article Erzincan İli Tulum Peynirlerinden

Detaylı

Vet. Bil. Derg. (2008), 24, 1; 69-75 ARAÞTIRMA MAKALESÝ KONYA DA ÜRETÝLEN SÜZME (TORBA) YOÐURTLARIN BAZI MÝKROBÝYOLOJÝK VE KÝMYASAL ÖZELLÝKLERÝ K. Kaan Tekinþen @ 1 Mustafa Nizamlýoðlu 1 Nazif Bayar 2

Detaylı

ANKARA ÜNĠVERSĠTESĠ BĠLĠMSEL ARAġTIRMA PROJELERĠ KOORDĠNASYON BĠRĠMĠ KOORDĠNATÖRLÜĞÜNE. : Lisansüstü Tez Projesi (Yüksek Lisans)

ANKARA ÜNĠVERSĠTESĠ BĠLĠMSEL ARAġTIRMA PROJELERĠ KOORDĠNASYON BĠRĠMĠ KOORDĠNATÖRLÜĞÜNE. : Lisansüstü Tez Projesi (Yüksek Lisans) ANKARA ÜNĠVERSĠTESĠ BĠLĠMSEL ARAġTIRMA PROJELERĠ KOORDĠNASYON BĠRĠMĠ KOORDĠNATÖRLÜĞÜNE Proje Türü Proje No Proje Yürütücüsü : Lisansüstü Tez Projesi (Yüksek Lisans) : 16L0443001 : Doç. Dr. Pınar ŞANLIBABA

Detaylı

Ancak, Salmonella spp., Escherichia coli, Clostridium perfringens ve Staphylococcus aureus

Ancak, Salmonella spp., Escherichia coli, Clostridium perfringens ve Staphylococcus aureus 1 T.C. ANKARA ÜNİVERSİTESİ BİLİMSEL ARAŞTIRMA PROJESİ KESİN RAPORU SIĞIR KARKASLARINDA MİKROBİYEL YÜZEY KONTAMİNASYONUN BELİRLENMESİ Proje Yürütücüsü: Haydar ÖZDEMİR Proje Numarası: 20070810008HPD Başlama

Detaylı

Kars Piyasasında Tüketime Sunulan Sade Dondurmaların Mikrobiyolojik Kalitelerinin Belirlenmesi

Kars Piyasasında Tüketime Sunulan Sade Dondurmaların Mikrobiyolojik Kalitelerinin Belirlenmesi Kars Piyasasında Tüketime Sunulan Sade Dondurmaların Mikrobiyolojik Kalitelerinin Belirlenmesi Aksem AKSOY 1*, Çiğdem SEZER 2, Leyla VATANSEVER 2 1 Kafkas Üniversitesi, Kars Meslek Yüksek Okulu, Gıda Teknolojisi

Detaylı

Enfeksiyon odaklarından izole edilen Gram negatif ve Gram pozitif bakterilerde antimikrobiyal duyarlılık sonuçları

Enfeksiyon odaklarından izole edilen Gram negatif ve Gram pozitif bakterilerde antimikrobiyal duyarlılık sonuçları Enfeksiyon odaklarından izole edilen Gram negatif ve Gram pozitif bakterilerde antimikrobiyal duyarlılık sonuçları Doç. Dr. Gönül Şengöz 13 Haziran 2015 KAYIP DİLLERİN FISILDADIKLARI SERGİSİ-İSTANBUL Antimikrobiyal

Detaylı

Biyofilmler; mikroorganizmaların, biyotik veya abiyotik yüzeylere adhezyonu sonrasında oluşturdukları glikokaliks olarak da adlandırılan

Biyofilmler; mikroorganizmaların, biyotik veya abiyotik yüzeylere adhezyonu sonrasında oluşturdukları glikokaliks olarak da adlandırılan Biyofilmler; mikroorganizmaların, biyotik veya abiyotik yüzeylere adhezyonu sonrasında oluşturdukları glikokaliks olarak da adlandırılan ekstraselluler matriks içinde, birbirlerine yapışarak meydana getirdikleri

Detaylı

Olgularla Klinik Bakteriyoloji: Antibiyotik Duyarlılık Testleri Yorumları. Dilara Öğünç Gülçin Bayramoğlu Onur Karatuna

Olgularla Klinik Bakteriyoloji: Antibiyotik Duyarlılık Testleri Yorumları. Dilara Öğünç Gülçin Bayramoğlu Onur Karatuna Olgularla Klinik Bakteriyoloji: Antibiyotik Duyarlılık Testleri Yorumları Dilara Öğünç Gülçin Bayramoğlu Onur Karatuna Olgularla Klinik Bakteriyoloji: Antibiyotik Duyarlılık Testleri Yorumları Dr Dilara

Detaylı

Enterobacteriaceae Ġzolatlarında Karbapenemazların Saptanmasında Modifiye Hodge Testi ve Carba NP Testlerinin Karşılaştırılması

Enterobacteriaceae Ġzolatlarında Karbapenemazların Saptanmasında Modifiye Hodge Testi ve Carba NP Testlerinin Karşılaştırılması Enterobacteriaceae Ġzolatlarında Karbapenemazların Saptanmasında Modifiye Hodge Testi ve Carba NP Testlerinin Karşılaştırılması Gülçin BAYRAMOĞLU 1, Gülşen ULUÇAM 1, Çiğdem GENÇOĞLU ÖZGÜR 2, Ali Osman

Detaylı

Tulum Peynirinden İzole Edilen Cronobacter spp. Prevalansı ve Antibiyotik Dirençliliği

Tulum Peynirinden İzole Edilen Cronobacter spp. Prevalansı ve Antibiyotik Dirençliliği Tulum Peynirinden İzole Edilen Cronobacter spp. Prevalansı ve Antibiyotik Dirençliliği Abdullah Dikici, Kaan Kemal Tekinşen, Özgür Gölge*, Fatma Hepsağ, Ahmet Koluman Edirne-2016 Özet Giriş Tulum Peyniri

Detaylı

ARAŞTIRMA. Elazığ da Satışa Sunulan Bazı Sütlü Tatlıların Mikrobiyolojik Kalitesi. F.Ü.Sağ.Bil.Vet.Derg. 2013; 27 (1):

ARAŞTIRMA. Elazığ da Satışa Sunulan Bazı Sütlü Tatlıların Mikrobiyolojik Kalitesi. F.Ü.Sağ.Bil.Vet.Derg. 2013; 27 (1): ARAŞTIRMA F.Ü.Sağ.Bil.Vet.Derg. 2013; 27 (1): 19-24 http://www.fusabil.org Elazığ da Satışa Sunulan Bazı Sütlü Tatlıların Mikrobiyolojik Kalitesi Gülsüm ÖKSÜZTEPE 1 Hüsnü ŞAHAN GÜRAN 2 Gökhan Kürşad İNCİLİ

Detaylı

Abant Medical Journal

Abant Medical Journal doi: 10.5505/abantmedj.2014.74946 Abant Medical Journal Orijinal Makale / Original Article Volume Cilt 3 Issue Sayı 3 Year Yıl 2014 On Yıllık Dönemde S.aureus Suşlarının Antibiyotik Direnç Durumundaki

Detaylı

Emine Zuhal Kalaycı Çekin 1, Gülşah Malkoçoğlu 3, Nicolas Fortineau 2, Banu Bayraktar 1, Thierry Naas 2, Elif Aktaş 1

Emine Zuhal Kalaycı Çekin 1, Gülşah Malkoçoğlu 3, Nicolas Fortineau 2, Banu Bayraktar 1, Thierry Naas 2, Elif Aktaş 1 Karbapenem dirençli Pseudomonas aeruginosa izolatlarında karbapenemaz varlığının genotipik ve fenotipik yöntemlerle araştırılması ve MALDI-TOF MS aracılığı ile yüksek riskli klon tayini Emine Zuhal Kalaycı

Detaylı

Caucasian Journal of Science

Caucasian Journal of Science Caucasian Journal of Science Journal home page: www.cjoscience.com Vol.1 Issue:2 Year: 2014 Received: Jaunary 2014 Accepted: March 2014 Avaible:December 2014 SIĞIR PNÖMONİK AKCİĞERLERİNDEN İZOLE EDİLEN

Detaylı

Tüketime sunulan çeşitli hazır yemek ürünlerinin mikrobiyolojik kalitesinin belirlenmesi *

Tüketime sunulan çeşitli hazır yemek ürünlerinin mikrobiyolojik kalitesinin belirlenmesi * Araştırma Makalesi/Original Article Makale Dili Türkçe /Article Language Turkish Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi Tüketime sunulan çeşitli hazır yemek ürünlerinin mikrobiyolojik kalitesinin belirlenmesi

Detaylı

Sığır karkaslarında Staphylococcus aureus un varlığı, enterotoksijenik özellikleri ve antimikrobiyal dirençliliği*

Sığır karkaslarında Staphylococcus aureus un varlığı, enterotoksijenik özellikleri ve antimikrobiyal dirençliliği* Ankara Üniv Vet Fak Derg, 63, 17-23, 16 Sığır karkaslarında Staphylococcus aureus un varlığı, enterotoksijenik özellikleri ve antimikrobiyal dirençliliği* Erhan KEYVAN 1, Haydar ÖZDEMİR 2 1 Mehmet Akif

Detaylı

ÇOKLU TÜP FERMANTASYON YÖNTEMİ İLE TOPLAM KOLİFORM TAYİNİ. Koliform Bakteri Grubunun Tanımı

ÇOKLU TÜP FERMANTASYON YÖNTEMİ İLE TOPLAM KOLİFORM TAYİNİ. Koliform Bakteri Grubunun Tanımı ÇOKLU TÜP FERMANTASYON YÖNTEMİ İLE TOPLAM KOLİFORM TAYİNİ Koliform Bakteri Grubunun Tanımı Koliform grubunu oluşturan bakteriler; tamamı aerobik veya fakültatif anaerobik olan, gram negatif, spor oluşturmayan,

Detaylı

Bursa da Tüketime Sunulan Bazı Baharatların Mikrobiyal Florası

Bursa da Tüketime Sunulan Bazı Baharatların Mikrobiyal Florası 103 J Fac Vet Med 20 (2001) 103-107 Bursa da Tüketime Sunulan Bazı Baharatların Mikrobiyal Florası Nejlet FİLİZ* Geliş Tarihi: 21.11.2000 Özet: Bu çalışmada Bursa da tüketime sunulan toplam 48 adet karabiber,

Detaylı

Sorunlu Mikroorganizmalar, Sorunlu Antibiyotikler ve E Test. Prof.Dr.Güner Söyletir Marmara Üniversitesi, İstanbul

Sorunlu Mikroorganizmalar, Sorunlu Antibiyotikler ve E Test. Prof.Dr.Güner Söyletir Marmara Üniversitesi, İstanbul Sorunlu Mikroorganizmalar, Sorunlu Antibiyotikler ve E Test Prof.Dr.Güner Söyletir Marmara Üniversitesi, İstanbul Sorunlu Mikroorganizmalar Nonfermentatif bakteriler Acinetobacter sp. Stenotrophomonas

Detaylı

Komplike deri ve yumuşak doku enfeksiyonu etkeni çoklu dirençli patojenlerin bakteriyofaj duyarlılıklarının araştırılması

Komplike deri ve yumuşak doku enfeksiyonu etkeni çoklu dirençli patojenlerin bakteriyofaj duyarlılıklarının araştırılması Komplike deri ve yumuşak doku enfeksiyonu etkeni çoklu dirençli patojenlerin bakteriyofaj duyarlılıklarının araştırılması Aycan Gundogdu, Ph.D. Erciyes Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim

Detaylı

OLGU SUNUSU. Doç.Dr.Sebahat AKSARAY. Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı. Haydarpaşa Numune Eğitim ve Araştırma Hastanesi

OLGU SUNUSU. Doç.Dr.Sebahat AKSARAY. Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı. Haydarpaşa Numune Eğitim ve Araştırma Hastanesi OLGU SUNUSU Doç.Dr.Sebahat AKSARAY Haydarpaşa Numune Eğitim ve Araştırma Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı bazı davetlilerde gastroenterit tablosu bulguları Yiyecek öyküsü Semptomların ortaya

Detaylı

Paketlenmiş tavuk etlerinden hareketli Aeromonas türlerinin saptanması*

Paketlenmiş tavuk etlerinden hareketli Aeromonas türlerinin saptanması* Paketlenmiş tavuk etlerinden hareketli Aeromonas türlerinin saptanması* Seher AYTAN**, Belgin SARIMEHMETOĞLU** Öz: Bu çalışmada Ankara nın değişik semtlerindeki marketlerden alınan paketlenmiş 30 tavuk

Detaylı

Giriş. Giriş. Mastitis. Mastitisin sınıflandırılması. Sığır Mastitisi Kökenli Streptokok Türlerinin Virülens Özelliklerinin Belirlenmesi

Giriş. Giriş. Mastitis. Mastitisin sınıflandırılması. Sığır Mastitisi Kökenli Streptokok Türlerinin Virülens Özelliklerinin Belirlenmesi Giriş ü Türkiye deki sığır varlığı, sağılan sığır sayısı ve bunlardan elde edilen süt üretimi ile ilgili son yılların verileri incelendiğinde, önceki yıllara göre azalma eğilimi dikkati çekmektedir. Sığır

Detaylı

ULUSAL ANTİMİKROBİYAL DİRENÇ SURVEYANS SİSTEMİ (UAMDSS) Doç.Dr.Nilay ÇÖPLÜ

ULUSAL ANTİMİKROBİYAL DİRENÇ SURVEYANS SİSTEMİ (UAMDSS) Doç.Dr.Nilay ÇÖPLÜ ULUSAL ANTİMİKROBİYAL DİRENÇ SURVEYANS SİSTEMİ (UAMDSS) Doç.Dr.Nilay ÇÖPLÜ UAMDSS NEDEN GEREKLI? Antimikrobiyal direnç sorunu ile baş edebilmek için akılcı antimikrobiyal kullanımını sağlamak gereklidir.

Detaylı

BD Haemophilus Test Medium Agar (HTM)

BD Haemophilus Test Medium Agar (HTM) PA-254058.06-1 - KULLANIM TALİMATLARI KULLANIMA HAZIR PLAK BESİYERİ PA-254058.06 Rev.: April 2013 BD Haemophilus Test Medium Agar (HTM) KULLANIM AMACI BD Haemophilus Test Medium Agar (Haemophilus Test

Detaylı

Laboratuvarda Tularemi Örnekleriyle Çalışma Rehberi

Laboratuvarda Tularemi Örnekleriyle Çalışma Rehberi Laboratuvarda Tularemi Örnekleriyle Çalışma Rehberi Doç.Dr. Aynur Karadenizli Kocaeli Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji AD, Kocaeli Bakteri ile çalışmaya uygun laboratuar

Detaylı

1.5 Kalite Kontrol Bölüm Fiziksel Kalite Kriterleri Bölüm Mikrobiyolojik Kalite Kriterleri Mikrobiyal Kontaminasyon

1.5 Kalite Kontrol Bölüm Fiziksel Kalite Kriterleri Bölüm Mikrobiyolojik Kalite Kriterleri Mikrobiyal Kontaminasyon 1.5 Kalite Kontrol Günümüzde gıda mikrobiyolojisi laboratuarlarında yaygın olarak ticari dehidre formülasyonlardan hazırlanan besiyerleri veya kullanıma hazır besiyerleri kullanılmaktadır. Kullanıma hazır

Detaylı

Pamukkale Üniversitesi Mühendislik Bilimleri Dergisi Pamukkale University Journal of Engineering Sciences

Pamukkale Üniversitesi Mühendislik Bilimleri Dergisi Pamukkale University Journal of Engineering Sciences Pamukkale Üniversitesi Mühendislik Bilimleri Dergisi Pamukkale University Journal of Engineering Sciences Probiyotik gıdalardan izole edilen laktik asit bakterilerinin antibiyotik dirençliliklerinin belirlenmesi

Detaylı

Akreditasyon Sertifikası Eki (Sayfa 1/5) Akreditasyon Kapsamı

Akreditasyon Sertifikası Eki (Sayfa 1/5) Akreditasyon Kapsamı Akreditasyon Sertifikası Eki (Sayfa 1/5) Deney Laboratuvarı Adresi : Kazım Karabekir Mah.İstasyon Cad.No:423/9 Darıca KOCAELİ KOCAELİ/TÜRKİYE Tel : 0262 655 00 68 Faks : 0262 655 00 69 E-Posta : Website

Detaylı

PCR ve RFLP YÖNTEMLERİ İLE MYCOBACTERIUM TÜRLERİNİN İDENTİFİKASYONU

PCR ve RFLP YÖNTEMLERİ İLE MYCOBACTERIUM TÜRLERİNİN İDENTİFİKASYONU 21. Yüzyılda Tüberküloz Sempozyumu ve II. Tüberküloz Laboratuvar Tanı Yöntemleri Kursu, Samsun PCR ve RFLP YÖNTEMLERİ İLE MYCOBACTERIUM TÜRLERİNİN İDENTİFİKASYONU Prof.Dr. Ahmet SANİÇ 1, Doç.Dr. Cafer

Detaylı

İdrar Örneklerinden İzole Edilen Bakteriler ve Antibiyotiklere Duyarlılıkları

İdrar Örneklerinden İzole Edilen Bakteriler ve Antibiyotiklere Duyarlılıkları 95 Kocatepe Tıp Dergisi The Medical Journal of Kocatepe 12: 95-100 / Mayıs 2011 Afyon Kocatepe Üniversitesi İdrar Örneklerinden İzole Edilen Bakteriler ve Antibiyotiklere Duyarlılıkları Bacteria Isolated

Detaylı

BD Mueller Hinton Chocolate Agar

BD Mueller Hinton Chocolate Agar PA-254035.05-1 - KULLANIM TALİMATLARI KULLANIMA HAZIR KAPLI ARAÇLAR PA-254035.05 Rev.: Nov 2012 KULLANIM AMACI (Mueller Hinton Çikolata Agar), klinik örneklerden elde edilen güç üreyen bakterilerin izolasyonu

Detaylı

TİCARİ YUMURTACI TAVUK SÜRÜLERİNDE TERMOFİLİK CAMPYLOBACTER SPP. PREVALANSI VE ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARI

TİCARİ YUMURTACI TAVUK SÜRÜLERİNDE TERMOFİLİK CAMPYLOBACTER SPP. PREVALANSI VE ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARI ARAŞTIRMA BALIKESİR SAĞLIK BİLİMLERİ DERGİSİ / BALIKESIR HEALTH SCIENCES JOURNAL TİCARİ YUMURTACI TAVUK SÜRÜLERİNDE TERMOFİLİK CAMPYLOBACTER SPP. PREVALANSI VE ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARI THE PREVALENCE

Detaylı

Temas kurulacak kiģiler: Uzm. Dr. Belkıs LEVENT Tel: 312-565 55 38 E-posta: b_levent@yahoo.com

Temas kurulacak kiģiler: Uzm. Dr. Belkıs LEVENT Tel: 312-565 55 38 E-posta: b_levent@yahoo.com SUġ HAZIRLAMA VE GÖNDERME PROSEDÜRÜ - Saklanmak veya gönderilmek istenen Salmonella şüpheli suşlar SS, XLD veya HE agar gibi seçici bir besiyerine pasajlanarak, saf kültürleri elde edilir. - Yatık nutrient

Detaylı

Karbapenemlere dirençli Bacteroides fragilis grubu bakterilerin varlığını araştırmak için rektal sürüntü örnekleriyle tarama

Karbapenemlere dirençli Bacteroides fragilis grubu bakterilerin varlığını araştırmak için rektal sürüntü örnekleriyle tarama Karbapenemlere dirençli Bacteroides fragilis grubu bakterilerin varlığını araştırmak için rektal sürüntü örnekleriyle tarama Öncü Akgül, Nurver Ülger, Gülşen Altınkanat Gelmez, Hüseyin Bilgin, Nilüfer

Detaylı

Gereç ve yöntem. Şişli Hamidiye Etfal EAH- 700-yataklı. Yenidoğan yoğun bakım ünitesi -29 yataklı Bir izolasyon odası Üç farklı bölüm

Gereç ve yöntem. Şişli Hamidiye Etfal EAH- 700-yataklı. Yenidoğan yoğun bakım ünitesi -29 yataklı Bir izolasyon odası Üç farklı bölüm Amaç Şişli Hamidiye Etfal EAH yenidoğan yoğun bakım ünitesinde üç haftalık süreçte üç hastanın idrar örneğinden karbapenem dirençli Klebsiella oxytoca üremesi üzerine yapılan salgın incelemesi Gereç ve

Detaylı

6 yaşındaki erkek hasta İstanbul da yaşıyor Son üç gündür.geçmeyen bulantı.kas ağrısı.karın krampları.ishal şikayetleriyle hastaneye götürülüyor

6 yaşındaki erkek hasta İstanbul da yaşıyor Son üç gündür.geçmeyen bulantı.kas ağrısı.karın krampları.ishal şikayetleriyle hastaneye götürülüyor UZMANIYLA TARTIŞMA Olgularla Klinik Bakteriyoloji: Sindirim Sistemi Prof. Dr. Betigül ÖNGEN İ.Ü. İstanbul Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Olgu Sunumu Olgu 6 yaşındaki erkek hasta İstanbul

Detaylı

Ġ.Ü. MÜHENDĠSLĠK FAKÜLTESĠ ÇEVRE MÜHENDĠSLĠĞĠ BÖLÜMÜ MĠKROORGANĠZMALARIN ASEPTĠK TRANSFERĠ VE ÇĠZGĠ EKĠM

Ġ.Ü. MÜHENDĠSLĠK FAKÜLTESĠ ÇEVRE MÜHENDĠSLĠĞĠ BÖLÜMÜ MĠKROORGANĠZMALARIN ASEPTĠK TRANSFERĠ VE ÇĠZGĠ EKĠM Ġ.Ü. MÜHENDĠSLĠK FAKÜLTESĠ ÇEVRE MÜHENDĠSLĠĞĠ BÖLÜMÜ Çevre Mikrobiyolojisi Dersi Laboratuvar Uygulama 4 MĠKROORGANĠZMALARIN ASEPTĠK TRANSFERĠ VE ÇĠZGĠ EKĠM 1. ASEPTĠK TEKNĠKLER Mikroorganizmalar, teneffüs

Detaylı

Avrupa Antimikrobik Duyarlılık Testleri Komitesi

Avrupa Antimikrobik Duyarlılık Testleri Komitesi Avrupa Antimikrobik Duyarlılık Testleri Komitesi belirlenmesi ve disk difüzyon için EUCAST tarafından önerilen rutin ve genişletilmiş iç kalite kontrol Sürüm 6.1, geçerlilik tarihi 01.03.016 Bu doküman

Detaylı

Bacillus cereus ve Analiz Yöntemleri

Bacillus cereus ve Analiz Yöntemleri Bacillus cereus ve Analiz Yöntemleri Bacillus cereus Gram pozitif ve spor olu turan g da zehirlenme etkeni bakteriler aras nda yer almaktad r. Sporlar s l i leme oldukça dirençlidir. Genellikle 10 7 /g

Detaylı

attomol apo B-100 quicktype

attomol apo B-100 quicktype attomol apo B-100 quicktype İnsan apolipoprotein B-100 (apo B-3500 mutasyonu) gen inde 10708G>A geçiş tespitine yönelik kit Sadece in vitro diagnostik kullanım içindir! 20 tespit sipariş numarası: 1015

Detaylı

KISA BİLDİRİ: STAFİLOKOKLARDA METİSİLİN DİRENCİNİN FARKLI YÖNTEMLERLE ARAŞTIRILMASI VE ÇOKLU ANTİBİYOTİK DİRENCİNİN SAPTANMASI*

KISA BİLDİRİ: STAFİLOKOKLARDA METİSİLİN DİRENCİNİN FARKLI YÖNTEMLERLE ARAŞTIRILMASI VE ÇOKLU ANTİBİYOTİK DİRENCİNİN SAPTANMASI* MİKROBİYOL MİKROBİYOLOJİ BÜL 2008; 42: BÜLTENİ 119-124 119 KISA BİLDİRİ: STAFİLOKOKLARDA METİSİLİN DİRENCİNİN FARKLI YÖNTEMLERLE ARAŞTIRILMASI VE ÇOKLU ANTİBİYOTİK DİRENCİNİN SAPTANMASI* SHORT COMMUNICATION:

Detaylı

Listeria monocytogenes in Asit Dirençli Türlerinin Benzalkonyum Klorür Direnci ve Biyofilm Oluşumu. Emel ÜNAL TURHAN, Karin Metselaar, Tjakko Abee

Listeria monocytogenes in Asit Dirençli Türlerinin Benzalkonyum Klorür Direnci ve Biyofilm Oluşumu. Emel ÜNAL TURHAN, Karin Metselaar, Tjakko Abee Listeria monocytogenes in Asit Dirençli Türlerinin Benzalkonyum Klorür Direnci ve Biyofilm Oluşumu Emel ÜNAL TURHAN, Karin Metselaar, Tjakko Abee Çalışmanın İçeriği L. monocytogenes ve asit dirençli türler,

Detaylı

BBL Haemophilus Test Medium Agar L007380 Rev. 06 Şubat 2007 KALİTE KONTROL PROSEDÜRLERİ

BBL Haemophilus Test Medium Agar L007380 Rev. 06 Şubat 2007 KALİTE KONTROL PROSEDÜRLERİ I GİRİŞ BBL Haemophilus Test Medium Agar Rev. 06 Şubat 2007 KALİTE KONTROL PROSEDÜRLERİ Haemophilus Test Medium Agar, Haemophilus türleri için antimikrobiyal disk difüzyon duyarlılık prosedüründe kullanım

Detaylı

Polimeraz Zincir Reaksiyonu. Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

Polimeraz Zincir Reaksiyonu. Mikrobiyoloji Anabilim Dalı 4. Ha&a Polimeraz Zincir Reaksiyonu Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Sunu içeriği PCR ın tanımı PCR ın kısa tarihçesi Hücre içi DNA replikasyonu PCR bileşenleri PCR temel prensipler PCR ın kullanım alanları

Detaylı

Pozitif kan kültürü şişesinden doğrudan MALDI-TOF MS ile identifikasyon

Pozitif kan kültürü şişesinden doğrudan MALDI-TOF MS ile identifikasyon Pozitif kan kültürü şişesinden doğrudan MALDI-TOF MS ile identifikasyon Serap Süzük Yıldız 1, Salih Altınok 1, Banu Kaşkatepe 2, Hüsniye Şimşek 1, Selçuk Kılıç 1,3 1, Mikrobiyoloji Referans Laboratuvarı

Detaylı

STREPTOCOCCUS AGALACTİAE KLİNİK İZOLATLARINDA ANTİBİYOTİKLERE DUYARLILIK Antibiotic Susceptibilities of Clinical Streptococcus agalactiae Isolates

STREPTOCOCCUS AGALACTİAE KLİNİK İZOLATLARINDA ANTİBİYOTİKLERE DUYARLILIK Antibiotic Susceptibilities of Clinical Streptococcus agalactiae Isolates ARAŞTIRMA (Research Report) Ölçü M, Eşel D STREPTOCOCCUS AGALACTİAE KLİNİK İZOLATLARINDA ANTİBİYOTİKLERE DUYARLILIK Antibiotic Susceptibilities of Clinical Streptococcus agalactiae Isolates Mehmet ÖLÇÜ

Detaylı

REAKSİYON PRENSİPLERİ

REAKSİYON PRENSİPLERİ REAKSİYON PRENSİPLERİ Reaksiyon Bileşenleri: qpcr Master Mix (PMM) Hedef probe Mix (HPM) Zenginleştirilmiş gıda ürünleri kültüründen izole edilen DNA örneği Polimerase Chain Reaction (PCR): Son yıllarda

Detaylı

BRCA 1/2 DNA Analiz Paneli

BRCA 1/2 DNA Analiz Paneli FAST-BRCA Sequencing Kit BRCA 1/2 DNA Analiz Paneli Dizi Analizi Amaçlı Kullanım İçin KULLANIM KILAVUZU İÇİNDEKİLER 1 GİRİŞ... 3 2 KİT İÇERİĞİ... 3 3 SAKLAMA... 3 4 GEREKLİ MATERYAL VE CİHAZLAR... 3 5

Detaylı

Gıda Örneklerinde Genetiği Değiştirilmiş Organizma Analizleri. Bölüm 9. MON810 Mısır, Bt-176 Mısır ve Roundup Ready Soya nın PCR ile Nitel Saptanması

Gıda Örneklerinde Genetiği Değiştirilmiş Organizma Analizleri. Bölüm 9. MON810 Mısır, Bt-176 Mısır ve Roundup Ready Soya nın PCR ile Nitel Saptanması Gıda Örneklerinde Genetiği Değiştirilmiş Organizma Analizleri Bölüm 9 MON810 Mısır, Bt-176 Mısır ve Roundup Ready Soya nın PCR ile Nitel Saptanması M. Querci, M. Maretti, M. Mazzara WORLD HEALTH ORGANIZATION

Detaylı

MUKOİD SALMONELLA ENTERİTİDİS SUŞUNUN PCR YÖNTEMİ İLE TANIMLANMASI

MUKOİD SALMONELLA ENTERİTİDİS SUŞUNUN PCR YÖNTEMİ İLE TANIMLANMASI MUKOİD SALMONELLA ENTERİTİDİS SUŞUNUN PCR YÖNTEMİ İLE TANIMLANMASI Uz Dr Fulya BAYINDIR BİLMAN 1, Uz Dr Elçin GÜNAYDIN 2, Uz Dr Mine TURHANOĞLU 1 1 Diyarbakır Eğitim ve Araştırma Hastanesi 2 Veteriner

Detaylı

attomol HLA-B*27 Sadece in vitro diagnostik kullanım içindir! 1.Giriş 2. Genel Açıklamalar

attomol HLA-B*27 Sadece in vitro diagnostik kullanım içindir! 1.Giriş   2. Genel Açıklamalar attomol HLA-B*27 HLA-B*27 in tespitine yönelik kit (Doku tiplemesi için kullanmayın!) Sadece in vitro diagnostik kullanım içindir! 40 tespit sipariş numarası: 1030 1.Giriş İnsan lökosit antijenleri(hla)

Detaylı

Et Ve Et Ürünlerinden Listeria Monocytogenes in İzolasyonu

Et Ve Et Ürünlerinden Listeria Monocytogenes in İzolasyonu Berktaş ve ark. Van Tıp Dergisi: 13 (2):36-41, 2006 Et Ve Et Ürünlerinden Listeria Monocytogenes in İzolasyonu Mustafa Berktaş*, Edibe N. Bozkurt*, Hamza Bozkurt*, Mustafa Alişarlı**, Hüseyin Güdücüoğlu

Detaylı