PCP ref A KULLANICI KILAVUZU
|
|
- Levent Erdinç
- 6 yıl önce
- İzleme sayısı:
Transkript
1 KULLANICI KILAVUZU PCP ref A Pneumocystis carinii DNA Belirlemek için kit PCR amplifikasyonu ve agaroz jel elektroforezi İçin tüm reaktifleri içerir
2
3 1. KİT İÇERİĞİ 3 2. REAKTİFLERİ SAKLAMA KOŞULLARI 4 3. KULLANIM İÇİN ÖNLEMLER 4 4. GÜVENLİK KURALLARI Genel güvenlik kuralları Safety rules about the kit 6 5. KİT İÇERİĞİNDE BULUNMAYAN GEREKLİ MATERYALLER Reaktifler Cihazlar Materyaller 7 6. REAKTİFLERİ HAZIRLAMA 8 7. GİRİŞ 9 8. TEST PRENSİBİ ÜRÜN TANIMI ÖRNEK TOPLAMA, MANİPULASYON VE ÖN-MUAMELESİ Solunum örneği Histolojik örnekler Kan AMPLİFİKASYON PROTOKOLÜ DNA EKSTRAKSİYONU DNA AMPLİFİKASYONU TST DNA Amplifikasyonu Pneumocistis carinii DNA amplifikasyonu AMPLİFİKASYON ÜRÜNLERİ Agaroz jel elektroforezi Örnek yükleme Sonuçların yorumlanması: TST ve Pneumocistis carinii DNA amplifikasyonu 17 1
4 12. SORUN GİDERME TEST LİMİTLERİ TEST PERFORMANSI Özgünlük Diagnostik ve analytik duyarlılık BİBLİYOGRAFYA SİPARİŞ İÇİN BİLGİLER İlgili ürünler 23 2
5 1. KİT İÇERİĞİ AÇIKLAMA KUTU P Tekdoz premiks tüp PCP Tekdoz premiks TST (thiosulfate sulfurtransferase -rhodanese) tüpleri Taq DNA polymerase termostabil ETİKET AB Taq 5 U/μL TÜP (T) RENGİ YA DA KAPAK Yeşil (T) 20 C DE SAKLANIR 25 test 50 test 8 test Mavi (T) Kırmızı 1 x 40 μl 1 x 80 μl 1 x 15 μl KÜÇÜK ÇANTA P.carinii genom parçası İçeren plazmid DNA Pozitif kontrol PCP 20 C DE SAKLANIR Mavi 1 x 30 μl 1 x 50 μl 1 x 10 μl KUTU F +2 / +8 C DE SAKLANIR Örnek yükleme için elektroforez buffer Ethidium Bromide solusyonu (2,5 mg/ml) 6X Blue Mavi 1 x 200 μl 1 x 350 μl 1 x 100 μl Ethidium Bromide toksik R S 36/37 45 Kırmızı 1 x 150 μl 1 x 250 μl 1 x 80 μl DNA Moleküler Ağırlık Markır MW Markır Sarı 1 x 150 μl 1 x 250 μl 1 x 50 μl KUTU A +15 / +25 C DE SAKLANIR Moleküler biyoloji için agaroz AGAROZ 1 x 15 g 1 x 27 g 1 x 5 g Elektroforez buffer TRIS-Borate-EDTA ph: 8,00 TAE 50X 1 x 60 ml 1 x 100 ml 1 x 20 ml 3
6 2. REAKTİFLERİ SAKLAMA KOŞULLARI Kitin herbir komponenti, tekli kutuların etiketlerinde belirtilen talimatlara gore saklanmalıdır. Özellikle: KUTU P Küçük çanta KUTU F KUTU A 20 C de saklanır 20 C de saklanır 2 / 8 C DE SAKLANIR 15 / 25 C DE SAKLANIR Önerilen sıcaklıkta saklandığında, tüm test reaktifleri son kullanım tarihine kadar stabil kalır. 3. KULLANIM İÇİN ÖNLEMLER Kit; moleküler biyoloji tekniklerini diagnostikte uygulama eğitimi almış ve tecrübesi olan araştırmacı tarafından kullanılmalıdır; Kit prosedürüne başlamadan önce kullanım kılavuzunu dikkatlice ve tamamen okuyun; Ürünleri ısı kaynağından uzakta tutun; Son kullanım tarihi geçmiş kit parçalarını kullanmayın; Saklama koşulları, kutu bütünlüğü ya da metod uygulaması ile ilgili herhangi bir şüpheniz olduğunda, AB ANALITICA teknik destek ile bağlantı kurun: laboratorio@abanalitica.it. Nükleik asitlerin amlifikasyonunda, araştırmacı aşağıdaki özel önlemleri almalıdır: Filtreli uç kullanın; Biyolojik örnekler, ekstrakte edilmiş DNA, kit içeriğindeki pozitif kontrol ve tüm amplifikasyon ürünleri, amplifikasyon reaktiflerinden farklı bir yerde saklanmalıdır. 4
7 PCR öncesi ve sonrası için farklı alanlar hazırlayın ve iki alan arasında materyal (pipetler, uçlar, tüpler, vs.) paylaşımı yapmayın. Sık sık eldiven değiştirin. Benç yüzeyini %5 sodyum hipoklorit ile temizleyin. Kullanımdan önce reaktifleri oda ısısında eritin. Taq polymerase ve ekstrakte DNA yı hızlı bir şekilde oda ısısında ve buzkalıbı üzerinde ekleyin. 4. GÜVENLİK KURALLARI 4.1. Genel Güvenlik Kuralları Reaktifler ve klinik örnekler ile çalışırken tek kullanımlık eldiven kullanın ve çalışma bitiminde ellerinizi yıkayın. Ağızla pipetleme yapmayın. Bilinen hiçbir diagnostik metod enfeksiyon ajanlarının yokolduğunun garantisini vermediğinden, herbir klinik örneğin potansiyel enfeksiyonlu olduğu göz önünde bulundurulup, bu şekilde çalışılması gereklidir. Klinik örnekler ile direk temasta olan cihazların kontaminasyonlu olduğu ve bu şekilde kullanılması gerektiği göz önüne alınmalıdır. Örneklerin kazara etrafa dökülmesi durumunda, %10 Sodyum Hipoklorit ile temizleyin. Temizlenmiş materyaller, kontamine ürünler için olan özel konteynerlere atılmalıdır. Klinik örnekler, materyaller ve kontamine ürünler aşağıdaki dekontaminasyondan sonra atılmalıdır: 30 dakika %5 Sodyum Hipoklorit (1 volüm %5 Sodyum Hipoklorit solusyonu herbir 10 volüm kontaminasyonlu sıvı için) solusyonuna batırılmalı YA DA en az 2 saat 121 C de otoklavlanmalı (NOT: Sodyum Hipoklorit içeren solusyonları otoklavlamayın!!) 5
8 4.2. Kit Hakkında Güvenlik Kuralları Bu kit kullanımı için riskler tekli komponentler ile ilişkilidir: Tehlikeli Komponentler: ETHIDIUM BROMIDE 3,8-diamino-1-ethyl-6-phenylphenantridiumbromide (Ethidium Bromide) <2% Risk tanımı: T (Toksik) RİSK İBARESİ VE S İBARESİ R 23 ve R 68 S 36/37 45 İnhalasyon için toksik. Geri dönülmez etkiler riski. Laboratuar giysisi ve tek kullanımlık eldiven kullanın. Kaza veya rahatsızlık durumlarında, doktora başvurun ve paket etiketini gösterin. R ve S ibareleri kit ile sağlanan konsantre ürünlere işaret etmektedir. Özellikle Ethidium Bromide için, agaroz jelde dilusyona kadar. Konsantre Ethidium Bromide uygulamasında kimyasal dağıtıcı buharlı kabin kullanın. Seyreltilmiş Ethidium solusyonu ile çalışırken daima laboratuar giysisi ve tek kullanımlık eldiven giyin. Bu ürünler genel çöplere atılamaz. Kurutucu system kullanılmamalıdır. Atılım için yasal kuralları uygulayın. Ethidium Bromide kaza ile dökülmesi durumunda Sodyum Hipoklorit ve su ile temizleyin. İstenildiğinde Ethidium Bromide Güvenlik data sheet (MSDS) gönderilebilir. 6
9 5. KİT İÇERİĞİNDE BULUNMAYAN GEREKLİ MATERYALLER 5.1. Reaktifler Steril DNase ve RNase free su; Distile su; 5.2. Cihazlar Laminar flow kabini (kontaminasyondan korunmak için amplifikasyon premikse TAQ polymerase eklenirken kullanılması önerilir; ekstrakte DNa eklenirken başka bir laminar flow kabini kullanılması önerilebilir); Mikropipetler (aralık: 0,2-2 µl; 0,5-10 µl; 2-20 µl); Thermalcycler; Tartı; Manyetik ısıtıcı ya da mikrodalga; Mikrosantrifüj (max rpm); Kimyasal kabin (Ethidium Bromide uygulamasında kullanılması önerilir); Agaroz minijel için yatay elektroforez haznesi; Güç kaynağı ( V); UV Transilluminator; Foto kamera ya da imaj analizör Materyaller Tek kullanımlık eldivenler; Tek kullanımlık filtreli uçlar (aralık: 0,2-2 µl; 0,5-10 µl; 2-20 µl); TBE dilusyonu için dereceli silindirler (1L); Agaroz jel hazırlamak için pyrex şişe ya da Becker; Parafilm. 7
10 6. REAKTİFLERİ HAZIRLAMA 1 L TAE Buffer (1X) hazırlamak için: 20 ml 50X TAE ile 980 ml distile suyu karıştırın. 8
11 7. GİRİŞ Pneumocystis carinii immunbaskılı hastalarda (organ nakli olmuş, onkolojik ya da AIDS hastaları) pnömoninin en sık etiyolojik ajanı olan her yerde bulunan bir patojendir. P.carinii birinci yaşındaolan çocukları etkileyen (doğumda asla) belirli ve ciddi interstisyel pnömoni formundan da sorumludur (H. M. Ginzburg, 1996). P.carinii etrafında nötral mukopolisakaritten zengin bir kapsül ile sferoid ya da küçük yumurta-şekilli hücreler ile korpuskular bir forma sahiptir. İlk stadyumda (hücreiçi faz) patojen pulmoner alveolide deskuamat olan ve proliferasyonu stimule eden alveolar hücreler tarafından fagosite edilmiştir. İkinci stadyumda alveolar hücrelerin disgregatif fenomenine göre gözenekli bir durum ile keskin bit eozinofil reticulum endoalveolar ve endobronşiyal seviyede bulunmuştur. Parazit kültür analizi genellikle zordur ve histolojik metodlar çok spesifik ve duyarlı değildir (Grocott-Gomori, toluidine blueo, Giemsa ya da Wright boyası ile boyanan sito-histolojik örnekler). Monoklonal antikor kullanımı (immunofloresanda), duyarlılık hala şüpheli olmasına rağmen test özgünlüğünü artırır. Yıllardır P. carinii enfeksiyonları invaziv prosedürlerle elde edilen örneklerin analizi ile klinik olarak tanımlanmıştır; PCR tekniklerinin gelişmesi elde edilmesi ve spesifik DNA dizilerinin amplifikasyonu kolay olan patolojik örneklerin kullanılabilmesini sağlamıştır. Metod bu parazitin belirlenmesi için oldukça duyarlı ve özgündür (A. E. Wakefield ve ark., 1990). Bu kitte PCR tekniği farklı biyolojik dokularda P.carinii enfeksiyonu belirlemesi için kullanılır: Pulmoner biyopsi (taze, donmuş ya da parafine gömülü), bronkoalveolar lavaj (BAL), çekilmiş tükürük, bronkoaspirat, balgam, nazofaringeal aspirat, kan ve serum (ekstrapulmoner enfeksiyon için). 9
12 8. TEST PRENSİBİ PCR (Polimeraz Zincir Reaksiyonu) literatürlerde ilk DNA amplifikasyonu metodudur. (Saiki RK ve arkadaşları, 1985). Thermostable DNA polymerase ile DNA nın spesifik bir parçasının (hedef dizi) in vitro amplifikasyon reaksiyonu olarak tanımlanabilir. Reaksiyonda nükleik asitin üç segmenti yer alır: Amplifiye olması için çift iplikli DNA kalıbı (hedef DNA) ve iki tek iplikli oligonükleotid primerler kalıp DNA ya spesifik olarak dizayn edilmiştir. DNA polymerase primerler tarafından işaretlenen bölgeden sentez işlemine başlar ve solusyonda serbest olarak bulunan tamamlayıcı nükleotidlerin (dntpler) eklenmesi ve bağlanması ile orjinal çift iplikli hedef DNA bölgesi ile aynı olan yeni çift iplikli DNA molekülünü sentezler. Çeşitli sikluslardan sonra, hedef diziye uygun olan milyonlarca DNA molekülü oluşturabilir. Bu testin duyarlılığı, laboratuar tanısında uygulamaya olanak sağlar. Amplifikasyon reaksiyonunun geniş biyolojik örneklerde uygulanabilmesinin yanında, PCRın oldukça küçük DNA segmentlerini de amplifiye edebilmesinden başlangıç DNAsı kısmi olarak yıkılabilir. 9. ÜRÜN TANIMI PCP kit metodu, bu patojenik mikroorganizmanın belirlenmesi için spesifik P. carinii genomunun yüksek korunan rrna 5S bölgesinin amplifikasyonundan ibarettir. Bu kit, TST- thiosulfate sulfurtransferase -rhodanese geni (amplifikasyonun kontrolü) amplifikasyonu ile amplifikasyon için ekstrakte DNAnın uygunluğunu da değerlendirmeyi sağlar. TST gen amplifikasyonunda negatif bir sonuç ya amplifikasyon reaksiyonunun inhibitörlerinin görüldüğünü ya da DNAnın oldukça yıkıldığını işaret eder. Bu metod, olası yanlış negatif sonuçları tanımlamakta kullanıcıya yardımcı olur. Kit, amplifikasyon için bir de amplifikasyonun pozitif kontrolünü sağlar. Pozitif kontrol amplifikasyonu başarılı ise bu rekasiyonun doğru çalıştığını garanti eder. Bu kontroller kullanıcı için tehlikeli değildir, çünkü P. carinii genomunun sadece bir parçasını içeren plazmid DNAdırlar. 10
13 PCP kit premiks formatındadır: Amplifikasyon için tüm reaktifler pre-mikstir ve Taq polymerase ve ekstrakte DNA eklenebilecek şekilde tekdoz test tüplerinde alikuatlanmıştır. Bu premiks formatı, kullanıcı için zaman kazancı ile amplifikasyon öncesi manipulasyon aşamalarını azaltır; reaktiflerin tekrar tekrar dondurup çözülmesini engeller ve hepsinden öte, bu format kontaminasyon riskini minimize eder, risk yanlış pozitif sonuçlara neden olur. Bu nedenle, daima uygun amplifikasyon kontrollerini kullanmayı önerir. 11
14 10. ÖRNEK TOPLAMA, MANİPULASYON VE ÖN- MUAMELESİ Mikrobiyoloji analizi ve moleküler biyoloji ile P. carinii enfeksiyonunun belirlenmesi için kullanılan örnekler solunumsal örnekler (bronkoalveolar lavaj (BAL), çekilmiş tükürük, balgam, salgı, bronkoskopiile elde edilen bronşiyal sekresyon) ve diğer solunumsal olmayan örneklerdir (pulmoner ve limfonodal biyopsiler, kan ve serum) Solunumsal örnekler Biyolojik örnek toplama sırasında kullanıcının güvenliği için her bir klinik örneği potansiyel enfeksiyon ajanı olarak kabul etmek ve bu şekilde uygulamak iyi bir kuraldır. Balgam toplama ve enfekte mikroorganizmanın etrafından diffuzyona neden olan bronkoskopi uygun bir odadada yapılmalı ve çalışan uygun koruyucu bariyerler kullanmalıdır. Solunumsal örnekler (salgı) N-acetil-L-cysteine (1,5%) ya da dithiothreitol (0,1%) dilusyonu ile akışkan olmalıdır, solvent salgı ile eşit miktarda eklenmelidir (direk toplama kutusuna) ve materyalin tutarlılığına göre 37 C de dakika bırakılmalıdır. Genellikle solunumsal örnekler 4% NaOH solusyonu eklenmesi ile dekontamine edilir, santrifüjden sonra HCl ile nötralize edilir. Elde edilen pellet PBS de suspense edilir. Toplama kutusu steril, çevirmeli kapaklı ve tek kullanımlık olmalıdır. Önemli bir deneyime sahip olmak için örnek tükürük olmamalıdır, fakat derin solunumsal bölgeden bir örnek olmalıdır. Taze ya da dekontamine örnekler kısa bir süre için (48 saaatten uzun değil) + 2 / + 8 C de ya da uzun periyotlar için (birkaç ay için) -20 C de saklanmalıdır. 12
15 10.2. Histolojik örnekler Histolojik örnekler pulmoner ve lenfonodal biyopsiler, taze, donmuş formalin fikse ve parafine gömülü örneklerdir. Biyopsi örneği toplanması rutin olarak yapılmalıdır. Taze biyopsiler toplamadan birkaç dakika içinde çalışılmalı veya likit nitrojen ile hızlıca dondurulmalıdır ve sonra enzimatik sindirimi takiben steril kesici kullanarak mekanik kesilmeye kadar -80 C de saklanmalıdır. Fikse ve parafine gömülü biyopsilerde Lilie formülü olarak %10 sodyum ve potasyum tuzları ile ph 7 de formalin buffer kullanmanızı öneririz. Buffer olmayan Bouin, Holland ve diğer asidik fiksatifler (osmik asit gibi) olan formalinde fikse edilmiş dokular sonraki nukleik asit ekstraksiyonu için uygun değildir, çünkü bu maddeler dokuda sindirilemeyen çapraz-bağlar meydana getirirler. Taze ya da donmuş histolojik örneklerde (yaklaşık 50 mg a kadar), steril kesici kullanarak dokunun hemen mekanik sindiriminin yapılması önerilir. Bu operasyonu cam slayt üzerinde yapın ve 1XPBS buffer alikuatı ekleyin. Sonra Pasteur pipeti kullanarak doğranmış dokuyu tüpe aktarın ve örnek sindirimi ile devam edin. Bu durumda, histolojik örnek fikse edilir ve parafine gömülür, ilk olarak parafin uzaklaştırılır ve enzimatik sindirim yapılır Kan P. carinii araştırması ekstrapulmoner ya da diffüz enfeksiyonlarda en iyi materyal olan kandan başlayabilir. Örnek toplama tüm genel sterilite önlemlerini takip etmelidir. Aktarım için transport medyum içermeyen steril kutular kullanın. Kan EDTAlı olarak alınmalıdır. Heparin gibi diğer koagülasyon ajanları TAQ polymerase ın güçlü inhibitörleridir ve bu yüzden amplifikasyon reaksiyonunun verimliliğini bozar. Taze kan +2/+8 C de saklanmalıdır (toplamadan 4 saat içinde uygulayın), eğer DNA kısa süre sonar ekstrakte edilmeyecekse örneği dondurmak gerekir. DNA ekstraksiyonundan önce, Ficoll-Hypaque sistem ya da eritrosit lizis ile lenfosit izolasyonu için ilk aşama gereklidir. 13
16 11. AMPLİFİKASYON PROTOKOLÜ DNA EKSTRAKSİYONU Solunumsal ve histolojik örneklerden DNA ekstraksiyonu için AB ANALITICA CLEAN DNA kiti (AB ANALITICA, kod ), kit ile standardize edilmiş, kullanmanızı önerir. Bu metod, taze, donmuş ya da fikse ve gömülü dokuların sindirimi için Proteinaz K kullanımını gerektirir. Doku sindirimi bütün gece yapılmalıdır. Başka bir ekstraksiyon metodu kullanılabilir. Bu durumda, TST (10 μl) ve P.carinii (10 μl) amplifikasyonu için paragraf ve de belirtilen ekstrakt miktarı AB ANALITICA metodu ile elde edilen ekstrakta referanstır. Alternatif ekstraksiyon metodları kullanıldığında, eğer amplifikasyon için DNA solusyon miktarı 10 μl den düşükse su ekleyerek amplifikasyon miks miktarı ayarlanmalıdır. 14
17 11.2. DNA AMPLİFİKASYONU TST DNA amplifikasyonu Her bir premiks tüpüne (mavi tüpler) ekleyin: AB Taq Ekstrakte DNA 0,5 μl 10 μl Analiz etmek için örneklerin yanında daima bir negatif kontrol (mikse DNA yerine su ekleyin) ve 10 µl pozitif kontrol (bir genomik DNA) amplifiye edilmelidir Pneumocistis carinii DNA amplifikasyonu Her bir premiks tüpüne (yeşil tüpler) ekleyin: AB Taq Ekstrakte DNA 0,5 μl 10 μl Analiz etmek için örneklerin yanında daima bir negatif kontrol (mikse DNA yerine su ekleyin) ve 10 µl pozitif kontrol (bir genomik DNA) amplifiye edilmelidir. Kısa bir süre santrifüj edin ve test tüplerini (TST ve Pneumocistis carinii) aşağıdaki programda thermalcyclera koyun: 1 cycle 95 C 5 min 40 cycles 95 C 60 C 72 C 1 min 1 min 2 min 1 cycle 72 C 5 min Amplifikasyon fragman uzunluğu: TST: 202 bp Pneumocistis carinii:: 120 bp 15
18 11.3. AMPLİFİKASYON ÜRÜNLERİNİN GÖRÜNTÜLENMESİ Agaroz jel elektroforezi %3 agaroz jel hazırlanması: 1,5 g Agaroz tartın ve 50 ml 1X TAE içine dökün. Solusyonu berrak oluncaya kadar manyetik ısıtıcı ya da mikrodalga içine bırakın. Jeli el ile dokunabilecek kadar soğumaya bırakın (3-5 dakika) ve 10 µl Ethidium Bromide (2,5 mg/ml) ekleyin. NOT: Ethidium Bromide güçlü bir mutajenik ajandır: Daima eldiven kullanın ve bu reaktifle ya da içeren jel ile çalışırken tercihen kimyasal güvenlik kabini altında çalışın. Jeli tarakları ile birlikte uygun bir dökme tankına koyun ve oda ısısında soğuyana kadar bekleyin ya da jel katı hale gelene kadar buzdolabına koyun. Jel katılaştığında, dikkatlice tarakları çıkarın (jel kuyucuklarına zarar vermemeye dikkat edin), tankı elektroforez haznesine alın ve jelin üzerini tamamen kaplayana kadar uygun miktarda TAE buffer ekleyin (yaklaşık jel yüzeyinin 1-2mm üzerinde) Örnek yükleme Test tüpünde ya da direk parafilmde aşağıdakileri karıştırın: 2 μl 6X Blue 10 μl PCR ürünü Ya da moleküler ağırlık markır (MW markır) Miski jel kuyucuklarına yükleyin; güç kaynağını açın ve voltajı V arasına ayarlayın dakika jeli yürütün ve sonra UV transilluminatore koyun; amplifikasyon ürünlerinin boyutunu referans Moleküler Ağırlık Markırı ile karşılaştırarak analiz edin. *DNA Moleküler Ağırlık Markır (MW): , 404, 353, 242, 190, 147, 110, 89, 67, 34, 26 bp. NOT: %3 agaroz jelde bp bantlar genellikle tam olarak çözülmez ve tek bir bant olarak görülür; 26 ve 34 bp bantları bazen görünmek için çok küçük olur (düşük moleküler ağırlıklarından dolayı). 16
19 NOT: UV ışınları deri ve en önemlisi gözler için tehlikelidir: daima eldiven ve koruyucu gözlük kullanın ya da UV transilluminatorün koruyucu ekranını kullanın Sonuçların yorumlanması: TST ve Pneumocistis carinii DNA amplifikasyonu Kontroller aşağıdaki sonuçları göstermelidir: KONTROL SONUÇ YORUM Pozitif kontrol POZİTİF Amplifikasyon doğru çalışır. Negatif kontrol NEGATİF Kontaminasyon yokluğu Agaroz jelde bandların yorumları aşağıdaki tablodaki gibi olmalıdır: SONUÇ YORUM TST band yokluğu Örnek amplifikasyon için uygun değildir (DNA ekstraksiyonunu tekrar edin) TST band varlığı Amplifiye olabilir örnek P. carinii band yokluğu TST band varlığı P. carinii band varlığı P. carinii negatif Amplifiye olabilir örnek P. carinii pozitif Pozitif örneğin tarama için aspesifik fragman vermesi olasıdır; bu analiz ile alakası olmayan başlangıç klinik örneğinin (örneğin parafine gömülü materyal) tipolojisine bağlı olabilir. Daha fazla detaylı bilgi için AB ANALITICA teknik destek ile irtibata geçin( faks N
20 120 bp Figür 1: Agaroz jel elektroforezi 1. DNA Moleküler Ağırlık Markır 2. Pozitif kontrol 3. P. carinii için pozitif örnek 18
21 12. SORUN GİDERME 1. Hem amplifikasyon ürünü hem de pozitif control DNA bandı yoksa TAQ polymerase premikse doğru eklenememiştir -Uygun volümde pipet ve uçlar kullanın (pipet aralığı 0,2-2 μl); -Görsel olarak TAQ polymerasın premikse difüze olduğunu gözleyin: Bu basittir, çünkü enzim, yüksek bir densiteye sahip olan gliserolde çözülür; Alternative olarak, tüp duvarına konulmuş olan TAQ polymerasın görsel olarak teyit edin, sonra kısa bir süre santrifüj edin. Thermalcycler doğru olarak programlanmamıştır Thermalcycler programının uygunluğunu ve kullanıcı kılavuzundaki sıcaklık profilini kontrol edin. Kit uygun şekilde çalışmaz -Premiks, TAQ polymerase ve pozitif kontrolü -20 C de saklayın; -Premiks ve reaktifleri tekrar tekrar dondurup/çözdürmekten sakının. 2. Test edilen örnekte pozitif kontrol için iyi bir bant vardır fakat ne TST ne de P. carinii için amplifikasyon bandı yoktur Ekstraksiyon aşaması sırasında olası problemler: Ekstraksiyon metodunun uygun olduğundan ve tüm bilgileri doğru şekilde takip ettiğinizden emin olun; Ekstraksiyon kitinin sorun giderme bölümüne başvurun; Yeni bir örnek ile doğru şekilde tekrar DNA ekstraksiyonu yapın. Amplifikasyon inhibe olmuştur Başlangıç örneğini distile su ve TE ile seyreltin; Küçük miktarda klinik örnekten DNA ekstraksiyonunu tekrar edin; Uygun ekstraksiyon sistemi kullanın. 19
22 3. Agaroz jel elektroforezinden sonra aspesifik ya da ekstraband görülmesi Thermalcycler sıcaklık değişimlerini çok yavaş yapın Thermalcycler değişikliklerini uygulayın. Amplifikasyon reaksiyonunun hazırlanması oda ısısında çok uzun zaman alır. Oda ısısında çalışma zamanınızı hızlandırın; Buz kalıbı üzerinde çalışın. Ekstrakte DNA purifiye edilmiştir İyi bir örnek purifikasyonu sağlayan ekstraksiyon sistemi kullanın. Başlangıç örnekleri yıkılmış DNA içerir Ekstraksiyon aşamasını başka bir başlangıç klinik örneği kullanarak tekrarlayın; Örneğin uygun yolla toplanıp saklandığından emin olun. Daha fazla detaylı bilgi için AB ANALITICA teknik destek ile irtibata geçin( faks N
23 13. TEST LİMİTLERİ Kit performansı aşağıdaki durumlarda azalır: Klinik örnekler bu analize uygun değildir (doğru saklanmamış histolojik örnekler için nötral formalin fiksatifinden farklı bir fiksatif kullanın). Amplifikasyon reaksiyonunun inhibitörlerinin görülmesi ya da uygun olmayan ekstraksiyon sistemi kullanılması nedeniyle DNA amplifiye olmaz. Kit önerilen sıcaklıkta saklanmamıştır. 14. TEST PERFORMANSI Özgünlük En önemli bilgi bankasındaki primer dizi sıralaması spesifik olmayan dizilerin yokluğunu gösterir ve Pneumocistis carinii amplifikasyonunu garanti eder. Diğer patojenik mikroorganizmaların genomik DNA ya da nukleik asitleri ile çapraz reaksiyon görülmemiştir Diagnostik ve analitik duyarlılık Moleküler analiz (PCR) için Pneumocistis carinii araştırması için optimal klinik örnek bronkoalveolar lavaj (BAL) ve pulmoner biyopsilerdir. Bu durumda testin duyarlılığı ve özgünlüğü yaklaşık %100 dür. Çekilmiş tükürük (IS) ve trakeobronşiyal aspiratlar gibi klinik örneklerde testin duyarlılık ve özgünlüğü % 86,2-60 a kadar düşer. 21
24 15. BİBLİYOGRAFYA H. M. Ginzburg, Emerging Infectious Diseases; Vol. 2, No. 2, April-June, 1996 A. E. Wakefield et al., Detection of Pneumocistis carinii with DNA amplification; Lancet, Vol. 36, 336: ,
25 16. SİPARİŞ İÇİN BİLGİLER PCP: rrna 5S bölgesinde amplifikasyon ile Pneumocystis carinii DNA belirlemesi için kit. Kod Ürün Pkg 03-20A-25 PCP - Pneumocystis carinii 25 test 03-20A-50 PCP - Pneumocystis carinii 50 test İlgili ürünler CLEAN DNA: CLEAN DNA: Taze, donmuş ve formalin-fikse ve parafine-gömülü histolojik örneklerden, farklı biyolojik sıvılardan, katı ve likit medyumda mikrobiyal hücresel kültürden fenol-kloroform kullanmadan spin-kolon yöntemi ile hızlı DNA ekstraksiyonu ve purifikasyonu için kit. Kod Ürün Pkg CLEAN DNA 50 test CLEAN DNA 100 test 23
26 24
27
28 AB ANALITICA srl - Via Svizzera PADOVA, (ITALIA) Tel Fax info@abanalitica.it
Ampliquality CHLAM-T Kod 03-10A Kod 03-10R
KULLANICI KILAVUZU Ampliquality CHLAM-T Kod 03-10A Kod 03-10R Chlamydia trachomatis Belirlemek için kit 0123 1. ÜRÜN BİLGİSİ...3 2. KİT İÇERİĞİ...4 3. REAKTİFLERİ SAKLAMA KOŞULLARI...6 4. KULLANIM İÇİN
DetaylıREF A Helicobacter pylori Belirlemek için kit
KULLANICI KILAVUZU HP REF. 03-11A Helicobacter pylori Belirlemek için kit 1. KİT İÇERİĞİ 3 2. REAKTİFLERİ SAKLAMA KOŞULLARI 4 3. KULLANIM İÇİN ÖNLEMLER 4 4. GÜVENLİK KURALLARI 5 4.1. Genel güvenlik kuralları
DetaylıVDR KOD A Vitamin D reseptör geninde (vdr) polimorfizmlerin belirlenmesi için kit
KULLANICI KILAVUZU VDR KOD. 04-49A Vitamin D reseptör geninde (vdr) polimorfizmlerin belirlenmesi için kit 1. KİT İÇERİĞİ 3 2. REAKTİFLERİ SAKLAMA KOŞULLARI 4 3. KULLANIM İÇİN ÖNLEMLER 4 4. GÜVENLİK KURALLARI
DetaylıAmpliquality HPV-HL Kod 03-31A Kod 03-31R
KULLANICI KILAVUZU Ampliquality HPV-HL Kod 03-31A Kod 03-31R Yüksek ve düşük onkojenik risk-ilişkili genotiplerin tanımlanması için Human Papillomavirus tiplendirme kiti 1. ÜRÜN BİLGİSİ... 3 2. KİT İÇERİĞİ...
DetaylıAmpliquality HPV-HS Kod 03-28A Kod 03-28R
KULLANICI KILAVUZU Ampliquality HPV-HS Kod 03-28A Kod 03-28R Human Papillomavirus Yüksek duyarlı tarama ve tiplendirmesi için kit 1. ÜRÜN BİLGİSİ... 3 2. KİT İÇERİĞİ... 4 3. REAKTİFLERİ SAKLAMA KOŞULLARI...
DetaylıKULLANICI KILAVUZU. Genequality P53 Kod 04-22A. SSCP ile p53 gen mutasyonlarını Tarama kiti A-25_ _TR.doc6
KULLANICI KILAVUZU Genequality P53 Kod 04-22A SSCP ile p53 gen mutasyonlarını Tarama kiti 1. ÜRÜN BİLGİSİ 3 2. KİT İÇERİĞİ 4 3. REAKTİFLERİ SAKLAMA KOŞULLARI 6 4. KULLANIM İÇİN ÖNLEMLER 6 5. GÜVENLİK
DetaylıBCL2 KOD A Bcl-2 geninde t(14;18) (q32;q21) Translokasyonunu belirlemek için kit
KULLANICI KILAVUZU BCL2 KOD. 04-28A Bcl-2 geninde t(14;18) (q32;q21) Translokasyonunu belirlemek için kit 1. KİT İÇERİĞİ 3 2. REAKTİFLERİ SAKLAMA KOŞULLARI 4 3. KULLANIM İÇİN ÖNLEMLER 4 4. GÜVENLİK KURALLARI
DetaylıGENEQUALITY DDK/G17 KULLANICI KILAVUZU. Kod 04-44A Kod 04-44R
KULLANICI KILAVUZU GENEQUALITY DDK/G17 Kod 04-44A Kod 04-44R Duchenne ve Becker muskuler distrofi için gende 3, 4, 6, 8, 13,17, 19, 43, 44, 45,47, 48, 49, 50, 51, 52, 60 delesyonlarının belirlenmesi için
DetaylıAmpliquality HSV 1/2 Kod 03-75A Kod 03-75R
KULLANICI KILAVUZU Ampliquality HSV 1/2 Kod 03-75A Kod 03-75R Tip 1 ve 2 Herpes Simplex Eş zamanlı tanımlaması için kit 1. ÜRÜN BİLGİSİ 5 2. KİT İÇERİĞİ 6 3. REAKTİFLERİ SAKLAMA KOŞULLARI 7 4. KULLANIM
DetaylıAMPLIQUALITY CMV REF A ref R
KULLANICI KILAVUZU AMPLIQUALITY CMV REF. 03-22A ref. 03-22R Human Cytomegalovirus Belirlemek için kit 0123 1. ÜRÜN BİLGİSİ... 3 2. KİT İÇERİĞİ... 4 3. REAKTİFLERİ SAKLAMA KOŞULLARI... 5 4. KULLANIM İÇİN
DetaylıRTA JEL / PZR Saflaştırma Kiti
RTA JEL / PZR Saflaştırma Kiti Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi - 2011-12 DNA parçalarının agaroz jelden geri kazanımı ve PZR ürünlerinin saflaştırılması için Yalnızca profesyonel kullanım için REF 09009050
DetaylıRTA Kandan Genomik DNA İzolasyon Kiti
RTA Kandan Genomik DNA İzolasyon Kiti Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi - 2011-05 IVD İnsan kan örneklerinden in vitro tanı amaçlı genomik nükleik asit izolasyon ve saflaştırması için In vitro tanı amaçlı
DetaylıAvian Flu Screening&Typing H5, H7
REF V-34-50R VER 04.03.08 Avian Flu Screening&Typing H5, H7 Kullanılan Semboller REF Liste Numarası 2-8 C/ -20 C de saklayın RUO Sadece Araştırma Kullanımı için Dikkat! LOT Lot Numarası VER Versiyon Son
DetaylıRTA DNA qpcr Probe Master Mix
RTA DNA qpcr Probe Master Mix Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi -- 2012-01 DNA'nın gerçek zamanlı tayini ve miktar ölçümü için Yalnızca profesyonel kullanım için REF 09030025 25 test 09030100 100 test 09030500
Detaylıattomol apo B-100 quicktype
attomol apo B-100 quicktype İnsan apolipoprotein B-100 (apo B-3500 mutasyonu) gen inde 10708G>A geçiş tespitine yönelik kit Sadece in vitro diagnostik kullanım içindir! 20 tespit sipariş numarası: 1015
DetaylıRTA Dokudan ve Parafine-Gömülü Dokudan Genomik DNA İzolasyon Kiti
RTA Dokudan ve Parafine-Gömülü Dokudan Genomik DNA İzolasyon Kiti Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi - 2011-05 IVD İnsan dokusu ve parafine gömülü doku örneklerinden in vitro tanı amaçlı genomik nükleik asit
DetaylıSTR-VNTR REF A REF R
KULLANICI KILAVUZU STR-VNTR REF. 04-20A REF. 04-20R Allojenik kemik iliği transplantasyonunun aşılanmasının izlenmesi için kit. 04-20A-25_8033622781240_TR.doc AB ANALITICA srl - Via Svizzera 16-35127
DetaylıRTA Plazmid DNA İzolasyon Kiti
RTA Plazmid DNA İzolasyon Kiti Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi - 2011-12 Bakteri örneklerinden plazmid DNA izolasyonu ve saflaştırılması için Yalnızca profesyonel kullanım için REF 09007050 50 test 09007100
Detaylıattomol HLA-B*27 Sadece in vitro diagnostik kullanım içindir! 1.Giriş 2. Genel Açıklamalar
attomol HLA-B*27 HLA-B*27 in tespitine yönelik kit (Doku tiplemesi için kullanmayın!) Sadece in vitro diagnostik kullanım içindir! 40 tespit sipariş numarası: 1030 1.Giriş İnsan lökosit antijenleri(hla)
DetaylıBRCA 1/2 DNA Analiz Paneli
FAST-BRCA Sequencing Kit BRCA 1/2 DNA Analiz Paneli Dizi Analizi Amaçlı Kullanım İçin KULLANIM KILAVUZU İÇİNDEKİLER 1 GİRİŞ... 3 2 KİT İÇERİĞİ... 3 3 SAKLAMA... 3 4 GEREKLİ MATERYAL VE CİHAZLAR... 3 5
DetaylıKistik Fibrozis DNA Analiz Paneli
FAST-CFTR Sequencing Kit Kistik Fibrozis DNA Analiz Paneli Dizi Analizi Amaçlı Kullanım İçin KULLANIM KILAVUZU İÇİNDEKİLER 1 GİRİŞ... 3 2 KİT İÇERİĞİ... 3 3 SAKLAMA... 3 4 GEREKLİ MATERYAL VE CİHAZLAR...
DetaylıMitokondrial DNA Analiz Paneli
FAST-mtDNA Sequencing Kit Mitokondrial DNA Analiz Paneli Dizi Analizi Amaçlı Kullanım İçin KULLANIM KILAVUZU İÇİNDEKİLER 1 GİRİŞ... 3 2 KİT İÇERİĞİ... 3 3 SAKLAMA... 3 4 GEREKLİ MATERYAL VE CİHAZLAR...
DetaylıProtokolü PD S Reaksiyon
Salmonella sp. Real time PCR Tespit Kiti Protokolü PD S00 0 50 Reaksiyon REŞİT GALİP CADDESİ 74-7 06700 ÇANKAYA, ANKARA, TÜRKİYE T +90 32 447 22 79 / 80 F +90 32 447 22 07 www.bmlabosis.com İnternal Pozitif
DetaylıKromozom, DNA ve Gen. Allel Segregasyonu. DNA çift sarmalı. Hastalık yapan mutasyonlar protein fonksiyonunu bozar. Hastalık yapan mutasyonlar
Temel Genetik Kavramlar DNA izolasyon yöntemleri Kromozom, DNA ve Gen Hücre Nukleus Kromozomlar Gen Prof.Dr.Uğur ÖZBEK Protein DNA çift sarmalı Allel Segregasyonu Şeker Fosfat omurga Bazlar Baz çifti A
DetaylıPOLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU (PZR-PCR) VE RESTRİKSİYON PARÇA UZUNLUĞU POLİMORFİZMİ (RFLP)
Deney: M 1 POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU (PZR-PCR) VE RESTRİKSİYON PARÇA UZUNLUĞU POLİMORFİZMİ (RFLP) a) PCR yöntemi uygulaması b) RPLF sonuçları değerlendirilmesi I. Araç ve Gereç dntp (deoksi Nükleotid
DetaylıRTA Bakteriden Genomik DNA İzolasyon Kiti
RTA Bakteriden Genomik DNA İzolasyon Kiti Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi - 2011-12 IVD Bakteri örneklerinden genomik nükleik asit izolasyonu ve saflaştırılması için In vitro tanı amaçlı kullanım için Yalnızca
Detaylıattomol lactose intolerance C>T quicktype
attomol lactose intolerance -13910C>T quicktype İnsan laktase-genine karşı -13910C>T geçiş tespitine yönelik mutasyon testi Sadece in vitro diagnostik kullanım içindir! 20 tespit sipariş numarası: 1045
DetaylıProtokolü PD S001 01. 50 Reaksiyon
Salmonella sp. Real time PCR Tespit Kiti Protokolü PD S001 01 50 Reaksiyon REAKSİYON PRENSİPLERİ Reaksiyon Bileşenleri: qpcr Master Mix (PMM) Hedef probe Mix (HPM) Zenginleştirilmiş gıda ürünleri kültüründen
DetaylıRTA Mayadan Genomik DNA İzolasyon Kiti
RTA Mayadan Genomik DNA İzolasyon Kiti Kullanma Klavuzu Yayın Tarihi - 2011-12 Maya örneklerinden genomik nükleik asit izolasyonu ve saflaştırılması için Yalnızca profesyonel kullanım için REF 09002050
DetaylıINNO-LiPA HLA-DPB Amplifikasyon
INNO-LiPA HLA-DPB Amplifikasyon ANAHTAR-KODU: FRI33177 80345 INNO-LiPA HLA-C Amplifikasyon 28798 v1 2015-04-24 p 1/7 Türkçe Tarafından üretildi: Fujirebio Europe N.V. Technologiepark 6 9052 Gent Belgium
DetaylıRT-PCR. (reverse transckripsiyon-polimeraz zincir reaksiyonu) Dr Gülnur Güler
RT-PCR (reverse transckripsiyon-polimeraz zincir reaksiyonu) Dr Gülnur Güler RT-PCR (reverse transckripsiyon-polimeraz zincir reaksiyonu) mrna ekspresyon seviyelerini belirlemek için sensitiv bir metod
DetaylıRTA Viral DNA İzolasyon Kiti Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi - 2010-05
RTA Viral DNA İzolasyon Kiti Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi - 2010-05 IVD In vitro tanı amaçlı insan plazma ve serum örneklerinden viral nükleik asit izolasyon ve saflaştırılması için In vitro tanı amaçlı
DetaylıREAKSİYON PRENSİPLERİ
REAKSİYON PRENSİPLERİ Reaksiyon Bileşenleri: qpcr Master Mix (PMM) Hedef probe Mix (HPM) Zenginleştirilmiş gıda ürünleri kültüründen izole edilen DNA örneği Polimerase Chain Reaction (PCR): Son yıllarda
DetaylıEKSTRAKSİYON KİTİ AB SIMULTANEOUS RNA + DNA KIT Kod Kod
KULLANICI KILAVUZU EKSTRAKSİYON KİTİ AB SIMULTANEOUS RNA + DNA KIT Kod 05-53-25 Kod 05-53-50 Sitolojik örneklerden ve taze, donmuş, fikse ya da parafine gömülü dokulardan RNA ve DNA eş zamanlı ekstraksiyonu
DetaylıMANTAR ENFEKSİYONLARININ MOLEKÜLER YÖNTEMLERLE TANISI
MANTAR ENFEKSİYONLARININ MOLEKÜLER YÖNTEMLERLE TANISI Nilgün Çerikçioğlu Marmara Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı 1 İnvazif Mantar Enfeksiyonları (İME) Bağışıklık sistemi Morbidite-mortalite
DetaylıGenequality AZF MX Kod Kod Kod C Kod A Kod R
KULLANICI KILAVUZU Genequality AZF MX Kod Kod Kod. 04-23C Kod. 04-23A Kod. 04-23R AZF lokusda delesyonların tespiti için kit Compliant to the European Guidelines EAA/EQMN best practice guidelines for molecular
DetaylıPCR Bir reaksiyonun kurulması ve optimize edilmesi
Hafta V PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları PCR Bir reaksiyonun kurulması ve optimize edilmesi Doç. Dr. Hilâl Özdağ F Đ Z Đ K Đ A L T Y A P I Reaksiyonda kullanılanlar: P C R I. Kalıp DNA a) PCR degrade
DetaylıMAIA Pesticide MultiTest
MAIA Pesticide MultiTest GIDALARDA PESTİSiT KALINTILARI İÇİN AB MAKSİMUM KALINTI LİMİTLERİ İLE UYUMLU ÇOKLU KALINTI TARAMA TESTİ Microplate Acetylcholinesterase Inhibition Assay (MAIA) katı veya sıvı gıda
DetaylıAB CELIACHIA Kod 02-10C Kod 02-10A Kod 02-10R
KULLANICI KILAVUZU AB CELIACHIA Kod 02-10C Kod 02-10A Kod 02-10R DQ2 ve DQ8 haplotipleri ile ilişkili HLA alellerinin seçici amplifikasyonu ile CELIAC Hastalığının genetik yatkınlığını belirlemek için
DetaylıNÜKLEİK ASİTLERİN ELEKTROFOREZİ
T.C. FIRAT ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ BİYOLOJİ BÖLÜMÜ NÜKLEİK ASİTLERİN ELEKTROFOREZİ Yüksek Lisans Semineri Hazırlayan: Venhar ÇELİK Danışman: Yrd.Doç.Dr. Dilek Turgut-BALIK NÜKLEİK ASİTLERİN
Detaylıα1-antitrypsin quicktype
attomol α1-antitrypsin quicktype İnsan α-1 antitripsin gen inde M-, Z- and S-alellerin tespitine yönelik kit Sadece in vitro diagnostik kullanım içindir! Z-mutasyonun tespiti için 10 sipariş numarası:
DetaylıINNO-LiPA HLA-DRB Dekoder Amplifikasyon.
ANAHTAR-KODU: FRI24098 80341 INNO-LiPA HLA-DRB dekoder Amplifikasyon 28820 v2 2015-09-16 p 1/7 INNO-LiPA HLA-DRB Dekoder Amplifikasyon. Türkçe Tarafından üretildi: Fujirebio Europe N.V. Technologiepark
DetaylıListeria Monocytogenes Real time PCR Tespit Kiti
Listeria Monocytogenes Real time PCR Tespit Kiti Protokol PD LM00 0 50 Reaksiyon REŞİT GALİP CADDESİ 74-7 06700 ÇANKAYA, ANKARA, TÜRKİYE T +90 32 447 22 79 / 80 F +90 32 447 22 07 W www.bmlabosis.com İnternal
DetaylıINNO-LiPA HLA-DQA1 Multiplex
INNO-LiPA HLA-DQA1 Multiplex ANAHTAR-KODU: FRI92817 80704 INNO-LiPA HLA-DQA1 Multiplex 28804 v1 2015-05-20 p 1/7 Türkçe Tarafından üretildi: Fujirebio Europe N.V. Technologiepark 6 9052 Gent Belgium Tel.
DetaylıProtein Ekstraksiyonu
Protein Ekstraksiyonu Dr.Gaye Güler Tezel Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi Patoloji Anabilim Dalı Proteinler tüm canlı organizmalar için en önemli makromoleküllerden biridir. Bazıları yapısal komponentleri
DetaylıMikrobiyolojide Moleküler Tanı Yöntemleri. Dr.Tuncer ÖZEKİNCİ Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji A.D
Mikrobiyolojide Moleküler Tanı Yöntemleri Dr.Tuncer ÖZEKİNCİ Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji A.D 1 Enfeksiyonun Özgül Laboratuvar Tanısı Mikroorganizmanın üretilmesi Mikroorganizmaya
DetaylıKAPİLLER ELEKTROFOREZ DNA SEKANSLAMA
İçerik Giriş...2 Deney İçin Gerekli Olan Malzemeler...3 Deneyin Yapılışı... 4-9 Genomik DNA Kalıbının Hazırlanması...4 PCR Amplifikasyonu... 4-5 DNA Miktarının Belirlenmesi...6 Sekans Reaksiyonunun Hazırlanması...7
DetaylıSaMag Extraction kiti Kullanım Klavuzu
SaMag Extraction kiti Kullanım Klavuzu Sacace Biotechnologies SaMag-12 ve SaMag-24 otomatik ekstraksiyon sistemleri ile kullanım için SaMag V iral Nucleic Acid Extraction Kit (SM003) Sacace Biotechnologies
DetaylıRTA Viral Nükleik Asit İzolasyon Kiti
RTA Viral Nükleik Asit İzolasyon Kiti Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi - 2011-10 IVD In vitro tanı amaçlı insan serum veya plazma (EDTA) örneklerinden viral DNA ve RNA izolasyon ve saflaştırılması amacıyla
DetaylıNilgün Çerikçioğlu Marmara Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı
Nilgün Çerikçioğlu Marmara Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Kandolaşımı Enfeksiyonları %10 Kandidemi Ölüm hızı : % 50 (YBÜ) Erken tanı (?), tedavinin önemi Etken: Candida allbicans
DetaylıGenequality AZF MX EKSTANSİYON
KULLANICI KILAVUZU Kod Genequality AZF M EKSTANSİYON Kod Kod. 04-24A Kod. 04-24R AZF lokus da mikrodelesyonların ekstansiyon tespiti için kit Compliant to the European Guidelines EAA/EQMN best practice
DetaylıPerformans Özellikleri
Performans Özellikleri QIAamp DSP DNA FFPE Tissue Kiti, Sürüm 1 60404 Sürüm yönetimi Bu belge, QIAamp DSP DNA FFPE Tissue Kiti Performans Özellikleri, Sürüm 1, R3 belgesidir. Testi gerçekleştirmeden önce
DetaylıAgaroz jel elektroforezi
MOLEKÜLER TEKNİKLER Dr. Naşit İĞCİ Nevşehir Hacı Bektaş Veli Üniversitesi Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü 4. Sınıf (2017-2018 Bahar) 2. NOT Agaroz jel elektroforezi PAGE daha çok proteinlerin ve küçük
DetaylıGenequality JAK-2 Kod 04-26A Kod 04-26R
KULLANICI EL KİTABI Genequality JAK-2 Kod 04-26A Kod 04-26R Jak-2 geninin V617F genetik varyantını tanımlama kiti 04-26R-50_8033622781851_TR.doc 1. ÜRÜN BİLGİSİ 3 1.1 Amaç 3 2. KIT İÇERİĞİ 4 3. REAKTİFLERİN
DetaylıINNO-LiPA MYCOBACTERIA v2 Amp
KEY-CODE: FRI44675 80347 INNO-LiPA MYCOBACTERIA v2 Amp 28725 v0 2014-02-04 p 1/7 INNO-LiPA MYCOBACTERIA v2 Amp Türkçe Üretici: Fujirebio Avrupa N.V. Technologiepark 6 9052 Gent Belçika +32 9 329 13 29
DetaylıDNA Đzolasyonu. Alkaline-SDS Plasmit Minipreleri. Miniprep ler bakteri kültüründen plasmit DNA sı izole etmenizi sağlar.
DNA Đzolasyonu Saflaştırılmak istenen DNA ya genomik DNA dır ya da genomik olmayan mtdna, chldna, plasmit DNAsıdır.DNA izolasyon kitleri, genomik ve genomik olmayan DNA izole etmemizi sağlayan standartlaştırılmış
DetaylıKULLANICI EL KİTABI. AMPLIQUALITY HPV-TİP Kod 03-29A
KULLANICI EL KİTABI AMPLIQUALITY HPV-TİP Kod 03-29A Allele-özgü reverse hibridizasyon yöntemi ile Human Papillomavirus tarama ve genotipleme kiti (reverse line blot) 1. ÜRÜN BİLGİSİ 1.1 KULLANIM AMACI
DetaylıPolimeraz Zincir Reaksiyonu. Mikrobiyoloji Anabilim Dalı
4. Ha&a Polimeraz Zincir Reaksiyonu Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Sunu içeriği PCR ın tanımı PCR ın kısa tarihçesi Hücre içi DNA replikasyonu PCR bileşenleri PCR temel prensipler PCR ın kullanım alanları
DetaylıHÜCRE DONDURMA VE ÇÖZME. Uzm. Mol. Bio. Gamze ÇAĞATAY
HÜCRE DONDURMA VE ÇÖZME Uzm. Mol. Bio. Gamze ÇAĞATAY Neden Dondurma? Hücreleri saklamak Düşük pasajlarda araştırma yapmak Hücrenin orijinal yapısını korumak Genetik stabiliteyi korumak Mikrobiyal ve çapraz
DetaylıÜRÜN KULLANIM KILAVUZU
ÜRÜN KULLANIM KILAVUZU 1.0 Ürün bilgileri 1.1 Ürün adı : May-Grünwald Giemsa Boyama Seti 1.2 Ürün Kodu : 5025-100, 5025-500, 5025-1000 1.3 Ürün Marka adı : GBL 1.4 Ürün Tanımı: Kan hücrelerinin, lenfohemopoetik
DetaylıOsmaniye Korkut Ata Üniversitesi, Biyoloji Bölümü Araştırma Laboratuarları ve Üniteleri
Osmaniye Korkut Ata Üniversitesi, Biyoloji Bölümü Araştırma Laboratuarları ve Üniteleri Biyoloji Bölümünde Merkezi Araştırma Laboratuarlarının Kurulumu Osmaniye Korkut Ata Üniversitesi, Biyoloji Bölümü
DetaylıLaboratuvar Tekniği. Adnan Menderes Üniversitesi Tarımsal Biyoteknoloji Bölümü TBY 118 Muavviz Ayvaz (Yrd. Doç. Dr.) 5. Hafta (14.03.
Laboratuvar Tekniği Adnan Menderes Üniversitesi Tarımsal Biyoteknoloji TBY 118 Muavviz Ayvaz (Yrd. Doç. Dr.) 5. Hafta (14.03.2014) 1 5. Haftanın Ders İçeriği DNA ekstraksiyonu DNA ekstraksiyonunun amacı
DetaylıÜRÜN KULLANIM KILAVUZU
ÜRÜN KULLANIM KILAVUZU 1.0 Ürün bilgileri 1.1 Ürün adı : May-Grünwald Giemsa, TS Boyama Seti 1.2 Ürün Kodu : 5152-100, 5152-500,5152-1000 1.3 Ürün Marka adı : GBL 1.4 Ürün Tanımı: Doku kesitlerinde özellikle
DetaylıPneumocystis jirovecii (carinii) Real-TM Real Time Kit
REF TP2-50 FRT VER 23.04.08 Pneumocystis jirovecii (carinii) Real-TM Real Time Kit Kullanılan Semboller REF Liste Numarası 2-8 C/ -20 C de saklayın IVD Sadece araştırma Kullanımı için Dikkat! LOT Lot Numarası
DetaylıATIKSULARDA FENOLLERİN ANALİZ YÖNTEMİ
ATIKSULARDA FENOLLERİN ANALİZ YÖNTEMİ YÖNTEM YÖNTEMİN ESASI VE PRENSİBİ Fenolik maddeler uçucu özellik göstermeyen safsızlıklardan distilasyon işlemiyle ayrılır ve ph 7.9 ± 0.1 de potasyum ferriksiyanür
DetaylıAmpliquality CHLAM-T Kod 03-10A Kod 03-10R
KULLANICI KILAVUZU Ampliquality CHLAM-T Kod 03-10A Kod 03-10R Chlamydia trachomatis Belirlemek için kit 0123 1. ÜRÜN BİLGİSİ...3 2. KİT İÇERİĞİ...4 3. REAKTİFLERİ SAKLAMA KOŞULLARI...5 4. KULLANIM İÇİN
DetaylıKULLANIM KILAVUZU. LCD Array Kit. Süt ID 2.0. Customized LCD-Array Kit. Kod: A
KULLANIM KILAVUZU LCD Array Kit Süt ID 2.0 Customized LCD-Array Kit Kod: A-850-12 1) Giriş: Bu dizi süt ve süt ürünlerinde hayvan DNA'sının hızlı, kolay ve güvenilir tanımlaması için geliştirilmiştir.
DetaylıSoru 1: DNA miktarını saptamak için spektrofotometrik yöntemin arkasındaki prensibi açıklayınız:
Ara Sınav Soruları Soru 1: DNA miktarını saptamak için spektrofotometrik yöntemin arkasındaki prensibi açıklayınız: Cevap1: 260 nm de 1 cm yol uzunluğundaki OD = 50 μ g/ml çift sarmal DNA için, 40 μ g/ml
DetaylıTÜBİTAK BİDEB LİSE ÖĞRETMENLERİ FİZİK, KİMYA, BİYOLOJİ, MATEMATİK- PROJE DANIŞMANLIĞI EĞİTİMİ ÇALIŞTAYI LİSE3 (Çalıştay 2013) BİYOLOJİ GRUP TUHAF
TÜBİTAK BİDEB LİSE ÖĞRETMENLERİ FİZİK, KİMYA, BİYOLOJİ, MATEMATİK- PROJE DANIŞMANLIĞI EĞİTİMİ ÇALIŞTAYI LİSE3 (Çalıştay 2013) BİYOLOJİ GRUP TUHAF PROJE ÖNERİSİ ADI TUHAF MATERYALLERDEN İZOLE EDİLEN DNA
DetaylıINNO-LiPA HLA-DRB1 Amp Plus
INNO-LiPA HLA-DRB1 Amp Plus KOD: FRI10743 80617 INNO-LiPA HLA-DRB1 Amp Plus 28821 v6 de 2017-12-06 p 1/9 Türkçe Üretici: Fujirebio Europe N.V. Technologiepark 6 9052 Gent Belgium Tel. +32 9 329 13 29 BTW
DetaylıM47 MICROGEN STREP MICROGEN
M47 MICROGEN STREP MICROGEN Strep; kültür ortamından Streptococcus Lancefield gruplarının (A, B, C, D, F ve G) tespitini hızlı bir şekilde gerçekleştiren latex slide aglütasyon testidir. İnsanda enfeksiyona
DetaylıGıda Örneklerinde Genetiği Değiştirilmiş Organizma Analizleri. Bölüm 9. MON810 Mısır, Bt-176 Mısır ve Roundup Ready Soya nın PCR ile Nitel Saptanması
Gıda Örneklerinde Genetiği Değiştirilmiş Organizma Analizleri Bölüm 9 MON810 Mısır, Bt-176 Mısır ve Roundup Ready Soya nın PCR ile Nitel Saptanması M. Querci, M. Maretti, M. Mazzara WORLD HEALTH ORGANIZATION
DetaylıÜRÜN KULLANIM KILAVUZU
ÜRÜN KULLANIM KILAVUZU 1.0 Ürün bilgileri 1.1 Ürün adı : Alkali Fosfataz Lökosit Boyama Seti 1.2 Ürün Kodu : 5057-100 1.3 Ürün Marka adı : GBL 1.4 Ürün Tanımı: Kan, kemik iliği veya doku numunelerinde
DetaylıINNO-LiPA HLA-B Multiplex Plus
INNO-LiPA HLA-B Multiplex Plus ANAHTAR-KODU: FRI19834 80616 INNO-LiPA HLA-B Multiplex Plus 28777 v1 2015-05-20 p 1/8 Türkçe Tarafından üretildi: Fujirebio Europe N.V. Technologiepark 6 9052 Gent Belgium
DetaylıTEKNİK ŞARTNAME. 1) LC FS DNA Master Hy. Pb.,96 react
1) LC FS DNA Master Hy. Pb.,96 react TEKNİK ŞARTNAME 1) Kit hot-start PCR reaksiyonları, kantitasyon, SNP ve mutasyon çalışmaları için uygun 2) Kit ; primer, Prob ve template DNA haricind başka malzeme
DetaylıULUSAL BİYOÇEŞİTLİLİĞİNİN VE GEN KAYNAKLARININ KORUNMASI HEDEFLERİ DOĞRULTUSUNDA BÜYÜK MEMELİ TÜRLERİNİN ARAŞTIRILMASI, KORUNMASI VE YÖNETİMİ
ULUSAL BİYOÇEŞİTLİLİĞİNİN VE GEN KAYNAKLARININ KORUNMASI HEDEFLERİ DOĞRULTUSUNDA BÜYÜK MEMELİ TÜRLERİNİN ARAŞTIRILMASI, KORUNMASI VE YÖNETİMİ Örnekleme Çalışmaları: Önemli Noktalar DNA ÇALIŞMASI Projenin
DetaylıDNA JEL ELEKTROFOREZİ. Mikrobiyoloji Anabilim Dalı
5. Ha&a DNA JEL ELEKTROFOREZİ Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Tanımı Electro elektrik enerjisi anlamına gelmektedir. Phoresis ise, Yunanca phoros tan türeyerek içinden taşımak anlamına gelmektedir. Elektroforez
DetaylıLizis tamponu (50mL) : NaC 0,15M, EDTA 5mM, Tris-HCL 50mM, Np40 %1, Proteaz inhibitör kokteyli-1 tablet (Roche 50mL için ETDA free)
4. UYGULAMALI PROTEİN ELDESİ YÖNTEMLERİ A. BİLGİ Organlarda, dokularda ve hücre içerisinde bulunan proteinlerin analiz edilebilmesi için önce hücrenin dışına, bir sıvı içerisinde çıkarılmalıdırlar. Bu
DetaylıRTA Viral RNA İzolasyon Kiti
RTA Viral RNA İzolasyon Kiti Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi - 2011-09 IVD In vitro tanı amaçlı insan plazma ve serum örneklerinden viral nükleik asit izolasyon ve saflaştırılması için In vitro tanı amaçlı
DetaylıMOLEKÜLER BİYOLOJİ LABORATUVARI
MOLEKÜLER 2014-2015 BİYOLOJİ LABORATUVARI GÜZ DÖNEMİ MOLEKÜLER BİYOLOJİ LABORATUVARI 7.HAFTA DERS NOTLARI GAZİ ÜNİVERSİTESİ FEN FAKÜLTESİ BİYOLOJİ BÖLÜMÜ Sayfa 1 / 6 1. RFLP (RESTRİKSİYON PARÇA UZUNLUK
DetaylıTÜBERKÜLOZ LABORATUVARI TEST REHBERİ
TÜBERKÜLOZ LABORATUVARI TEST REHBERİ TEST ADI SONUÇ VERME ARB (Aside Dirençli Bakteri) Boyalı Direkt Bakı Erlich- Ziehl Neelsen boyamalı preparatta mikroskobik inceleme (acil ise her saat). Her gün 14:30,
DetaylıÜRÜN KULLANIM KILAVUZU
ÜRÜN KULLANIM KILAVUZU 1.0 Ürün bilgileri 1.1 Ürün adı : Gümüşleme Retikulum Boyama Seti 1.2 Ürün Kodu : 5077-100 1.3 Ürün Marka adı : GBL 1.4 Ürün Tanımı: Bağ ve destek dokularındaki gümüş tutucu retiküler
DetaylıTürk Endokrin Cerrahi Çalışma Grubu Doku Bankası ve Örnek Saklama Protokolleri Çalışması
Türk Endokrin Cerrahi Çalışma Grubu Doku Bankası ve Örnek Saklama Protokolleri Çalışması Doku ve genetik materyal bankaları işlenmiş veya dondurulmuş dokuların uzun süreli depolandığı ve kayıt sistemlerinin
DetaylıVERİFİKASYON. Dr. Tijen ÖZACAR. Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD - İZMİR
VERİFİKASYON Dr. Tijen ÖZACAR Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD - İZMİR TANIM Ticari veya laboratuvarda geliştirilmiş bir testin, laboratuvardaki performansının ölçülerek dökümante
Detaylı1. HP PCR Template Preparation DNA isolation Kit özellikler
Genel Şartlar: 1. Teklif edilen kitler, orjinal ambalajında olmalıdır. Kitlerin ve kutuların içindeki reaktiflerin/sarf malzemelerin üzerinde üretici firma adı, testin adı, test sayısı, son kullanma tarihi
DetaylıTemizlik: Mikroorganizmaların çoğalması ve yayılmasını önlemek için, yüzeylerin kir ve organik maddelerden fiziksel olarak uzaklaştırılmasıdır.
DOKÜMAN NO: STR-TL-09 YAYIN TARİHİ : AĞUSTOS 2014 REVİZYON TARİHİ : 00 REVİZYON NO:00 SAYFA 1 / 5 1-Amaç: Ç.Ü Diş Hekimliği Fakültesi klinik ortamından kaynaklanabilecek enfeksiyonları önlemek için hasta,
Detaylı1) HOLDING PIPET TEKNIK SARTNAMESI
1) HOLDING PIPET TEKNIK SARTNAMESI 1. Pipet insan oosit mikromanipulasyonlarında, oositi zarar vermeden tutma işleminde kullanılmaya uygun 2. Mikropipet borosilika camından imal edilmiş olmalıdır ve gamma
DetaylıVİRAL TANI KİTLERİ (GFJ-480)
VİRAL TANI KİTLERİ (GFJ-480) CMV PCR Tanı Kiti Cytomegalovirus un Konvensiyonel PCR yöntemiyle tanınması. HHV-5 olarak da bilinen Sitomegalovirüs, herpes virus ailesinin bir üyesidir. Oldukça sık görülen
DetaylıNÜKLEİK ASİTLERİN SAKLAMA KOŞULLARI
NÜKLEİK ASİTLERİN SAKLAMA KOŞULLARI Dr. Zafer KÜÇÜKODACI GATA HEH Patoloji Servisi 22. ULUSAL PATOLOJİ KONGRESİ 7 Kasım 2012 Manavgat DNA ve RNA NIN KANTİTASYONU Spektrofotometrik ölçüm Floresans teknik
DetaylıINNOTEST HIV Antigen mab Neutralization Reagents
KOD: FRI58431 80565 INNOTEST HIV Antigen mab Neutralization Reagents 28698 v2 2017-04-25 p 1/6 INNOTEST HIV Antigen mab Neutralization Reagents Türkçe Üretici: Fujirebio Europe N.V. Technologiepark 6 9052
DetaylıINNO-LiPA HLA-A Multiplex 100
Anahtar Kod: FRI74935 80689 INNO-LiPA HLA-A Multiplex 100 2014-01-16 28753 v0 P 1/7 Türkçe INNO-LiPA HLA-A Multiplex 100 Üretici: Fujirebio Europe N.V. Technologiepark 6 9052 Gent Belçika +32-9 329 13
DetaylıBölüm 1. Kimyasal / Malzeme ve Kurum / İş Sahibinin Tanıtımı
Bölüm 1. Kimyasal / Malzeme ve Kurum / İş Sahibinin Tanıtımı 1.1. Madde/Müstahzar, Kimyasalın /Malzemenin Tanıtılması Ürün Adı : CAS No : 57-55-6 Kullanım alanları : Polyester üretiminde, kozmetik sanayisinde,
DetaylıSAĞLIK PERSONELİ KORUYUCU EKİPMANLARI (SPKE) ENFEKSİYON KONTROL KOMİTESİ
SAĞLIK PERSONELİ KORUYUCU EKİPMANLARI (SPKE) ENFEKSİYON KONTROL KOMİTESİ Hastalara sağlık hizmeti ve bakım veren sağlık çalışanlarının, başta kırım kongo kanamalı ateşi, insan immün yetmezlik virüsü (HIV),
DetaylıREAKSİYON PRENSİPLERİ
REAKSİYON PRENSİPLERİ Reaksiyon Bileşenleri: qpcr Master Mix (PMM) Hedef probe Mix (HPM) Zenginleştirilmiş gıda ürünleri kültüründen izole edilen DNA örneği Polimerase Chain Reaction (PCR): Son yıllarda
DetaylıNiçin PCR? Dr. Abdullah Tuli
Niçin PCR? Dr. Abdullah Tuli 1980 lerin Başı Bir yöntem düşünün Tepkimeyi gerçekleştirmek kolay mıdır? Bu yöntem çok mu karmaşıktır, yoksa basit mi? Yöntemde kullanılan örnek, saf mı ya da son derece karmaşık
DetaylıGenequality HEMO STRIP Kod C Kod A Kod R Kod
KULLANICI KILAVUZU Genequality HEMO STRIP Kod. 09-11C Kod. 09-11A Kod. 09-11R Kod Hemokromatoz ilişkili HFE geninde mutasyonların eş zamanlı teşhisi ve tanısı için reverse hibridizasyon testi (RHA) 1 ÜRÜN
DetaylıMOLEKÜLER MİKROBİYOLOJİ LABORATUVARI ÇALIŞMA PROSEDÜRÜ
KOD.MİK.PR.02 YAYIN TRH. KASIM 2011 REV. TRH. EYLÜL 2012 REV. NO.1 SAYFA NO.1/14 1. AMAÇ: Moleküler mikrobiyoloji laboratuvarında yürütülen faaliyetleri tanımlamak. 2. KAPSAM: Bu talimat, Moleküler mikrobiyoloji
DetaylıTissue_LC_200_V7_DSP ve Tissue_HC_200_V7_DSP (QIAsymphony DSP DNA Mini Kiti için kullanıcı açısından doğrulanmıştır)
Ağustos 2015 QIAsymphony SP Protokol Sayfası Tissue_LC_200_V7_DSP ve Tissue_HC_200_V7_DSP (QIAsymphony DSP DNA Mini Kiti için kullanıcı açısından doğrulanmıştır) Bu belge Kit Versiyonu 1 için Tissue_LC_200_V7_DSP
DetaylıÜRÜN KULLANIM KILAVUZU
ÜRÜN KULLANIM KILAVUZU 1.0 Ürün bilgileri 1.1 Ürün adı : Alsiyan Mavisi ph: 2,5 Boyama Seti 1.2 Ürün Kodu : 5053-100 1.3 Ürün Marka adı : GBL 1.4 Ürün Tanımı: Doku kesitlerinde asit mukopolisakkaridlerin
DetaylıREKOMBİNANT DNA TEKNOLOJİSİ. Araş. Gör. Dr. Öğünç MERAL
Araş. Gör. Dr. Öğünç MERAL 1960 lardan bu yana genetik ve moleküler biyolojideki kavrayışımızın hızla artması, biyoteknolojide heyecan verici buluşlar ve uygulamalara yol açtı. DNA yapısı ve fonksiyonlarının
Detaylı