HIZLI YÖNTEMLER (III)
|
|
- Nesrin Engin
- 8 yıl önce
- İzleme sayısı:
Transkript
1 1 Doç.. Dr. Serap COŞANSU AKDEMİR HIZLI YÖNTEMLER (III) 2 MOLEKÜLER GENETİK YÖNTEMLER Gıda kaynaklı patojenlerin tanımlanmasında ve karakterizasyonunda fenotipik yöntemler halen yaygın olarak kullanılmakla birlikte, son yıllarda genetik yöntemlere olan eğilim artmıştır. Doç. Dr. Serap Coşansu Akdemir 1
2 3 Bakteriyel ribozom (70S) 3 farklı rrna fraksiyonu içerir: 5S, 16S ve 23S 5S: 120 nükleotid 16S: 1500 nükleotid 23S: 3000 nükleotid Bunlardan 16S rrna bakterilerin tanımlanmasında kullanılır. 4 Bakteri hücresinden 16S rrna yı ekstrakte etmek ve ampilifiye etmek (çoğaltmak) nispeten kolay 1 g yaş ağırlığa sahip hücre kitlesinde DNase enzimi ile DNA parçalandıktan sonra, ticari kitler kullanılarak RNA ekstrakte edilebilir. Ortama nükleotid primerleri, revers transkriptaz (RT) ve deoksiribonükletid ilave edildiğinde RT rrnaşablonunu okur ve şablona göre DNA kopyalarını (cdna) oluşturur. Bir seri manupulasyondan sonra orijinal 16S rrna sekansı ortaya çıkarılabilir. Doç. Dr. Serap Coşansu Akdemir 2
3 5 Nükleik Asit (DNA) Probları Bir DNA probu, hedef mikroorganizmadan elde edilmiş ve homolog DNA veya RNA sekanslarını belirlemeye yarayan DNA sekansından oluşur. Buna göre, prob DNA aranan mikroorganizmanın DNA sı ile hibridize olabilmelidir. Hibridizasyonun gerçekleşip gerçekleşmediğini ortaya çıkarmak için prob DNA işaretlenir. İşaretleme için radyoizotoplar kullanılabilir: 32 P, 3 H, 125 I ve 14 C 6 Kromozomal DNA sıklıkla hedef nükleik asidin kaynağıdır, ancak çoğu durumda hücre içinde tektir. Bu nedenle mrna, rrna veya plazmid DNA sı gibi çoklu hedefler tercih edilir. Böylece yöntemin hassasiyeti artar. Sentetik oligonükleotid probları bazdan oluşur ve hibridizasyon dk da gerçekleşir. Doç. Dr. Serap Coşansu Akdemir 3
4 7 İşlem: 1. Restriksiyon endonükleaz ile bilinmeyen organizmanın DNA fragmentlerinin oluşturulması 2. Fragmentlerin elektroforez ile ayrılması ve nitroselüloz filtrelere aktarılması. 3. İşaretlenmiş problarla hibridizasyon 4. Reaksiyona girmeyen probların uzaklaştırılması için yıkama ve hibridizasyonun otoradyografi ile tespiti 8 Standart bir probla belirlenebilecek minimum bakteri hücresi sayısı , ancak bazı araştırıcılar 10 4 adet bakteri hücresini belirleyebilmişler Gıda örneğinde patojen bakterilerin belirlenmesinde sayı çok düşük (1 kob/ml) olabileceğinden mutlaka zenginleştirme yapılmalı. Başlangıç hücre sayısı 10 8 olduğunda saat sonunda sonuç alınabilir. Zenginleştirme gerekli olduğunda toplam süre en az 44 saat Doç. Dr. Serap Coşansu Akdemir 4
5 9 Digoksigenin ile işaretlenmiş prob kullanılarak 48 saatte çiğ et örneğindeki 10 kob/g düzeyindeki enterotoksijenik C. perfringens belirlenebilmiş L. monocytogenes in süt, et ve su ürünlerinde aramasında kolorimetrik DNA probu ile FDA in yöntemi karşılaştırılmış 660 süt ve su ürünü örneğinin 354 ünde FDA in yöntemi ile patojen belirlenmiş, buna karşın prob ile 393 örnek pozitif sonuç vermiş 540 et örneğinin 261 i FDA in yöntemi ile, 378 i ise DNA probla pozitif bulundu. Prob 48 saat içinde sonuç verirken, FDA/USDA in metodu ile sonuç almak için 3-4 gün gerekli 10 Salmonella spp. için geliştirilen kolorimetrik prob 110 serotipin tamamını tanımlamış, 61 Salmonella olmayan izolatın hiçbirinde sahte-pozitif sonuç vermemiştir. Salmonella için geliştirişmiş radyoizotopla işaretlenmiş prob 269 kanatlı karkası ve su örneğinde test edilmiştir. İki kez zenginleştirme uygulandıktan sonra 0,03 hücre/ml kadar düşük sayıdaki Salmonella belirlenebilmiştir. Prob ml de ~10 4 kadar az sayıdaki hücreyi saptayabilir. Doç. Dr. Serap Coşansu Akdemir 5
6 11 DNA probları koloni hibridizasyon tekniklerinde de kullanılır. Koloni hibridizasyon tekniğinde hedef mikroorganizma uygun bir katı besiyerinde inkübe edildikten sonra mikrokolonilerin direkt olarak bir membran üzerinde oluşması sağlanır. Asıl petri veya membran ile eş zamanlı kopyası hazırlanır. 12 Doç. Dr. Serap Coşansu Akdemir 6
7 13 Kolonilerin oluştuğu petri kutusu üzerine nitroselüloz disk yerleştirilir ve belirli süre inkübe edilir. Böylece kolonilerin disk üzerine kopyası çıkarılmış olur. Disk petriden ayrılır ve sırasıyla şu işlemler yapılır: a) NaOH ilave edilerek bakterilerin lize olması ve DNA nın hücre dışına çıkması sağlanır. b) NaOH nötralize edilir. c) Proteinleri uzaklaştırmak için proteaz ilave edilir. d) Membran yıkanır. e) DNA yı membrana sabitlemek için 80 o C ye ısıtılır. f) Membran üzerindeki DNA radyoaktif prob ile uygun koşullar altında hibridize edilir. g) Membran yıkanarak hibridize olmamış problar uzaklaştırılır. h) Membran x-ray film üzerine konur. X- ray film üzerine bir veya daha fazla leke oluşması orada hibridizasyon olduğunu, dolayısıyla hedef bakteriyi işaret eder. 14 Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) Moleküler genetik yöntemler içinde gıdalardaki bakteri ve virüsleri tespit etme ve tanımlamada en fazla kullanılan yöntemdir. Çünkü; Yüksek hassasiyet Yüksek spesifiklik Ticari kitler halinde kolaylıkla ulaşılabilir olması vs İlk kez 1971 yılında Kleppe ve ark. tarafından ortaya konmuş Şu an kullanılmakta olan yöntem Perkin Elmer-Cetus Corp. da çalışan bilim adamları tarafından geliştirilmiş. PCR yöntemine katkılarından dolayı K.B. Mullis 1993 yılında kimya dalında Nobel Ödülüne ortak olmuş Doç. Dr. Serap Coşansu Akdemir 7
8 PCR yöntemi genel olarak şu şekilde uygulanır: Başlangıç materyali dsdna (double strand DNA) ise tek sarmal DNA elde etmek için 95 o C ye ısıtılır. Başlangıç materyali RNA ise (örneğin virüs genomu) önce revers transkriptaz (RT-PCR) kullanılarak dsdna ya dönüştürülür. DNA zincirlerini ayırmak için ısıttıktan sonra oligonükleotid primerleri varlığında 55 o C ye soğutulur. Böylece soğutma sırasında tekrar dsdna oluşur. Ortama DNA polimerazla birlikte datp, dctp, dttp, dgtp ilave edilir (d: deoksinükleotid). Bunlar DNA sentezinin ön maddeleridir. Bu işlem tekrar edildiğinde 2 zincir 4, 4 zincir 8, vs olur. Yeterince tekrarlanırsa başlangıçtaki DNA nın birkaç milyon kopyası elde edilebilir Primerler genellikle kısa oligonükleotidlerdir nükleotid uzunluğunda olup baz dizilimi hedef DNA bölgesinin son kısmı ile uyumludur. Amplifikasyon çok sayıda döngüden oluşur. Her bir döngü sırasında çift sarmal DNA ısıtılarak denatüre edilir yani tek sarmala dönüşür. Daha sonra reaksiyon karışımı soğutularak primerlerin tek sarmal DNA lara bağlanması sağlanır. Böylece termostabil DNA-polimerazın bağlanabileceği aktif bölgeler oluşur. DNA-polimerazın çalışmasıyla tekrar çift sarmal DNA meydana gelir. Bir sonraki döngüde primerler hem orijinal hem de yeni üretilen DNA zincirine bağlanır. Böylece DNA kopyalarının sayısı logaritmik olarak artar. Doç. Dr. Serap Coşansu Akdemir 8
9 17 BAX system Probelia Foodproof 18 Multiplex PCR (MPCR) Birden fazla mikroorganizmanın tek bir reaksiyonla hızlı bir şekilde belirlenmesine olanak sağlar. MPCR, çoklu virülens faktörlerin tanımlanmasında ve çok sayıda izolatın aynı anda tanımlanmasında kullanılabilir. MPCR nin ticari şekli GeneDisc Uygulanması kolay Birkaç saat içinde sonuç alınabilir Gıda endüstrisinde gıda kaynaklı patojenler belirlenebilir. Doç. Dr. Serap Coşansu Akdemir 9
10 19 GeneDisc Sistem üç birimden oluşur: GeneDisc DNA Ekstraktörü GeneDisc Plate (Üzerindeki kuyucuklarda anahtar nitelikteki iki reaktif primer ve prob kullanıma hazır halde bulunur.) GeneDisc Cycler: Testi yapar ve sonuçları kaydeder. 20 Sistem nasıl çalışır? GeneDisc DNA ekstraktörü örneği analize hazırlamak için kullanılır. 4 temel aşamadan oluşur: filtrasyon, sonikasyon, ısıtma, DNA saflaştırma GeneDisc Plate yaklaşık aynı çaptaki üst üste konmuş DVD ye benzer bir aparattır. Üstteki diskin orta kısmında 6, 9 veya 12 bölme içeren bir oyuk yer alır. Alttaki diskte ise 36 kuyucuk ve mikrokanal bulunur. Her bir bölme sırasıyla 6, 4 veya 3 kuyucuğa mikrokanallarla bağlıdır. Buna göre aynı anda 6, 9 veya 12 örnek test edilebilir. Reaktiflerin kuyucuklara yerleştirilmiş olması taşımada kolaylık sağlar. Oda sıcaklığı veya 4 o C de nakliye edilebilir, çoğu zaman olduğu gibi -20 o C veya daha düşük sıcaklık gerektirmez. Her bir bölmede bir negatif kontrol ve bir pozitif kontrol kuyucuğu yer alır. Böylece test sonucunun geçerliliğinden emin olunur. Doç. Dr. Serap Coşansu Akdemir 10
11 21 22 Fluoresan in situ hibridizasyon (FISH) Ribozomal RNA yı hedef alan FISH PCR-olmayan moleküler teknikler içinde en çok kullanılanıdır. DNA yerine RNA yı hedef almak hem yöntemi duyarlı hale getirir, hem de canlı hücreleri belirlemeye olanak sağlar. Bu yöntemde hücreler kimyasal bağlayıcılar ile muamele edilir ve uygun koşullar altında cam üzerinde veya oligonükleotid prob içeren sıvı ortamda hibridize edilir. Genellikle problar nükleotid uzunluğunda olup 5 ucundan kolvalent olarak floresan boya ile etiketlenir. Bağlanmayan probu uzaklaştırmak için yıkadıktan sonra boyanan hücreler epifloresan mikroskop ile belirlenir. Teşhis limiti yaklaşık 10 4 kob/ml dir. Yaklaşık bir gecelik zenginleştirme işlemi ile bu seviyeye ulaşılır. Doç. Dr. Serap Coşansu Akdemir 11
12 23 24 Mikroarray teknolojisi Basit bir mikroarray bilinen farklı bakteri türlerinden elde edilmiş tek sarmal DNA (ss-dna) parçacıklarının tutturulduğu katı bir yüzeyden oluşur. Katı yüzey naylon membran, cam slayt veya silikon çip olabilir. Bilinmeyen yada tanımlanmak istenen DNA parçacıkları mikroarraya maruz bırakılırsa çip üzerinde kendisine uyan tek sarmal DNA zincirini tamamlayacaktır. Doç. Dr. Serap Coşansu Akdemir 12
13 25 Mikroarray ler nasıl üretilir ve nasıl çalışır? Mikroarray lerin üretiminde çeşitli yöntemler kullanılabilir: cam lamlar üzerine ince uçlu iğnelerle baskı, önceden hazırlanmış maskelerle fotolitografi, dinamik mikroayna cihazlarıyla fotolitografi, ink-jet baskı, mikroelektrod array lerinde elektrokimya gibi... Temel olarak çiplerin hazırlanması iki şekilde yapılabilir: Çip üzerinde oligonükleotid sentezi DNA nın direkt olarak yüzeye bırakılması 26 Çip üzerinde oligonükleotid sentezi (On-chip oligonucleotide synthesis) DNA ya da gen parçaları direkt olarak cam maddenin üzerinde sentez edilir. Genellikle fotolitografi yöntemi kullanılır. Doç. Dr. Serap Coşansu Akdemir 13
14 27 28 DNA nın direkt olarak yüzeye bırakılması (Direct DNA deposition): Bu teknikte genomik DNA nın parçaları fiziksel olarak cam yüzeydeki yerlerine bırakılır. Yöntem Stanford Üniversitesi nden Pat Brown un laboratuvarında tasarlanmıştır. Doç. Dr. Serap Coşansu Akdemir 14
15 Stanford çiplerinin DNA fragmentleri; genlerin PCR amplifikasyonuyla elde edilip, cam film üzerine robotic spotting yöntemiyle kusursuz bir şekilde yerleştirilmesiyle elde edilir. PCR ürünleri cam film üzerine yaklaşık 2 cm 2 bir alana noktacıklar halinde yerleştirilir. Her bir PCR ürününün yerleştirildiği bölge ve içerdiği DNA dizisi kesin olarak bellidir. Daha sonra slayt üzerindeki DNA lar kurutulur (100ºC de 2 sn ), sabitlenir (UV cross-linking), ve denatüre edilerek tek zincirli hale getirilir (95º C de 2 dk). Hazırlanan çipler, işaretlenmiş cdna fragmentleriyle bağlanmak üzere kullanılırlar Ice nucleation assay Bu yöntem prensip olarak lux geninin hedef bakteriye özgü faja aktarıldığı bakteriyel biyolüminesans yöntemine benzer. Gram-negatif bakteri cinslerinin çoğu «ice nucleator» gibi davranan bir proteinin sentezini kodlayan «ina» geni içerir. Bu geni içeren bakterilerden biri Pseudomonas syringae olup ina geni 3600 baz çiftinden oluşur. Doç. Dr. Serap Coşansu Akdemir 15
16 31 Bu protein suyun normalden daha yüksek sıcaklıklarda donmasına olanak sağlar. Yani normal koşullarda -6 o C veya daha düşük sıcaklık gerekirken -2 o C de su buza dönüşebilir. Söz konusu ice nükleatörler yumurta akı, somon gibi gıdalara uygulandığında hem donma süresi kısaltılmış hem de enerji tasarrufu sağlanmıştır. 32 Bakteriyel ice nükleasyon testi ilk kez Salmonella yı belirlemek için geliştirilmiştir. P. syringae den elde edilen ina geni Salmonella ya spesifik bir faja aktarılır. Faj Salmonella varlığı araştırılan ortama ilave edilir. Eğer Salmonella varsa faj tarafından edilecek ve faj genleri bakteri genomu ile birlikte ifade edildiğinde dış membranın bir parçası olarak ice nükleasyon proteini sentezlenecektir. -9 o C civarında buz kristallerinin oluşumu ile Salmonella varlığını gösterir. Floresan özellikteki freeze indikatör boya ilave edilirse yeşil renk buz kristallerini yani Salmonella varlığını, turuncu renk ise negatif sonucu gösterir. Salmonella nın P22 fajı ile 25 hücre/g düzeyindeki patojen 24 h içinde belirlenebilmiştir. Doç. Dr. Serap Coşansu Akdemir 16
17 33 Biyosensörler Biyosensörler, biyospesifik tanıma sistemlerinin fiziksel veya elektrokimyasal sinyaller ile kombine edildiği analitik cihazlardır. Gıdalardaki patojenlerin belirlenmesinde kullanılan biyosesörler enzim, antikor, antijen veya nükleik asit gibi biyolojik olarak aktif bir materyal ile alınan sinyalleri dönüştüren bir birimden oluşur. Alınan sinyal hedef molekülün konsantrasyonu ile doğru orantılı olup elektrik, optik veya termal bir sinyaldir. 34 Biyosensörler analiz süresini kısaltmakla birlikte kullanılabilirlikleri seçici ve hassas olmalarına bağlıdır. Otomatik ve minyatürize sistemlerdir. Örnek miktarı nanolitre ile ifade edilir. Bu nedenle kullanılan reaktif miktarı azalacağından maliyet düşer. Aynı anda çok sayıda örneğin analizine olanak sağladığından zamandan tasarruf sağlar. Doç. Dr. Serap Coşansu Akdemir 17
18 35 Doç. Dr. Serap Coşansu Akdemir 18
FLORESAN İN SİTU HİBRİDİZASYON
FLORESAN İN SİTU HİBRİDİZASYON Sağlık Teknikeri Hande ÇOLAKOĞLU Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Patoloji AD SIVI ve DOKULARIN FISH UYGULAMASI ÖNCESİ HAZIRLIK İŞLEMLERİ FISH Çalışmalarında Ön Uygulama
DetaylıHafta VIII Rekombinant DNA Teknolojileri
GENETĐK 111-503 Hafta VIII Rekombinant DNA Teknolojileri Doç.Dr. Hilâl Özdağ Rekombinant DNA Teknolojisi Amaç Spesifik DNA dizilerinin yerlerinin belirlenmesi. DNA nın belirli noktalardan kesilmesi Belirli
DetaylıMOLEKÜLER BİYOLOJİ LABORATUVARI
MOLEKÜLER 2014-2015 BİYOLOJİ LABORATUVARI GÜZ DÖNEMİ MOLEKÜLER BİYOLOJİ LABORATUVARI 7.HAFTA DERS NOTLARI GAZİ ÜNİVERSİTESİ FEN FAKÜLTESİ BİYOLOJİ BÖLÜMÜ Sayfa 1 / 6 1. RFLP (RESTRİKSİYON PARÇA UZUNLUK
DetaylıPOLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU (PZR-PCR) VE RESTRİKSİYON PARÇA UZUNLUĞU POLİMORFİZMİ (RFLP)
Deney: M 1 POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU (PZR-PCR) VE RESTRİKSİYON PARÇA UZUNLUĞU POLİMORFİZMİ (RFLP) a) PCR yöntemi uygulaması b) RPLF sonuçları değerlendirilmesi I. Araç ve Gereç dntp (deoksi Nükleotid
DetaylıMICROARRAY TEKNOLOJİSİ
MICROARRAY TEKNOLOJİSİ Bilgisayar teknolojisinin moleküler biyolojiye paralel olarak hızla gelişmesi, iki disiplini birbirine yaklaştırmıştır. Böylece, biyoteknolojinin kavramsal olarak ulasabileceği son
DetaylıMICROARRAY TEKNOLOJİSİ
MICROARRAY TEKNOLOJİSİ Bilgisayar teknolojisinin moleküler biyolojiye paralel olarak hızla gelişmesi, iki disiplini birbirine yaklaştırmıştır. Böylece,biyoteknolojinin kavramsal olarak ulasabileceği son
DetaylıREAKSİYON PRENSİPLERİ
REAKSİYON PRENSİPLERİ Reaksiyon Bileşenleri: qpcr Master Mix (PMM) Hedef probe Mix (HPM) Zenginleştirilmiş gıda ürünleri kültüründen izole edilen DNA örneği Polimerase Chain Reaction (PCR): Son yıllarda
DetaylıProtokolü PD S001 01. 50 Reaksiyon
Salmonella sp. Real time PCR Tespit Kiti Protokolü PD S001 01 50 Reaksiyon REAKSİYON PRENSİPLERİ Reaksiyon Bileşenleri: qpcr Master Mix (PMM) Hedef probe Mix (HPM) Zenginleştirilmiş gıda ürünleri kültüründen
DetaylıMOLEKÜLER BİYOLOJİDE KULLANILAN YÖNTEMLER II. ( WESTERN BLOTTING (WESTERN EMDİRİMİ) ve İMMÜNODETEKSİYON
MOLEKÜLER BİYOLOJİDE KULLANILAN YÖNTEMLER II ( WESTERN BLOTTING (WESTERN EMDİRİMİ) ve İMMÜNODETEKSİYON Western blotting: Akrilamit jeldeki protein bantlarının daha kararlı ve sabit bir ortama (örneğin,
DetaylıGENETİK TANI YÖNTEMLERİ. Prof.Dr.Mehmet Alikaşifoğlu
GENETİK TANI YÖNTEMLERİ Prof.Dr.Mehmet Alikaşifoğlu S Genetik Tanı Yöntemleri S Sitogenetik Tanı Yöntemleri S Moleküler Sitogenetik Tanı Yöntemleri S Moleküler Genetik Tanı Yöntemleri Sitogenetik Tanı
DetaylıRT-PCR. (reverse transckripsiyon-polimeraz zincir reaksiyonu) Dr Gülnur Güler
RT-PCR (reverse transckripsiyon-polimeraz zincir reaksiyonu) Dr Gülnur Güler RT-PCR (reverse transckripsiyon-polimeraz zincir reaksiyonu) mrna ekspresyon seviyelerini belirlemek için sensitiv bir metod
DetaylıMikrobiyolojide Moleküler Tanı Yöntemleri. Dr.Tuncer ÖZEKİNCİ Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji A.D
Mikrobiyolojide Moleküler Tanı Yöntemleri Dr.Tuncer ÖZEKİNCİ Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji A.D 1 Enfeksiyonun Özgül Laboratuvar Tanısı Mikroorganizmanın üretilmesi Mikroorganizmaya
DetaylıBAKTERİLERİN GENETİK KARAKTERLERİ
BAKTERİLERİN GENETİK KARAKTERLERİ GENETİK MATERYALLER VE YAPILARI HER HÜCREDE Genetik bilgilerin kodlandığı bir DNA genomu bulunur Bu genetik bilgiler mrna ve ribozomlar aracılığı ile proteinlere dönüştürülür
DetaylıGıda Örneklerinde Genetiği Değiştirilmiş Organizma Analizleri. Bölüm 9. MON810 Mısır, Bt-176 Mısır ve Roundup Ready Soya nın PCR ile Nitel Saptanması
Gıda Örneklerinde Genetiği Değiştirilmiş Organizma Analizleri Bölüm 9 MON810 Mısır, Bt-176 Mısır ve Roundup Ready Soya nın PCR ile Nitel Saptanması M. Querci, M. Maretti, M. Mazzara WORLD HEALTH ORGANIZATION
DetaylıProtokolü PD S Reaksiyon
Salmonella sp. Real time PCR Tespit Kiti Protokolü PD S00 0 50 Reaksiyon REŞİT GALİP CADDESİ 74-7 06700 ÇANKAYA, ANKARA, TÜRKİYE T +90 32 447 22 79 / 80 F +90 32 447 22 07 www.bmlabosis.com İnternal Pozitif
DetaylıListeria Monocytogenes Real time PCR Tespit Kiti
Listeria Monocytogenes Real time PCR Tespit Kiti Protokol PD LM00 0 50 Reaksiyon REŞİT GALİP CADDESİ 74-7 06700 ÇANKAYA, ANKARA, TÜRKİYE T +90 32 447 22 79 / 80 F +90 32 447 22 07 W www.bmlabosis.com İnternal
DetaylıRekombinant DNA teknolojisi ve genomik
C H A P T E R 3 Rekombinant DNA teknolojisi ve genomik Dr. Aslı Sade Memişoğlu PowerPoint Lecture by: Melissa Rowland-Goldsmith Chapman University Başlıklar 3.1 Rekombinant DNA teknolojisi ve klonlamaya
DetaylıSoru 1: DNA miktarını saptamak için spektrofotometrik yöntemin arkasındaki prensibi açıklayınız:
Ara Sınav Soruları Soru 1: DNA miktarını saptamak için spektrofotometrik yöntemin arkasındaki prensibi açıklayınız: Cevap1: 260 nm de 1 cm yol uzunluğundaki OD = 50 μ g/ml çift sarmal DNA için, 40 μ g/ml
DetaylıMERKEZ LABORATUVAR. Moleküler Biyoloji Deneylerinde Sıklıkla Kullanılan Bazı Aletlerin Tanıtımı
MERKEZ LABORATUVAR Moleküler Biyoloji Deneylerinde Sıklıkla Kullanılan Bazı Aletlerin Tanıtımı Yüksek Performans Sıvı Kromatografisi (HPLC) Karbonhidratların, organik asitlerin, vitaminlerin, amino asitlerin
DetaylıMIKROARRAY TEKNOLOJİSİ. Veysel Sabri HANÇER Moleküler Biyoloji ve Genetik Doktora Programı
MIKROARRAY TEKNOLOJİSİ Veysel Sabri HANÇER Moleküler Biyoloji ve Genetik Doktora Programı 2602040083 vshancer@yahoo.com EŞ ANLAMLILAR Biochip DNA chip DNA microarray Gene array 2 Neden bu teknolojiye ihtiyaç
DetaylıRekombinant DNA Teknolojisi-II
BYM613 Genetik MühendisliM hendisliği Rekombinant DNA Teknolojisi-II Hacettepe Üniversitesi Biyomühendislik BölümüB 2012-2013 2013 Güz G z DönemiD Dr. Eda Çelik-AKDUR edacelik@hacettepe.edu.tr İçerik (2
Detaylıİnfeksiyon tanısında yeni yaklaşımlar Biyosensörler. Barış OTLU İnönü Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Malatya.
İnfeksiyon tanısında yeni yaklaşımlar Biyosensörler Barış OTLU İnönü Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Malatya. Bakterilerin tanımlanması Bakterilerin tanımlanması Bakterilerin
DetaylıReplikasyon, Transkripsiyon ve Translasyon. Yrd. Doç. Dr. Osman İBİŞ
Replikasyon, Transkripsiyon ve Translasyon Yrd. Doç. Dr. Osman İBİŞ DNA replikasyonu DNA nın replikasyonu, DNA molekülünün, sakladığı genetik bilgilerin sonraki nesillere aktarılması için kendi kopyasını
DetaylıMaya ve maya benzeri mantarların sekans analizi ile identifikasyonu
Maya ve maya benzeri mantarların sekans analizi ile identifikasyonu Dr. Ayşe KALKANCI Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Ankara 24-25 Şubat 2011, İzmir Sunum Planı Teorik
DetaylıREAKSİYON PRENSİPLERİ
REAKSİYON PRENSİPLERİ Reaksiyon Bileşenleri: qpcr Master Mix (PMM) Hedef probe Mix (HPM) Zenginleştirilmiş gıda ürünleri kültüründen izole edilen DNA örneği Polimerase Chain Reaction (PCR): Son yıllarda
DetaylıBAKTERİLERDE GENETİK MADDE AKTARILMASI
BAKTERİLERDE GENETİK MADDE AKTARILMASI Bakterilerde genetik maddenin bir kısmı bakteriden bakteriye aktarılabilmekte ve bunun sonucunda önemli genetik değişmeler olmaktadır Verici hücre ile alıcı hücre
DetaylıREKOMBİNANT DNA TEKNOLOJİSİ. Araş. Gör. Dr. Öğünç MERAL
Araş. Gör. Dr. Öğünç MERAL 1960 lardan bu yana genetik ve moleküler biyolojideki kavrayışımızın hızla artması, biyoteknolojide heyecan verici buluşlar ve uygulamalara yol açtı. DNA yapısı ve fonksiyonlarının
DetaylıOXA-48 in Saptanmasına Yönelik İzotermal Rekombinaz Polimeraz Amplifikasyon Yöntemine Dayalı Bir Hızlı Moleküler Test Formatının Geliştirilmesi
OXA-48 in Saptanmasına Yönelik İzotermal Rekombinaz Polimeraz Amplifikasyon Yöntemine Dayalı Bir Hızlı Moleküler Test Formatının Geliştirilmesi Mert Ahmet Kuşkucu, Gökhan Aygün, Asiye Karakullukçu, Nergiz
DetaylıĠ.Ü. MÜHENDĠSLĠK FAKÜLTESĠ ÇEVRE MÜHENDĠSLĠĞĠ BÖLÜMÜ
Ġ.Ü. MÜHENDĠSLĠK FAKÜLTESĠ ÇEVRE MÜHENDĠSLĠĞĠ BÖLÜMÜ Çevre Mikrobiyolojisi Dersi Laboratuvar Uygulama 6 BOYAMA TEKNİKLERİ Mikrobiyolojide çeşitli organizmaları ve bunların farklı bölgelerini boyamak için
DetaylıFISH ve in situ melezleme
FISH ve in situ melezleme In situ melezleme belirli bir mrna nın doku içinde nerede bulunduğunu görmemize yarar. Bu metod inceleyenin ilgilendiği mrna nın normal yerini görmesine olanak sağlar. In situ
DetaylıProtein Ekstraksiyonu
Protein Ekstraksiyonu Dr.Gaye Güler Tezel Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi Patoloji Anabilim Dalı Proteinler tüm canlı organizmalar için en önemli makromoleküllerden biridir. Bazıları yapısal komponentleri
DetaylıMoleküler Yöntemlerin Tanımlanması
Moleküler Yöntemlerin Tanımlanması Uğur Özbek İstanbul Üniversitesi DETAE, Genetik A.D. 2. Ulusal Lenfoma Myeloma Kongresi Lenfomalarda Moleküler Patogenez ve Hematopatoloji 16.04.2011 Sunum I. İnsan Genomu
DetaylıGıdalarda Patojen Mikroorganizma Aranmasında Kullanılan Moleküler Genetik Yöntemler 1
Orlab On-Line Mikrobiyoloji Dergisi Yıl: 2005 Cilt: 03 Sayı: 12 Sayfa: 1-7 www.mikrobiyoloji.org/pdf/702051201.pdf 1. Giriş Gıdalarda Patojen Mikroorganizma Aranmasında Kullanılan Moleküler Genetik Yöntemler
DetaylıSADE ve SAGE ve Gen Ekspresyonunun Seri Analizi. Prof.Dr. Nermin GÖZÜKIRMIZI
SADE ve SAGE ve Gen Ekspresyonunun Seri Analizi Prof.Dr. Nermin GÖZÜKIRMIZI Gen Anlatımının Belirlenmesi DNA mikroçalışmaları Makroçalışmaları EST (Expressed sequence tag) Gen anlatımının seri analizi
DetaylıGen Đfadesi, tespiti ve ölçülmesi
Gen Đfadesi, tespiti ve ölçülmesi Doç. Dr. Hilâl Özdağ Eposta: ozdag@medicine.ankara.edu.tr Tel: 2225826/202 Ders Notları Đçin: http://bteml.biotek.ankara.edu.tr/wiki/index.php/ana_sayfa adresinden Genombilimde
DetaylıMoleküler Biyolojide Kullanılan Yöntemler-5
Moleküler Biyolojide Kullanılan Yöntemler-5 Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) (DNA nın in vitro çoğaltılması) 2 Hücrede doğal olarak (in vivo)gerçekleşen replikasyon, in vitro koşullarda da (hücre dışında)
DetaylıSSO Yöntemiyle HLA Tiplendirmesi. Gürbüz POLAT
SSO Yöntemiyle HLA Tiplendirmesi Gürbüz POLAT SSO Diziye özgü oligonükleotid problarıyla PCR da çoğaltılmış DNA nın hibridizasyonu ile HLA allellerini saptamak için kullanılan moleküler tipleme yöntemidir.
DetaylıNilgün Çerikçioğlu Marmara Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı
Nilgün Çerikçioğlu Marmara Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Kandolaşımı Enfeksiyonları %10 Kandidemi Ölüm hızı : % 50 (YBÜ) Erken tanı (?), tedavinin önemi Etken: Candida allbicans
DetaylıVirolojik Teşhis Yöntemleri. Viral Partikül Tespiti 8/10/2018. Virüs izolasyonu/identififikasyonu
Virolojik Teşhis Yöntemleri Dr.Öğr.Üyesi Engin BERBER Viral partikül tespiti Virüs izolasyonu/identififikasyonu Viral antijen tespiti Virüs spesifik antikor tespiti Viral nükleik asit tespiti 1 2 Elektron
DetaylıComparative Genomic Hybridization (CGH)
CGH, ARRAY-CGH Comparative Genomic Hybridization (CGH) CGH sitogenetik tekniğini ilk defa, Kallioniemi ve ark. 1992 de Science da yayınlattıkları çalışmaları ile ortaya koydular. Kallioniemi A, Kollioniemi
DetaylıMİKROBİYOLOJİ ANABİLİM DALI BİYOTEKNOLOJİ DERS NOTLARI
MİKROBİYOLOJİ ANABİLİM DALI BİYOTEKNOLOJİ DERS NOTLARI Biyoteknoloji, genetik materyallerde moleküler düzeyde yapılan manipülasyonlarla yeni ve istenilen fenotipte organizmalar ve faydalı ürünler elde
DetaylıM47 MICROGEN STREP MICROGEN
M47 MICROGEN STREP MICROGEN Strep; kültür ortamından Streptococcus Lancefield gruplarının (A, B, C, D, F ve G) tespitini hızlı bir şekilde gerçekleştiren latex slide aglütasyon testidir. İnsanda enfeksiyona
DetaylıDNA Dizileme (Sekanslama)
T.C GIDA TARIM VE HAYVANCILIK BAKANLIĞI PENDİK VETERİNER KONTROL ENSTİTÜSÜ DNA Dizileme (Sekanslama) Dr. Eray ATIL Vet. Hekim, Mikrobiyolog Pendik Veteriner Kontrol Enstitüsü Eğitim Bilgileri Eğitim süresi
DetaylıONDOKUZ MAYIS ÜNİVERSİTESİ MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ KİMYA MÜHENDİSLİĞİ BÖLÜMÜ ORGANİK KİMYA LABORATUVARI DENEY 5: YENİDEN KRİSTALLENDİRME DENEYİ
ONDOKUZ MAYIS ÜNİVERSİTESİ MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ KİMYA MÜHENDİSLİĞİ BÖLÜMÜ ORGANİK KİMYA LABORATUVARI DENEY 5: YENİDEN KRİSTALLENDİRME DENEYİ TEORİ : Organik deneyler sonucunda genellikle elde edilen ürün,
DetaylıAgaroz jel elektroforezi
MOLEKÜLER TEKNİKLER Dr. Naşit İĞCİ Nevşehir Hacı Bektaş Veli Üniversitesi Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü 4. Sınıf (2017-2018 Bahar) 2. NOT Agaroz jel elektroforezi PAGE daha çok proteinlerin ve küçük
DetaylıKAPİLLER ELEKTROFOREZ DNA SEKANSLAMA
İçerik Giriş...2 Deney İçin Gerekli Olan Malzemeler...3 Deneyin Yapılışı... 4-9 Genomik DNA Kalıbının Hazırlanması...4 PCR Amplifikasyonu... 4-5 DNA Miktarının Belirlenmesi...6 Sekans Reaksiyonunun Hazırlanması...7
DetaylıAmaç. Bu pratiğin amacı öğrencilerin polimeraz zincir reaksiyonu ve kullanım alanları hakkında bilgi sahibi olmalarını sağlamak
BİYOFİZİK 2015 1 Amaç Bu pratiğin amacı öğrencilerin polimeraz zincir reaksiyonu ve kullanım alanları hakkında bilgi sahibi olmalarını sağlamak 2 Hedefler Bu pratiğin sonunda öğrenciler, polimeraz zincir
DetaylıBrusellozda laboratuvar tanı yöntemleri 14.02.2006 1
Brusellozda laboratuvar tanı yöntemleri 14.02.2006 1 Spesifik tanı yöntemleri: 1. Direk (kült ltür r ve bakterinin gösterilmesi) g 2. Antikorların n gösterilmesig 1.Standart tüp aglütinasyonu 2.Rose Bengal
DetaylıHücre içinde bilginin akışı
Hücre içinde bilginin akışı 1 DNA Çift Zincir Heliks 2 Hücre Çekirdeği ve Çekirdek Zarının Yapısal Organizasyonu Hatırlıyor musunuz? DNA Kromatin Kromatid Kromozom RNA Protein Çekirdek Çekirdekcik Nükleotid
DetaylıPolimeraz Zincir Reaksiyonu. Mikrobiyoloji Anabilim Dalı
4. Ha&a Polimeraz Zincir Reaksiyonu Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Sunu içeriği PCR ın tanımı PCR ın kısa tarihçesi Hücre içi DNA replikasyonu PCR bileşenleri PCR temel prensipler PCR ın kullanım alanları
DetaylıIDC Savunma Sanayi Nakliye Ticaret A.Ş. HIZLI BİYOLOJİK PATHOJEN/TOKSİN ve KİMYASAL GAZ TESPİT SİSTEMLERİ
IDC Savunma Sanayi Nakliye Ticaret A.Ş HIZLI BİYOLOJİK PATHOJEN/TOKSİN ve KİMYASAL GAZ TESPİT SİSTEMLERİ IDC Savunma Sanayi Nakliye Ticaret A.Ş HIZLI BİYOLOJİK PATHOJEN/TOKSİN TESPİT SİSTEMLERİ Biyolojik
DetaylıGenom analizi için belirteç olarak kullanılan DNA dizileri
Salgınların Araştırılmasında Hızlı Genotiplendirme Yöntemleri Avantajları-Dezavantajları Doç. Dr. Z. Ceren KARAHAN Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobioyoloji Anabilim Dalı Moleküler Genetik
DetaylıDNA HİBRİDİZASYONU. HAZIRLAYANLAR: Beyhan KORKMAZ ( ) Prof. Dr. Figen ERKOÇ GAZİ EĞİTİM FAKÜLTESİ
DNA HİBRİDİZASYONU HAZIRLAYANLAR: Beyhan KORKMAZ (040559019) Prof. Dr. Figen ERKOÇ GAZİ EĞİTİM FAKÜLTESİ DNA hibritleşmesi; birbirine komplementer iki tek zincir nükleik asit sekansının çift zincirli tek
DetaylıKromozom, DNA ve Gen. Allel Segregasyonu. DNA çift sarmalı. Hastalık yapan mutasyonlar protein fonksiyonunu bozar. Hastalık yapan mutasyonlar
Temel Genetik Kavramlar DNA izolasyon yöntemleri Kromozom, DNA ve Gen Hücre Nukleus Kromozomlar Gen Prof.Dr.Uğur ÖZBEK Protein DNA çift sarmalı Allel Segregasyonu Şeker Fosfat omurga Bazlar Baz çifti A
DetaylıRTA DNA qpcr Probe Master Mix
RTA DNA qpcr Probe Master Mix Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi -- 2012-01 DNA'nın gerçek zamanlı tayini ve miktar ölçümü için Yalnızca profesyonel kullanım için REF 09030025 25 test 09030100 100 test 09030500
DetaylıİMMUNİZASYON. Bir bireye bağışıklık kazandırma! Bireyin yaşı? İmmunolojik olarak erişkin mi? Maternal antikor? Konak antijene duyarlı mı? Sağlıklı mı?
İMMUNİZASYON Bir bireye bağışıklık kazandırma! Bireyin yaşı? İmmunolojik olarak erişkin mi? Maternal antikor? Konak antijene duyarlı mı? Sağlıklı mı? Canlıya antijen verdikten belli bir süre sonra, o canlıda
DetaylıSALGIN ARAŞTIRMASINDA KULLANILAN TİPLENDİRME YÖNTEMLERİ
SALGIN ARAŞTIRMASINDA KULLANILAN TİPLENDİRME YÖNTEMLERİ Prof.Dr. Meltem Yalınay Çırak Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji A.D. fenotipik yöntemler genotipik yöntemler
DetaylıMEME KARSİNOMUNDA HER2/NEU DURUMUNU DEĞERLENDİRMEDE ALTERNATİF YÖNTEM: REAL TİME-PCR
MEME KARSİNOMUNDA HER2/NEU DURUMUNU DEĞERLENDİRMEDE ALTERNATİF YÖNTEM: REAL TİME-PCR Nuket Eliyatkın Hakan Özgür Pınar Erçetin Safiye Aktaş Ali Küpelioğlu Sunum Planı Meme Kanserinde HER2 nin yeri HER2
DetaylıBiyoteknoloji ve Genetik II. Hafta 8 TRANSLASYON
Biyoteknoloji ve Genetik II Hafta 8 TRANSLASYON Prof. Dr. Hilal Özdağ A.Ü Biyoteknoloji Enstitüsü Merkez Laboratuvarı Tel: 2225826/125 Eposta: hilalozdag@gmail.com TRANSLASYON Translasyon a. mrna ribozoma
Detaylı(ZORUNLU) MOLEKÜLER İMMÜNOLOJİ I (TBG 607 TEORİK 3, 3 KREDİ)
T. C. İSTANBUL BİLİM ÜNİVERSİTESİ SAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ TIBBİ BİYOLOJİ VE GENETİK ANABİLİM DALI YÜKSEK LİSANS PROGRAMI 2015-2016 EĞİTİM-ÖĞRETİM YILI DERS İÇERİKLERİ I. YARIYIL (ZORUNLU) MOLEKÜLER
DetaylıFinal Sınavı Soruları
Final Sınavı Soruları Soru1: PCR döngüsünü kısaca anlatılınız. Cevap1: İlk adımda solüsyonun sıcaklığı artırılarak DNA zincirinin denatüre olması sağlanır. Bu sırada Bundan sonra primerlerin tekli DNA
DetaylıMİKROBİYOLOJİDE BİYOTEKNOLOJİ
MİKROBİYOLOJİDE BİYOTEKNOLOJİ Biyoteknoloji; Genetik materyallerde moleküler düzeyde yapılan manipulasyonlarla yeni ve istenilen fenotipte organizmalar ve faydalı ürünler elde etmektir 1920 li yıllar...
DetaylıMİKROBİYOLOJİDE BİYOTEKNOLOJİ. Doç. Dr. Funda BAĞCIGİL
MİKROBİYOLOJİDE BİYOTEKNOLOJİ Doç. Dr. Funda BAĞCIGİL Biyoteknoloji; Genetik materyallerde moleküler düzeyde yapılan manipulasyonlarla yeni ve istenilen fenotipte organizmalar ve faydalı ürünler elde etmektir
DetaylıOsmaniye Korkut Ata Üniversitesi, Biyoloji Bölümü Araştırma Laboratuarları ve Üniteleri
Osmaniye Korkut Ata Üniversitesi, Biyoloji Bölümü Araştırma Laboratuarları ve Üniteleri Biyoloji Bölümünde Merkezi Araştırma Laboratuarlarının Kurulumu Osmaniye Korkut Ata Üniversitesi, Biyoloji Bölümü
DetaylıNÜKLEİK ASİTLERİN ELEKTROFOREZİ
T.C. FIRAT ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ BİYOLOJİ BÖLÜMÜ NÜKLEİK ASİTLERİN ELEKTROFOREZİ Yüksek Lisans Semineri Hazırlayan: Venhar ÇELİK Danışman: Yrd.Doç.Dr. Dilek Turgut-BALIK NÜKLEİK ASİTLERİN
DetaylıProf. Dr. Nermin Gözükırmızı
Biyoloji Araştırmaları, Moleküler Boyutu ve Önceliklerimiz Prof. Dr. Nermin Gözükırmızı İstanbul Üniversitesi Fen Fakültesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü nermin@istanbul.edu.tr, http://www.istanbul.edu.tr/fen/mbg/personel.php?id=30
DetaylıTRANSLASYON ve PROTEİNLER
TRANSLASYON ve PROTEİNLER Prof. Dr. Sacide PEHLİVAN 13 Aralık 2016 mrna daki baz sırasının kullanılarak amino asitlerin doğru sıra ile proteini oluşturmasını kapsayan olayların tümüne Translasyon veya
DetaylıİMMUNOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ
İMMUNOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ Presipitasyon G)İMMUNOASSAY TESTLER İşaretli antikorların kullanılmasıyla 1942 de; FA Fluoresan Antikor (Fluorokromlar) 1954 de; IFA (İndirekt Fluoresan Antikor) 1960 da; RIA
DetaylıTRANSLASYON VE DÜZENLENMESİ
TRANSLASYON VE DÜZENLENMESİ TRANSLASYON Translasyonda nükleik asit kullanılır fakat son ürün bir nükleik asit değil proteindir. Translasyon mekanizması 4 ana bileşenden oluşmaktadır: 1. mrnalar 2. trnalar
DetaylıIII-Hayatın Oluşturan Kimyasal Birimler
III-Hayatın Oluşturan Kimyasal Birimler MBG 111 BİYOLOJİ I 3.1.Karbon:Biyolojik Moleküllerin İskeleti *Karbon bütün biyolojik moleküllerin omurgasıdır, çünkü dört kovalent bağ yapabilir ve uzun zincirler
DetaylıBiyolistik - Gen Silahı. İlker Gönülalp Yıldız Teknik Üniversitesi Biyoloji Bölümü
Biyolistik - Gen Silahı İlker Gönülalp Yıldız Teknik Üniversitesi Biyoloji Bölümü Biyolistik Biyolistik, biyolojik ve balistik kelimelerinin kısaltmalarının birleştirilmesi şeklinde adlandırılan, hücrelerin
DetaylıTüberkülozun Mikrobiyolojik Tanısı. Süheyla SÜRÜCÜOĞLU
Tüberkülozun Mikrobiyolojik Tanısı Süheyla SÜRÜCÜOĞLU Tüberkülozun etkin kontrolü için; Yayma sonuçları Kültür ve identifikasyon Duyarlılık testleri ; 24 saat ; 21 gün ; 30 günde bildirilmeli CDC, 1995
DetaylıÜNİTE 12:GENETİK MÜHENDİSLİĞİ VE BİYOTEKNOLOJİ
ÜNİTE 12:GENETİK MÜHENDİSLİĞİ VE BİYOTEKNOLOJİ Genetik mühendisliği gelişmeden önce insanlar yapay seçilim yoluyla istenen özelliklerin yavru canlılarda görülmesini sağlamışlardır. Örneğin seçici üretim
DetaylıGenetikten Genombilime Geçişte Transkriptom Analizleri
Genetikten Genombilime Geçişte Transkriptom Analizleri Doç.Dr. Hilâl Özdağ AÜ iyoteknoloji Enstitüsü Mammals Other chordates Other eukaryotes Homo sapiens [NCI 35] Vega Gallus gallus [WASHUC1] Drosophila
DetaylıÇiftlik Hayvanlarında Cinsiyetin Denetimi
Çiftlik Hayvanlarında Cinsiyetin Denetimi Cinsiyetin belirlenmesi Demokritus (MÖ: 470-402) Sağ testisten erkek, sol testisten dişi yavruların dünyaya geldiğini ileri sürmüştür. Fötal yaşamda cinsiyetin
DetaylıREVİZYON DURUMU. Revizyon Tarihi Açıklama Revizyon No
REVİZYON DURUMU Revizyon Tarihi Açıklama Revizyon No Hazırlayan: Onaylayan: Onaylayan: Prof. Dr. Nedime Serakıncı, Yrd. Doç. Dr. Umut Fahrioğlu Adem Aköl Kalite Konseyi Başkanı Sinan Özyavaş Kalite Koordinatörü
DetaylıGIDA MÜHENDİSLİĞİ BÖLÜMÜ DOKTORA DERS KATALOĞU
DOKTORA DERS KATALOĞU ERCİYES ÜNİVERSİTESİ GDM 638 Lipid Kimyası Zorunlu DERS SAATİ: 3 Bahar Yrd. Doç. Dr. Hasan YALÇIN KREDİSİ :3 Tel:(352) 4374901 (32731), E-mail: hyalcin@erciyes.edu.tr, Web sayfası
DetaylıTranskripsiyon ve Transkripsiyonun Düzenlenmesi
MBG 505 BAKTERİ GENETİĞİ Transkripsiyon ve Transkripsiyonun Düzenlenmesi Emrah ÖZÇELİK Ribonükleik asit (RNA) 3 tip RNA Mesajcı RNA (mrna) (genetik seviyede) Transfer RNA (trna) Ribozomal RNA (rrna) (fonksiyonel
DetaylıRTA JEL / PZR Saflaştırma Kiti
RTA JEL / PZR Saflaştırma Kiti Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi - 2011-12 DNA parçalarının agaroz jelden geri kazanımı ve PZR ürünlerinin saflaştırılması için Yalnızca profesyonel kullanım için REF 09009050
DetaylıATIKSULARDA FENOLLERİN ANALİZ YÖNTEMİ
ATIKSULARDA FENOLLERİN ANALİZ YÖNTEMİ YÖNTEM YÖNTEMİN ESASI VE PRENSİBİ Fenolik maddeler uçucu özellik göstermeyen safsızlıklardan distilasyon işlemiyle ayrılır ve ph 7.9 ± 0.1 de potasyum ferriksiyanür
DetaylıPolimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR: Polymerase Chain Reaction) Ayten AŞKIN KILINÇ Veteriner Hekim
Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR: Polymerase Chain Reaction) Ayten AŞKIN KILINÇ Veteriner Hekim PCR nedir? DNA Polimeraz enzimi kullanılarak DNA nın spesifik bir parçasının in vitro (bir tüp içerisinde)
DetaylıEYLÜL 2011 S0485&S0486
İSTANBUL İL KONTROL LABORATUVAR MÜDÜRLÜĞÜ GIDA MİKROBİYOLOJİSİNDE DIŞ KALİTE DEĞERLENDİRMESİ (EQA=EXTERNAL QUALITY ASSESMENT) SONUÇ RAPORU EYLÜL 2011 S0485&S0486 İstanbul İl Kontrol Laboratuvar Müdürlüğü
DetaylıMikrobiyal Gelişim. Jenerasyon süresi. Bakterilerde üreme eğrisi. Örneğin; (optimum koşullar altında) 10/5/2015
Mikrobiyal Gelişim Tek hücreli organizmalarda sayı artışı Bakterilerde en çok görülen üreme şekli ikiye bölünmedir (mikroorganizma sayısı) Çok hücreli organizmalarda kütle artışı Genelde funguslarda görülen
DetaylıM50 otomatik tanımlama Ve duyarlılık testi
BD Phoenix M50 otomatik tanımlama Ve duyarlılık testi Performans Tanımlama Tanımlama için 45 kromojenik ve florojenik sübstrat kullanılır. Cihazdaki inkübasyon ve deteksiyon sürecinde ek reaktif eklenmesi
DetaylıBİO 775 PROTEOMİK ve GENOMİK
1 BİO 775 PROTEOMİK ve GENOMİK SEQUENCE TAGGED SITES (STSs) EXPRESSED SEQUENCE TAG (ESTs) S. Esin SELÇUK 2006 2 SEQUENCE TAGGED SITES (STSs) STS; genomda 200-300 baz uzunluğundaki kısa bir bölgedir ve
DetaylıBornova Vet.Kont.Arst.Enst.
Gıda ve Yemlerde Salmonella Gelişimi imi ve Analiz Metotları Şebnem Ö Budak 08-09 09 Ekim 2008, İzmir Salmonella spp. Salmonella spp., enterobacteriaceae familyası üyesi, fakültatif anaerob, gram negatif,
Detaylı7. BÖLÜM MİKROBİYAL GELİŞİM
7. BÖLÜM MİKROBİYAL GELİŞİM 1 Gelişim Tek hücreli organizmalarda sayı artışı Bakterilerde en çok görülen üreme şekli ikiye bölünmedir (mikroorganizma sayısı) Çok hücreli organizmalarda kütle artışı Genelde
DetaylıGıda Kaynaklı Patojenlerin Belirlenmesinde Yenilikçi Yaklaşımlar: Nanopartiküllerin Kullanımı
Gıda Kaynaklı Patojenlerin Belirlenmesinde Yenilikçi Yaklaşımlar: Nanopartiküllerin Kullanımı Dünya Sağlık Örgütü 2014 verilerine göre, birçoğu çocuk olmak üzere 2,2 milyon insanın su ve/veya gıda kaynaklı
DetaylıAdnan Menderes Üniversitesi Tarımsal Biyoteknoloji Bölümü TB101 Çiğdem Yamaner (Yrd. Doç. Dr.) 3. Hafta (01.10.2013)
Adnan Menderes Üniversitesi Tarımsal Biyoteknoloji Bölümü TB101 Çiğdem Yamaner (Yrd. Doç. Dr.) 3. Hafta (01.10.2013) ADÜ Tarımsal Biyoteknoloji Bölümü 1 DNA moleküllerinin analizinde çok çeşitli yöntemler
DetaylıKanatlı Hayvan Hastalıkları
Kanatlı Hayvan Hastalıkları Kanatlı sektörü ile ilgili genel bilgiler 1930 Merkez Tavukçuluk Enstitüsü 1952 Saf ırkların ilk kez ithal edilmesi 1963 Damızlık (Parent stock) ithali 1970 Yatırımlarda artma
DetaylıMOLEKÜLER DNA DİZİ ANALİZ YÖNTEMLERİ
MOLEKÜLER DNA DİZİ ANALİZ YÖNTEMLERİ DNA dizi analizleri ya da sekanslama; DNA birincil (temel) yapılarının belirlenmesinde kullanılan yöntemlerdir, DNA nın nukleotid dizilerinin saptanması anlamına gelir.
Detaylıcdna Kitaplık Hazırlanışı
cdna Kitaplık Hazırlanışı Uzm.Bio.Veysel Sabri HANÇER İstanbul Üniversitesi Moleküler Biyoloji ve Genetik Doktora Programı 2602043040 Genetik Bilginin İki Kaynağı Vardır; Genomik DNA mrna Ökaryotlardaki
Detaylıİşlevsel Genomik Nedir?
İşlevsel Genomik Nedir? İşlevsel Genomik, yapısal genomik tarafından sağlanan bileşenlerin ve bilginin kullanımı ile gen işlevinin değerlendirilmesinde, deneysel yaklaşımların (genom veya sistem boyunca)
DetaylıTEKNİK FOTOĞRAFÇILIK. V. Hafta KOÜ METALURJİ & MALZEME MÜHENDİSLİĞİ
TEKNİK FOTOĞRAFÇILIK V. Hafta KOÜ METALURJİ & MALZEME MÜHENDİSLİĞİ Işıklandırmada gümüşhalojenür kristalinde elektron transportuyla fotolitik gümüş oluşur; bu da kristal içi developman çekirdeğini oluşturur.
DetaylıHücre Üzerine Mikrocerrahi Uygulamaları Hücrenin altbirimlerine ayrılması Moleküllerin analizi. Prof. Dr. Müjgan Cengiz
Hücre Üzerine Mikrocerrahi Uygulamaları Hücrenin altbirimlerine ayrılması Moleküllerin analizi Prof. Dr. Müjgan Cengiz Canlı Hücrelerdeki Moleküllerin İzlenmesi Mikroskopla inceleme hücrede belli düzeyde
DetaylıWESTERN BLOT. Yrd. Doç. Dr. Eda Becer. Yakın Doğu Üniversitesi Eczacılık Fakültesi Biyokimya Anabilim Dalı
WESTERN BLOT Yrd. Doç. Dr. Eda Becer Yakın Doğu Üniversitesi Eczacılık Fakültesi Biyokimya Anabilim Dalı Northern Blot (RNA) James Alwine George Stark Western Blot (Protein) Eastern Blot (??) George Stark
DetaylıKALITSAL MOLEKÜLÜN BİÇİMİ ve ORGANİZASYONU PROF. DR. SERKAN YILMAZ
KALITSAL MOLEKÜLÜN BİÇİMİ ve ORGANİZASYONU PROF. DR. SERKAN YILMAZ Değişik canlı gruplarında kalıtsal molekülün çeşidi, sayısı, biçimi ve organizasyonu bakımından farklılıklar bulunur. Ortak özellik: nükleik
DetaylıWestern Blot (veya immünblot), protein ekspresyonunu doğrulamak için standart laboratuvar
İçerik Giriş...2 Western Blot Yöntemi...2 Protein Örneklerinin Hazırlanması...2 Dikey Jel Sistemi Kullanımı...3 Kuru Transfer Sistem Kullanımı...4 Bloklama...6 Protein Tespiti...6 Kemilüminesans Tanımlama
DetaylıEpigenetik modifikasyonlarla çalışma yöntemleri.
Epigenetik modifikasyonlarla çalışma yöntemleri www.plantcell.org/cgi/doi/10.1105/tpc.110.tt0110b Epigenetik modifikasyonlarla çalışma yöntemleri DNA metilasyonu bisülfit dizileme TTCGCCGACTAA TTCGCCGAuTAA
Detaylı